The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
GAMGAKEYCRTLFPYTGTNEDELTFREGEIIHLISKETGEAGWWKGELNGKEGVFPDNFAVQIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
CD2-associated protein
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| publication title |
Solution Structure, Dynamics and Thermodynamics of the three SH3 domains of CD2AP
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
7
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-12-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1JXO A; 2ENM A; 4WCI A; 1PKT A; 3NGP A; 2DM1 A; 3ZL7 C; 4QT7 A; 3M0T A; 2RQT A; 2KXC A; 3EG2 A; 4J9G A; 1GFD A; 2JM9 A; 3SHW A; 4AFQ C; 4OMP A; 2BZX A; 2DBM A; 3UF4 A; 1U5S A; 2D8J A; 1QKW A; 2SRC A; 2VVK A; 2BZ8 A; 2K9G A; 4J9E A; 3TSZ A; 1GL5 A; 2HDA A; 1UGV A; 1MV3 A; 2GGR A; 1UG1 A; 1VYT A; 2IIM A; 4JJD A; 2KRM A; 2DL5 A; 1YWO A; 2EPD A; 4IIO A; 3VS5 A; 3CQT A; 1BBZ A; 2AZV A; 2C0I A; 2PTK A; 3LH5 A; 1M30 A; 4J9H A; 1UHF A; 2AKK A; 1NYG A; 1M27 C; 3I5R A; 1UTI A; 2FPE A; 5I22 A; 2K6D A; 1ZUU A; 1WIE A; 1ZUK A; 1YNZ A; 2LQW A; 2KGT A; 2YUO A; 2DF6 A; 2FO0 A; 1AWX A; 4JJC A; 1KIK A; 1I1J A; 1X43 A; 1JXM A; 2A08 A; 3NPF A; 1XOV A; 1HJD A; 1SSH A; 2CUD A; 2FRW A; 2CT4 A; 2LCS A; 2EYW A; 4RTY A; 3M0Q A; 2JM8 A; 1G83 A; 4RTZ A; 1A0N B; 1OV3 A; 1SHG A; 3FJ5 A; 3VS2 A; 3VS4 A; 2K2M A; 1AZG B; 1FYN A; 2LQN A; 2GQI A; 4F16 A; 2MOX A; 4J9B A; 2DIL A; 2CT3 A; 3KFV A; 4HXJ A; 1W70 A; 2YDL A; 4RTT A; 2RNA A; 1RI9 A; 2DRM A; 2O9V A; 3RBB B; 1E6H A; 4J9C A; 2MCN A; 1T3L A; 4Z8A A; 3TVT A; 2HEQ A; 4LN2 A; 2RPN A; 1WDX A; 4CC3 A; 1WLP B; 2EGC A; 4F17 A; 2BZY A; 1TG0 A; 1B3Q A; 1YN8 A; 1M3A A; 4D8D A; 1NEG A; 2DL3 A; 3EHQ A; 3VS0 A; 1WXU A; 1QCF A; 1Y57 A; 2ED0 A; 2LX7 A; 1PNJ A; 2J05 A; 2LJ0 A; 4LUE A; 3VRY A; 5GJW B; 2K79 A; 3PVQ A; 1JQQ A; 2L3Q A; 3EGU A; 3PE0 A; 2D1X A; 2KR3 A; 1GCQ C; 1CSK A; 1NLP C; 2AZS A; 3A98 A; 1K0S A; 1NEB A; 1ABQ A; 4RTX A; 1SHF A; 3VS6 A; 4AFS C; 2B86 A; 1AZE A; 1CKB A; 2KRN A; 2EGA A; 1K76 A; 1KSW A; 1VYV A; 5ECA A; 1WX6 A; 2V1R A; 2L3S A; 1H3H A; 1K9A A; 4ZNX A; 3VS1 A; 3H41 A; 2ABL A; 2KBT A; 3O5Z A; 2F2V A; 1JU5 C; 2W0Z A; 2DNU A; 2GTJ A; 2SEM A; 2YUP A; 2A36 A; 1VA7 A; 2YT6 A; 5GJV B; 1UDL A; 4Z88 A; 1ZBJ A; 1X2Q A; 4HCK A; 2KRS A; 2V1Q A; 1G2B A; 1RUW A; 1UUE A; 2JTE A; 2YSQ A; 2EQI A; 1QKX A; 1VYU A; 2A37 A; 3H0F A; 4AG1 C; 1BK2 A; 1CKA A; 3M0S A; 1KJW A; 4J9D A; 2DX1 A; 2QDL A; 2M0Y A; 2FG0 A; 4Y92 A; 2KEA A; 2HCK A; 4LUD A; 2RMO A; 4AFU C; 4CC7 A; 2L2P A; 3VS3 A; 1V1C A; 2K3B A; 4Z89 A; 2A28 A; 2J7I A; 2EYY A; 1Z9Q A; 3I9Q A; 1PRL C; 2DYB A; 4JPB W; 1TUD A; 3TSW A; 1QWF A; 1PKS A; 1GCQ A; 3C0C A; 4HVW A; 2LP5 A; 2DVJ A; 1U3O A; 4HVV A; 2LZ6 B; 2KRO A; 2NWM A; 1IO6 A; 3NMZ C; 3UA7 A; 2DL8 A; 2KT8 A; 1K1Z A; 2JMC A; 2OI3 A; 2JS2 A; 1WXT A; 2EW3 A; 4J9I A; 5L23 A; 2HSP A; 1GCP A; 1SRL A; 2RF0 A; 2CDT A; 2O31 A; 5IHN A; 2AKL A; 1UHC A; 1NYF A; 2ROT A; 1UJY A; 2DE0 X; 2DL4 A; 4D8K A; 2JXB A; 2O2O A; 2EKH A; 1AEY A; 2OAW A; 2BTT A; 3UAT A; 2EBP A; 1NM7 A; 1I07 A; 1M3C A; 3THK A; 1UJ0 A; 2GBQ A; 3REA B; 2DMO A; 1KFZ A; 1T3S A; 1TUC A; 4LE9 A; 4FSS A; 5FWC A; 2D0N A; 2E5K A; 4OMO A; 1ARK A; 2C0O A; 1WA7 A; 1ZUY A; 1T0H A; 2LNH B; 3EG0 A; 3EG1 A; 5I11 A; 1RLQ C; 2M51 A; 1BU1 A; 1ZLM A; 3SEM A; 1MUZ A; 1E7O A; 2ESW A; 1YCS B; 3R6N A; 5IHK A; 2RN8 A; 1RLP C; 2DLP A; 1J3T A; 3VRZ A; 1GBQ A; 4RTU A; 3QWY A; 1ABO A; 2ED1 A; 2FEI A; 2H8H A; 1ZX6 A; 4A63 B; 1OPL A; 2LMJ A; 1WYX A; 2KE9 A; 2JS0 A; 1UE9 A; 2CH4 W; 5IHI A; 3PVL A; 3UA6 A; 4X1V A; 4OMQ A; 1E6G A; 1QLY A; 3I5S A; 1PWT A; 3I35 A; 1QWE A; 3NHN A; 1AWO A; 1NG2 A; 5FW9 A; 3GBQ A; 2KXD A; 2CSQ A; 1H8K A; 4GBQ A; 2RQR A; 4CC2 A; 2J6O A; 1I0C A; 1HSQ A; 2DA9 A; 2G6F X; 4OML A; 2JW4 A; 1N5Z A; 2CRE A; 1K0X A; 2RQW A; 2DRK A; 1YWP A; 1PHT A; 1SRM A; 1WXB A; 1WI7 A; 4LNP A; 2I0N A; 1FMK A; 1EFN A; 1M8M A; 5HCK A; 2L0A A; 2YUN A; 1HD3 A; 1X2K A; 2P4R A; 4DEX A; 2FRY A; 2KYB A; 2EYX A; 3EHR A; 4OMM A; 1AOJ A; 2CH4 A; 4CC4 B; 3EG3 A; 4EIK A; 2HBW A; 4JZ3 A; 2EYZ A; 2OJ2 A; 1Y0M A; 2F2X A; 1X6G A; 2EGE A; 1K4U S; 5IH2 A; 3M0U A; 2VKN A; 5FWB A; 1M3B A; 2PZ1 A; 5IXB A; 3JV3 A; 2AK5 A; 1SEM A; 1X69 A; 4J9F A; 1U06 A; 3QWX X; 3REB B; 2LJ1 A; 4F14 A; 1YP5 A; 2CSI A; 2X3X D; 1H92 A; 1SPK A; 5IXF A; 1W6X A; 2F2W A; 2DL7 A; 1ZSG A; 1GRI A; 2EVR A; 2GNC A; 3M0R A; 4ESR A; 1AVZ C; 2YUQ A; 2O9S A; 2PNI A; 1AWW A; 4M4Z A; 1OOT A; 5EC7 A; 2FPD A; 2FPF A; 2J6F A; 4ORZ A; 2RQU A; 3ULR B; 4KRT A; 2X3W D; 2JT4 A; 4JZ4 A; 1LCK A; 1OEB A; 2K7A A; 2ECZ A; 3U23 A; 2DBK A; 2J6K A; 2LJ3 A; 1NLO C; 1W1F A; 2MIO A; 4AG2 C; 2NUZ A; 1OPK A; 1JEG A; 2J06 A; 1AWJ A; 1MV0 B; 1X27 A; 4IIM A; 1AD5 A; 3RNJ A; 2W10 A; 3VS7 A; 2KYM A; 2GTO A; 1Z9Z A; 4GLM A; 2L3P A; 2C0T A; 1BB9 A; 4RTV A; 2VWF A; 4RUG A; 2CUB A; 1PRM C; 3H0H A; 2ROL A; 1JO8 A; 1B07 A; 4R0K A; 4OMN A; 4DEY A; 2DJQ A; 4JJB A; 1GFC A; 2D8H A; 3H0I A; 4K11 A; 3M0P A; 1X6B A; 4AFZ C; 4HVU A; 4E6R A; 2XMF A; 1UFF A; 1UEC A; 3IQL A; 4RTW A; 1GBR A; 2O88 A; 2JMA A; 2KT1 A; 1WFW A; 1T0J A; 1S1N A; 2RQV A; 2KNB B; #chains in the Genus database with same CATH topology 5FLX E; 1VQP A; 5DLQ E; 3NGP A; 2DM1 A; 3AHU A; 2KXC A; 4MZP A; 4FYY B; 3V7S A; 2JM9 A; 5KYX B; 3SHW A; 1SF9 A; 2KAF A; 4E7H A; 4A53 A; 3I56 T; 2DEQ A; 3RMQ A; 1C0M A; 3FRN A; 1Q7Y C; 1QKW A; 2SRC A; 5LJ5 h; 1VQO A; 3UT1 A; 1GL5 A; 3LH0 A; 1UG1 A; 2Y4X A; 2IIM A; 4JJD A; 2KRM A; 5AT1 B; 1BI2 A; 2EJF A; 1KHI A; 2RO0 A; 3CCL T; 1Y96 B; 1M27 C; 1OU9 A; 3CCQ T; 2WSC E; 4OMF B; 1ZUU A; 1ZUK A; 3G1J A; 3G71 Q; 5LJ5 f; 4C8Q B; 3URG A; 4DOV A; 3NPF A; 1XOV A; 2LX9 A; 2NUP A; 3X24 B; 2FZC B; 1VQN A; 1RAH B; 1HJD A; 1SSH A; 2CUD A; 2FZK B; 2MK5 A; 2OTJ T; 3M0Q A; 4C0Z A; 4LDW A; 4M7D E; 1JJ2 P; 2Z0W A; 5GAM j; 2E4H A; 1B34 B; 1Q82 C; 2P84 A; 3GP8 A; 3QUI A; 3PMT A; 1W70 A; 2EQJ A; 4QKU A; 1O9S A; 3CCR T; 3OYF A; 3RDV A; 2DRM A; 1FXX A; 2QQA A; 2MCN A; 3OB9 A; 5DY9 A; 3CC7 A; 2HEQ A; 1WDX A; 4CC3 A; 1ZHI A; 3S3O A; 3I56 Q; 2EGC A; 2KK4 A; 2ZPE B; 1NPR A; 2BZY A; 2E64 A; 1YN8 A; 3JCM X; 3HP9 A; 1M3A A; 1NEG A; 4KUI A; 2DVE A; 1C1A A; 1N6A A; 1YJN Q; 3BW1 A; 2LJ0 A; 1PCX A; 3FDR A; 3CCM A; 5A0D A; 2PUO B; 2FB7 A; 3PE0 A; 3EGU A; 2YRD A; 5GAN 2; 1M1F A; 3GNF B; 3CCQ Q; 4BDZ A; 1CSK A; 2AZS A; 3A98 A; 1K0S A; 1NEB A; 1MNE A; 1MHN A; 1SHF A; 1S72 T; 3X28 B; 2B86 A; 3CCE A; 1QVF P; 2HQE A; 4C5G A; 2EGA A; 1K76 A; 4M75 E; 5CQX A; 2OTJ Q; 1TSF A; 2DTH A; 3VS1 A; 1VQM T; 1QVG P; 5KYU A; 4AT1 B; 1RAE B; 1ZA2 B; 2VXE A; 3O5Z A; 4C0D C; 1WQW A; 3S3N A; 2YUP A; 7AT1 B; 2A36 A; 4HT9 A; 4J7I A; 1G3S A; 1UDL A; 1C6V X; 2KRS A; 3ZBD A; 1G2B A; 1MND A; 3T9N A; 1VQ9 T; 1QKX A; 2A37 A; 3H0F A; 3G7Z A; 1LPL A; 3LW5 E; 3PIP A; 4EMH A; 3M0S A; 2R5M A; 3CCR Q; 3GOX A; 4C92 E; 2EAY A; 2KDS A; 1Q81 R; 4BDY A; 4FT2 A; 1WHK A; 2XKO C; 3EG9 A; 2E5Q A; 1JJ2 S; 2KEA A; 4OVA A; 4JRK A; 3OS0 A; 2RMO A; 1K73 R; 4AFU C; 4C0D B; 2L2P A; 1TS9 A; 3VS3 A; 2DIQ A; 2ZPI B; 5FU7 C; 1M1G A; 4Z89 A; 2LC4 A; 5LJ3 g; 2DYB A; 1TUD A; 2PUK B; 4E7J A; 4M75 A; 1K9M C; 1YIJ T; 2KRO A; 1Q95 G; 3EFO B; 1IO6 A; 3UA7 A; 2KQW A; 5D7U A; 2CP6 A; 1K1Z A; 1D0Y A; 1WXT A; 3N5B B; 3QJ6 A; 3PTA A; 5L23 A; 1O75 A; 2MWP A; 4E2F B; 1GCP A; 2NUT A; 2MWO A; 2RF0 A; 1S72 Q; 1Q86 C; 3MP8 A; 2CDT A; 4CRI A; 3CME Q; 2XD0 A; 2CYZ B; 3JCM b; 5IHN A; 4LD6 A; 2QAS A; 2QTV A; 2HD0 A; 1VQO T; 2RB6 A; 2K3Y A; 1VQM Q; 3WVD B; 3UAT A; 2YRV A; 4OB3 B; 1XNI A; 1KD1 C; 2XIC A; 1QVF S; 3JB9 G; 1NZ9 A; 4FSS A; 2DXC A; 5FWC A; 1VQ9 Q; 4D6W A; 1OX8 A; 4KGZ B; 4E7K A; 1WNL A; 3EGX B; 1QVG S; 1WA7 A; 4FW1 A; 4ZGD B; 1RAG B; 2CP7 A; 2QQ9 A; 3EG1 A; 4PL6 A; 1VQ7 T; 1BU1 A; 3QZ5 B; 3LX7 A; 1G3W A; 2M02 A; 3HRS A; 1VQN T; 1PG5 B; 4M78 B; 1YBY A; 3EFS A; 2CGH A; 4M75 G; 3M55 A; 1J3T A; 2LQ8 A; 4PJM A; 1GBQ A; 2LCL A; 3DB3 A; 2M0O A; 2Y90 A; 2EYQ A; 2KY9 A; 2H8H A; 3H9N A; 3JCM J; 3CMA A; 2JS0 A; 1YIJ Q; 5GAN 7; 3HKS A; 4X1V A; 3OYG A; 1E6G A; 2XG8 D; 1QCN A; 3OYI A; 1BIA A; 4LD9 K; 1UGP B; 4MDW A; 2K4Y A; 1NG2 A; 2KXD A; 2QTX A; 4OB1 B; 1BI0 A; 1H8K A; 3DKM A; 1SG5 A; 1UEB A; 1HSQ A; 2G6F X; 2QI2 A; 3QII A; 1VQO Q; 1W2B A; 1VUB A; 3UDC A; 1JBM A; 2JW4 A; 1N5Z A; 1MGQ A; 2DYI A; 3CCS A; 2RQW A; 2DRK A; 1M5Q 1; 3I55 A; 4EPC A; 1MMN A; 3EGD A; 2GQV A; 3M58 A; 1Q7Y R; 3X25 B; 3X26 B; 4LNP A; 2I0N A; 3FB9 A; 3CCM T; 3BDL A; 1M8M A; 5LJ3 j; 4PJO B; 1YCY A; 1VIF A; 1UGS B; 4RMO A; 1HD3 A; 2P4R A; 2O4X A; 3GPL A; 2FRY A; 1PD1 A; 3OYA A; 3QKJ A; 1AOJ A; 2CH4 A; 1VQ7 Q; 2QA4 T; 3SDZ A; 3CCE T; 4FSX A; 2F2X A; 1K4U S; 1QVP A; 1VQN Q; 2PQW A; 3HHT B; 5IXB A; 2AK5 A; 2QK0 A; 4M7D C; 4J9F A; 5KYX A; 2OTL A; 3D7S B; 3UPU A; 3RR6 A; 4M77 C; 2E1H A; 4JS4 A; 4RCC A; 2LJ1 A; 4F14 A; 1VQ5 T; 5FRN A; 1QW1 A; 1F1B B; 2COZ A; 1VQ6 A; 1FMV A; 2DL7 A; 1N9R A; 1GRI A; 3MEA A; 5LJ3 h; 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3G4S A; 4M7A G; 1WIE A; 2HQX A; 4P5N A; 2LQW A; 4C92 B; 1N9S A; 1UGQ B; 3MEV A; 4E7I A; 2CP5 A; 4JJC A; 1KIK A; 2HQH A; 3CC2 Q; 3CMA T; 1HK9 A; 1IHV A; 1JXM A; 2A08 A; 1QQJ A; 2K2V A; 4BD3 A; 3VJP A; 3CCU T; 2CT4 A; 2LCS A; 4RTY A; 1K9M R; 2LNV A; 2DIG A; 2P4T A; 3EH2 A; 4E7S A; 2MPX C; 1A0N B; 2GCX A; 2X4J A; 3C4S A; 1SHG A; 2EQU A; 1BCO A; 3VU3 C; 1AZG B; 2LQN A; 4F16 A; 5GMK j; 1OQK A; 4MZT A; 3Q1J A; 1KC8 U; 3JCM d; 1Q86 R; 2HKQ B; 3CCS T; 3LLR A; 2LQK A; 4C8Q F; 3I55 T; 2O9V A; 1OU8 A; 1T3L A; 4OP0 A; 2E41 A; 2ZCF B; 5KE2 A; 1VQ8 T; 2P0Q A; 2R57 A; 1U1S A; 1WLP B; 4F17 A; 4QW2 A; 1TU0 B; 3M53 A; 4M7A F; 1KD1 R; 2NYS A; 2VV5 A; 3G6E A; 2DTO A; 2DL3 A; 2RK2 A; 3EHQ A; 4PLL A; 5GAN d; 5KH6 A; 2MI6 A; 3CCJ T; 1PNJ A; 2IG0 A; 4PNO A; 1D09 B; 5LJ5 j; 4BI3 A; 2F1L A; 3PFS A; 1EIF A; 4N4G A; 2EQK A; 5D6Y A; 1DJ7 B; 2K79 A; 4KGV B; 1FWZ A; 4ZN1 A; 2R58 A; 1GCQ C; 2HSE B; 5GMK h; 2OTL T; 2FVU A; 2FYK A; 3FC3 A; 3VS6 A; 4AFS C; 1VQ6 T; 1BIB A; 3CMA Q; 2KRN A; 1QCO A; 2KVQ G; 4MDX A; 3PIO A; 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