The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
72
|
structure length |
72
|
Chain Sequence |
GSSGSSGEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQYIVVQDTSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2
|
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of human SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
7
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| structure length |
72
|
| sequence length |
72
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4E6R A; 2EYX A; 1M30 A; 2EGE A; 1YNZ A; 3M0U A; 1AD5 A; 1GFC A; 2ED0 A; 2YUQ A; 1AVZ C; 1SRL A; 2KT8 A; 2IIM A; 2YT6 A; 5IHN A; 3I5S A; 3PVL A; 5GJW B; 2ENM A; 2AZV A; 3LH5 A; 5FW9 A; 1GCP A; 4CC3 A; 1MV3 A; 2V1Q A; 5IHI A; 2DLP A; 1PRM C; 3GBQ A; 1A0N B; 3R6N A; 1QCF A; 4CC7 A; 2C0O A; 3VS1 A; 2J05 A; 1NYG A; 1WXU A; 2CUB A; 1U5S A; 4J9G A; 4K11 A; 2JMA A; 4HVV A; 3NMZ C; 2VKN A; 4AG1 C; 2A08 A; 2O9S A; 2M0Y A; 4DEX A; 4KRT A; 1GFD A; 1V1C A; 1OV3 A; 2KRN A; 1SHG A; 1WFW A; 2D8H A; 2ESW A; 2OAW A; 1OEB A; 2LZ6 B; 2FPD A; 2SEM A; 3FJ5 A; 1X2Q A; 2HDA A; 2YUN A; 1RUW A; 2DRK A; 2ECZ A; 3EGU A; 5I22 A; 2J6O A; 2BZ8 A; 3UA7 A; 1K76 A; 3H0I A; 2O31 A; 3VS6 A; 3KFV A; 2XMF A; 2KNB B; 1ZUU A; 4OML A; 2BZY A; 1YWO A; 2L3S A; 1SSH A; 2BTT A; 2DJQ A; 2GQI A; 3M0T A; 1PHT A; 2DE0 X; 2RQT A; 4RTY A; 2NWM A; 3JV3 A; 4GBQ A; 1W70 A; 1H3H A; 4JJD A; 1QLY A; 1XOV A; 3H0H A; 3EG2 A; 2JS2 A; 2ROT A; 2O88 A; 4DEY A; 3M0S A; 1VA7 A; 2B86 A; 2JM8 A; 4OMP A; 2K9G A; 2V1R A; 2CT4 A; 3UF4 A; 3I35 A; 1AWX A; 2AKL A; 2RMO A; 4IIO A; 1H92 A; 1ZBJ A; 4J9C A; 4WCI A; 1NYF A; 5GJV B; 2FRW A; 3CQT A; 3VS3 A; 4AFU C; 1M3B A; 2O2O A; 4D8K A; 2A36 A; 4LUD A; 1J3T A; 1MUZ A; 1OPK A; 4LN2 A; 1OPL A; 2ABL A; 1GBQ A; 3I5R A; 2FEI A; 2AK5 A; 3VRZ A; 2SRC A; 2EYZ A; 2GTJ A; 3TVT A; 2PZ1 A; 5FWB A; 4F14 A; 2A28 A; 1WA7 A; 2L3Q A; 1E6G A; 2F2W A; 1NM7 A; 2RQU A; 1YWP A; 1QWF A; 2RNA A; 4OMO A; 1JXO A; 1BBZ A; 3EG1 A; 1QWE A; 2OJ2 A; 4J9E A; 1BK2 A; 4RTW A; 1ZUK A; 2FG0 A; 2MIO A; 1I07 A; 1K1Z A; 1PKT A; 3H41 A; 1GRI A; 1UFF A; 2LNH B; 1X43 A; 4OMQ A; 2VWF A; 1Y57 A; 1UUE A; 3QWX X; 2EW3 A; 4A63 B; 4EIK A; 1QKW A; 1U06 A; 4X1V A; 1BB9 A; 2P4R A; 1UTI A; 2DL4 A; 4RTV A; 2FPF A; 3PVQ A; 5IHK A; 1UE9 A; 1LCK A; 2KRM A; 4RUG A; 2JS0 A; 5L23 A; 3RBB B; 4J9H A; 1TUD A; 2CH4 W; 2HEQ A; 1GBR A; 1WXB A; 2YDL A; 1PRL C; 2YUP A; 2W0Z A; 5HCK A; 1WIE A; 1SHF A; 2EYW A; 2HBW A; 2CSI A; 2GNC A; 2KT1 A; 4FSS A; 2K6D A; 2RQR A; 2AKK A; 2RPN A; 5EC7 A; 2W10 A; 2DYB A; 1KIK A; 2MOX A; 2CT3 A; 4RTX A; 2F2V A; 1X69 A; 2JW4 A; 2GTO A; 4GLM A; 4OMM A; 2J7I A; 1QKX A; 2AZS A; 3EG0 A; 1KJW A; 1UEC A; 1E7O A; 1Z9Q A; 1UJ0 A; 2MCN A; 1SEM A; 4Z89 A; 1I1J A; 4ORZ A; 1YP5 A; 2L0A A; 1ABQ A; 2K3B A; 2DVJ A; 1JQQ A; 3TSZ A; 2KE9 A; 1ZLM A; 2KR3 A; 2RQV A; 3TSW A; 2DL8 A; 1NEB A; 1CKA A; 1M3C A; 2DL3 A; 1H8K A; 1NG2 A; 2CDT A; 1U3O A; 3QWY A; 4J9F A; 4JJC A; 2K7A A; 3EHQ A; 3M0R A; 2JMC A; 3O5Z A; 2EGA A; 3H0F A; 2H8H A; 4JPB W; 1M3A A; 4JZ4 A; 1GCQ C; 1JXM A; 1NLO C; 2C0I A; 2C0T A; 1E6H A; 2DM1 A; 2LQN A; 4ESR A; 4HXJ A; 2LX7 A; 1ZX6 A; 2RF0 A; 1JO8 A; 2KRO A; 2PNI A; 1ABO A; 2LP5 A; 2FPE A; 1GL5 A; 5FWC A; 4LNP A; 4AFZ C; 1X2K A; 1S1N A; 1YCS B; 1WDX A; 1AZE A; 2DNU A; 1ZSG A; 1WLP B; 3ZL7 C; 3THK A; 2M51 A; 3NPF A; 1WX6 A; 4JZ3 A; 1ZUY A; 3M0Q A; 2KRS A; 2QDL A; 2ED1 A; 1K9A A; 4R0K A; 3EHR A; 2A37 A; 2J6K A; 1AOJ A; 2EVR A; 2DL7 A; 3I9Q A; 2NUZ A; 1BU1 A; 2JTE A; 1CKB A; 2J6F A; 3U23 A; 2EGC A; 1UGV A; 1UG1 A; 2LJ1 A; 4RTU A; 1RLQ C; 2X3W D; 1TG0 A; 4F17 A; 1JU5 C; 1AEY A; 4Y92 A; 2DRM A; 1B3Q A; 1IO6 A; 1B07 A; 4HCK A; 1RLP C; 2GGR A; 2DIL A; 1T0H A; 1X6G A; 2DBK A; 2X3X D; 4OMN A; 4AFQ C; 2FO0 A; 5IXF A; 1Z9Z A; 4HVW A; 4RTT A; 1AWJ A; 4CC2 A; 4ZNX A; 3REB B; 1RI9 A; 2EQI A; 3VS0 A; 2LJ0 A; 2DL5 A; 1M8M A; 1PWT A; 2K79 A; 5IH2 A; 1VYV A; 1X27 A; 2J06 A; 1SRM A; 1KSW A; 1T3S A; 2RN8 A; 1SPK A; 4LE9 A; 2BZX A; 1HSQ A; 2EPD A; 3IQL A; 3SHW A; 2D1X A; 1AWW A; 1I0C A; 4J9I A; 1G2B A; 3EG3 A; 2LCS A; 2KXD A; 4IIM A; 1KFZ A; 2D8J A; 2DBM A; 2KYB A; 1UJY A; 2F2X A; 4J9D A; 4M4Z A; 1NLP C; 4JJB A; 3REA B; 2CRE A; 1N5Z A; 3NHN A; 1MV0 B; 5ECA A; 1NEG A; 1UHC A; 4F16 A; 1UDL A; 1UHF A; 5IXB A; 3PE0 A; 1X6B A; 1HJD A; 1OOT A; 1WXT A; 2HCK A; 3M0P A; 2CH4 A; 1VYU A; 2EKH A; 1TUC A; 2JT4 A; 2EBP A; 2K2M A; 2ROL A; 2D0N A; 4AG2 C; 3VRY A; 2O9V A; 2OI3 A; 2RQW A; 4QT7 A; 4CC4 B; 1Y0M A; 3RNJ A; 1W6X A; 1K0S A; 1HD3 A; 1EFN A; 2DA9 A; 2KBT A; 2JXB A; 5I11 A; 2JM9 A; 2DMO A; 3SEM A; 2YSQ A; 2LQW A; 2HSP A; 4J9B A; 2FRY A; 1W1F A; 2LMJ A; 4HVU A; 2YUO A; 3NGP A; 1PNJ A; 1AZG B; 1K0X A; 3UAT A; 1FMK A; 1AWO A; 2CUD A; 4AFS C; 4Z8A A; 2DX1 A; 3VS5 A; 2L3P A; 1T0J A; 1WYX A; 2E5K A; 1G83 A; 2KYM A; 1ARK A; 1WI7 A; 2KXC A; 3VS7 A; 3A98 A; 4Z88 A; 2DF6 A; 2L2P A; 3VS2 A; 1M27 C; 1YN8 A; 2EYY A; 3UA6 A; 4LUE A; 1FYN A; 3VS4 A; 4D8D A; 1VYT A; 2CSQ A; 1GCQ A; 2VVK A; 2G6F X; 1T3L A; 2PTK A; 1CSK A; 2KGT A; 2KEA A; 4RTZ A; 1JEG A; 1K4U S; 2GBQ A; 1PKS A; 2LJ3 A; 3ULR B; 2I0N A; 3C0C A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2HD0 A; 3PTA A; 3MEU A; 2LT1 A; 4C92 B; 1GFC A; 1AVZ C; 2KT8 A; 1VUB A; 3CCJ T; 1VQ5 A; 2YT6 A; 1BIB A; 3PVL A; 3X24 B; 5GAN j; 5GJW B; 3OBY A; 1RAH B; 4M7A G; 2CP7 A; 2DXC A; 1MV3 A; 2DLP A; 4MDX A; 1PRM C; 3LLR A; 1A0N B; 1PSF A; 1WJQ A; 3LX7 A; 3V7C A; 4CC7 A; 2J05 A; 1WXU A; 3CPW S; 4J9G A; 4C8Q F; 4K11 A; 1MHN A; 4E7H A; 3BDU A; 5GAM d; 2O9S A; 3Q1J A; 4M75 C; 2PQW A; 1YJ9 A; 3LWI A; 4AT1 B; 4M77 B; 2GCX A; 2COZ A; 3L2U A; 1GFD A; 4M7D B; 4HCC A; 2D8H A; 1WFW A; 2VXE A; 2LZ6 B; 4J7I A; 1QVF S; 2SEM A; 3MP8 A; 5KYU A; 3G6E Q; 1Q81 C; 1RUW A; 2ECZ A; 1QCO A; 1K76 A; 3H0I A; 2KI7 A; 3PGG A; 4M77 D; 4J6Y A; 1M90 U; 4M7D D; 2HQE A; 4C5E A; 4NS5 A; 1VQL A; 3EGD A; 2QA4 T; 1YWO A; 4FW1 A; 2L3S A; 2XK0 A; 2K5I A; 2DJQ A; 3M0T A; 4RTY A; 1JRI A; 4GBQ A; 2XDP A; 2O01 E; 1QLY A; 3EG2 A; 5LJ3 h; 4PJO E; 2DYI A; 3H6Z A; 3M0S A; 2EQK A; 2V1R A; 4IIO A; 3CXC P; 1H92 A; 3PMI A; 2A0F B; 3CQT A; 4LXC A; 1X01 A; 4AFU C; 1M3B A; 3MEV A; 3CPF A; 4DBR A; 4LUD A; 2CZ1 B; 5LJ3 g; 4LN2 A; 3EFS A; 2E65 A; 2FEI A; 4FM4 B; 3CC4 Q; 2OAU A; 2GTJ A; 4PJO F; 5FWB A; 3WVE B; 2CZ0 B; 2A28 A; 2PVD B; 2RNA A; 4XU3 A; 4PNO A; 1BBZ A; 2E3H A; 1PM3 A; 1ZUK A; 4XTZ A; 1K9M U; 3OYH A; 1OU9 A; 2XKO C; 1K1Z A; 4BDY A; 5CKB A; 2VXF A; 2QQS A; 3H41 A; 4M78 E; 4EMK B; 3QZ9 B; 4E2F B; 1D0Z A; 4OMQ A; 2VWF A; 1Y57 A; 1MMN A; 4XK8 E; 1KD1 U; 1UUE A; 4FT2 A; 2DEQ A; 2X4W A; 4J5Y A; 1H3Z A; 5LJ5 e; 5GAN 8; 3G6E A; 1UTI A; 4RTV A; 4M77 C; 5KYN A; 2LTO A; 4M7D C; 1KHI A; 3OS5 A; 2QK0 A; 4LDY A; 2DVE A; 4Y91 A; 2CH4 W; 1B7T A; 2HEQ A; 3RR6 A; 1GBR A; 3OBW A; 3JCM c; 2GF7 A; 4FYX B; 3JCM J; 2FB7 A; 3V7S A; 3CPW A; 3A8L B; 2GNC A; 2KT1 A; 3LGL A; 4O6J A; 3M9Q A; 4BUG A; 4ANJ A; 3AHU A; 1WPY A; 1Q7Y U; 2HAX A; 2P84 A; 2PUK B; 4DOW A; 3JCM V; 2CT3 A; 4MMK A; 4QQG A; 2LQK A; 4C0F A; 5CAI A; 3G4S A; 1QVF A; 4OMM A; 2GTO A; 1SSF A; 3FDR A; 3E9F A; 2J7I A; 1QKX A; 2AZS A; 4ZGJ B; 1KJW A; 5GMK i; 1Z9Q A; 1U1T A; 1D09 B; 1I1J A; 5J26 A; 4M7A D; 1JQQ A; 5CQY A; 2QA4 Q; 3G1J A; 4M75 A; 2EQJ A; 2YRD A; 1H8K A; 5KCH A; 4JJC A; 4JLI A; 3E9G A; 3OSV A; 2CZ7 B; 2D9T A; 2NYS A; 2ZPI B; 1KG1 A; 2QEX A; 2C0T A; 1E6H A; 3HFO A; 3RKY A; 2LX7 A; 5KCO A; 2E64 A; 2DXB A; 4ZGE B; 3R6O A; 2DZC A; 1GL5 A; 2ZPE B; 1S1N A; 1YCS B; 4XU2 A; 6AT1 B; 4IUT A; 2RA2 A; 9ATC B; 2Y90 A; 1WLP B; 3M54 A; 1FMV A; 3SDZ A; 3CCJ A; 1LPL A; 3CD6 T; 2KRS A; 2QDL A; 5CKF A; 1UGS B; 1YIT A; 2RJF A; 2XID A; 3OYY A; 4OF1 A; 2JN0 A; 3ZFJ A; 1BU1 A; 3I55 T; 2JTE A; 4PFZ A; 2J6F A; 5LJ5 g; 3L2W A; 4FT4 A; 3A1P A; 2PVO B; 1UGV A; 1UG1 A; 4ZTJ A; 2EJF A; 2LJ1 A; 4RTU A; 2DTH A; 2RK1 A; 3TQ7 P; 2X3W D; 1N9R A; 3MKD A; 1IO6 A; 4CI0 C; 3S3N A; 3HSB A; 2DIL A; 1T0H A; 2CGH A; 5IXF A; 3HTR A; 3L2R A; 3CXC A; 1QMC A; 1KHC A; 2DTO A; 5GAN d; 5GAO r; 2K79 A; 3O8V A; 2ZCF B; 2RN8 A; 4LE9 A; 3V8L A; 3CCS T; 1FXX A; 4ELZ C; 2DK3 A; 3DLL A; 3CC2 A; 2QA4 A; 1U1S A; 4C5G A; 2P0P A; 2QXF A; 3EG3 A; 2QGG A; 2DEU A; 1VQ5 T; 4XU1 A; 2NUP B; 4KGZ B; 2BUD A; 1VIF A; 3CME T; 2F2X A; 1K8A U; 2ZPH B; 1OX8 A; 2F5K A; 2HSE B; 1D1A A; 3QO3 A; 4A4H A; 3OMG A; 4IUV A; 1WHJ A; 2RJD A; 3REA B; 4M77 A; 2L3R A; 4M7D A; 1D3B B; 4E7J A; 3NHN A; 1MV0 B; 4F16 A; 3VUZ A; 2DFU A; 2RB6 A; 1UHF A; 1TSF A; 2IPO B; 4A4E A; 4X34 A; 3ER0 A; 1X6B A; 1HJD A; 1OOT A; 2DPP B; 4QQD A; 2K5L A; 2NUT B; 2K2M A; 3QYH B; 1M9S A; 4QT7 A; 1Q86 U; 1Y0M A; 1W6X A; 4KH0 B; 2RI2 A; 4KGX B; 2QGF B; 2F5T X; 2LVM A; 5I2M A; 1LVK A; 2XU8 A; 5I11 A; 3RER A; 1LOJ A; 4F7U E; 2Y4X A; 3QXE B; 5D6X A; 2DO3 A; 1RAI B; 1VQL T; 3WXM B; 1W1F A; 3CCV A; 3N5B B; 4FW2 A; 2ZZD A; 2BE7 D; 3MCA B; 1FMK A; 2CUD A; 4E7I A; 4AFS C; 2DX1 A; 3VS5 A; 2HMA A; 4C92 G; 3EAE A; 1RAF B; 2XI9 A; 2E4H A; 2RO0 A; 3OS1 A; 3VS7 A; 8ATC B; 2RI5 A; 3P8D A; 3CD6 Q; 1QVG P; 4F7U F; 2WSE E; 1XQH A; 1VYT A; 1Y96 B; 1MGQ A; 1T3L A; 2PTK A; 5GAM g; 3QDF A; 4KBM B; 4IUR A; 3I55 Q; 3M4Y A; 4V2S A; 1K4U S; 2GBQ A; 1K9M C; 1X6O A; 5FRO A; 4E6R A; 4O5V A; 4M77 G; 5HY6 A; 4M7D G; 2YUQ A; 3OYD A; 1SRL A; 2IIM A; 1KD1 C; 2QTX A; 3OYA A; 3I5S A; 3M5A A; 4X9C A; 2ENM A; 2AZV A; 4L6V 5; 2XG8 D; 1GCP A; 1RL2 A; 4EPC A; 4JS4 A; 1D0Y A; 1D1C A; 3GBQ A; 1VQM A; 2DXT A; 3NTK A; 1NJI U; 2CUB A; 2MPX C; 1NPR A; 3EH2 A; 4HVV A; 3NMZ C; 3CCS Q; 1QP3 A; 3CMA Q; 2YLB A; 4B9X A; 4XU0 A; 4DEX A; 1QVG S; 3LYI A; 5AYF A; 1V1C A; 3CCQ A; 2ESW A; 4C0Z A; 1OEB A; 1VQ5 Q; 2X35 A; 2VYT A; 1Q7Y C; 3CME Q; 1N27 A; 1X2Q A; 2HDA A; 3RUX A; 2J6O A; 2BZ8 A; 3UA7 A; 3PIO A; 3A8O B; 2E1H A; 4M75 F; 3VS6 A; 2OX7 A; 4XQ3 A; 4ZN3 A; 3OB9 A; 3M58 A; 1YFN A; 5LL6 S; 1RAG B; 2CS7 A; 2RHX A; 1RI0 A; 3HP9 A; 3NTI A; 2BTT A; 1WZO A; 2H3J A; 2OTJ T; 1PHT A; 2LCL A; 2RQT A; 3HHT B; 1Q7Y R; 4BD3 A; 2KAF A; 4JRI A; 5GAN 5; 3G4S T; 2E12 A; 3CD6 A; 1MNE A; 1QP2 A; 3FLG A; 2O88 A; 3JB9 F; 2PVG B; 3F70 A; 4NOY A; 1VA7 A; 3NTH A; 4OMP A; 4E7S A; 3C4S A; 3CCE T; 3I35 A; 5GAO l; 3I55 A; 5GJV B; 1VQL Q; 2DTI A; 4DQ2 A; 2HL5 C; 1VOM A; 1I8F A; 1J3T A; 3HRS A; 2ABL A; 1VQO T; 3I5R A; 2MI6 A; 2CP5 A; 3MHX A; 1WHH A; 2X4Y A; 3VRZ A; 1G3W A; 4OB0 B; 4RG8 A; 2KY9 A; 1M1K U; 4OB2 B; 2PZ1 A; 4FYV B; 5CIU A; 4PJM A; 1YWP A; 3FJP A; 4QVZ A; 2R57 A; 1VQK T; 4OMO A; 3HFN A; 4OB1 B; 4C8Q E; 2OJ2 A; 3SFM A; 1MMD A; 2XDB A; 2MIO A; 4WF2 A; 3VV0 A; 1PKT A; 1IHW A; 4PLI A; 1PD0 A; 1UFF A; 3EG9 B; 1X43 A; 3QHS A; 4IUP A; 3UPU A; 4II1 A; 4D6W A; 3A8G B; 1I5L A; 3CME A; 2VGM A; 1YIT T; 5LJ3 j; 4EMH A; 2QQA A; 2FPF A; 3OYL A; 4M78 G; 1UE9 A; 2MWP A; 4C92 D; 2KRM A; 4FL6 A; 3L2Z A; 1WHK A; 5L23 A; 3LH0 A; 3JAM E; 3QKJ A; 1EX4 A; 1TUD A; 1X75 C; 1R8O B; 2V8J A; 2EYQ A; 5IAY A; 4KUD K; 2YDL A; 3MP1 A; 2RI3 A; 4VUB A; 1PRL C; 4Q5W A; 5HCK A; 1WIE A; 1EIF A; 5AT1 B; 2K6D A; 2W10 A; 4J7F A; 4J6X A; 1QVG A; 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