The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
61
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structure length |
61
|
Chain Sequence |
VTLFVALYDYQADRWTDLSFHKGEKFQILDASPPGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
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| molecule keywords |
CHYMASE
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| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
12
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| structure length |
61
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| sequence length |
61
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LJ0 A; 3THK A; 2KNB B; 3I9Q A; 4RTU A; 1YP5 A; 2PNI A; 4CC4 B; 4QT7 A; 1YWO A; 1KSW A; 1WI7 A; 3H0F A; 2FRW A; 3EG3 A; 2FPD A; 2GTJ A; 2L3Q A; 2FEI A; 2GGR A; 2HDA A; 4OMQ A; 2V1Q A; 1WX6 A; 2LZ6 B; 4A63 B; 3M0P A; 2EGC A; 4LN2 A; 3R6N A; 2K2M A; 2PZ1 A; 2OI3 A; 4RTX A; 1S1N A; 1Y0M A; 2BZY A; 2YUQ A; 1M3B A; 1G83 A; 3UA7 A; 2RQR A; 1K1Z A; 4RTW A; 4EIK A; 2YUN A; 1UEC A; 1YWP A; 1ABQ A; 2EPD A; 2FG0 A; 2K6D A; 3PVQ A; 3REA B; 3JV3 A; 2KEA A; 5IHK A; 3I5S A; 4JJD A; 2ECZ A; 1Y57 A; 2J6O A; 2LP5 A; 3EGU A; 1WYX A; 4CC7 A; 3VS4 A; 3PE0 A; 2RF0 A; 2DJQ A; 2DYB A; 2K9G A; 1X6B A; 1W70 A; 3LH5 A; 4OMP A; 1E7O A; 4JZ4 A; 1UGV A; 2VWF A; 1UE9 A; 5HCK A; 1MV0 B; 1GRI A; 1ZLM A; 1VYT A; 1PKT A; 1B07 A; 1UHF A; 2A37 A; 4RTY A; 2AZS A; 2EBP A; 2K7A A; 4ZNX A; 2JS0 A; 3EHR A; 2PTK A; 4KRT A; 3UA6 A; 1SPK A; 1K0S A; 1BBZ A; 1UJY A; 2DRM A; 3KFV A; 4J9B A; 4OMO A; 3VS2 A; 2EQI A; 4OMN A; 3M0S A; 4Z88 A; 2HCK A; 2MOX A; 1BK2 A; 5FWC A; 1UG1 A; 2DL3 A; 2EW3 A; 3PVL A; 2SRC A; 4J9G A; 2EVR A; 4X1V A; 1NG2 A; 2DMO A; 2H8H A; 5I11 A; 1NEB A; 2J06 A; 2O9V A; 1M3A A; 5FW9 A; 3UAT A; 2G6F X; 2DL5 A; 2YT6 A; 1QWE A; 1YN8 A; 2CRE A; 1T0J A; 2KRO A; 2DLP A; 3M0T A; 5I22 A; 1BU1 A; 3TSW A; 1JQQ A; 2KRM A; 1WDX A; 1ZUK A; 2L3P A; 1ZSG A; 5EC7 A; 1ZBJ A; 5FWB A; 4LUD A; 1HD3 A; 2O2O A; 2LNH B; 3GBQ A; 4Z8A A; 2DE0 X; 4K11 A; 1GCP A; 2LQW A; 3RBB B; 1AWX A; 2YSQ A; 2BTT A; 2K3B A; 2RMO A; 1ZX6 A; 1U06 A; 1E6H A; 2W0Z A; 1GL5 A; 2HSP A; 1WA7 A; 2CUD A; 4FSS A; 2K79 A; 1VYV A; 2KYB A; 2AZV A; 1OV3 A; 1UFF A; 3H0H A; 1W6X A; 2DVJ A; 3VS3 A; 1TUC A; 4ESR A; 4J9D A; 1M30 A; 1WXT A; 1AOJ A; 1X2K A; 2ESW A; 4GLM A; 4J9I A; 1JXO A; 1K9A A; 3VS0 A; 3A98 A; 3RNJ A; 1WLP B; 4AG2 C; 2YDL A; 2AKL A; 2FRY A; 2J05 A; 1NLP C; 2YUP A; 1WFW A; 4E6R A; 2L3S A; 2DM1 A; 1SHF A; 1WXU A; 3EG2 A; 1YCS B; 2CSQ A; 1UHC A; 1H8K A; 3NMZ C; 1QKW A; 2OAW A; 3ZL7 C; 2M0Y A; 2CT3 A; 4JPB W; 1WIE A; 2HEQ A; 1HJD A; 2B86 A; 2ROT A; 1TG0 A; 1GBR A; 1I07 A; 5IHN A; 4HCK A; 1A0N B; 1GCQ A; 2CDT A; 2KXD A; 1NYG A; 1JU5 C; 1QWF A; 3IQL A; 1E6G A; 2JXB A; 4J9F A; 1X69 A; 2OJ2 A; 4AFU C; 1GCQ C; 2GNC A; 2D1X A; 1JEG A; 3I5R A; 1KFZ A; 1HSQ A; 2DRK A; 1CKA A; 2X3W D; 4AFQ C; 2DF6 A; 3QWX X; 2V1R A; 2JM9 A; 1FMK A; 2YUO A; 2RQT A; 4RTT A; 1SHG A; 1KJW A; 1NLO C; 1UUE A; 1IO6 A; 2QDL A; 2MIO A; 4CC2 A; 4JJB A; 2P4R A; 1NYF A; 3TSZ A; 4AFS C; 1AD5 A; 2D0N A; 4ORZ A; 2RQV A; 1GBQ A; 2DL7 A; 4LNP A; 1T0H A; 2JW4 A; 2DX1 A; 1H92 A; 2KXC A; 1JO8 A; 2SEM A; 2EGE A; 3VRY A; 3VS7 A; 5ECA A; 1PNJ A; 1AVZ C; 2KYM A; 3H41 A; 1B3Q A; 2HBW A; 1ARK A; 5IHI A; 1M8M A; 1Z9Z A; 1YNZ A; 1W1F A; 5GJW B; 1OPK A; 2KRN A; 5L23 A; 2JM8 A; 2X3X D; 1OOT A; 1LCK A; 2L0A A; 2RQU A; 1EFN A; 1ZUY A; 1PHT A; 2DNU A; 4OMM A; 2XMF A; 1VA7 A; 3VS6 A; 1RLQ C; 2ABL A; 1PWT A; 1U5S A; 2CSI A; 4D8D A; 1I0C A; 1AWO A; 2IIM A; 2LMJ A; 1QLY A; 2JMA A; 2DA9 A; 4M4Z A; 2DL4 A; 2JT4 A; 2RPN A; 1AZG B; 1X43 A; 1VYU A; 4JZ3 A; 4IIO A; 2D8J A; 3EHQ A; 5IH2 A; 2I0N A; 4AG1 C; 2CH4 A; 2KBT A; 1M3C A; 3O5Z A; 2KT1 A; 4D8K A; 1U3O A; 2KR3 A; 3SHW A; 4DEX A; 1RUW A; 2BZX A; 2L2P A; 4RTZ A; 3M0U A; 4HVU A; 1N5Z A; 1AZE A; 2A08 A; 2DL8 A; 2O31 A; 1OPL A; 4LE9 A; 2LJ3 A; 1MUZ A; 1TUD A; 1RI9 A; 1G2B A; 4GBQ A; 2E5K A; 4WCI A; 3ULR B; 1UTI A; 1V1C A; 1SRM A; 2GBQ A; 3VS1 A; 1NEG A; 1CSK A; 2M51 A; 2W10 A; 1FYN A; 2KGT A; 2AK5 A; 2GTO A; 1NM7 A; 2LX7 A; 4IIM A; 3REB B; 1X6G A; 3H0I A; 2C0I A; 2ED0 A; 2KT8 A; 4F16 A; 1X27 A; 2DBK A; 1UDL A; 2VVK A; 1ABO A; 4F14 A; 2CUB A; 1M27 C; 4F17 A; 4Z89 A; 1BB9 A; 1UJ0 A; 3NPF A; 3VRZ A; 1SRL A; 4R0K A; 2J6F A; 2LQN A; 2JS2 A; 3M0R A; 2O88 A; 4RUG A; 1AEY A; 2ED1 A; 3VS5 A; 2RN8 A; 3QWY A; 3C0C A; 5GJV B; 2NUZ A; 5IXB A; 1Z9Q A; 4HVV A; 2KE9 A; 2FPE A; 4JJC A; 1OEB A; 1SSH A; 2LCS A; 2EYX A; 4Y92 A; 2FPF A; 2NWM A; 2C0O A; 2DBM A; 1ZUU A; 1KIK A; 4HVW A; 2MCN A; 3EG0 A; 2EYW A; 1CKB A; 1K76 A; 3TVT A; 1PRM C; 2RQW A; 2A28 A; 2RNA A; 2GQI A; 1GFC A; 3M0Q A; 1WXB A; 4LUE A; 1T3L A; 5IXF A; 2KRS A; 1PKS A; 1MV3 A; 2F2V A; 2EKH A; 2F2W A; 2F2X A; 4AFZ C; 4HXJ A; 1QKX A; 1QCF A; 2C0T A; 2J7I A; 2VKN A; 3EG1 A; 4DEY A; 2EYZ A; 2LJ1 A; 1SEM A; 1GFD A; 2CT4 A; 2A36 A; 2ROL A; 1I1J A; 4J9E A; 1K4U S; 2FO0 A; 2ENM A; 1RLP C; 1AWJ A; 2D8H A; 3NGP A; 1X2Q A; 4J9C A; 1H3H A; 2DIL A; 1K0X A; 3SEM A; 4OML A; 2J6K A; 4RTV A; 2CH4 W; 1PRL C; 3NHN A; 1JXM A; 2O9S A; 2JTE A; 2AKK A; 4J9H A; 1AWW A; 2BZ8 A; 3UF4 A; 1J3T A; 3FJ5 A; 2EYY A; 1T3S A; 3I35 A; 4CC3 A; 2JMC A; 3CQT A; 1XOV A; 3U23 A; 2EGA A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3OA6 A; 3EG9 A; 1G3Y A; 2HL3 A; 3EAE A; 3OYM A; 2KMT A; 1B34 B; 5A0D A; 4OF1 A; 1BIB A; 2FRW A; 2WSC E; 2FPD A; 2QGF B; 2GGR A; 1IRX A; 3CXC P; 1WX6 A; 1JJ2 A; 4C0D B; 3CCQ Q; 1WHH A; 1MGQ A; 1G3S A; 2YUQ A; 3OYG A; 3D7S B; 2DPP B; 3DKM A; 1K1Z A; 1W4S A; 4RTW A; 2ZPF B; 1K9M C; 2AT1 B; 2QA4 Q; 1FMW A; 3VUB A; 1UEC A; 3REA B; 3JV3 A; 2KEA A; 2MWO A; 2K3Y A; 1QVG A; 2LP5 A; 5GAM e; 3CC4 Q; 4XAX B; 2DYB A; 3JCM g; 1E7O A; 3EGX A; 1GXI E; 1FWZ A; 2K3X A; 4JZ4 A; 4EPC A; 2BE7 D; 5HCK A; 2K2V A; 1WHG A; 1GRI A; 3FJP A; 1VYT A; 1H3Z A; 1B07 A; 2P0Q A; 1OU8 A; 4B9X A; 1UHF A; 1KD1 U; 1VQ4 A; 1QW1 A; 2EBP A; 2K7A A; 2ZPE B; 3EHR A; 4RCB A; 4CI0 C; 4DQ2 A; 5GAN f; 4KRT A; 1PC0 A; 4J9B A; 4M75 D; 1ZSZ A; 3PTA A; 1BK2 A; 2F5K A; 1UG1 A; 1WJR A; 1N9R A; 2EW3 A; 1XQH A; 2SRC A; 1PG5 B; 1RAI B; 1NG2 A; 2DMO A; 2H8H A; 2KY9 A; 1Q82 C; 1M90 R; 2O9V A; 4QQD A; 1NJI U; 4FT2 A; 2DL5 A; 1O75 A; 5FRO A; 1QCN A; 4E7L A; 2E3H A; 4PJO E; 4KBM B; 2EKO A; 2NUT B; 1JQQ A; 4E2F B; 4JRQ A; 1WDX A; 2A7Y A; 4NS5 A; 5DLO A; 3CEY A; 3CXC S; 4BE0 A; 4E7J A; 3JB9 J; 1HD3 A; 1WHJ A; 5C0M A; 3JRZ A; 2DE0 X; 3G6E T; 3RBB B; 3I55 Q; 1YJ9 T; 2K3B A; 2DZC A; 2QTV A; 2BIV A; 1GL5 A; 3E19 A; 2D0Q B; 3V7C A; 3OBW A; 2HBP A; 1KK7 A; 1C0M A; 4LDW A; 1W6X A; 4ESR A; 4PJO A; 2HAX A; 3L2U A; 1K9A A; 2XHC A; 2VXF A; 3A98 A; 1WLP B; 4PLL A; 4DBQ A; 4AG2 C; 2YDL A; 1S72 A; 4PJO C; 2KK4 A; 4JS4 A; 2VYT A; 3JCM b; 3QZ5 B; 4KUD K; 5GAM h; 2DM1 A; 1SHF A; 3CC7 Q; 3EH1 A; 1H8K A; 4M7D F; 2FZG B; 3NMZ C; 3HRT A; 3LGF A; 3C12 A; 3CBM A; 3KBG A; 5GAO q; 1WIE A; 3CD6 A; 3V8K A; 3OW2 P; 2VC8 A; 2QGG A; 4F7U G; 1I07 A; 3CCL Q; 4HCK A; 3QJ6 A; 3A8H B; 3CCJ Q; 2H3J A; 1D3B B; 1JU5 C; 1K9M R; 1HXD A; 2ZPB B; 2OJ2 A; 2PQW A; 1LPL A; 1JEG A; 2QG9 B; 1Q86 C; 1CKA A; 3C4S A; 1Y96 B; 4ZGE B; 2V1R A; 1D1A A; 2E6N A; 2YLC A; 2K57 A; 3ZBD A; 5GMK i; 1BCO A; 1YJW T; 3MEW A; 5IAY A; 1VQ6 T; 1WQW A; 3G6E A; 2MIO A; 4M7D B; 2DEU A; 2PUO B; 3TSZ A; 1M1K C; 4HT9 A; 1YJ9 A; 4DOW A; 4OVA A; 4J8O A; 5GAN 4; 1VQ8 Q; 1VQL Q; 5HY6 A; 1T0H A; 1VQM T; 5D6X A; 2D6F A; 1O9S A; 2LRQ A; 3EG9 B; 4IUV A; 2EGE A; 1BCM A; 2O01 E; 4FL6 A; 2MMP A; 1SSF A; 1K8A C; 2HBW A; 1NE8 A; 1QVF A; 5KYY A; 2PVD B; 3WVE B; 3V8L A; 1YNZ A; 1W1F A; 2IPO B; 4E7S A; 1OPK A; 2KRN A; 1OOT A; 2RQU A; 3FEO A; 3CCR T; 4OMM A; 2LT4 A; 2DET A; 3ME9 A; 1PWT A; 4IUP A; 9ATC B; 3PIP A; 4RCC A; 4VUB A; 1I0C A; 1AWO A; 2AHJ B; 2IIM A; 2LMJ A; 4MZM A; 4C92 G; 3CCM Q; 4FYV B; 3LWI A; 3LGL A; 3OYC A; 2RPN A; 1AZG B; 3OW2 S; 1VYU A; 2LNV A; 3MP6 A; 5GAN 5; 2DO3 A; 2HQE A; 5KCH A; 3CBP A; 4XU3 A; 2KT1 A; 3SHW A; 3OYD A; 4DEX A; 1RUW A; 4A4H A; 2BZX A; 4RTZ A; 3EGX B; 3MEA A; 4C5H A; 1QVP A; 4M77 D; 4NL3 A; 2VUB A; 2KVQ G; 2ZGW A; 5GAN d; 2ZCF B; 2JTF A; 4GBQ A; 1BKB A; 3M53 A; 3ULR B; 1QCO A; 3JCM J; 2MYS A; 1YJW A; 2YLB A; 1VQ6 A; 1VQO T; 5GMK l; 3GF5 A; 3M4G A; 1ZSZ B; 3OY9 A; 1Q7Y C; 2LX7 A; 1U1S A; 3CPF A; 4IIM A; 2NUP A; 3MPU B; 1VQM A; 1X6G A; 2JOY A; 2FVU A; 5CR2 A; 2ED0 A; 4RG2 A; 4M78 F; 1M5Q 1; 1U1T A; 2YRD A; 2JUF A; 1Q95 G; 2LDM A; 1I4K 1; 3TRE A; 4C5G A; 4M75 G; 4R0K A; 3CME T; 1Q81 U; 1ZA2 B; 3CCR A; 3RUX A; 3C0C A; 5GJV B; 4IKF A; 5IXB A; 1Z9Q A; 1R0B G; 2Y4Y A; 2PUK B; 4PNO A; 1OEB A; 1Q86 R; 3PMT A; 3FRN A; 2NWM A; 2V8I A; 4LXC A; 1VIF A; 4F7U E; 1AT1 B; 1YHQ T; 5A2Q E; 2LTO A; 5M9O A; 3OSS C; 2XDD A; 3M55 A; 1YIT Q; 3GP8 A; 1PRM C; 2A28 A; 3RER A; 1M1K R; 4MMK A; 3OYH A; 3H8Z A; 3M0Q A; 1WXB A; 3MP1 A; 4LUE A; 4FCY A; 1BI2 A; 2F2W A; 1WZO A; 2C0T A; 2EYZ A; 1SEM A; 2F69 A; 2JTM A; 4C8Q G; 1WHL A; 2DXT A; 2OTL T; 2CT4 A; 5GAO p; 1K8A R; 3G4S T; 1RLP C; 4QQ6 A; 2GQV A; 2JVV A; 1X2Q A; 1H3H A; 2DIL A; 3QII A; 3OYJ A; 1VQO A; 4J9H A; 1AWW A; 4MDW A; 4KH1 B; 4EMH A; 2CS7 A; 1KQ1 A; 4F7U A; 2X4W A; 4OB0 B; 1KQ2 A; 1XOV A; 3U23 A; 5LJ3 e; 2QQA A; 3G71 T; 3DLL A; 1S72 Q; 3I9Q A; 2JN0 A; 4PLI A; 3RDV A; 1KQS P; 1YP5 A; 5D6W A; 4CC4 B; 4QT7 A; 1PSF A; 5GMK j; 3EFO A; 5HK0 A; 2HQX A; 3M54 A; 1KSW A; 3LH0 A; 4M7A D; 2MPX C; 3EG3 A; 2VV5 A; 3J80 E; 2CZ6 B; 2FEI A; 3CD6 Q; 3CME A; 2V1Q A; 3QSU A; 4A4G A; 5CKE A; 1MND A; 4XU2 A; 3X20 B; 3R6N A; 4FSX A; 5LJ5 f; 3G1J A; 4C92 E; 2COY A; 4FYY B; 1VQ5 T; 3UA7 A; 2F1L A; 2PVG B; 1ABQ A; 2R57 A; 3CCS Q; 2EQU A; 4IUT A; 2FG0 A; 4JUV A; 3I56 T; 1YHQ A; 2RHX A; 1RL2 A; 2ECZ A; 1VQN Q; 1VQP Q; 2XI9 A; 4CC7 A; 3H9N A; 5KYX A; 3PIO A; 3VS4 A; 4EMK A; 2DJQ A; 2K9G A; 1D09 B; 1KG1 A; 4OMP A; 3LH5 A; 1Q7Y R; 1QMC A; 5KYY B; 3JCM X; 4EMK C; 1YJ9 Q; 1UE9 A; 1MV0 B; 4PFP A; 3KXT A; 1ZLM A; 5KYW A; 1VQ9 Q; 4JJN K; 2OTL A; 2A37 A; 4X34 A; 3G4S A; 3S3O A; 1PD1 A; 1D0X A; 3V8J A; 1K0S A; 1BBZ A; 2DRM A; 3KFV A; 1YIJ T; 4Z88 A; 4C92 C; 4L59 A; 3QYH B; 2MOX A; 5FWC A; 4R55 A; 4WF2 A; 3BY7 A; 2FHD A; 4PJJ A; 2EVR A; 3G71 A; 2EFI A; 2A3L A; 3GLX A; 3CC2 T; 5I11 A; 2J06 A; 3NTH A; 1KQS S; 5FW9 A; 1QP2 A; 2RI3 A; 3JCM e; 2YT6 A; 1ZQ1 A; 2LX9 A; 2RO0 A; 3V7S A; 1QWE A; 3CBO A; 1OU9 A; 5I2M A; 4C0F A; 2CRE A; 4M75 E; 1T0J A; 3RES A; 3CMA Q; 3WVD B; 1TS9 A; 3GPL A; 1VQK Q; 5I22 A; 1BU1 A; 3TSW A; 2K5F A; 1AHJ B; 1OI1 A; 2L3P A; 4FW1 A; 7AT1 B; 5GMK e; 3M57 A; 2CP6 A; 4K11 A; 2LQW A; 4DBF A; 1VQ5 A; 2CZ1 B; 2DKG A; 4KH0 B; 2BTT A; 4RG8 A; 2RMO A; 1ZX6 A; 1U06 A; 4OGE A; 1M4Z A; 2DIQ A; 3I56 A; 1N27 A; 2CUD A; 1UEB A; 2NUP B; 4C92 D; 1N8R C; 4M77 G; 1VYV A; 2AZV A; 3QDR B; 2QQ9 A; 8ATC B; 5FRN A; 1UFF A; 1XJW B; 3H0H A; 3VJP A; 3VS3 A; 2P0K A; 1K73 C; 1TUC A; 1M30 A; 4M75 A; 2AIR B; 1WXT A; 2DD5 A; 1X2K A; 1RAD B; 2HQH A; 3CCU T; 3J81 E; 4C8Q E; 2LQK A; 1VIE A; 5KE3 A; 4M75 C; 1OZ3 A; 4PJM A; 3QXE B; 2FRY A; 2XDP A; 1FX7 A; 5GAN 2; 2X35 A; 2CSQ A; 4FT4 A; 2QYZ A; 3LW5 E; 2OAW A; 3JB9 I; 3ZL7 C; 4EMG A; 4MZP A; 4JPB W; 2V26 A; 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