The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
78
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structure length |
78
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Chain Sequence |
GPYAQPSINTPLPNLQNGPFYARVIQKRVPNAYDKTALALEVGELVKVTKINMSGQWEGECNGKRGHFPFTHVRLLDQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
Trans isomer of Crk protein
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| publication title |
Structural basis for regulation of the Crk signaling protein by a proline switch.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
7
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| structure length |
78
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| sequence length |
78
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-09-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CT4 A; 2EVR A; 2KT8 A; 2CRE A; 2GNC A; 1B07 A; 1RLQ C; 1PHT A; 3R6N A; 4JJB A; 3EG0 A; 1GRI A; 3U23 A; 2HEQ A; 4AFU C; 2EQI A; 2LJ1 A; 5IHN A; 2LMJ A; 2O9V A; 1GFD A; 1YNZ A; 1FMK A; 1YCS B; 4LE9 A; 3NPF A; 3O5Z A; 1S1N A; 4JZ4 A; 2LQN A; 5FW9 A; 2JT4 A; 1U3O A; 3QWX X; 1YP5 A; 3EG3 A; 4CC3 A; 2I0N A; 1BBZ A; 4ORZ A; 1UDL A; 3H41 A; 1SPK A; 1Z9Q A; 2V1Q A; 1UUE A; 4OMP A; 1X27 A; 1AWO A; 2DL4 A; 1OPL A; 4RTU A; 3UF4 A; 2J06 A; 4R0K A; 3GBQ A; 5IXF A; 5L23 A; 5GJW B; 1H92 A; 3FJ5 A; 1WXU A; 2L0A A; 1M3B A; 2DYB A; 1NG2 A; 4LUE A; 1PKT A; 1AWX A; 2AK5 A; 2AZS A; 1X2Q A; 1AWJ A; 1LCK A; 2OI3 A; 4J9I A; 2O31 A; 2YUO A; 2FPD A; 2ECZ A; 2K2M A; 2D8J A; 1NM7 A; 2FPF A; 4CC4 B; 2BZ8 A; 1ABO A; 3TVT A; 5IXB A; 1X6G A; 1QCF A; 2SRC A; 1AVZ C; 1AEY A; 1X2K A; 2FPE A; 1UFF A; 1BK2 A; 2CT3 A; 2JTE A; 1SSH A; 3M0Q A; 2V1R A; 5IHI A; 2GTJ A; 1X43 A; 2EGE A; 3I5R A; 2JM9 A; 2KE9 A; 2X3X D; 2JS0 A; 1ABQ A; 2MOX A; 4LN2 A; 4ESR A; 2SEM A; 2DJQ A; 2J6O A; 3EG1 A; 5ECA A; 3PE0 A; 1E6H A; 2C0O A; 1ARK A; 2DBM A; 2L3P A; 2AZV A; 1KIK A; 2DM1 A; 3CQT A; 2BTT A; 1WYX A; 1NEG A; 2CH4 A; 2KXC A; 2QDL A; 3LH5 A; 4J9G A; 1U5S A; 1MV3 A; 2XMF A; 4HVU A; 1VYV A; 2KNB B; 2DL5 A; 2ABL A; 4A63 B; 4J9C A; 2OAW A; 2KRS A; 3VS0 A; 2DX1 A; 1UTI A; 2DE0 X; 2LZ6 B; 4DEX A; 1HSQ A; 1Y57 A; 1AWW A; 2P4R A; 2VWF A; 4QT7 A; 2PTK A; 1YWP A; 1AZG B; 1OOT A; 1W6X A; 2EKH A; 2DA9 A; 1TUD A; 1K76 A; 1M3A A; 2HCK A; 1W70 A; 4CC7 A; 1I1J A; 4J9D A; 2OJ2 A; 1T3S A; 1IO6 A; 2LP5 A; 2O88 A; 1B3Q A; 2D1X A; 1EFN A; 1BU1 A; 3VS7 A; 1KJW A; 1GL5 A; 4JJC A; 3UA7 A; 5IHK A; 2J05 A; 2L2P A; 4AFZ C; 4OMQ A; 1UG1 A; 1WDX A; 2VVK A; 1HJD A; 1OEB A; 2W0Z A; 1K1Z A; 1N5Z A; 2DMO A; 2LNH B; 2YUP A; 2GBQ A; 2KRO A; 4DEY A; 1K0S A; 2D8H A; 1T0J A; 1G2B A; 2C0I A; 1QKW A; 1OV3 A; 1PRM C; 1QWE A; 2YUN A; 4HXJ A; 1NYG A; 1GFC A; 2KBT A; 2F2V A; 3VS2 A; 1JQQ A; 1TUC A; 3EG2 A; 2EYY A; 2E5K A; 2RQT A; 2M0Y A; 4M4Z A; 2EBP A; 2DVJ A; 1HD3 A; 4J9F A; 2J7I A; 1JO8 A; 4FSS A; 1VYU A; 2YDL A; 4E6R A; 2JMC A; 2EGC A; 2KT1 A; 2DNU A; 3SEM A; 2KGT A; 2RNA A; 5FWB A; 2MCN A; 3VS1 A; 3RBB B; 3TSZ A; 3ULR B; 2DL3 A; 2HSP A; 2CUB A; 3I35 A; 2YSQ A; 1ZSG A; 2LQW A; 1M3C A; 1W1F A; 3M0S A; 2CSI A; 1SRL A; 2RMO A; 3I9Q A; 1WXT A; 2L3Q A; 4LNP A; 1WFW A; 4CC2 A; 1RI9 A; 2G6F X; 2EGA A; 4X1V A; 4OMM A; 3THK A; 1ZUY A; 5I22 A; 1WLP B; 1TG0 A; 2CDT A; 2O9S A; 1H8K A; 1JXO A; 1U06 A; 2NUZ A; 4Z89 A; 1RUW A; 1CKB A; 1G83 A; 1SEM A; 3JV3 A; 4OML A; 2DLP A; 2BZX A; 3NMZ C; 2C0T A; 2YUQ A; 2K9G A; 1WI7 A; 1AOJ A; 4RTW A; 2GQI A; 3KFV A; 2DF6 A; 2EW3 A; 4Z8A A; 2ESW A; 2MIO A; 4HVW A; 2GTO A; 1CSK A; 1SHF A; 2CH4 W; 3VS6 A; 3PVQ A; 4J9E A; 1KSW A; 2M51 A; 1T0H A; 1NLO C; 3IQL A; 3H0I A; 1PKS A; 2ENM A; 1SRM A; 1ZLM A; 2JS2 A; 2KYM A; 2PNI A; 2FRY A; 2A37 A; 3TSW A; 1K0X A; 2DRK A; 2W10 A; 4AG2 C; 4GBQ A; 2EYW A; 2H8H A; 1NLP C; 1MV0 B; 1WXB A; 1H3H A; 4OMO A; 4JJD A; 2FG0 A; 1UJ0 A; 4RTZ A; 1X6B A; 2EPD A; 2JXB A; 4IIO A; 3REA B; 1V1C A; 4RTT A; 2A28 A; 2RN8 A; 1XOV A; 1ZUU A; 1PRL C; 1CKA A; 2RF0 A; 3VS4 A; 2A08 A; 2K7A A; 3C0C A; 2DL7 A; 2DL8 A; 3VRY A; 2J6K A; 2PZ1 A; 1K4U S; 1UHC A; 3EHQ A; 2EYZ A; 5IH2 A; 3EHR A; 4J9B A; 2K79 A; 2FRW A; 2RPN A; 2VKN A; 2KRN A; 1AD5 A; 3VS3 A; 1UE9 A; 2ED1 A; 1RLP C; 2KXD A; 1AZE A; 5EC7 A; 4Z88 A; 4JZ3 A; 2JMA A; 4OMN A; 2KEA A; 2ROT A; 4Y92 A; 1GCP A; 2KYB A; 3UAT A; 3M0U A; 1M8M A; 1T3L A; 1UGV A; 1QLY A; 3NHN A; 2X3W D; 2DRM A; 2LJ3 A; 2YT6 A; 4AFQ C; 1E6G A; 3M0R A; 2HBW A; 2CSQ A; 1YN8 A; 1J3T A; 4JPB W; 2CUD A; 4J9H A; 2RQV A; 1ZBJ A; 3EGU A; 3SHW A; 2ED0 A; 1OPK A; 4F14 A; 2RQR A; 4D8D A; 1SHG A; 1GBQ A; 1Y0M A; 2RQW A; 2J6F A; 1ZUK A; 1I0C A; 1BB9 A; 4HCK A; 4F16 A; 2A36 A; 2HDA A; 2DIL A; 2EYX A; 1VA7 A; 2F2W A; 2L3S A; 4F17 A; 4RUG A; 2K6D A; 3A98 A; 3ZL7 C; 4IIM A; 2KRM A; 1QKX A; 1M27 C; 2B86 A; 2F2X A; 3VS5 A; 1JXM A; 1Z9Z A; 3I5S A; 4RTV A; 3RNJ A; 3VRZ A; 1MUZ A; 3H0F A; 4RTX A; 1UJY A; 2JW4 A; 1GBR A; 5I11 A; 1QWF A; 2AKK A; 1M30 A; 2BZY A; 2AKL A; 4WCI A; 2ROL A; 2JM8 A; 1I07 A; 2O2O A; 4ZNX A; 5GJV B; 1VYT A; 3PVL A; 4AFS C; 2K3B A; 3REB B; 4HVV A; 2DBK A; 1GCQ C; 1E7O A; 3QWY A; 1ZX6 A; 5HCK A; 2KR3 A; 4AG1 C; 1K9A A; 1YWO A; 4K11 A; 1A0N B; 2LX7 A; 1NYF A; 3M0T A; 4RTY A; 1X69 A; 1WA7 A; 2FEI A; 1NEB A; 5FWC A; 2D0N A; 2FO0 A; 3NGP A; 1FYN A; 1GCQ A; 4GLM A; 2LJ0 A; 1PWT A; 1UEC A; 1WIE A; 2GGR A; 1JU5 C; 3UA6 A; 2IIM A; 1PNJ A; 3M0P A; 2RQU A; 1KFZ A; 3H0H A; 2NWM A; 2LCS A; 1JEG A; 1UHF A; 4D8K A; 4LUD A; 4KRT A; 4EIK A; 1WX6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3OW2 P; 3I56 A; 2EVR A; 3VV0 A; 4C92 C; 2ZAE A; 1RLQ C; 1PHT A; 3LGL A; 3DB4 A; 3CC4 T; 1VQK Q; 2DET A; 1KC8 R; 5FRN A; 4C92 B; 5J26 A; 1WGS A; 2LMJ A; 4OB0 B; 2O9V A; 1YNZ A; 2P0Q A; 2RO0 A; 2X4W A; 1SF9 A; 5GAM e; 1D3B A; 4XU2 A; 2BE7 D; 1VQ4 T; 3O5Z A; 2L89 A; 1S1N A; 4OMF B; 4C92 A; 4C8Q F; 3QWX X; 3DLM A; 1RAA B; 4M7D C; 1OZ3 A; 4E47 A; 1BBZ A; 1FMV A; 1SPK A; 4OMP A; 1OPL A; 4RTU A; 2K57 A; 4E7J A; 2EJ9 A; 1VQL A; 4M7D B; 3GBQ A; 5IXF A; 3CCV A; 2L0A A; 1JB0 E; 3N5B B; 4C0Z A; 1K9M C; 3CCU Q; 4LUE A; 1PKT A; 1AWX A; 1LCK A; 2PU9 B; 2YUO A; 3QII A; 3EFO B; 2D8J A; 2DYI A; 5LJ3 f; 1MMG A; 4M75 A; 3CPW P; 1ABO A; 5IXB A; 2RD1 A; 4JUV A; 3DKM A; 1YJN Q; 3UT1 A; 2X4Y A; 1TOV A; 3LH0 A; 3M4Y A; 5GAO m; 1LNX A; 2V1R A; 4J6Y A; 5IHI A; 2MK5 A; 2EGE A; 2NLU A; 4ATO A; 3OYA A; 1Q82 R; 1ABQ A; 1HYO A; 2MOX A; 4LN2 A; 4E2F B; 3RDV A; 4E7S A; 2AZV A; 4FT2 A; 4E7H A; 2DZ9 A; 4BAC A; 3KXT A; 1WYX A; 4A53 A; 1U5S A; 4M7A E; 1VQ6 A; 1VYV A; 2FZC B; 2DTO A; 2ABL A; 1S72 T; 4J9C A; 3CXC P; 2DE0 X; 4KT0 E; 1HSQ A; 4PJL A; 1FWZ A; 4O5V A; 1U1T A; 5LJ5 e; 4QT7 A; 4C92 F; 4XU0 A; 1TSF A; 4JRI A; 1I4K 1; 3PIO A; 2RM4 A; 1O75 A; 2HCK A; 3CC7 T; 3QJ6 A; 1W70 A; 4CC7 A; 4J9D A; 2F5T X; 5D6X A; 4M77 D; 1OZ2 A; 2CP2 A; 1YHQ Q; 3V8K A; 3G4S T; 2RHX A; 4E7Z A; 3URG A; 1VQK A; 4PJO E; 5GAO p; 3UA7 A; 2LNV A; 1XTD A; 1KQS P; 5IHK A; 3JCM e; 3V8L A; 4AFZ C; 2KAF A; 1QW1 A; 2ZPB B; 2FHD A; 2RHU A; 4HCZ A; 4RG8 A; 5C6S A; 2YUP A; 2DMO A; 3HTR A; 2KRO A; 2ZPF B; 4PJO D; 4M75 F; 2C0I A; 1V76 A; 1OV3 A; 1OI1 A; 1QWE A; 2YUN A; 3LW5 E; 4BUG A; 2IVW A; 1YI2 Q; 2RB6 A; 3CCJ Q; 1QP2 A; 4NL2 A; 5CR2 A; 2OAU A; 1MMN A; 3EG2 A; 1W4S A; 2DVJ A; 3TEE A; 4J9F A; 3HKS A; 2ATC B; 3CCU A; 3D7S B; 2YDL A; 2CP7 A; 4EMK C; 2JMC A; 3SFM A; 1YJW T; 3OSS C; 4DOV A; 5FWB A; 5CQY A; 4J8O A; 1VQP T; 5LJ3 j; 3J81 E; 3JCM c; 2HMA A; 3SB2 A; 2EFI A; 3I55 Q; 3GIB A; 2CUB A; 4TVR A; 4XQ3 A; 2YSQ A; 4KUL A; 4EMK B; 2CSI A; 2EYQ A; 4N0A C; 5I21 A; 4LDU A; 3J7A F; 3L2R A; 3JSC A; 3WXM B; 4N4H A; 4R56 A; 4EMK A; 3JRZ A; 4M78 A; 3H6Z A; 3OBY A; 2G6F X; 2EGA A; 3LX7 A; 1WLP B; 3TQ7 P; 5CIU A; 4F7U G; 1JXO A; 1Q95 G; 2XD0 A; 4N0A A; 2QTV A; 2HQE A; 1CKB A; 1G83 A; 1SEM A; 4OML A; 2AHJ B; 4QQ6 A; 4XTU A; 2C0T A; 1W2B S; 1AOJ A; 4FIB A; 1CSK A; 1XNI A; 2CZ7 B; 4M77 G; 1Y96 B; 3VS6 A; 1KSW A; 5DM7 R; 3LWH A; 2M51 A; 1NLO C; 1VQ9 Q; 3EGX A; 4JLG A; 3H0I A; 4XTY A; 3TCJ A; 2JS2 A; 3OS1 A; 3G7Z A; 4C0D C; 2O4X B; 5FRO A; 2KYM A; 4KGV B; 2FRY A; 2A37 A; 1VQ4 A; 4AG2 C; 2X4J A; 4JRP A; 3ZBD A; 3CCQ T; 2E41 A; 2COY A; 4JLI A; 4C0D B; 4JJD A; 1K9M R; 5GAM f; 2FG0 A; 5GAN 8; 2LT4 A; 3EGD B; 1X6B A; 4PJO G; 3OYF A; 1V1C A; 1PD0 A; 4IUV A; 2A28 A; 1ZUU A; 1CKA A; 1VQM Q; 2A08 A; 2K7A A; 2EQM A; 4LDX A; 3VUB A; 3T9N A; 4II1 A; 2BIV A; 2DL8 A; 1YFN A; 3QYH B; 2BE9 B; 5KE2 A; 2J6K A; 3A8G B; 4FW1 A; 2VXF A; 1G3S A; 3GLX A; 4F7U B; 4E7K A; 1TH7 A; 1TUG B; 4J9B A; 6AT1 B; 3OYN A; 1VOM A; 3NFC A; 1TXQ A; 2KRN A; 2R58 A; 1XQH A; 4M77 C; 5D7U A; 4F7U A; 4Z88 A; 2QGG A; 4MZM A; 5KYW B; 4X9C A; 3FJP A; 4M77 B; 5GAN 4; 4FU6 A; 5GMK m; 2EIF A; 2XKO C; 3I56 T; 2PQW A; 3QDR B; 5KYW A; 3OYB A; 2YT6 A; 4M78 F; 3PIP A; 4M77 A; 3G6E Q; 1E6G A; 3OYE A; 2JTF A; 1WZO A; 2CSQ A; 4PJO C; 1J3T A; 4JPB W; 1DJ7 B; 3PGG A; 1UGQ B; 1R77 A; 2CUD A; 3CPW A; 1M1K C; 1ZBJ A; 3EGU A; 5GAN f; 3RKX A; 3MEU A; 1EIF A; 2HZY A; 2HAX A; 4OF1 A; 4PJO B; 3I55 A; 1LVK A; 1Q86 C; 1QVF P; 2RQR A; 2LX9 A; 1M5Q 1; 5CKF A; 2P0K A; 2ZZD A; 1JRI A; 1I5L A; 2VAS A; 1GBQ A; 4FYW B; 1Y0M A; 1ZUK A; 4HKE A; 1BB9 A; 3SDZ A; 2DIL A; 1VA7 A; 1S72 A; 3Q1J A; 4V2S A; 2KRM A; 1QKX A; 1M27 C; 3UWN A; 1VQL T; 5KYX B; 1VQN T; 1Q7Y U; 4AMC A; 3VS5 A; 1YIT Q; 3H0F A; 3CCV T; 3VKI A; 5LJ3 e; 4C5E A; 3CC7 A; 2AKK A; 2CGH A; 5KYX A; 2ROL A; 4BDY A; 4FYX B; 1I07 A; 5KCH A; 5GJV B; 1PC0 A; 4OGC A; 1KHC A; 3L2Z A; 2DBK A; 3JB9 F; 2L3R A; 4OP0 A; 1ZX6 A; 1K9A A; 1A0N B; 1NYF A; 3M0T A; 3OYH A; 3CCE Q; 3L2V A; 1WA7 A; 1I5O B; 2NUP A; 3CMA A; 3JCM f; 2FO0 A; 4IUQ A; 3OSV A; 4F7U F; 4GLM A; 1UEC A; 4XTW A; 5AT1 B; 2RQU A; 3A8H B; 3LLR A; 3SWN C; 2JOY A; 3GNF B; 1JEG A; 4KRT A; 2XU8 A; 2CT4 A; 4M77 F; 4ZTJ A; 1TU0 B; 2CRE A; 2GNC A; 1B07 A; 2YRV A; 3BY7 A; 5HK3 A; 1RAE B; 3SWN B; 2DAQ A; 3CC2 A; 2X4X A; 2CZ1 B; 2F1L A; 3U23 A; 2EQI A; 2QXF A; 2NUT A; 2LT1 A; 4MML A; 5IHN A; 3E1S A; 4A4E A; 4O6J A; 4LE9 A; 3NPF A; 2PVD B; 1U3O A; 4BE1 A; 1YP5 A; 3VYG A; 5CQX A; 2QEX Q; 1MND A; 2GFA A; 1UDL A; 3H41 A; 3QZ5 B; 1Z9Q A; 3QSU A; 2V1Q A; 2COZ A; 4LDV A; 1X27 A; 3RMQ A; 1VQK T; 2DL4 A; 1AWO A; 4R0K A; 1KC8 U; 2R5A A; 1H92 A; 1M3B A; 5GAN j; 2DYB A; 4ZN3 A; 1BI0 A; 1AWJ A; 2OI3 A; 3ZEH A; 2FPD A; 2QTX A; 2GQV A; 3BW1 A; 2K3X A; 1NM7 A; 4RMO A; 1QCN A; 4RCC A; 2OTJ Q; 2BZ8 A; 3TVT A; 3V7R A; 3CCL Q; 2L5Q A; 3OYG A; 1X2K A; 2FPE A; 5CVI A; 3MEV A; 2JJ9 A; 2P84 A; 2CT3 A; 1SSH A; 5KYN A; 3M0Q A; 4C5G A; 3CCU T; 1X43 A; 4L59 A; 4HCB A; 2MWO A; 1MMD A; 2JM9 A; 2MI6 A; 2EQU A; 3EH1 A; 4ZN1 A; 2DPP B; 1Q81 C; 2J6O A; 2KSS A; 4J6W A; 3EG1 A; 1WQW A; 2GFU A; 1H3Z A; 2C0O A; 1W2B A; 2L3P A; 3HFN A; 2BTT A; 2F5K A; 3OYL A; 4PK4 A; 2CH4 A; 3M59 A; 4VUB A; 1YJN T; 4HVU A; 3L2W A; 2KNB B; 2VC8 A; 1BKB A; 2DX1 A; 1UTI A; 4DEX A; 1Y57 A; 4B6M A; 2VWF A; 3PMI A; 1AT1 B; 2PTK A; 1TWB A; 1WHL A; 4BI3 A; 1M1K R; 1PSF A; 1OOT A; 4BY6 C; 2EKH A; 2XHC A; 3HL8 A; 4C5I A; 5J3B A; 1WHK A; 1M3A A; 2K5I A; 1YIJ Q; 2OJ2 A; 3FRN A; 2CZ6 B; 4BY6 B; 3LWI A; 1B3Q A; 3M55 A; 1EFN A; 1BU1 A; 3CBP A; 3C94 A; 3CCM A; 3CEY A; 2L2P A; 1UG1 A; 2E4H A; 1WDX A; 5IN1 A; 3X25 B; 4CRI A; 3OY9 A; 4B9X A; 1OEB A; 2W0Z A; 4PJN A; 4OB1 B; 3HHT B; 3S6W A; 4DEY A; 5CKH A; 2M0O A; 1QKW A; 1XJW B; 1PRM C; 1YHQ T; 2E3H A; 5GAN 3; 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