The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
58
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structure length |
58
|
Chain Sequence |
NATFGMGDRVRKKSGAAWQGQIVGWYCTNLTPEGYAVESEAHPGSVQIYPVAALERIN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| molecule keywords |
Dihydrofolate reductase type 2
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| publication title |
Crystal structure of a type II dihydrofolate reductase catalytic ternary complex.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
12
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| structure length |
58
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| sequence length |
58
|
| ec nomenclature |
ec
1.5.1.3: Dihydrofolate reductase. |
| pdb deposition date | 2007-10-16 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3SFM A; 2RK2 A; 2GQV A; 3T9N A; 2VV5 A; 1VIF A; 1VIE A; 2RH2 A; 2P4T A; 3UDC A; 2RK1 A; 2OAU A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4XU0 A; 1BIA A; 3G4S A; 5AT1 B; 1MGQ A; 4PNO A; 2OTL Q; 1YJN Q; 1AZG B; 2AK5 A; 3M0U A; 1M2O A; 2Y4X A; 2QG9 B; 3MPU B; 2JMA A; 3BFM A; 1NLO C; 3M0R A; 3OW2 S; 4JJD A; 1ZHI A; 3CCQ Q; 4EIK A; 3M55 A; 3RKX A; 3LW5 E; 2P84 A; 4M7A F; 2DTO A; 1QQJ A; 4PJO E; 3WXM B; 4J6Y A; 4LE9 A; 5GMK m; 3OYN A; 3VS5 A; 4JRI A; 2H8H A; 3V7S A; 2MCN A; 3TVT A; 5CKB A; 1UB4 A; 2LQK A; 2E1H A; 1LOJ A; 2ZZD A; 2KRM A; 2E70 A; 2QDL A; 1UJ0 A; 3PMT A; 2WSE E; 3CCU T; 1VQ6 Q; 4RMO A; 3V8L A; 3PTA A; 1WZO A; 4F7U B; 2KT8 A; 4M75 G; 1RAH B; 4J7I A; 4LNP A; 4X1V A; 1KC8 U; 5KYX A; 2I0N A; 1TU0 B; 2RM4 A; 4C92 E; 3S3O A; 1LVK A; 2K3Y A; 4HKE A; 2R58 A; 3CBO A; 2LDM A; 4KT0 E; 1GFD A; 4C8Q F; 5HKC A; 1RLP C; 3M58 A; 3M4Y A; 2KSS A; 5GAN 3; 1BCM A; 1BI2 A; 1N8R C; 2JT4 A; 1GL5 A; 3H0I A; 1WHH A; 3OQ5 A; 2CRE A; 4ZGE B; 1WGS A; 4RCB A; 5J26 A; 5KYY B; 2JZ2 A; 3C0C A; 1R0C B; 4JUV A; 1X6B A; 5L23 A; 3I56 Q; 3I5S A; 1QVG P; 2JVV A; 4ORZ A; 3CD6 T; 4XTZ A; 2RK1 A; 4KGZ B; 3OMG A; 1EIF A; 1HSQ A; 4AFQ C; 2K6D A; 5CKH A; 1MV0 B; 2KBT A; 4E7Z A; 3L2V A; 1WHL A; 1BU1 A; 2ZPH B; 3N5B B; 3FC3 A; 1JU5 C; 2K4Y A; 4WTO B; 2DKG A; 3CC4 Q; 2RA2 A; 4JRK A; 1P92 A; 1YP5 A; 2DNU A; 1N9R A; 2SRC A; 5KYU A; 2BKD N; 3L1A A; 3OB9 A; 4RTY A; 4B9X A; 1TH7 A; 2XD0 A; 5CO7 A; 3V7C A; 5GAM e; 3JCM h; 2OX7 A; 3QWX X; 1H3Z A; 1FX7 A; 3CBP A; 1KD1 C; 7AT1 B; 3X26 B; 4PJO A; 1HYO A; 2NUZ A; 1MUZ A; 1YJ9 Q; 1VQK T; 4Y28 E; 2VAS A; 2K2M A; 2HSP A; 1C1A A; 2D6F A; 2DYI A; 1G3T A; 2AKL A; 2Z0W A; 1G3S A; 4QQD A; 1K0X A; 2DE0 X; 4JJB A; 2K79 A; 3S3N A; 3CC2 A; 1M5Q 1; 4M7D B; 1MV3 A; 2VKN A; 3JRZ A; 1VQ8 T; 4C92 A; 5GAM f; 4OMQ A; 3ULR B; 4J5Y A; 1G2B A; 4D8K A; 1U1T A; 2IIM A; 4KRT A; 2V8J A; 3G71 Q; 2PTK A; 3CCE T; 2M9U A; 1Q7Y R; 4M77 C; 2RQT A; 3X24 B; 1VQ7 T; 1VQL Q; 4OB1 B; 3CCV A; 3G1J A; 4C5E A; 4QT7 A; 1MMG A; 4M77 B; 1VQ5 Q; 1VQP T; 1SG5 A; 3J81 E; 1WHM A; 4QVZ A; 3G6E Q; 1K8A C; 1M90 C; 2HQH A; 4ESR A; 3X25 B; 1TXQ A; 1M4Z A; 1J3T A; 3SWN C; 2OTJ T; 3MEW A; 3VJP A; 4JS4 A; 2FZK B; 5DM7 R; 2LT4 A; 4LUD A; 1WHK A; 1IRX A; 2HBW A; 2JMC A; 3BDL A; 4LD6 A; 4PFO A; 3JCM e; 1Z9Z A; 2MAM A; 3CCU A; 5LJ5 h; 2F1L A; 1BIB A; 1OEB A; 4LDU A; 3CPW A; 1M3A A; 2AIR B; 4IUP A; 2ZPE B; 2O4X A; 4N4G A; 1RAI B; 4JPB W; 2JTE A; 3ME9 A; 1RAD B; 4XTW A; 1B34 A; 2D1X A; 4PKC C; 2X4X A; 4F7U G; 3CCM A; 1UJY A; 2NUP B; 1WXU A; 1UUE A; 2RJD A; 1GCP A; 4MZM A; 2L3R A; 2VB6 A; 3JCM X; 5D6Y A; 1G8X A; 5GAO n; 3HRT A; 1WNL A; 2RO0 A; 3CME T; 4F17 A; 5FU7 C; 2L5Q A; 1YJW T; 3JCM f; 4BDZ A; 4GLK A; 5GAN 4; 5J39 A; 2EJG A; 5FRN A; 2KY9 A; 3QZ5 B; 2L8D A; 2HQX A; 3CD6 A; 2KR3 A; 3VS0 A; 2CT4 A; 1VQ9 A; 2BZX A; 1D0X A; 1ZSZ C; 2DXU A; 3JAM E; 5GAO m; 1FMK A; 3J7A F; 2RQV A; 3C4S A; 3LLR A; 4C8Q D; 2RK2 A; 1ZSZ B; 1AD5 A; 3PNW C; 5GMK e; 2M16 A; 3LX7 A; 2HQE A; 4L6V 5; 5IHK A; 3EFS A; 3A8L B; 3PT9 A; 1JO8 A; 4FYV B; 3URG A; 2EQJ A; 3MO8 A; 4GLM A; 2YSQ A; 2DD4 A; 4RTT A; 1HD3 A; 1V76 A; 2COZ A; 3QBY A; 4VUB A; 4E7I A; 4ELZ C; 5L8R E; 1OUL A; 2HCK A; 5LJ5 e; 2CSI A; 4XAX B; 3JB9 I; 3CCR T; 4EMK C; 3NGP A; 1VQK A; 4R0K A; 1TUD A; 3P8B B; 4V2S A; 1AHJ B; 1WDX A; 4M7D E; 2MPX C; 2P0Q A; 1FWZ A; 4KUD K; 2Y4Y A; 3X20 B; 2QGG A; 1RAB B; 1NE8 A; 3EH2 A; 4M78 C; 2YHT A; 2DD5 A; 4MZP A; 3NPF A; 4OVA A; 2HKN A; 4J9D A; 4M77 E; 4CC4 B; 3R6O A; 3PMI A; 4PFP A; 2J6K A; 5KYX B; 2JTM A; 5LJ5 f; 2MOX A; 3D7S B; 2FZC B; 3CCE A; 1OPL A; 1QVF P; 1SHF A; 4OMO A; 2D0Q B; 1SKU B; 1M1K R; 1KD1 R; 1N9S A; 3JCM V; 1BI1 A; 4LDW A; 1PRM C; 1VQP A; 2ZAE A; 4R56 A; 5LJ3 d; 3GNG A; 1YBY A; 1Y57 A; 5I11 A; 1IGQ A; 3REA B; 4E2F B; 1YI2 Q; 2EWN A; 2FO0 A; 2VC8 A; 2DJZ A; 2GFU A; 3M54 A; 3QDR B; 3RR6 A; 1QWE A; 3LH5 A; 2XG8 D; 5A0D A; 2CP5 A; 3OMC A; 1I81 A; 1VQN Q; 2FYK A; 3MKD A; 2GGR A; 2KDS A; 2EQI A; 2K2V A; 2K5L A; 3SFM A; 2DL4 A; 1W4S A; 2VXF A; 1N5Z A; 3JSC A; 2LTO A; 4ME7 A; 3JCM b; 1OV3 A; 4RUG A; 3M5A A; 4DQ2 A; 4PLI A; 1TTH B; 1WX6 A; 3CCS T; 1K76 A; 4F7U F; 1VYU A; 3OA6 A; 1EFN A; 1QW1 A; 4IUT A; 2M0Y A; 1K73 C; 5GAN e; 5KYU B; 2HAX A; 2DL8 A; 3M4G A; 5I2M A; 1UHF A; 4DBH A; 3CME A; 1I07 A; 1KSW A; 1YJW A; 2LCL A; 4PJO B; 1YWO A; 1K8A R; 3JB9 J; 1M90 R; 2FZG B; 1IO6 A; 5IH2 A; 2DM1 A; 3UWN A; 2QYZ A; 3HKS A; 3PVQ A; 4M75 C; 2NUT A; 4TVR A; 3VS1 A; 5J3B A; 2RJE A; 1GFC A; 3I35 A; 2V8I A; 3L2R A; 1UGQ B; 4PJO D; 2YRD A; 2G3R A; 2C0I A; 1VYV A; 1PSF A; 3JB9 H; 2DER A; 4X9C A; 1NJI C; 1GRI A; 4RCC A; 3SDZ A; 2F2V A; 4M77 A; 2LCS A; 3QHS A; 3VRZ A; 3ZFJ A; 4C8Q G; 2COY A; 4Y91 A; 1I4K 1; 1AWX A; 5GAN f; 4ZTF A; 1SF9 A; 1Q7Y U; 1VQ4 Q; 4FL6 A; 1YCS B; 5C0M A; 1K9A A; 1YHQ T; 2JN0 A; 1M3C A; 2J6O A; 2E6N A; 2H3J A; 3V8J A; 2A3L A; 3SWN A; 2DPP B; 2J06 A; 3E9F A; 4DBQ A; 2RHI A; 4AFS C; 1D1A A; 4C92 D; 1JXM A; 2RB6 A; 1X6O A; 2X3W D; 2RHX A; 2K3X A; 4D8D A; 3A8G B; 2LNV A; 2D9T A; 5KCO A; 5D6X A; 5IHN A; 1S72 Q; 2DL5 A; 3RKW A; 3R6N A; 4M78 E; 2MWO A; 2LJ0 A; 2CKK A; 3G4S Q; 1U1S A; 4K11 A; 4F16 A; 2PUO B; 4WF2 A; 1SRL A; 1IHV A; 3M53 A; 2RPN A; 2GQV A; 3A8M B; 2HSE B; 2RF0 A; 3OY9 A; 4E6R A; 2W0Z A; 1WIE A; 2QTX A; 1TOV A; 1QVF S; 4OMM A; 1ZA1 B; 2JUF A; 1X01 A; 4JDS A; 1W2B P; 3IQL A; 1MMD A; 3LWI A; 4M7D F; 2DA9 A; 2O9S A; 3KUF A; 5GAN 2; 5GAM j; 2ZPI B; 4PK4 A; 4CC7 A; 2ZPF B; 2ZPG B; 2X35 A; 4BUG A; 2YXY A; 3CCJ Q; 1ZSZ A; 2K5F A; 1ZA2 B; 2QA4 T; 3S3M A; 3CC2 T; 2QXF A; 1VQO Q; 2F69 A; 3ASK A; 4HVU A; 1ZLM A; 2KYM A; 3CCL T; 1T0J A; 1IRE B; 3PE0 A; 1KQS P; 4GY5 A; 5GMK l; 1HK9 A; 2M1H A; 4M4Z A; 4CRI A; 5GAN 6; 4J6X A; 3CCV T; 1NBE B; 3GP8 A; 2BE7 D; 1QVG A; 2DVJ A; 4XU2 A; 2QEX T; 4OB2 B; 3ZEH A; 3OS2 A; 3CCS A; 2CP6 A; 1FXX A; 3A98 A; 3QXE B; 3MP1 A; 2LJ3 A; 3DLM A; 1KQ1 A; 4EMK A; 4J8O A; 2JJ9 A; 3PGG A; 1NPR A; 4QVD A; 5LJ3 j; 4QQG A; 1IGU A; 4B6M A; 5HK0 A; 4R55 A; 4Z02 A; 5A0G A; 1OX8 A; 5GAM g; 2HEQ A; 2X51 A; 1U06 A; 3OSS C; 4M78 A; 4IUV A; 2O88 A; 4XTY A; 4QW2 A; 4C0G A; 4J9B A; 3EG1 A; 3EG0 A; 2KEA A; 1PD0 A; 4PJO G; 1JEG A; 2EYY A; 1KQ2 A; 1I0C A; 2PZ1 A; 4Q5W A; 1RAG B; 2DXT A; 3CCM T; 2J7I A; 3BY7 A; 4DEX A; 1UGP B; 1UGR B; 5IXF A; 1QMC A; 3JCM W; 1YIJ T; 2MIO A; 2GTO A; 4C0D C; 3PVL A; 1QLY A; 4AFZ C; 2P4T A; 1YWP A; 2JS2 A; 1WQW A; 1GCQ C; 2QGF B; 4OF1 A; 1YHQ A; 1JBM A; 4XQ3 A; 4JZ3 A; 1M1K U; 3EFO B; 1G83 A; 1WLP B; 2CZ1 B; 1Z9Q A; 2XK0 A; 1KD1 U; 2YRV A; 3NTK A; 4O6J A; 4HT9 A; 2CP7 A; 1ZUU A; 3EG3 A; 3JV3 A; 3CXC P; 2KGT A; 1K73 R; 2K3B A; 3MET A; 4C92 G; 1UFF A; 2KK4 A; 1X2Q A; 2F5K A; 3RES A; 1ZUK A; 4XTX A; 5LJ3 g; 1VQ9 T; 2DIG A; 1VIE A; 1PD1 A; 2CS7 A; 1PSE A; 1FYN A; 1Y7X A; 1BB9 A; 3FDR A; 4A54 A; 2CP3 A; 3M9Q A; 2CP0 A; 2HNI A; 2PQW A; 5KH6 A; 4GBQ A; 1KG1 A; 1D1B A; 2QDY B; 3EAE A; 5IAY A; 3ER0 A; 4OGC A; 1VQ6 A; 3P8D A; 1D3B A; 3RUX A; 1W2B S; 1AZE A; 3GLX A; 1RL2 A; 4HVW A; 1NJI R; 1I5O B; 2DFU A; 1SSH A; 2EKH A; 1W1F A; 5FRM A; 2DLP A; 4BY6 C; 2KI7 A; 3CCV Q; 1CSK A; 5GMK j; 1WFW A; 2LVM A; 3FJP A; 4BE2 A; 1WA7 A; 2L0A A; 2GNC A; 4HCK A; 4C5H A; 2ZCF B; 4C0Z A; 2ATC B; 4M75 A; 4FT2 A; 4EPC A; 1K8A U; 3FEO A; 1M90 U; 1IB8 A; 4FU6 A; 4AG1 C; 2FPD A; 3EGU A; 2E41 A; 2A0F B; 2QA4 A; 4ZGJ B; 2JTF A; 2RNA A; 3VS7 A; 3QYH B; 1XJW B; 3GPL A; 3CCU Q; 2VUB A; 1VOM A; 2ROT A; 1RAC B; 1YNZ A; 2XKO C; 2NUT B; 3CCL A; 4MML A; 3CC7 T; 4M7D D; 4IKF A; 4RTU A; 2EKO A; 1N27 A; 1ZQ1 A; 3HL8 A; 4A4G A; 1ABQ A; 3A8O B; 3I55 A; 2QEX A; 3CC4 A; 4BD3 A; 4L5G A; 3LGF A; 5A0L A; 1KJW A; 3F70 A; 1T3S A; 2P4R A; 2J05 A; 3H9N A; 4N0A C; 1SSF A; 4PLL A; 4M77 D; 1NYF A; 3VRY A; 4UC4 A; 3CPF A; 1MMN A; 1M8V A; 2OJ2 A; 3SWN B; 2XIC A; 3CD6 Q; 5CIU A; 5KYN A; 3GF5 A; 2GFA A; 4P5N A; 5CQY A; 3OYC A; 5GAO r; 3E1S A; 1M30 A; 5FU6 C; 4PJO F; 5FU6 B; 4M7A C; 1NYG A; 3EGX B; 1NPP A; 4NS5 A; 3JCM c; 3OYM A; 6AT1 B; 2QQR A; 4RG8 A; 4J9H A; 1YIJ A; 2DZ9 A; 4KUI A; 4ANJ A; 3PIP A; 1D0Z A; 1QVG S; 1WHG A; 5EC7 A; 2E4H A; 3HRS A; 3OYD A; 3M0S A; 3NTI A; 1HJD A; 1OI1 A; 1PC0 A; 3VU3 C; 5FU7 B; 5GAO l; 1VQK Q; 3QG1 A; 3AT1 B; 1M9S A; 2FB7 A; 4C92 F; 3RER A; 2JW4 A; 2KRN A; 2KQW A; 3VUB A; 2DMO A; 2LJ1 A; 2QQA A; 1TUG B; 4N4I A; 2GQI A; 3CEY A; 4MDW A; 4LD9 K; 3KFV A; 3VS4 A; 1CKB A; 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1M8M A; 4QQ6 A; 1X6G A; 2COW A; 2OI3 A; 2E10 A; 4JJC A; 5GAN 8; 3INZ A; 1I1J A; 3TRE A; 2DL7 A; 4DBR A; 4M7A E; 4OP0 A; 3OS5 A; 2C0T A; 1XQH A; 4XU3 A; 1RLQ C; 1M2V A; 2EQK A; 4KBM B; 3JCM d; 2QTV A; 2K9G A; 1ZX6 A; 3OYH A; 4C0F A; 1NJI U; 1PKS A; 1M1F A; 3VYH B; 4LUE A; 3LH0 A; 1SHG A; 2DF6 A; 1AWO A; 1ZBJ A; 2DBM A; 3NMZ C; 4C5I A; 1D3B B; 5KE2 A; 3RMQ A; 2CH4 A; 5FLX E; 1LJO A; 1Q86 C; 1SEM A; 2RI3 A; 4J83 A; 5AYF A; 2GCX A; 4E7K A; 1NM7 A; 1M3B A; 3QUI A; 3OW2 P; 4AFU C; 2D8H A; 1I8F A; 3CCR Q; 1B7T A; 2ABL A; 5FW9 A; 4JZ4 A; 4DOW A; 3MP8 A; 4EDU A; 2EAY A; 3UPU A; 2DBK A; 4M75 B; 4AMC A; 2WAC A; 1W2B A; 4DEY A; 1PRL C; 2PVG B; 3I9Q A; 3CMA T; 1YI2 A; 3MJX A; 3VS6 A; 5GMK i; 4FM4 B; 2OTL T; 1K9M C; 2O2O A; 1PWT A; 3LGL A; 1AOJ A; 3TU4 K; 1O75 A; 3ZBD A; 2EW3 A; 4MZT A; 1GXI E; 3TEE A; 2A7Y A; 2JXB A; 2QK0 A; 4C92 C; 2O01 E; 1TWB A; 1YIT A; 2QQB A; 4MDX A; 3OBW A; 2HMA A; 1KQS A; 1WJS A; 3QYG B; 3H6Z A; 1RAE B; 3SB2 A; 1S1N A; 1BBZ A; 4BI8 B; 5IN1 A; 2D8J A; 1G3Y A; 3VS2 A; 2WSC E; 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