The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
62
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structure length |
62
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Chain Sequence |
VTLFVALYDYNATRWTDLSFHKGEKFQILEFGPGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/de novo protein
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| molecule keywords |
CHYMASE
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| publication title |
Generation, Characterization and Structural Data of Chymase Binding Proteins Based on the Human Fyn Kinase SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
12
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| structure length |
62
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| sequence length |
62
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WXT A; 1ARK A; 1GCQ C; 5I11 A; 2AKK A; 1YCS B; 2JXB A; 1KFZ A; 1K0X A; 4LNP A; 2BZY A; 2EGE A; 3VS4 A; 2RN8 A; 2DLP A; 3VS7 A; 3RBB B; 2JTE A; 2BZ8 A; 1ZLM A; 3O5Z A; 4JJC A; 1NEB A; 2K9G A; 1T3L A; 1SHG A; 2KRM A; 2F2X A; 2V1R A; 2KE9 A; 1AWO A; 1WYX A; 3TSW A; 2LQN A; 1M27 C; 4OMM A; 2KRS A; 1ZUY A; 3PVL A; 4JZ4 A; 2ED1 A; 1GCQ A; 5FW9 A; 2BZX A; 4F14 A; 3M0Q A; 1OPL A; 2JM9 A; 2KBT A; 4K11 A; 1NG2 A; 1HJD A; 3EG2 A; 2LNH B; 2P4R A; 4HXJ A; 4CC2 A; 2EYW A; 3EG3 A; 1PRM C; 4RTU A; 1UGV A; 1A0N B; 2DRM A; 2KYM A; 3VS2 A; 1AWW A; 1PKT A; 2D8H A; 4OMQ A; 2DX1 A; 1WIE A; 2DYB A; 1KJW A; 1X2K A; 5IXF A; 1H92 A; 2DL5 A; 2JS0 A; 3REB B; 2VKN A; 2LCS A; 4ESR A; 3C0C A; 1ZUU A; 1OV3 A; 2CT4 A; 2XMF A; 4RTT A; 2LQW A; 2MOX A; 2VWF A; 4AFU C; 4LUD A; 2HBW A; 2CSI A; 2HEQ A; 2A28 A; 1MUZ A; 1K9A A; 1LCK A; 1ZUK A; 3THK A; 1K1Z A; 1K4U S; 2FO0 A; 4RTW A; 1TG0 A; 2O9S A; 3EHR A; 1GFC A; 1PNJ A; 4CC7 A; 4JZ3 A; 2K6D A; 2J06 A; 3UA6 A; 2DMO A; 2RPN A; 2F2V A; 4Z8A A; 1VYV A; 1S1N A; 1BU1 A; 1CKB A; 2O88 A; 2EPD A; 2J7I A; 2KEA A; 1M30 A; 3NGP A; 4ZNX A; 4LE9 A; 4OML A; 1GRI A; 2CRE A; 4AG1 C; 3SEM A; 1SPK A; 1X6B A; 4RTY A; 2DNU A; 2AKL A; 2HDA A; 2A37 A; 2KNB B; 3REA B; 2RNA A; 4D8K A; 2K7A A; 1NEG A; 2EYZ A; 2KXD A; 5IHI A; 3NPF A; 2ABL A; 4HVW A; 2L3Q A; 2F2W A; 1AVZ C; 3VS1 A; 2EQI A; 2A36 A; 3ULR B; 1GL5 A; 2DL8 A; 2YUP A; 1AOJ A; 4OMO A; 1JU5 C; 2OI3 A; 2JM8 A; 2D0N A; 1PWT A; 1YN8 A; 1M3C A; 4JJD A; 4LUE A; 4RTZ A; 1YP5 A; 1SEM A; 1NYF A; 2EYY A; 2X3W D; 5FWC A; 1ZSG A; 3VS3 A; 1ABO A; 4RTV A; 1U06 A; 1EFN A; 2JS2 A; 2CH4 A; 3R6N A; 2OAW A; 1X27 A; 2AZV A; 1K76 A; 2DL4 A; 1HD3 A; 1M3B A; 2I0N A; 1VYT A; 2DL7 A; 1T0J A; 1ZX6 A; 2EKH A; 1NM7 A; 1U5S A; 3JV3 A; 1UEC A; 1SHF A; 1WFW A; 5I22 A; 1TUC A; 2YDL A; 4OMP A; 1MV0 B; 2E5K A; 2X3X D; 1MV3 A; 3M0R A; 2JW4 A; 2CSQ A; 3M0S A; 3CQT A; 1CKA A; 4J9F A; 2J6O A; 1WI7 A; 4AG2 C; 1WDX A; 3UF4 A; 3FJ5 A; 3A98 A; 3I9Q A; 1W1F A; 2K2M A; 1X2Q A; 2FPD A; 3PE0 A; 4ORZ A; 2AK5 A; 1M8M A; 4HCK A; 1G2B A; 2KR3 A; 4GBQ A; 4J9D A; 1JXO A; 2DIL A; 2ENM A; 2YT6 A; 2EW3 A; 3VRY A; 2KT1 A; 4D8D A; 4RUG A; 4DEY A; 2M51 A; 1GBR A; 1AEY A; 2O31 A; 1AD5 A; 2GQI A; 1IO6 A; 2AZS A; 3VS5 A; 1GBQ A; 2KRN A; 2YUQ A; 2LJ0 A; 1E6H A; 4CC3 A; 4Z89 A; 4EIK A; 1UHC A; 2W10 A; 3VS0 A; 2RF0 A; 4J9G A; 2KRO A; 3RNJ A; 3GBQ A; 2PTK A; 1YWO A; 2QDL A; 5FWB A; 1NLP C; 1OOT A; 4CC4 B; 2HCK A; 2HSP A; 1AWX A; 3M0U A; 2FG0 A; 2RQV A; 1SSH A; 1WLP B; 2J6K A; 2L0A A; 2LZ6 B; 2K79 A; 1PRL C; 2DM1 A; 2IIM A; 1SRM A; 1UJ0 A; 3UAT A; 3UA7 A; 2RQW A; 1UG1 A; 2CH4 W; 1N5Z A; 5ECA A; 2FRW A; 2G6F X; 4GLM A; 2JT4 A; 1WA7 A; 2FPF A; 4J9C A; 5IHK A; 1B3Q A; 2L3S A; 4Z88 A; 1E7O A; 1X69 A; 1Y0M A; 2LJ3 A; 2D8J A; 1U3O A; 3H41 A; 1H3H A; 1BB9 A; 3PVQ A; 2SEM A; 2DRK A; 1W6X A; 4R0K A; 1JEG A; 4F16 A; 1NLO C; 1OPK A; 3VRZ A; 3VS6 A; 1WXU A; 2VVK A; 3LH5 A; 3EG0 A; 2YSQ A; 1BBZ A; 2YUO A; 1CSK A; 5L23 A; 1QLY A; 2D1X A; 3U23 A; 2KYB A; 5EC7 A; 1RLQ C; 1YWP A; 2CUB A; 5IXB A; 2KT8 A; 5GJV B; 2DJQ A; 1TUD A; 4KRT A; 1V1C A; 5IH2 A; 3H0I A; 2FRY A; 2ROT A; 1OEB A; 1B07 A; 1AZG B; 2LP5 A; 2DBM A; 1X43 A; 2DA9 A; 1BK2 A; 2SRC A; 4Y92 A; 3EHQ A; 2EGA A; 4WCI A; 2L3P A; 5IHN A; 3I5R A; 1UHF A; 2EBP A; 2EYX A; 4E6R A; 2NWM A; 1PKS A; 2J05 A; 4QT7 A; 2RQT A; 2MIO A; 2KXC A; 2ECZ A; 2JMA A; 2EGC A; 5HCK A; 2DL3 A; 1H8K A; 1KSW A; 1Z9Z A; 2YUN A; 2OJ2 A; 4F17 A; 2J6F A; 1X6G A; 1GFD A; 1JO8 A; 2DE0 X; 1PHT A; 4J9I A; 1UFF A; 2LJ1 A; 1QWE A; 2GGR A; 4AFZ C; 1RI9 A; 1SRL A; 2C0T A; 2RQR A; 1WXB A; 2B86 A; 1UJY A; 4LN2 A; 2GNC A; 4DEX A; 1NYG A; 1I1J A; 2DVJ A; 2MCN A; 4AFQ C; 3TSZ A; 4FSS A; 1WX6 A; 1KIK A; 2V1Q A; 3I5S A; 3I35 A; 2FEI A; 2RMO A; 2NUZ A; 3EGU A; 3QWX X; 2CT3 A; 1T3S A; 1I07 A; 1K0S A; 2O2O A; 1QKX A; 1Z9Q A; 4IIO A; 1FYN A; 1AWJ A; 1RUW A; 2RQU A; 1GCP A; 2LX7 A; 4JPB W; 1ZBJ A; 2C0O A; 1Y57 A; 1VA7 A; 2GTJ A; 1VYU A; 2L2P A; 2ED0 A; 4RTX A; 1I0C A; 2M0Y A; 4HVV A; 1JQQ A; 1QWF A; 4IIM A; 2CDT A; 4HVU A; 3KFV A; 4M4Z A; 4J9E A; 2ROL A; 1T0H A; 3H0H A; 2PZ1 A; 2DF6 A; 2EVR A; 2LMJ A; 4A63 B; 3IQL A; 2GTO A; 4OMN A; 2JMC A; 1JXM A; 3M0T A; 3NHN A; 3TVT A; 1J3T A; 1YNZ A; 3ZL7 C; 3QWY A; 2C0I A; 2A08 A; 1HSQ A; 2DBK A; 1M3A A; 2BTT A; 4AFS C; 1W70 A; 1QCF A; 4J9H A; 1UUE A; 3SHW A; 1G83 A; 2W0Z A; 2PNI A; 3EG1 A; 5GJW B; 1XOV A; 2K3B A; 1UE9 A; 1AZE A; 4X1V A; 2O9V A; 1RLP C; 2KGT A; 1UTI A; 1QKW A; 3H0F A; 2CUD A; 1E6G A; 2ESW A; 4J9B A; 1ABQ A; 3M0P A; 2FPE A; 2H8H A; 1FMK A; 1UDL A; 3NMZ C; 4JJB A; 2GBQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1GCQ C; 2ZGW A; 3HRU A; 5CKH A; 2AKK A; 4C92 G; 1R77 A; 4PJO G; 3VS4 A; 2RN8 A; 3MEA A; 2DLP A; 5CKB A; 3VS7 A; 2JZ2 A; 5HY6 A; 2BZ8 A; 3CCV T; 3V7C A; 4LDW A; 4OP0 A; 2MK5 A; 4M7D A; 2KRM A; 3RMQ A; 3EAE A; 2ZPB B; 4M75 B; 4E2F B; 5CK9 A; 2XHC A; 4C8Q F; 2CYZ B; 4NL2 A; 2KRS A; 1ZUY A; 3PVL A; 1NE8 A; 1SSF A; 5FW9 A; 4BI3 A; 1OPL A; 1C6V X; 1NG2 A; 3OYG A; 3EG2 A; 3N5B B; 2P4R A; 4CC2 A; 2EYW A; 2JTF A; 4RTU A; 1UGV A; 4A54 A; 1A0N B; 2DRM A; 3GLX A; 4BB7 A; 1K9M R; 1M1K R; 4FM4 B; 1OI1 A; 1OZ3 A; 2D8H A; 4ZGJ B; 2DX1 A; 1X2K A; 2RD1 A; 2JS0 A; 3REB B; 2FL7 A; 2V8J A; 2XI9 A; 3DB4 A; 1ZUU A; 3FRN A; 1QVG A; 5C0M A; 1TTH B; 3M9Q A; 2EJ9 A; 5GAM d; 3QKJ A; 1BI3 A; 4AFU C; 4M75 E; 2CS7 A; 3X28 B; 1JB0 E; 3EFO B; 3JCM b; 1K4U S; 1TG0 A; 3I56 T; 2KMT A; 1M8V A; 4JZ3 A; 4M75 F; 2DMO A; 2RPN A; 1VYV A; 2EJF A; 2DO3 A; 1HYO A; 1KD1 R; 1CKB A; 1YBY A; 2V26 A; 3J81 E; 1KD1 C; 4E7I A; 1YI2 T; 4A4E A; 2RHZ A; 4BAC A; 4ZNX A; 3CBO A; 4JRQ A; 3SEM A; 5GAO m; 2PUO B; 1IZ6 A; 1UGS B; 2X4X A; 4D8K A; 2RNA A; 2Y4X A; 2EYZ A; 4XAX B; 4JRK A; 3FDR A; 3C4S A; 2LVM A; 4DA4 A; 1JJ2 P; 4FCY A; 4FW2 A; 2YUP A; 1H3Z A; 3OBW A; 5CIU A; 3OYH A; 2OI3 A; 3A8M B; 2D0N A; 3MP6 A; 1M3C A; 4JJD A; 4LUE A; 3G6E Q; 4JLG A; 2QEX A; 2M02 A; 5FWC A; 2X3W D; 1X01 A; 1BYM A; 4RTV A; 1U06 A; 1VQ5 T; 1KQS A; 2OAW A; 2DER A; 1YIJ T; 2AZV A; 2I0N A; 1HXD A; 1U5S A; 2XU8 A; 3PTA A; 2HSE B; 4EPC A; 2JNG A; 2E4H A; 2K2V A; 2YDL A; 4OMP A; 4E7Z A; 2IG0 A; 4JRI A; 1MV3 A; 2JW4 A; 2A0F B; 2IVW A; 3A8H B; 3ZEH A; 1VQM A; 3CQT A; 3BDL A; 4RCC A; 2VXE A; 2QA4 A; 3SB2 A; 3ZBD A; 5DLQ E; 3P8D A; 1Q7Y R; 1QVF A; 1BCM A; 2L89 A; 1B34 B; 1W1F A; 2DZ9 A; 1X2Q A; 2FPD A; 4ORZ A; 4FYW B; 3CCU Q; 1G3T A; 4E7H A; 1Y96 A; 3VRY A; 3LWI A; 2KT1 A; 3X26 B; 2PUK B; 4D8D A; 3VUZ A; 1M2V B; 5CQY A; 1IO6 A; 3C94 A; 5I2M A; 2KRN A; 5KH6 A; 2HKN A; 2VV5 A; 5D6W A; 1UHC A; 1PC0 A; 5LJ3 h; 4M78 G; 2RF0 A; 5FRM A; 3CCJ Q; 3GBQ A; 4RCB A; 2M1H A; 2XG8 D; 3RR6 A; 2XK0 A; 1LOJ A; 1WLP B; 2L0A A; 3A8O B; 1PRL C; 1SRM A; 3DLM A; 3G4S T; 2QA4 T; 2RQW A; 1QQJ A; 1MMN A; 1WHH A; 3EG9 A; 1BCO A; 4N0A C; 4PFZ A; 2RJF A; 2FPF A; 2K5I A; 3S3M A; 3M59 A; 2L3S A; 3D7S B; 2P4T A; 1WNL A; 4BE1 A; 4PJO D; 2ATC B; 4FU6 A; 4F04 B; 1RI0 A; 5GMK l; 4M7A G; 1X6O A; 2HD0 A; 3M58 A; 3X24 B; 1NBE B; 2DEU A; 3OMG A; 2D8J A; 1WHL A; 1AHJ B; 1BI0 A; 3M4Y A; 1H3H A; 3PVQ A; 2MYS A; 2DPP B; 3VS6 A; 2VVK A; 1QVG S; 4A4H A; 1PG5 B; 1VQ4 Q; 5M9O A; 5L23 A; 1QLY A; 2D1X A; 5EC7 A; 3PMI A; 1RAE B; 1U8R A; 2XKO C; 5GJV B; 1OYX A; 5IH2 A; 3H0I A; 3V8K A; 2RJC A; 3OW2 A; 5CKF A; 4E7K A; 3BY7 A; 1I5O B; 2E6N A; 2LP5 A; 2M9U A; 4DOW A; 2DA9 A; 3V8J A; 4MML A; 5GAO p; 4M7D D; 4WCI A; 5IHN A; 3CCS Q; 2EBP A; 3OYY A; 2J05 A; 4QT7 A; 5DLO A; 2RQT A; 2MIO A; 1YIT Q; 4XTU A; 5DY9 A; 2EGC A; 5HCK A; 1Z9Z A; 2OJ2 A; 2VAS A; 5LJ5 h; 1JO8 A; 3QPH A; 2DE0 X; 2JOY A; 1U1S A; 3CXC P; 1IGQ A; 3OYL A; 2LJ1 A; 1GXI E; 2YHT A; 4VUB A; 4AFZ C; 3EFO A; 4Y91 A; 5GAN 6; 2QXF A; 4ZGE B; 2XD0 A; 4DEX A; 1I1J A; 2E41 A; 3QHS A; 3TSZ A; 1M9S A; 2WAC A; 2FEI A; 3NTK A; 2YXY A; 1FXX A; 3EGU A; 3MPU B; 1W2B S; 1KQS S; 4HT9 A; 4XTW A; 3JAM E; 1VQL A; 2OTL T; 4IIO A; 1FYN A; 1AWJ A; 1RUW A; 5LJ3 d; 1PCX A; 2C0O A; 2RI5 A; 1Y57 A; 3HRT A; 4KUD K; 3CCU A; 1ZHI A; 2CP0 A; 2QAS A; 1BKB A; 2GFU A; 1WJR A; 1JQQ A; 2K5L A; 3OS5 A; 1M5Q 1; 3CCR T; 4XQ3 A; 3WVD B; 1WJS A; 3FB9 A; 2RA2 A; 2PZ1 A; 2DKG A; 2EVR A; 2DAQ A; 3CC4 A; 1IHV A; 1JXM A; 3OYK A; 4RG2 A; 1D1B A; 1QP3 A; 3MP8 A; 3NHN A; 3CCJ A; 2G3R A; 2QGG A; 3VYG A; 3SFM A; 2BTT A; 4BE0 A; 2RH2 A; 5GAM j; 1G83 A; 1VQL T; 3NFC A; 2QK0 A; 3EG1 A; 2CP2 A; 4ATO A; 1KHI A; 3OYN A; 1XOV A; 1UGR B; 2LDM A; 2DFU A; 3KBG A; 4R56 A; 2O9V A; 1OX8 A; 1UTI A; 4EMK C; 4JUV A; 1ZA1 B; 2CUD A; 1YJ9 Q; 5GAO n; 1K9M U; 1M1K U; 2ESW A; 4J9B A; 3A8G B; 4D6W A; 2H8H A; 2GBQ A; 1RAH B; 5KYY B; 1ARK A; 4ELZ C; 1TU0 B; 3TU4 K; 1VQ8 Q; 2JXB A; 5D7U A; 1K0X A; 3OYJ A; 4LNP A; 3CPW A; 2EGE A; 5GAN 4; 3OY9 A; 3CC4 T; 4F7U B; 4PJL A; 3RBB B; 3QSU A; 2JTE A; 5CCA A; 5GAN 7; 1ZLM A; 1M2V A; 3I56 Q; 2K9G A; 4M77 G; 1VQ4 A; 4B6M A; 3L2Q A; 4NL3 A; 1WHG A; 2LCL A; 2HMA A; 2WSE E; 4BY6 C; 5CKD A; 1GCQ A; 2CZ1 B; 2BZX A; 8AT1 B; 3FLG A; 2KBT A; 5KYU B; 3PMT A; 4FSX A; 5LJ5 d; 1VQ9 Q; 4MZT A; 3PIP A; 1SG5 A; 2JTM A; 2OTJ T; 1PKT A; 3JCM f; 3NTH A; 4PFP A; 1Y07 A; 2RK1 A; 3J7A F; 2H3E B; 5IXF A; 1RL2 A; 1H92 A; 1YIT A; 3CXC A; 3INZ A; 2BUD A; 1JJ2 S; 4F7U E; 1YCY A; 4M7A D; 3G71 Q; 2F5T X; 3CC2 Q; 1WGS A; 2LQW A; 2NLU A; 2COZ A; 4F7U F; 4Y28 E; 2MOX A; 3P8H A; 3PGG A; 4FYX B; 4LUD A; 2HEQ A; 2A28 A; 1YJW Q; 1VQ7 A; 1ZA2 B; 1MUZ A; 1Y7X A; 1K9A A; 1LCK A; 3VV0 A; 3EGD B; 2O9S A; 1VQP Q; 5LJ3 g; 2K6D A; 3UA6 A; 2F2V A; 1WHM A; 2ZZD A; 5D6X A; 3CCL T; 1VOM A; 2PVD B; 2DTH A; 1VQO T; 2CRE A; 4RTY A; 2DNU A; 2AKL A; 2EJG A; 1K8A R; 2RHY A; 1G3Y A; 1MMD A; 5GMK h; 2K7A A; 5J3B A; 5IHI A; 3HKS A; 2E64 A; 3NPF A; 4FL6 A; 1V76 A; 4HVW A; 1VQK A; 2CKK A; 3QJY A; 4IUV A; 1Q7Y U; 1AVZ C; 3VS1 A; 2EQI A; 2NUT B; 3ULR B; 2DIQ A; 2K3X A; 4UC4 A; 4QQ6 A; 1VQ7 T; 4OMO A; 5LJ3 e; 1K73 R; 3JCM P; 5CQX A; 5IT9 E; 3OS2 A; 3JRZ A; 4RTZ A; 1YP5 A; 1SEM A; 4A4G A; 1UGQ B; 2EYY A; 4OB1 B; 1N9R A; 4QW2 A; 4A53 A; 1OU8 A; 4MZM A; 1ABO A; 3CC7 A; 3LX7 A; 3WXM B; 1VQN Q; 2CH4 A; 1QVF P; 3R6N A; 4C8Q E; 2MAM A; 3C95 A; 1S72 Q; 1Q81 U; 1HD3 A; 2QG9 B; 1VYT A; 2RJE A; 1Q95 G; 3LH0 A; 2FHD A; 2AT1 B; 1NM7 A; 2KI7 A; 3CME Q; 3QDF A; 3CCE T; 3JV3 A; 1YHQ Q; 1UGP B; 3CD6 A; 1TXQ A; 2X4Y A; 1SHF A; 1YJ9 A; 1TUC A; 3ME9 A; 3O8V A; 5GAN f; 4P5N A; 5GAN 5; 4J6W A; 1CKA A; 1YJN T; 3HL8 A; 3UF4 A; 3A98 A; 4JS5 A; 2DVE A; 1K9M C; 1M1K C; 4HCK A; 1U1T A; 4J9D A; 1JXO A; 2DIL A; 2ENM A; 2GQV A; 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