The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
MEAIAKHDFSATADDELSFRKGQILKILNMEDDSNWYRAELDGKEGLIPSNYIEMKNHD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Protein E(sev)2B
|
| publication title |
Structural Comparison of the Unstable drkN SH3 Domain and a Stable Mutant
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Drosophila melanogaster
|
| total genus |
9
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1E6G A; 2J7I A; 2KT8 A; 2JW4 A; 1WLP B; 5I11 A; 3H41 A; 1SSH A; 2RMO A; 4AG2 C; 2B86 A; 2DE0 X; 3VS0 A; 1K4U S; 1RUW A; 3PVQ A; 1W6X A; 1UHF A; 2KXC A; 1UG1 A; 2C0I A; 1UJ0 A; 2YT6 A; 3EGU A; 3TSW A; 4CC2 A; 2JS2 A; 2L2P A; 1AWO A; 2D8H A; 1OV3 A; 2CT4 A; 2O9V A; 3QWX X; 2JM9 A; 2JMC A; 2AKK A; 2ENM A; 5FW9 A; 2SRC A; 2JMA A; 3UA7 A; 1M3A A; 2G6F X; 1WX6 A; 2YUO A; 1PRM C; 4DEX A; 1GCP A; 1UEC A; 2RPN A; 2J06 A; 1HSQ A; 1WXU A; 1ZUK A; 2JS0 A; 1X6B A; 2VWF A; 2P4R A; 4IIM A; 1OOT A; 3RNJ A; 1NLP C; 2EYY A; 1WYX A; 1PNJ A; 4J9E A; 4JPB W; 2FPD A; 3EG3 A; 4IIO A; 4HVW A; 2QDL A; 2DX1 A; 2LP5 A; 1PHT A; 2GQI A; 2A08 A; 2BZX A; 3GBQ A; 1NEB A; 2CT3 A; 3NHN A; 5IHN A; 1YP5 A; 1JO8 A; 1UUE A; 5ECA A; 2J05 A; 5HCK A; 2KE9 A; 2BTT A; 1UHC A; 2GGR A; 2W0Z A; 1WXB A; 5IXF A; 2EGA A; 2DL4 A; 1OPK A; 3M0U A; 2HSP A; 2EGE A; 4LUE A; 1AVZ C; 2DL3 A; 5GJV B; 1H92 A; 4EIK A; 2FG0 A; 3NGP A; 1BU1 A; 5IHI A; 2DNU A; 4CC7 A; 2YSQ A; 3VRZ A; 1KFZ A; 1AEY A; 2DYB A; 2L3Q A; 2RF0 A; 3REA B; 2AZS A; 1RI9 A; 2DJQ A; 2ROL A; 2F2X A; 1GL5 A; 2F2W A; 1WDX A; 4AG1 C; 1T0H A; 3O5Z A; 3UA6 A; 1KIK A; 1X6G A; 2J6O A; 2KYB A; 2DLP A; 4CC3 A; 3THK A; 2E5K A; 1PKT A; 1WFW A; 1RLP C; 2EYZ A; 2LQN A; 1WI7 A; 2IIM A; 2CH4 W; 3VS2 A; 2KYM A; 1VYU A; 3VRY A; 2GTJ A; 1OEB A; 2LJ3 A; 2HEQ A; 4ORZ A; 2EYW A; 1TUC A; 2EBP A; 2K7A A; 1UGV A; 2NWM A; 3ZL7 C; 2BZ8 A; 3VS4 A; 2FPE A; 2LZ6 B; 3TVT A; 2AZV A; 1QWE A; 4OML A; 1JEG A; 1Z9Q A; 1U5S A; 2LNH B; 2I0N A; 1GBQ A; 1WA7 A; 2ESW A; 2LMJ A; 2X3X D; 1X69 A; 1I07 A; 1YCS B; 2JTE A; 2HCK A; 1YNZ A; 2RQW A; 4RTT A; 2YUN A; 2HBW A; 3IQL A; 3NMZ C; 1K0S A; 2HDA A; 3M0Q A; 1M3B A; 4HVV A; 1NG2 A; 4AFZ C; 1AZG B; 3EG1 A; 1M3C A; 2L3S A; 1RLQ C; 2EVR A; 2YUP A; 2JT4 A; 3UAT A; 2D8J A; 2ED0 A; 4RTX A; 1K9A A; 3I5R A; 3NPF A; 5IXB A; 1ABO A; 1M8M A; 2OI3 A; 4Z88 A; 3EG0 A; 1GFD A; 2DRK A; 2FEI A; 1NLO C; 4JZ3 A; 2D1X A; 2ROT A; 1M27 C; 1ZUU A; 2VVK A; 1A0N B; 1JXM A; 2O88 A; 2GBQ A; 2KGT A; 2DL7 A; 4ESR A; 3TSZ A; 4J9H A; 5IHK A; 1OPL A; 1MV0 B; 2LJ0 A; 1X43 A; 2EPD A; 4J9C A; 1NEG A; 1UJY A; 2YDL A; 4Y92 A; 2VKN A; 2A36 A; 2DL5 A; 2DBK A; 4LE9 A; 4F14 A; 2CSI A; 1MV3 A; 2MIO A; 1TG0 A; 3A98 A; 3EG2 A; 2V1R A; 4RUG A; 2RQV A; 2PNI A; 2FO0 A; 2LCS A; 3PE0 A; 1JU5 C; 1GFC A; 2K3B A; 2D0N A; 1E7O A; 1QKW A; 2ABL A; 4J9I A; 1CSK A; 5FWC A; 1UFF A; 1GCQ C; 3UF4 A; 1H3H A; 2JXB A; 2XMF A; 4CC4 B; 2KRS A; 4LNP A; 4OMQ A; 1BB9 A; 2AK5 A; 3ULR B; 3REB B; 3H0I A; 3M0R A; 1UE9 A; 2F2V A; 1KJW A; 4A63 B; 4LUD A; 1H8K A; 1X2K A; 4K11 A; 3VS3 A; 1E6H A; 2MOX A; 2KRO A; 2DMO A; 4HCK A; 4OMN A; 1I0C A; 1JQQ A; 1WIE A; 3EHQ A; 1CKA A; 2YUQ A; 1GCQ A; 4ZNX A; 2A28 A; 2C0T A; 2RNA A; 3VS5 A; 2EW3 A; 2FRW A; 1MUZ A; 4KRT A; 2DL8 A; 3RBB B; 2M0Y A; 2LQW A; 4JJC A; 1PRL C; 1W70 A; 2DIL A; 1I1J A; 1UTI A; 1ZX6 A; 1GBR A; 3SEM A; 1UDL A; 4D8K A; 2ECZ A; 1U3O A; 1AD5 A; 5EC7 A; 5I22 A; 4Z8A A; 4J9G A; 4RTY A; 3R6N A; 1K1Z A; 2RQU A; 1FMK A; 2DRM A; 1YN8 A; 2CUB A; 2DA9 A; 2KRM A; 4AFS C; 4F17 A; 1Y57 A; 4OMM A; 1V1C A; 2RQR A; 4OMP A; 3KFV A; 1G2B A; 1S1N A; 1YWO A; 2LJ1 A; 1M30 A; 1B07 A; 1W1F A; 4HVU A; 2KT1 A; 2MCN A; 1HD3 A; 4R0K A; 4AFQ C; 1CKB A; 2L3P A; 1N5Z A; 4GLM A; 3M0T A; 1XOV A; 4X1V A; 1PWT A; 1AWX A; 3C0C A; 2LX7 A; 3FJ5 A; 1PKS A; 2JM8 A; 4RTW A; 3M0S A; 1AWJ A; 4J9B A; 2O31 A; 4AFU C; 1QCF A; 4JJD A; 1NM7 A; 2PTK A; 1SPK A; 2C0O A; 4RTV A; 4RTZ A; 2BZY A; 2FPF A; 4JJB A; 5L23 A; 1J3T A; 2K79 A; 1ABQ A; 3U23 A; 2KBT A; 2RN8 A; 1IO6 A; 2O2O A; 2DF6 A; 2O9S A; 1TUD A; 4OMO A; 1LCK A; 1YWP A; 2X3W D; 1KSW A; 3QWY A; 1GRI A; 2M51 A; 1X27 A; 2EYX A; 4QT7 A; 1QLY A; 1B3Q A; 1JXO A; 3I5S A; 1Y0M A; 3H0H A; 4GBQ A; 1FYN A; 3M0P A; 1SEM A; 1AWW A; 3VS1 A; 3VS7 A; 4FSS A; 2L0A A; 1ARK A; 4JZ4 A; 1QKX A; 2CRE A; 1X2Q A; 3EHR A; 1ZSG A; 3SHW A; 4D8D A; 1U06 A; 1EFN A; 1Z9Z A; 2CH4 A; 1K76 A; 2KNB B; 1NYF A; 1VYV A; 1NYG A; 1HJD A; 1ZLM A; 2CUD A; 2CSQ A; 4Z89 A; 4WCI A; 4DEY A; 3PVL A; 2W10 A; 4RTU A; 2ED1 A; 1SRL A; 2KXD A; 2NUZ A; 3LH5 A; 2OAW A; 2GNC A; 3H0F A; 5FWB A; 3I35 A; 2KRN A; 1T3S A; 4M4Z A; 2CDT A; 1VYT A; 5GJW B; 2DVJ A; 2DBM A; 2A37 A; 2J6K A; 1AZE A; 1T3L A; 2EGC A; 4J9D A; 2AKL A; 2SEM A; 2EQI A; 2GTO A; 2K9G A; 2EKH A; 3JV3 A; 1SRM A; 2FRY A; 1SHG A; 1QWF A; 1BK2 A; 2K6D A; 1BBZ A; 1VA7 A; 4E6R A; 3I9Q A; 4HXJ A; 2J6F A; 1ZBJ A; 2K2M A; 2RQT A; 1AOJ A; 4J9F A; 1T0J A; 3CQT A; 1SHF A; 2KR3 A; 2OJ2 A; 2PZ1 A; 2KEA A; 1ZUY A; 1K0X A; 3VS6 A; 2H8H A; 2DM1 A; 4LN2 A; 1WXT A; 4F16 A; 1G83 A; 2V1Q A; 5IH2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EFR A; 2KT8 A; 3CMA T; 1SSH A; 2RMO A; 2RHY A; 5KCH A; 5FU7 B; 1VQN A; 5CQX A; 1WHG A; 1UGR B; 4AG2 C; 3VS0 A; 1RUW A; 3GPL A; 4C8Q F; 1KC8 C; 4XU3 A; 2YT6 A; 4J7F A; 3CCM T; 2HKN A; 4QQ6 A; 4IUV A; 3G4S T; 2M1H A; 1AHJ B; 4JRI A; 3HFO A; 1TS9 A; 2D8H A; 4BUG A; 2CT4 A; 1K73 R; 4OP0 A; 2DO3 A; 1YJN T; 5CIU A; 3M9Q A; 3CCS A; 3OYK A; 1YJ9 A; 3SB2 A; 2LQ8 A; 1UEC A; 1HSQ A; 2FZK B; 1BCO A; 3P8B B; 2VWF A; 2CP2 A; 3P8D A; 1PNJ A; 4J9E A; 3M59 A; 4CI0 C; 3CPF A; 2DX1 A; 2GFA A; 4C8Q E; 2GQI A; 4OGE A; 2BZX A; 2X9H A; 2E41 A; 1BKB A; 1SSF A; 3NTK A; 2LQK A; 3PT9 A; 1UB4 A; 4M7D B; 4M78 G; 2J05 A; 4C92 C; 1H3Z A; 3BDL A; 3JCM P; 2V26 A; 2Y4Y A; 5A0L A; 1UGP B; 2GGR A; 3CCJ Q; 1WXB A; 5IXF A; 2EGA A; 2RB6 A; 2DL4 A; 6AT1 B; 3M0U A; 2EGE A; 3SDZ A; 3OYN A; 1ZSZ B; 1YJW T; 4MZP A; 5KE2 A; 4QKU A; 1AEY A; 2X4Y A; 3OW2 S; 2RF0 A; 4BE0 A; 1R0C B; 4RCB A; 2JTM A; 3E1S A; 3A8M B; 4C5E A; 1RI9 A; 2RJE A; 5D7U A; 1VQ9 Q; 2DJQ A; 2F2X A; 4M77 D; 2Z0W A; 2F2W A; 4UC4 A; 4AG1 C; 1T0H A; 1YIJ T; 2QQB A; 1VQ8 Q; 4EDU A; 3UA6 A; 1O9S A; 4PJO F; 2DLP A; 1OZ2 A; 2OX7 A; 5I21 A; 2VAS A; 1IHV A; 4KUI A; 4OGC A; 3X26 B; 5KYW A; 1WFW A; 2RJC A; 2VB6 A; 2F5T X; 2YLC A; 4C8Q A; 2KYM A; 3TU4 K; 1UGV A; 2NUT A; 2RI5 A; 3ZL7 C; 4JLI A; 1R77 A; 3PIO A; 3X24 B; 2FPE A; 2LZ6 B; 1UGQ B; 3TVT A; 3BE3 A; 5GAN 3; 2EIF A; 1VQK T; 5LL6 S; 2JJ9 A; 2I0N A; 3OYM A; 4HCC A; 4BDZ A; 2X3X D; 3RIR A; 1KQS A; 2JTE A; 4PJO E; 1G8X A; 2JTF A; 1MNE A; 5DLQ E; 2EQM A; 1EIF A; 3CCJ A; 2VGM A; 1M3B A; 1NG2 A; 4KBM B; 3CD6 Q; 4EPC A; 1D1A A; 1HYO A; 5AYF A; 1WQW A; 3V7R A; 3UPU A; 3MKD A; 1K8A R; 1M5Q 1; 4PKC C; 1MMN A; 3L2U A; 4FIB A; 3CEY A; 3UAT A; 4M77 G; 2M0O A; 4RTX A; 3VJP A; 2QAZ A; 1K9A A; 1VQ8 A; 3VKI A; 4HT9 A; 2RO0 A; 1M2V A; 2YHT A; 1WJS A; 1JXM A; 5IHK A; 1OPL A; 1WZO A; 4BE2 A; 3AT1 B; 1D1C A; 1X43 A; 1KC8 R; 2EPD A; 5LJ3 e; 1KHC A; 3SWN B; 2HKQ B; 4KGX B; 2DL5 A; 3PTA A; 4PJO A; 4F14 A; 3EGX A; 1W2B P; 5GAM g; 3JCM d; 2MIO A; 5GAO m; 3EFO B; 5GAM j; 4BDY A; 3EG2 A; 4FYW B; 2PVD B; 1KD1 U; 2HZY A; 3JCM V; 2ZPF B; 2NUP B; 4F7U B; 3M57 A; 3OYD A; 3CMA Q; 2ZPH B; 4C5G A; 1GCQ C; 5GAN d; 2XMF A; 4FYV B; 4LNP A; 2BE9 B; 1OUL A; 2BKD N; 3M0R A; 2K3Y A; 4A63 B; 3G4S Q; 4K11 A; 1I81 A; 2MOX A; 3CD6 A; 2KRO A; 3WVE B; 2HQE A; 4OMN A; 2NYS A; 2L8D A; 4XK8 E; 1JQQ A; 2P0P A; 3QYH B; 1WIE A; 1YJN Q; 3QDR B; 2P0Q A; 2CGH A; 1CKA A; 2YUQ A; 1VQN T; 1NJI U; 2M0Y A; 2OAU A; 3PMI A; 1IGU A; 1W70 A; 2DIL A; 3FIF A; 5L8R E; 3RKW A; 4FU6 A; 1X75 C; 1UDL A; 4D8K A; 1U3O A; 4P5N A; 1VOM A; 3S3M A; 2PUO B; 3V8L A; 2EYQ A; 3EAE A; 3HP9 A; 3OSV A; 4M7A F; 3OQ5 A; 2QYZ A; 3CCS T; 2DRM A; 1W2B S; 1YN8 A; 1YJ9 T; 5I2S A; 2DAQ A; 1JJ2 P; 5CKH A; 1B34 A; 1V1C A; 3KBG A; 3MP1 A; 1BI2 A; 2PVG B; 3RKY A; 1G2B A; 2BUD A; 2O01 E; 1RAI B; 2LJ1 A; 4QW2 A; 3JCM b; 1RAH B; 4HVU A; 1GXI E; 2KT1 A; 1EZZ B; 4AFQ C; 2K5F A; 2LT1 A; 3M0T A; 4X1V A; 1PWT A; 1AWX A; 2V8I A; 3HPW A; 2LX7 A; 3M54 A; 2PQW A; 1PKS A; 1VQM A; 1LVK A; 1AWJ A; 4J9B A; 2O31 A; 3RUX A; 4DA4 A; 3HHT B; 1NM7 A; 4M7A E; 2PTK A; 2C0O A; 4RTV A; 2K57 A; 4RTZ A; 1NJI C; 3H6Z A; 2BZY A; 4JJB A; 3RKX A; 1J3T A; 4JS4 A; 3OYG A; 3VU3 C; 2KBT A; 3RR6 A; 1IO6 A; 2O2O A; 2DF6 A; 2PVO B; 2O9S A; 2ZCF B; 1TUD A; 4OB3 B; 1LCK A; 3OYY A; 1YWP A; 4AT1 B; 3QWY A; 4HCB A; 4XAX B; 2O4X B; 1HXD A; 4QT7 A; 1Y0M A; 3M0P A; 5GAO n; 4M78 F; 3CME A; 1JJ2 S; 2L0A A; 1Q86 U; 1X2Q A; 1ZSG A; 1YHQ Q; 4PLI A; 3CBO A; 1TWB A; 3GP8 A; 2R5A A; 4V2S A; 4WCI A; 2EQK A; 2CKK A; 4PJO G; 3LGL A; 3PVL A; 2XG8 D; 1SRL A; 2IVW A; 2KXD A; 3LYI A; 2NUZ A; 1NZ9 A; 2OAW A; 2GNC A; 5FWB A; 2E3I A; 3HKS A; 4N4G A; 3I35 A; 2RJD A; 1RL2 A; 4ZN3 A; 4M4Z A; 2DVJ A; 5KYN A; 2A37 A; 1QVF A; 4FM4 B; 3HRU A; 4M78 E; 1U1S A; 4LDU A; 4M75 D; 1D1B A; 4L5G A; 1SHG A; 4LD9 K; 1BK2 A; 2X4W A; 1BBZ A; 2EJG A; 3I9Q A; 4HXJ A; 3CCJ T; 2GQV A; 2JN0 A; 1AOJ A; 3CPW P; 2MF2 A; 2A0F B; 5HK3 A; 3CCU Q; 4E7Z A; 2KAF A; 2KR3 A; 3OMC A; 2ZPB B; 2PZ1 A; 4FYX B; 2JZ2 A; 3CXC P; 4LN2 A; 4JJD A; 1Q86 C; 4M75 C; 1RAF B; 2JW4 A; 3G6E T; 2XKO C; 3EGD A; 4PLL A; 1PCX A; 3OS1 A; 1UHF A; 2QQS A; 1VQP Q; 2C0I A; 1VQ5 Q; 1UJ0 A; 3FC3 A; 1RAE B; 3ME9 A; 4CC2 A; 4E7S A; 2JS2 A; 2L2P A; 1AWO A; 3HFN A; 4GLK A; 1YHQ A; 1QW1 A; 3QWX X; 1PD0 A; 2JM9 A; 2QTV A; 3QHS A; 5CKF A; 2KI7 A; 5GAN 8; 1M3A A; 2LC4 A; 2M16 A; 2YUO A; 2DYI A; 4M78 A; 1GCP A; 3CCQ T; 2RPN A; 3MCA B; 4JDS A; 4M77 F; 2P4R A; 1OOT A; 3RNJ A; 1NLP C; 2CP5 A; 2CP3 A; 5FU7 C; 3E2U A; 3HRT A; 1PHT A; 3CPW S; 2X4X A; 1C6V X; 4KH1 B; 1VQN Q; 1YP5 A; 2C06 A; 2EWN A; 1UUE A; 5ECA A; 3CXC S; 1RAB B; 5HCK A; 3CCU A; 4PL6 A; 4X9D A; 3JCM c; 2BTT A; 3CD6 T; 4ANJ A; 2VUB A; 3JCM g; 3A5Z B; 2HSP A; 4LUE A; 1KK7 A; 2R58 A; 1KQ1 A; 5CKB A; 5GJV B; 1H92 A; 4E2F B; 3VV0 A; 3NGP A; 1KG1 A; 1N9S A; 1OQK A; 4M77 E; 4VUB A; 1KFZ A; 1NJI R; 2L3Q A; 5D6W A; 3VUB A; 2AZS A; 4KT0 E; 5GAN g; 3QJ6 A; 5GAN j; 1VQP A; 1VQ5 A; 3R6O A; 4C92 A; 2ROL A; 1GL5 A; 2WSF E; 1IHW A; 3F70 A; 4E7K A; 1R0B G; 1M90 U; 1V76 A; 4BE1 A; 1KIK A; 5GMK l; 2KQW A; 2VXF A; 2HQH A; 4EMK A; 4B6M A; 3THK A; 4M7D C; 5LJ3 f; 5EG2 A; 3HSB A; 2YWW A; 2E5K A; 4E7J A; 2CH4 W; 4DQ2 A; 5AT1 B; 1K9M U; 4HCZ A; 1VYU A; 3VRY A; 2LJ3 A; 2LCC A; 3RER A; 5GMK e; 3CCV Q; 1WHH A; 4A4G A; 2NWM A; 2CZ0 B; 4OF1 A; 2XHC A; 4KUL A; 2F69 A; 1VIE A; 2L3R A; 1JEG A; 1QWE A; 2D9T A; 2GCX A; 4C0F A; 1U5S A; 2LNH B; 1Y7X A; 2P0K A; 1WA7 A; 2LMJ A; 1VQ6 Q; 2RD1 A; 1NPR A; 2MI6 A; 1YCS B; 3X20 B; 1VQM T; 1QVG S; 4M77 A; 3OW2 P; 2CZ6 B; 2M02 A; 4XTW A; 1ZA1 B; 2H3J A; 1G3Y A; 1M3C A; 5GAO r; 5DY9 A; 1PSF A; 2CP6 A; 1Q81 U; 1M1F A; 2EVR A; 3V8J A; 2JT4 A; 2LTO A; 3FEO A; 2XD0 A; 4C92 D; 5I2M A; 1M4Z A; 4J5Y A; 3I5R A; 1ABO A; 1Y71 A; 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