The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
70
|
structure length |
70
|
Chain Sequence |
GSSGSSGLEQYVVVSNYKKQENSELSLQAGEVVDVIEKNESGWWFVSTSEEQGWVPATYLEAQNSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
SH3 and PX domain-containing protein 2A
|
| publication title |
Solution structure of the first SH3 domain from human KIAA0418 protein
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
6
|
| structure length |
70
|
| sequence length |
70
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-02-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K6D A; 4HVU A; 1RUW A; 2QDL A; 1E7O A; 2KRM A; 3VS1 A; 2X3W D; 3KFV A; 2O88 A; 3VS7 A; 1UGV A; 2YSQ A; 3NMZ C; 1CSK A; 1HSQ A; 2DF6 A; 1TG0 A; 2XMF A; 1U5S A; 2C0T A; 1WIE A; 2AZS A; 2RQW A; 2DNU A; 1GCQ C; 2RQR A; 3H41 A; 2OI3 A; 1M8M A; 4J9H A; 4JZ4 A; 4HXJ A; 1KIK A; 5HCK A; 4EIK A; 1PWT A; 3VS2 A; 2EBP A; 3I9Q A; 4R0K A; 2KYM A; 4JJB A; 2YUN A; 1ABQ A; 2OAW A; 2E5K A; 1OOT A; 4Y92 A; 4GLM A; 2EYW A; 1KFZ A; 2L3Q A; 1KJW A; 2AKL A; 2GNC A; 2K3B A; 2YUO A; 2VVK A; 1RLP C; 3NPF A; 2YUQ A; 1PRL C; 1ZX6 A; 1CKA A; 1E6G A; 1VYU A; 1Y0M A; 3EGU A; 5FWB A; 2BZ8 A; 5I22 A; 1QWF A; 2ROL A; 2YDL A; 5L23 A; 1NYG A; 2M51 A; 2DX1 A; 1TUD A; 1YP5 A; 3NGP A; 1ZLM A; 4F17 A; 1RLQ C; 2I0N A; 3JV3 A; 2DBM A; 2LQN A; 4J9F A; 1QLY A; 1B07 A; 1JEG A; 2LJ1 A; 3EG3 A; 3FJ5 A; 3VRY A; 1SPK A; 1K0X A; 1BU1 A; 2DBK A; 4WCI A; 2CH4 A; 4FSS A; 3EG0 A; 3M0U A; 1GFD A; 4JPB W; 4RTU A; 2EYZ A; 1LCK A; 1ZUY A; 5FWC A; 2GBQ A; 3U23 A; 2AKK A; 2CSI A; 1X2Q A; 4LE9 A; 3ZL7 C; 1PKS A; 1MUZ A; 2X3X D; 3M0Q A; 1BBZ A; 2CSQ A; 1Y57 A; 2KNB B; 3M0T A; 2LZ6 B; 2FRY A; 1WI7 A; 4OMM A; 3SHW A; 1IO6 A; 1W1F A; 1E6H A; 2K7A A; 3EG1 A; 4ESR A; 2EYX A; 2RN8 A; 4M4Z A; 1X2K A; 2GTJ A; 4DEX A; 1OPK A; 3VRZ A; 2A37 A; 1QKW A; 1OV3 A; 2DIL A; 2M0Y A; 2ECZ A; 1H92 A; 1I07 A; 1YWP A; 4JJD A; 3UAT A; 2DVJ A; 2C0O A; 2FPD A; 2DL5 A; 2L2P A; 2LJ3 A; 1UHF A; 2JTE A; 3LH5 A; 5IXB A; 4OMQ A; 5GJW B; 1Z9Q A; 3PVQ A; 1M3B A; 2JMA A; 2OJ2 A; 4F16 A; 3SEM A; 2SEM A; 2J6F A; 2MCN A; 2FO0 A; 1AEY A; 1SHG A; 2RMO A; 1UJY A; 3VS3 A; 4AFS C; 1XOV A; 5IH2 A; 2AZV A; 4CC7 A; 2D1X A; 1PNJ A; 3QWX X; 1QWE A; 2EGE A; 5IXF A; 1PHT A; 3REB B; 1M3C A; 1T0J A; 1SRM A; 4X1V A; 1WDX A; 1WXT A; 4HVW A; 2KRN A; 4DEY A; 2VKN A; 4CC2 A; 2HEQ A; 2JW4 A; 1YCS B; 4RTX A; 1PKT A; 2LMJ A; 2K9G A; 4RTZ A; 2KR3 A; 1TUC A; 2KXC A; 1I0C A; 3H0H A; 2HSP A; 1ZUK A; 1T0H A; 2CH4 W; 4AFQ C; 1EFN A; 2D8J A; 2PZ1 A; 2EGC A; 1I1J A; 2DRK A; 2L0A A; 2C0I A; 4LNP A; 4RUG A; 4RTW A; 1AWJ A; 5GJV B; 1ZBJ A; 4K11 A; 2KRS A; 1SSH A; 1AD5 A; 2A28 A; 2RQV A; 4LUE A; 2DE0 X; 1NEB A; 4HCK A; 4RTY A; 2LQW A; 3PE0 A; 1UEC A; 1RI9 A; 4LN2 A; 1X43 A; 2GTO A; 4Z8A A; 4OMO A; 2LCS A; 1JXO A; 2A08 A; 2J05 A; 3VS6 A; 3A98 A; 2MOX A; 1ARK A; 1GCP A; 5IHN A; 4CC3 A; 1WX6 A; 2NWM A; 1FYN A; 3REA B; 2ENM A; 2LNH B; 3EHQ A; 1K4U S; 1K0S A; 4J9C A; 1X69 A; 4E6R A; 1YNZ A; 1ZSG A; 1KSW A; 5IHK A; 2RF0 A; 1SRL A; 2JM8 A; 2J7I A; 2KT8 A; 3THK A; 1NLP C; 2J6O A; 2CRE A; 2O31 A; 1UE9 A; 1GFC A; 1QCF A; 2JMC A; 2LP5 A; 4D8K A; 2EQI A; 4J9I A; 1K9A A; 1GRI A; 2KXD A; 3TVT A; 3R6N A; 1B3Q A; 1G83 A; 3EG2 A; 1GBQ A; 4AG1 C; 5EC7 A; 1NM7 A; 4OMP A; 1AWO A; 2O9S A; 2DMO A; 2EYY A; 2JS2 A; 3I5R A; 4JZ3 A; 1NYF A; 2KE9 A; 4KRT A; 2DM1 A; 1K76 A; 1NEG A; 2PNI A; 2KRO A; 2RQT A; 4IIM A; 2DL8 A; 1H3H A; 1JQQ A; 2D0N A; 2FEI A; 1G2B A; 2V1Q A; 3C0C A; 1X6B A; 2SRC A; 2ESW A; 3IQL A; 1VA7 A; 3QWY A; 1U06 A; 3UA7 A; 3VS5 A; 5I11 A; 2DYB A; 1WXB A; 3UA6 A; 1W6X A; 3UF4 A; 1VYV A; 1N5Z A; 2F2V A; 2V1R A; 3I35 A; 2BZY A; 2K2M A; 2BZX A; 1WXU A; 2LX7 A; 2RPN A; 2EW3 A; 1VYT A; 2ED1 A; 4J9E A; 2KYB A; 1HJD A; 2F2W A; 3TSZ A; 1M3A A; 1SEM A; 2CUB A; 4CC4 B; 2JXB A; 3ULR B; 1X27 A; 1AVZ C; 4OML A; 4AFU C; 3EHR A; 2ROT A; 1U3O A; 3RNJ A; 2O2O A; 2JT4 A; 4J9G A; 2KBT A; 4Z89 A; 1AZG B; 1T3S A; 1JXM A; 1BB9 A; 3VS0 A; 2BTT A; 1OPL A; 4GBQ A; 2DA9 A; 2G6F X; 4HVV A; 2HBW A; 4OMN A; 3H0F A; 2YUP A; 1WYX A; 1SHF A; 2EKH A; 1AZE A; 1ZUU A; 1GBR A; 4ZNX A; 1WFW A; 1K1Z A; 4AG2 C; 2ABL A; 1S1N A; 2DRM A; 3M0S A; 4F14 A; 1V1C A; 1AWW A; 1AWX A; 2CUD A; 5IHI A; 5ECA A; 2K79 A; 1J3T A; 3RBB B; 3VS4 A; 2L3P A; 1NLO C; 4RTT A; 1NG2 A; 2DL4 A; 2J6K A; 2HCK A; 2FRW A; 2B86 A; 4IIO A; 5FW9 A; 4JJC A; 1UDL A; 1GCQ A; 1YWO A; 4J9D A; 2KEA A; 1UG1 A; 2EVR A; 1CKB A; 1UFF A; 1Z9Z A; 1JO8 A; 2FPF A; 1MV3 A; 2KGT A; 1HD3 A; 1UHC A; 1A0N B; 2DJQ A; 4LUD A; 1T3L A; 1YN8 A; 4A63 B; 2NUZ A; 2YT6 A; 1M27 C; 2KT1 A; 2EGA A; 1UJ0 A; 2DLP A; 2MIO A; 2DL7 A; 1UTI A; 1WLP B; 1UUE A; 4QT7 A; 2J06 A; 3CQT A; 1GL5 A; 2W10 A; 1M30 A; 1X6G A; 4D8D A; 2VWF A; 4ORZ A; 3M0R A; 3TSW A; 2CT4 A; 1W70 A; 2A36 A; 2HDA A; 4Z88 A; 2EPD A; 1BK2 A; 2LJ0 A; 2DL3 A; 2L3S A; 2JM9 A; 2JS0 A; 2FPE A; 3M0P A; 2D8H A; 3I5S A; 4J9B A; 4RTV A; 3GBQ A; 2IIM A; 1QKX A; 2RQU A; 2F2X A; 4AFZ C; 2GQI A; 3PVL A; 2GGR A; 2CDT A; 1JU5 C; 2CT3 A; 2H8H A; 3O5Z A; 2P4R A; 3NHN A; 1ABO A; 2FG0 A; 1MV0 B; 1WA7 A; 1H8K A; 1FMK A; 2ED0 A; 2PTK A; 2O9V A; 1PRM C; 2RNA A; 3H0I A; 2W0Z A; 1OEB A; 1AOJ A; 2AK5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EG9 A; 2EQM A; 2JN0 A; 1YJN Q; 4HVU A; 4E7I A; 1JBM A; 4KBM B; 1E7O A; 1VUB A; 2HQX A; 2RD1 A; 3CCJ Q; 3NMZ C; 1CSK A; 2DF6 A; 1JJ2 S; 3OYH A; 3CPW A; 2OI3 A; 5GAN 5; 1MMD A; 2E12 A; 1VQL A; 3MHX A; 2RB6 A; 4EIK A; 1KD1 U; 1PWT A; 3VS2 A; 4D6W A; 4R0K A; 3QZ9 B; 3L2W A; 1N9R A; 3CPW P; 3RUX A; 4PK4 A; 1IHW A; 1OOT A; 1Y96 A; 1KFZ A; 1PSF A; 2L3Q A; 1KJW A; 2DXB A; 1YJW T; 4F7U E; 2K3B A; 3RMS A; 2VVK A; 1RLP C; 1OUL A; 1PRL C; 2B8A A; 1Q81 R; 3QBY A; 5A0D A; 1E6G A; 1K8A R; 2DZC A; 1JJ2 A; 4HT9 A; 1Y0M A; 2YXY A; 4FYW B; 5GAM g; 5I22 A; 1QWF A; 4QVD A; 2CZ1 B; 2DXC A; 1JJ2 P; 4M7A C; 1NYG A; 2VV5 A; 1TUD A; 1V76 A; 4E7L A; 1BI0 A; 1UGS B; 4WF2 A; 2LQN A; 2FZC B; 2MYS A; 1ZSZ A; 2QGG A; 1KK7 A; 2XD0 A; 5LJ3 g; 2EQK A; 3EG3 A; 3FJ5 A; 2DTO A; 1SF9 A; 3RDV A; 1TTH B; 1YI2 Q; 1NE8 A; 1PC0 A; 5GMK e; 3JCM e; 4C8Q E; 2QG9 B; 3MEU A; 2HSE B; 1FMV A; 1YIT A; 4QQ6 A; 4B9W A; 4JPB W; 2DAQ A; 3CCM A; 1Q7Y U; 2R5A A; 4N0A A; 1WHL A; 3MEV A; 4F7U F; 3JB9 H; 3VYH B; 5FWC A; 1H64 1; 5FU6 C; 2QAZ A; 1FXX A; 1IRE B; 3P8H A; 2F5K A; 3QJ6 A; 3CMA A; 1KQS A; 1B34 A; 2EFI A; 3BY7 A; 2CSQ A; 3JCM d; 2KNB B; 2LZ6 B; 2Y90 A; 2X4Y A; 2KMT A; 1IO6 A; 1W1F A; 1KQS P; 1K9M R; 3BFM A; 1NJI C; 1WJQ A; 4PJJ A; 2QEX T; 2EYX A; 3EFR A; 1X2K A; 2GTJ A; 5D6X A; 4DBQ A; 4DEX A; 1OPK A; 3M56 A; 3JB9 G; 3TRE A; 1OZ2 A; 1YWP A; 4JJD A; 3FRN A; 2DL5 A; 2L2P A; 4DOW A; 4C8Q F; 3I55 Q; 2LC4 A; 1G5V A; 5GJW B; 4KGX B; 4EMH A; 3CXC S; 4YTL A; 4F16 A; 4OF1 A; 1WPY A; 3SEM A; 2SEM A; 5LJ5 f; 2FO0 A; 1VQ9 A; 1AEY A; 4WTO B; 3QYG B; 3CCL T; 1W2B S; 4KT0 E; 1VQM Q; 4JUV A; 3OSV A; 3LWH A; 5LJ5 h; 2RMO A; 2O01 E; 4AFS C; 5CKD A; 1PHT A; 4L6V 5; 3PTA A; 4M77 G; 1M1K C; 1WDX A; 1WXT A; 4DEY A; 5KYW A; 3J7A F; 3GNF B; 4N4H A; 3CXC A; 2HEQ A; 2M0O A; 1BIA A; 3N5B B; 1PKT A; 4RTX A; 3RR6 A; 2KR3 A; 3UT1 A; 5KYU B; 2HSP A; 1I5L A; 5CVI A; 1ZUK A; 2CH4 W; 1VOM A; 4M7A G; 5CCA A; 1EFN A; 2C0I A; 4RTW A; 5GJV B; 3WVE B; 2OTJ T; 3A8O B; 1I5O B; 2A28 A; 2RQV A; 2E6N A; 3V7S A; 1NEB A; 2DTH A; 2AT1 B; 2X4X A; 5J3B A; 2PU9 B; 1X43 A; 4PJO G; 4JLG A; 3HHT B; 2A08 A; 4PNO A; 2HZY A; 3VS6 A; 4OMF B; 4RCB A; 2MOX A; 1ARK A; 3A8H B; 1GCP A; 4CC3 A; 2FHD A; 2NWM A; 2BKD N; 5KYY A; 1FYN A; 3REA B; 3EHQ A; 4M7A B; 3X25 B; 2RK1 A; 4J7I A; 1K0S A; 2DJZ A; 4LDY A; 2MWP A; 3OYE A; 4MDW A; 3CC4 Q; 2J7I A; 2MK5 A; 3THK A; 3OS1 A; 2RHX A; 5CQX A; 1LPL A; 2LP5 A; 4D8K A; 2YHT A; 4RKU E; 1XJW B; 4J9I A; 5KYX B; 3OA6 A; 1GRI A; 1YJN T; 2BIV A; 3TVT A; 3R6N A; 1B3Q A; 2E41 A; 3CCJ T; 4FYX B; 1D0Z A; 4KUD K; 3G7Z A; 4FU6 A; 3HSB A; 2JS2 A; 3L2U A; 5GAO n; 5FU6 B; 3ER0 A; 2RI3 A; 3ASK A; 1G3Y A; 3JCM f; 2DM1 A; 2PNI A; 3C94 A; 1H3H A; 1JQQ A; 3JCM h; 3CD6 Q; 2FEI A; 2O4X B; 2SRC A; 1W6X A; 1VYV A; 2V1R A; 2F2V A; 2LT1 A; 2K2M A; 1OX9 A; 1WZO A; 2RPN A; 3G6E Q; 1I8F A; 1XQH A; 2ED1 A; 2NLU A; 1FX7 A; 2P0P A; 3UDC A; 2E10 A; 1FMW A; 3QZ5 B; 3BE3 A; 1M3A A; 4C0G A; 3PNW C; 3M5A A; 2CKK A; 2YRC A; 2COY A; 1SKU B; 4OGE A; 2ROT A; 3PIP A; 3G71 A; 1EZZ B; 2O2O A; 4Z89 A; 1P92 A; 1AZG B; 2EJF A; 3E19 A; 3NTI A; 1YI2 T; 3VS0 A; 1OPL A; 4GBQ A; 2G6F X; 1KD1 R; 3P8D A; 2HBW A; 1X6O A; 2YUP A; 1VQL Q; 3LGF A; 4A4G A; 1K8A U; 4M78 D; 1RAA B; 2KAF A; 3CCV A; 5L8R E; 1K1Z A; 1GBR A; 2ABL A; 2X9H A; 2CP7 A; 1LNX A; 2LTO A; 4L5G A; 2CZ0 B; 5GAN 3; 3X26 B; 1VQ4 Q; 4LDU A; 3SFM A; 2FL7 A; 3DLL A; 1J3T A; 2QGF B; 2OAU A; 1I81 A; 4RTT A; 1NJI U; 3G4S T; 2J6K A; 3MPU B; 2LDM A; 2HCK A; 4M77 E; 2B86 A; 1KHI A; 5FW9 A; 1GCQ A; 1C0M A; 1U1S A; 5DLQ E; 2KEA A; 5GMK l; 2EVR A; 3OBW A; 1VQO A; 2LT4 A; 2WSC E; 2NUT A; 1S72 T; 3QDR B; 4OB2 B; 1MV3 A; 3OYJ A; 2M1H A; 4J7F A; 4BI4 A; 3CME Q; 1RL2 A; 5KH6 A; 2IG0 A; 4R55 A; 2NUZ A; 1HK9 A; 4M7A E; 4C92 D; 3I55 T; 4NL3 A; 3RIR A; 4A54 A; 1RAD B; 3ME9 A; 1Q7Y R; 1Q86 C; 1WLP B; 1UUE A; 2J06 A; 2CP2 A; 1VQM T; 4BD3 A; 3E9G A; 5D7U A; 5FRN A; 4D8D A; 1BI1 A; 2VWF A; 4PJO E; 2HKN A; 3EGD A; 3HFO A; 4BDZ A; 3TSW A; 2YWW A; 5CQY A; 3HL8 A; 1M1K U; 1BK2 A; 4M77 F; 3CCE A; 4EDU A; 1IGU A; 3I5S A; 2P0K A; 4RTV A; 4M75 D; 5GMK i; 2EWN A; 3OQ5 A; 1VQ6 Q; 2ZPE B; 2RH2 A; 4PFZ A; 1U1T A; 3CC7 T; 4PL6 A; 3PVL A; 1HYO A; 3FEO A; 4DBH A; 2CT3 A; 1BIB A; 2ZAE A; 2P4R A; 1JB0 E; 4M7A F; 1WA7 A; 2DO3 A; 2MMP A; 1N9S A; 3OYM A; 3HFN A; 2ED0 A; 4E2F B; 2XHC A; 4C5G A; 3I56 T; 3H0I A; 3TU4 K; 5I21 A; 2RHI A; 3S3O A; 1VQ8 Q; 2K6D A; 1UGR B; 2KRM A; 1VQ9 Q; 2X3W D; 2O88 A; 4PJO F; 1UGQ B; 4E7J A; 2YSQ A; 5GAO q; 1U5S A; 3S3M A; 2XI9 A; 1Y71 A; 1WIE A; 2RQW A; 2DNU A; 1YJ9 T; 4XTU A; 1M8M A; 4JZ4 A; 4F7U B; 5HCK A; 3JB9 J; 4FYY B; 2EBP A; 1GXI E; 2QQB A; 1M9S A; 2V26 A; 1ABQ A; 2ZPH B; 4JJB A; 2E5K A; 2DEQ A; 3LGL A; 1WQ7 A; 2DYI A; 2P84 A; 4Y92 A; 5GAO p; 3OYB A; 2EYW A; 3CC4 T; 1D3B B; 3JCM W; 1VQN A; 3HTR A; 3KBG A; 1CKA A; 1Y07 A; 2HD0 A; 1VQK A; 1QVG A; 3OYI A; 3TEE A; 2YDL A; 5L23 A; 2DX1 A; 3T9N A; 3M55 A; 1QVG P; 5LL6 S; 3INZ A; 2A3L A; 3HRT A; 1B07 A; 3MJX A; 1JEG A; 3OW2 S; 4C0D C; 3CD6 T; 3VRY A; 1SPK A; 4Q5W A; 1BU1 A; 4WCI A; 2CH4 A; 2ZCF B; 4M7D D; 1TS9 A; 1GFD A; 1RI0 A; 3PMI A; 2EYZ A; 2VB6 A; 2L5Q A; 3UPU A; 1RAE B; 1KC8 C; 4KH0 B; 2AKK A; 3RMQ A; 1WQW A; 4PFP A; 1X2Q A; 4LE9 A; 4AT1 B; 1K73 C; 3SB2 A; 5LJ5 e; 1PKS A; 2X3X D; 3OW2 A; 3EGX B; 1WI7 A; 1VQ5 Q; 2E1H A; 3ZBD A; 3CBM A; 5CKB A; 2E6Z A; 4M78 G; 3EG1 A; 1C1A A; 1IXD A; 4KUI A; 3OW2 P; 2CP3 A; 1NZ9 A; 5GAO m; 2BUD A; 2OTL Q; 3VU3 C; 4JRQ A; 2DIL A; 2M0Y A; 2PVD B; 1I07 A; 3QXE B; 4ZN3 A; 2DVJ A; 1Q82 C; 2FPD A; 2IVW A; 3VJP A; 3JB9 I; 2JTE A; 4OMQ A; 2K5F A; 1Z9Q A; 3PVQ A; 1WHK A; 1M90 C; 3G1J A; 2D9T A; 2OJ2 A; 1KHC A; 1VQ4 T; 3EH1 A; 1SHG A; 1RAB B; 1PD1 A; 2DER A; 4ZGJ B; 2BE7 D; 1EIF A; 1ZQ1 A; 1QCN A; 1UJY A; 5I2M A; 5IH2 A; 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