The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
58
|
structure length |
58
|
Chain Sequence |
ETKFVQALFDFNPQESGELAFKRGDVITLINKDDPNWWEGQLNNRRGIFPSNYVCPYN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein/inhibitor
|
| molecule keywords |
PROTEIN (SEX MUSCLE ABNORMAL PROTEIN 5)
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| publication title |
Exploiting the basis of proline recognition by SH3 and WW domains: design of N-substituted inhibitors.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Caenorhabditis elegans
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| total genus |
12
|
| structure length |
58
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| sequence length |
58
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-11-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2SRC A; 1ZBJ A; 2C0I A; 1WFW A; 4J9F A; 2DF6 A; 1IO6 A; 1SSH A; 1I1J A; 1MUZ A; 2LJ3 A; 3H0F A; 2LMJ A; 2LNH B; 2YT6 A; 2L3P A; 1OEB A; 4AG2 C; 1X2Q A; 3NGP A; 2KRO A; 4RTX A; 1GL5 A; 2OI3 A; 4DEY A; 2EGC A; 1GRI A; 2K3B A; 2CRE A; 1ZSG A; 5I22 A; 4X1V A; 2K7A A; 2D1X A; 2ECZ A; 2EBP A; 2F2V A; 1AD5 A; 1X6G A; 2RF0 A; 3UF4 A; 2EW3 A; 2HBW A; 2DE0 X; 1AVZ C; 2O9V A; 5FW9 A; 3RNJ A; 3EHQ A; 1J3T A; 3PVQ A; 2EGE A; 1JXO A; 3UAT A; 1H92 A; 2EKH A; 2LZ6 B; 1CSK A; 2CH4 W; 2KXC A; 1H3H A; 1NLP C; 4CC7 A; 2BZY A; 4J9B A; 3PE0 A; 1BB9 A; 1MV3 A; 2KNB B; 1AOJ A; 3M0S A; 4LUE A; 1SRL A; 1NEB A; 1WIE A; 2LCS A; 1K0S A; 1UJ0 A; 2DL7 A; 3PVL A; 5IXB A; 2EPD A; 2ENM A; 3GBQ A; 3CQT A; 3H41 A; 1NM7 A; 4M4Z A; 2E5K A; 2DL4 A; 2PNI A; 1T3S A; 2LQW A; 1WX6 A; 2GBQ A; 3NHN A; 1GBR A; 3EG3 A; 1WI7 A; 2CT3 A; 4F16 A; 1ZUY A; 2YUQ A; 2KRM A; 2YDL A; 1NLO C; 4OMO A; 2EGA A; 1RUW A; 3KFV A; 4JPB W; 3EHR A; 1M3C A; 5IXF A; 1FYN A; 2FG0 A; 4HCK A; 1AWO A; 5EC7 A; 2LJ0 A; 4OML A; 2CSQ A; 2A28 A; 1JEG A; 1WXB A; 2GTO A; 5GJV B; 1BU1 A; 2KE9 A; 4D8K A; 1RLP C; 1K1Z A; 2C0T A; 1I0C A; 1JU5 C; 1OV3 A; 1I07 A; 4JZ4 A; 1UHF A; 1NYF A; 5IHK A; 2VWF A; 1PKT A; 4R0K A; 2KEA A; 2FPD A; 1KSW A; 3SEM A; 2SEM A; 2MCN A; 2JMA A; 2B86 A; 3ZL7 C; 1QLY A; 3H0H A; 1SHG A; 2RN8 A; 1Y57 A; 4A63 B; 1WXT A; 2FPF A; 2DLP A; 1K76 A; 2FEI A; 4FSS A; 3EG0 A; 1T0J A; 1E6G A; 1AEY A; 4QT7 A; 2FRY A; 4J9C A; 2BTT A; 2F2X A; 2V1R A; 1G2B A; 2OJ2 A; 1BK2 A; 1ZUU A; 2RNA A; 1KJW A; 4RTU A; 4F17 A; 2X3W D; 3UA7 A; 1W6X A; 3TVT A; 3TSZ A; 1WYX A; 4CC3 A; 1KIK A; 1RLQ C; 1VA7 A; 3SHW A; 1QKW A; 3NMZ C; 3VS5 A; 1JO8 A; 2LJ1 A; 1UGV A; 1E7O A; 5GJW B; 3I5S A; 4LN2 A; 3VRY A; 1UFF A; 3C0C A; 5IHN A; 1UTI A; 4RTT A; 2RQU A; 1RI9 A; 2YUN A; 2DRK A; 4K11 A; 1PHT A; 1GCP A; 1JXM A; 1JQQ A; 2O31 A; 2C0O A; 4RUG A; 1MV0 B; 2MIO A; 1W70 A; 4HVV A; 2KYM A; 4J9G A; 1K4U S; 1OOT A; 4HXJ A; 1FMK A; 1VYT A; 2DMO A; 2G6F X; 3QWX X; 3ULR B; 1WA7 A; 1OPK A; 2DM1 A; 3VS2 A; 1U3O A; 1M3A A; 4F14 A; 2M0Y A; 2ROT A; 1HD3 A; 2FO0 A; 4RTV A; 2CT4 A; 4KRT A; 2EQI A; 1AWJ A; 1QCF A; 3THK A; 2L2P A; 2GQI A; 2CUB A; 2ED1 A; 1GBQ A; 2AK5 A; 1WXU A; 2D8H A; 4Z89 A; 1YN8 A; 1X27 A; 3VS1 A; 3H0I A; 2RPN A; 2BZX A; 2KYB A; 4HVW A; 2RQT A; 4Y92 A; 2HDA A; 2JTE A; 3A98 A; 2A36 A; 2EYY A; 2J6F A; 4RTY A; 2RQR A; 3R6N A; 3VS7 A; 3M0P A; 3VS0 A; 4JJD A; 1ABQ A; 1K0X A; 4JZ3 A; 4DEX A; 2CUD A; 4OMP A; 2A37 A; 1T3L A; 1V1C A; 4ZNX A; 4AFZ C; 2PZ1 A; 2AZV A; 4HVU A; 2LQN A; 2FPE A; 1VYU A; 3FJ5 A; 2F2W A; 1S1N A; 2MOX A; 4JJB A; 1Y0M A; 4RTW A; 3VS6 A; 5L23 A; 1CKA A; 1U06 A; 1GCQ A; 1X2K A; 2EVR A; 2O9S A; 2V1Q A; 1AZG B; 1EFN A; 1ZLM A; 1TUC A; 1SEM A; 1G83 A; 2JMC A; 2DYB A; 1M8M A; 2JS0 A; 2OAW A; 2YUP A; 1SPK A; 1WDX A; 1QWE A; 5FWC A; 2M51 A; 3M0T A; 1NEG A; 4AFU C; 2DVJ A; 2CSI A; 2D8J A; 1YP5 A; 2EYX A; 4GBQ A; 2XMF A; 4AG1 C; 1UUE A; 1ZX6 A; 4AFS C; 1PKS A; 1SRM A; 3M0U A; 4LNP A; 1UHC A; 1HSQ A; 2JS2 A; 4ESR A; 2J05 A; 4EIK A; 2A08 A; 4ORZ A; 2DRM A; 2KT1 A; 5I11 A; 2RMO A; 2W0Z A; 2KRN A; 5IHI A; 3TSW A; 4IIM A; 4OMN A; 2EYZ A; 3I35 A; 2JT4 A; 2JW4 A; 1YWP A; 4OMQ A; 3EG2 A; 1E6H A; 2J6O A; 1PNJ A; 1QKX A; 2NWM A; 4AFQ C; 1X43 A; 3M0R A; 2L3S A; 2KR3 A; 2GTJ A; 3NPF A; 2X3X D; 1KFZ A; 1W1F A; 4D8D A; 1Z9Q A; 2AZS A; 2ESW A; 1M27 C; 2GGR A; 4J9I A; 1YCS B; 1NG2 A; 2K9G A; 1YNZ A; 3EG1 A; 1ZUK A; 2DBK A; 2DBM A; 2RQV A; 1AZE A; 1UDL A; 2FRW A; 1PRL C; 1UJY A; 2DL8 A; 3IQL A; 3REB B; 2J06 A; 2DJQ A; 1PRM C; 3EGU A; 1X6B A; 1M30 A; 2CDT A; 3LH5 A; 1WLP B; 1GFD A; 2VVK A; 1VYV A; 2J7I A; 1N5Z A; 2L0A A; 2RQW A; 4E6R A; 1UEC A; 2I0N A; 1PWT A; 2EYW A; 3I9Q A; 1Z9Z A; 1K9A A; 4IIO A; 2IIM A; 2JM9 A; 1TUD A; 2DIL A; 1AWX A; 1QWF A; 1T0H A; 4LE9 A; 4J9E A; 2K6D A; 1B3Q A; 4RTZ A; 2ROL A; 5HCK A; 4JJC A; 3RBB B; 2AKL A; 1U5S A; 1ARK A; 4J9H A; 4GLM A; 2O2O A; 2YSQ A; 1B07 A; 1OPL A; 5FWB A; 2CH4 A; 2DL5 A; 5IH2 A; 4J9D A; 4LUD A; 3UA6 A; 2YUO A; 2KBT A; 2KRS A; 4OMM A; 2HSP A; 1UG1 A; 1CKB A; 1X69 A; 3VRZ A; 2HEQ A; 1ABO A; 2W10 A; 2KGT A; 2KXD A; 1GFC A; 1H8K A; 2P4R A; 2HCK A; 1SHF A; 1A0N B; 3JV3 A; 4CC2 A; 2QDL A; 1LCK A; 1YWO A; 2AKK A; 2DL3 A; 2GNC A; 5ECA A; 1AWW A; 1NYG A; 2H8H A; 2NUZ A; 1TG0 A; 3M0Q A; 1HJD A; 3QWY A; 2LX7 A; 4Z88 A; 4WCI A; 1BBZ A; 2VKN A; 3I5R A; 2DX1 A; 2DNU A; 4Z8A A; 2KT8 A; 2BZ8 A; 2DA9 A; 2K2M A; 2L3Q A; 1UE9 A; 2D0N A; 2JXB A; 2ABL A; 2J6K A; 2LP5 A; 2JM8 A; 2K79 A; 3U23 A; 4CC4 B; 2ED0 A; 1M3B A; 3O5Z A; 2PTK A; 3VS3 A; 2O88 A; 1GCQ C; 1XOV A; 3REA B; 3VS4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1SSH A; 2DD4 A; 4PJO F; 4OP0 A; 5GAN f; 2LMJ A; 1QVP A; 2LNH B; 1Y07 A; 2L3P A; 1PSE A; 2YT6 A; 4AG2 C; 3AHU A; 3CCJ Q; 3NGP A; 2XKO C; 2KRO A; 1GL5 A; 1D0X A; 2CZ1 B; 1VQK T; 3RKY A; 2VB6 A; 2CRE A; 1VQ6 Q; 1HK9 A; 2MPX C; 1KG1 A; 4X1V A; 2K7A A; 3G1J A; 2CZ0 B; 1X6G A; 4M77 G; 9ATC B; 2RF0 A; 3JCM f; 2VC8 A; 2LC4 A; 3BFM A; 2EW3 A; 4M7D E; 2DE0 X; 1XQH A; 2DXC A; 1KQS A; 5C6S A; 3CCJ A; 4BI4 A; 1J3T A; 2FZC B; 1U1S A; 2L89 A; 1R77 A; 2LZ6 B; 3SDZ A; 1HYO A; 1CSK A; 2KQW A; 4CI0 C; 2RK2 A; 3EFO B; 1K9M R; 3M57 A; 1MV3 A; 2KNB B; 2VXF A; 2E41 A; 4M75 D; 1WGS A; 2JVV A; 2AT1 B; 3OYL A; 1UJ0 A; 3PVL A; 3L1A A; 3GBQ A; 2QQA A; 2F1L A; 3H41 A; 5FU6 C; 2DL4 A; 2LCL A; 1VQ8 A; 3OYB A; 4RCC A; 4KGV B; 4PLL A; 2HQE A; 2JTF A; 1MND A; 1RUW A; 2F69 A; 3RIR A; 3OYE A; 3OYN A; 2BIV A; 2FG0 A; 4M77 A; 3QYG B; 2M0O A; 1JEG A; 1QW1 A; 1WXB A; 1IGU A; 1D09 B; 5GJV B; 3M5A A; 2KVQ G; 3NTI A; 3L2U A; 2QGF B; 5GAN e; 4BE1 A; 1KD1 C; 1B34 A; 3OA6 A; 1I0C A; 1JU5 C; 1N8R C; 1I07 A; 4JZ4 A; 1UHF A; 4ZTF A; 1NYF A; 4XTW A; 1YJ9 T; 2YRV A; 2KEA A; 1M90 U; 1DJ7 B; 2NUP B; 1KSW A; 2JMA A; 2B86 A; 3H0H A; 1JB0 E; 3G6E A; 2RHX A; 1EIF A; 3ER0 A; 1ZBX A; 3JCM e; 1VQN Q; 1T0J A; 1E6G A; 3SB2 A; 2XDD A; 2BTT A; 2F2X A; 2V1R A; 3I55 T; 1FWZ A; 4BDZ A; 1BK2 A; 2YLC A; 3MHX A; 4R55 A; 4C8Q C; 2OTL Q; 3OYJ A; 2RNA A; 3OBW A; 4QW2 A; 1V76 A; 4C92 E; 4DOV A; 3HTR A; 1KIK A; 1RLQ C; 2CZ6 B; 2OAU A; 3SHW A; 2C06 A; 1QKW A; 2P0Q A; 3SWN C; 3KUF A; 3JCM X; 2EQJ A; 4A53 A; 1W2B A; 2GFA A; 2ZPE B; 3WVD B; 3GOX A; 2L3R A; 3OSS C; 4KT0 E; 2RQU A; 5J3B A; 3PT9 A; 1WQW A; 1XNI A; 1UEB A; 4LXC A; 1XJW B; 1WHM A; 3RES A; 4M7A C; 4L5G A; 4PFP A; 1Q95 G; 2MIO A; 3DB4 A; 3JCM c; 1K4U S; 1FMK A; 4O6J A; 1VYT A; 2DMO A; 2G6F X; 4HCZ A; 1NJI U; 2MF2 A; 2I2L A; 3CCU T; 2K3Y A; 1U3O A; 3EFO A; 4M75 A; 1HD3 A; 1K8A U; 3CCV Q; 2JTM A; 4C0F A; 1QCF A; 2DAQ A; 1VQ9 Q; 3RKW A; 5GAN 6; 3MP6 A; 1GBQ A; 4FM4 B; 1BYM A; 1KHI A; 1X27 A; 1YJN Q; 4JJN K; 2JZ2 A; 1SF9 A; 3JB9 I; 3CEY A; 2DXU A; 2RQR A; 3R6N A; 3CCV A; 2DK3 A; 3HL8 A; 4JZ3 A; 1V1C A; 1WJQ A; 3CPF A; 3INZ A; 2AZV A; 4HVU A; 1QVG S; 1VYU A; 2JJ9 A; 2F2W A; 4JJB A; 1Y0M A; 4FT4 A; 1YJN A; 3RKX A; 3CC4 Q; 1M1K R; 1CKA A; 1GCQ A; 2V1Q A; 4N4I A; 2FB7 A; 2EJF A; 3QHS A; 3EFS A; 2RH2 A; 2JMC A; 2NUP A; 1M8M A; 4FW1 A; 2OTJ T; 4DBQ A; 1WDX A; 1QWE A; 3GP8 A; 2EJ9 A; 2EQM A; 3EGX B; 3M0T A; 1IRE B; 1Q81 U; 4M75 C; 2DVJ A; 3FEO A; 1VQP Q; 2D8J A; 5LJ3 g; 1D1C A; 3CBP A; 4BE0 A; 2L5Q A; 2EYX A; 1YJW A; 2XMF A; 4PFO A; 2QA4 Q; 1SRM A; 4LNP A; 3CME T; 2CP5 A; 3LX7 A; 2MI6 A; 4KGX B; 2DRM A; 2E3H A; 4E7H A; 3CCS A; 3MEV A; 4ZTJ A; 5I11 A; 2WSC E; 4RCB A; 2W0Z A; 4IUR A; 1VQK Q; 1VQP A; 1Q82 U; 1UGQ B; 4JDS A; 1VQO T; 2JT4 A; 3S3N A; 1E6H A; 4QVC A; 1QKX A; 1NPP A; 3OS1 A; 1QVF A; 2L3S A; 3NPF A; 2X3X D; 1KFZ A; 4BY6 B; 5FRO A; 2ESW A; 3JRZ A; 4J9I A; 1N9S A; 5LJ5 d; 1VQL Q; 2K9G A; 3BW1 A; 3OYH A; 1OYX A; 5LJ3 j; 2FRW A; 2M02 A; 1MMA A; 2Z0W A; 1PRL C; 1UJY A; 2JN0 A; 1YIJ T; 5I2S A; 1IRX A; 1TXQ A; 4LDW A; 2EWN A; 1M30 A; 2G3R A; 5KCO A; 1WLP B; 2NLU A; 2WSF E; 4E7Z A; 2DFU A; 2HL3 A; 4LD9 K; 4XAX B; 2LRQ A; 2K5F A; 3H9N A; 4BAC A; 2F5K A; 4L59 A; 5KYU B; 2IPO B; 2V8J A; 3NTK A; 1TUD A; 2D0Q B; 3M58 A; 1IGQ A; 1B3Q A; 4RTZ A; 4OF1 A; 4IUT A; 2VGM A; 3A8O B; 4HCC A; 2DZ9 A; 1JJ2 P; 5GAN j; 1N6A A; 5LJ5 g; 2AKL A; 2DTO A; 1LJO A; 3CCL Q; 1AHJ B; 2YSQ A; 3QJ6 A; 1UGS B; 2K57 A; 5IH2 A; 5CKE A; 4M78 B; 1XTD A; 3L42 A; 1IHV A; 2KBT A; 1YJ9 Q; 3R6O A; 3X20 B; 2HSP A; 4AMC A; 4N4H A; 4F7U E; 2HEQ A; 3EGX A; 1QVG P; 2HZY A; 3JB9 D; 2HSE B; 1H8K A; 3OQ5 A; 2HCK A; 1TS9 A; 2RK1 A; 2AHJ B; 1IHW A; 2LX9 A; 1KHC A; 3VYH B; 2QDL A; 2RB6 A; 2DPP B; 3HHT B; 1LCK A; 3OS0 A; 3URG A; 1YJ9 A; 4A4K A; 2DVE A; 1Q7Y R; 2H8H A; 1TG0 A; 3VYG A; 3DKM A; 3QWY A; 2PVO B; 2LX7 A; 4Z88 A; 4EDU A; 4Z8A A; 5GAM g; 2XDB A; 4BUG A; 1OU9 A; 5HK3 A; 2KSS A; 4C8Q E; 2LP5 A; 3VUB A; 4RG2 A; 2R58 A; 3I55 A; 3G4S A; 2K79 A; 4JLI A; 1IZ6 A; 1YBY A; 2K3X A; 1PD1 A; 4BE2 A; 3O5Z A; 5CQY A; 1RAE B; 4BDY A; 3VS3 A; 3HSB A; 2CP0 A; 5FU7 C; 1YHQ T; 3OYD A; 1KQS S; 4M78 G; 1ZBJ A; 1FMW A; 2RM4 A; 3QYH B; 3JCM P; 4J9F A; 1R8O B; 2DF6 A; 1IO6 A; 2P84 A; 4E7I A; 2MWP A; 3H0F A; 5AT1 B; 1X2Q A; 1K8A C; 3A5Z B; 1C6V X; 2OI3 A; 4J6W A; 3CCU Q; 2EGC A; 2K3B A; 4MZT A; 5GAN 4; 2KDS A; 5D6W A; 2D1X A; 3CCM T; 4M7A E; 4X9D A; 2MYS A; 2KK4 A; 1K9M U; 3CCQ T; 2LNV A; 3DLM A; 1BCM A; 1WHJ A; 1AVZ C; 3CD6 T; 4XU1 A; 5FW9 A; 2Y4Y A; 3UWN A; 5GAM j; 3RNJ A; 1S72 T; 5KYU A; 3OYG A; 3PVQ A; 3L2Z A; 1JXO A; 3CCU A; 2CP3 A; 3E9G A; 4LDV A; 1H92 A; 4MDW A; 4B9W A; 5HKC A; 4XQ3 A; 2CH4 W; 4JS5 A; 4DQ2 A; 1IB8 A; 3L2V A; 1K73 R; 2DO3 A; 1M1F A; 2XID A; 1WNL A; 3MO8 A; 2QK0 A; 1Y7X A; 3M0S A; 4M78 A; 1NEB A; 1SSF A; 1WIE A; 4C0Z A; 1K0S A; 4HKE A; 2ENM A; 2A7Y A; 2OTJ Q; 1NM7 A; 4JUV A; 1VQ5 Q; 2GBQ A; 2ZGW A; 3MKD A; 3LH0 A; 2EQK A; 4O5V A; 4JPB W; 1M3C A; 3CME Q; 1AWO A; 1HXD A; 1BIA A; 2OTJ A; 1BU1 A; 5LJ3 f; 4M77 D; 4XTV A; 2C0T A; 3C95 A; 4PJO B; 4TVR A; 4F7U F; 1WHK A; 4XK8 E; 2X4X A; 1VQO Q; 4RKU E; 3C12 A; 4FT2 A; 3CME A; 1SHG A; 2RN8 A; 4J7F A; 4A63 B; 4EMK C; 3ME9 A; 5GMK j; 1BI0 A; 3GIB A; 2FEI A; 2KY9 A; 3EG0 A; 2CS7 A; 3L2R A; 1EZZ B; 3CPW A; 1W2B S; 3EH1 A; 3M9Q A; 4EMG A; 1VQO A; 2B8A A; 4ELY C; 2OJ2 A; 2YRC A; 4HT9 A; 4J6Y A; 1G3T A; 1M5Q 1; 4RTU A; 2ZPI B; 5GAO m; 3TVT A; 3TSZ A; 3HFO A; 4C8Q F; 4CC3 A; 5GAN 3; 1X01 A; 2MMP A; 2HQX A; 3GPL A; 2H3J A; 4FYY B; 4JRQ A; 3WXM B; 4QVZ A; 5GJW B; 4OB0 B; 3CCR T; 3I56 T; 3JB9 J; 2FL7 A; 3V7R A; 1UFF A; 1YIJ A; 1RAB B; 1UTI A; 4RTT A; 5DM7 R; 4EPC A; 4PJO G; 2H3E B; 1RL2 A; 1PHT A; 2FHD A; 1JXM A; 1F1B B; 2X4J A; 1MV0 B; 1KD1 R; 4J9G A; 2KYM A; 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