The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
78
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structure length |
78
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Chain Sequence |
RAQDKKRNELGLPKMEVFQEYYGIPPPPGAFGGFLRLNPGDIVELTKAEAEHNWWEGRNTATNEVGWFPCNRVHPYVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
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| molecule keywords |
vav
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| publication title |
Solution structure of N-terminal SH3 domain of Vav and the recognition site for Grb2 C-terminal SH3 domain
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
6
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| structure length |
78
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| sequence length |
78
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-09-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DMO A; 2LQW A; 1WA7 A; 2OI3 A; 4CC3 A; 3VS5 A; 3NPF A; 1QCF A; 2L3P A; 2LMJ A; 2L3Q A; 4HVU A; 4GLM A; 1H3H A; 1W70 A; 1M30 A; 2D8J A; 1KFZ A; 4J9D A; 1ZLM A; 2M51 A; 2W0Z A; 1SRM A; 1ZUY A; 4OMN A; 4HCK A; 4OMP A; 2OJ2 A; 1ZUU A; 2O2O A; 1K76 A; 4LNP A; 2EW3 A; 2GQI A; 3C0C A; 3EG3 A; 4HVV A; 4ESR A; 2AKL A; 1M27 C; 2EGC A; 2DRM A; 3VRZ A; 2KXD A; 3REB B; 3NGP A; 2GTO A; 1SSH A; 2K7A A; 1XOV A; 2J6O A; 2CT3 A; 4X1V A; 1HD3 A; 5L23 A; 2IIM A; 2CUD A; 3RNJ A; 2L0A A; 2FEI A; 3H41 A; 4AFQ C; 1WXU A; 5GJV B; 2NUZ A; 2HBW A; 4R0K A; 2K79 A; 2GTJ A; 2A36 A; 4DEX A; 1SHG A; 4OMM A; 1B07 A; 1FMK A; 2J6K A; 2PNI A; 1WYX A; 4LN2 A; 1SHF A; 2HDA A; 3VS1 A; 1NM7 A; 1YN8 A; 1HSQ A; 1QLY A; 3THK A; 2PTK A; 5IHI A; 2EYW A; 1M8M A; 3VS0 A; 2E5K A; 4LUD A; 3M0S A; 2YUP A; 4J9F A; 2QDL A; 2CH4 A; 1OEB A; 1WXB A; 1PNJ A; 2LP5 A; 3CQT A; 3REA B; 2DRK A; 5FW9 A; 2V1R A; 4J9H A; 4QT7 A; 3LH5 A; 2A28 A; 2DL5 A; 2KEA A; 4FSS A; 1OV3 A; 2D1X A; 5ECA A; 2CH4 W; 1NEG A; 1JQQ A; 1ZBJ A; 2EGA A; 1CKA A; 1WI7 A; 4RTV A; 2RQR A; 4RTU A; 2K6D A; 2YUN A; 2DIL A; 2XMF A; 3M0U A; 3GBQ A; 1GCQ C; 4AFS C; 4KRT A; 2FG0 A; 2DF6 A; 1BBZ A; 2AK5 A; 2KT1 A; 1SEM A; 2JS0 A; 1W6X A; 2LNH B; 4OMO A; 4Z88 A; 4OMQ A; 3IQL A; 1GFC A; 1G2B A; 4J9C A; 2OAW A; 2JS2 A; 2HEQ A; 1WLP B; 1ABQ A; 3UF4 A; 3VS3 A; 2EYZ A; 1Y0M A; 1M3C A; 1PKS A; 4IIO A; 5IHK A; 2ED1 A; 3H0H A; 1RLQ C; 2EBP A; 4A63 B; 2RPN A; 4JJC A; 1X2K A; 1ABO A; 4LE9 A; 2A37 A; 1UHF A; 1UG1 A; 2LZ6 B; 2RF0 A; 1YP5 A; 2B86 A; 1KJW A; 2JMA A; 2RQV A; 1JEG A; 3TSW A; 3M0R A; 1OPL A; 2YSQ A; 2KGT A; 2D0N A; 1UGV A; 2EGE A; 1YNZ A; 2ECZ A; 4RTW A; 2KE9 A; 4EIK A; 2F2X A; 4K11 A; 2ROT A; 3TSZ A; 4CC4 B; 1BU1 A; 1ARK A; 2CRE A; 2KRM A; 2ESW A; 3PVL A; 1K0S A; 1AVZ C; 1I1J A; 1WXT A; 3KFV A; 2FO0 A; 2DL8 A; 3EHR A; 2EYX A; 1JXM A; 4JZ4 A; 2FPE A; 1JO8 A; 1G83 A; 4CC7 A; 2MOX A; 1RLP C; 1U5S A; 2BZY A; 2CSQ A; 3FJ5 A; 3UAT A; 1NG2 A; 1T3S A; 3R6N A; 3VS2 A; 1NEB A; 1U06 A; 1J3T A; 1BB9 A; 1UTI A; 4RTX A; 3EGU A; 2I0N A; 1AD5 A; 1MV0 B; 1QWE A; 3PVQ A; 4D8K A; 4AG1 C; 1M3A A; 1QKW A; 1YWO A; 2RQT A; 2ED0 A; 2J6F A; 2FRY A; 1FYN A; 3NHN A; 2KR3 A; 4D8D A; 1A0N B; 2JMC A; 2KBT A; 3M0T A; 4Z89 A; 2JT4 A; 4HVW A; 1I0C A; 1WDX A; 2YDL A; 1H92 A; 1X43 A; 2C0T A; 2O31 A; 5IH2 A; 2C0O A; 3VS7 A; 2LQN A; 4HXJ A; 5IXB A; 1E7O A; 1Z9Z A; 2KYM A; 1K0X A; 3NMZ C; 3UA7 A; 1GBQ A; 2O88 A; 2KYB A; 2HSP A; 3M0Q A; 5FWC A; 2DVJ A; 2ENM A; 2W10 A; 3VRY A; 5IHN A; 2FPF A; 3H0F A; 1M3B A; 2JTE A; 2G6F X; 2BTT A; 2MCN A; 3SEM A; 4F14 A; 2EVR A; 4JJD A; 2KT8 A; 4J9I A; 4CC2 A; 1GCQ A; 4M4Z A; 2DLP A; 1TUC A; 1K9A A; 1OOT A; 1Z9Q A; 3EG2 A; 2AKK A; 1K4U S; 2M0Y A; 2RMO A; 1K1Z A; 2NWM A; 1WIE A; 5EC7 A; 5GJW B; 5I22 A; 1T0J A; 2DA9 A; 1AWJ A; 2L3S A; 2PZ1 A; 2SRC A; 2DL7 A; 1UEC A; 1VYU A; 1AWO A; 2RQU A; 2DL3 A; 2O9S A; 1AOJ A; 2KNB B; 1X2Q A; 4JPB W; 4RUG A; 1PRL C; 1GL5 A; 1VYT A; 2ABL A; 1NLP C; 5FWB A; 2LJ3 A; 2X3W D; 3ZL7 C; 1MV3 A; 1X69 A; 1H8K A; 1UUE A; 2CUB A; 1NLO C; 4J9E A; 2D8H A; 1YCS B; 2AZS A; 3I5R A; 2J06 A; 4J9B A; 2X3X D; 1MUZ A; 2C0I A; 3I35 A; 1OPK A; 2YT6 A; 1SPK A; 2A08 A; 4OML A; 1YWP A; 3VS6 A; 4WCI A; 4J9G A; 1PWT A; 1JXO A; 1PRM C; 1E6G A; 1VA7 A; 2KRO A; 1EFN A; 1PHT A; 2RNA A; 3A98 A; 1T3L A; 3M0P A; 1UFF A; 2F2W A; 2FPD A; 3UA6 A; 1QWF A; 1WFW A; 4JJB A; 4ORZ A; 2L2P A; 1N5Z A; 1I07 A; 1KIK A; 1U3O A; 2VVK A; 1LCK A; 4AFU C; 1GBR A; 2LX7 A; 2DJQ A; 2MIO A; 2J7I A; 1GCP A; 4E6R A; 2O9V A; 3H0I A; 3EHQ A; 1IO6 A; 2GBQ A; 1SRL A; 2EQI A; 2H8H A; 1X27 A; 2ROL A; 1S1N A; 3PE0 A; 3EG0 A; 1V1C A; 1RUW A; 4RTT A; 2DBM A; 5I11 A; 2DBK A; 2JW4 A; 1W1F A; 2DE0 X; 2VKN A; 1BK2 A; 1UJ0 A; 4AFZ C; 1ZSG A; 2LCS A; 4AG2 C; 2KXC A; 2CSI A; 5HCK A; 1NYG A; 1NYF A; 4Z8A A; 3SHW A; 1CSK A; 1KSW A; 1UE9 A; 2K3B A; 1HJD A; 2RN8 A; 1AZE A; 1AZG B; 2DM1 A; 4RTZ A; 2SEM A; 2BZ8 A; 2K9G A; 2KRS A; 1AWW A; 4F16 A; 1TG0 A; 2P4R A; 1TUD A; 2YUO A; 1UHC A; 1AEY A; 4LUE A; 1T0H A; 2YUQ A; 1Y57 A; 1ZX6 A; 2JM9 A; 1JU5 C; 4IIM A; 3QWX X; 1QKX A; 1UJY A; 2CDT A; 2JM8 A; 3I9Q A; 1CKB A; 4RTY A; 1ZUK A; 1RI9 A; 1UDL A; 2J05 A; 5IXF A; 2CT4 A; 2FRW A; 2LJ1 A; 1GRI A; 1E6H A; 2EYY A; 1GFD A; 1X6G A; 4GBQ A; 4JZ3 A; 2AZV A; 2VWF A; 2DX1 A; 3JV3 A; 2EKH A; 2LJ0 A; 3U23 A; 2EPD A; 2K2M A; 1PKT A; 1B3Q A; 3I5S A; 4Y92 A; 3RBB B; 2DYB A; 2GNC A; 2HCK A; 2JXB A; 4F17 A; 2V1Q A; 1WX6 A; 3VS4 A; 2DL4 A; 2BZX A; 3QWY A; 1AWX A; 2DNU A; 2RQW A; 2GGR A; 3EG1 A; 4DEY A; 3ULR B; 4ZNX A; 2F2V A; 2KRN A; 1X6B A; 1VYV A; 3TVT A; 3O5Z A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2L3R A; 2LQW A; 4CC3 A; 1Q86 C; 2JTF A; 4GLM A; 4N4H A; 3MO8 A; 2QA4 T; 3LW5 E; 1BCM A; 1M1K R; 4M77 E; 1ZUY A; 1IXD A; 4KGZ B; 4HCK A; 3OSS C; 1ZSZ A; 2RH2 A; 4LNP A; 1YJ9 T; 4A53 A; 2EW3 A; 2H3J A; 3EG3 A; 3CCE A; 3DKM A; 2BKD N; 4IUP A; 2ZPF B; 4C5E A; 1K8A C; 1I4K 1; 5AT1 B; 3UPU A; 5L23 A; 2F1L A; 3HRT A; 1OZ2 A; 2FEI A; 4AFQ C; 1BI2 A; 2QDY B; 4OB2 B; 3CME Q; 3CCS Q; 2DPP B; 5A0G A; 2PVD B; 2K79 A; 4OMM A; 1KHC A; 3MET A; 1ZA1 B; 2J6K A; 1O9S A; 5LJ3 g; 2DO3 A; 3OW2 A; 4CI0 C; 1SHF A; 1MNE A; 4XTW A; 1D0Y A; 3X28 B; 1Q7Y C; 4JLG A; 2H3E B; 4JJN K; 3OYY A; 5IHI A; 1VQ6 Q; 1Y71 A; 2EYW A; 3VS0 A; 1IGU A; 2QGF B; 2HAX A; 4J9F A; 3A8G B; 1WHL A; 2FZK B; 1YIJ A; 4MZP A; 1ZBX A; 2F5K A; 4QT7 A; 4C5H A; 1VQK Q; 1LOJ A; 2VC8 A; 4FSS A; 1OV3 A; 1YBY A; 4C0F A; 2EGA A; 2LRQ A; 4DA4 A; 4RTU A; 2K6D A; 3I56 T; 5D6Y A; 2DIL A; 2XMF A; 2AHJ B; 1KC8 R; 1KQS A; 2FG0 A; 2V8J A; 1VIE A; 3OYI A; 4J6X A; 1OX8 A; 1SEM A; 2JS0 A; 1M2V A; 5DLO A; 4OMO A; 4PL6 A; 4Z88 A; 5GMK m; 1C1A A; 1GFC A; 1G2B A; 5D6W A; 2EQM A; 1Q86 R; 3HL8 A; 5KYN A; 4XU1 A; 2E3H A; 3V7C A; 1VQK T; 4KBM B; 1N6A A; 4OP0 A; 4IIO A; 2ED1 A; 4A63 B; 4J7F A; 1X2K A; 1ABO A; 2LCC A; 4M7A G; 2A37 A; 2K4Y A; 3CCM Q; 2RF0 A; 2BIV A; 2FHD A; 2BE9 B; 3OS1 A; 1JEG A; 3M4G A; 2QI2 A; 1OPL A; 5HY6 A; 5J3B A; 1YIT Q; 1VQ7 Q; 5CQY A; 2F2X A; 1TUG B; 1MMA A; 3MP8 A; 1ARK A; 2KRM A; 5J26 A; 3EFO A; 1H64 1; 2CZ0 B; 1QVF A; 1I1J A; 3QZ5 B; 3CEY A; 1NJI U; 2KQW A; 1JJ2 S; 1JXM A; 2HNI A; 2M0O A; 5GAO r; 4KUL A; 4M7A A; 2FPE A; 1JO8 A; 1UGP B; 3TQ7 P; 3JCM g; 2E4H A; 2MOX A; 1RLP C; 3UAT A; 5KYU B; 1Q82 C; 1NG2 A; 3R6N A; 1OUL A; 1WJS A; 1U06 A; 4E7Z A; 1UTI A; 1KK7 A; 2CP3 A; 2I0N A; 2XU8 A; 5GAO m; 1QWE A; 3WVD B; 4D8K A; 1YIT T; 3RES A; 4AG1 C; 1TOV A; 2J6F A; 1W2B P; 4HVW A; 1I0C A; 1OYX A; 1WDX A; 3MCA B; 2MI6 A; 2YDL A; 4MDW A; 3EG9 B; 3OYH A; 2C0O A; 2DXU A; 2LQN A; 1E7O A; 3CPW P; 5KYX A; 3Q1J A; 1K0X A; 1ZQ1 A; 5GAN e; 3M0Q A; 4M7D C; 4LDW A; 2W10 A; 3OYB A; 5CKF A; 2FPF A; 3H0F A; 4OGC A; 4C8Q G; 4DQ2 A; 4XQ3 A; 1RAI B; 4R55 A; 2JTM A; 1UEB A; 4OB0 B; 2BTT A; 2E65 A; 2A3L A; 4JJD A; 4J9I A; 4CC2 A; 1TUC A; 2YHT A; 4E47 A; 1OOT A; 1Z9Q A; 5AYF A; 4M7D F; 1K4U S; 3MEA A; 2M0Y A; 2O4X A; 2NWM A; 1K73 R; 1T0J A; 2ZPE B; 3J7A F; 1M8V A; 2PZ1 A; 1IHW A; 1UEC A; 2VV5 A; 2M9U A; 4E7L A; 1VYU A; 1AWO A; 4M75 G; 2DL3 A; 2WSE E; 2KNB B; 4JPB W; 1X2Q A; 4MZM A; 5FRO A; 4M7D E; 3MEW A; 1PRL C; 3ZFJ A; 1RAA B; 2ABL A; 5FWB A; 2LJ3 A; 1X69 A; 2YXY A; 4C8Q A; 4J8O A; 4J9E A; 1OQK A; 2Y90 A; 1YCS B; 2AZS A; 7AT1 B; 5IT9 E; 1U8R A; 2LQK A; 2CP7 A; 2C0I A; 3CXC S; 3I35 A; 4HCB A; 2XI9 A; 2DVE A; 3OS5 A; 2CP5 A; 2YT6 A; 4XU2 A; 3LLR A; 5KE3 A; 2CZ7 B; 2MF2 A; 2ZPG B; 1FXX A; 4DBQ A; 3DB4 A; 5KH6 A; 1VQ5 Q; 4EPC A; 1PWT A; 1QP3 A; 2OTJ T; 1VA7 A; 2KRO A; 1EFN A; 1PHT A; 2KK4 A; 1Q82 R; 1ZSZ C; 1D0Z A; 1T3L A; 3M0P A; 1UFF A; 4BI4 A; 4E7K A; 1D3B B; 5LJ3 e; 4AFU C; 2R5A A; 1GBR A; 1PD0 A; 2J7I A; 1SSF A; 1X6O A; 3CCV Q; 1IB8 A; 4PFO A; 3H0I A; 2VGM A; 4FM4 B; 1KG1 A; 2E3I A; 1IO6 A; 2GBQ A; 2L5Q A; 4XTZ A; 5CO7 A; 2PVG B; 2EQI A; 2QQS A; 4PFZ A; 1I8F A; 3V8K A; 1NBE B; 1BIB A; 3PE0 A; 2EQK A; 3PIO A; 2DBM A; 1DJ7 B; 2DE0 X; 3NFC A; 1QVG S; 1BK2 A; 4AFZ C; 1KD1 R; 3EGX A; 1VQP A; 4AG2 C; 2IVW A; 1X75 C; 3L2W A; 5KYY B; 3SHW A; 1WHJ A; 2K3B A; 1UE9 A; 3CCL Q; 1AZE A; 2RM4 A; 3O8V A; 2CYZ B; 1N8R R; 1AWW A; 2DK3 A; 4ZTF A; 2GF7 A; 2ZPH B; 3CC2 A; 4LUE A; 2DXT A; 4M77 B; 3G4S A; 2RB6 A; 2JM9 A; 2WSF E; 3HKS A; 1QKX A; 1UJY A; 1VQ4 Q; 3NTI A; 1RI9 A; 1UGQ B; 4HA8 A; 2J05 A; 5CKD A; 2VAS A; 1VQM Q; 2FRW A; 2A0F B; 2P4T A; 1E6H A; 2EYY A; 3L2Z A; 5GAN 6; 1GFD A; 5J39 A; 5D6X A; 3OBW A; 2XDB A; 1YI2 Q; 2HL5 C; 3U23 A; 2QQA A; 3I5S A; 2GQV A; 2F5T X; 4A4G A; 1M4Z A; 2B8A A; 4FT2 A; 5GMK e; 5FU7 C; 2RI2 A; 8AT1 B; 5FRM A; 4IUT A; 5KCO A; 3HRU A; 2BZX A; 2WSC E; 1D1B A; 2GGR A; 3ULR B; 1VQ4 T; 1N9S A; 1WQW A; 2OI3 A; 3VS5 A; 2RD1 A; 2EJF A; 1M90 R; 2OTL Q; 4LDV A; 2CP0 A; 2L3Q A; 1VQO Q; 1IHV A; 3JCM V; 1W70 A; 2D8J A; 1VQN Q; 4KH0 B; 2DFU A; 4RG2 A; 2KI7 A; 1ZLM A; 3QSU A; 5CAI A; 4OMN A; 6AT1 B; 1WJQ A; 4OMP A; 4BB7 A; 1JB0 E; 1K76 A; 3TEE A; 5CKH A; 4A4H A; 3G6E A; 5LL6 S; 2DEQ A; 3VYH B; 1JJ2 A; 2FB7 A; 2E6Z A; 1VQ6 A; 1M27 C; 2EGC A; 3NGP A; 1HYO A; 1QQJ A; 4ANJ A; 2X4J A; 2J6O A; 2CT3 A; 4X1V A; 4M7A C; 3LGL A; 4LDU A; 4IUR A; 3RNJ A; 5GAN j; 3E19 A; 1WXU A; 2CP6 A; 1M1F A; 5GJV B; 3OYD A; 2HBW A; 2LQ8 A; 3VKI A; 2A36 A; 4RKU E; 4DEX A; 5KYW B; 4L6V 5; 4E7I A; 1VQN T; 4LN2 A; 2HDA A; 2JN0 A; 2LC4 A; 4M7A F; 2PU9 B; 2COZ A; 3DLL A; 2PTK A; 2K3X A; 4PJN A; 4LDX A; 2CP2 A; 3SDZ A; 2K2V A; 2E5K A; 5GAN f; 3A8M B; 2VB6 A; 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