The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
90
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structure length |
90
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Chain Sequence |
TVEFYQRLSTETLFFIFYYLEGTKAQYLAAKALKKQSWRFHTKYMMWFQRHEEPKTITDEFEQGTYIYFDYEKWGQRKKEGFTFEYRYLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Gene regulation
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| molecule keywords |
CCR4-NOT TRANSCRIPTION COMPLEX SUBUNIT 3
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| publication title |
Structure and Assembly of the not Module of the Human Ccr4-not Complex
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
17
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| structure length |
90
|
| sequence length |
90
|
| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-08-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4C0F A; 5FU6 B; 4C0D B; 5FU6 C; 4BY6 B; 5FU7 B; 4C0D C; 4BY6 C; 4C0G A; 5FU7 C; #chains in the Genus database with same CATH topology 2HDA A; 4CRI A; 4Z02 A; 2FL7 A; 1S1N A; 4AFQ C; 2BE9 B; 2QI2 A; 3M0S A; 1C6V X; 1WHM A; 3M4Y A; 1JO8 A; 2FRW A; 3L2Q A; 2DIG A; 4BDY A; 1OPK A; 3EFO A; 4DEX A; 1PM3 A; 2RJE A; 3M9Q A; 3FJ5 A; 4EIK A; 1Z9Q A; 1D0Y A; 4WTO B; 3T9N A; 2DAQ A; 1PD0 A; 2HL3 A; 2MAM A; 3UT1 A; 3CPW P; 3MP1 A; 2EYW A; 1OZ3 A; 2DL7 A; 3L1A A; 2J6K A; 2DEQ A; 1VQ4 A; 5KH6 A; 2LX9 A; 2EFI A; 2K5F A; 2GFU A; 3VUB A; 4RG2 A; 1PSF A; 4BE0 A; 2CUD A; 2PZ1 A; 5FU7 B; 1RAB B; 1M1G A; 4M7A D; 4IKF A; 2V8K A; 2DZ9 A; 1Q82 U; 1D0Z A; 2LCC A; 4IUR A; 1YWP A; 5FRO A; 3QG1 A; 2Y4Y A; 4N4I A; 1QWE A; 2DMO A; 3QZ5 B; 5GMK e; 1VQL Q; 1WZO A; 5A0D A; 2L5Q A; 5CKE A; 2OTL A; 1X2K A; 4PL6 A; 1G3T A; 3UF4 A; 4BY6 B; 5DLO A; 2FHD A; 4QQG A; 1QCN A; 3DLM A; 2VUB A; 3OYM A; 2R57 A; 3E9F A; 1WQW A; 1FMK A; 2LT4 A; 1GCQ A; 2COW A; 5LJ5 j; 3BDL A; 3MKD A; 2K3X A; 4RTT A; 2RF0 A; 1JB0 E; 3PIP A; 1V1C A; 3G6E Q; 4C92 G; 4IUV A; 2E41 A; 2LNH B; 2KAF A; 3UWN A; 1K76 A; 1LJO A; 3PMT A; 4GY5 A; 4J9F A; 3KBG A; 3RKX A; 4M78 G; 1H3H A; 5J3B A; 1EX4 A; 3C4S A; 3SD4 A; 1VQL T; 2HKN A; 1TS9 A; 4FYY B; 1K9M U; 4PJJ A; 3RMS A; 1VQK T; 2XHC A; 3CMA T; 4M77 E; 4B6M A; 2HQH A; 1BI0 A; 1G2B A; 5KE3 A; 1N8R R; 4A4H A; 3UA7 A; 3PVQ A; 2JW4 A; 3NFC A; 3MEW A; 1Y96 B; 4PNO A; 3G6E T; 2J6F A; 3CCQ T; 6AT1 B; 1WPY A; 3EG0 A; 2LJ3 A; 2XU8 A; 2O88 A; 4E7Z A; 4BE2 A; 2KRN A; 2CP2 A; 1B7T A; 3V7S A; 2CT4 A; 2RH2 A; 4LD6 A; 3OYK A; 2EW3 A; 1YJ9 Q; 5I11 A; 2OX7 A; 2K3Y A; 1TUC A; 3OW2 A; 1GFC A; 4LDV A; 3G71 Q; 4M7D F; 2FRY A; 2KBT A; 5GMK j; 5LJ3 g; 3CC4 Q; 3M0R A; 2RQU A; 2GF7 A; 2EQJ A; 3LYI A; 1OU9 A; 2ZGW A; 1UHF A; 1ZA2 B; 5CQX A; 3OYI A; 3C95 A; 2FZC B; 4MDX A; 4E7H A; 2CZ6 B; 1M27 C; 1Z9Z A; 4C8Q E; 1UGV A; 1WHG A; 3NMZ C; 5GAN g; 3JCM b; 2JTF A; 3UDC A; 4EMH A; 5L8R E; 5A2Q E; 1XNI A; 2YUQ A; 1YJ9 T; 1UE9 A; 4C0D C; 1BI2 A; 3S3M A; 2XDB A; 3JCM J; 3CC4 A; 2JS0 A; 2H3E B; 3G71 T; 5CVI A; 4JRI A; 2D9T A; 1K8A U; 3A1P A; 3QYG B; 3CC4 T; 2D8J A; 3H8Z A; 2A37 A; 3V8J A; 2K3B A; 3CCL A; 4HVW A; 1N9R A; 2IG0 A; 2JJ9 A; 3JV3 A; 4LD9 K; 2W0Z A; 1MMN A; 5CO7 A; 2KRM A; 3QHS A; 3RKW A; 4X9C A; 4JZ4 A; 1Q7Y R; 2BZY A; 3OYF A; 3H0I A; 4M77 D; 4J9B A; 1I4K 1; 3TQ7 P; 5KYW B; 5DM7 R; 2DO3 A; 3IQL A; 4JLG A; 3RDV A; 2X9H A; 5GAO m; 2DJQ A; 3CCS Q; 4IIO A; 2JXB A; 3QWY A; 2I0N A; 4M7A G; 2CT3 A; 1EZZ B; 1Y96 A; 4F7U G; 4MML A; 5D7U A; 5HK3 A; 3NHN A; 1RUW A; 2VVK A; 2LCL A; 3H6Z A; 4PJL A; 1GCQ C; 3CBM A; 3LGL A; 2X35 A; 5CKH A; 2J6O A; 1EIF A; 1W70 A; 3M56 A; 1VQM Q; 4FT2 A; 4C5H A; 3VYH B; 4A4F A; 1MNE A; 1I8F A; 2ESW A; 3G4S A; 1KD1 R; 3HPW A; 1CSK A; 2AK5 A; 2BIV A; 3HRS A; 4O5V A; 3RKY A; 3V7C A; 4M7D A; 2FZK B; 4L6V 5; 1HJD A; 3CCS A; 3CCS T; 5HY6 A; 1H8K A; 1W4S A; 2PUK B; 1SRM A; 1NEG A; 3CCJ T; 2E3H A; 4AFS C; 4C92 B; 3H41 A; 4OB2 B; 1RL2 A; 1UHC A; 4QQ6 A; 4E7S A; 4C8Q D; 1Q7Y U; 1R77 A; 1VQM A; 3PT9 A; 3L2U A; 2QTV A; 1N9S A; 4ZGJ B; 3QWX X; 4M78 B; 5LJ5 d; 1KIK A; 4M78 F; 5LJ5 f; 3GNG A; 3PMI A; 1K9A A; 4E7L A; 2DET A; 2DTO A; 3GBQ A; 1YJW Q; 2LP5 A; 3G7Z A; 4RMO A; 2RHX A; 2X3X D; 3CCV Q; 2Y90 A; 5FU7 C; 5CR2 A; 1AWW A; 2HMA A; 3ZL7 C; 1AZE A; 3MHX A; 2L8D A; 2DRK A; 2RI5 A; 4C92 E; 1U3O A; 2ZZD A; 2LZ6 B; 3SHW A; 9ATC B; 1M1K R; 1B34 B; 2G6F X; 2QYZ A; 3FDR A; 5GAO q; 4JS5 A; 1JBM A; 4JJD A; 1B07 A; 1MHN A; 1V29 B; 4KH1 B; 4HCK A; 3KXT A; 2RJF A; 3HSB A; 2RQW A; 3SEM A; 3EFS A; 4FIB A; 1YJW A; 4FW2 A; 1YI2 Q; 4LDU A; 2DBM A; 2VC8 A; 3CCV A; 2CP5 A; 4C0Z A; 2LJ0 A; 4BY6 C; 3CCE A; 3CC2 Q; 2OJ2 A; 4OML A; 1M30 A; 3I56 Q; 4EMK B; 1KC8 U; 1UGQ B; 2WSC E; 5L23 A; 4M4Z A; 4JRQ A; 3PE0 A; 1NPP A; 4Y28 E; 3SWN B; 4XTX A; 1AWJ A; 1MMG A; 2QG9 B; 3HRU A; 1U1T A; 4KUL A; 5KYU B; 4QVD A; 1C1A A; 1M90 C; 3NTI A; 2HKQ B; 1R0B G; 2E3I A; 3M0P A; 2DPP B; 3S3N A; 2EJ9 A; 2XIC A; 1YI2 A; 1VQ6 Q; 1M3C A; 4P5N A; 1TG0 A; 2QGF B; 2EQI A; 1W1F A; 4J7I A; 4C92 A; 1YI2 T; 3JB9 J; 3OB9 A; 4XU0 A; 1LPL A; 5GMK l; 3CC2 T; 2ZPB B; 1OOT A; 3MP8 A; 4QVZ A; 1RAI B; 2D6F A; 3I56 T; 1M1K U; 3HFO A; 5HCK A; 4M78 A; 4KUI A; 1VQO Q; 2E65 A; 1SHF A; 1T0J A; 2HD0 A; 3QZ9 B; 4ELY C; 3PTA A; 3GNF B; 2ZCF B; 4Z8A A; 2PUO B; 1VQ9 Q; 1YIJ Q; 5CKD A; 3CPF A; 1YCS B; 5KYX B; 2EKO A; 3URG A; 3FB9 A; 1VQ6 A; 4LXC A; 4M77 G; 3OW2 P; 1FMW A; 4NS5 A; 2CYZ B; 1BB9 A; 4X1V A; 5GAM e; 4ZGE B; 4JJB A; 1VQ6 T; 3CCM A; 2FPD A; 4M7A B; 1NLO C; 1G5V A; 2B8A A; 2CZ7 B; 1WJQ A; 4M7A F; 2CH4 W; 4ZTF A; 4M7D C; 3HHT B; 1B34 A; 4BI8 B; 4F7U F; 4JLI A; 4XTU A; 3LW5 E; 3RUX A; 3JCM g; 5LJ3 h; 4PJO D; 4AMC A; 2RHY A; 3MO8 A; 3JB9 D; 1QW1 A; 2DLP A; 1YFN A; 2BUD A; 2V8J A; 2A08 A; 1VQO T; 3M0T A; 1YIJ A; 3LX7 A; 4VUB A; 4DEY A; 4A4E A; 1UFF A; 1VQ9 T; 1XOV A; 1ZSZ B; 5IN1 A; 8ATC B; 2HSE B; 5GAN h; 1MMA A; 2EJG A; 1WGS A; 3VKI A; 1EFN A; 2XDP A; 1I07 A; 5A0L A; 2DER A; 2J06 A; 2L0A A; 2SRC A; 3MET A; 2ABL A; 1I81 A; 1SEM A; 2P84 A; 2CDT A; 3ZEH A; 1YJN Q; 3LWH A; 3OYJ A; 4C8Q G; 4ELZ C; 2DXU A; 2V1R A; 3HRT A; 1NE8 A; 1C0M A; 1CKB A; 5FW9 A; 4PK4 A; 5I2M A; 1I0C A; 1VQN Q; 2KXC A; 4J83 A; 4OP0 A; 2BZX A; 1KK7 A; 3VS7 A; 4HCC A; 2CP6 A; 5KYY B; 4TVR A; 1K1Z A; 5I2S A; 2EJF A; 3M57 A; 3QKJ A; 3VV0 A; 3ZBD A; 2V1Q A; 5AYF A; 3CCU Q; 2X4X A; 1YCY A; 2E70 A; 1NM7 A; 2JTE A; 2DRM A; 2C06 A; 3KFV A; 1YJN A; 4FSX A; 4XK8 E; 3L42 A; 1X27 A; 1OX9 A; 2LQK A; 5KYX A; 1YHQ A; 1YJN T; 5GAM j; 1BK2 A; 3PGG A; 1G3W A; 2MMP A; 1VQN A; 2RHZ A; 3SB2 A; 3P8D A; 5GAO p; 4BAC A; 5KCH A; 4EDU A; 3RER A; 1VQN T; 3MJX A; 3FEO A; 2FPE A; 2KQW A; 3N5B B; 3VS3 A; 5D6X A; 4M7A A; 3EFR A; 2LVM A; 2RQT A; 4F7U A; 3LGF A; 3H0H A; 4A53 A; 3QDR B; 1M2V B; 1I5L A; 2CZ1 B; 1ARK A; 1W6X A; 3C12 A; 4OMN A; 3CCU A; 3G1J A; 2O4X B; 2VAS A; 1Q82 C; 4C92 C; 4OVA A; 3M0U A; 4E47 A; 3VYG A; 2XK0 A; 3VS6 A; 2YUO A; 2ED0 A; 3OYY A; 4DOV A; 4CC7 A; 1BYM A; 2QAZ A; 1VOM A; 4JUV A; 4DOW A; 4F16 A; 2OTL Q; 4D6W A; 4M78 C; 1VQ4 T; 2ECZ A; 2YUP A; 2EVR A; 4XAX B; 5ECA A; 1X6G A; 2JM9 A; 3FIF A; 3HKS A; 1G8X A; 1UDL A; 1BKB A; 2DK3 A; 2OI3 A; 1ABO A; 2FYK A; 1Q86 R; 3O5Z A; 1T3S A; 1I1J A; 4QVC A; 4RUG A; 1M3A A; 4HKE A; 2ROL A; 1VQ8 A; 2E1H A; 2KK4 A; 4AG2 C; 4DA4 A; 3OBY A; 4KGZ B; 2F2W A; 5FWC A; 1BBZ A; 2NLU A; 2PQW A; 4XTW A; 1JRI A; 1M9S A; 2HBW A; 5IHK A; 3ULR B; 3OY9 A; 3CXC A; 2DX1 A; 3J80 E; 5KYY A; 3BY7 A; 1JQQ A; 4M77 B; 3HP9 A; 1M4Z A; 4M77 F; 2OTL T; 1O9S A; 3PIO A; 2QDL A; 4MZT A; 2QQ9 A; 2XDD A; 1K9M C; 4QW2 A; 1IGU A; 2QDY B; 3O8V A; 4LN2 A; 5LL6 S; 1AD5 A; 4KUD K; 3ER0 A; 2CP7 A; 4EMK C; 2LCS A; 4PJO G; 3JB9 G; 3RIR A; 2K5I A; 4QKU A; 2F69 A; 4LDY A; 1UEB A; 3WVD B; 1Y07 A; 4HXJ A; 4X9D A; 1GCP A; 4MMK A; 5FWB A; 1O75 A; 2D8H A; 2QQS A; 5IAY A; 1NYG A; 3PFS A; 1Q86 U; 1GBQ A; 2EPD A; 1PRL C; 2O4X A; 3JCM c; 3DB3 A; 2AKK A; 1NEB A; 1KQS A; 1N6A A; 3MP6 A; 2QA4 Q; 2KEA A; 3F70 A; 3VRY A; 2ZPF B; 1QVP A; 5I21 A; 2R58 A; 5CCA A; 3VS5 A; 1ZUY A; 1RAA B; 4C8Q B; 2JOY A; 2HEQ A; 4C8Q F; 1WNL A; 4II1 A; 2VWF A; 3TSZ A; 1RLP C; 2M1H A; 2JTM A; 2F2X A; 1WXU A; 2I2L A; 1D3B B; 2DVE A; 2VXF A; 3JCM V; 2M0Y A; 1GFD A; 4KGX B; 1WIE A; 1MV0 B; 2NYS A; 4JJN K; 2COZ A; 1TXQ A; 2GTO A; 2LMJ A; 2RK2 A; 1PSE A; 1X2Q A; 2QA4 A; 4M7A C; 3QSU A; 3QO3 A; 2C0O A; 4N4G A; 4RTV A; 1OQK A; 4QQD A; 1X6B A; 2QA4 T; 1K8A C; 4QT7 A; 3CCL Q; 2FEI A; 3FRN A; 4M77 A; 5GAO n; 5IXF A; 3JCM h; 4NL2 A; 3WVE B; 1JJ2 A; 1WQ7 A; 1E6G A; 3M0Q A; 3RNJ A; 1W2B A; 4Y91 A; 2EQK A; 3AT1 B; 2DEU A; 2KI7 A; 1BCM A; 1QQJ A; 1N8R U; 2D0Q B; 4OMM A; 4LDW A; 2KVQ G; 4CC2 A; 5GAM d; 5M9O A; 3OMC A; 5GAM f; 2M9U A; 3OS5 A; 2EYX A; 3OSV A; 4F17 A; 2XG8 D; 1IHW A; 2EAY A; 3GF5 A; 1KQS S; 3MCA B; 3M53 A; 4PFP A; 3C94 A; 4M75 B; 3PVL A; 3CCL T; 3G4S Q; 2A36 A; 1Y7X A; 2K5L A; 2VGM A; 2DTH A; 1G3Y A; 3QDF A; 2K7A A; 2XID A; 2CSQ A; 1AT1 B; 2O2O A; 3OW2 S; 1GXI E; 4F14 A; 1AEY A; 1U5S A; 4C8Q A; 1OU8 A; 1UGR B; 2L3S A; 1VQ7 A; 3EG1 A; 4XU2 A; 3X26 B; 4HT8 A; 2DBK A; 1D3B A; 4HVU A; 5DY9 A; 3VS2 A; 2K9G A; 2CH4 A; 5GAN 4; 2MK5 A; 4R0K A; 1Q7Y C; 2GCX A; 4C5G A; 3E1S A; 1JJ2 S; 4M75 E; 3G4S T; 2E4H A; 1QMC A; 1WA7 A; 3I55 Q; 4ATO A; 4PKC C; 2Z0W A; 4J9G A; 1VQ5 Q; 2HSP A; 2IPO B; 2NUP B; 3NPF A; 5LJ5 g; 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1XTD A; 1M1K C; 3EAE A; 1XQH A; 2YHT A; 4M75 D; 1VYU A; 3LH0 A; 2PVD B; 4UC4 A; 2LQN A; 2OTJ A; 1MV3 A; 3JCM W; 1ZHI A; 3QII A; 4HVV A; 1IXD A; 2LC4 A; 1VQP A; 5DLQ E; 4IUQ A; 5GAN 5; 3CD6 A; 1RAC B; 2ZAE A; 3CCM Q; 2EGC A; 2CRE A; 3A8M B; 1VQP T; 3M54 A; 3OQ5 A; 1KQS P; 3HTR A; 1H3Z A; 2DIQ A; 2FPF A; 3A8G B; 1VYV A; 3OSS C; 2K79 A; 2DYI A; 1TWB A; 2C0I A; 4DBH A; 1M8M A; 4RG8 A; 1NBE B; 2RI2 A; 3EG9 B; 4HA8 A; 2E6Z A; 1NZ9 A; 2DJZ A; 2JUF A; 2RA2 A; 3OYG A; 1Y57 A; 4C8Q C; 4RTZ A; 2KNB B; 1G83 A; 3Q1J A; 1S72 Q; 5GAN 8; 4N4H A; 3M58 A; 3M59 A; 2OAU A; 2JS2 A; 4J9I A; 3EGX B; 1E7O A; 2GNC A; 5LJ3 e; 1Q81 U; 3CCM T; 1IZ6 A; 1KG1 A; 1MND A; 3OYE A; 1BI3 A; 1QCF A; 4V2S A; 2M16 A; 3OYN A; 1JJ2 P; 4MZP A; 2NWM A; 1J3T A; 2JT4 A; 2QAS A; 1W2B P; 1AWO A; 4Y92 A; 5GAN e; 1QKX A; 1H92 A; 2DL8 A; 2RD1 A; 1YIJ T; 1S72 A; 3EFO B; 4EMK A; 2L3Q A; 3EGD B; 2D0N A; 2E10 A; 5GAN 7; 2K2V A; 1AZG B; 3SWN A; 1WJS A; 1GRI A; 4RTX A; 5KYU A; 3HL8 A; 1ABQ A; 5GJW B; 3OMG A; 1UG1 A; 2DZC A; 1PKS A; 4ME7 A; 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