The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
GSTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGACHGQTGMFPRNYVTPVNR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
GROWTH FACTOR RECEPTOR-BOUND PROTEIN 2
|
| publication title |
Solution Structure of the C-Terminal SH3 Domain of Grb2 Complexed with a Ligand Peptide: A Ligand Exchange Model of the SH3 Domain
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
6
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-01-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4JJD A; 3ULR B; 2HCK A; 1SSH A; 3REA B; 2BZY A; 1PWT A; 1H92 A; 3PVQ A; 2DE0 X; 2JT4 A; 2BTT A; 4AG1 C; 1M3C A; 2YUO A; 1JU5 C; 4HXJ A; 4OMO A; 1U3O A; 1TG0 A; 3EG3 A; 5ECA A; 4X1V A; 1NEB A; 4F17 A; 4RTV A; 1GCQ C; 2PZ1 A; 1HD3 A; 1U06 A; 1QKX A; 2EVR A; 2LJ1 A; 3EHQ A; 1WX6 A; 2L3Q A; 1HJD A; 1UE9 A; 2B86 A; 2BZ8 A; 2AKK A; 2EGA A; 1CKB A; 3VS7 A; 1GCP A; 4RTZ A; 4AG2 C; 1AOJ A; 1ARK A; 3TSZ A; 1EFN A; 1OPL A; 1QLY A; 2V1R A; 1HSQ A; 1Y0M A; 1N5Z A; 2CRE A; 4HVW A; 2L3P A; 2DRK A; 3M0R A; 3REB B; 2DYB A; 4FSS A; 1ZX6 A; 1S1N A; 2O9S A; 5IH2 A; 1GCQ A; 4CC2 A; 1RLQ C; 2RQR A; 2DMO A; 4HVU A; 2KNB B; 2DF6 A; 4RTU A; 1QCF A; 4JJC A; 4AFS C; 1YCS B; 1X6G A; 2EYX A; 2O31 A; 2F2X A; 1VYT A; 2K9G A; 4ORZ A; 1OPK A; 2DL7 A; 5I22 A; 2EYY A; 2KT8 A; 2CUB A; 2YUQ A; 2VVK A; 4Z89 A; 4J9B A; 1KSW A; 2AK5 A; 3RNJ A; 1AWX A; 1AVZ C; 4JJB A; 1J3T A; 2CDT A; 2O88 A; 2AZS A; 4HCK A; 3QWX X; 1YWP A; 1SPK A; 3VS4 A; 1T0J A; 2DA9 A; 2JW4 A; 4J9F A; 1NLP C; 3VS6 A; 2LQW A; 3A98 A; 3I5R A; 2OAW A; 2FPF A; 4J9G A; 1YWO A; 2BZX A; 1ZUK A; 2CH4 W; 3M0P A; 1KJW A; 2KXD A; 4E6R A; 2K6D A; 2FRY A; 1T0H A; 1W6X A; 2RNA A; 2ED1 A; 1B07 A; 1Z9Z A; 2RN8 A; 4Z88 A; 5HCK A; 1JO8 A; 1Y57 A; 1M27 C; 3C0C A; 2J06 A; 1ZSG A; 2FRW A; 3H0H A; 1WLP B; 2DNU A; 4LNP A; 1LCK A; 3H0I A; 2J6K A; 4RTW A; 1T3S A; 1RLP C; 1VYU A; 1K9A A; 2CH4 A; 2FG0 A; 2GTO A; 4CC4 B; 5FWC A; 3VS3 A; 4KRT A; 1I0C A; 2C0O A; 1SHF A; 3UA6 A; 2DL4 A; 1RI9 A; 2JXB A; 1GFC A; 1PKS A; 1GBQ A; 3JV3 A; 1GFD A; 2LQN A; 2ROT A; 1GL5 A; 2CSI A; 2GBQ A; 2YUP A; 1X69 A; 4J9C A; 5IHN A; 2J05 A; 2E5K A; 2LNH B; 2NWM A; 3I9Q A; 2JMA A; 1M30 A; 2A28 A; 3LH5 A; 1I07 A; 2K7A A; 2OI3 A; 1X2Q A; 2D8J A; 4LUD A; 1BB9 A; 1IO6 A; 3TSW A; 2RPN A; 2JMC A; 2L0A A; 3PE0 A; 5FW9 A; 1UFF A; 4R0K A; 3UAT A; 1WI7 A; 2VKN A; 1UTI A; 2ED0 A; 2FPE A; 1UHC A; 2M0Y A; 2FPD A; 2DBM A; 2YSQ A; 2AKL A; 1M3B A; 2RF0 A; 1AWW A; 2EYZ A; 4DEX A; 3FJ5 A; 1TUC A; 1VYV A; 4ZNX A; 4OMQ A; 1UJ0 A; 2J7I A; 1X43 A; 3SEM A; 3THK A; 4CC3 A; 1E6G A; 1K76 A; 2FO0 A; 3VS5 A; 1WIE A; 2DRM A; 2RQU A; 4WCI A; 1VA7 A; 1CSK A; 2DJQ A; 2AZV A; 2HEQ A; 4F14 A; 4F16 A; 3VS1 A; 4AFZ C; 2KRS A; 1YN8 A; 2LJ0 A; 3EGU A; 2EQI A; 4JZ3 A; 2G6F X; 3NMZ C; 1NM7 A; 2DL5 A; 3I35 A; 2YT6 A; 3KFV A; 4RTX A; 1SRL A; 5GJV B; 1UHF A; 2K79 A; 5IXB A; 5L23 A; 2F2V A; 2J6F A; 2KYB A; 4RTT A; 1AD5 A; 1UG1 A; 3H0F A; 4J9E A; 4D8K A; 1M3A A; 4RUG A; 1E6H A; 2ECZ A; 2DLP A; 1UGV A; 4HVV A; 2CT4 A; 1CKA A; 5GJW B; 3TVT A; 1H8K A; 1UUE A; 3GBQ A; 3EG0 A; 2OJ2 A; 1PNJ A; 4Y92 A; 2YDL A; 2MCN A; 2VWF A; 2KR3 A; 1QKW A; 3NPF A; 5EC7 A; 1YNZ A; 2A08 A; 1H3H A; 2LJ3 A; 1BU1 A; 1ABO A; 4QT7 A; 1SHG A; 1AZG B; 1E7O A; 2O2O A; 2EPD A; 2J6O A; 2F2W A; 5IXF A; 2C0T A; 2FEI A; 3NGP A; 2KXC A; 2KRM A; 1G2B A; 2LX7 A; 1ZLM A; 2GQI A; 4JZ4 A; 2KRO A; 2D1X A; 1UDL A; 1NLO C; 1ZUY A; 2MOX A; 1GBR A; 1X2K A; 2EW3 A; 2HBW A; 4AFU C; 2EBP A; 2PTK A; 1WFW A; 2NUZ A; 1NYF A; 1ZBJ A; 2P4R A; 3VRY A; 2CUD A; 5IHI A; 2EKH A; 3M0Q A; 2A36 A; 2KGT A; 2EYW A; 1QWE A; 1PRM C; 2LMJ A; 1B3Q A; 2H8H A; 3O5Z A; 2ABL A; 1SRM A; 3NHN A; 2LZ6 B; 3EG2 A; 4LN2 A; 2GNC A; 1PRL C; 2DBK A; 2KBT A; 3U23 A; 4J9D A; 2HSP A; 4LE9 A; 3UF4 A; 1OV3 A; 5IHK A; 2L3S A; 1JQQ A; 1T3L A; 2EGC A; 2JTE A; 1WXU A; 3R6N A; 1JXM A; 1JEG A; 1U5S A; 2ROL A; 2IIM A; 4J9H A; 1FYN A; 1NYG A; 2M51 A; 1MV0 B; 2ESW A; 5FWB A; 1MUZ A; 2ENM A; 4K11 A; 3UA7 A; 2A37 A; 1WXT A; 2C0I A; 2GTJ A; 3M0T A; 1A0N B; 3PVL A; 1UEC A; 2RQT A; 4AFQ C; 2W0Z A; 2CSQ A; 3ZL7 C; 1KIK A; 1PKT A; 2V1Q A; 5I11 A; 4Z8A A; 1AEY A; 1FMK A; 1OOT A; 1AZE A; 3M0U A; 1NG2 A; 2PNI A; 1YP5 A; 2W10 A; 4OMM A; 1WDX A; 1G83 A; 1QWF A; 4RTY A; 4A63 B; 2D0N A; 2SEM A; 3VS0 A; 1ABQ A; 1K0S A; 2RQV A; 2KRN A; 1MV3 A; 2CT3 A; 4IIM A; 2D8H A; 4OMN A; 2DX1 A; 2L2P A; 2MIO A; 4OML A; 1NEG A; 2HDA A; 4J9I A; 2X3W D; 1W70 A; 3QWY A; 1I1J A; 1V1C A; 1K4U S; 2QDL A; 2LCS A; 2I0N A; 2DIL A; 2JS2 A; 1K1Z A; 3IQL A; 2LP5 A; 2EGE A; 1AWO A; 2K2M A; 1XOV A; 1X6B A; 2DL3 A; 2O9V A; 4GBQ A; 3VRZ A; 1GRI A; 2K3B A; 1ZUU A; 3SHW A; 1X27 A; 2XMF A; 1JXO A; 2DM1 A; 3RBB B; 2SRC A; 2KT1 A; 1BK2 A; 1UJY A; 2JM9 A; 1WXB A; 2DL8 A; 4DEY A; 2DVJ A; 4D8D A; 3M0S A; 1Z9Q A; 1K0X A; 4M4Z A; 4EIK A; 1TUD A; 2GGR A; 2JM8 A; 2RQW A; 1AWJ A; 2KEA A; 1WYX A; 2RMO A; 2JS0 A; 3EG1 A; 3CQT A; 1W1F A; 1BBZ A; 1M8M A; 2KYM A; 2X3X D; 1KFZ A; 4LUE A; 1OEB A; 1PHT A; 2YUN A; 4JPB W; 1RUW A; 2KE9 A; 4GLM A; 3VS2 A; 4OMP A; 3I5S A; 4IIO A; 3EHR A; 4CC7 A; 4ESR A; 1WA7 A; 1SEM A; 3H41 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1M2V A; 2OAU A; 1W2B S; 1SSH A; 1H92 A; 4FL6 A; 5LJ5 e; 2BTT A; 5FU6 C; 1TG0 A; 4E47 A; 3EG3 A; 1N8R C; 2CZ7 B; 1WNL A; 4F17 A; 4IUT A; 1QVG S; 2V8K A; 1GCQ C; 1HD3 A; 1KD1 R; 2EVR A; 2LJ1 A; 5CVI A; 3RKY A; 2DEQ A; 1M2O A; 2WAC A; 3QYH B; 3GPL A; 2NUP B; 3BY7 A; 4RTZ A; 2RHX A; 3TSZ A; 1OPL A; 1I81 A; 1Y0M A; 3F70 A; 2DRK A; 5DY9 A; 4JRQ A; 2HL5 C; 2O9S A; 3QZ5 B; 4IUU A; 1YJW T; 1M2V B; 2EJG A; 3DLL A; 1EX4 A; 3LH0 A; 4HCB A; 1NJI U; 4E7L A; 3M57 A; 3X24 B; 1DJ7 B; 2CUB A; 1VQ7 T; 1PD0 A; 2YUQ A; 2FL7 A; 1G3S A; 2DET A; 3OYK A; 3GF5 A; 1M9S A; 1G3T A; 4HCK A; 4IKF A; 1QW1 A; 5I2M A; 5C6S A; 1S72 T; 3NTI A; 1SPK A; 3VS4 A; 2YHT A; 3VS6 A; 3OYE A; 4Y28 E; 2LQW A; 3A98 A; 3I5R A; 2OAW A; 2QYZ A; 1IB8 A; 3BE3 A; 1RI0 A; 2DD5 A; 3UDC A; 4E6R A; 3JB9 D; 3I55 A; 2FRY A; 2QG9 B; 1W6X A; 2HSE B; 2F69 A; 3FJP A; 2G3R A; 3JB9 J; 3PMI A; 1I5O B; 1Y57 A; 5M9O A; 1WLP B; 1OZ3 A; 4J6X A; 1LCK A; 1T3S A; 1MGQ A; 4PJJ A; 4OP0 A; 4JLG A; 2FG0 A; 1PCX A; 1SHF A; 2VYT A; 4MDW A; 1WHJ A; 4AT1 B; 4C0D B; 1HXD A; 1QVP A; 1D09 B; 2A7Y A; 1IZ6 A; 2YUP A; 3CD6 A; 2QI2 A; 5IHN A; 3EAE A; 4CI0 C; 2COY A; 4FCY A; 2NWM A; 3VKI A; 2JMA A; 4F04 B; 1K73 U; 2XK0 A; 1B7T A; 2A28 A; 3M58 A; 1I07 A; 1ZQ1 A; 3C95 A; 2K7A A; 3M55 A; 1X2Q A; 4N4I A; 4ANJ A; 1YFN A; 2P0P A; 2RM4 A; 2MF2 A; 4C0Z A; 4R0K A; 1WI7 A; 4M7D E; 1VIF A; 2M0O A; 9ATC B; 3PNW C; 3CME Q; 1VQM A; 2RF0 A; 3V8L A; 4KUL A; 3JB9 G; 4KGX B; 3QO3 A; 1RAA B; 1KD1 C; 4BDZ A; 4OMQ A; 1D0Z A; 1D0Y A; 1H64 1; 1N9R A; 3OW2 A; 1MHN A; 2QEX Q; 1I4K 1; 2VXF A; 2LCL A; 3P8D A; 1CSK A; 4M75 D; 2DJQ A; 4M77 A; 2YRC A; 2MK5 A; 1VQ6 Q; 3A5Z B; 5D6X A; 4AFZ C; 2KRS A; 1YI2 T; 2D9T A; 2LJ0 A; 3OBY A; 2EQI A; 4OMF B; 3NMZ C; 4D6W A; 2DL5 A; 2YT6 A; 3MEV A; 3KUF A; 4JRI A; 5J26 A; 4M78 C; 3CCR T; 1VQP T; 5L23 A; 4PFO A; 2F2V A; 5CKD A; 2KYB A; 3M54 A; 3JCM e; 3H0F A; 3KXT A; 2K3Y A; 3MJX A; 1Q7Y R; 1KHC A; 1D1C A; 3JCM b; 2ECZ A; 1VQK A; 3OMC A; 4PLI A; 3TVT A; 3CCE Q; 1Q82 U; 4PKC C; 5AYF A; 3OW2 P; 1U1S A; 4EMK A; 3EG0 A; 3MHX A; 3JB9 I; 1PNJ A; 3FEO A; 3J80 E; 1N8R U; 2KR3 A; 2H3E B; 1PSF A; 1IRX A; 5EC7 A; 2FZG B; 2RI2 A; 1IGQ A; 1YNZ A; 1BU1 A; 2ZAE A; 3OYH A; 1ZA2 B; 1WGS A; 2O2O A; 1IHW A; 3JB9 F; 2F2W A; 3URG A; 1G2B A; 2LX7 A; 1ZLM A; 1EIF A; 4JZ4 A; 3OYJ A; 2D1X A; 2QXF A; 1M1K U; 1UDL A; 4M75 G; 2CZ6 B; 2MOX A; 1ZBX A; 3CCR A; 2HBW A; 3C12 A; 1SF9 A; 2PTK A; 4EMK B; 3MKD A; 3CCM T; 1Q86 C; 5CR2 A; 1VQL T; 3LGL A; 5IHI A; 2EKH A; 2EYW A; 1M5Q 1; 1QWE A; 5GAO l; 1JJ2 A; 4M7A C; 5CQY A; 1B3Q A; 3O5Z A; 1SRM A; 2LZ6 B; 3EG2 A; 2EQJ A; 3MP1 A; 3G6E T; 1PRL C; 4TVR A; 3U23 A; 2A0F B; 3ME9 A; 4XTU A; 1OV3 A; 1JQQ A; 2EGC A; 2F5K A; 2JTE A; 3J81 E; 1YJN Q; 1NPP A; 2HAX A; 2RHU A; 1U5S A; 1TUG B; 3TCJ A; 1FYN A; 1NYG A; 4QQD A; 1VQ4 T; 1H3Z A; 4NL2 A; 2ESW A; 2LTO A; 4K11 A; 1BIA A; 2HMA A; 2PUK B; 2EAY A; 1JJ2 P; 3CCQ A; 1A0N B; 4FYW B; 4O6J A; 3PVL A; 1YIJ T; 4LDX A; 1WQ7 A; 4BE2 A; 1YCY A; 2V1Q A; 5I11 A; 4Z8A A; 1VQ5 Q; 2X4X A; 1BKB A; 1NG2 A; 4M75 F; 3M53 A; 4OMM A; 1QWF A; 4RTY A; 1WJR A; 2LCC A; 3CPW S; 4FU6 A; 2ZPE B; 1QP2 A; 3KBG A; 4X34 A; 4ZGJ B; 4IIM A; 4XTW A; 1N27 A; 2AHJ B; 2OTJ T; 5LJ5 f; 3DLM A; 4M75 B; 5CKH A; 2MIO A; 1XQH A; 3EFO A; 2CP2 A; 1VQ8 Q; 1NEG A; 1LOJ A; 1SSF A; 2BUD A; 4J9I A; 1VOM A; 2X3W D; 4MZM A; 3CMA A; 1V1C A; 2QDL A; 3CCS T; 2I0N A; 1K1Z A; 3Q1J A; 2LP5 A; 3WVE B; 4DQ2 A; 4R56 A; 1AWO A; 1VQO Q; 3OMG A; 2JTM A; 4GBQ A; 3VRZ A; 3CBP A; 1XJW B; 5GAO p; 4ELY C; 1RAE B; 2IVW A; 2AT1 B; 3CCL Q; 1UEB A; 2XMF A; 1KC8 R; 1KD1 U; 2CP7 A; 4KGZ B; 4DEY A; 1NJI C; 3CC2 Q; 2DVJ A; 4D8D A; 3EH2 A; 3M0S A; 3M56 A; 4M4Z A; 4EIK A; 1TUD A; 2GGR A; 2QEX A; 2KEA A; 3TRE A; 3EFO B; 2KYM A; 2IG0 A; 1PHT A; 3G7Z A; 4JPB W; 4QVC A; 2ZPG B; 1YIT A; 3I5S A; 4FIB A; 3GOX A; 3G4S T; 3HKS A; 3H41 A; 4JJD A; 4C0G A; 3OYF A; 3WXM B; 2HCK A; 3REA B; 2BZY A; 4MZT A; 2EIF A; 2ZPI B; 3FB9 A; 1C0M A; 3DKM A; 2JT4 A; 4L5G A; 4BI4 A; 1D1B A; 1M3C A; 2YUO A; 5GMK h; 4PJO C; 1JU5 C; 4HXJ A; 3OYC A; 5GAM d; 1U3O A; 2HQX A; 3G71 T; 3MEW A; 4E7S A; 5CKF A; 2PZ1 A; 1V76 A; 1U06 A; 1QKX A; 3DB4 A; 3EHQ A; 3HFN A; 2L3Q A; 1HJD A; 3FRN A; 5KE2 A; 2AKK A; 2CZ0 B; 2E12 A; 4DBF A; 3VS7 A; 4LXC A; 1K9M R; 2RI5 A; 2DXT A; 1AOJ A; 1HSQ A; 1N5Z A; 3OYB A; 2CRE A; 2LX9 A; 2QQS A; 4C92 C; 5GAM e; 4BAC A; 2DYB A; 1YJW Q; 4FSS A; 3GNF B; 1S1N A; 4KH1 B; 4CC2 A; 3I56 T; 2PVO B; 4Z02 A; 4A53 A; 2LDM A; 4HVU A; 4RTU A; 4AFS C; 1D0X A; 1K73 C; 2O31 A; 2K9G A; 1YJ9 Q; 1VQ7 Q; 5LJ3 d; 2Z0W A; 3OYI A; 2M1H A; 2EYY A; 2KT8 A; 3CCV T; 2X4Y A; 1IXD A; 4DBH A; 5GAN d; 2RH2 A; 4JJB A; 1OUL A; 4KH0 B; 2P0K A; 3HL8 A; 3G71 A; 4XTV A; 2CDT A; 2O88 A; 1S72 Q; 3EH1 A; 2HKN A; 4RG2 A; 3OYD A; 1YWP A; 2CS7 A; 2PQW A; 1NLP C; 2MWO A; 4J9G A; 4UC4 A; 3FDR A; 2CH4 W; 3M0P A; 4NOY A; 4C8Q C; 1N9S A; 1MMN A; 2L89 A; 5LJ3 e; 1ZHI A; 1FX7 A; 4ME7 A; 2K6D A; 2HNI A; 2RNA A; 5CKB A; 3JCM Q; 3A8L B; 3HTR A; 5GAN e; 2KSS A; 3BFM A; 4E7J A; 2EQM A; 1JO8 A; 3ASK A; 5HCK A; 1M27 C; 2FRW A; 1OU9 A; 5LJ5 g; 2DNU A; 3CC4 A; 3H0I A; 4RTW A; 4E2F B; 5HK0 A; 4A4F A; 1K9A A; 4CC4 B; 5FWC A; 2RHY A; 1I0C A; 1KC8 C; 4RCC A; 3JV3 A; 4FW1 A; 1GFD A; 3A8O B; 2ROT A; 2LT1 A; 2GBQ A; 2E6Z A; 2E4H A; 1X69 A; 5KE3 A; 2V26 A; 2E41 A; 2QA4 A; 2DK3 A; 4J9C A; 2LNH B; 3S3M A; 1JRI A; 4HCC A; 1Q82 C; 3CPF A; 1OQK A; 3OYL A; 4LUD A; 1BB9 A; 1IO6 A; 1UGR B; 2P4T A; 3CCU Q; 4JRP A; 1LJO A; 2JMC A; 2HD0 A; 3TEE A; 5CCA A; 4PJM A; 1BCM A; 2OTL Q; 1B34 A; 2Y4Y A; 3X20 B; 1Q7Y U; 2DBM A; 2E70 A; 2HKQ B; 1VQN Q; 2CYZ B; 3I55 T; 5GAN 7; 4BY6 C; 2RJF A; 3O8V A; 1TUC A; 5A0D A; 6AT1 B; 4ELZ C; 1YHQ T; 3CBM A; 1VQO A; 4CRI A; 1X43 A; 3THK A; 1C6V X; 1WQW A; 1M1K C; 3GP8 A; 2EQK A; 2DRM A; 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