The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
80
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structure length |
80
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Chain Sequence |
MGPLGSPEFAKYARALKDYNVSDTSLLPFKRNDIITITFKDQENKWFMGQLNGKEGSFPVDHVEILLSDVPPPQPVHPVA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
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| molecule keywords |
Class VII unconventional myosin
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| publication title |
The SH3 domain of a M7 interacts with its C-terminal proline-rich region.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Dictyostelium discoideum
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| total genus |
7
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| structure length |
80
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| sequence length |
80
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-08-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4JPB W; 1X2Q A; 1H3H A; 1G2B A; 1PNJ A; 1WXU A; 1A0N B; 1UHC A; 1ZUK A; 2JXB A; 1SHG A; 2OI3 A; 4D8K A; 4RTX A; 2OAW A; 3REA B; 4F17 A; 1RI9 A; 1JXM A; 1RUW A; 1X6G A; 4JZ4 A; 2FPF A; 2J6O A; 1AD5 A; 2GGR A; 2EGE A; 2J7I A; 2HSP A; 2X3W D; 2KXC A; 4FSS A; 1NLP C; 1NYF A; 2FPE A; 4ZNX A; 1XOV A; 2DLP A; 4J9G A; 1JQQ A; 3ZL7 C; 4OMN A; 2KRM A; 1YCS B; 2JS0 A; 3VS3 A; 3FJ5 A; 4KRT A; 2BTT A; 1AEY A; 2A37 A; 1I1J A; 2PNI A; 2DL4 A; 2MIO A; 1BK2 A; 1YN8 A; 2YUQ A; 1PHT A; 4J9F A; 1LCK A; 1HSQ A; 1AWX A; 2L2P A; 2KBT A; 2EQI A; 5GJV B; 1ZSG A; 3R6N A; 1WXB A; 1WDX A; 3VS4 A; 4CC3 A; 4JZ3 A; 2HBW A; 1B3Q A; 1MUZ A; 3O5Z A; 2O2O A; 1VYT A; 1X6B A; 4J9I A; 3M0U A; 2RQU A; 4HVW A; 4DEY A; 2RF0 A; 2RQR A; 2GBQ A; 1MV3 A; 4J9C A; 4RTY A; 4E6R A; 5ECA A; 3UAT A; 2EVR A; 1QLY A; 4RTT A; 3SEM A; 1B07 A; 1TUD A; 2C0O A; 3VRZ A; 2C0T A; 2V1R A; 2ESW A; 2H8H A; 1BB9 A; 1VYV A; 2J6F A; 4F14 A; 3PE0 A; 1EFN A; 2V1Q A; 2DMO A; 4LNP A; 1BU1 A; 1GFC A; 3EGU A; 2J06 A; 5FW9 A; 1TUC A; 3QWX X; 2B86 A; 3M0R A; 1UFF A; 2D1X A; 4J9D A; 1E7O A; 5GJW B; 1VYU A; 4CC7 A; 1ABO A; 1E6G A; 2HCK A; 1VA7 A; 4OMP A; 3IQL A; 2KNB B; 4RTZ A; 5HCK A; 2GTO A; 2RQW A; 4AFZ C; 4OMQ A; 2YUO A; 1K0X A; 2CSQ A; 1WXT A; 2CDT A; 2D8J A; 4WCI A; 1W1F A; 4OMO A; 3NGP A; 2EGA A; 1PRL C; 2KRN A; 2JMA A; 2W0Z A; 4JJD A; 2LJ3 A; 2K7A A; 2AK5 A; 2YSQ A; 1NEG A; 4IIO A; 1FYN A; 1WIE A; 4AG1 C; 3EG3 A; 2J6K A; 2K3B A; 2EW3 A; 3M0P A; 1OPK A; 2EKH A; 4D8D A; 1GCP A; 1X69 A; 2F2V A; 3H41 A; 1K4U S; 2EYW A; 2GTJ A; 2X3X D; 2EYX A; 2LMJ A; 1ZX6 A; 2EPD A; 2J05 A; 2RQV A; 4DEX A; 2NUZ A; 2O9V A; 3QWY A; 2ABL A; 1IO6 A; 2KT1 A; 2AZV A; 4Z8A A; 1OV3 A; 2SEM A; 4JJB A; 2CSI A; 1Y0M A; 2DBK A; 1T0H A; 4HXJ A; 4RUG A; 4Y92 A; 3C0C A; 2O9S A; 3REB B; 3VS1 A; 2JM8 A; 4AFS C; 2YUP A; 2A28 A; 1T0J A; 3SHW A; 1S1N A; 2A08 A; 2HEQ A; 1NM7 A; 2AKK A; 2BZ8 A; 2LP5 A; 1M3A A; 3EG2 A; 1ZUY A; 3EHQ A; 4RTU A; 4LUD A; 2KE9 A; 2QDL A; 1I07 A; 1Z9Q A; 2AKL A; 3NPF A; 4LE9 A; 2KEA A; 3H0H A; 2DIL A; 1K1Z A; 2EGC A; 1UJ0 A; 1GCQ C; 1GL5 A; 1U06 A; 2CUB A; 2EYZ A; 2KYM A; 1CKB A; 2KXD A; 2DBM A; 2LJ1 A; 2PZ1 A; 1PRM C; 1WI7 A; 3I9Q A; 2VWF A; 2DX1 A; 1UEC A; 1W6X A; 1JU5 C; 1JXO A; 2D8H A; 2M51 A; 2RNA A; 1WX6 A; 3EG0 A; 2EYY A; 4HVV A; 4LUE A; 2K9G A; 1H92 A; 2YT6 A; 1KFZ A; 2L0A A; 2P4R A; 1WLP B; 2CUD A; 2FRW A; 2PTK A; 4Z88 A; 1UE9 A; 1T3L A; 1BBZ A; 3M0T A; 4QT7 A; 2LX7 A; 3EHR A; 2FEI A; 4K11 A; 3TVT A; 2DF6 A; 1K0S A; 1M27 C; 2CT4 A; 1H8K A; 2K6D A; 5IHI A; 2DRM A; 1WYX A; 2LQW A; 2KRO A; 1U3O A; 2VVK A; 5IXB A; 1UGV A; 1NLO C; 1WA7 A; 2JW4 A; 1AVZ C; 1ZUU A; 2KT8 A; 1NEB A; 5L23 A; 1UUE A; 2OJ2 A; 4Z89 A; 1J3T A; 2O31 A; 2DJQ A; 1SSH A; 3VRY A; 2CRE A; 3JV3 A; 2O88 A; 1G83 A; 2NWM A; 4CC2 A; 2CT3 A; 1X2K A; 4EIK A; 2FPD A; 4R0K A; 2GNC A; 2ED0 A; 2YUN A; 3M0S A; 4OML A; 1UDL A; 1M30 A; 3LH5 A; 2LZ6 B; 2JS2 A; 3U23 A; 2DNU A; 2L3S A; 1MV0 B; 1NG2 A; 3UA7 A; 1PWT A; 2CH4 W; 2KR3 A; 1OEB A; 3VS0 A; 1KIK A; 4AFU C; 2DRK A; 1K76 A; 1KSW A; 3VS6 A; 1QKW A; 4F16 A; 2C0I A; 1Y57 A; 2JMC A; 1W70 A; 2IIM A; 2RPN A; 1K9A A; 2F2X A; 1V1C A; 3RNJ A; 2DVJ A; 3H0F A; 2ROT A; 4HCK A; 3I5S A; 3THK A; 2K2M A; 2I0N A; 2M0Y A; 4J9E A; 2JT4 A; 5FWC A; 1M8M A; 2A36 A; 3CQT A; 4HVU A; 2VKN A; 5IXF A; 4GLM A; 1SHF A; 3I5R A; 3PVQ A; 2KYB A; 1HD3 A; 3M0Q A; 4A63 B; 4GBQ A; 2ED1 A; 1SEM A; 1AZG B; 1QWE A; 1SPK A; 1UTI A; 1ZLM A; 4J9H A; 2DL7 A; 2YDL A; 1HJD A; 2GQI A; 1AWO A; 5IHN A; 4ESR A; 1SRM A; 1GRI A; 1M3C A; 1RLP C; 1GFD A; 1QWF A; 1X43 A; 2DL5 A; 3PVL A; 3VS7 A; 3NHN A; 1U5S A; 4IIM A; 2RMO A; 2DL8 A; 2JTE A; 1UG1 A; 1ZBJ A; 1JEG A; 1Z9Z A; 1X27 A; 1M3B A; 2LJ0 A; 2DA9 A; 1JO8 A; 2MOX A; 1AZE A; 4J9B A; 1YWP A; 2LNH B; 2HDA A; 3TSZ A; 3VS2 A; 2ECZ A; 2L3P A; 5IH2 A; 1UJY A; 2ENM A; 1GCQ A; 2G6F X; 1NYG A; 1AWJ A; 4CC4 B; 4OMM A; 2RQT A; 2F2W A; 1QKX A; 4AFQ C; 1QCF A; 1RLQ C; 3EG1 A; 4RTV A; 1PKS A; 1PKT A; 2JM9 A; 2SRC A; 4X1V A; 2ROL A; 1CSK A; 2DM1 A; 2LQN A; 2K79 A; 1YP5 A; 3TSW A; 4JJC A; 1YWO A; 2CH4 A; 2AZS A; 2W10 A; 4RTW A; 5IHK A; 3I35 A; 2BZX A; 3H0I A; 3NMZ C; 2FO0 A; 3VS5 A; 3KFV A; 3UF4 A; 2FRY A; 1CKA A; 3UA6 A; 1T3S A; 1KJW A; 5FWB A; 2E5K A; 1YNZ A; 1GBR A; 1SRL A; 1FMK A; 4LN2 A; 5EC7 A; 1WFW A; 1AOJ A; 1UHF A; 2KRS A; 1OPL A; 1ARK A; 2XMF A; 4AG2 C; 2RN8 A; 3GBQ A; 2L3Q A; 5I11 A; 2EBP A; 1I0C A; 2KGT A; 1OOT A; 1GBQ A; 2LCS A; 2MCN A; 2D0N A; 3A98 A; 2DYB A; 4ORZ A; 2DE0 X; 2DL3 A; 1E6H A; 5I22 A; 1AWW A; 2FG0 A; 1N5Z A; 3ULR B; 1TG0 A; 4M4Z A; 3RBB B; 1ABQ A; 2BZY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5IAY A; 1U1S A; 1H3H A; 4PLI A; 3E9F A; 5A0G A; 3C95 A; 1RAC B; 4M7A C; 3QPH A; 1K8A R; 4D8K A; 3FDR A; 4E7K A; 5IN1 A; 1G3W A; 1G5V A; 1OZ3 A; 1XJW B; 2FPF A; 4L6V 5; 2EGE A; 3I56 A; 1Y71 A; 2KXC A; 4HCC A; 2ZPB B; 2XKO C; 4E7J A; 2K4Y A; 5D6Y A; 3VS3 A; 3V7C A; 3FJ5 A; 5GAM f; 2O01 E; 4KH0 B; 3CCE A; 3HRS A; 3NFC A; 4LD6 A; 4PJO A; 2MAM A; 2HMA A; 1IXD A; 3O8V A; 2JVV A; 4ELY C; 3V7R A; 3JAM E; 2VXF A; 3R6N A; 5IT9 E; 1WXB A; 3A8L B; 4JZ3 A; 1VQ6 A; 2LCL A; 1M90 R; 2HBW A; 1MUZ A; 2HD0 A; 1BI3 A; 2K5F A; 4O5V A; 4E6R A; 3CC4 T; 2YWW A; 3KBG A; 3UAT A; 2VV5 A; 3WVE B; 4M7A F; 4RTT A; 1B07 A; 2C0O A; 3VRZ A; 3JSC A; 2C0T A; 5J3B A; 2V1R A; 2H8H A; 1BB9 A; 3JCM P; 4F14 A; 1BU1 A; 2RI3 A; 3EGU A; 1KHI A; 2J06 A; 1YIT A; 4GLK A; 4BD3 A; 3QWX X; 2DZC A; 3M0R A; 2KI7 A; 2RHY A; 4J9D A; 2WSF E; 1ABO A; 3INZ A; 1TTH B; 4OMP A; 1LVK A; 2PU9 B; 2IG0 A; 4C5G A; 4RTZ A; 4OB1 B; 3OYF A; 4OMQ A; 4FSX A; 3GF5 A; 3A1P A; 2HAX A; 2CDT A; 2D8J A; 4WCI A; 1YIJ T; 2RO0 A; 1I5O B; 2E6Z A; 3CCS A; 5FU6 C; 4C92 G; 3OYG A; 3MPU B; 1N8R U; 2W0Z A; 2LJ3 A; 2YSQ A; 1N6A A; 1QVP A; 1Q86 C; 1TSF A; 3OYH A; 3CC7 Q; 1K8A C; 1OPK A; 4XU2 A; 1X69 A; 5AYF A; 1K4U S; 3RIR A; 3PIO A; 2EYX A; 4OB2 B; 2LMJ A; 2JTM A; 1D0Z A; 3CCQ A; 1WJQ A; 4C0D B; 3CCJ Q; 4DEX A; 2O9V A; 3HL8 A; 1MMG A; 1YHQ T; 2SEM A; 4JJB A; 1M1K R; 2F5K A; 3VUZ A; 2JUF A; 1MND A; 3C0C A; 2MF2 A; 1YIJ A; 4JLI A; 3A8H B; 3C12 A; 3M56 A; 3DKM A; 1T0J A; 5I2M A; 3SHW A; 2QA4 A; 1OU9 A; 2MYS A; 4KGX B; 2BZ8 A; 2LP5 A; 1M3A A; 4RTU A; 1OX9 A; 4P5N A; 3WXM B; 3SD4 A; 4KUL A; 2HL5 C; 2DIL A; 3MJX A; 3JCM J; 2F1L A; 1VQ5 A; 2E65 A; 2A3L A; 5CCA A; 2ZPH B; 1U06 A; 1M90 C; 4FL6 A; 2KYM A; 1CKB A; 3JCM b; 5LJ3 d; 2DBM A; 4LDY A; 2VC8 A; 1WZO A; 2DTI A; 3HFO A; 4OB0 B; 3G7Z A; 1I4K 1; 5HK3 A; 1WI7 A; 3I9Q A; 1YHQ A; 2VWF A; 4PFZ A; 3QJY A; 1UEC A; 5LJ5 g; 1LJO A; 4HCB A; 3VYG A; 4AMC A; 4KUI A; 2HQX A; 2RNA A; 1K73 R; 3MEU A; 3LGL A; 4FYW B; 2K9G A; 3VKI A; 4FT2 A; 5A2Q E; 1ZA2 B; 1PG5 B; 4MZM A; 1BBZ A; 2DF6 A; 1JBM A; 4II1 A; 1M27 C; 2CT4 A; 3DB4 A; 4PJO B; 2LQW A; 3OYJ A; 2P4T A; 1UGV A; 1NLO C; 3CCE Q; 1WA7 A; 5CIU A; 7AT1 B; 4BB7 A; 1QVG P; 1UGR B; 1J3T A; 2DJQ A; 5HKC A; 1KHC A; 1Y7X A; 3VRY A; 5GMK j; 1VQ6 Q; 2O88 A; 3CCU T; 1WGS A; 1DJ7 B; 1GXI E; 3EH1 A; 2K3Y A; 4C0F A; 5LJ3 g; 2FPD A; 2K3X A; 4NL2 A; 4R0K A; 3CCL T; 2GNC A; 4OF1 A; 2ED0 A; 2YUN A; 1XNI A; 5DLO A; 3J80 E; 2RHZ A; 5CAI A; 3CPF A; 2DXU A; 2FZC B; 3OYA A; 4PJO D; 2DYI A; 5KYN A; 2CGH A; 1UGS B; 2LZ6 B; 1M1K C; 2JS2 A; 3G4S T; 1BI0 A; 3EFR A; 2E5Q A; 5LJ5 f; 3RMQ A; 1YIT Q; 1KIK A; 5GAM j; 1HYO A; 2DRK A; 4J5Y A; 1YJN Q; 4PFP A; 3VS6 A; 4Y28 E; 1Y57 A; 2JMC A; 1W70 A; 2RPN A; 2XG8 D; 1YI2 T; 1BCO A; 2ZAE A; 1OZ2 A; 3GLX A; 3G71 Q; 2I0N A; 2M0Y A; 2JT4 A; 3CCL A; 4B6M A; 2A36 A; 3CCS Q; 2VKN A; 4JDS A; 6AT1 B; 3JB9 D; 2PVG B; 1VQK T; 1WHH A; 3PTA A; 4ZGJ B; 2QTV A; 3A8M B; 1SPK A; 1AZG B; 1MHN A; 1HJD A; 1AWO A; 4ESR A; 1GRI A; 3JCM e; 3CCQ Q; 3FRN A; 4JUV A; 2DL5 A; 3PVL A; 3VS7 A; 2Y4X A; 1VQ9 T; 1K9M U; 3JCM h; 2LJ0 A; 2VAS A; 4ZTF A; 4LDW A; 2V8I A; 1AZE A; 4QQG A; 4PLL A; 1YIJ Q; 3VS2 A; 3QKJ A; 2RI5 A; 1TH7 A; 3VJP A; 2COZ A; 2G6F X; 2QA4 Q; 4X34 A; 2GF7 A; 2QGG A; 3CD6 Q; 4F04 B; 4CC4 B; 2PVO B; 4N0A A; 2F2W A; 2DKG A; 3OYL A; 3EG1 A; 4RTV A; 3L42 A; 2YRC A; 4PJO E; 2DK3 A; 1VQ5 Q; 1MGQ A; 3AT1 B; 2LQN A; 4L5G A; 2W10 A; 1SKU B; 4FW2 A; 5KH6 A; 1I8F A; 1JJ2 A; 2QI2 A; 2E70 A; 2DTO A; 5KYX B; 1T3S A; 2ZCF B; 1KJW A; 2E5K A; 4MML A; 2DER A; 1WFW A; 1OPL A; 3LLR A; 2RN8 A; 3CPW A; 1Y96 A; 2KGT A; 1OOT A; 1GBQ A; 2LCS A; 2MK5 A; 2D0N A; 3A98 A; 3M57 A; 2DYB A; 2QYZ A; 1VQ7 A; 1LPL A; 3ASK A; 4ORZ A; 2AIR B; 5CKH A; 1E6H A; 3LGF A; 3G6E Q; 1N5Z A; 3ULR B; 3L1A A; 4M4Z A; 3RBB B; 3QDR B; 1ABQ A; 4J6Y A; 1VIE A; 4JPB W; 1OI1 A; 1G2B A; 2QQA A; 1M1G A; 2JXB A; 2LQK A; 3OQ5 A; 1SHG A; 1VOM A; 3L2R A; 4JRP A; 1NZ9 A; 4B9X A; 5A0D A; 4MMK A; 5EG2 A; 4X9D A; 1W2B A; 4RTX A; 3REA B; 4F17 A; 4YTL A; 1AD5 A; 5A0L A; 2ZGW A; 1QCO A; 3CME Q; 4NOY A; 4WF2 A; 3CCM A; 4BDZ A; 1VQP T; 2FL7 A; 2LVM A; 4V2S A; 3ME9 A; 4OGC A; 1V76 A; 4BE0 A; 3LH0 A; 1JJ2 S; 3RR6 A; 5FU7 C; 2KRM A; 1NJI U; 2EYQ A; 1D1B A; 3CCV T; 2DEU A; 2RJD A; 2BTT A; 1AEY A; 2E4H A; 3PT9 A; 1G3Y A; 4A4K A; 3TRE A; 4JRQ A; 3CPW S; 2OTL A; 1LCK A; 4J8O A; 1PC0 A; 2L2P A; 2KBT A; 5GJV B; 3OYI A; 1ZSG A; 3RES A; 4EMK A; 3EGX A; 1B3Q A; 3SFM A; 1VYT A; 3A5Z B; 3WVD B; 2RQU A; 1VQP A; 2MWP A; 1VQM T; 2GBQ A; 1MV3 A; 4A4F A; 2E41 A; 1VQO T; 4QW2 A; 2QEX A; 2COW A; 2DD4 A; 2YRD A; 5GAN e; 1QLY A; 3CCL Q; 2LT4 A; 2Y90 A; 5GAM e; 4C5I A; 1IHW A; 5GAN h; 2ESW A; 1W2B S; 2XK0 A; 3PE0 A; 2LQ8 A; 2VB6 A; 2DMO A; 5GAM h; 2RD1 A; 3UPU A; 2D1X A; 2NYS A; 1VQ4 A; 4EPC A; 1E7O A; 5GJW B; 3RMS A; 1VYU A; 3MP1 A; 2DZ9 A; 5LJ5 j; 5HCK A; 1VQN T; 1D0X A; 5CKB A; 1K0X A; 3SB2 A; 1WXT A; 2DO3 A; 1M4Z A; 4MDW A; 1ZSZ A; 4PJM A; 4EMG A; 1PRL C; 3HRU A; 3EFS A; 3PGG A; 2AK5 A; 2DJZ A; 1NEG A; 1WIE A; 1QP3 A; 3I55 T; 4F7U B; 4FYV B; 4D8D A; 1GCP A; 1KC8 U; 1D3B A; 3H41 A; 2GTJ A; 2X3X D; 4QQ6 A; 3NTH A; 3VUB A; 1ZX6 A; 2EPD A; 5I21 A; 1FXX A; 2NUZ A; 2ABL A; 1IO6 A; 1IRE B; 1OV3 A; 3OW2 A; 3RDV A; 1VQN A; 2HBP A; 4JRK A; 4HXJ A; 4XU1 A; 2M16 A; 2M02 A; 2HKN A; 3REB B; 1Q82 U; 1Y96 B; 1YJ9 A; 1QVF P; 2JM8 A; 2YUP A; 2FHD A; 2XDD A; 2YLC A; 2L3R A; 2RA2 A; 2K5L A; 2A08 A; 1Q7Y R; 1AHJ B; 2AKK A; 2HEQ A; 3EHQ A; 3CCR A; 2KE9 A; 3JB9 G; 1Z9Q A; 2AKL A; 1VQ7 Q; 1K1Z A; 4Q5W A; 2EGC A; 1UJ0 A; 4DA4 A; 3MO8 A; 3CBM A; 4MZT A; 3FJP A; 2CUB A; 2EYZ A; 2R58 A; 1RL2 A; 1VQ8 T; 2KK4 A; 2P84 A; 3BW1 A; 4XTU A; 2H3J A; 1X6O A; 3CMA Q; 3P8D A; 2MPX C; 1KD1 C; 4M78 A; 4OB3 B; 4C0G A; 4R56 A; 1JXO A; 2M51 A; 3EG0 A; 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