The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
3
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
TFVALYDYESRTETDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLTTGQTGYIPSNYVAPS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| molecule keywords |
SRC TYROSINE KINASE SH3 DOMAIN
|
| publication title |
1H and 15N assignments and secondary structure of the Src SH3 domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
|
| total genus |
3
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1994-03-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2J05 A; 4OMN A; 1K9A A; 1PHT A; 2DE0 X; 1M3B A; 3VRZ A; 2EGE A; 1W1F A; 2VKN A; 2KXD A; 2KRN A; 4F17 A; 1TUC A; 1AWO A; 2NUZ A; 2DJQ A; 1K76 A; 3VS7 A; 3H0I A; 5FW9 A; 4J9C A; 2KYM A; 4ESR A; 2DL8 A; 4OMO A; 1K4U S; 1ABO A; 2LP5 A; 4RTX A; 4J9H A; 2LZ6 B; 2AZS A; 2JM8 A; 5IHI A; 3A98 A; 1TG0 A; 2FG0 A; 2DL3 A; 1PKT A; 1XOV A; 2LJ3 A; 2KT1 A; 1UUE A; 2PNI A; 2RNA A; 5EC7 A; 1E6G A; 3VS6 A; 2JW4 A; 2DNU A; 2KRS A; 3NPF A; 2LX7 A; 2DBK A; 3FJ5 A; 1SPK A; 1A0N B; 4CC4 B; 4AG1 C; 1VYT A; 2LMJ A; 2V1R A; 1BB9 A; 1GCQ C; 2GBQ A; 4DEX A; 2RF0 A; 1E7O A; 2K7A A; 4OML A; 1NEG A; 2CSQ A; 3R6N A; 2EVR A; 2A08 A; 1WYX A; 2DL4 A; 3CQT A; 3EG2 A; 4EIK A; 5HCK A; 2DBM A; 2M51 A; 2H8H A; 4RTT A; 3UA6 A; 1QCF A; 4HVU A; 4M4Z A; 1B3Q A; 1HD3 A; 5IHK A; 1K0S A; 1OOT A; 4J9D A; 4JJB A; 2DYB A; 2D0N A; 2HEQ A; 2I0N A; 2BTT A; 3VS5 A; 2RQU A; 1LCK A; 1JU5 C; 2JS0 A; 1G2B A; 1X27 A; 1NLO C; 3C0C A; 1GBQ A; 1SRM A; 1YWP A; 1UHC A; 2YT6 A; 2RMO A; 3I5S A; 2LQW A; 1T3S A; 5GJV B; 1KSW A; 2YSQ A; 2JMC A; 4LN2 A; 2GTJ A; 2W10 A; 2PZ1 A; 1RLP C; 2FPF A; 1SEM A; 2FPD A; 2CT4 A; 1UG1 A; 1YWO A; 1T0H A; 2EPD A; 2CSI A; 4ZNX A; 1SSH A; 2GNC A; 5IHN A; 2MCN A; 1HSQ A; 2HBW A; 1BU1 A; 3EHR A; 1AWJ A; 3H0F A; 2EGA A; 2DRM A; 1QWE A; 1M3A A; 1X2Q A; 2K6D A; 1ZLM A; 2O88 A; 4WCI A; 4Z89 A; 2E5K A; 1JO8 A; 2K9G A; 1GL5 A; 1H92 A; 4JZ3 A; 2K3B A; 2P4R A; 1PRM C; 2A37 A; 4E6R A; 5I11 A; 3PVQ A; 1EFN A; 1GFD A; 1OV3 A; 2AKK A; 2L3S A; 1NLP C; 1U5S A; 1UJY A; 3QWY A; 1YP5 A; 2MIO A; 2J7I A; 2L3Q A; 1NEB A; 4KRT A; 1ZUY A; 5IXB A; 4GLM A; 4X1V A; 2O9V A; 2W0Z A; 1UHF A; 2KBT A; 2RQV A; 1AD5 A; 1CSK A; 4IIO A; 3VS0 A; 3NMZ C; 3UA7 A; 1OPL A; 4HCK A; 2ED0 A; 1MV0 B; 3M0T A; 4J9I A; 2PTK A; 1KIK A; 1NM7 A; 4LNP A; 4FSS A; 2KGT A; 2LJ1 A; 1J3T A; 1WI7 A; 1BBZ A; 4JPB W; 2SRC A; 1ZBJ A; 2FEI A; 4RTY A; 2CRE A; 1Y57 A; 1TUD A; 2DVJ A; 1QKX A; 2LCS A; 2RQT A; 1K0X A; 1H8K A; 2D8J A; 2KXC A; 2DL7 A; 2C0I A; 1UFF A; 2YUQ A; 2LQN A; 3UF4 A; 2VWF A; 2A28 A; 2J6O A; 1WXU A; 2RN8 A; 4LUD A; 4RUG A; 4F14 A; 2FPE A; 4HXJ A; 1MV3 A; 1YCS B; 3REA B; 4JJD A; 1ZSG A; 2ABL A; 3VS3 A; 3TVT A; 4AFQ C; 1K1Z A; 1UEC A; 1H3H A; 2RQW A; 3EG3 A; 1Z9Z A; 1WX6 A; 2C0T A; 3UAT A; 1X6G A; 2K79 A; 2OI3 A; 1QLY A; 2OJ2 A; 2DA9 A; 1SHG A; 2EBP A; 1M3C A; 2CH4 W; 3VS4 A; 2YUP A; 2DX1 A; 1X2K A; 5L23 A; 1PRL C; 2IIM A; 2GQI A; 1HJD A; 2G6F X; 3JV3 A; 3PVL A; 4J9G A; 1YN8 A; 3VS1 A; 2OAW A; 2DF6 A; 3LH5 A; 2DIL A; 2J6F A; 4LE9 A; 1FYN A; 1AEY A; 2BZY A; 1I07 A; 3M0S A; 2BZX A; 4RTU A; 4A63 B; 1G83 A; 1CKB A; 2KRO A; 2X3W D; 1PKS A; 1QWF A; 1U06 A; 2DM1 A; 4RTZ A; 4HVV A; 3VRY A; 2SEM A; 2O9S A; 2V1Q A; 2M0Y A; 2ROT A; 2JS2 A; 3EHQ A; 2GTO A; 2XMF A; 1ABQ A; 3O5Z A; 5I22 A; 1UGV A; 1NYF A; 2A36 A; 4IIM A; 4ORZ A; 4F16 A; 4RTW A; 1N5Z A; 1WA7 A; 1NYG A; 1IO6 A; 4QT7 A; 3QWX X; 2GGR A; 2CUD A; 1JQQ A; 2HDA A; 1FMK A; 2HCK A; 1QKW A; 2L3P A; 1AOJ A; 2F2X A; 4Y92 A; 3SEM A; 1S1N A; 4Z8A A; 2KE9 A; 2ESW A; 1X6B A; 1M27 C; 1PWT A; 4J9B A; 2ROL A; 3NGP A; 4CC2 A; 1UJ0 A; 1GFC A; 5GJW B; 1UDL A; 2D8H A; 2YUO A; 2DMO A; 4JJC A; 4JZ4 A; 4CC7 A; 2BZ8 A; 3TSW A; 2NWM A; 2YUN A; 1V1C A; 3RNJ A; 3EGU A; 2CT3 A; 4CC3 A; 3PE0 A; 5ECA A; 1JXO A; 2HSP A; 2CDT A; 1AZG B; 2EYW A; 1ZX6 A; 1JXM A; 1PNJ A; 1U3O A; 3GBQ A; 1JEG A; 4AG2 C; 1B07 A; 2FRY A; 3REB B; 4DEY A; 1WFW A; 2EW3 A; 2DRK A; 2EGC A; 3IQL A; 2L0A A; 1AZE A; 5IXF A; 2DLP A; 3THK A; 3NHN A; 4LUE A; 5IH2 A; 2EYY A; 1UTI A; 4GBQ A; 1ARK A; 2CH4 A; 3KFV A; 1VYU A; 1GCQ A; 2YDL A; 2O31 A; 1T0J A; 1WXB A; 3EG1 A; 4Z88 A; 2JMA A; 1VA7 A; 1MUZ A; 3I5R A; 2EKH A; 2EQI A; 1KFZ A; 1OEB A; 4AFZ C; 2JT4 A; 3ULR B; 2JXB A; 1GCP A; 2EYX A; 3TSZ A; 3EG0 A; 1KJW A; 2MOX A; 4AFU C; 2AKL A; 1ZUU A; 4OMM A; 1I0C A; 1AWW A; 3M0R A; 1CKA A; 4J9E A; 4AFS C; 1RUW A; 1SRL A; 2F2W A; 2L2P A; 4D8K A; 2ED1 A; 1W70 A; 2J06 A; 1T3L A; 1WIE A; 2B86 A; 2RQR A; 2QDL A; 1WDX A; 3H0H A; 1SHF A; 4RTV A; 1RI9 A; 1E6H A; 3I35 A; 4D8D A; 2AZV A; 1Z9Q A; 1X69 A; 1AWX A; 2KEA A; 1GRI A; 2K2M A; 3M0U A; 2KRM A; 1WXT A; 1GBR A; 4J9F A; 2KT8 A; 2C0O A; 4HVW A; 2EYZ A; 5FWB A; 2J6K A; 1NG2 A; 1ZUK A; 1W6X A; 2FO0 A; 1AVZ C; 1UE9 A; 2CUB A; 1M8M A; 1Y0M A; 4K11 A; 2KR3 A; 3RBB B; 1WLP B; 2ENM A; 1I1J A; 3M0P A; 1X43 A; 2LNH B; 4R0K A; 1RLQ C; 4OMQ A; 2D1X A; 2AK5 A; 2JM9 A; 2X3X D; 5FWC A; 4OMP A; 2FRW A; 3SHW A; 2KYB A; 2DL5 A; 2ECZ A; 2O2O A; 1YNZ A; 2RPN A; 2F2V A; 3ZL7 C; 2VVK A; 3I9Q A; 1M30 A; 3VS2 A; 3M0Q A; 2JTE A; 1OPK A; 3U23 A; 2KNB B; 2LJ0 A; 1VYV A; 3H41 A; 1BK2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1M90 C; 3FJP A; 2J05 A; 5LJ5 h; 4OMN A; 4BB7 A; 2QQB A; 2VV5 A; 1NZ9 A; 1M3B A; 1VQ6 A; 1W2B A; 2KRN A; 2GCX A; 4GY5 A; 4PJO F; 1M1G A; 5FRO A; 3BW1 A; 2DZC A; 2RI2 A; 4OMO A; 3RMS A; 5CAI A; 3LWI A; 3RKW A; 3CCU T; 2MK5 A; 4OGC A; 1UB4 A; 5M9O A; 4M77 E; 4C92 G; 2QYZ A; 2DL3 A; 3V8J A; 3DLL A; 2LJ3 A; 2KT1 A; 2PNI A; 3CCV Q; 1VQL Q; 5EC7 A; 3HP9 A; 5GMK j; 2DNU A; 3NPF A; 1MMG A; 4MML A; 2PUK B; 2RJD A; 3I55 Q; 1Y96 B; 2BE9 B; 4PJO D; 3GLX A; 1A0N B; 1GXI E; 4N4H A; 3OMG A; 4MZP A; 2LNV A; 4C5H A; 2CGH A; 3JCM e; 2DL4 A; 3MP8 A; 3CPW P; 5HCK A; 3RR6 A; 2DBM A; 3PIP A; 2H8H A; 4HVU A; 4KBM B; 1VQM T; 1B3Q A; 1HD3 A; 1OOT A; 4C0G A; 2WAC A; 1VQ7 A; 3L2Q A; 4KUI A; 2BTT A; 3VS5 A; 2RQU A; 4ATO A; 1JU5 C; 2JS0 A; 1G2B A; 1QVP A; 4EPC A; 2XIC A; 2DFU A; 3HRT A; 4HT8 A; 2YT6 A; 3CBO A; 2DJZ A; 3A5Z B; 1KSW A; 2YSQ A; 3AT1 B; 4LN2 A; 1M5Q 1; 1SEM A; 5GMK h; 3G6E T; 2E41 A; 3E9G A; 2EPD A; 2E3I A; 2QTV A; 3FIF A; 1Q86 R; 1VQ8 A; 4C92 D; 1JO8 A; 4RKU E; 4JLI A; 3BDU A; 1PRM C; 3JCM V; 1EFN A; 3L42 A; 2AKK A; 2L3S A; 2XDP A; 3OYL A; 1UJY A; 1KQ1 A; 5CKB A; 3JCM c; 1ZUY A; 5IXB A; 2QI2 A; 3C94 A; 3D7S B; 4GLM A; 3CCQ Q; 1KQS S; 1UHF A; 2KBT A; 4M77 A; 2O4X B; 3MJX A; 2RM4 A; 1YJN Q; 4HCK A; 1IHV A; 1OYX A; 3SWN B; 4LNP A; 2EWN A; 3SWN A; 2L3R A; 2KGT A; 1VQ6 Q; 2DK3 A; 1FXX A; 1D1B A; 2XID A; 3GNG A; 5LJ3 f; 5GAN f; 1KQS A; 1N8R U; 1PSE A; 1BCO A; 5LJ3 g; 3V8L A; 2DVJ A; 5GAN g; 2RQT A; 5CIU A; 4FM4 B; 1WQW A; 1ACM B; 5GAO r; 1WNL A; 4XK8 E; 3V7C A; 2J6O A; 1WXU A; 4RUG A; 4JJD A; 3DB3 A; 3VS3 A; 1K8A R; 3TCJ A; 2HAX A; 4M7A B; 2E70 A; 4E7S A; 3H8Z A; 2C0T A; 3UAT A; 1X6G A; 1K8A C; 4M75 E; 2Y4Y A; 2LC4 A; 1QLY A; 4LD9 K; 2OJ2 A; 5CR2 A; 3OB9 A; 8ATC B; 2DEQ A; 1XNI A; 1YIT A; 3HHT B; 2QG9 B; 2EBP A; 1M3C A; 5KYU A; 2XK0 A; 2ZPB B; 4MZM A; 3VS4 A; 1PRL C; 2IIM A; 2GQI A; 1HJD A; 3CMA A; 1PD1 A; 3JV3 A; 2PVO B; 2EAY A; 3JB9 J; 2DF6 A; 2DIL A; 3JCM J; 3M5A A; 1I07 A; 2HZY A; 2OTJ A; 5GMK l; 2DPP B; 1PKS A; 1U06 A; 2XDB A; 1OI1 A; 1VQP A; 4HVV A; 1VQ7 Q; 3M59 A; 4C0Z A; 2M0Y A; 4C92 E; 2K5L A; 3H6Z A; 3MPU B; 1Q81 R; 1YI2 T; 3EHQ A; 4A4F A; 4M7D F; 1M1F A; 2GTO A; 3M57 A; 3O5Z A; 4ORZ A; 4IIM A; 1IGQ A; 4ELZ C; 1Q81 C; 4L6V 5; 3CPW S; 4IUU A; 4RTW A; 5DY9 A; 3G1J A; 4BI3 A; 4EMG A; 3QJY A; 2KSS A; 2QQA A; 2GGR A; 1JQQ A; 1FMK A; 2OTL T; 1VQN A; 1FMV A; 2LVM A; 1S1N A; 4DOW A; 4ZTJ A; 1BIA A; 1I5O B; 1M27 C; 1PWT A; 3LWH A; 3NGP A; 2K2V A; 4CC2 A; 4LDW A; 2P0Q A; 3M4Y A; 3CPW A; 5KYN A; 2QQR A; 3GNF B; 2YUO A; 4C8Q F; 4PJO A; 4PJL A; 1LJO A; 3QKJ A; 2CP6 A; 3PE0 A; 5ECA A; 5GAO n; 3OYF A; 1G3T A; 3CBP A; 1WZO A; 4PLI A; 1PNJ A; 5LJ3 e; 2E1H A; 2K57 A; 5GAN e; 4VUB A; 3EGX B; 1IRE B; 2RJF A; 2PVG B; 3V8K A; 1WJS A; 2DLP A; 2FZG B; 4LUE A; 5C0M A; 2EYY A; 1UTI A; 2JJ9 A; 3KFV A; 5LL6 S; 4E7J A; 4L5G A; 3CEY A; 3PMT A; 3MCA B; 1T0J A; 3EG1 A; 4Z88 A; 1VQO T; 1YIJ T; 1K9M U; 3MET A; 1VQK A; 3CCE T; 2EQI A; 1YJ9 A; 2JT4 A; 3ULR B; 3DKM A; 2GF7 A; 2JXB A; 3TSZ A; 3EG0 A; 4AFU C; 3CC7 Q; 3SWN C; 1VQ4 A; 2R5A A; 1Q82 U; 3ZBD A; 1FWZ A; 2DO3 A; 3EFS A; 1PC0 A; 1I0C A; 4J9E A; 4IUR A; 1Y07 A; 1RUW A; 3L2V A; 2QA4 T; 1W70 A; 2QEX A; 1D3B A; 1RAF B; 1YIT Q; 1G3S A; 1Q95 G; 3FEO A; 3CC4 T; 2QDL A; 5D7U A; 1M90 U; 1SHF A; 2MAM A; 1QMC A; 1QW1 A; 1OZ3 A; 2DTO A; 5KCH A; 5IAY A; 2VXF A; 2AZV A; 3VUB A; 1PD0 A; 1W2B P; 1B34 B; 2DET A; 1Z9Q A; 1B34 A; 3ASK A; 4BI4 A; 4EMK B; 1X75 C; 1AWX A; 4EMK A; 2WSE E; 3I56 T; 2KRM A; 2OTJ Q; 3X20 B; 1GBR A; 2C0O A; 4HVW A; 5LJ5 d; 5FWB A; 2J6K A; 1JBM A; 2E12 A; 2PUO B; 1NG2 A; 1ZUK A; 3CD6 Q; 3EFO B; 3CPF A; 2CUB A; 2KR3 A; 1ZQ1 A; 4BE1 A; 1R0B G; 4PJN A; 3RBB B; 4P5N A; 3FDR A; 1I1J A; 1UGP B; 3PTA A; 3M0P A; 2F1L A; 3JCM h; 1X43 A; 2LNH B; 3X24 B; 3AHU A; 2DVE A; 3PMI A; 4IKF A; 1M2V A; 3GOX A; 5GAM e; 1NPR A; 3TQ7 P; 1MMN A; 4OMP A; 3SHW A; 1VQ5 Q; 2KYB A; 2DL5 A; 4E7K A; 1VIE A; 1RAH B; 1VQN Q; 3I9Q A; 3OS1 A; 3M0Q A; 1G3Y A; 3QII A; 1AHJ B; 3E19 A; 2HQX A; 1D0Z A; 3H41 A; 1WHJ A; 5I2M A; 4XU3 A; 2JUF A; 1PHT A; 5KYW B; 1I4K 1; 3VRZ A; 2AT1 B; 2CKK A; 2CP7 A; 4M7A G; 2RI3 A; 1QVF S; 1AWO A; 2NUZ A; 2DJQ A; 2M16 A; 5FW9 A; 2MWO A; 3LGF A; 4JS5 A; 2BE7 D; 2DXU A; 3Q1J A; 3CCV A; 3CXC S; 2XG8 D; 2CP5 A; 5HK0 A; 4J9H A; 2JM8 A; 4PJO C; 5IHI A; 3A98 A; 4MMK A; 4XTV A; 2NUP B; 1XOV A; 1QVF A; 3QZ5 B; 2KVQ G; 3UDC A; 2JN0 A; 3CCL A; 3J7A F; 2RNA A; 2JW4 A; 3MKD A; 2A7Y A; 3CXC A; 2DBK A; 1YJ9 Q; 3MEU A; 2VYT A; 2YRC A; 1SPK A; 3OSS C; 3KUF A; 2VC8 A; 4AG1 C; 4M7A F; 2V1R A; 3PNW C; 3GP8 A; 3HL8 A; 1VQ4 Q; 1WJR A; 3LX7 A; 2GBQ A; 2ZCF B; 2RF0 A; 3CME T; 4KGV B; 3LYI A; 2A08 A; 2HD0 A; 1KC8 U; 1WYX A; 3JCM X; 2X35 A; 4EIK A; 4XAX B; 3JCM W; 4BDY A; 3JCM g; 5IHK A; 1QCF A; 4LDU A; 4HCB A; 2HEQ A; 3C12 A; 3CCS A; 2E6Z A; 4C0D C; 4JRK A; 4M7D B; 3L2R A; 4M7D A; 2YHT A; 3OYY A; 3SD4 A; 2LQ8 A; 3C0C A; 2DXT A; 2HL3 A; 3PFS A; 1UHC A; 4OP0 A; 5J26 A; 3I5S A; 2P0K A; 2KDS A; 1XQH A; 3KBG A; 1KQS P; 4M7A D; 2P0P A; 1MND A; 1K73 R; 2CT4 A; 1UG1 A; 1SG5 A; 1T0H A; 4LD6 A; 3PIO A; 4II1 A; 4E2F B; 1YHQ Q; 3GF5 A; 2CSI A; 3EG9 A; 5IHN A; 3G4S Q; 5KYX B; 4JUV A; 2E3H A; 3EHR A; 2ZPH B; 1AWJ A; 3I55 T; 2EGA A; 1QWE A; 5D6W A; 2K6D A; 5CVI A; 1ZLM A; 2H3E B; 1V29 B; 2Y4X A; 4C8Q B; 1WHK A; 3HFN A; 1H92 A; 4EMK C; 5CKH A; 2A0F B; 2A37 A; 4E6R A; 5HKC A; 3PVQ A; 2O01 E; 1GFD A; 1JJ2 P; 4XTW A; 1YJN A; 3QWY A; 2LX9 A; 5LJ3 j; 2DAQ A; 2X9H A; 5GAN j; 3M9Q A; 3FC3 A; 2L3Q A; 1NEB A; 2W0Z A; 2LRQ A; 1AD5 A; 3RUX A; 2F5T X; 4B9W A; 3WXM B; 3QZ9 B; 3ME9 A; 3UA7 A; 2ED0 A; 2RHZ A; 3QDF A; 2V8J A; 2PTK A; 1KIK A; 5I21 A; 1RAD B; 5GAO q; 3UPU A; 4E47 A; 1BBZ A; 5FU6 C; 4JPB W; 5I2S A; 1ZBJ A; 2FEI A; 2RO0 A; 1RAI B; 3CCM Q; 3E2U A; 3OYN A; 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