The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
|
sequence length |
54
|
structure length |
54
|
Chain Sequence |
GAMEAIYAYEAQGDDEISIDPGDIITVIRGDDGSGWTYGECDGLKGLFPTSYCK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
BZZ1 protein
|
| publication title |
Structural genomics of yeast SH3 domains
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
14
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| structure length |
54
|
| sequence length |
54
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SRM A; 1H3H A; 1PKT A; 2CT3 A; 2RPN A; 4X1V A; 1VYV A; 5GJV B; 4HVV A; 1GFC A; 1E6G A; 1OEB A; 2MIO A; 4OMM A; 1RLQ C; 1OPL A; 2I0N A; 3EHQ A; 4M4Z A; 4EIK A; 2FG0 A; 1UUE A; 1VYU A; 3NPF A; 2KBT A; 3JV3 A; 2DA9 A; 1WLP B; 2H8H A; 1ZUK A; 2RF0 A; 1Y57 A; 2PZ1 A; 2LJ3 A; 1UDL A; 1WFW A; 2JMA A; 3EGU A; 3VRZ A; 1K4U S; 2EYX A; 1QKX A; 4R0K A; 3VS6 A; 2CSQ A; 2LP5 A; 5FW9 A; 2DL7 A; 3EG1 A; 1UGV A; 4AFZ C; 3A98 A; 1I07 A; 1PHT A; 1YWP A; 3LH5 A; 2JM8 A; 1AWX A; 3M0R A; 1UEC A; 1ZUY A; 1WYX A; 2YDL A; 3PE0 A; 1T0J A; 1JQQ A; 2HEQ A; 4DEY A; 2G6F X; 2LNH B; 5L23 A; 4GBQ A; 2M51 A; 2DNU A; 1UG1 A; 2L0A A; 2YUO A; 3QWY A; 4WCI A; 3FJ5 A; 2AKL A; 1V1C A; 1B07 A; 1BU1 A; 3GBQ A; 3UF4 A; 1ARK A; 2DBM A; 5EC7 A; 1JXM A; 2D1X A; 1AWO A; 3PVQ A; 4JJB A; 3TVT A; 2ESW A; 1S1N A; 3EHR A; 1IO6 A; 2PTK A; 3IQL A; 2LX7 A; 1SHG A; 1M27 C; 2BTT A; 4J9H A; 1GCQ C; 2AKK A; 1GRI A; 3EG2 A; 2CSI A; 2FPE A; 4J9C A; 2KGT A; 2F2V A; 4AG2 C; 1QKW A; 2F2X A; 2LMJ A; 2JMC A; 1QWF A; 2JW4 A; 1RI9 A; 2EGE A; 2YSQ A; 2RQT A; 2VWF A; 3H0H A; 3M0U A; 3EG0 A; 2P4R A; 1GBR A; 2DBK A; 4LUD A; 1T3S A; 2AZS A; 2DL3 A; 1AVZ C; 2O2O A; 3QWX X; 3VS3 A; 4Z88 A; 3H0F A; 5IXF A; 1M30 A; 1YCS B; 2RQU A; 4GLM A; 2YUN A; 1HSQ A; 3R6N A; 2YUP A; 1JXO A; 1WA7 A; 1AOJ A; 4JPB W; 2V1R A; 2AK5 A; 4F16 A; 5FWC A; 4RTV A; 1UTI A; 3EG3 A; 3NMZ C; 1VA7 A; 1GFD A; 3H41 A; 1WIE A; 1T0H A; 4FSS A; 5IHN A; 3PVL A; 4D8K A; 1PNJ A; 4F17 A; 2FEI A; 2RN8 A; 1UJY A; 2FO0 A; 2OJ2 A; 2O31 A; 1NLP C; 2EPD A; 4ESR A; 4LNP A; 2L2P A; 4D8D A; 2JXB A; 2SEM A; 1TG0 A; 2L3S A; 5I11 A; 4CC7 A; 2BZ8 A; 2DMO A; 1NYG A; 4CC3 A; 1X69 A; 1M3A A; 4J9I A; 1YWO A; 2ROL A; 2RQV A; 1PKS A; 2MCN A; 3I5R A; 2YT6 A; 3C0C A; 2DVJ A; 2DYB A; 2OI3 A; 4OML A; 4AFU C; 4F14 A; 1M8M A; 1BK2 A; 2DX1 A; 1EFN A; 5IHI A; 1SEM A; 5HCK A; 4CC2 A; 1NEG A; 2ABL A; 1X2K A; 2D8J A; 2J06 A; 4Z89 A; 2LCS A; 5IXB A; 2GTJ A; 4IIM A; 4LUE A; 3UA6 A; 2D8H A; 2C0I A; 1H92 A; 4J9D A; 2KT1 A; 4JZ4 A; 1RUW A; 4K11 A; 2CRE A; 2KR3 A; 1SHF A; 3UAT A; 2A08 A; 2KE9 A; 3O5Z A; 1WX6 A; 2L3P A; 2RQW A; 2EYZ A; 2EYW A; 2CT4 A; 1WDX A; 2KYM A; 1TUC A; 2DJQ A; 2DRK A; 2X3W D; 1MUZ A; 1W1F A; 2J6O A; 4J9G A; 1KFZ A; 1SPK A; 2ROT A; 3M0Q A; 1K0S A; 4CC4 B; 5I22 A; 2RMO A; 2CH4 A; 3I9Q A; 2ED0 A; 1M3C A; 1ZBJ A; 2ECZ A; 1KJW A; 2FRW A; 1AZG B; 3VS2 A; 4E6R A; 3M0T A; 3ULR B; 2GNC A; 2KRM A; 4RTY A; 4AG1 C; 4AFQ C; 2EVR A; 4RTZ A; 4J9F A; 1QCF A; 4ORZ A; 4JJD A; 3SEM A; 2DL8 A; 1AWJ A; 2FPD A; 1XOV A; 1ZUU A; 3VS4 A; 1SRL A; 3THK A; 2KRS A; 3SHW A; 3VS0 A; 1K1Z A; 4AFS C; 2C0T A; 3ZL7 C; 2HDA A; 1ZSG A; 1ZX6 A; 2HCK A; 1GCP A; 2CH4 W; 5ECA A; 1UJ0 A; 3RNJ A; 2LZ6 B; 4HCK A; 1J3T A; 1YP5 A; 1FMK A; 1UHF A; 1Y0M A; 2HBW A; 4IIO A; 3VS5 A; 1FYN A; 2A37 A; 4DEX A; 2ENM A; 4LN2 A; 4HVW A; 1PRM C; 2O88 A; 2QDL A; 1JEG A; 4RTW A; 1WI7 A; 1HD3 A; 4OMO A; 3VRY A; 1WXB A; 2K79 A; 1GL5 A; 1G83 A; 1X6G A; 3VS1 A; 2J6K A; 2KXC A; 1WXU A; 1OPK A; 2PNI A; 1U3O A; 1K76 A; 2BZY A; 1HJD A; 1CSK A; 1GBQ A; 5FWB A; 1JU5 C; 2DL4 A; 2K9G A; 4RTX A; 2JTE A; 4RTU A; 4RTT A; 1AEY A; 2J6F A; 2VVK A; 1N5Z A; 1KIK A; 2EGC A; 1UHC A; 2K3B A; 4HXJ A; 2V1Q A; 2C0O A; 2YUQ A; 2EKH A; 2EGA A; 2W10 A; 1T3L A; 1I1J A; 2GGR A; 1NLO C; 2CUB A; 2JT4 A; 1KSW A; 1W70 A; 2K7A A; 2GTO A; 2OAW A; 2KT8 A; 2MOX A; 2X3X D; 4HVU A; 1RLP C; 2LQN A; 1TUD A; 3NGP A; 3UA7 A; 1M3B A; 4Z8A A; 2AZV A; 2EBP A; 2IIM A; 1MV3 A; 2E5K A; 2LQW A; 2CUD A; 4Y92 A; 2KYB A; 2JM9 A; 3M0S A; 1K0X A; 1ABQ A; 2NWM A; 1Z9Q A; 2LJ1 A; 1H8K A; 1X2Q A; 1Z9Z A; 5GJW B; 1E6H A; 3TSZ A; 4A63 B; 2RNA A; 1W6X A; 1U06 A; 2A36 A; 1X27 A; 3VS7 A; 2DM1 A; 2VKN A; 2DL5 A; 3CQT A; 1UE9 A; 2K2M A; 2DE0 X; 2O9S A; 2KRN A; 1B3Q A; 1CKA A; 1G2B A; 1YNZ A; 2HSP A; 1OV3 A; 1NYF A; 2ED1 A; 1AWW A; 1YN8 A; 2J05 A; 2GBQ A; 4QT7 A; 1K9A A; 2KRO A; 1ABO A; 2EQI A; 2M0Y A; 2DIL A; 2KXD A; 1UFF A; 1CKB A; 3M0P A; 1OOT A; 1JO8 A; 2EYY A; 3NHN A; 5IH2 A; 5IHK A; 1QLY A; 2B86 A; 3RBB B; 2CDT A; 4JJC A; 3I35 A; 4RUG A; 2A28 A; 3REB B; 1X43 A; 1X6B A; 2EW3 A; 2L3Q A; 2GQI A; 1NM7 A; 2O9V A; 2JS2 A; 2FPF A; 1PWT A; 1SSH A; 4J9E A; 2XMF A; 1AD5 A; 2K6D A; 2LJ0 A; 3TSW A; 1MV0 B; 2F2W A; 3I5S A; 1ZLM A; 3H0I A; 1QWE A; 1BB9 A; 2FRY A; 2W0Z A; 1VYT A; 4OMP A; 2DF6 A; 4KRT A; 1E7O A; 2NUZ A; 3U23 A; 1GCQ A; 2D0N A; 2KEA A; 2RQR A; 2KNB B; 4JZ3 A; 4OMQ A; 3KFV A; 2SRC A; 1A0N B; 2JS0 A; 1NG2 A; 3REA B; 1NEB A; 1I0C A; 2DRM A; 4J9B A; 1BBZ A; 1U5S A; 1WXT A; 1PRL C; 2DLP A; 1LCK A; 4ZNX A; 2J7I A; 4LE9 A; 4OMN A; 2BZX A; 1AZE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5FRN A; 1PKT A; 2CT3 A; 2RPN A; 4BUG A; 1VYV A; 3MP1 A; 2A3L A; 1YJW T; 4FSX A; 1GFC A; 3EFO B; 1BCM A; 4HA8 A; 4M7A B; 1OEB A; 2QGF B; 4OMM A; 2I0N A; 5LJ5 d; 4EIK A; 5CKD A; 1RAA B; 2FG0 A; 3HP9 A; 2KBT A; 1NJI R; 2ATC B; 3HTR A; 2B8A A; 1JJ2 S; 4JJN K; 3ZFJ A; 3GP8 A; 3VRZ A; 2EYX A; 3PNW C; 4MDX A; 2DO3 A; 2LCL A; 2CSQ A; 4BAC A; 5FW9 A; 2RHI A; 3EG1 A; 3PTA A; 3PMT A; 3JB9 I; 3M0R A; 1ZSZ B; 1ZUY A; 1UGP B; 3PE0 A; 4M78 C; 1TSF A; 2OTL A; 2HEQ A; 2G6F X; 1TU0 B; 4C0F A; 1G3T A; 3OS5 A; 4XK8 E; 5L23 A; 4GBQ A; 3KUF A; 3MKD A; 2E3H A; 1VQP A; 2YUO A; 3QWY A; 3H9N A; 4JRP A; 3M55 A; 2AKL A; 3SDZ A; 4WF2 A; 3CXC S; 1BU1 A; 1JXM A; 2GQV A; 1S1N A; 2CP2 A; 1VQ8 A; 3IQL A; 2LX7 A; 1Q86 C; 2RK2 A; 4M77 A; 4KGZ B; 4B6M A; 2P0Q A; 4D6W A; 3TEE A; 2E4H A; 1GRI A; 3EG2 A; 2CSI A; 4LDW A; 3HRU A; 1B7T A; 3OYD A; 2RJD A; 4XTW A; 2D6F A; 4C92 D; 4B9X A; 1PC0 A; 1QKW A; 3WXM B; 4C8Q G; 4IUU A; 2JMC A; 4UC4 A; 1RI9 A; 4XTU A; 5KYY B; 2QI2 A; 2HQX A; 2P4R A; 3CME A; 1RAC B; 1QVG S; 2AZS A; 2DL3 A; 2NUT B; 1AVZ C; 2E41 A; 3EH1 A; 3PGG A; 1S72 A; 4Z88 A; 2E10 A; 5DLO A; 1YIJ A; 2YUN A; 5CO7 A; 1JXO A; 2V1R A; 2RH2 A; 1K73 U; 2CP0 A; 2QEX A; 4PJO D; 3CCV T; 3G71 A; 4FYY B; 3CC2 T; 1UTI A; 5KYU A; 1VA7 A; 3EGD A; 5KYX A; 2P84 A; 2CYZ B; 1QVF S; 3G6E T; 4OGE A; 3AT1 B; 4C0D C; 1SKU B; 4N4G A; 2FEI A; 4E7I A; 2M9U A; 2RN8 A; 2DPP B; 1UJY A; 2VGN A; 4EMK B; 4M7D E; 2EPD A; 4MML A; 3L1A A; 4RG8 A; 4IUV A; 2JXB A; 1YHQ A; 2FB7 A; 1YJ9 T; 1Y96 B; 4CC7 A; 3LGF A; 2DMO A; 1G3S A; 1NYG A; 4CC3 A; 1X69 A; 1KD1 R; 3CXC A; 1YWO A; 2ROL A; 2IG0 A; 1PKS A; 1GXI E; 5FU6 B; 1N8R U; 2MCN A; 3C0C A; 4LDY A; 5GAM f; 3CCV Q; 2PU9 B; 3CC2 Q; 2FHD A; 1KHI A; 3MP6 A; 2DX1 A; 1EFN A; 1FXX A; 1SEM A; 1IXD A; 5HCK A; 4M78 F; 1X2K A; 1XJW B; 4KUI A; 3G6E Q; 2LCS A; 1KQ2 A; 4C0G A; 2D8H A; 4C8Q B; 2ZCF B; 1M1F A; 5I2S A; 1WX6 A; 3DB4 A; 4F7U F; 2DXT A; 3DLM A; 1M9S A; 2RQW A; 2EYZ A; 2EYW A; 3RMS A; 2CT4 A; 1WDX A; 3O8V A; 4DQ2 A; 1QVG A; 1TUC A; 5DY9 A; 2COW A; 1YJ9 Q; 3C12 A; 1UEB A; 3G4S T; 1HK9 A; 2XDD A; 1KFZ A; 2VXE A; 1RAD B; 1JRI A; 1MND A; 1K0S A; 2RMO A; 4PFO A; 2CH4 A; 2FL7 A; 2HKN A; 2ECZ A; 4XU1 A; 5GAO r; 4E6R A; 4RCB A; 3M0T A; 1QP3 A; 2R5A A; 5LJ5 f; 4AG1 C; 4AFQ C; 5FLX E; 4RTZ A; 4J9F A; 2H3J A; 2LVM A; 4M75 A; 1AWJ A; 4DOW A; 1ZUU A; 1SRL A; 3THK A; 3V7C A; 1YCY A; 1O9S A; 2ZGW A; 3SHW A; 4M77 E; 2GFU A; 4AFS C; 1D09 B; 2KQW A; 3H6Z A; 4E7K A; 2LZ6 B; 5HY6 A; 4J6X A; 3G4S Q; 1YP5 A; 2RHZ A; 1TXQ A; 1KC8 R; 1M2V B; 3VS5 A; 1FYN A; 2A37 A; 5FRO A; 4DEX A; 3CC4 T; 2ENM A; 4ANJ A; 4HVW A; 2E65 A; 3P8H A; 2D0Q B; 2O88 A; 2YRC A; 1YFN A; 4QVZ A; 2RI5 A; 3DLL A; 4FYV B; 1VQN T; 3CPW P; 2M1H A; 3CCJ A; 4HT8 A; 4M7A D; 1IRX A; 3FB9 A; 3VS1 A; 2HMA A; 2Y4X A; 4F7U G; 4FU6 A; 1U3O A; 2BZY A; 3QDR B; 5FWB A; 1JU5 C; 4FT2 A; 1OUL A; 4RTX A; 1B34 A; 2JNG A; 1KIK A; 4E7Z A; 2EQU A; 3GIB A; 1YJN A; 2EQM A; 4E47 A; 1WJS A; 2YUQ A; 3CC4 Q; 3EG9 B; 1PCX A; 5GAO l; 3X25 B; 2E70 A; 2WSE E; 1D3B B; 3ASK A; 1NLO C; 3JAM E; 5GMK h; 5CKF A; 2K7A A; 1W70 A; 1VQN Q; 2KT8 A; 2BE7 D; 2X3X D; 2QGG A; 2R5M A; 3E9G A; 3CC2 A; 1BI2 A; 2IIM A; 1MV3 A; 4JRI A; 1OZ3 A; 4ZTF A; 2WSF E; 3E2U A; 5KCH A; 3QJ6 A; 3EFO A; 3G6E A; 2CUD A; 3UPU A; 2K57 A; 2JM9 A; 1ABQ A; 2QK0 A; 1H8K A; 1X2Q A; 4JLI A; 1E6H A; 1WZO A; 1IGU A; 3CCS A; 1RAI B; 1W6X A; 1UB4 A; 4XAX B; 2FYK A; 2VKN A; 4PJO G; 3CQT A; 3V7S A; 2K2M A; 3M57 A; 1PD0 A; 2JZ2 A; 5C0M A; 2KRN A; 1BI3 A; 3KBG A; 1G2B A; 2HSP A; 1I5O B; 3J7A F; 3R6O A; 3JCM c; 2AIR B; 3LYI A; 4QQD A; 3RKY A; 1ZSZ A; 1U1T A; 4LDU A; 3VUZ A; 4P5N A; 2J05 A; 1YI2 T; 1K9A A; 2CKK A; 4F7U B; 3RER A; 3I56 A; 2NLU A; 2JJ9 A; 2M0Y A; 2DIL A; 2KXD A; 1K9M R; 3OYF A; 1KD1 U; 2YLC A; 3NHN A; 1Q7Y R; 2B86 A; 4BE0 A; 2EJF A; 4IUP A; 4M75 E; 2A28 A; 1X43 A; 1LPL A; 2RJF A; 4C0Z A; 2JS2 A; 3G4S A; 2FPF A; 3D7S B; 4HT9 A; 2E1H A; 3V8J A; 3A5Z B; 2DTI A; 3L42 A; 3QDF A; 3TSW A; 3OYA A; 3PFS A; 3H0I A; 2FRY A; 4TVR A; 3HL8 A; 1M2O A; 3CPW A; 1YI2 Q; 3U23 A; 5M9O A; 2D0N A; 3CMA T; 3QG1 A; 2SRC A; 3REA B; 2DRM A; 4X9D A; 1WXT A; 2NUT A; 5KYN A; 1PM3 A; 2DTH A; 2BZX A; 3SB2 A; 5GAM j; 5GAM g; 3OYJ A; 4IUT A; 4PJO B; 1I8F A; 2VGM A; 1H3H A; 4PK4 A; 1VQP T; 4X1V A; 3NTI A; 2K5I A; 2XIC A; 1MMG A; 4C0D B; 1FWZ A; 2KDS A; 2CZ6 B; 2MIO A; 3QZ5 B; 3CC4 A; 2BKD N; 1DJ7 B; 1UUE A; 3NPF A; 1I81 A; 4FYW B; 2QQA A; 5D6W A; 3SWN C; 1WLP B; 2XI9 A; 4EMK A; 3L2Z A; 3X20 B; 1VQN A; 3CMA Q; 2JMA A; 2VB6 A; 2L8D A; 2LP5 A; 4C5G A; 1KC8 U; 1U1S A; 1Y96 A; 1YWP A; 2F5T X; 3LH5 A; 2JM8 A; 1WGS A; 1AWX A; 2DIG A; 2AHJ B; 3CME T; 1VQP Q; 5C6S A; 1T0J A; 5LJ5 j; 4DEY A; 5LJ5 g; 1QQJ A; 3EGX B; 1S72 T; 2M51 A; 1YIJ T; 4O6J A; 1K8A R; 1VQO A; 4WCI A; 4BI3 A; 1Q82 U; 2HSE B; 3SD4 A; 4C8Q A; 1V29 B; 4OB0 B; 2QEX T; 3G71 T; 3GBQ A; 1ARK A; 4A4F A; 3FRN A; 5KH6 A; 3PVQ A; 4NS5 A; 2ESW A; 2PTK A; 2FZG B; 1GCQ C; 4EDU A; 2AKK A; 3QO3 A; 5GMK i; 4M7D C; 4J9C A; 3CME Q; 4CI0 C; 2F2V A; 1BI0 A; 1YHQ T; 2JW4 A; 1QWF A; 1S72 Q; 2YSQ A; 3JRZ A; 2VWF A; 3M0U A; 2OTJ A; 2IVW A; 2VUB A; 2KMT A; 4J7I A; 2EJG A; 4LUD A; 1T3S A; 1YIJ Q; 4PL6 A; 4PJN A; 3VS3 A; 4E7H A; 1M30 A; 2QEX Q; 1K73 C; 3G71 Q; 4QW2 A; 3BE3 A; 4F04 B; 1HSQ A; 2JTM A; 1WA7 A; 3OSV A; 4JPB W; 4ATO A; 2AK5 A; 4F16 A; 5FWC A; 4NL3 A; 4RTV A; 5GAN 4; 1GFD A; 3JCM e; 1WIE A; 1XTD A; 5IHN A; 2P0P A; 1PNJ A; 5I2M A; 4IUR A; 2OAU A; 2DZ9 A; 2FO0 A; 2OJ2 A; 3SFM A; 1YHQ Q; 4MZP A; 2GF7 A; 3KXT A; 2COY A; 3OYY A; 5DM7 R; 4D8D A; 4N4H A; 5A2Q E; 5KCO A; 2SEM A; 2YXY A; 1N8R C; 3OYH A; 2KVQ G; 2DIQ A; 4L6V 5; 4N4I A; 4A4G A; 1QMC A; 1Q7Y U; 3OS1 A; 2DYB A; 2HD0 A; 4OML A; 4BE1 A; 2RA2 A; 4JS4 A; 1BK2 A; 3CMA A; 3C95 A; 4CC2 A; 1NEG A; 2L89 A; 1BYM A; 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