The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
74
|
structure length |
74
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Chain Sequence |
GSSGSSGVENLKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSESGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Endocytosis/exocytosis
|
| molecule keywords |
Intersectin 2
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| publication title |
Solution structure of the second SH3 domain of human intersectin 2 (KIAA1256)
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
11
|
| structure length |
74
|
| sequence length |
74
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-02-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YWP A; 3VS0 A; 2JTE A; 1HJD A; 3EG1 A; 2EYX A; 1NEB A; 1SPK A; 2KE9 A; 1K9A A; 5ECA A; 1K0X A; 1AWX A; 4OMN A; 4J9G A; 3UF4 A; 2VVK A; 3M0S A; 3M0T A; 1WYX A; 1UFF A; 1ZUK A; 2LJ0 A; 1SHF A; 3FJ5 A; 2A28 A; 1K0S A; 3SEM A; 1UGV A; 1GBR A; 2M0Y A; 4RTY A; 2DRK A; 2L0A A; 1MV0 B; 2DL4 A; 2MOX A; 3M0R A; 1PRM C; 4X1V A; 1X2Q A; 2RQW A; 3I9Q A; 1T0J A; 3NMZ C; 1SRM A; 1E7O A; 2GTO A; 2SRC A; 2MIO A; 2K7A A; 2CUB A; 1U5S A; 1Y0M A; 4A63 B; 2D1X A; 1JU5 C; 2KNB B; 2D8H A; 2AK5 A; 1WI7 A; 3O5Z A; 3EG3 A; 1B3Q A; 2ED1 A; 1SEM A; 1Z9Z A; 2NUZ A; 3H0F A; 1U06 A; 5GJV B; 3NPF A; 4AFU C; 1NG2 A; 4CC7 A; 2K9G A; 1YP5 A; 2DBM A; 3M0U A; 2O88 A; 2RMO A; 1WXU A; 1E6H A; 2IIM A; 2KRM A; 2XMF A; 4KRT A; 1B07 A; 4E6R A; 2C0O A; 4LUE A; 1JEG A; 2FPD A; 1OV3 A; 1UJ0 A; 2EPD A; 1X27 A; 1JXO A; 2AZS A; 1M3A A; 4ESR A; 3EHR A; 2O31 A; 1ABQ A; 2RQU A; 2BZX A; 1OPL A; 4HVW A; 2SEM A; 1I07 A; 1BB9 A; 1IO6 A; 2EYW A; 3VS3 A; 1T0H A; 2J6O A; 2H8H A; 1WLP B; 4JJD A; 1I1J A; 3H0H A; 2KEA A; 2W10 A; 4RTW A; 4J9C A; 2O9V A; 1AWO A; 1M8M A; 1FMK A; 2JMC A; 2O2O A; 5IXF A; 2RQR A; 2EKH A; 2DM1 A; 3M0P A; 1S1N A; 1W1F A; 1M30 A; 5IXB A; 2G6F X; 2DBK A; 2DA9 A; 3EG0 A; 1K4U S; 2FRY A; 3RNJ A; 1GBQ A; 1E6G A; 3REB B; 3JV3 A; 2E5K A; 2HEQ A; 4JJC A; 1W70 A; 5I11 A; 4Z88 A; 4Z89 A; 3LH5 A; 2C0I A; 2ABL A; 4RTT A; 4OMO A; 2X3X D; 4AFQ C; 1VYU A; 2F2W A; 1WXB A; 1AEY A; 2KRO A; 1X6G A; 2OI3 A; 3EG2 A; 1SHG A; 1Z9Q A; 1GFD A; 1AWJ A; 1T3L A; 2L3S A; 5GJW B; 1TUD A; 4Y92 A; 4GLM A; 2F2X A; 3H0I A; 1NYF A; 2JM8 A; 1UG1 A; 2KXC A; 1KFZ A; 4RUG A; 2P4R A; 2JXB A; 2HCK A; 1X6B A; 4IIM A; 3THK A; 2EGE A; 3VS7 A; 4J9I A; 4OMP A; 2CH4 A; 1ZX6 A; 2LP5 A; 2LQW A; 2CH4 W; 2CRE A; 2RF0 A; 2X3W D; 1BBZ A; 4JPB W; 1H8K A; 1JQQ A; 2JT4 A; 1M3C A; 4F17 A; 2K79 A; 2EVR A; 5FW9 A; 2HBW A; 1YWO A; 3NHN A; 3U23 A; 1GFC A; 1UEC A; 2EBP A; 4OMM A; 2MCN A; 3TSZ A; 2F2V A; 2YUQ A; 5FWB A; 2PNI A; 2DE0 X; 1V1C A; 4JZ3 A; 2D0N A; 3PVL A; 1NLP C; 2K6D A; 3IQL A; 1EFN A; 2BTT A; 2ROT A; 2KGT A; 2I0N A; 1OEB A; 3UA6 A; 2YSQ A; 1ZLM A; 2K3B A; 1OOT A; 2FG0 A; 4AG2 C; 2DMO A; 2PZ1 A; 4J9D A; 2EYY A; 4LN2 A; 5IHN A; 2ESW A; 2EQI A; 1PRL C; 1OPK A; 1KSW A; 3UAT A; 2LQN A; 1HSQ A; 5I22 A; 1NEG A; 1AOJ A; 1NLO C; 2OAW A; 1RUW A; 2GQI A; 2ED0 A; 2KYB A; 2DIL A; 2GBQ A; 2KRS A; 5L23 A; 2LCS A; 4F16 A; 2A36 A; 4LNP A; 1UHC A; 2EGC A; 2D8J A; 1RLP C; 1AZG B; 4LUD A; 2JM9 A; 2RN8 A; 1UJY A; 1MUZ A; 4M4Z A; 2KRN A; 2OJ2 A; 2LNH B; 2FRW A; 2EGA A; 2JMA A; 4D8D A; 5IHK A; 4RTV A; 1CKB A; 3VS1 A; 2BZY A; 4CC2 A; 2RQV A; 1VA7 A; 2CT4 A; 1ABO A; 3VS5 A; 1RLQ C; 1SRL A; 1SSH A; 1GCQ A; 1PWT A; 3TSW A; 2CSQ A; 3C0C A; 2QDL A; 1MV3 A; 1QKX A; 2L3Q A; 4Z8A A; 2LX7 A; 2DX1 A; 1ZSG A; 2A08 A; 3GBQ A; 1AZE A; 1PNJ A; 1ZBJ A; 4OML A; 4AG1 C; 3VRY A; 2DRM A; 1NYG A; 1RI9 A; 2JW4 A; 1AWW A; 1VYT A; 4HXJ A; 3ZL7 C; 2J7I A; 2CT3 A; 1UUE A; 2VKN A; 5FWC A; 1QWE A; 1PHT A; 2V1Q A; 4EIK A; 2CUD A; 2KT8 A; 2JS0 A; 5IH2 A; 1WXT A; 2KBT A; 3A98 A; 1X43 A; 4HVV A; 1JO8 A; 2M51 A; 4QT7 A; 2DVJ A; 1HD3 A; 4J9E A; 3VS4 A; 3PVQ A; 1PKS A; 2BZ8 A; 3H41 A; 2KR3 A; 4WCI A; 3TVT A; 3EHQ A; 1GRI A; 2FPF A; 4K11 A; 4IIO A; 2FPE A; 1Y57 A; 2DJQ A; 4DEY A; 1T3S A; 2W0Z A; 2L3P A; 1K76 A; 3VS2 A; 4AFZ C; 1AD5 A; 3PE0 A; 1K1Z A; 2DYB A; 2GTJ A; 4R0K A; 1FYN A; 2YDL A; 1X2K A; 4RTU A; 3SHW A; 1TG0 A; 2J6F A; 3I5R A; 2KXD A; 1ZUY A; 3CQT A; 1U3O A; 3EGU A; 4ZNX A; 1M3B A; 2ECZ A; 2HDA A; 2KYM A; 3KFV A; 2DL7 A; 1XOV A; 1WDX A; 2VWF A; 1YN8 A; 1KJW A; 2ENM A; 4J9B A; 4CC3 A; 3UA7 A; 3VRZ A; 2AZV A; 1CKA A; 2AKK A; 4RTX A; 1GL5 A; 1W6X A; 2RQT A; 1UHF A; 2PTK A; 1NM7 A; 2HSP A; 1H3H A; 2V1R A; 1GCQ C; 2EW3 A; 2J6K A; 2J05 A; 2YUP A; 2CDT A; 1J3T A; 2LMJ A; 2A37 A; 3NGP A; 3REA B; 5EC7 A; 1QLY A; 2YUN A; 1WX6 A; 4CC4 B; 4DEX A; 1QWF A; 2DL5 A; 2GGR A; 2FO0 A; 1PKT A; 2YUO A; 1A0N B; 4HVU A; 2C0T A; 3RBB B; 2DNU A; 1QKW A; 1UE9 A; 2L2P A; 1AVZ C; 1LCK A; 2DL8 A; 1VYV A; 1QCF A; 1WA7 A; 3ULR B; 2DL3 A; 2CSI A; 4HCK A; 4OMQ A; 2K2M A; 3R6N A; 3QWY A; 1ARK A; 1G83 A; 2LJ1 A; 1X69 A; 4J9H A; 2ROL A; 3M0Q A; 1ZUU A; 5IHI A; 4F14 A; 4D8K A; 4RTZ A; 2DF6 A; 2JS2 A; 1GCP A; 1WIE A; 2KT1 A; 1YNZ A; 1G2B A; 4ORZ A; 3I5S A; 1TUC A; 1M27 C; 2O9S A; 4GBQ A; 4JZ4 A; 2NWM A; 5HCK A; 2DLP A; 3VS6 A; 2EYZ A; 2RNA A; 1WFW A; 2FEI A; 1KIK A; 4LE9 A; 2LZ6 B; 1I0C A; 1JXM A; 2RPN A; 1CSK A; 2J06 A; 1UDL A; 4JJB A; 1N5Z A; 2YT6 A; 4FSS A; 2AKL A; 3QWX X; 3I35 A; 4AFS C; 1YCS B; 2B86 A; 1BU1 A; 1H92 A; 1UTI A; 2GNC A; 2LJ3 A; 1BK2 A; 4J9F A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5FRM A; 2JTE A; 1YIJ T; 4X9C A; 2RHU A; 3EG1 A; 2ZPE B; 4FYY B; 2JJ9 A; 1SPK A; 1WZO A; 3M57 A; 1WQ7 A; 2M1H A; 3CCE T; 4XQ3 A; 1WJR A; 2HQX A; 5CKE A; 2VVK A; 3G6E T; 3ZBD A; 3CME A; 1G5V A; 3OS1 A; 4KBM B; 2VAS A; 1WYX A; 1QP3 A; 1U8R A; 4FW1 A; 4RKU E; 3CCM Q; 1VQM Q; 4C5G A; 3BE3 A; 2PU9 B; 3SEM A; 4RTY A; 2L0A A; 4JRI A; 3V7R A; 1W2B P; 1W2B A; 2QQ9 A; 5EG2 A; 1YIT Q; 3CC7 T; 3NMZ C; 1Q81 C; 9ATC B; 3CPW S; 4LD9 K; 2HZY A; 1U5S A; 1Y0M A; 2Y4Y A; 3EFS A; 2D1X A; 1JU5 C; 4ZTF A; 2D8H A; 1RAF B; 4M78 C; 4N4H A; 1M1G A; 1YIJ Q; 3CCU T; 1Z9Z A; 3NTI A; 3UT1 A; 4QQG A; 4LDU A; 5AYF A; 2DBM A; 2DET A; 2O88 A; 2RMO A; 1WXU A; 1E6H A; 2KRM A; 4XTU A; 2XMF A; 4KRT A; 3MEW A; 1B07 A; 1VIE A; 1VUB A; 4E7H A; 2C0O A; 5D7U A; 4LUE A; 3A8M B; 1JRI A; 1X27 A; 1JXO A; 2AZS A; 3M9Q A; 1M3A A; 4NS5 A; 2MYS A; 1ABQ A; 3QZ9 B; 1TXQ A; 4HVW A; 1OI1 A; 2EYW A; 4FM4 B; 2RA2 A; 3TQ7 P; 4Y28 E; 4GLK A; 4F04 B; 4BY6 C; 4C8Q E; 1IHW A; 1VQ5 Q; 4E7I A; 4PJJ A; 4J9C A; 2O9V A; 2QEX Q; 1JJ2 P; 1VQ7 A; 4DBF A; 2JMC A; 2GF7 A; 5IXF A; 1JJ2 A; 3HFN A; 4DOV A; 1FMW A; 5GAN 4; 1V76 A; 5KYU B; 1W1F A; 2JVV A; 5IXB A; 4C8Q G; 5GAN g; 3OYG A; 1VIF A; 4DBH A; 1R0C B; 1HYO A; 3LGL A; 4XTX A; 3OYA A; 2VGN A; 3OB9 A; 5GAN 5; 1W70 A; 1C1A A; 4OB2 B; 4R55 A; 5I2M A; 1RAA B; 5CO7 A; 3LH5 A; 2ABL A; 2QXF A; 1VYU A; 2F2W A; 2RK1 A; 1WXB A; 1BCM A; 2F5K A; 2KRO A; 5KYY A; 4BE2 A; 1IRX A; 3G4S A; 2P4T A; 4EMG A; 2LNV A; 3OYM A; 2L3S A; 2K4Y A; 2BIV A; 1KC8 C; 2R58 A; 2E3I A; 3ER0 A; 4GLM A; 3GOX A; 3H0I A; 1D1A A; 3OW2 A; 2DXU A; 1NYF A; 4IUR A; 5KYX B; 5DY9 A; 2KXC A; 1NBE B; 3CCJ T; 4JRP A; 3V8J A; 2JXB A; 1UEB A; 2HBP A; 2EQU A; 4IIM A; 3CC7 A; 4A4H A; 1M1K U; 3H8Z A; 2DTH A; 1M2V A; 3CC2 Q; 1YJN Q; 1KK7 A; 3J81 E; 4RG8 A; 2RF0 A; 4M7A A; 2EQK A; 2ZAE A; 2YHT A; 4PKC C; 2QAS A; 5LJ5 f; 3CCU A; 1KQ2 A; 3EFR A; 1M3C A; 1MMA A; 3RMS A; 4E2F B; 3U23 A; 2JOY A; 2B8A A; 3PMT A; 1OX9 A; 2HL5 C; 3X24 B; 2O4X A; 3KUF A; 2YUQ A; 2X51 A; 1VQ6 T; 2CZ7 B; 4C92 B; 3JCM Q; 4JZ3 A; 3RUX A; 2K6D A; 4E7Z A; 1YBY A; 2ROT A; 1MNE A; 4EMK C; 4J5Y A; 2DMO A; 2PZ1 A; 2BE9 B; 2EYY A; 1ZA1 B; 1RL2 A; 1PRL C; 5GAN f; 2PVG B; 4C0Z A; 3CPF A; 3E9F A; 3L2W A; 1NLO C; 1DJ7 B; 2OAW A; 1RUW A; 2GQI A; 1Y71 A; 5C6S A; 1QVP A; 5KYW B; 1N9S A; 4LNP A; 5GAN j; 1UHC A; 3FDR A; 2CP0 A; 2KQW A; 1YI2 T; 1AZG B; 2JM9 A; 3EH1 A; 4M78 D; 3G71 A; 4JRQ A; 1B7T A; 1VQ6 Q; 2EGA A; 1VQN Q; 4D8D A; 3BW1 A; 4C8Q A; 2XHC A; 1CKB A; 3UPU A; 2MWP A; 4QQD A; 1M90 R; 2RQV A; 1VA7 A; 5GAO r; 1ABO A; 2K57 A; 3CBP A; 3SDZ A; 2HAX A; 2E6Z A; 1PWT A; 4IKF A; 3C0C A; 1I4K 1; 2XD0 A; 3OA6 A; 2A08 A; 2RD1 A; 1WHJ A; 4Q5W A; 4AG1 C; 1NYG A; 4KUD K; 4IUQ A; 2J7I A; 4M7D B; 1D09 B; 1ZHI A; 3C95 A; 1YI2 Q; 1NJI U; 1PHT A; 4EIK A; 2CUD A; 2KT8 A; 1WXT A; 1KQS A; 1X43 A; 1IXD A; 4ZGD B; 2M9U A; 2K3X A; 4QT7 A; 1HD3 A; 4LDY A; 3P8H A; 3OBY A; 1PKS A; 3QBY A; 2KR3 A; 4WCI A; 1YJ9 Q; 1KD1 C; 1MHN A; 3OS2 A; 4DEY A; 3OYH A; 3CCL T; 1K76 A; 3VS2 A; 3VU3 C; 2QQR A; 1BI1 A; 2RI5 A; 3SHW A; 2RH2 A; 5GAN 8; 2DD4 A; 1XNI A; 2KXD A; 4PJO B; 3MEA A; 2LTO A; 2EAY A; 3CQT A; 3QUI A; 1TOV A; 5A0G A; 4M77 C; 5J26 A; 2YRD A; 1EIF A; 1WDX A; 2ZCF B; 2ENM A; 3BDU A; 4CC3 A; 2AZV A; 5D6W A; 4RTX A; 2RQT A; 2H3J A; 1UHF A; 2PTK A; 3S3N A; 2NUT B; 4OB3 B; 2KDS A; 1H3H A; 3CCS A; 3EAE A; 1GCQ C; 2J6K A; 3TRE A; 2CDT A; 2DZC A; 3EFO B; 1J3T A; 3JCM X; 3NGP A; 2YUN A; 4DEX A; 3QSU A; 1QCO A; 2DL5 A; 4EDU A; 3HHT B; 1PKT A; 1A0N B; 4D6W A; 5GAM g; 1QKW A; 1UE9 A; 1UGP B; 2CGH A; 1AVZ C; 4M7A F; 1LCK A; 1VYV A; 1K73 R; 1YHQ A; 4OMQ A; 3HSB A; 4BB7 A; 2DAQ A; 3PT9 A; 5CKF A; 2CP5 A; 3MEV A; 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2ED1 A; 1R8O B; 1SEM A; 4PJL A; 4E7L A; 3QKJ A; 2H3E B; 2NUZ A; 1U06 A; 1G3W A; 1HXD A; 3X20 B; 4CC7 A; 2K9G A; 3WVE B; 1N8R R; 2XDP A; 2EWN A; 2ZZD A; 3L2U A; 5GAM j; 3OYL A; 4FCY A; 4KGX B; 1JEG A; 1N27 A; 3JB9 F; 1D3B B; 1UJ0 A; 3SWN C; 1SF9 A; 6AT1 B; 5GAN 3; 2FL7 A; 3CMA Q; 3VUB A; 3RDV A; 1OPL A; 3CME Q; 1VQ4 A; 4BY6 B; 3A5Z B; 4FYV B; 2J6O A; 2WSE E; 2QG9 B; 1D1B A; 2OX7 A; 1ZSZ C; 4FSX A; 1TTH B; 4RTW A; 4FU6 A; 3EGX B; 4HA8 A; 1TWB A; 3LLR A; 3JCM b; 1FMK A; 3I55 Q; 3G7Z A; 2DM1 A; 3M0P A; 2A7Y A; 3E19 A; 2PUO B; 1YJW A; 2DYI A; 2DBK A; 2G6F X; 1VQ7 T; 3EG0 A; 4M75 A; 1TUG B; 2FRY A; 1E6G A; 2FZC B; 2E5K A; 2HEQ A; 4JJC A; 4IUP A; 2EFI A; 4ATO A; 4Z88 A; 3MHX A; 3HKS A; 2C0I A; 4DBR A; 4RTT A; 1EZZ B; 2RJE A; 5DLO A; 3I56 T; 2ZPG B; 5D6X A; 2DFU A; 1AEY A; 3EG2 A; 2JNG A; 4EPC A; 3QDF A; 1BYM A; 2IVW A; 1GFD A; 1AWJ A; 3EFO A; 2QQS A; 1TUD A; 4Y92 A; 4ANJ A; 2NUP A; 4KH1 B; 3G4S T; 2F2X A; 4VUB A; 4FL6 A; 3D7S B; 1Y07 A; 2L5Q A; 5CIU A; 4M7A E; 2VXE A; 2DZ9 A; 2QQB A; 2A0F B; 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