4H34A

Crystal structure of the tyrosine phosphatase shp-2 with q506p mutation
Total Genus 150
50100150200250300350400450020406080100120140
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
534
structure length
486
Chain Sequence
RRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHSDYINANIIMPEFKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVPTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQKSKR
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS10 (167-175)S1 (28-33)TI1 (4-7)TIV1 (8-11)AH1 (13-23)S3 (50-58)TII1 (25-28)S2 (41-47)TIV2 (37-40)TI2 (34-37)TVIII1 (35-38)TIV3 (46-49)S4 (63-65)S23 (455-458)TIV14 (459-462)AH5 (225-256)TII2 (65-68)S5 (70-71)S6 (100-101)S15 (221-222)TI3 (107-110)TI4 (110-113)TII3 (131-134)S7 (113-115)TIV5 (114-117)AH3 (119-129)TI5 (140-143)S8 (134-139)TIV6 (152-166)S9 (147-152)TII4 (143-146)TIV10 (180-183)TIV8 (174-177)S12 (202-203)AH7 (432-448)O2 (209-211)TI6 (204-207)S13 (209-210)S14 (214-215)TI7 (217-220)AH8 (463-482)TIV11 (222-225)TI14 (285-288)TIV13 (449-452)TI9 (266-269)TI10 (267-270)3H1 (258-260)TI8 (265-268)TIV12 (292-303)TVIII3 (277-280)TI11 (270-273)3H2 (274-276)S20 (383-392)TII6 (405-408)TI13 (279-282)TI15 (286-289)O3 (305-307)S21 (396-405)S16 (307-310)S22 (413-420)S17 (327-330)TI16 (334-337)AH6 (337-348)TVIII5 (429-432)TI19 (409-412)TVIII4 (424-427)TIV4 (59-62)AH2 (74-82)S11 (178-180)AH4 (190-199)TI18 (408-411)TII'1 (380-383)TI17 (393-396)TVIII6 (483-486)S18 (352-355)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with Q506P mutation
rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
total genus 150
structure length 486
sequence length 534
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2012-09-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4h34A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4h34A02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4h34A03
2NTAA 3QCBA 4RI4A 3VS3A 1SHDA 5EG3B 1D5RA 2F46A 4GWFA 1O42A 2HDVA 4H34A 4GE2A 2HXPA 1JYQA 5I6VA 2B4UA 5DF6A 2A3KA 2ZN7A 1NWLA 3M4UA 2EU0A 3VRYA 5AULA 1A81A 4OHHA 2QBRA 1A1EA 3KFJA 1GRIA 3EB1A 2I3UA 2EO6A 1FPZA 3AWFA 1JU5A 1O4JA 1WQUA 2PLEA 2DLYA 4AZ1A 4JNBA 1F2FA 2HCMA 3RZ2A 2B3OA 3S4OA 3ZM0A 2JYQA 2PLDA 4J51A 3RO1A 2H46E 4XZ0A 1Z3KA 2Y1NA 4NWGA 2BZLA 5HKYA 2CMCA 1NZLA 1UUSA 4FL2A 5HDEA 2QCJA 3OB2B 4QAPA 3RGQA 2MK2A 3V0JA 1YGRA 2F71A 5AWXA 2EKXA 2P6XA 2HCKA 1YVHA 2F70A 5K24A 2LQWA 3EACA 1OPLA 1ONYA 3CD3A 1YFOA 4GL9E 1O4GA 2L3TA 2QBSA 3ZMPA 1OHDA 2I6PA 1AYCA 1RJAA 1O41A 1TZEE 1A5YA 3N84A 3VS4A 1LKKA 3BLTA 5K9WA 1FU6A 5KAZA 4PYHA 1OETA 2F6FA 2FJNA 2CNEA 2B4OA 2F6YA 1AYAA 4S0GA 3HIZB 3EU0A 5KAAA 4GFUA 2NLKA 3SR9A 2B07A 2I6IA 1A07A 3I36A 2PTKA 4E68A 3QCDA 3PQZA 5CDWA 1BZCA 3V0GA 3VGOA 1O4HA 4K2RA 2QBQA 3EAXA 2BGDA 2SRCA 4D3QA 1PA9A 1PA1A 2PQ5A 3VS1A 1GHUA 1HCTB 1IJRA 1O43A 3CBLA 2BIJA 4FBNA 3O4SA 1R6HA 2GJTA 3BLUA 3MOZA 3PLFB 1QCFA 3QCLA 4D3PA 1O4AA 2CIAA 1B47A 1NWEA 5GJHA 1V3AA 3S3EA 3D1HA 3D42A 3GXHA 2CS0A 3BUWB 2DCRA 2ZMMA 1WCHA 4R30A 1FHSA 1KSWA 5EEQA 4RDDA 3CM3A 4K11A 3I80A 2CFVA 3V0HA 1GWZA 1AOUF 2QDCA 4OHEA 1AD5A 3BRHA 2Y3AB 4ERCA 4GE6A 2CI9A 1YWFA 1JYRA 2KNOA 1O4RA 4D8KA 4GFVA 3D44A 2QDPA 1D1ZA 4L1BB 3OVEA 2A8BA 2VEWA 3D1OA 2BBUA 5K23A 1KAKA 3O4UA 1LUKA 2EYVA 1XRIA 2J16A 4GS0A 1O46A 1YPTA 3QCNA 1O4NA 2RORA 1X0NA 2AOAA 4JGHA 3S9KA 3SMEA 3AWEA 2CJZA 5KA9A 2ESBA 1M27A 1O45A 1QZ0A 2PNBA 2OZOA 2HC2A 1BFJA 2OUDA 3F9AA 2I6JA 5KA1A 1O4EA 1FBVA 4DGXA 1YGUA 5KA2A 1G7FA 3HHMB 1H9OA 2GSBA 2BV5A 1BLJA 4X6SA 5BX1A 1BHHA 3ZM1A 3VS0A 2Q47A 3CWGA 3EAZA 3VRPA 4TVVA 1C85A 2B49A 3F81A 1G4WR 4U17A 3QWXX 1G7GA 3QCJA 2E0TA 1YZ4A 4A4BA 4Y2EA 3H2XA 1O44A 3O4TA 1A1CA 1BG1A 2QCTA 1Q6JA 2VEYA 1ZCKA 5KACA 4QBWA 1LYVA 3S4EA 2AOBA 3CWEA 3CXLA 2C46A 3PSKA 4WTYA 2OOQA 3OMHA 2ABLA 3QCIA 2IUHA 4LUDA 2ETZA 5K22A 5K25A 3UYOA 2QMSA 5KA0A 4IKCA 2CRHA 1ZFPE 1O4MA 1I3ZA 4OHDA 3MXCA 2PBNA 2LQNA 1J4XA 2YSXA 1O49A 2IMGA 4R0SA 1Q6MA 1X24A 4EIHA 1BLKA 1OEUA 2NT2A 3S8OA 3OLRA 1D4TA 1EENA 2CR4A 3MMJA 2YDUA 1OHEA 3GXGA 1R1QA 2K79B 1NZ7A 2EO3A 4RKKA 1WRMA 3QCGA 2DVJA 4QSYA 1LQFA 3ZV2A 2LCTA 3QCKA 2NV5A 1A08A 4B04A 4WU3A 2M3VA 2C0OA 2QEPA 4PVGA 3V0EA 3B7OA 1O4BA 3O3LA 2Q05A 4KYQA 3PFVA 4D3RA 4GPLB 1YVLA 3ZMQA 4E93A 1XXVA 3F99A 4YR8B 1O4PA 4ICZA 2SHPA 1ZCLA 3K2MA 3TKZA 3ZNIA 2AZRA 2HC1A 1PH0A 4K44A 1G1GA 1TCEA 4OHLA 1O4IA 1X27A 1OO3A 4RH5A 4HJQA 2QDMA 1LCKA 1FU5A 2H03A 5BUGA 2CM8A 1SHAA 2VEVA 5DC9A 1Q6SA 3VROA 2I6MA 1ECVA 3IN7A 1K9AA 1KA6A 2GE9A 4F59A 1O4KA 5D0JA 4NNDA 2RF6A 1FYRA 3VS5A 4ZI4A 1BF5A 4MBBA 1BZHA 4BPCA 1CWEA 2F6WA 3S3FA 2CNHA 2MBCA 5KABA 3VS7A 1OESA 2MRKA 2I4GA 1ZC0A 1PTUA 2DM0A 5HKZA 1D4WA 5IBMA 1XA6A 2YU7A 1Q1MA 4GE5A 2R0BA 1PICA 1AB2A 2B4PA 5J8RA 2H04A 1KC2A 4EY0A 2I5XA 1OEVA 2I4HA 2CNFA 3LJ8A 2F6VA 1I9TA 5M43A 1PXHA 1MILA 2RVFA 2Y1MA 1IS0A 2H4VA 1BKLA 4DGPA 1FQ1A 2P4DA 3VRQA 5LXQB 2XP1A 3M7FA 3PSJA 2RSYA 1GFYA 1NZVA 1AOTF 4ZRTA 3EMUA 2DXPA 4QUMA 1FMKA 3A5KA 4GRZA 4Y14A 5HKWA 1M61A 1T4JA 4XZ1A 3VRZA 2I6OA 3US4A 2HNPA 4I8NA 1VHRA 2FH7A 2CMBA 4TZIA 2CNGA 1ONZA 1QXKA 4M4ZA 2CM3A 3AWGA 2GP0A 3F41A 2MC1A 4JEGA 3EZZA 3QCFA 2JJDA 2KK6A 1O4CA 5MMZB 2PT0A 1LARA 1OEOX 2Y2FA 1O48A 1A1AA 1M3GA 4RH9A 1G1HA 4BJOA 1C83A 2I42A 4K45A 1LUNA 1LUMA 5K9VA 4QBEA 2NT7A 5J3XA 2WGPA 2IUIA 4ROJA 2C9WA 4P9ZA 2HDXA 4WOHA 5DC0B 1SKJA 3C7IA 5KA8A 1OO4A 5IBSA 3F9BA 4JMJA 2GWOA 1R1SA 1T48A 1OHCA 4JBCA 2DLZA 3IMJA 3I7ZA 3MXYA 2MQIA 3TL0A 1CJ1A 2B4SA 2I1YA 1JWOA 3S3HA 3QWYA 4WWQA 1EEOA 1U24A 3V0IA 3BKBA 1XM2A 4HJPA 4QUNA 5KA7A 1BM2A 2RMXA 5GJIA 2C0TA 1YN9A 4GRYA 3PJPA 5EHPA 3S8LA 2C0IA 3BM8A 2CM2A 2HUWA 3NHNA 1C88A 3QKPA 2FCIA 1NRVA 2IZVA 1AYDA 3PS5A 3VS2A 1RXDA 3QCEA 4P9VA 2ECDA 3ZM3A 5DC4A 1P15A 3OV1A 4HRFA 4NX8A 1RPYA 1Y1UA 3BUMB 2OZ5A 2PSZA 1CSYA 2F6TA 1BFIA 1AYBA 1BMBA 1MW4A 2HMHA 5AXIA 3D9CA 2EOBA 1LCJA 2MRJA 2G6ZA 4NYHA 3V0FA 3QCMA 2K7AB 1XBOA 1AAXA 2HY3A 3U96A 1O4QA 1WAXA 3QKQA 4KYRA 2H4KA 4ZN5A 1PTYA 1C86A 2LNWA 2J17A 2EYZA 3GXWA 1NO6A 4U1PA 5EHRA 1YTSA 3OB1B 4JMKA 1SPSA 2F6ZA 2J16B 5GTJA 1O4LA 1FPRA 1CWDL 1QG1E 2FO0A 2H8HA 2PI7A 2I3RA 4YAAA 1C87A 4RHGA 2IUGA 5BZXA 1UURA 1BZJA 4H1OA 1LUIA 4LUEA 1Q6NA 5BO4A 3S3KA 2H5KA 1U26A 1R1PA 1ZZWA 5KA4A 1A09A 4JE4A 1RPMA 1I57A 1BHHB 1I9SA 2BGEA 1F1WA 3S8NA 1JLNA 2EL8A 3BUOB 3N7YA 2CI8A 1O4FA 3VS6A 2C7SA 3IMDA 3ZM2A 2L6KA 3OP0A 1LKLA 1KAVA 1T49A 2I4EA 4KI9A 5EELA 1OPKA 1RQQC 2LNXA 3BUNB 1L8KA 1YTNA 1Q6PA 2VEUA 4A4CA 4Z6BA 1HCSB 1C84A 3BUXB 1X6CA 4FL3A 1NL9A 4QAHA 1FBZA 4NWFA 1G83A 5KA3A 1P13A 2AUGA 1PYNA 2OQ1A 3QCHA 2CM7A 4RI5A 5BZZA 1KA7A 2HNQA 2AHSA 2HB1A 3UF4A 4F5BA 1PTTA 1SHBA 3GQIB 3D1QA 1CSZA 5KADA 2EYYA 1Y57A 1BHFA 1NNYA 2G59A 3VRRA 3QCCA 1L8GA 1SUGA 2FJMA 1Q6TA 4OHIA 2HVLA 2VIFA 3IN8A 3MAZA 2NZ6A 2OC3A 2Y96A 3A5JA 3NMEA 4R0TA 1PTVA 1XXPA 3N0AA 2CMAA 1QADA 1O4OA 4WU2A 3V0DA 2PNAA 1BKMA 1OEMX 3HCKA 2QBPA 3GXXA 1SPRA 2H4GA 1JYUA 2DX0A 3VRNA 3MOWA 3N8MA 3RGOA 3T04A 1A1BA 1U25A 2I75A 1G4US 2CNIA 2CBLA 1O47A 4F5AA 2H02A 2VEXA 1YTWA 1O4DA 3O5XA 2L4KA 1JF7A 1MKPA 2PA5A 1G1FA 3WA4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2NTAA 3QCBA 4RI4A 3VS3A 1SHDA 5EG3B 1D5RA 2F46A 4GWFA 1O42A 2HDVA 4H34A 1P31A 4GE2A 2JFHA 2HXPA 1JYQA 5I6VA 2B4UA 4ZIYA 2VTDA 5DF6A 2A3KA 2ZN7A 1NWLA 3M4UA 2EU0A 2UUOA 3VRYA 5AULA 1A81A 4OHHA 1GQQA 2QBRA 1A1EA 3ZM5A 3KFJA 2AM1A 1GRIA 3EB1A 2I3UA 2EO6A 1FPZA 3AWFA 4HV4A 1JU5A 1O4JA 1WQUA 2PLEA 2DLYA 4AZ1A 4JNBA 1F2FA 2HCMA 3RZ2A 2B3OA 4C13A 3S4OA 3ZM0A 2JYQA 2PLDA 4J51A 3RO1A 2H46E 1W78A 4XZ0A 1Z3KA 2Y1NA 4NWGA 2BZLA 5HKYA 2CMCA 1NZLA 1UUSA 4FL2A 5HDEA 2QCJA 3LYVA 3OB2B 4QAPA 2MK2A 3RGQA 3V0JA 1YGRA 2F71A 5AWXA 2EKXA 2P6XA 2HCKA 1YVHA 2F70A 5K24A 2LQWA 3EACA 1OPLA 1ONYA 3CD3A 1YFOA 4GL9E 3ZL8A 1O4GA 1EEHA 2L3TA 2QBSA 3ZMPA 1OHDA 2I6PA 1AYCA 1RJAA 1O41A 1TZEE 1A5YA 3N84A 3VS4A 1LKKA 3BLTA 5K9WA 1FU6A 5KAZA 4PYHA 1OETA 2F6FA 2FJNA 2CNEA 2B4OA 2F6YA 1AYAA 4S0GA 3HIZB 3EU0A 5KAAA 4GFUA 2NLKA 3SR9A 2B07A 3HN7A 2I6IA 1A07A 3I36A 2VTEA 2PTKA 4E68A 3QCDA 3PQZA 5CDWA 1BZCA 3V0GA 3VGOA 1O4HA 4K2RA 2QBQA 3EAXA 2BGDA 2SRCA 4D3QA 1PA9A 1PA1A 2PQ5A 3VS1A 4CVKA 1GHUA 1HCTB 1IJRA 1O43A 4UAGA 3CBLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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