1X27A

Crystal structure of lck sh2-sh3 with sh2 binding site of p130cas
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
NLVIALHSYEPSHDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular basis for regulation of Src by the docking protein p130Cas
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase LCK
total genus 38
structure length 163
sequence length 163
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2005-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1x27A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1x27A02
3PFVA 4F14A 3N8MA 1YVLA 1Z9ZA 2O88A 1LUNA 3VS5A 2EL8A 2RSYA 3TVTA 1NLOC 1ZUUA 1QCFA 3QWYA 1X6BA 2DLZA 3VRYA 1UHFA 2CT3A 2YSQA 1BHHA 3C7IA 1LUKA 1IS0A 2EPDA 4E68A 1LCJA 1HSQA 4AFSC 2ETZA 4JGHA 1JWOA 5I6VA 4J9DA 1U3OA 2LCTA 1O41A 2EYYA 3GBQA 5IHNA 1AWWA 1BMBA 1SPRA 1H9OA 1ZFPE 2RORA 3I9QA 2J6KA 1EFNA 2JS0A 3HIZB 3BUXB 4NWFA 3EAZA 1M27A 1O4BA 2SEMA 1O4IA 3S8OA 5I11A 4RTUA 1PRMC 5BO4A 2DJQA 2O9VA 1O44A 1BBZA 3EG0A 4RUGA 4AFQC 2Y3AB 1GCQC 1X2QA 1KC2A 1RLQC 2AKLA 1O43A 4J9CA 1Y0MA 1O42A 5FWCA 1H3HA 1NM7A 4RTTA 1PKTA 4EY0A 2L2PA 1JYRA 1A09A 2A36A 1Y57A 5I22A 2DMOA 1WI7A 1FBVA 4D8KA 1YVHA 4FSSA 1I1JA 3U23A 1ZX6A 1GHUA 5EG3B 1UJYA 4JJBA 1MW4A 2F2XA 4JZ3A 2EYVA 3M0SA 2VIFA 3PE0A 1BKLA 1I3ZA 4HXJA 2HDAA 3GXXA 2HCKA 1A1EA 1T3SA 4E93A 1VYVA 1WXUA 2K9GA 2G6FX 4J9HA 2RQRA 1AYBA 1B47A 4J9IA 5FW9A 1HCTB 4J9BA 1D1ZA 1JXOA 4IIOA 1X69A 1I07A 2KYMA 3M0QA 1NZVA 1YWPA 1T3LA 2K79B 1WYXA 2EKHA 1O4GA 2W0ZA 3EGUA 1GFDA 3VRRA 2EYWA 1FHSA 1WDXA 2JTEA 3CD3A 1QKWA 3M0UA 4GWFA 2GTJA 2V1RA 1UG1A 1O46A 3EG2A 5EC7A 1RQQC 1W70A 4OHHA 2PNBA 2DYBA 2K7AA 1A1AA 2D8HA 3CXLA 1BHFA 1NG2A 1NRVA 5HKYA 1A1CA 1UGVA 2AUGA 1OOTA 1KFZA 1J3TA 1AB2A 2DRKA 2I0NA 3VRQA 2KXDA 5KAZA 3IN8A 1U5SA 4A4CA 1Y1UA 2DBKA 1K4US 1PHTA 2E5KA 1A08A 1O47A 1OO3A 3PSJA 2CREA 1BM2A 2DL8A 2KBTA 4U1PA 1WA7A 5IBSA 1AOJA 1RPYA 1GCPA 3IMJA 1F1WA 2B86A 1M27C 1GL5A 1D4WA 2DM0A 5IHIA 2L0AA 4J9FA 2GQIA 4ORZA 2GE9A 2CSIA 3OVEA 4QSYA 2BTTA 5ECAA 4Y92A 3A98A 1A1BA 3S9KA 1UTIA 4WCIA 3K2MA 3NGPA 2KRMA 3SHWA 3MXCA 2OAWA 1D4TA 1M61A 2FO0A 1CSYA 1O4QA 1AOUF 2CS0A 2JT4A 2CI9A 5DC0B 1BK2A 1X6GA 4OMNA 1WXBA 2YSXA 2C0OA 4HVVA 2GSBA 2LNWA 1AWOA 1KJWA 2DF6A 2LMJA 1K1ZA 4CC4B 4X1VA 2H8HA 4F5AA 1WLPB 3NPFA 5HKWA 2BZXA 4R0KA 4Z8AA 1HJDA 2O9SA 5IXBA 2YT6A 2EKXA 1O4OA 3VS4A 1I0CA 1YNZA 2LNXA 2EVRA 2YU7A 1O4AA 3PLFB 1M3BA 2EGEA 3VS3A 1QLYA 2AOAA 3N84A 3RBBB 4RTWA 1WQUA 2IUGA 4HVWA 3H0FA 2L3PA 3KFJA 4A63B 2GTOA 1IO6A 2IUHA 2RQUA 2AZSA 3TSWA 2LJ1A 4AG2C 1KIKA 3UA6A 2FG0A 3PJPA 4M4ZA 5EHRA 2L3SA 2DX1A 4OHEA 5IBMA 4Z89A 2YUOA 1CKBA 4DEYA 1O48A 2HDXA 1H92A 1JEGA 1HD3A 2ED1A 5GJHA 1A0NB 2YUNA 4AFUC 1UHCA 4JEGA 2DL3A 1O49A 1SHDA 1UURA 3EACA 3H0HA 1BFIA 1O4MA 2DCRA 1JXMA 3VRPA 1AD5A 2MIOA 2H46E 2VKNA 5D0JA 1LCKA 2BBUA 2D0NA 1KA6A 4DGXA 2RNAA 4RTVA 1O4KA 5EHPA 2PTKA 5FWBA 4K2RA 5GJIA 4J9EA 4FL3A 2Y1NA 2M0YA 2FPDA 3JV3A 1O4FA 2CDTA 2J05A 2KGTA 2K7AB 1AWJA 2ABLA 1UJ0A 1TUDA 2DNUA 3LH5A 3GXWA 1K76A 3PQZA 4EIHA 3S8NA 1CWEA 1GCQA 4HCKA 4OMPA 3MXYA 4JE4A 4OHIA 2D8JA 3SEMA 3VS0A 2FEIA 2Y1MA 4XZ1A 1UUSA 2RVFA 4FBNA 2LCSA 4HVUA 3BKBA 4CC7A 1YWOA 1SEMA 2HMHA 3UA7A 2DLPA 4K45A 2GNCA 1CWDL 2M51A 1QWFA 1CKAA 1O4CA 3PS5A 4JPBW 1O45A 4GPLB 4OHLA 4WWQA 4CC3A 1GBRA 3TKZA 2RN8A 3M0PA 4P9ZA 3M7FA 1UECA 3FJ5A 2CUBA 3ZL7C 1X2KA 2K6DA 2DILA 2KEAA 1M3AA 1BFJA 3VS7A 1LUIA 1LKKA 2AK5A 5IH2A 2W10A 4AG1C 3EHQA 1QWEA 1UE9A 1ABOA 1TCEA 3US4A 1VA7A 2NWMA 2XMFA 2QMSA 1O4EA 2J6FA 2CH4A 2MRJA 2PZ1A 4LNPA 4RTZA 1X0NA 4KRTA 4F17A 3KFVA 2KYBA 2CRHA 2CI8A 2RMXA 3EG1A 1P13A 2EQIA 2RQWA 2EYXA 3CWGA 1ZLMA 1MV3A 2ENMA 1AZEA 4TZIA 1KSWA 1E7OA 2KNOA 2KNBB 1AEYA 1ABQA 4D8DA 1K0XA 2KROA 2FCIA 1YP5A 2SHPA 3RNJA 3BUMB 1X27A 4FL2A 1SHGA 1O4DA 2K2MA 1O4PA 1RLPC 3VS1A 2C0IA 3OB1B 3VGOA 2EW3A 1X43A 4EIKA 3ULRB 1ARKA 1R1PA 4XZ0A 1ZBJA 4GLMA 4J9GA 2RQTA 1NEBA 2HEQA 1RUWA 1JO8A 3PVLA 5IXFA 4X6SA 1S1NA 1O4RA 2ECZA 1AVZC 1OEBA 1VYUA 3BUOB 2KT8A 2RF0A 4F59A 2IZVA 3OP0A 1OV3A 3HHMB 1MUZA 5L23A 2X3WD 2PNAA 1NEGA 1T0HA 4LE9A 2VVKA 2DVJA 3IN7A 3ZNIA 2ESWA 1BB9A 1SHAA 3CQTA 1F2FA 1OPKA 2KXCA 1BLJA 5DC4A 2RMOA 2CT4A 2CH4W 1M30A 1LUMA 5EEQA 2JM9A 1ZUYA 1WFWA 3S8LA 1JQQA 1GFCA 1VYTA 1SSHA 4JJCA 1K9AA 1XOVA 1TUCA 1M3CA 2KT1A 1JYQA 2AZVA 1RJAA 3THKA 4E6RA 1A81A 4DGPA 2XP1A 2X3XD 3R6NA 1CJ1A 4H34A 3OB2B 3TL0A 4OMLA 3OV1A 3IQLA 3N7YA 4LUEA 2CR4A 2PLEA 4JZ4A 2DL7A 1O4LA 2PLDA 2NUZA 2H5KA 2B3OA 1OPLA 1IJRA 2LNHB 2JM8A 2HUWA 1GBQA 2DBMA 3I35A 5EELA 2KE9A 2J6OA 1FBZA 3MAZA 3NMZC 1W1FA 3REAB 1JU5C 4F16A 1SHBA 4LN2A 2EGCA 4GL9E 3CBLA 1NYGA 5DF6A 1UUEA 2RQVA 1UDLA 2LJ3A 3REBB 4K44A 4Z88A 2HDVA 2OI3A 2D1XA 2EU0A 2KK6A 1HCSB 2L3QA 2DLYA 2IUIA 1FMKA 1N5ZA 4ZNXA 3T04A 2YDLA 2RPNA 3UYOA 4K11A 3C0CA 2SRCA 3PSKA 2YUQA 3EHRA 2IIMA 2FPEA 1R1QA 2GBQA 2OZOA 4QT7A 4IIMA 2KR3A 4JJDA 2LQNA 4LUDA 4CC2A 1OO4A 3PVQA 1B07A 5IHKA 4RTYA 2AOBA 2O2OA 1JYUA 2JXBA 1T0JA 1E6GA 1PNJA 4RTXA 5HKZA 1WX6A 2ED0A 2FRYA 1NYFA 3M0RA 3M0TA 1X6CA 1NLPC 1TG0A 1M8MA 1H8KA 2BZYA 2JMAA 1AWXA 5GJWB 2VWFA 2F2WA 1ZUKA 4A4BA 3I5SA 2JMCA 3UF4A 2FPFA 4OMOA 1R1SA 4H1OA 2O31A 1BG1A 2PNIA 1PRLC 2LQWA 3VS2A 1RI9A 2C9WA 2MOXA 1FYNA 2DL4A 2CUDA 4OMQA 2JYQA 3QWXX 2HBWA 4ESRA 2AKKA 3VROA 1U06A 3TSZA 1AZGB 1FYRA 1G83A 3UATA 5CDWA 1QKXA 1W6XA 2V1QA 2FRWA 2DE0X 5HCKA 3HCKA 2EYZA 1CSKA 1SPSA 2CBLA 2EOBA 1YCSB 4ROJA 1PICA 1SKJA 1PKSA 2DRMA 1CSZA 2OJ2A 2C0TA 2YUPA 2EBPA 1O4HA 2CSQA 2JW4A 1YN8A 3VRZA 2L3TA 4NWGA 2QDLA 1UFFA 1SPKA 2LX7A 1BU1A 1O4JA 4OMMA 1SRLA 3NHNA 1MILA 1BHHB 2CIAA 1BF5A 2ECDA 1AYDA 5AULA 3VS6A 3I5RA 1MV0B 1WIEA 1BKMA 1K0SA 4U17A 1JU5A 2A08A 4OHDA 5J3XA 2MCNA 2L4KA 1BLKA 2MK2A 2A37A 1B3QA 4P9VA 2K3BA 5DC9A 3BUNB 2KRNA 2DX0A 2EO6A 2MQIA 1ZSGA 1A07A 2GGRA 2ROTA 1QG1E 2K79A 2A28A 2DA9A 2ROLA 1SRMA 2DM1A 2EGAA 1AOTF 3IMDA 4GBQA 1V1CA 1NZLA 1E6HA 3BUWB 2L6KA 1G2BA 1Z3KA 2LP5A 2BZ8A 3O5ZA 1AYCA 5AXIA 1TZEE 1GRIA 3H0IA 3H41A 2KRSA 1WXTA 2MRKA 2F2VA 5GJVB 1Z9QA 2JS2A 3EG3A 3GQIB 2J7IA 1AYAA 4DEXA 1KA7A 4F5BA 2J06A 3WA4A 1LKLA 2DL5A 2LJ0A 4L1BB 2HSPA 1PWTA 1QADA 1FU6A 2EO3A 2LZ6B 2P4RA 1O4NA 1XA6A 2MC1A 2OQ1A 3VRNA 1FU5A 1SHFA 4AFZC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OS0A 4ZN3A 4F14A 3N8MA 2ATCB 1IHWA 1NLOC 4BD3A 1QCFA 1X6BA 1WQ7A 1UHFA 2CT3A 1LUKA 1Y71A 1IS0A 2EYQA 2P0PA 3GPLA 4KGVB 2HAXA 2H3EB 1OQKA 4PJOG 2GF7A 2P84A 3EGDA 3MEUA 1BMBA 2Y4XA 4NWFA 1UGPB 4M7AG 3JCMg 3FRNA 1O4IA 1WHHA 3G4SQ 1Q86C 4RUGA 4Q5WA 5A0DA 1GCQC 4KULA 2AKLA 4J9CA 1O42A 4E7JA 3I55A 5D6WA 1H3HA 1PKTA 3VV0A 2L2PA 1JYRA 3QO3A 4F7UG 4C92B 5I22A 2DMOA 4C8QG 3I56T 3MCAB 4C92E 1UJYA 2A7YA 3QG1A 2NUPA 2HDAA 1VQ6A 1VYVA 2G6FX 4P5NA 1AYBA 1Q7YC 4BACA 2DYIA 4J9BA 1SSFA 5C6SA 4IIOA 3DB4A 1QVGP 2KYMA 1WYXA 2EKHA 1O4GA 1QVFA 4YTLA 3SDZA 4J8OA 1GFDA 5EG2A 4PJLA 2D6FA 4JRIA 2YRDA 1YI2T 4TVRA 5KE3A 3CBOA 1RQQC 4OHHA 2QQRA 2DYBA 2D8HA 1BHFA 5HKYA 5CR2A 1VOMA 1OOTA 4PFZA 1KFZA 5FRNA 2DERA 1AB2A 2DRKA 1VQ7T 4PNOA 3M56A 4JRKA 1U5SA 1TSFA 3F70A 1K4US 2E5KA 4N4GA 1VIFA 2CYZB 1BM2A 2DL8A 5A0GA 4U1PA 4PLLA 1D0YA 2CP7A 1GCPA 2B86A 4M75B 1GL5A 5IHIA 5J3BA 1VQ6T 4RCBA 4ORZA 2CSIA 3A8LB 2DPPB 1BYMA 1UTIA 4M7DB 3JRZA 5KE2A 1N8RU 3K2MA 3MXCA 2LRAA 1M61A 1KQ1A 2R5MA 2MWOA 2JT4A 4LDWA 2CI9A 4OMNA 1WXBA 2M02A 2KMTA 2VGNA 4J83A 2DJZA 1YBYA 2H8HA 4F5AA 1YITT 5HKWA 2ZPFB 1D0ZA 2EKXA 3JCMX 3TREA 1I0CA 5GMKi 1W2BP 2XDPA 3PLFB 2DTHA 3CD6Q 3N84A 3CCSQ 3RBBB 2IUGA 4GLKA 5LJ3f 1W2BS 3H0FA 5GANh 2IUHA 3CCMA 1K73U 1ZA2B 2QGFB 1RI0A 5IBMA 3FLGA 2YUOA 4F7UF 1O48A 1FMVA 3CCMQ 5GJHA 2X9HA 2A3LA 4FSXA 1UHCA 4FCYA 4JEGA 1LOJA 3EACA 2DO3A 2VGMA 3HPWA 1BFIA 1O4MA 3P8HA 1JXMA 3VRPA 1AD5A 2MIOA 2VKNA 1PM3A 2XK0A 5AT1B 1PSEA 2DEUA 5GAN6 5GJIA 2E4HA 2M0YA 1QVGA 1O4FA 1IXDA 1PSFA 2J05A 2KGTA 3H9NA 2ABLA 4NL3A 2DNUA 3S8NA 3PQZA 2M9UA 4JE4A 1U8RA 3A8HB 2R58A 1I4K1 5HY6A 3A8MB 6AT1B 4CC7A 1YWOA 4IUVA 1K9MC 3UA7A 4JDSA 1CWDL 2M51A 1QWFA 1BIAA 2RD1A 4CRIA 3PS5A 1O45A 4OHLA 3TKZA 2RN8A 3M0PA 4P9ZA 3M7FA 3FJ5A 3ZL7C 1B34B 1X2KA 4JUVA 3RMQA 5CIUA 2KEAA 1M3AA 1YJ9Q 4O6JA 2O4XA 1H3ZA 2AK5A 5IH2A 3G6EA 3S6WA 1UE9A 4FM4B 1ACMB 3L2WA 4N0AA 5D6XA 5DY9A 2J6FA 3CCST 1TH7A 5GAOl 3E19A 4KRTA 4F17A 1QP2A 1D3BB 3EG1A 2EQIA 4M78C 2KDSA 2RM4A 3QDRB 2EYXA 5LJ3j 2ENMA 3TQ7P 3DLMA 3HSBA 1NJIU 4D8DA 3QJ6A 3G71Q 2ZPHB 3OBWA 3OB1B 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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