1X27A

Crystal structure of lck sh2-sh3 with sh2 binding site of p130cas
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
NLVIALHSYEPSHDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase LCK
publication title Molecular basis for regulation of Src by the docking protein p130Cas
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 163
sequence length 163
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2005-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1x27A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1x27A02
2L3SA 1O42A 1SRMA 3WA4A 5IHNA 1PRLC 1GHUA 2W0ZA 4OHIA 3VS2A 2B86A 1MUZA 3VS7A 2HUWA 2L3TA 4CC3A 3H0FA 2MQIA 2SRCA 2DLZA 1B47A 2YUPA 2EKHA 1UG1A 3VS6A 1KA6A 2LNWA 4F5AA 3GBQA 1F2FA 1VYTA 1N5ZA 1WDXA 3VGOA 2K7AA 2RQRA 5GJWB 2VWFA 3I5SA 1ARKA 4XZ0A 2ROTA 2F2XA 1I3ZA 3O5ZA 2L4KA 2RQVA 1CSZA 4U1PA 1UURA 1HD3A 2D8HA 2LQWA 3SHWA 3NMZC 3H0HA 4Y92A 2FPFA 1ZUUA 1PNJA 5HKZA 4D8KA 2DLPA 1KA7A 1O4DA 2O9SA 2J05A 5AULA 1UHCA 1YVHA 3VS1A 2O9VA 1ABQA 2H46E 3H0IA 2C0TA 3OB1B 3RBBB 2RVFA 3HCKA 2MOXA 1LUNA 1FBZA 4XZ1A 2EW3A 5HKWA 5FWCA 2ECDA 3NPFA 4RTZA 4CC4B 1W70A 4LUDA 3PJPA 1H8KA 1U06A 1BKMA 3NHNA 5DC9A 1BF5A 1SRLA 1JWOA 2H5KA 4K2RA 1T3SA 1P13A 2EQIA 4J9GA 4NWFA 1OPLA 1JXOA 1SPKA 2LP5A 5IXBA 2RQWA 1X6GA 1IJRA 2RNAA 2RMXA 1OPKA 3KFVA 5IH2A 2EL8A 1A0NB 2L0AA 3VRZA 2GTJA 2RMOA 4A4CA 3EG2A 3UATA 2RF0A 2GE9A 1AZGB 3ZNIA 1HCTB 4F17A 2L3QA 1K0XA 1A08A 1LKLA 3VRNA 5I6VA 1WA7A 1AOTF 5ECAA 4OMQA 2CSQA 3M0SA 1CWEA 1A1AA 1LCKA 1BFIA 4ESRA 4R0KA 2BTTA 4X1VA 1SHFA 1MV0B 2D8JA 2DBKA 2ENMA 1SSHA 1ZLMA 1SPSA 2J06A 1M30A 1LUKA 1CJ1A 4OHDA 2LQNA 1UGVA 1QG1E 1KC2A 5BO4A 2MIOA 1FU5A 1GL5A 3S9KA 1SEMA 2EU0A 3TSWA 4L1BB 4J9DA 1FYNA 1O4KA 2AUGA 2KNOA 1OO4A 3CD3A 2LCTA 3A98A 1XOVA 1X69A 1BB9A 2CRHA 3OB2B 4DGPA 2EKXA 2AZSA 2ETZA 4JJCA 1GBQA 2OAWA 2CUDA 1O44A 1M3CA 1E6GA 4LN2A 4RTTA 2DRKA 4F14A 1WI7A 3HIZB 2J6KA 4DEXA 4Z8AA 1F1WA 3R6NA 3PLFB 5EC7A 2M51A 1I07A 1RLPC 3VS0A 2H8HA 1RJAA 2AK5A 4JJBA 4TZIA 1BG1A 2JT4A 1BBZA 2GGRA 1O4FA 2JTEA 3JV3A 1NLOC 3GQIB 2EO6A 1O4BA 1O4AA 5DF6A 1AYCA 2EYVA 4AFSC 3EAZA 3N84A 2KE9A 2OI3A 3M0QA 1LKKA 2C9WA 1K9AA 2K79A 2NWMA 2HDAA 3VRPA 2RSYA 4F5BA 2CSIA 1GCQA 1WXTA 3BUOB 2PNAA 1X27A 2ABLA 3ULRB 1MW4A 4LNPA 3QWXX 2MCNA 2DL7A 3K2MA 4JJDA 4A63B 1AWJA 5FW9A 2IUIA 1NRVA 2PTKA 3S8LA 2FO0A 2CT3A 3I9QA 2F2VA 2ED0A 1M3BA 1YCSB 2IZVA 1YP5A 3U23A 3UF4A 2E5KA 1BM2A 2GBQA 1ZUYA 1B3QA 1AVZC 2DX1A 3C7IA 1GFDA 1R1PA 3EHRA 1WLPB 3REBB 2FRYA 2DNUA 1AOJA 2CUBA 2ROLA 1WXUA 4JZ4A 2DLYA 1I0CA 4Z88A 4CC2A 2DM1A 1UJ0A 2YUNA 4LUEA 4Z89A 2C0IA 1UDLA 1NZVA 4JZ3A 1QLYA 2O31A 2YUQA 2JXBA 5GJVB 2EGAA 2JYQA 2DE0X 2SEMA 2CI9A 3CXLA 1O4HA 2X3XD 2JS0A 3RNJA 1O4LA 1ABOA 3C0CA 3PVLA 1AYBA 3BUWB 1O4QA 3EGUA 2DILA 1IS0A 1MILA 3M0TA 2DBMA 2DRMA 2QDLA 2L2PA 4K44A 1PHTA 1A81A 2CH4A 2LMJA 3TKZA 1BLJA 3SEMA 1T3LA 1K4US 3S8OA 2BZXA 4HVWA 4JGHA 2QMSA 2Y1NA 2AZVA 3N7YA 4AFZC 2RN8A 3PE0A 2RPNA 3VROA 3PSJA 5DC4A 1RUWA 4LE9A 1SKJA 1CKAA 1OV3A 1FBVA 3OV1A 1AD5A 2XP1A 5FWBA 5J3XA 2AOBA 4J9IA 1AYDA 5I11A 2DF6A 3S8NA 4H34A 2YSXA 5GJHA 2EBPA 2LNXA 1I1JA 2BZYA 2DJQA 2KXDA 4OMNA 1D4TA 1JXMA 2AKLA 4X6SA 2DYBA 4RUGA 1BK2A 2VVKA 1UJYA 4JPBW 4A4BA 1RLQC 5CDWA 2EPDA 1M8MA 2LZ6B 2YDLA 2PNBA 1BFJA 1OO3A 1X6CA 2MRKA 1U3OA 4WWQA 1HJDA 2DL4A 1G83A 1W1FA 1Y0MA 2CS0A 1X2KA 2LJ1A 4KRTA 5HCKA 1KJWA 4IIMA 1QCFA 2EYZA 2VIFA 2OJ2A 1KSWA 3VS5A 2K7AB 2DVJA 4GWFA 4P9ZA 4E6RA 5EHRA 2RORA 4J9FA 1PKSA 1BLKA 1M27A 3QWYA 4DEYA 1O4OA 3PVQA 1TZEE 1UFFA 4RTYA 1O49A 1AB2A 4FL2A 2CBLA 2YU7A 1RQQC 4FSSA 3VRRA 5IBMA 4OHLA 1O4IA 1WIEA 2O88A 4EIHA 3EG1A 1XA6A 1HCSB 1T0HA 2D0NA 1TCEA 4RTWA 2HSPA 3US4A 1FMKA 4OHHA 2KGTA 3ZL7C 2A08A 3M7FA 1OEBA 1JYUA 5I22A 1ZSGA 1H3HA 1AZEA 2MK2A 1QWFA 1WFWA 2HEQA 1LUMA 4AFUC 1VA7A 1V1CA 1YWPA 1O4MA 1JEGA 2GSBA 2LJ3A 2EVRA 2MRJA 2CREA 2LX7A 5GJIA 5HKYA 4CC7A 4GBQA 2FCIA 1X0NA 2XMFA 2DM0A 1BMBA 2GNCA 3H41A 1T0JA 2EYXA 3EHQA 2HCKA 1YN8A 1GCQC 2YUOA 3EACA 4OMLA 2CIAA 2W10A 2JW4A 1CWDL 2CH4W 1W6XA 2G6FX 2KYBA 4H1OA 5EELA 3TVTA 3N8MA 2FG0A 1O43A 4F16A 3FJ5A 4J9HA 1GRIA 5IXFA 4RTVA 1BU1A 1HSQA 1Z9QA 1BHHB 2K2MA 2KXCA 1OOTA 1O4RA 1M3AA 5EHPA 1Y1UA 2RQTA 4DGXA 1QWEA 1ZX6A 4K45A 2HDXA 1JU5A 2ESWA 1A1EA 2LCSA 2J6OA 1X43A 1S1NA 1IO6A 2DL3A 2DL5A 1A1CA 1M61A 2KYMA 4E68A 2IIMA 1SHAA 3OVEA 1A07A 2HMHA 2PZ1A 2KBTA 2L6KA 4AFQC 2SHPA 3VRQA 1BHFA 1QADA 3BUNB 4U17A 5IHIA 2OZOA 1PKTA 2CR4A 1RPYA 1MV3A 1YVLA 3M0RA 1AEYA 2BZ8A 2P4RA 2JMCA 2DMOA 1R1QA 3PFVA 1CSYA 4QSYA 1AWXA 2J6FA 1TUDA 1O4CA 1O4NA 1J3TA 4AG2C 1O47A 1R1SA 2PLEA 1SHBA 1G2BA 2LNHB 5DC0B 1NZLA 2B3OA 1NYFA 2JS2A 2KEAA 3IMJA 1SPRA 4HCKA 2EO3A 2DX0A 2FPDA 2V1QA 1O4GA 1UTIA 4RTXA 5IBSA 2MC1A 4ZNXA 3GXXA 3GXWA 2I0NA 3HHMB 3VS4A 1JQQA 2IUGA 1RI9A 3OP0A 4J9EA 2C0OA 2EGCA 2KRMA 1TG0A 1KIKA 2ECZA 3T04A 2K79B 1O46A 1NM7A 3BUMB 1K1ZA 2O2OA 3LH5A 1X6BA 4J9CA 2OQ1A 3IN8A 1GFCA 2IUHA 1WXBA 3BKBA 4GLMA 1FYRA 2ED1A 5IHKA 1ZUKA 5L23A 2EOBA 1GBRA 2Y1MA 3THKA 1NLPC 1YNZA 1O41A 3CBLA 5EG3B 1UHFA 2KRSA 2X3WD 2PNIA 4FBNA 1LCJA 1O45A 2K9GA 2A28A 1WX6A 4JE4A 1E7OA 2YT6A 1AYAA 1K76A 1K0SA 1GCPA 5EEQA 1VYVA 1Y57A 3CWGA 2J7IA 4OHEA 2K6DA 2F2WA 2AKKA 1CKBA 1Z9ZA 1NEBA 4HVVA 3PQZA 3UA6A 2EYYA 4HXJA 2VKNA 3TL0A 1H9OA 1JYRA 1QKWA 2BBUA 1BHHA 4HVUA 4RTUA 4NWGA 2RQUA 1O4JA 1H92A 3IQLA 1A1BA 2EGEA 1M27C 2CI8A 1NEGA 3REAB 3MXCA 1UECA 2LJ0A 3BUXB 2KT1A 5AXIA 1D1ZA 4EY0A 4QT7A 2FRWA 2JMAA 3I35A 3KFJA 4FL3A 4ORZA 1A09A 2A37A 2YSQA 1YWOA 3MXYA 2KR3A 4J9BA 2L3PA 1EFNA 2HBWA 4F59A 1O4PA 2KNBB 3TSZA 1B07A 1NG2A 2KT8A 4P9VA 3UA7A 1PRMC 2PLDA 1NYGA 3NGPA 4E93A 3CQTA 2M0YA 1WYXA 3VRYA 1PICA 1Z3KA 4JEGA 1ZFPE 1U5SA 4OMOA 4EIKA 1E6HA 4OMMA 2JM9A 1O48A 4GL9E 3IN7A 2FEIA 1SHGA 2DL8A 2K3BA 3UYOA 1PWTA 2JM8A 3EG0A 2Y3AB 4M4ZA 4GPLB 5D0JA 1D4WA 3VS3A 2EYWA 3M0UA 1UUSA 2AOAA 5KAZA 2HDVA 3PS5A 1KFZA 4ROJA 1O4EA 1JU5C 1JO8A 3I5RA 2D1XA 2KK6A 1WQUA 2DCRA 1AWWA 2KROA 1AOUF 4AG1C 3M0PA 4IIOA 1SHDA 2DA9A 1ZBJA 2FPEA 1QKXA 2GQIA 1UUEA 1X2QA 2KRNA 2NUZA 4OMPA 4WCIA 1JYQA 2V1RA 2GTOA 3PSKA 4K11A 3EG3A 4D8DA 1TUCA 1FHSA 2CDTA 2A36A 1FU6A 1VYUA 1AWOA 1LUIA 3MAZA 1CSKA 3IMDA 2CT4A 1UE9A 1BKLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2L3SA 1SRMA 5IHNA 4E7IA 4C0GA 3OBWA 5KYUB 3CPWP 4OHIA 3VS2A 4QQ6A 1NJIC 2EJ9A 2EIFA 2HUWA 4CC3A 3OYGA 2L3TA 2P0KA 2QQSA 2YUPA 2EKHA 4C92D 5A2QE 2DFUA 1Q81U 1F2FA 1UGSB 1VYTA 1WDXA 3CPWS 1WHMA 3CPWA 4XTYA 1ARKA 4M78B 4M7AB 1I3ZA 3QSUA 4QQGA 3QUIA 4J6XA 4WF2A 2RQVA 1D1AA 3MHXA 1UURA 1HD3A 2L8DA 3SHWA 3NMZC 5CR2A 1HXDA 2FPFA 5HKZA 4KUDK 4DOWA 1YVHA 4M7DB 1ABQA 5GANh 3F70A 5KYWB 3HCKA 2MOXA 2LT4A 2EW3A 2CYZB 3MJXA 3L42A 3C95A 4PLIA 2EQIA 3MO8A 4J9GA 1SPKA 4M78D 4M7AD 2RQWA 1IJRA 2FL7A 2RNAA 3KFVA 2VGNA 2RMOA 3CXCS 3URGA 4C5IA 3UATA 3LX7A 2WSCE 5I2SA 3VRNA 5I6VA 5ECAA 4OMQA 2CSQA 4M7DD 1CWEA 1LCKA 2A3LA 2RHZA 5GANj 4R0KA 2BTTA 1U1SA 3G71A 1M30A 1CJ1A 2LQNA 1UGVA 3M4YA 2CP3A 2MIOA 1U8RA 2EU0A 4BI3A 5I21A 1O4KA 2AUGA 2KNOA 1OI1A 2CZ7B 2CRHA 4DGPA 2AZSA 2ETZA 1BI0A 1M3CA 4F14A 5DM7R 4DEXA 2JTFA 4Z8AA 3GLXA 1I81A 3VYGA 3QO3A 4TZIA 1O4FA 2GGRA 2FVUA 2EO6A 5DF6A 1AYCA 4A4EA 4AFSC 1OZ3A 2KE9A 2OI3A 3KUFA 2NWMA 2HDAA 3E9FA 2RSYA 2CSIA 2JZ2A 3HP9A 1MW4A 1QVPA 4EPCA 2LT1A 4JJDA 3K2MA 3M55A 1ACMB 4A63B 5CKFA 1KD1C 4AT1B 2PTKA 4L59A 2FO0A 3I9QA 2NUPA 4BB7A 1VQ7Q 3JCMh 2GBQA 3C4SA 3C7IA 3EFOB 4C8QG 3REBB 1VQPT 1AOJA 4JZ4A 3A5ZB 1I0CA 1ZSZC 2HD0A 2DM1A 1UJ0A 1UDLA 3JCMV 4EMKA 1R8OB 3JCMP 2MMPA 1IZ6A 1FX7A 3I56T 1IHWA 2YRCA 2DE0X 2DO3A 3T9NA 2BE9B 1W2BP 2DK3A 3OYMA 4F7UE 4X9DA 3EGUA 4C8QC 4N4GA 2L2PA 2JUFA 3SB2A 3VROA 3PSJA 3JB9H 1CKAA 1KHIA 4OGEA 2DAQA 2DF6A 1YJ9Q 3CBMA 4H34A 2YSXA 2EBPA 1OQKA 2LNXA 2JNGA 3JRZA 3OS1A 4RUGA 3LWIA 1Q95G 3BW1A 1MMAA 1JRIA 5GANf 1M8MA 4M75G 3QZ9B 1BFJA 1X6CA 9ATCB 1BCOA 4L6V5 1X2KA 2LJ1A 2XG8D 1BCMA 2KK4A 5J39A 2HKQB 4P9ZA 5EHRA 3CCMQ 2RM4A 4J9FA 1PKSA 4J8OA 4M78F 4DEYA 1TZEE 2E70A 4M75C 2CBLA 1KQSP 2LX9A 2RH2A 4XTXA 1QVGP 1WIEA 2RHXA 1O4IA 3EG1A 4RTWA 1FMKA 2IPOB 2QI2A 3I55A 3PTAA 1KQSA 1WZOA 4M7DF 3M7FA 5GAMe 5I22A 1N9SA 1H3HA 2VASA 2HEQA 1LUMA 2GSBA 2LX7A 1S72A 1YJNA 2FCIA 8ATCB 4FT4A 4FYWB 1G8XA 3L2ZA 2YUOA 2DXCA 1VQ4A 2CH4W 2G6FX 2COYA 2CZ1B 3K2TA 2P0PA 3MP6A 4RTVA 2F5TX 1HSQA 3N5BB 1YJWA 4DOVA 3KXTA 1OOTA 1NPPA 4DGXA 1QWEA 4GY5A 3G6EA 2HDXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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