1X27A

Crystal structure of lck sh2-sh3 with sh2 binding site of p130cas
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
NLVIALHSYEPSHDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase LCK
publication title Molecular basis for regulation of Src by the docking protein p130Cas
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 38
structure length 163
sequence length 163
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2005-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1x27A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1x27A02
1CWDL 2L3PA 2ETZA 3PFVA 1VA7A 1BG1A 1A09A 5I11A 5J3XA 2L6KA 2LP5A 4U17A 3M7FA 2BTTA 2DRMA 2KR3A 2V1RA 2NUZA 2LNHB 3EAZA 3NMZC 2PNAA 3PQZA 4K2RA 1WX6A 2JM9A 2RQWA 5IXBA 3VRZA 1D1ZA 1X6BA 3OP0A 1SPSA 2CUDA 1UE9A 3I9QA 1MUZA 2FPDA 2RQVA 1KC2A 1NRVA 2BZXA 1OEBA 3OV1A 1M8MA 4JZ4A 1AB2A 1O46A 2DF6A 1OPKA 1YN8A 2HEQA 2VWFA 1LCKA 1MW4A 2RF0A 1UGVA 1SRMA 2FO0A 2KXDA 5ECAA 1AZGB 1K0SA 1FBVA 5DF6A 4X1VA 3TSWA 5GJWB 4JJDA 2AK5A 2RQTA 3OB1B 2LQWA 2LJ3A 1OV3A 2C0IA 1UHCA 4J9DA 1RJAA 3EG3A 3BUXB 2ED0A 1B47A 3S9KA 1EFNA 1K1ZA 2EYXA 4DEYA 2DLYA 1H92A 1ABOA 1H3HA 1RLQC 5AULA 1LKKA 2YT6A 2KGTA 2DNUA 1LUNA 5IBSA 4KRTA 1A07A 2RMOA 3FJ5A 4CC7A 1H9OA 2D8JA 1FYRA 3BUNB 3M0TA 2O88A 4EIKA 2FG0A 2CBLA 1O42A 3N8MA 5DC4A 1ZLMA 2YUQA 1QCFA 1BHHB 2Y1MA 1AD5A 3MXCA 1ZX6A 2EL8A 1UJYA 2YSQA 4OHIA 2DRKA 1R1SA 1SHDA 1UFFA 1ARKA 2YUPA 2PNBA 4DGXA 3GBQA 1FHSA 1X2QA 2GBQA 1QLYA 3PVQA 1A0NB 1R1PA 1RQQC 4JJCA 4HCKA 5DC9A 2H46E 1GFDA 2JXBA 1WXBA 4RTYA 2LJ0A 2K9GA 2K2MA 4HXJA 1WLPB 2J06A 4GBQA 1QKWA 2DLZA 4EY0A 1B07A 2K7AB 3EACA 3S8OA 2W10A 1FBZA 5EHRA 2QMSA 1SHBA 4GWFA 1BFIA 4F17A 1SPRA 4E93A 3VRQA 2JS2A 2K79A 3S8NA 1HJDA 2LJ1A 4RTUA 1O4HA 2CIAA 2KXCA 1NLOC 3GXXA 1UURA 2LNWA 3NPFA 1O45A 1S1NA 3NHNA 1H8KA 1BKLA 1Z3KA 4R0KA 2DJQA 4P9ZA 1NYGA 3EG2A 2DL5A 1O4CA 1W6XA 1O4BA 4J9EA 2DLPA 1MV3A 2CR4A 2O9SA 4F5AA 3R6NA 1O44A 4OMNA 1AYBA 1HSQA 4AG2C 2AOBA 1AWJA 2J6KA 3LH5A 2K3BA 3O5ZA 2L3TA 3WA4A 2MC1A 2A28A 2HCKA 3PVLA 1BBZA 2GTJA 1LKLA 1JXOA 2AUGA 2HDXA 4F5BA 2EYZA 3H0IA 5IBMA 1ZUKA 1Z9QA 3VS7A 4RTVA 2DE0X 1OO4A 2E5KA 1KSWA 2LX7A 3IN7A 4H1OA 2EYVA 2RQRA 2MCNA 2YUNA 1WXTA 4LUDA 1I1JA 2AZVA 1AOTF 5EELA 4Y92A 1SEMA 1BKMA 1O4PA 4OHDA 5GJHA 1KJWA 2GQIA 1M3BA 2KRSA 2CI8A 3VROA 1YVLA 1ZUUA 2O9VA 1UG1A 1O4RA 3CBLA 2IUIA 5HCKA 3BUMB 2LCTA 2JMCA 4GL9E 3C0CA 1OOTA 2DBMA 3CWGA 3IMJA 4Z8AA 4K11A 5FW9A 1E6HA 1E6GA 2MQIA 4RTXA 4OHEA 1HD3A 3N84A 1A81A 1TUCA 2IZVA 2QDLA 1SHAA 3VRYA 4OHLA 3TL0A 1K0XA 4EIHA 2HDAA 3M0RA 1F2FA 1ZUYA 1MV0B 2JT4A 2EO6A 2KEAA 4OMLA 3US4A 4K45A 2M51A 4IIOA 2RPNA 1JYQA 2A37A 3RNJA 1M3CA 1AYDA 2D1XA 1G83A 2CH4A 2DBKA 2H8HA 1BMBA 1WA7A 1W1FA 2B3OA 3PJPA 4J9CA 1O41A 1IO6A 1AZEA 1NZLA 2L4KA 2DL3A 1VYTA 1UUSA 4FSSA 3VS1A 4ROJA 1ZSGA 2KK6A 1T0JA 4LUEA 5GJIA 3IQLA 5FWBA 4JGHA 2L3QA 2CSIA 2L0AA 2MRKA 3I35A 4HVWA 5DC0B 2XMFA 2HUWA 2C0TA 1QWFA 4AG1C 2RORA 2LCSA 3BUWB 5KAZA 1XOVA 3VS6A 2DM0A 2OI3A 3EHQA 1CSZA 2A36A 2CUBA 5IHNA 1JU5A 4F59A 2DYBA 2ROTA 1YWOA 3KFVA 5HKZA 3VGOA 1TCEA 2KBTA 2XP1A 2KYMA 1KA6A 2B86A 2YSXA 1F1WA 4JJBA 3PSKA 2EYWA 4RTWA 1PKSA 3H0HA 1M27A 2CT4A 2YDLA 1ZBJA 3PS5A 1OPLA 1UDLA 4OMMA 4J9HA 4OMQA 4QSYA 2EU0A 1M3AA 4F14A 3QWXX 1IJRA 2ABLA 2KNBB 5EG3B 1BLKA 4XZ0A 2HBWA 2FCIA 3OVEA 2BZ8A 1M27C 1XA6A 1FYNA 1O4DA 3CQTA 4P9VA 1HCTB 4LNPA 2DMOA 2F2VA 2I0NA 4AFSC 2OZOA 4NWFA 2M0YA 4OHHA 1AWXA 3H41A 1PRLC 1WYXA 2RN8A 1V1CA 1SHFA 5GJVB 2NWMA 2D8HA 4X6SA 1O4LA 4CC3A 1SKJA 1SSHA 2DX0A 1GRIA 3C7IA 2CRHA 2GNCA 5IHKA 1X69A 2DL8A 1MILA 1BFJA 4FL2A 5I22A 3REAB 1UTIA 1D4TA 1GCQA 1RI9A 1T3SA 2FRYA 4M4ZA 1KFZA 1O4JA 2HDVA 1NEGA 2MOXA 2X3WD 2CT3A 1GFCA 2BZYA 2RMXA 3CXLA 5EC7A 3GXWA 2EBPA 4K44A 5EEQA 3UATA 2EPDA 1TZEE 4L1BB 1A08A 4OMOA 4RUGA 1WQUA 2DL7A 1SPKA 1YCSB 4LE9A 2EW3A 1BM2A 1Y57A 2AKLA 2DM1A 1LUKA 1PWTA 3U23A 1GCQC 3I5RA 2K79B 1QKXA 2DA9A 1AVZC 2O2OA 4Z88A 1YP5A 2EYYA 2EOBA 4ESRA 4AFQC 2LNXA 4D8KA 1RUWA 4J9FA 3PLFB 4FL3A 1O4QA 1W70A 2MK2A 4HVUA 1RPYA 2YUOA 2FEIA 2ECZA 1M61A 2CS0A 3N7YA 3EG0A 1UUEA 1O49A 1PHTA 1X6GA 4XZ1A 1A1CA 1NYFA 1JXMA 1A1AA 2MIOA 1TG0A 1GBRA 2JYQA 2EVRA 2C9WA 1CKBA 1R1QA 1I07A 2AOAA 1O43A 2AKKA 1SRLA 1WFWA 3EHRA 1WIEA 1FMKA 2L3SA 5I6VA 1PICA 5AXIA 2YU7A 2DILA 2DVJA 4A4CA 2FPEA 2SRCA 3VRRA 3VS0A 2PNIA 3PE0A 1JWOA 2C0OA 3IMDA 3SEMA 1QADA 1U5SA 2L2PA 4JZ3A 4LN2A 4CC2A 2GGRA 3UA7A 1LUMA 1E7OA 2EGEA 1O4AA 1QG1E 3RBBB 1M30A 3HCKA 1CSYA 1LUIA 3IN8A 4J9BA 1BU1A 1JQQA 3SHWA 2SEMA 2X3XD 2KYBA 4OMPA 1AYCA 3VRPA 2KNOA 2V1QA 3VS5A 1O47A 2VKNA 2ECDA 2SHPA 3OB2B 2CREA 2KE9A 5FWCA 3S8LA 2RQUA 4NWGA 3GQIB 3HHMB 3K2MA 1O4GA 3JV3A 2VIFA 4U1PA 3MXYA 5EHPA 1YNZA 1ABQA 2G6FX 3VS2A 1FU5A 1UECA 1O4NA 2HMHA 3ZNIA 1FU6A 3CD3A 1AYAA 4D8DA 2IUHA 1O4KA 1JEGA 1AOJA 1KA7A 2KRNA 2JM8A 2JS0A 2EKXA 1I3ZA 2DCRA 1BF5A 1K76A 1QWEA 4DEXA 2EO3A 1JYUA 2EGCA 1UJ0A 3TSZA 4GPLB 5D0JA 1K4US 5CDWA 1BB9A 1BHHA 2ENMA 2JMAA 1J3TA 2RNAA 2GE9A 2KT8A 2KT1A 3T04A 1IS0A 4IIMA 1U06A 2PTKA 2W0ZA 1PKTA 5BO4A 1Y0MA 4WCIA 1SHGA 3EG1A 2J05A 1TUDA 4GLMA 1B3QA 2OJ2A 4RTTA 1Y1UA 1WXUA 2F2WA 1JU5C 2EQIA 2ESWA 2FRWA 5IXFA 1X43A 3PSJA 4RTZA 2A08A 1JYRA 1I0CA 2CDTA 3UA6A 1PNJA 1T3LA 2P4RA 1A1EA 1OO3A 1NG2A 3M0PA 1O4MA 1G2BA 2D0NA 2DL4A 3M0QA 1X2KA 2H5KA 1BLJA 1WI7A 1Z9ZA 3TVTA 1VYUA 3I5SA 1A1BA 2AZSA 2PZ1A 2FPFA 3VS3A 1CKAA 1CJ1A 1O48A 3BUOB 2K7AA 4ZNXA 2K6DA 4DGPA 1P13A 1NEBA 1HCSB 3HIZB 4J9GA 3ZL7C 2Y3AB 1VYVA 2MRJA 4ORZA 4TZIA 4QT7A 2OAWA 2LQNA 4JE4A 3MAZA 1NZVA 1GHUA 2J6FA 3UF4A 1CWEA 1X6CA 2KRMA 2RSYA 1O4EA 2PLEA 2CH4W 2ROLA 5HKWA 2J7IA 2O31A 3BKBA 4WWQA 2BBUA 2EKHA 1BHFA 1K9AA 3UYOA 1WDXA 4AFUC 1UHFA 1KIKA 2JTEA 2JW4A 1GL5A 1D4WA 2CSQA 3VRNA 1ZFPE 2IUGA 3M0UA 4AFZC 4JEGA 4H34A 1AOUF 3THKA 4CC4B 1X27A 3TKZA 3NGPA 4A63B 4JPBW 4E68A 1CSKA 3M0SA 1X0NA 2HSPA 2DX1A 4F16A 2GTOA 2RVFA 1BK2A 3H0FA 5IH2A 1GBQA 1LCJA 2F2XA 2J6OA 3REBB 2OQ1A 1AEYA 1NM7A 1RLPC 1AWOA 1GCPA 3KFJA 4E6RA 1O4OA 2EGAA 5L23A 1PRMC 3ULRB 2PLDA 2VVKA 3VS4A 2GSBA 5IHIA 1O4IA 3EGUA 4J9IA 5HKYA 1AWWA 1JO8A 2CI9A 4HVVA 3A98A 2IIMA 1T0HA 2Y1NA 1O4FA 2LZ6B 2ED1A 4FBNA 2LMJA 4Z89A 4A4BA 1YWPA 1NLPC 1U3OA 2KROA 1N5ZA 3QWYA 1YVHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DTHA 3FRNA 4LD6A 1M90U 1BG1A 3EH1A 3KBGA 4U17A 2CZ7B 3M7FA 2DRMA 2KR3A 4HCBA 3EAZA 2JZ2A 3PQZA 4FYYB 2JM9A 1G3TA 2RQWA 3C94A 4A4EA 4NOYA 1SPSA 1UE9A 3ZFJA 2FPDA 2RQVA 4JRQA 1KC2A 2DEQA 2HL5C 4JZ4A 2DF6A 2Y4YA 2K5FA 4OGCA 5D6XA 5I2MA 1BIBA 1SRMA 4QW2A 8AT1B 2K5LA 2RQTA 3CMET 3G4ST 2LQWA 3JCMc 1OV3A 5GAMf 1G8XA 3EG3A 3BUXB 3ZBDA 1EFNA 2DLYA 1VQ6T 1QVPA 4JLIA 1H3HA 5AULA 1LKKA 2EAYA 1RAEB 3EFOB 3OYFA 1S72T 3A8MB 4BY6C 1RACB 2LRAA 2QA4Q 4ZN3A 2FG0A 4BE1A 3QYHB 2Y1MA 1AD5A 4C8QF 4R55A 2K57A 2DRKA 4BDYA 1UFFA 3JCMe 2CP0A 1FHSA 2WSFE 2NUTA 2GBQA 2FVUA 1WPYA 4IUVA 2DFUA 1R1PA 3FLGA 4HCKA 2P84A 2JXBA 1WXBA 4RTYA 1KHIA 1RL2A 2E3HA 2DPPB 1WLPB 3OYIA 2DK3A 2J06A 5GAN6 3TREA 4N4GA 2W10A 2DTOA 1FBZA 4FL6A 4EMHA 2QMSA 5LJ3f 4F17A 4JS4A 1SPRA 4B9XA 5KH6A 4M78C 2KXCA 4FU6A 1WNLA 2LNWA 3H9NA 1K8AC 1B7TA 1S1NA 3WVEB 1JRIA 4QVZA 1BKLA 4P9ZA 1ACMB 3GP8A 2NUPB 1O4BA 4J9EA 3HKSA 2DLPA 2KQWA 4QVDA 4F5AA 2DD5A 1HSQA 4AG2C 4LDXA 4Y91A 1AWJA 2J6KA 2E64A 3LH5A 5GAOq 4M75A 2A28A 5IT9E 2EYZA 3RUXA 1WHLA 4RTVA 2DE0X 1IXDA 2HAXA 1D1AA 2EYVA 4DOVA 1AOTF 1VQ4A 5EELA 4Y92A 1SEMA 4OHDA 2X51A 4OB1B 3TEEA 3VROA 4L59A 1ZUUA 2LCCA 5KCHA 2IG0A 5CK9A 2M16A 3IMJA 2B8AA 4K11A 1VUBA 3EGXA 4X9DA 5J39A 2K3YA 4RTXA 1M1KC 2MQIA 1G3WA 1HD3A 2X35A 3R6OA 2EJGA 2IZVA 2QDLA 1K0XA 5GAN7 3M0RA 1ZUYA 1MV0B 2JT4A 3MO8A 1WGSA 2K2VA 3QHSA 1JYQA 2A37A 3RKWA 2D1XA 4PKCC 1WJRA 2CH4A 1OX9A 3L2QA 4FYWB 3LH0A 2QQAA 2GCXA 2CP7A 1UUSA 3TCJA 3VS1A 3QDFA 5A0DA 1T0JA 4C92G 5FWBA 1LNXA 4L6V5 2MRKA 4OB2B 3X20B 2XIDA 3OYBA 5DC0B 4M75F 2MAMA 2C0TA 1QWFA 5KAZA 3VKIA 3VS6A 1R8OB 3CPFA 4A53A 4C0ZA 2LT1A 4TVRA 4FYVB 1JU5A 1YWOA 2ZPIB 2KYMA 3OW2S 2XK0A 1F1WA 3PSKA 2RJCA 2QGFB 2QA4T 4M78D 4X34A 3RR6A 3HL8A 1M27A 2YDLA 1ZBJA 2RHYA 1OPLA 3PS5A 2CZ1B 4J9HA 4QSYA 2YRDA 3JCMQ 3OYAA 3L42A 1BLKA 2HBWA 3CCJQ 2FCIA 5GAOr 3OVEA 2BZ8A 3JRZA 1M27C 3EG9A 2HBPA 1Q81U 3CCQQ 3V8LA 3CQTA 4P9VA 5KYXB 3VUBA 4NWFA 1ZHIA 2D9TA 1VQLQ 2AHJB 4PJOE 3MCAB 1SKJA 1FX7A 1SSHA 4BI8B 4GY5A 4MZPA 4XTXA 4PJMA 2OTJA 2CRHA 2GNCA 2DL8A 3REAB 1D4TA 1T3SA 2HDVA 3CCEA 1KFZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1O4E A;  2PLE A;  2CH4 W;  2ROL A;  5HKW A;  2J7I A;  2O31 A;  3BKB A;  4WWQ A;  2BBU A;  2EKH A;  1BHF A;  1K9A A;  3UYO A;  1WDX A;  4AFU C;  1UHF A;  1KIK A;  2JTE A;  2JW4 A;  1GL5 A;  1D4W A;  2CSQ A;  3VRN A;  1ZFP E;  2IUG A;  3M0U A;  4AFZ C;  4JEG A;  4H34 A;  1AOU F;  3THK A;  4CC4 B;  1X27 A;  3TKZ A;  3NGP A;  4A63 B;  4JPB W;  4E68 A;  1CSK A;  3M0S A;  1X0N A;  2HSP A;  2DX1 A;  4F16 A;  2GTO A;  2RVF A;  1BK2 A;  3H0F A;  5IH2 A;  1GBQ A;  1LCJ A;  2F2X A;  2J6O A;  3REB B;  2OQ1 A;  1AEY A;  1NM7 A;  1RLP C;  1AWO A;  1GCP A;  3KFJ A;  4E6R A;  1O4O A;  2EGA A;  5L23 A;  1PRM C;  3ULR B;  2PLD A;  2VVK A;  3VS4 A;  2GSB A;  5IHI A;  1O4I A;  3EGU A;  4J9I A;  5HKY A;  1AWW A;  1JO8 A;  2CI9 A;  4HVV A;  3A98 A;  2IIM A;  1T0H A;  2Y1N A;  1O4F A;  2LZ6 B;  2ED1 A;  4FBN A;  2LMJ A;  4Z89 A;  4A4B A;  1YWP A;  1NLP C;  1U3O A;  2KRO A;  1N5Z A;  3QWY A;  1YVH A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1CWD L;  2L3P A;  2ETZ A;  3PFV A;  1VA7 A;  1BG1 A;  1A09 A;  5I11 A;  5J3X A;  2L6K A;  2LP5 A;  4U17 A;  3M7F A;  2BTT A;  2DRM A;  2KR3 A;  2V1R A;  2NUZ A;  2LNH B;  3EAZ A;  3NMZ C;  2PNA A;  3PQZ A;  4K2R A;  1WX6 A;  2JM9 A;  2RQW A;  5IXB A;  3VRZ A;  1D1Z A;  1X6B A;  3OP0 A;  1SPS A;  2CUD A;  1UE9 A;  3I9Q A;  1MUZ A;  2FPD A;  2RQV A;  1KC2 A;  1NRV A;  2BZX A;  1OEB A;  3OV1 A;  1M8M A;  4JZ4 A;  1AB2 A;  1O46 A;  2DF6 A;  1OPK A;  1YN8 A;  2HEQ A;  2VWF A;  1LCK A;  1MW4 A;  2RF0 A;  1UGV A;  1SRM A;  2FO0 A;  2KXD A;  5ECA A;  1AZG B;  1K0S A;  1FBV A;  5DF6 A;  4X1V A;  3TSW A;  5GJW B;  4JJD A;  2AK5 A;  2RQT A;  3OB1 B;  2LQW A;  2LJ3 A;  1OV3 A;  2C0I A;  1UHC A;  4J9D A;  1RJA A;  3EG3 A;  3BUX B;  2ED0 A;  1B47 A;  3S9K A;  1EFN A;  1K1Z A;  2EYX A;  4DEY A;  2DLY A;  1H92 A;  1ABO A;  1H3H A;  1RLQ C;  5AUL A;  1LKK A;  2YT6 A;  2KGT A;  2DNU A;  1LUN A;  5IBS A;  4KRT A;  1A07 A;  2RMO A;  3FJ5 A;  4CC7 A;  1H9O A;  2D8J A;  1FYR A;  3BUN B;  3M0T A;  2O88 A;  4EIK A; 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