1X27A

Crystal structure of lck sh2-sh3 with sh2 binding site of p130cas
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
NLVIALHSYEPSHDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular basis for regulation of Src by the docking protein p130Cas
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase LCK
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 163
sequence length 163
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2005-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1x27A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1x27A02
1X27A 2K7AA 3GXWA 4AG1C 2AZSA 1AZGB 1LKKA 2RN8A 3H0FA 2YUNA 4ROJA 1AB2A 1KSWA 1FBVA 4RUGA 2MIOA 1B3QA 1AYDA 3K2MA 2DRKA 5IH2A 1U5SA 1KIKA 1O4HA 1CWEA 5AULA 2KGTA 4FL3A 2ESWA 5FWBA 2DA9A 5BO4A 1QLYA 2GQIA 3H0IA 3CWGA 3REAB 1BLKA 5IHKA 5I11A 3PSJA 1BFIA 1I07A 4RTTA 2AKKA 3EG1A 1OO4A 2J7IA 1T3LA 1UGVA 3VS0A 2W0ZA 1RPYA 2DRMA 1JYQA 1GCPA 5D0JA 2KRSA 1NRVA 2JXBA 1QKXA 2DVJA 3PFVA 2KRNA 4Z89A 1ZBJA 1WX6A 2P4RA 1O4GA 1A09A 2KXCA 1BHHA 2AZVA 1YP5A 1ZLMA 2H5KA 3FJ5A 1NLPC 4F17A 2GTOA 2DBMA 5EHPA 4JEGA 2MOXA 4JE4A 2JT4A 1SHBA 3EACA 3R6NA 2IIMA 2DX0A 1AOUF 2ROTA 1MW4A 2J6OA 2JS2A 3IMJA 3EHQA 2HDAA 5IBMA 3EAZA 1CKAA 2DL3A 1T3SA 2K3BA 1JU5C 2K79B 1LUIA 1LUNA 1O42A 2B3OA 2L4KA 3TKZA 1O4KA 1HSQA 2PNAA 1QADA 2CSQA 2FPEA 4CC7A 1O4MA 5GJHA 2KYMA 3EG2A 5GJWB 1CSZA 4U1PA 4F59A 4EY0A 2ED1A 1MUZA 3GQIB 1ABOA 2HDVA 3VRYA 2CI9A 3M0TA 3NPFA 4XZ1A 2HUWA 2YT6A 3H0HA 1BKMA 3EGUA 3LH5A 2O9VA 1K0SA 5IBSA 3VRRA 4FSSA 1ABQA 2EYXA 2CT3A 2MC1A 5DC9A 3M0SA 1JXMA 2A08A 3M7FA 2EYVA 4DEXA 1T0JA 2EGEA 4RTXA 2RMOA 2DBKA 3KFVA 2CH4A 5J3XA 2DLZA 2RORA 2J6KA 1GRIA 2OZOA 2L0AA 4D8KA 2Y3AB 3MAZA 2H8HA 1PHTA 1RJAA 2Y1NA 1NEGA 1SSHA 2EKHA 5EC7A 3PSKA 5FW9A 5DC4A 2ECZA 5EEQA 4RTYA 3CXLA 4J9EA 2M51A 1KA6A 4OHLA 2ECDA 4GLMA 2KRMA 3ULRB 2YSQA 1M61A 1O4DA 4CC2A 4R0KA 1VYTA 1I0CA 2GNCA 4E68A 1AD5A 4AFQC 2OJ2A 1OPLA 3VRNA 2LJ3A 1EFNA 1O4NA 2ENMA 1K9AA 2HEQA 1FBZA 2A28A 1UDLA 2AKLA 1X2QA 1OOTA 3PQZA 3N7YA 3OV1A 1NG2A 4JJDA 1A08A 3HIZB 3C0CA 2EGAA 5AXIA 2BTTA 3BKBA 1NM7A 1FU6A 3VS2A 2RQWA 1AOJA 4X6SA 5HKZA 1SHFA 2FCIA 1MILA 2KNBB 2DL7A 4A63B 2CDTA 4IIOA 1AYBA 3GXXA 5KAZA 2FPDA 1RUWA 3M0PA 4LUEA 4ORZA 2L3SA 1K0XA 1R1QA 1BHFA 4EIHA 2KROA 2A36A 2EYWA 2SHPA 1TUDA 1P13A 2KT1A 2DM1A 4LNPA 1QWFA 1O46A 3TSWA 2DE0X 4OHIA 1X0NA 2KYBA 2ED0A 5DC0B 1QG1E 1K1ZA 3GBQA 1O48A 3OB1B 1WIEA 2ETZA 3BUWB 2KNOA 2F2VA 4FBNA 1M8MA 2G6FX 1O43A 4P9ZA 1JYUA 1CWDL 1H92A 4AFSC 1U06A 1UUSA 2HCKA 5DF6A 1JU5A 2OQ1A 2BZ8A 1LUKA 2LZ6B 2OI3A 4OHDA 4OMNA 2DL4A 1GCQC 1A0NB 2RQTA 4OHHA 1M3AA 2KBTA 1O4OA 1GFCA 1H8KA 2EPDA 4JZ3A 2L3TA 4K45A 1IO6A 1YNZA 1A1CA 4P9VA 3S8NA 1U3OA 4RTUA 4A4BA 2CR4A 2CUBA 3EHRA 3ZL7C 1WYXA 1HJDA 2LQWA 4X1VA 2AUGA 1YCSB 2C0OA 3VS4A 2LNXA 2PLEA 4H34A 2K9GA 3VS6A 4OMLA 2CUDA 2CS0A 2V1RA 3REBB 2B86A 3OB2B 1UJ0A 2JM9A 2CT4A 3PJPA 2HSPA 4IIMA 1OPKA 5HCKA 2MCNA 1HCTB 4E93A 3VRPA 3H41A 1Y1UA 1FU5A 1BKLA 1O44A 1ZX6A 1ZFPE 4WWQA 1BMBA 1B47A 1W70A 4H1OA 3EG0A 2EU0A 1T0HA 2LCTA 1O4JA 1BU1A 3IN7A 2FEIA 2EL8A 3NHNA 1ARKA 1TG0A 1O4QA 2CH4W 1X6CA 2MRJA 4RTZA 2KR3A 1TUCA 2C9WA 1Z9ZA 4ESRA 1MV0B 1J3TA 1NLOC 2FG0A 2EYYA 1M30A 3PVLA 3N84A 2L6KA 2D8HA 2LNWA 1K4US 2BZYA 1NYGA 1PKTA 2SEMA 2OAWA 3BUMB 2VKNA 2YUPA 5HKYA 3EG3A 1M27C 2D1XA 1O47A 1Y0MA 3O5ZA 3TL0A 4U17A 2NWMA 3RBBB 4HVUA 4NWFA 2FPFA 1AWWA 2LP5A 1LKLA 4JGHA 2JS0A 1RQQC 2IZVA 1AWXA 2FRYA 1UURA 1CSYA 1UECA 1Z3KA 3UATA 1O4FA 2J05A 3OP0A 3VS3A 3BUOB 3QWYA 4AFZC 3CD3A 2GSBA 1NEBA 2F2WA 3RNJA 1WI7A 4OMOA 4GBQA 1QCFA 1H3HA 1BK2A 1HCSB 2QMSA 1TZEE 4F14A 4J9GA 4AFUC 1O4PA 4K44A 1E7OA 1S1NA 4DGXA 4JJBA 1KFZA 2GGRA 3THKA 2J6FA 1IJRA 2EW3A 3MXCA 2W10A 1NZVA 2CBLA 4OMMA 3N8MA 2DNUA 4OMPA 2VWFA 1O4AA 1R1PA 3T04A 1RLQC 1GHUA 1PKSA 2K79A 4QSYA 1CKBA 2AOBA 1SRLA 2EKXA 2IUHA 4GWFA 1GCQA 3PVQA 3JV3A 3NGPA 4L1BB 2IUIA 3US4A 1GBRA 4AG2C 4J9DA 2DYBA 4D8DA 2LJ1A 1PWTA 2RVFA 1X6BA 1WXBA 1JO8A 2HMHA 2PLDA 2EVRA 2AK5A 2I0NA 1O4LA 2E5KA 1D4TA 1O4RA 2LNHB 1F1WA 1ZSGA 1PRMC 1UHFA 1IS0A 1AWOA 1JXOA 1O4BA 1BB9A 1A1EA 1D1ZA 3UA7A 5IXFA 1D4WA 2YU7A 1GFDA 3SHWA 1O45A 2JMCA 1NYFA 1I3ZA 1QWEA 2HDXA 1BF5A 5IHNA 4EIKA 1NZLA 1BHHB 1V1CA 1VYVA 2O31A 1MV3A 4LUDA 1AEYA 2JYQA 1X6GA 2ABLA 1KC2A 4K2RA 2DMOA 2MRKA 3PLFB 1UJYA 1Y57A 3UYOA 1SHAA 1SRMA 1AZEA 2BBUA 2QDLA 2SRCA 1PICA 1BM2A 1ZUUA 3M0QA 2YUQA 3M0UA 4Y92A 3I5SA 2J06A 2FRWA 1YVLA 1LCKA 4RTVA 4F5BA 4F16A 1QKWA 2L2PA 1ZUYA 3U23A 3I9QA 3BUNB 1A1AA 1M27A 5IHIA 2CREA 4K11A 1AWJA 1SKJA 3S8LA 4JPBW 2EYZA 2DF6A 3I35A 2RNAA 1N5ZA 3S8OA 1WXUA 1UE9A 5EHRA 1PNJA 5FWCA 1SHGA 4LN2A 1BBZA 1O4EA 1G83A 2X3XD 5EG3B 3A98A 2DLYA 1WFWA 2PNBA 1WQUA 1WXTA 4GPLB 3SEMA 3MXYA 2YSXA 4J9FA 1CJ1A 3QWXX 1SPSA 1R1SA 2BZXA 2D8JA 3UA6A 4F5AA 1FYNA 2CSIA 1FYRA 1UHCA 1BFJA 2DLPA 2K2MA 1YVHA 1F2FA 2JTEA 2EBPA 5L23A 2DL5A 2M0YA 1JEGA 2FO0A 1O49A 2GE9A 2DL8A 1YWPA 2LCSA 1G2BA 1Z9QA 1O41A 1E6GA 5GJVB 2PNIA 2CI8A 1WLPB 1TCEA 1B07A 4A4CA 4DGPA 1JQQA 3IMDA 1OO3A 1VYUA 3VS7A 4CC4B 1K76A 1JWOA 2L3PA 2CIAA 2JMAA 1JYRA 2RMXA 4OHEA 1GL5A 4OMQA 1RI9A 2RSYA 4JJCA 5ECAA 2VVKA 2K6DA 1AYCA 1XOVA 3S9KA 4E6RA 3VGOA 5I6VA 5GJIA 2C0IA 1X2KA 1UG1A 1RLPC 4KRTA 1BG1A 1SPKA 2YDLA 2GBQA 2F2XA 1GBQA 2PTKA 4HXJA 1AOTF 1SPRA 2EO6A 1FMKA 2DILA 1XA6A 3PS5A 2EOBA 1WA7A 4XZ0A 1O4CA 4GL9E 2LQNA 3OVEA 2L3QA 2A37A 3HCKA 4M4ZA 1YN8A 5CDWA 2KT8A 2EQIA 1UTIA 2ROLA 3VS1A 1E6HA 1FHSA 2RQUA 4CC3A 1YWOA 4QT7A 2DCRA 1KA7A 2D0NA 4J9HA 3M0RA 1M3CA 5HKWA 1I1JA 2DX1A 1UUEA 1BLJA 2K7AB 5I22A 3KFJA 2RPNA 2DJQA 1SEMA 1A81A 3VRQA 3NMZC 1SHDA 2VIFA 4NWGA 3C7IA 3PE0A 3IN8A 1WDXA 1X43A 3UF4A 2KEAA 3VROA 4HVWA 2C0TA 1KJWA 2MK2A 2YUOA 5IXBA 1LUMA 4Z88A 2O9SA 1VA7A 3TVTA 5EELA 1CSKA 2LMJA 2V1QA 1PRLC 4J9IA 2RQRA 2H46E 2NUZA 2EO3A 2LJ0A 1A1BA 1UFFA 4LE9A 2PZ1A 4WCIA 3CQTA 2RQVA 2CRHA 4J9CA 4J9BA 3I5RA 1AYAA 2KK6A 2KE9A 2X3WD 3VRZA 4RTWA 1ZUKA 2AOAA 2O88A 2KXDA 4DEYA 3HHMB 1W6XA 2RF0A 1W1FA 3TSZA 2HBWA 2DM0A 1O4IA 1M3BA 4HCKA 4FL2A 4JZ4A 1H9OA 1A07A 1AVZC 3CBLA 2XP1A 2O2OA 1OEBA 4TZIA 2MQIA 2JW4A 2XMFA 3VS5A 3WA4A 4Z8AA 2LX7A 4HVVA 1X69A 2Y1MA 3BUXB 2EGCA 1OV3A 2JM8A 2IUGA 4ZNXA 1LCJA 3IQLA 3ZNIA 2GTJA 1HD3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2COZA 2DFUA 2AZSA 3P8HA 2RN8A 3JCMe 4RUGA 2DRKA 1NZ9A 1JBMA 4O5VA 4OB2B 1CWEA 5AULA 4FL3A 2QA4T 3M55A 2GQIA 4FYXB 3REAB 3OW2S 1BLKA 1HK9A 3CD6Q 4M7DD 2COWA 4RTTA 2AKKA 2QXFA 3EG1A 3V7SA 1RPYA 3CPWA 3RR6A 1JYQA 5D0JA 4JRIA 1QKXA 3G4SQ 2DVJA 3PFVA 2HQHA 2H3EB 4Z89A 1ZBJA 5CO7A 4KBMB 4BDYA 4HCBA 1A09A 2KI7A 2CP2A 4F17A 1TTHB 5EHPA 2HSEB 2JT4A 4OF1A 3EACA 3I56T 3JCMV 3P8DA 4EMGA 2EQJA 1K8AU 2L5QA 2QAZA 4B9WA 1CKAA 2K3BA 2D9TA 4JLGA 1O42A 2ZPBB 4RKUE 3LWHA 2DYIA 4F59A 4EY0A 4OMFB 2XIDA 1Q86C 3ASKA 2YT6A 5A0DA 1K0SA 2XKOC 5IBSA 3VRRA 4FSSA 1ABQA 3RDVA 2EYXA 1ZQ1A 5DC9A 2HBPA 3M0SA 4E2FB 3M7FA 4L5GA 3CXCA 2RMOA 2CH4A 3FJPA 2DLZA 2XI9A 3CEYA 1EZZB 1PHTA 1RJAA 4E7KA 2ZPIB 2EKHA 3PSKA 1ZSZB 1VQ9A 1W2BP 1WHKA 3VYGA 2M51A 5GANh 2KRMA 2DZCA 1VYTA 4DBRA 1AD5A 2PVOB 2OJ2A 1VQLT 1OPLA 1EFNA 3OYMA 4M77G 2ENMA 1FBZA 2E12A 1UDLA 2AKLA 3PQZA 3TCJA 3OV1A 1VQ4A 4JJDA 2HL3A 5AXIA 2EGAA 2RK2A 5KYNA 1NM7A 1FU6A 1VQOA 1SHFA 4M7DF 1BI0A 1MILA 4A63B 2CDTA 4LUEA 1K0XA 1R1QA 1BHFA 2VGMA 2HL5C 4UC4A 3OMGA 4J7FA 1IREB 3VV0A 2DM1A 4LNPA 2DE0X 2CZ7B 2FVUA 3GBQA 1WIEA 5D6WA 2KNOA 4Y28E 3E9FA 1Y71A 2K3YA 3VYHB 2PU9B 3A8MB 2HCKA 2OQ1A 4PJOG 2LZ6B 1A0NB 3URGA 3V8JA 3X24B 2DAQA 2DTIA 2KBTA 1O4OA 1VQ6A 4K45A 1QMCA 3CCQA 3S8NA 1IO6A 1V76A 2NYSA 5LJ5h 3EHRA 1WYXA 2LQWA 4X1VA 3VKIA 3CPWS 1RAHB 3VS4A 2K9GA 5LJ3g 4BACA 4OB0B 4PJOE 3E2UA 2V1RA 2B86A 3OYJA 2JM9A 3Q1JA 3M57A 2HSPA 4IIMA 1O75A 3RMQA 1Y1UA 1O44A 3CCEQ 3CCLA 1ACMB 2V8KA 1ZFPE 4WWQA 1W70A 5CIUA 4E47A 3IN7A 1YJNA 2EL8A 3NHNA 1O4QA 2MRJA 4M77D 2JJ9A 4RTZA 2LX9A 1Z9ZA 2CYZB 2QQAA 4C92C 3OY9A 1MV0B 1NLOC 1M30A 3OS0A 4AT1B 2D8HA 2LNWA 1K4US 3CBPA 1NYGA 2SEMA 2VKNA 1VQ5A 2GFAA 4U17A 3BW1A 4NWFA 2FPFA 3TQ7P 2JS0A 4EDUA 1UURA 4F7UG 1Z3KA 3UATA 1RL2A 3OP0A 4J6XA 4A54A 3CXCS 2FYKA 5GAMg 3JCMJ 3CD3A 1NEBA 4OVAA 4JJNK 1QCFA 1BK2A 2QMSA 2E70A 4PJOD 4PFPA 4AFUC 4E7IA 1LVKA 4PKCC 4DGXA 3JCMf 4M7AB 3THKA 4LDWA 3OYIA 2EW3A 3MXCA 5KYYB 3QUIA 1QCOA 2VWFA 2QYZA 3T04A 1VQNQ 2K79A 1CKBA 3JCMW 1WJRA 4IUQA 2EJGA 4WTOB 2IUHA 2RD1A 2E65A 4GWFA 2XK0A 3PVQA 3P8BB 4KUIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5L23 A;  2DL5 A;  2M0Y A;  1JEG A;  2FO0 A;  1O49 A;  2GE9 A;  2DL8 A;  1YWP A;  2LCS A;  1G2B A;  1Z9Q A;  1O41 A;  1E6G A;  5GJV B;  2PNI A;  2CI8 A;  1WLP B;  1TCE A;  1B07 A;  4A4C A;  4DGP A;  1JQQ A;  3IMD A;  1OO3 A;  1VYU A;  3VS7 A;  4CC4 B;  1K76 A;  1JWO A;  2L3P A;  2CIA A;  2JMA A;  1JYR A;  2RMX A;  4OHE A;  1GL5 A;  4OMQ A;  1RI9 A;  2RSY A;  4JJC A;  5ECA A;  2VVK A;  2K6D A;  1AYC A;  1XOV A;  3S9K A;  4E6R A;  3VGO A;  5I6V A;  5GJI A;  2C0I A;  1X2K A;  1UG1 A;  1RLP C;  4KRT A;  1BG1 A;  1SPK A;  2YDL A;  2GBQ A;  2F2X A;  1GBQ A;  2PTK A;  4HXJ A;  1AOT F;  1SPR A;  2EO6 A;  1FMK A;  2DIL A;  1XA6 A;  3PS5 A;  2EOB A;  1WA7 A;  4XZ0 A;  1O4C A;  4GL9 E;  2LQN A;  3OVE A;  2L3Q A;  2A37 A;  3HCK A;  4M4Z A;  1YN8 A;  5CDW A;  2KT8 A;  2EQI A;  1UTI A;  2ROL A;  3VS1 A;  1E6H A;  1FHS A;  2RQU A;  4CC3 A;  1YWO A;  4QT7 A;  2DCR A;  1KA7 A;  2D0N A;  4J9H A;  3M0R A;  1M3C A;  5HKW A;  1I1J A;  2DX1 A;  1UUE A;  1BLJ A;  2K7A B;  5I22 A;  3KFJ A;  2RPN A;  2DJQ A;  1SEM A;  1A81 A;  3VRQ A;  3NMZ C;  1SHD A;  2VIF A;  4NWG A;  3C7I A;  3PE0 A;  3IN8 A;  1WDX A;  1X43 A;  3UF4 A;  2KEA A;  3VRO A;  4HVW A;  2C0T A;  1KJW A;  2MK2 A;  2YUO A;  5IXB A;  1LUM A;  4Z88 A;  2O9S A;  1VA7 A;  3TVT A;  5EEL A;  1CSK A;  2LMJ A;  2V1Q A;  1PRL C;  4J9I A;  2RQR A;  2H46 E;  2NUZ A;  2EO3 A;  2LJ0 A;  1A1B A;  1UFF A;  4LE9 A;  2PZ1 A;  4WCI A;  3CQT A;  2RQV A;  2CRH A;  4J9C A;  4J9B A;  3I5R A;  1AYA A;  2KK6 A;  2KE9 A;  2X3W D;  3VRZ A;  4RTW A;  1ZUK A;  2AOA A;  2O88 A;  2KXD A;  4DEY A;  3HHM B;  1W6X A;  2RF0 A;  1W1F A;  3TSZ A;  2HBW A;  2DM0 A;  1O4I A;  1M3B A;  4HCK A;  4FL2 A;  4JZ4 A;  1H9O A;  1A07 A;  1AVZ C;  3CBL A;  2XP1 A;  2O2O A;  1OEB A;  4TZI A;  2MQI A;  2JW4 A;  2XMF A;  3VS5 A;  3WA4 A;  4Z8A A;  2LX7 A;  4HVV A;  1X69 A;  2Y1M A;  3BUX B;  2EGC A;  1OV3 A;  2JM8 A;  2IUG A;  4ZNX A;  1LCJ A;  3IQL A;  3ZNI A;  2GTJ A;  1HD3 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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