3NHNA

Crystal structure of the src-family kinase hck sh3-sh2-linker regulatory region
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
DIIVVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATRKEGYIPSNYVARVDSLETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVKHYKIRTLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Tyrosine-protein kinase HCK
publication title Crystal Structure of the Src Family Kinase Hck SH3-SH2 Linker Regulatory Region Supports an SH3-dominant Activation Mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 31
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2010-06-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 3nhnA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 3nhnA02
3NPFA 1A1AA 2LQNA 4OHLA 1KIKA 3NHNA 2EVRA 3VS1A 1O4JA 1A1EA 1KA6A 3FJ5A 5IXBA 2MRJA 1T3LA 1ZX6A 1F1WA 4Z88A 2A36A 2JYQA 3UATA 1FYRA 1R1QA 2O31A 1QADA 4J9EA 2XP1A 1R1PA 2D8JA 2KROA 2HUWA 4H34A 3HCKA 2IIMA 1OEBA 1SSHA 1GHUA 1E6GA 4F16A 4JJDA 1HD3A 1K1ZA 1Z9QA 4K44A 3PJPA 3M0PA 1AVZC 2DX1A 1UJYA 4OMNA 2RSYA 4OHEA 1WIEA 4J9CA 1UGVA 1UUSA 2EU0A 1U5SA 2DL4A 1TCEA 4K11A 2FRWA 2AKKA 3OV1A 5FWBA 2L2PA 2F2WA 2OAWA 1UFFA 5HCKA 2C9WA 4L1BB 2CI9A 3RBBB 2J05A 3THKA 1O4HA 2MRKA 4F5AA 2L3TA 1WI7A 4RTWA 1P13A 2EKXA 1ARKA 1JWOA 4LE9A 5CDWA 2B86A 4OMMA 3M0UA 1PKSA 2JM9A 1Z9ZA 3SEMA 2JXBA 1YCSB 1T0HA 3VRYA 1WXUA 3VS2A 1BHHA 1CKAA 1AOUF 4QT7A 3BUXB 4JGHA 2K79B 1BLKA 2LP5A 1O4DA 1LUKA 1O4AA 1SPSA 2MQIA 2C0OA 2CREA 1LUNA 2ENMA 1GCPA 1LUIA 2RPNA 1RJAA 2YUOA 3RNJA 2EYVA 2BZ8A 2IZVA 5DC9A 2CDTA 2FPFA 2YDLA 1W1FA 3N7YA 3EG0A 1PKTA 3O5ZA 2LCSA 3EACA 2CSQA 2DL5A 4QSYA 3OP0A 2RMXA 2PNAA 4JPBW 2D0NA 4ROJA 2RQUA 1A08A 2K2MA 2KK6A 1ZBJA 4DGXA 2GE9A 1A09A 1M27C 2KRMA 1SPKA 1M27A 5AXIA 2ECDA 2CS0A 1UTIA 1HJDA 2SRCA 1SKJA 2DYBA 1YVLA 1X2QA 2LJ3A 2K3BA 3PFVA 4Z8AA 2YT6A 2J7IA 1NLPC 1QWFA 4JE4A 1VA7A 2FO0A 1O44A 1U3OA 1FBVA 5EELA 2JTEA 3IMJA 1UE9A 2IUHA 1SHFA 2DF6A 4AFQC 2EYZA 2HDAA 2O9SA 1VYUA 2D8HA 2PLEA 1WFWA 4GWFA 1M30A 3QWXX 1PWTA 4OMQA 3REAB 3M7FA 3PLFB 2CR4A 1AEYA 1BB9A 4EY0A 1OV3A 2OJ2A 1HCSB 2CT3A 1HCTB 2FRYA 2FG0A 2LMJA 2DBKA 2GGRA 4P9ZA 2SEMA 1KFZA 2AUGA 3M0SA 3UF4A 2H8HA 1KSWA 2DL7A 1M3CA 1B3QA 2EW3A 3IQLA 3U23A 4J9IA 4E68A 4XZ0A 5HKZA 1LUMA 4GL9E 1BK2A 2EGEA 2YUNA 4OMPA 2L6KA 3OB2B 1AB2A 1K76A 4IIMA 1O47A 1ZLMA 4HXJA 4X1VA 1NYFA 4E6RA 2GSBA 2X3WD 2O9VA 2OZOA 1BLJA 2DNUA 1TUDA 1ZUYA 4RTXA 1AZEA 1OPLA 1X6GA 2YU7A 2KT8A 1S1NA 2PLDA 4D8KA 1RQQC 2Y3AB 2JM8A 1I3ZA 5D0JA 2PNBA 2GQIA 2GTJA 1XOVA 1I1JA 4JZ4A 4OHDA 4XZ1A 1O49A 4ZNXA 2H46E 1YNZA 4D8DA 1KA7A 2NWMA 5GJWB 4LUEA 4F59A 3C0CA 3M0TA 4R0KA 1ABOA 3KFVA 5EHRA 4EIHA 2YSQA 3EG3A 2LJ1A 3I5SA 2V1RA 3VRQA 1BG1A 3BKBA 1JYQA 2KYBA 5KAZA 1BBZA 4RTVA 1O42A 4DGPA 1O4IA 2RORA 2DRKA 1N5ZA 5EG3B 3HHMB 2VKNA 1K9AA 2B3OA 3EG2A 4NWGA 2JT4A 3HIZB 1WLPB 1FMKA 4WCIA 2HSPA 1D4TA 4K45A 2A08A 3CBLA 1AWXA 1RLPC 2IUIA 3BUWB 2ABLA 5BO4A 1OPKA 2O2OA 4RUGA 2EQIA 3EHRA 1NRVA 3S8LA 1O43A 4RTUA 4FL2A 3GXWA 2ED0A 3VRZA 4HVWA 1VYVA 4EIKA 2PZ1A 4KRTA 2MC1A 1AOJA 4GPLB 1W6XA 1QKWA 1UHCA 1ZSGA 2L3QA 2IUGA 5ECAA 5IXFA 1UG1A 1NEGA 2Y1MA 5HKYA 4P9VA 5J3XA 3VS4A 1MW4A 2O88A 1V1CA 1J3TA 1A1CA 1AYCA 1WDXA 1X69A 1LKLA 1R1SA 5DC4A 2CH4W 2W0ZA 2EO3A 1RUWA 1MV3A 1E6HA 1X6BA 4HCKA 4RTZA 1NLOC 2CIAA 2MK2A 4OHHA 3VS5A 1Z3KA 2LNWA 2Y1NA 2EYXA 4JJCA 2EYYA 2LNXA 1G83A 1GBRA 2RMOA 4U1PA 2DLPA 2YUPA 2BTTA 3M0QA 3MAZA 3VROA 3KFJA 3VS3A 2AZVA 2KXDA 1M8MA 2JW4A 5I11A 3K2MA 2AK5A 1PHTA 2D1XA 1NG2A 3TSWA 3LH5A 3UA7A 2DLYA 1QWEA 2CSIA 2RVFA 4NWFA 1U06A 2L3SA 3VS7A 2HDXA 2KNBB 3SHWA 1RPYA 1QKXA 4HVUA 2MIOA 2K7AB 1ZUKA 3GQIB 1UECA 4AG2C 3VS6A 4AFSC 1LKKA 3ZNIA 1AWOA 3TKZA 5IBMA 2AZSA 1JU5C 1BU1A 1BFJA 2M0YA 1O4GA 1QCFA 2G6FX 2LCTA 1JU5A 3I5RA 2RQWA 1CWDL 1D1ZA 3I35A 1JYRA 3IN8A 2K79A 3H0IA 1UHFA 1JXOA 1O4RA 1NM7A 2CUDA 1Y1UA 1I0CA 4AG1C 1JYUA 1O48A 2DE0X 3MXCA 1X6CA 2FCIA 3CWGA 2EPDA 1UURA 1M61A 1O4PA 1NZLA 2W10A 1O4FA 2AOAA 3PS5A 2RQTA 4OMOA 1FBZA 1AWJA 1WA7A 1K0XA 5GJVB 2A28A 1AZGB 2DL8A 3TVTA 5IHKA 2J6KA 2KYMA 1OOTA 2LZ6B 4ORZA 2HCKA 4RTTA 1CWEA 4J9HA 1GRIA 1W70A 4E93A 5IH2A 4J9FA 1NZVA 4K2RA 1SHBA 1UDLA 2L3PA 2ROLA 3EGUA 2ECZA 1AYDA 4OHIA 2XMFA 2KT1A 2J06A 3PVLA 1I07A 2DA9A 2DBMA 2EBPA 2F2VA 2C0TA 2K7AA 4JZ3A 2LX7A 5IHIA 3REBB 3ZL7C 2PTKA 2HDVA 1BKMA 1XA6A 4X6SA 1IS0A 1QLYA 1YN8A 1GFDA 1A81A 3BUNB 2KEAA 3VRRA 2L4KA 2DX0A 2DLZA 4LN2A 1QG1E 1X0NA 1E7OA 1SRMA 1H92A 3VRPA 2JMAA 3CXLA 1O4CA 2VVKA 3PSKA 1TZEE 2I0NA 4AFZC 3OB1B 5GJIA 3PVQA 2JMCA 4F5BA 2GTOA 1ZFPE 1PRLC 1PICA 3CD3A 2GNCA 1JQQA 1AOTF 1GCQC 2ED1A 1BMBA 1GCQA 1SHGA 2DL3A 3JV3A 2JS0A 1BHHB 3MXYA 1CSZA 1M3AA 3ULRB 4RTYA 1H8KA 2EOBA 2QMSA 1FHSA 3S9KA 2KE9A 1CSKA 5DC0B 3VGOA 1CSYA 4Y92A 2GBQA 1YWPA 2DILA 1IJRA 1CJ1A 2KRNA 1SRLA 1FU5A 2OQ1A 1O41A 4FL3A 2KNOA 1K0SA 5IHNA 1BM2A 1Y0MA 4JEGA 3VRNA 4ESRA 4J9BA 4CC7A 1KJWA 3I9QA 3PE0A 2BBUA 2RN8A 2LNHB 4AFUC 3H41A 1PRMC 2QDLA 1SPRA 1X43A 1IO6A 2L0AA 1BFIA 2X3XD 1T0JA 4CC4B 2HEQA 1RLQC 4J9DA 1O46A 2KRSA 1G2BA 1AWWA 2EKHA 4GBQA 2EL8A 2MCNA 2CI8A 1WXTA 2VWFA 5HKWA 2PNIA 5FWCA 2P4RA 5L23A 2SHPA 1MILA 3M0RA 1NEBA 4DEYA 3BUMB 2HMHA 2AOBA 2RQVA 3NGPA 2ETZA 1EFNA 4FBNA 2ROTA 5I22A 2EGCA 1A07A 1SHAA 1BKLA 2KGTA 3TL0A 3EG1A 5GJHA 2DRMA 3R6NA 1GL5A 4TZIA 4A4CA 1X27A 2AKLA 4Z89A 4JJBA 3IMDA 1TUCA 2CUBA 1H3HA 4CC2A 2NUZA 4WWQA 2DM0A 1Y57A 1AD5A 2EYWA 2DM1A 1X2KA 2K9GA 3NMZC 2DVJA 2KR3A 4OMLA 1WQUA 2BZYA 1FYNA 2OI3A 3WA4A 5I6VA 4CC3A 1O4OA 4F14A 4IIOA 3N84A 4GLMA 3N8MA 1LCKA 2BZXA 2CH4A 2FEIA 2HBWA 2LQWA 2C0IA 3OVEA 2RQRA 2KBTA 1JO8A 1UJ0A 5EC7A 3S8OA 1O4LA 2MOXA 1BHFA 3T04A 2H5KA 1O4EA 1GBQA 4M4ZA 1YVHA 2DJQA 4A4BA 4LNPA 3GXXA 1K4US 1CKBA 1MV0B 3H0HA 1AYBA 3PQZA 1VYTA 2M51A 1O4BA 1HSQA 1O45A 5IBSA 3S8NA 3A98A 2YSXA 1A0NB 5FW9A 3VS0A 4A63B 1MUZA 1H9OA 3H0FA 1SHDA 1B07A 4LUDA 3EHQA 1O4QA 4H1OA 1B47A 2E5KA 3UA6A 1AYAA 2KXCA 1WXBA 1ABQA 1TG0A 1LCJA 3TSZA 1O4NA 2CBLA 2VIFA 5AULA 1YP5A 1JEGA 2YUQA 5EHPA 2K6DA 1O4MA 2EGAA 1JXMA 3EAZA 1SEMA 3QWYA 2FPDA 4DEXA 4FSSA 1WYXA 3IN7A 5EEQA 1A1BA 4F17A 1KC2A 2LJ0A 2CT4A 1O4KA 4J9GA 1YWOA 3PSJA 1WX6A 2RNAA 1F2FA 1UUEA 2DCRA 1ZUUA 1GFCA 1NYGA 3BUOB 3US4A 2FPEA 2J6OA 2DMOA 2JS2A 5DF6A 1FU6A 2CRHA 2ESWA 2EO6A 2V1QA 1OO3A 3GBQA 1D4WA 1M3BA 2J6FA 1BF5A 1RI9A 2A37A 4U17A 4HVVA 1T3SA 3C7IA 2F2XA 1PNJA 3UYOA 1OO4A 3CQTA 2RF0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4M75A 3H8ZA 1A1AA 3L2RA 1M2VB 4C8QB 1KIKA 1VQLA 3CCVQ 3VS1A 1KD1C 1A1EA 5IXBA 4FU6A 1T3LA 2YRDA 1VQPQ 4F7UG 1SG5A 2HUWA 2QDYB 3J7AF 1BIBA 3HCKA 3L2WA 4WF2A 2JTMA 2CP3A 1ZSZB 3M55A 4JJDA 4X34A 1K1ZA 1Z9QA 3PJPA 5C6SA 4Y91A 3RDVA 4BACA 3HSBA 4C8QD 3OYGA 1UGVA 2V26A 4X9CA 3CMAQ 1KHCA 3TREA 1TCEA 4K11A 3I56Q 5FWBA 2L2PA 2F2WA 2OAWA 2FL7A 4BI4A 1KC8R 2OX7A 3RBBB 2J05A 1WQWA 1FMVA 3OS0A 1D1BA 2HZYA 4LXCA 4C0DB 1P13A 4FL6A 2NUTB 5CDWA 2RJEA 1YJWQ 3M0UA 1PKSA 2RI3A 4JRKA 1Z9ZA 2JXBA 1YCSB 3VRYA 1AOUF 1WXUA 1V76A 3JCMb 1EZZB 3BUXB 3FJPA 1BLKA 1K73R 2DO3A 1SPSA 3LWHA 2C0OA 3OYCA 1LUNA 2ENMA 5FU6C 1LUIA 2WSFE 2RPNA 3ER0A 1VQPT 1ZA1B 1IREB 1RJAA 3RNJA 2FPFA 1G5VA 3EACA 3FDRA 2CSQA 2M1HA 3MKDA 1KHIA 3M58A 3JB9I 3VUBA 2RMXA 7AT1B 5GAOn 4PJNA 2DXBA 2D0NA 5IN1A 2RQUA 4F7UB 5KYYA 1A08A 2KK6A 3FB9A 5LJ3j 1M27C 3NTIA 1Q7YR 1M27A 2ECDA 1UTIA 3MCAB 5AYFA 3PFVA 4QQDA 1NLPC 1QWFA 3I56T 3CPWA 1QVFA 1O44A 1U3OA 4HT9A 1RAAB 2EJFA 2JTEA 2EYZA 2O9SA 3BE3A 6AT1B 1D0XA 1PSFA 3RMQA 1YJWT 3URGA 5KH6A 1OI1A 2CR4A 1OV3A 2OJ2A 2CT3A 2EQJA 2FRYA 2DBKA 3WVDB 3M9QA 3PIPA 3M0SA 5A0DA 2H8HA 2DL7A 1M3CA 1B3QA 2EGEA 2YUNA 4E7SA 2COYA 3AHUA 3EFOA 3D7SB 5CVIA 1B34B 3OB2B 1K76A 3OMCA 1VQKA 4KUDK 4E6RA 1BLJA 4RTXA 4PK4A 3JCMJ 2KT8A 3PIOA 1S1NA 4D8KA 2Y3AB 3TU4K 4A53A 2GQIA 1IRXA 2GTJA 4E7LA 1S72T 3JAME 1TS9A 3G4SA 4XU3A 5GJWB 4LUEA 1RABB 4MZTA 3EG9B 2XHCA 3C0CA 1D0ZA 3KFVA 5GAN7 2YSQA 2V1RA 2LCLA 2VASA 1BG1A 3BKBA 1TU0B 2QEXQ 4HCBA 3CCMQ 4ZN3A 1O4IA 3CBOA 5EG3B 2B3OA 3QUIA 4NWGA 2DZCA 3E1SA 4M78E 4MZMA 3HIZB 5CCAA 4DOVA 2HSPA 2F69A 2ABLA 5CQYA 3EHRA 4RTUA 5KYXB 1W4SA 2HKNA 4EIKA 1DJ7B 1W6XA 2L3QA 2IUGA 2JZ2A 3GNFB 3CCRQ 1N8RR 5ECAA 5IXFA 1UG1A 4P9VA 1P92A 1K73U 5GAN2 1AYCA 1WDXA 1C6VX 1M4ZA 2CH4W 2QYZA 3G71T 1FXXA 4FIBA 4KULA 1QVGP 2QTVA 3CXCP 4HCKA 4RTZA 1NLOC 2CIAA 1Z3KA 5CR2A 3RERA 2BTTA 2BIVA 2QGFB 3M0QA 3MAZA 2QEXT 4IUTA 3CCMT 3OYMA 2KXDA 2YHTA 3CD6Q 2CZ1B 3K2MA 2AK5A 1PHTA 1QQJA 1NG2A 4B9WA 4BY6B 2L3SA 3V8JA 5LJ5f 3QPHA 1D3BB 3S3OA 5GAMf 3CC7A 3GQIB 1M1KU 3CC4A 4XTWA 3E9GA 5LJ5d 2RB6A 1AWOA 2X4XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2KRS A;  1G2B A;  1AWW A;  2EKH A;  4GBQ A;  2EL8 A;  2MCN A;  2CI8 A;  1WXT A;  2VWF A;  5HKW A;  2PNI A;  5FWC A;  2P4R A;  5L23 A;  2SHP A;  1MIL A;  3M0R A;  1NEB A;  4DEY A;  3BUM B;  2HMH A;  2AOB A;  2RQV A;  3NGP A;  2ETZ A;  1EFN A;  4FBN A;  2ROT A;  5I22 A;  2EGC A;  1A07 A;  1SHA A;  1BKL A;  2KGT A;  3TL0 A;  3EG1 A;  5GJH A;  2DRM A;  3R6N A;  1GL5 A;  4TZI A;  4A4C A;  1X27 A;  2AKL A;  4Z89 A;  4JJB A;  3IMD A;  1TUC A;  2CUB A;  1H3H A;  4CC2 A;  2NUZ A;  4WWQ A;  2DM0 A;  1Y57 A;  1AD5 A;  2EYW A;  2DM1 A;  1X2K A;  2K9G A;  3NMZ C;  2DVJ A;  2KR3 A;  4OML A;  1WQU A;  2BZY A;  1FYN A;  2OI3 A;  3WA4 A;  5I6V A;  4CC3 A;  1O4O A;  4F14 A;  4IIO A;  3N84 A;  4GLM A;  3N8M A;  1LCK A;  2BZX A;  2CH4 A;  2FEI A;  2HBW A;  2LQW A;  2C0I A;  3OVE A;  2RQR A;  2KBT A;  1JO8 A;  1UJ0 A;  5EC7 A;  3S8O A;  1O4L A;  2MOX A;  1BHF A;  3T04 A;  2H5K A;  1O4E A;  1GBQ A;  4M4Z A;  1YVH A;  2DJQ A;  4A4B A;  4LNP A;  3GXX A;  1K4U S;  1CKB A;  1MV0 B;  3H0H A;  1AYB A;  3PQZ A;  1VYT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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