3NHNA

Crystal structure of the src-family kinase hck sh3-sh2-linker regulatory region
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
DIIVVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATRKEGYIPSNYVARVDSLETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVKHYKIRTLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of the Src Family Kinase Hck SH3-SH2 Linker Regulatory Region Supports an SH3-dominant Activation Mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase HCK
total genus 31
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2010-06-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 3nhnA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 3nhnA02
1O45A 1O44A 2KGTA 2ABLA 1M3CA 2CH4W 2YT6A 5HKZA 1YVHA 5IBSA 2MC1A 2K3BA 2PNAA 1HSQA 3A98A 2DBKA 2O2OA 1M27A 2GTJA 4HVVA 1KA6A 1BFIA 1BLKA 1FYRA 2CBLA 1YNZA 4U17A 4HXJA 4EY0A 1BHFA 5HKWA 3SHWA 1O4CA 4P9VA 1WFWA 3UA6A 4X1VA 3VRYA 2RQTA 3H0HA 2KE9A 4CC7A 1Y1UA 2LZ6B 2EYWA 1AYDA 3IN8A 1M61A 2DYBA 1O4GA 1O4EA 1GCQA 3EAZA 1ZUUA 1X6GA 1O48A 3CWGA 1AOUF 3PFVA 1ZUKA 4OHDA 1UUSA 1I3ZA 1T0HA 2L3PA 2ROTA 1Z9ZA 2F2WA 2L6KA 2DL4A 2JM8A 1MILA 3VRZA 1HD3A 2KROA 4HVWA 2AOBA 1CKBA 2GE9A 2RQRA 1FYNA 2LJ3A 2KT1A 4OMPA 1O4DA 2ECZA 3S8NA 2FPEA 2HDAA 4LNPA 4Y92A 3UF4A 1O4AA 5KAZA 1O41A 4D8KA 3I5SA 1RJAA 3THKA 3OV1A 1BM2A 2K7AA 3VS2A 4A63B 1O43A 3PJPA 5GJWB 1FU5A 3H0IA 2AKKA 2PNBA 4GL9E 5FWBA 2L3QA 3ULRB 1PICA 4RTXA 1ZBJA 2SEMA 2KYBA 2DX0A 2GBQA 3IQLA 1GFCA 1WX6A 4LN2A 4GBQA 1JU5C 2KEAA 1OV3A 2GTOA 2EYXA 1AB2A 2V1QA 1BHHA 1WXUA 2ED0A 2ROLA 2OAWA 2FRWA 2O9VA 2DNUA 1AYCA 4AG1C 3KFVA 4FL2A 1A1AA 2RPNA 2O9SA 1NZVA 1LKLA 1A1BA 1O49A 1I0CA 2RN8A 3M0TA 2GSBA 2HCKA 1HCSB 2JMAA 1TZEE 1ABQA 4NWFA 1GL5A 2FPFA 2HDVA 2A37A 1LUMA 1AOJA 3EG1A 3NMZC 2Y3AB 4OMLA 1UG1A 2CDTA 2KK6A 4F5AA 2KXDA 1O4PA 2OJ2A 4R0KA 1PKSA 2W0ZA 5ECAA 2Y1NA 1VYTA 1SRLA 3FJ5A 1UHFA 3TVTA 3UATA 1MW4A 1CWDL 1WQUA 3EGUA 4LE9A 1AEYA 1HJDA 4EIHA 1M27C 2CIAA 1UURA 4GLMA 4E68A 5BO4A 2MRKA 4JGHA 4H34A 1ZUYA 3EACA 3MXCA 1UJ0A 3REAB 3EHRA 1BKLA 2L2PA 2PLEA 2K79B 2BBUA 2YSQA 2PTKA 3VS3A 2CUBA 3N84A 1GCQC 1T0JA 1LUKA 4OHHA 2YUOA 2IUIA 4H1OA 1WIEA 1NYGA 2KXCA 2D8HA 2HUWA 2JTEA 1XOVA 5IHKA 2K9GA 2NUZA 2KNOA 2J06A 2DE0X 2KT8A 1RLQC 5AULA 2EYZA 1YN8A 2DL7A 3VRPA 3ZNIA 1CWEA 2KYMA 3C7IA 4WCIA 2MCNA 4RTWA 3IMDA 2OI3A 2YUNA 2YUPA 1NRVA 2K6DA 4XZ0A 2DX1A 2HBWA 2V1RA 1SPRA 1O4NA 2EYYA 1NYFA 4AG2C 2M0YA 4RUGA 1F1WA 3CXLA 1SPKA 4J9BA 5DF6A 4JJDA 2CI9A 1NZLA 1SKJA 3US4A 5GJHA 4K45A 2DRMA 1ARKA 4DEXA 2EGEA 4X6SA 3ZL7C 3CQTA 4HCKA 1AWJA 2DLPA 2IZVA 4JE4A 4F17A 1KC2A 1FMKA 1G2BA 2DVJA 2PNIA 2X3XD 4HVUA 2LNWA 1PKTA 2HSPA 1FBVA 1GRIA 2VKNA 2B3OA 2EO3A 1MV0B 1SRMA 5DC4A 5L23A 4A4BA 1K76A 1BK2A 1PWTA 1E6HA 1NEGA 2FG0A 2AKLA 4RTZA 4ORZA 2IUGA 3BUNB 2DL3A 4CC2A 1KJWA 2PLDA 2O88A 1LCKA 1U06A 2A36A 3VS4A 5I22A 2MRJA 2C9WA 2QDLA 2QMSA 4J9IA 3S8LA 4FSSA 1M3AA 1AYAA 3NHNA 2B86A 3PE0A 1IS0A 5I11A 1A1CA 2K79A 4XZ1A 1K1ZA 2EBPA 2JS2A 2MQIA 1H9OA 4F16A 3VROA 1E6GA 2BZ8A 2OZOA 2FEIA 1RLPC 4RTYA 1B3QA 1CSKA 2RSYA 3U23A 1CKAA 1O4JA 1R1PA 1ZLMA 2K2MA 1JYQA 1BBZA 4Z8AA 1O42A 1QWFA 2LP5A 1JWOA 1SPSA 2YU7A 4ROJA 2PZ1A 2IUHA 1BG1A 4E93A 1GBQA 1ZFPE 5EHRA 1A08A 2MIOA 4J9DA 2C0TA 4RTTA 1YVLA 3MXYA 3GXXA 1WA7A 2DBMA 1SHAA 1MUZA 4OMNA 2HDXA 2XP1A 3HIZB 1LCJA 1UDLA 2FPDA 2L3TA 4OHLA 2KRMA 5IHNA 3N7YA 1GCPA 2LNXA 4DGPA 2DLYA 1JXOA 3R6NA 3EG0A 2AUGA 3BUMB 1RUWA 2H8HA 1M30A 2SHPA 1UJYA 1G83A 1WLPB 3O5ZA 2VWFA 3S8OA 2ECDA 4JJCA 5GJVB 1JXMA 5IH2A 1VA7A 4J9CA 2EGCA 4FBNA 2KRSA 2J7IA 3VRRA 2RQVA 4DEYA 2KNBB 3TKZA 2D0NA 4TZIA 1EFNA 2J6OA 1RI9A 1X2KA 2H5KA 4P9ZA 1PNJA 2RQWA 1XA6A 2RMOA 4ESRA 4GWFA 1BLJA 3K2MA 1LKKA 1O4HA 3BUXB 3T04A 2LJ0A 1E7OA 1BKMA 1UGVA 3VS5A 1A07A 3JV3A 2P4RA 3GQIB 1BFJA 2CSIA 1H3HA 1QLYA 1UFFA 2ENMA 1AZEA 1S1NA 2GNCA 1QG1E 2D1XA 2F2XA 5D0JA 2CRHA 5EHPA 2E5KA 1UUEA 1T3SA 1PRLC 1TG0A 1I07A 3QWXX 3PQZA 2EQIA 3PSKA 2LNHB 1WXBA 1QADA 2RMXA 2LMJA 3VS7A 1IO6A 2CT3A 3I9QA 1UE9A 1B07A 1K4US 2EYVA 2LJ1A 1BF5A 1ZX6A 1VYVA 4D8DA 1SHGA 1JEGA 1UECA 4K11A 1D4TA 2EO6A 5IHIA 1O4QA 1X2QA 2O31A 5I6VA 1O4OA 3VGOA 2IIMA 2W10A 2DA9A 4LUEA 2CR4A 1YWOA 2D8JA 2DJQA 3NPFA 4J9HA 3VS6A 4K2RA 3LH5A 4FL3A 5IBMA 4K44A 2EOBA 1BB9A 2LCSA 4Z89A 1Z9QA 1AWOA 3EG2A 3VS0A 3GBQA 1JYRA 1KA7A 1GBRA 1JQQA 2DLZA 1OOTA 1H92A 2YSXA 1GHUA 1OEBA 2CI8A 3CBLA 4DGXA 1O4IA 1WYXA 3I5RA 1UHCA 2VIFA 4JEGA 2YDLA 5EEQA 2DM0A 2XMFA 3HCKA 1U5SA 1NM7A 1WDXA 2FRYA 2I0NA 4IIOA 1WXTA 1A0NB 3I35A 1OO3A 4J9EA 3PVLA 2A08A 2M51A 2Y1MA 2EPDA 3M0QA 3TSWA 1RQQC 2RNAA 1X27A 1AOTF 1QKWA 2MK2A 2EW3A 5CDWA 2F2VA 1M3BA 4L1BB 4QT7A 3OVEA 4J9GA 2RVFA 4OMQA 3M0RA 2DL8A 2CUDA 3TSZA 1K0SA 3OP0A 1O4RA 2J6KA 1W70A 5EG3B 3REBB 4LUDA 4JPBW 1U3OA 5FWCA 3PSJA 4F59A 2JMCA 1TUCA 3BUWB 1O4FA 2HMHA 1ZSGA 3VRNA 1J3TA 1X0NA 2DCRA 1O4KA 1FBZA 3IN7A 2RF0A 1F2FA 3MAZA 1Y0MA 1OO4A 1X6CA 1P13A 2LCTA 1T3LA 4AFUC 1OPKA 1AVZC 4E6RA 2NWMA 1LUIA 3KFJA 3PS5A 2JW4A 2DRKA 2A28A 2EGAA 2DM1A 2ED1A 4KRTA 1AWXA 1PRMC 1V1CA 1KFZA 2KBTA 5FW9A 1CSZA 2L0AA 1Z3KA 1B47A 1NLPC 2EVRA 3NGPA 2BZXA 3VRQA 2CH4A 2KR3A 1UTIA 3M7FA 2BZYA 2EKXA 4QSYA 1A09A 4OHIA 1SHDA 5EELA 1O46A 5J3XA 3WA4A 2EU0A 1SSHA 3EHQA 1FHSA 2GGRA 2L4KA 3S9KA 1HCTB 4F5BA 1TUDA 2JS0A 3PVQA 1W6XA 4NWGA 4ZNXA 4IIMA 1K9AA 5GJIA 1ABOA 1I1JA 1YCSB 1FU6A 2JT4A 3UA7A 3IMJA 1VYUA 2AOAA 1CSYA 1CJ1A 1N5ZA 5HKYA 4AFQC 4AFSC 2CT4A 5EC7A 3CD3A 2ESWA 2C0OA 2CSQA 1K0XA 1QCFA 3RBBB 2CS0A 3RNJA 4EIKA 2EKHA 3EG3A 2H46E 1H8KA 3HHMB 5DC9A 5DC0B 5IXBA 4A4CA 4U1PA 2SRCA 1AWWA 4RTVA 2RORA 2FO0A 2RQUA 4M4ZA 1JYUA 3N8MA 4CC4B 4JZ4A 1JO8A 1X43A 2DL5A 1LUNA 1TCEA 2ETZA 4OHEA 4RTUA 1AYBA 2L3SA 2J6FA 5HCKA 1R1QA 1A1EA 4GPLB 2JYQA 1Y57A 2VVKA 1MV3A 4CC3A 1D4WA 1GFDA 5IXFA 1SHFA 1SEMA 2GQIA 3H0FA 1WI7A 2LQNA 1QKXA 2LQWA 4AFZC 1O4LA 2AZSA 2YUQA 4OMOA 4F14A 2AZVA 2OQ1A 5AXIA 3SEMA 3GXWA 2CREA 3VS1A 3M0SA 1NLOC 3M0PA 3BKBA 3H41A 2X3WD 1RPYA 3C0CA 2G6FX 1X69A 2DMOA 4Z88A 2C0IA 1YP5A 3UYOA 2BTTA 1KSWA 2HEQA 1JU5A 1O47A 1W1FA 1NEBA 3TL0A 2JM9A 1A81A 2K7AB 4WWQA 1YWPA 2LX7A 4OMMA 1KIKA 1O4MA 3OB2B 4JJBA 1O4BA 1PHTA 1R1SA 1BU1A 1SHBA 1AZGB 1QWEA 2EL8A 2FCIA 4J9FA 3BUOB 3OB1B 3PLFB 1BMBA 2MOXA 2JXBA 2DILA 1BHHB 1M8MA 4JZ3A 1OPLA 2KRNA 3QWYA 1IJRA 2J05A 2AK5A 2DF6A 1D1ZA 1AD5A 1NG2A 1X6BA 3M0UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2CGHA 1O44A 2KGTA 2YXYA 1M3CA 2CH4W 1VQKQ 1YVHA 5IBSA 3BE3A 4DBFA 3HHTB 2O2OA 1WHLA 1BFIA 2MF2A 2CBLA 4OGEA 4HXJA 4U17A 3CCLT 4EY0A 4X1VA 3H0HA 1AYDA 4C92A 2DYBA 3JSCA 1O4EA 4PJJA 3V7SA 3EAZA 3M4GA 1ZUUA 3CWGA 3I56T 4N4HA 1FXXA 1ZUKA 1M9SA 1I5LA 1M1GA 1I3ZA 1T0HA 2ROTA 2F2WA 3L2RA 5LL6S 4NOYA 4ZN3A 1MILA 2CZ7B 1K9MC 4PJOA 4OMPA 1PC0A 3UF4A 1PCXA 3GNGA 2KDSA 3OV1A 4A63B 1O43A 3PJPA 3S3MA 4A4GA 1G3SA 2PNBA 2L3QA 3ULRB 1PICA 1ZBJA 2SEMA 2DX0A 1VQ4Q 2GBQA 2DEUA 2KEAA 1M8VA 2KQWA 2LC4A 3KFVA 4FIBA 4PLIA 2RHXA 1YIJQ 3CD6T 1A1BA 5CKFA 5KYNA 3M0TA 3PIOA 2DD5A 4DBQA 2GSBA 2JMAA 2P0KA 5GANh 1TZEE 4NWFA 3LLRA 2A37A 5GAOr 1WZOA 1LUMA 4M7DF 3OY9A 4E7LA 3RMQA 3OYJA 3TVTA 1UHFA 1CWDL 4ATOA 4JDSA 3HRTA 1VQ8A 4J7FA 4M77C 2CIAA 5GAN4 4HT8A 1UURA 5HK3A 4GLMA 1YIJT 3EACA 4C5EA 3REAB 1VUBA 3EHRA 1BKLA 3S3OA 2LNVA 1AT1B 2RHZA 1M1KC 1U1SA 2CUBA 1LUKA 4V2SA 3CMEQ 4H1OA 1NYGA 2KXCA 2HUWA 1XOVA 3A8HB 2KNOA 2EIFA 1Q82C 2ZPGB 5CVIA 4HT9A 5AULA 4XTXA 4XTZA 4RTWA 5LJ3f 3HTRA 3SWNA 2OI3A 3EGDA 2LDMA 1N27A 2YUPA 1V76A 1NRVA 2DX1A 2A3LA 4JRPA 3CXLA 5DF6A 2DXTA 2CI9A 2BKDN 5LJ3e 4ZTJA 4DEXA 2EGEA 5CK9A 2Z0WA 2IZVA 2ZCFB 3KBGA 4JE4A 3EFOB 5GMKm 3X25B 4RMOA 1G2BA 4HVUA 1JB0E 2DAQA 2DYIA 2HSPA 2VKNA 2YRCA 2B3OA 2EO3A 4N0AC 1MV0B 3CPFA 2V8IA 3HP9A 1BK2A 1E6HA 2AKLA 3EGXB 4ORZA 5D7UA 1KJWA 1Y7XA 2A36A 5I22A 2OTJQ 2K5LA 2C9WA 4Q5WA 2QMSA 4FSSA 1AYAA 2V8JA 2DVEA 5D6WA 2BE7D 1K8AC 1EIFA 2YLCA 1IREB 1K1ZA 2EBPA 2CP5A 2MQIA 4F16A 3CMAQ 2BZ8A 1BIBA 4JUVA 1D0YA 3U23A 1R1PA 1ZLMA 1O42A 1M2VB 1JWOA 1I5OB 1RAHB 4C8QA 4ROJA 2P0QA 2OTJT 1BG1A 2EJ9A 4ANJA 2DTOA 5FRNA 4J9DA 4M78C 3SB2A 2DBMA 1VQLQ 3CMAT 3G71Q 3A8GB 3A8OB 3WXMB 2LTOA 1UDLA 4CI0C 5GAOp 4OHLA 4RG8A 1OYXA 2X51A 1KD1C 2VGNA 4KBMB 2LNXA 2R5AA 4DGPA 2DLYA 3MCAB 4C0GA 1NZ9A 4CRIA 4M75B 1UJYA 3JAME 1QMCA 2MWPA 4XTUA 4LD9K 2QASA 3S8OA 2E1HA 5I21A 4QQGA 2HL3A 3G71T 3J80E 3J81E 3OYDA 2AT1B 2RQWA 3HRSA 4ESRA 4GWFA 4E7SA 2QTXA 3BUXB 3CCQQ 3FRNA 2LJ0A 4OB0B 1UGVA 3VS5A 1NJIC 3JV3A 1BFJA 2GFUA 2GNCA 3CCMT 1VQ6A 2RD1A 2GQVA 2M02A 4QQ6A 2RI5A 5D6XA 4PJNA 1N8RR 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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