2DVJA

Phosphorylated crk-ii
Total Genus 17
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
17
sequence length
228
structure length
227
Chain Sequence
b'MAGNFDSEERSSWYWGRLSRQEAVALLQGQRHGVFLVRDSSTSPGDYVLSVSENSRVSHYIINSSGPRPPVPPSPAQPPPGVSPSRLRIGDQEFDSLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPVSRSRQGSGVILRQEEAEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYRPASASVSALIGGNQEGSHPQPLGGPEPGPAQPSVNT'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords V-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog, isoform a
publication title Structural basis for the transforming activity of human cancer-related signaling adaptor protein CRK.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 17
structure length 227
sequence length 228
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2dvjA02
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2dvjA01
2BZXA 3EACA 1T3LA 2EGEA 1VYUA 4DGXA 4OMMA 2KNBB 4QT7A 1SRMA 1UHCA 1T0JA 1FYRA 1LUIA 2HDVA 1WDXA 2I0NA 1KIKA 2OZOA 2JMCA 1A1BA 1RJAA 1IO6A 2EPDA 2KR3A 1BK2A 1QLYA 2C9WA 1TUDA 2GNCA 3VRZA 5I11A 3S8OA 1E7OA 1WXBA 2L3TA 2D8HA 1RLQC 4X1VA 3TSZA 1FMKA 5D0JA 3BUNB 1NZVA 2HDAA 3TVTA 3UF4A 1SPRA 5ECAA 2KYBA 1MILA 1RUWA 3BUOB 3GBQA 2YT6A 1HCTB 1AB2A 1CWDL 4F17A 3ZNIA 4F5BA 2MIOA 2OQ1A 1O4KA 1O48A 3IMJA 4P9VA 1MUZA 5I6VA 1AWJA 1O4MA 3OB1B 2GSBA 2NWMA 1FU5A 1O49A 2NUZA 3VS2A 1BB9A 4NWGA 4WWQA 1QCFA 2RORA 1A1EA 2LJ3A 4K11A 1PWTA 2RPNA 1B3QA 2KT1A 2EO3A 2DRMA 3IMDA 1U06A 3M0PA 1X27A 3I5RA 2RQVA 2IIMA 4RTXA 2O2OA 2EGAA 2A36A 4HXJA 4RTYA 2DMOA 1JU5C 2DL3A 1BHHB 2JS2A 2CH4W 1X6BA 2YU7A 1AOUF 3VRNA 1NG2A 2LMJA 2D1XA 2L3QA 1NEGA 4LN2A 1PKSA 4GWFA 2C0OA 2J05A 4F14A 1ABQA 1JYRA 2DX0A 1M30A 1JEGA 4E68A 2LQWA 2EYWA 3MXCA 1UUEA 4LUDA 3WA4A 2FPDA 3UA7A 1QKWA 1H8KA 2V1QA 1BKMA 3VRPA 1LUKA 4JE4A 4JZ4A 2ETZA 2AKLA 2EU0A 1YNZA 2CUBA 2KNOA 4HVWA 1KA6A 4D8KA 4RUGA 1I0CA 4KRTA 1WIEA 1BHHA 2KROA 1O4CA 1QWFA 2VVKA 5IHKA 1K0XA 2JT4A 2L3PA 5IXFA 3VRQA 5IH2A 3GQIB 1O42A 4GPLB 1UURA 2EYVA 1O4GA 3SEMA 4JJCA 2CI9A 4J9HA 1A09A 1LCJA 2H46E 2Y3AB 2JW4A 2EYXA 5EHRA 1PRLC 5BO4A 1PKTA 2YUNA 1GFDA 2SRCA 2EL8A 5HKYA 2LJ1A 4J9DA 1UJ0A 1A1AA 2YSXA 2CUDA 2E5KA 1SRLA 2D0NA 2VKNA 2J6FA 2MC1A 4X6SA 5HKZA 1CSZA 2PZ1A 3M0SA 3MXYA 1E6GA 2IUGA 2K9GA 5HKWA 5I22A 3BUWB 1T0HA 4IIMA 1ZSGA 4H34A 2BZYA 4OHIA 2FPEA 5FW9A 2GQIA 3HHMB 1AVZC 5DF6A 5KAZA 2ED1A 3UATA 3PE0A 2A37A 1O4DA 1OEBA 2QDLA 1M3CA 4AFSC 1KC2A 1G83A 4L1BB 2DVJA 2DYBA 1I3ZA 1QADA 3VROA 1UE9A 4OMPA 2ENMA 1JU5A 3OV1A 2FCIA 1WA7A 1GCPA 3VRYA 1OPLA 4GLMA 1H9OA 3IN7A 2CREA 3BKBA 3N84A 2KBTA 2J06A 2BZ8A 2J6KA 4DEYA 4JEGA 2DNUA 1I1JA 1Y0MA 1I07A 1W6XA 5IBSA 4EY0A 1X6GA 2EBPA 1X69A 5GJHA 4Y92A 1ZUKA 1CKAA 1RQQC 3I5SA 4QSYA 1BF5A 1GFCA 3PVLA 4EIKA 2DRKA 1SEMA 3N8MA 3VS0A 3N7YA 2MOXA 1UHFA 1M3BA 2IZVA 3US4A 2EYZA 1QWEA 2JS0A 4JJDA 1AWWA 1O4FA 4HCKA 4OMQA 3UA6A 2A28A 1N5ZA 4F59A 1M27C 3C7IA 3S8NA 3PQZA 2YUOA 1FYNA 2KRMA 1O4HA 2XMFA 2CI8A 2ROLA 1GCQA 2DLPA 5AULA 2VWFA 1Y57A 1OOTA 2DF6A 2FG0A 2DBMA 2FPFA 1ZX6A 1P13A 4E93A 1WI7A 1GRIA 2KT8A 2K6DA 1KFZA 1IS0A 1D4WA 2AK5A 2EYYA 2DCRA 1BFIA 1CSKA 3VS5A 1FBVA 1AOJA 1BU1A 3GXXA 2PNBA 3VRRA 1YP5A 3H0HA 1UDLA 2PTKA 5EHPA 1W70A 1FBZA 1M3AA 4J9GA 1AZEA 3M0RA 3CBLA 4DEXA 1O4JA 2L2PA 5GJVB 2DL4A 4RTTA 5EEQA 4IIOA 2B86A 1R1PA 4GBQA 2YUPA 4EIHA 1BLKA 4RTVA 4XZ0A 2LCSA 2PNAA 3BUMB 4RTZA 2JTEA 1G2BA 4RTWA 1AYAA 4NWFA 1TUCA 1GBQA 4HVUA 2MK2A 1B07A 4JJBA 2KEAA 1M8MA 2CBLA 1LKLA 1SHFA 2J6OA 2CSIA 2RMOA 2SEMA 4ROJA 1BLJA 2D8JA 1SPSA 1PRMC 1O46A 3NGPA 1HD3A 1T3SA 1UJYA 1NLOC 2CT3A 1SHGA 2O9SA 2P4RA 2YUQA 3VS7A 1Y1UA 2RVFA 2F2XA 2K79B 3PJPA 2KE9A 4AFZC 1F2FA 2DE0X 1QKXA 1A07A 5L23A 1O44A 2L6KA 4K2RA 2PLEA 1CWEA 4LNPA 4LUEA 4AFQC 4CC7A 2O88A 4M4ZA 5IXBA 1RLPC 3H0FA 2DX1A 2DILA 1CSYA 1KSWA 5GJIA 1BHFA 2MQIA 1Z9QA 2JM8A 2H8HA 1F1WA 1WQUA 2DJQA 1VYVA 1O47A 2OJ2A 1TCEA 3VS6A 3ULRB 4FL3A 5EC7A 5FWCA 2VIFA 4LE9A 1UUSA 3I9QA 1UTIA 1O4PA 1SSHA 2CDTA 1QG1E 4ZNXA 1BG1A 1UG1A 3K2MA 2CRHA 2BTTA 2K79A 3U23A 2W0ZA 1OO4A 4Z8AA 2LNHB 1M61A 2HUWA 2EKHA 1ZUUA 3S9KA 2LNXA 3HCKA 1O4QA 2AOBA 1H3HA 1LCKA 4JPBW 1AD5A 1NRVA 3IQLA 3BUXB 2FEIA 2RQWA 2EKXA 1NM7A 3HIZB 4A63B 1YWOA 2CH4A 2DM1A 1A1CA 2RMXA 1UECA 1WFWA 4F5AA 1ABOA 2HBWA 2JXBA 2QMSA 3TKZA 1NZLA 4FBNA 4H1OA 1CKBA 3THKA 3PVQA 1Z3KA 3EGUA 2HMHA 1KJWA 4K45A 3KFJA 2K2MA 2LP5A 4OHLA 2PLDA 4ORZA 1H92A 2LNWA 3EG0A 1K0SA 2XP1A 2RNAA 2X3XD 1BFJA 2ECDA 1JXMA 1AZGB 1NYGA 1SHBA 3GXWA 5DC9A 3C0CA 2CSQA 2DBKA 4D8DA 2EGCA 2O31A 1FHSA 3M0TA 3CWGA 4CC4B 2OAWA 1B47A 1UFFA 3PSJA 2KXDA 1KA7A 4Z88A 2RQUA 3PSKA 2DL7A 2LZ6B 1CJ1A 2DL8A 5EELA 2JYQA 2ABLA 3T04A 1ZBJA 4AG1C 4CC3A 2EQIA 3M0UA 4OMOA 3I35A 2EVRA 4FSSA 2ROTA 2ED0A 3UYOA 4J9CA 4AFUC 4TZIA 1MV3A 2EO6A 1OV3A 1ZLMA 1SPKA 2C0TA 4JZ3A 1YN8A 5HCKA 3NMZC 2CIAA 3CXLA 1A0NB 4A4BA 3REAB 1R1QA 5IHNA 1XA6A 4J9BA 4ESRA 4Z89A 1BMBA 5DC4A 2RF0A 1NLPC 5CDWA 2PNIA 1BKLA 2SHPA 2GBQA 2RSYA 2FRWA 5IHIA 3OVEA 2AKKA 1BBZA 4OMLA 1JQQA 3LH5A 2AZVA 2K3BA 1GBRA 5IBMA 1WX6A 3M7FA 2FRYA 1S1NA 2L3SA 3CQTA 3EG1A 1U3OA 1HSQA 2JM9A 5GJWB 2K7AA 2DL5A 2KXCA 1LUMA 2H5KA 1JXOA 4HVVA 4J9FA 1O4BA 4A4CA 2O9VA 1OPKA 2X3WD 1FU6A 2DLZA 2AOAA 1MW4A 1BM2A 1K1ZA 4E6RA 1JYUA 1AYDA 2OI3A 3EG2A 3EHQA 3H41A 1HCSB 1X43A 3PS5A 4R0KA 2B3OA 3PLFB 1D1ZA 3ZL7C 2AZSA 2DLYA 3IN8A 1K76A 1TZEE 1EFNA 1E6HA 3VS1A 1A81A 1SHDA 1WXUA 3S8LA 2HSPA 1J3TA 1YVLA 3PFVA 1AOTF 1AYCA 1HJDA 1JWOA 4J9IA 1ARKA 5DC0B 1K9AA 2ECZA 2MRKA 1O4RA 2IUHA 4K44A 3VGOA 2HCKA 1O41A 2W10A 4P9ZA 3H0IA 1M27A 1AWXA 2RN8A 2DA9A 3MAZA 2HDXA 2GGRA 1O4NA 2M0YA 3TL0A 1RPYA 1X2KA 2L0AA 5FWBA 4AG2C 1PICA 1X2QA 2C0IA 1ZFPE 4F16A 1O4EA 2KK6A 1UGVA 2BBUA 3VS4A 1LKKA 4OHEA 2RQTA 1WXTA 1W1FA 1PHTA 1O4IA 1TG0A 1JO8A 1SKJA 2LQNA 2Y1NA 2CT4A 3QWXX 1GCQC 1AWOA 1YVHA 3CD3A 3NHNA 2KGTA 1SHAA 3A98A 1O4LA 3OB2B 4XZ1A 4CC2A 2CS0A 1A08A 1V1CA 1VYTA 3TSWA 1D4TA 4OHHA 1YCSB 2G6FX 1X6CA 1Z9ZA 1GL5A 2A08A 2HEQA 3RBBB 4OMNA 1VA7A 1XOVA 3RNJA 4U1PA 3M0QA 2KRNA 2LJ0A 2DM0A 1WLPB 1K4US 4U17A 2F2WA 3VS3A 2GTJA 1AEYA 2Y1MA 3OP0A 4DGPA 1WYXA 4J9EA 2JMAA 1AYBA 4JGHA 3EAZA 1PNJA 4OHDA 1RI9A 2GE9A 2EW3A 3REBB 1GHUA 2ESWA 1JYQA 2M51A 3QWYA 3EHRA 3R6NA 1LUNA 1R1SA 2IUIA 1IJRA 2RQRA 2FO0A 1O4AA 2YDLA 2LX7A 1U5SA 2MRJA 3JV3A 4WCIA 1MV0B 4RTUA 2LCTA 4GL9E 3FJ5A 1O45A 2YSQA 3EG3A 3SHWA 5EG3B 5AXIA 2F2VA 1OO3A 3O5ZA 3NPFA 2MCNA 1X0NA 2AUGA 2GTOA 1YWPA 1NEBA 1ZUYA 5J3XA 2KYMA 3KFVA 2CR4A 1NYFA 2L4KA 2EOBA 2V1RA 1O43A 2J7IA 2KRSA 1O4OA 2K7AB 4FL2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2MYSA 2RI3A 3EACA 2ZGWA 3HRTA 4DGXA 1R0CB 4A4GA 4OMMA 4DBFA 3OS1A 1UHCA 1T0JA 1FYRA 3NFCA 3I55A 1KD1R 1KIKA 3QHSA 1RJAA 2EPDA 2CZ7B 5I11A 1HK9A 4HCZA 3A8LB 2L3TA 4RCCA 1RLQC 1WGSA 3TSZA 1FMKA 3BUNB 1IB8A 2EWNA 4R55A 1SPRA 5ECAA 3NTKA 1MILA 1EZZB 5KH6A 2JN0A 1KHIA 1HCTB 1WHLA 1CWDL 1FXXA 1YI2Q 4ZGJB 3GNFB 1YIJA 1VQ9A 3CCEA 3OYIA 2GSBA 1FU5A 5FU7C 1XTDA 3VS2A 4WWQA 2RORA 1ZSZC 2FYKA 2DRMA 2VC8A 3IMDA 3X24B 2YRCA 5LJ5d 2ZPEB 2RJDA 3V7SA 2GCXA 4RTYA 4FYYB 1TWBA 1WJQA 2DMOA 3MKDA 2DL3A 1Q86C 2CH4W 1VQ5T 4GY5A 1NG2A 2LMJA 2D1XA 3OYMA 2BE9B 5GMKl 2RI2A 1M30A 1WQ7A 3JCMV 1VQ6Q 1LVKA 2JTMA 1D0XA 3WA4A 1QKWA 3VRPA 5GAMd 3M4GA 2AKLA 2AT1B 4AMCA 2EU0A 5CQXA 3CCQA 1H3ZA 3OQ5A 4KRTA 1QMCA 1WIEA 1K0XA 1FMWA 2L3PA 2HD0A 5IXFA 2YLBA 1W4SA 4GPLB 2EYVA 4KBMB 2EIFA 4JJCA 5DY9A 2MF2A 2H46E 5GAOm 1YITT 2YUNA 2SRCA 5GAOl 2LJ1A 2M16A 1UJ0A 1A1AA 2CUDA 4F7UG 1SRLA 2D0NA 4FCYA 2E41A 3M5AA 1CSZA 4XU3A 4QVCA 2IUGA 1YFNA 5HKWA 3FRNA 1VUBA 4JRQA 1FX7A 1NJIU 5DF6A 2BZYA 5KAZA 4C0GA 2GQIA 2QI2A 2ED1A 2A37A 1O4DA 4PNOA 2QDLA 1G3WA 1G83A 2EYQA 1RAGB 1UE9A 4DBHA 4TVRA 1KC8U 2LT4A 3GIBA 1OQKA 2PQWA 3HKSA 4XK8E 2DNUA 1Y0MA 1I07A 1X6GA 4BUGA 2WSCE 1ZUKA 5L8RE 3VJPA 1D3BA 3VS0A 3J7AF 1G5VA 3OYBA 2JS0A 1AWWA 1X6OA 1JB0E 4HCKA 1VQMT 3UA6A 1N5ZA 2BKDN 1M27C 2YUOA 2KRMA 4F7UA 4J6YA 1ZA1B 1M90C 3CC4Q 5KYXA 1HYOA 1JJ2P 3C12A 2FPFA 2LT1A 2HMAA 3TEEA 2E5QA 1U8RA 4II1A 1WI7A 5KYYA 1GRIA 2K6DA 1YJWT 1KFZA 2AK5A 2EYYA 4DQ2A 3MHXA 4OMFB 2CS7A 3AT1B 4M77G 1FBVA 2KY9A 3OS5A 3GXXA 2H3JA 1NBEB 2IVWA 2BUDA 3L2ZA 2I2LA 3GP8A 1W70A 1KD1C 5GANj 4R56A 3L2VA 4DEXA 3EH1A 2ZPIB 2LX9A 3QPHA 4RTTA 1RAIB 1D09B 4IIOA 5A2QE 1R1PA 3CCLQ 2LCSA 3BUMB 3QBYA 4RTWA 2D0QB 2KEAA 1Q7YU 2ZAEA 2CBLA 4HKEA 2J6OA 2RMOA 1GXIE 1BLJA 2QDYB 1VQOQ 3OA6A 3I55T 2P4RA 1W2BA 3M53A 4AFZC 1A07A 2L6KA 1O44A 4OB3B 3MP6A 2O88A 4XTZA 2OTJT 2RK2A 4Y28E 5D6WA 1KSWA 4M7DB 3GOXA 1Z9QA 2MQIA 2JM8A 3M58A 2ATCB 3M54A 1VYVA 1VQ9T 1YIJT 4HCBA 4C8QB 4M7DD 2DVEA 4M77A 3ULRB 3CCET 1YJNA 2VIFA 4LE9A 3I9QA 1UTIA 4C8QD 1BG1A 1UG1A 2QQBA 2QG9B 1OO4A 4M78C 1M61A 1VQ4Q 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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