2DVJA

Phosphorylated crk-ii
Total Genus 17
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
17
sequence length
228
structure length
227
Chain Sequence
b'MAGNFDSEERSSWYWGRLSRQEAVALLQGQRHGVFLVRDSSTSPGDYVLSVSENSRVSHYIINSSGPRPPVPPSPAQPPPGVSPSRLRIGDQEFDSLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPVSRSRQGSGVILRQEEAEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYRPASASVSALIGGNQEGSHPQPLGGPEPGPAQPSVNT'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for the transforming activity of human cancer-related signaling adaptor protein CRK.
pubmed doi rcsb
molecule keywords V-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog, isoform a
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 17
structure length 227
sequence length 228
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2dvjA02
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2dvjA01
3S8OA 2ED1A 1TCEA 2CBLA 5KAZA 1BFIA 3GXXA 3BKBA 2FPDA 1GBRA 1Y1UA 2QDLA 2RVFA 1O44A 1CSKA 2FG0A 2RN8A 1JXMA 2AZVA 3OB2B 4DGXA 3VS1A 1NRVA 3T04A 3RNJA 1BHHA 5DC4A 5AXIA 2DYBA 1SPSA 1TZEE 1VYUA 1AOUF 1SKJA 2BZ8A 1GRIA 3VS0A 2JS0A 2DE0X 4QT7A 1FYRA 2ENMA 4Z88A 2AOBA 2A08A 2F2XA 2KE9A 1O4MA 1OOTA 3VRYA 2F2WA 3IN8A 2B3OA 2K79B 4IIMA 2V1QA 2DLZA 2KR3A 1X69A 4AFSC 2MK2A 1FU5A 1K0SA 5I22A 3VRNA 2LNWA 1WXUA 4CC2A 4A4CA 1SRLA 1PICA 2EYXA 1O4NA 2RQTA 1X6CA 2IUIA 2CUDA 4XZ0A 4OHEA 2PNBA 2L4KA 1G2BA 2RQVA 2LJ0A 2EPDA 1BB9A 1O4CA 2IUHA 4A4BA 4E93A 1OEBA 4EIKA 2MC1A 5IBSA 1JQQA 2GTOA 1Y57A 2CT3A 2M0YA 2H46E 2L6KA 2DMOA 1LKLA 2LNHB 1K0XA 1NLOC 5IHIA 3VS3A 1O42A 2ED0A 2KBTA 1LCJA 1O4DA 2X3WD 3PJPA 4F14A 3TSZA 2RORA 4R0KA 3C0CA 3PSJA 2PNIA 5GJVB 2LJ3A 4OHIA 5IHKA 1NG2A 2GTJA 3M0QA 1JYUA 2DL8A 1QADA 4JPBW 3M0UA 3M0TA 1AWOA 1N5ZA 4JZ3A 2DBKA 3PE0A 1QKXA 1UJYA 5FW9A 2PLEA 2PNAA 1EFNA 2CH4A 1GFCA 2HDAA 1O4GA 2HDVA 1KA6A 2DL7A 4HVUA 3IMDA 3RBBB 1UUEA 4HCKA 5GJHA 5IXFA 1ZSGA 1T3LA 2DX0A 2PLDA 1UHFA 3IMJA 2KNOA 2L3QA 1BMBA 3VS6A 2D1XA 1I07A 1QLYA 4TZIA 1HCTB 2DA9A 3H0IA 1CJ1A 1SHAA 3VRPA 2DRKA 3VRRA 2KRMA 2IUGA 1AOTF 2RQWA 1K9AA 1LKKA 5L23A 2F2VA 1U3OA 1O4FA 2P4RA 4M4ZA 1O49A 1YNZA 2CSQA 2H5KA 2SHPA 2EO3A 1ZUYA 2JM9A 4GWFA 1WI7A 2DJQA 4FL2A 4JJCA 3I9QA 2OQ1A 3K2MA 1M27A 2CREA 1KFZA 1ABOA 2IZVA 2VKNA 3S8LA 3PVQA 1O4HA 2AZSA 2EYWA 1TUDA 1M8MA 2DLYA 1AD5A 3NMZC 2FRYA 2EBPA 1LUNA 3TL0A 1Y0MA 4FBNA 4WCIA 4CC3A 3QWYA 2L3SA 4KRTA 4J9GA 2AKKA 1KSWA 2BTTA 4OMMA 1Z3KA 1KA7A 2FO0A 2V1RA 3MXYA 3OB1B 3VRQA 2YUQA 4RTZA 2CUBA 2RNAA 2SRCA 1LCKA 3PVLA 2EYYA 1U06A 4JJBA 1D4TA 2KYMA 4OMOA 2EW3A 1CWEA 4XZ1A 1NEGA 2KT1A 2NUZA 3I5SA 1AWWA 2ABLA 5HCKA 4AFZC 4AG1C 1BKMA 2GE9A 1PHTA 2DL5A 5ECAA 2HCKA 2DILA 2CI8A 1JYRA 1HCSB 3LH5A 1IJRA 1LUIA 1O4JA 2OI3A 3TSWA 3BUXB 2W0ZA 3OP0A 3JV3A 3CWGA 4EY0A 2NWMA 4JEGA 4L1BB 3GQIB 1UHCA 5FWBA 1WXBA 2FPEA 1T0HA 3NHNA 1NZLA 1MV0B 2EYVA 4E68A 1VYVA 3EHQA 2VIFA 1GHUA 3VS4A 1BM2A 2CDTA 1KIKA 1NYGA 3MAZA 1AB2A 1U5SA 1E7OA 3EG2A 1ARKA 1W1FA 2AUGA 4EIHA 2I0NA 1BBZA 2MIOA 2VVKA 2LQNA 3EG0A 2BZXA 1X43A 4P9VA 2HUWA 2KRSA 1AEYA 2DM1A 4H34A 1SRMA 2EGEA 2C0OA 2DM0A 3M0PA 5D0JA 2MRJA 1AYBA 1UFFA 2ESWA 2OAWA 1H8KA 1AZGB 4E6RA 1I3ZA 1UUSA 1OO4A 2LMJA 1H3HA 1O4AA 2L3TA 3OVEA 5I11A 4RTWA 2O31A 1A08A 5GJWB 1JU5A 2YUOA 2DBMA 1X2QA 2D8HA 4U1PA 2O9SA 2AOAA 2LP5A 2EQIA 4ZNXA 1R1QA 2JM8A 2KK6A 3BUNB 1OV3A 1G83A 4RTVA 1K4US 1B47A 5GJIA 3H41A 2LQWA 2DL4A 1PKTA 1MUZA 3M0SA 4AFQC 2RSYA 2OJ2A 3UYOA 2LCSA 1T0JA 1QWFA 4LNPA 4HVVA 4A63B 1O4QA 5DF6A 1O46A 2A37A 1F2FA 3H0FA 2GNCA 1BHFA 3S8NA 1FHSA 2ECDA 3CBLA 1O45A 1S1NA 2LJ1A 1IO6A 1X2KA 1X27A 1ABQA 4GLMA 4LE9A 2SEMA 3BUMB 2J06A 1BKLA 1FYNA 1O43A 1K76A 2Y3AB 1ZX6A 2IIMA 2G6FX 4JE4A 1X6GA 2RMXA 1OPLA 1WA7A 1ZLMA 1ZUUA 2A36A 2KGTA 5EG3B 2J7IA 2YUNA 1M27C 2RPNA 3I5RA 1O4PA 3C7IA 4ROJA 1B3QA 2GQIA 4RTUA 2EVRA 1M3AA 2MQIA 3THKA 2DX1A 4F16A 1FBVA 1V1CA 2JMAA 4AFUC 3HHMB 1O48A 5BO4A 4J9EA 2EYZA 1A1CA 5IH2A 3NPFA 3TVTA 2AKLA 3EGUA 2J6KA 1YP5A 2KEAA 2DLPA 5FWCA 1O4BA 2CRHA 1H92A 1M3BA 2K79A 1IS0A 3GXWA 3US4A 1TG0A 3BUOB 4RTTA 1H9OA 1ZBJA 1YCSB 2EGAA 3SHWA 4IIOA 4J9DA 1FMKA 1HJDA 1D1ZA 4WWQA 3SEMA 2AK5A 2M51A 1BHHB 1CWDL 3U23A 4HXJA 2MRKA 3TKZA 2EKXA 1J3TA 4DEXA 3WA4A 1UTIA 4K44A 4X1VA 1B07A 1AWJA 4FL3A 1O4RA 2GGRA 4RUGA 4Z8AA 1RQQC 4K45A 1BLJA 4F17A 4X6SA 3N7YA 2JT4A 2CS0A 4F5AA 1MILA 2CR4A 2HDXA 3VS5A 1GCQA 1UECA 1F1WA 1HSQA 4RTYA 2O9VA 1BFJA 3REAB 5HKZA 3UF4A 2RQRA 1JYQA 3R6NA 4LN2A 4J9IA 5EELA 1CKBA 5DC9A 2MCNA 2FRWA 2L2PA 2OZOA 1JEGA 4OHHA 1XA6A 1ZFPE 1A09A 2KNBB 2DL3A 3HCKA 1SHFA 4GBQA 1JU5C 1WQUA 2QMSA 2JMCA 2YDLA 1LUKA 5HKYA 1WFWA 2EGCA 1UJ0A 3CQTA 1QG1E 2K7AB 2ETZA 1GCPA 4J9CA 5EC7A 1X0NA 1RLPC 1SEMA 1GBQA 2YT6A 1R1PA 2FPFA 1CKAA 5IXBA 1OO3A 3KFVA 4D8DA 2C0TA 1UG1A 2HMHA 4OMLA 2XMFA 4Z89A 2GSBA 1WLPB 2Y1NA 1BK2A 3UA6A 2DF6A 3NGPA 2RF0A 4OHLA 1WIEA 1TUCA 3EHRA 1A0NB 3PSKA 1QWEA 2HBWA 4JZ4A 2KXCA 2JYQA 1YN8A 3KFJA 1Z9QA 2YSQA 5EEQA 2CIAA 2VWFA 2FCIA 1LUMA 1A07A 2GBQA 2K2MA 2BBUA 3UATA 2CSIA 1O4KA 2PTKA 2J05A 2XP1A 1JWOA 5CDWA 1AYDA 2KRNA 4LUEA 2W10A 2LZ6B 1KC2A 2B86A 1GL5A 5EHRA 4OMPA 1BU1A 1O4EA 4NWGA 2YSXA 1I0CA 4J9HA 4OMNA 2ECZA 1QKWA 3O5ZA 2FEIA 4CC4B 4CC7A 1YVLA 3M7FA 2DVJA 2H8HA 3GBQA 1RJAA 3CD3A 5DC0B 1NYFA 2K3BA 1Z9ZA 2MOXA 3VS7A 5IBMA 4AG2C 2C0IA 1UGVA 1NLPC 1UDLA 1VYTA 1W70A 1AYCA 5HKWA 2C9WA 2EO6A 4QSYA 1NZVA 2EU0A 3PS5A 1MV3A 4JJDA 2HEQA 3IN7A 1YWOA 1CSYA 1AVZC 1RI9A 2DNUA 1HD3A 1BG1A 3VS2A 1BF5A 2K7AA 1O4OA 3ZNIA 2L3PA 3I35A 3PFVA 1PWTA 2KXDA 2ROTA 1JO8A 3OV1A 1WDXA 3FJ5A 4DGPA 3BUWB 3ULRB 1UURA 5I6VA 1FBZA 4J9FA 1AOJA 1D4WA 2JS2A 1O47A 3N8MA 2D0NA 2O2OA 2J6FA 1GFDA 1GCQC 2HSPA 5EHPA 5AULA 2A28A 1VA7A 2JTEA 2E5KA 2K6DA 3QWXX 1NM7A 1W6XA 3EAZA 2EKHA 1O4IA 1RPYA 1E6HA 2YU7A 2CT4A 1YVHA 4H1OA 1PRMC 1WXTA 2L0AA 1BLKA 4HVWA 2D8JA 1RUWA 3REBB 4GL9E 4ESRA 3UA7A 1UE9A 1A81A 1FU6A 1NEBA 2KROA 2EOBA 3H0HA 4GPLB 1A1BA 1M3CA 1SHBA 2BZYA 4OMQA 4LUDA 4DEYA 2LX7A 1MW4A 1AZEA 1WYXA 1SPRA 4FSSA 2X3XD 4U17A 2LCTA 2O88A 2Y1MA 4D8KA 1A1AA 1M61A 1KJWA 3A98A 1A1EA 2DRMA 2JXBA 1P13A 1AYAA 2CI9A 2DCRA 1XOVA 1PKSA 2JW4A 1SSHA 3N84A 3PLFB 3EG1A 4NWFA 1O4LA 2RMOA 3EACA 1WX6A 2K9GA 3ZL7C 4JGHA 4F59A 1K1ZA 1T3SA 4J9BA 4P9ZA 1I1JA 1PRLC 1YWPA 1JXOA 4K11A 1O41A 3PQZA 3S9KA 3EG3A 5IHNA 2KYBA 4F5BA 2J6OA 1PNJA 3CXLA 3MXCA 1X6BA 3VRZA 1RLQC 1CSZA 3HIZB 4K2RA 2RQUA 4OHDA 4RTXA 3M0RA 2KT8A 1SHGA 2CH4W 2YUPA 1M30A 1OPKA 3IQLA 1QCFA 1E6GA 4ORZA 1ZUKA 1R1SA 2PZ1A 1SHDA 1SPKA 2ROLA 2LNXA 3VGOA 2EL8A 5J3XA 1AWXA 4Y92A 3VROA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ED1A 5KAZA 4ZTJA 3M56A 2P0PA 2QDLA 1QMCA 2RVFA 1O44A 2AZVA 3HFOA 3VS1A 1N8RC 5D6YA 1BHHA 5J26A 5AXIA 3GLXA 3M58A 4EDUA 2BZ8A 3CCEA 2DE0X 4IUUA 4KUIA 4QT7A 5KCHA 4OB2B 1WJRA 1FYRA 1OX9A 2KE9A 2F2WA 3CC7T 3MP6A 4IIMA 2QEXA 2DLZA 4AFSC 5I22A 4M7DE 1WXUA 2LNWA 1SRLA 1QVPA 3CCLQ 4XZ0A 3KXTA 3CCMT 1NPPA 2EPDA 2DIQA 4A4BA 1VIEA 2KY9A 2M0YA 2L6KA 2DMOA 2C06A 2OTLQ 3CD6Q 1K0XA 4C5EA 1VQ9A 2OTJT 2X3WD 1O4DA 4F14A 2RORA 2WSEE 4VUBA 2PNIA 2ZPHB 2KI7A 5GJVB 4FT4A 3S3MA 2QXFA 1YIJQ 2GTJA 2EQJA 3M0QA 3CC2T 1N5ZA 3NTKA 3OYFA 3QDFA 2VC8A 5GAMe 2H3JA 4MMLA 4E47A 1O4GA 3JB9I 1VQKT 1Q86C 3RBBB 4HCKA 5IXFA 1ZSGA 2AHJB 2RO0A 1UHFA 4E7HA 3QDRB 2KNOA 2E70A 2L3QA 2D1XA 1I07A 1P92A 1M1KC 3EGXB 3SDZA 2RQWA 1YHQQ 3I56T 4XU1A 2K2VA 2P4RA 4UC4A 1YNZA 2CSQA 4ME7A 1R0BG 2SHPA 2EO3A 1VQ5T 2PUKB 2NUTA 2IVWA 2DJQA 4M77F 4JJCA 3I9QA 2OQ1A 4KGXB 3AHUA 1WQWA 5HK0A 3P8BB 1M90R 3S8LA 3PVQA 3JB9D 1VQ4Q 1H3ZA 2JNGA 2DPPB 2VYTA 3NMZC 2EBPA 1JBMA 4C92D 2DZ9A 4FBNA 2ZZDA 4CC3A 2L3SA 1K8AR 2V1RA 3OB1B 3CBOA 4IUTA 2SRCA 4J8OA 1LCKA 2ZAEA 2EYYA 1IGUA 1D4TA 4XTWA 1NZ9A 2EW3A 1Y7XA 1CWEA 3CXCA 3JRZA 4J5YA 4AG1C 1PHTA 4J6WA 2DL5A 2WACA 3HKSA 3VV0A 4QW2A 3LH5A 1PD1A 4R55A 5I2MA 2W0ZA 2XI9A 3JV3A 3CWGA 4A4GA 3GQIB 2QQRA 3NHNA 5FWBA 1OX8A 3EHQA 3VS4A 1V76A 1KIKA 1QVGP 2LTOA 4PKCC 1W1FA 3JCMX 3CCLT 4EIHA 1BBZA 2MIOA 5DY9A 3L42A 2DM1A 4H34A 4KH0B 2EGEA 2C0OA 3A8LB 5FRMA 2HD0A 5C6SA 2OTLT 4X9CA 3CD6T 2ESWA 2OAWA 1H8KA 1AZGB 3P8HA 3BY7A 1OO4A 2VV5A 1VQ7Q 1PG5B 3CXCS 2CS7A 4RTWA 3CCVA 2RB6A 4XU0A 3CCUA 3X28B 2PVDB 1X2QA 4U1PA 2O9SA 1YIJT 1VQPA 2E3HA 3CC4Q 4M78F 1BCMA 1VQMQ 3BUNB 1UGPB 1TWBA 5GJIA 2IG0A 4AFQC 1IRXA 1T0JA 4A63B 2GNCA 2K5IA 2NYSA 3OYNA 2LJ1A 4GLMA 4HKEA 2RI2A 1BKLA 2HQEA 1U1SA 3F70A 4Y28E 1YHQT 2IIMA 3JCMf 5LL6S 2K3XA 2NUPB 5GAN6 5GAN2 2CZ6B 2YRVA 1O4PA 2HL3A 2RPNA 3I5RA 1I5LA 3X25B 1WZOA 2EVRA 5FU7C 4OMFB 4LDVA 3V8JA 2DX1A 1VQ4T 4F16A 1RAGB 4AFUC 4FYWB 4J9EA 4M78C 2AKLA 3E9GA 2LC4A 2KEAA 4KBMB 4BE0A 4DQ2A 1M3BA 4XU3A 2QA4Q 4C5GA 3HP9A 2A3LA 2CP0A 3CPWA 4C8QF 4Z02A 2DETA 4A4HA 3BUOB 4IIOA 2X4WA 1FMKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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