2DVJA

Phosphorylated crk-ii
Total Genus 17
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
17
sequence length
228
structure length
227
Chain Sequence
MAGNFDSEERSSWYWGRLSRQEAVALLQGQRHGVFLVRDSSTSPGDYVLSVSENSRVSHYIINSSGPRPPVPPSPAQPPPGVSPSRLRIGDQEFDSLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPVSRSRQGSGVILRQEEAEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYRPASASVSALIGGNQEGSHPQPLGGPEPGPAQPSVNT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for the transforming activity of human cancer-related signaling adaptor protein CRK.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
molecule keywords V-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog, isoform a
total genus 17
structure length 227
sequence length 228
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2dvjA02
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2dvjA01
5FWBA 2ETZA 2J6KA 1BU1A 4HVVA 1O4NA 1X69A 2CSQA 2A37A 2VWFA 1W1FA 2AUGA 4R0KA 2KXCA 1A08A 2YUOA 1LUKA 4A63B 1O4HA 2SEMA 3ZL7C 1M30A 1SPKA 3KFVA 4P9ZA 2FEIA 2O2OA 3PLFB 2L3TA 4F5BA 2C0TA 2F2WA 2KRSA 1AYCA 1W70A 2DL8A 2P4RA 5EHRA 2ECZA 4X1VA 2DA9A 1ZBJA 1H8KA 1FU5A 2L2PA 1RLPC 3VRNA 1N5ZA 2KEAA 1YCSB 4IIMA 3VRRA 4GPLB 3S8OA 3LH5A 1UJ0A 2CUDA 3M0RA 3EHRA 1QG1E 4AG1C 3TVTA 5I11A 3EAZA 1LUMA 2J05A 3VRQA 1KJWA 1O4GA 3K2MA 2KYBA 2ED1A 2J7IA 2NUZA 1GCPA 2CI9A 3H0IA 1BFJA 2CUBA 1AB2A 2EYXA 1JYRA 1ARKA 5GJVB 4XZ0A 2YU7A 1H9OA 2ED0A 1MV3A 2J6FA 2LZ6B 1AYBA 1P13A 3PS5A 1WQUA 4HXJA 1LKLA 3OB1B 2K7AA 2LMJA 2MC1A 1NEBA 2DBMA 1VYTA 4RTYA 1K9AA 2VVKA 3CBLA 2EO6A 2L6KA 2YSQA 5D0JA 4RTUA 2FO0A 4D8KA 2GE9A 1AWWA 1FBVA 4J9CA 5IXFA 4E6RA 1SPRA 2VIFA 1G2BA 1UFFA 2SRCA 1MV0B 3M0UA 2FPDA 2CIAA 3ZNIA 2CREA 2HBWA 1SPSA 3BUWB 2M51A 3CXLA 2ENMA 2C9WA 1GBRA 4OMOA 1GRIA 2DMOA 1KC2A 1IS0A 1GCQA 1PKSA 3I35A 3CQTA 2QMSA 1V1CA 2DE0X 2EL8A 2RQUA 5HCKA 2B3OA 3UA6A 1D4TA 1BG1A 1M3BA 4Z88A 2RORA 1K4US 2SHPA 2DF6A 4KRTA 2G6FX 5IH2A 3MXYA 1TUCA 2MRKA 3SEMA 2HCKA 1Y0MA 1BMBA 1SEMA 1I1JA 3NPFA 2FRWA 2LNHB 4J9GA 1E7OA 2ROLA 1O45A 1HJDA 2RSYA 3MXCA 1B3QA 2KRMA 1A1BA 1O48A 1ZFPE 1A1EA 2Y1NA 4J9BA 1NM7A 3C7IA 4EY0A 3TL0A 1OV3A 5IHNA 1O4JA 5AXIA 2JMAA 2L3PA 2YT6A 4JPBW 1TUDA 2JW4A 3TSZA 1OEBA 4FBNA 1K1ZA 1A1AA 1EFNA 2EKXA 4FL3A 2PZ1A 1ABQA 4JGHA 5FW9A 1CKBA 4OHEA 4OMNA 2BTTA 2RVFA 1GL5A 2HDXA 4OHHA 2HSPA 4K44A 2K3BA 3OP0A 1U06A 1AOTF 3FJ5A 3BUXB 1CWDL 2LJ0A 1UJYA 1F2FA 4RUGA 3GBQA 4NWFA 2AOAA 1LCKA 1O49A 2BZXA 3TSWA 1X0NA 2JXBA 1JU5C 5EC7A 2AOBA 1UDLA 1LKKA 2DVJA 2EGCA 3H0FA 1SRMA 4J9IA 1J3TA 1UE9A 1VYVA 2KROA 1X6GA 4ESRA 1PKTA 2YSXA 1ZSGA 2CH4W 2GQIA 2DRMA 3EG3A 1B07A 2J6OA 4JJDA 1BF5A 2LJ1A 2IUHA 1H92A 1E6HA 1O4QA 2HMHA 2RNAA 3OV1A 5HKWA 3UYOA 1Z3KA 2MOXA 2KYMA 1O4KA 5DC9A 1BKLA 2GTJA 4JEGA 1UECA 2GGRA 1QCFA 1YVLA 1BHHA 1FU6A 2FPEA 1B47A 2EGAA 1E6GA 1AOJA 4AG2C 5DC4A 2FRYA 1A07A 1Y57A 2FPFA 1AOUF 4E68A 1O4MA 2DX1A 1X43A 2YDLA 1A09A 1O4IA 2EO3A 1X2QA 5CDWA 1YVHA 1OO3A 3M7FA 1R1SA 5GJIA 2AZSA 3S9KA 1U3OA 2LX7A 2OZOA 1Z9ZA 1R1QA 2C0OA 4F14A 1LUIA 3M0QA 4J9DA 1O4AA 1CJ1A 5DF6A 1PHTA 1O46A 3OB2B 1MUZA 2MIOA 4JZ4A 3H0HA 1AVZC 1A1CA 1WDXA 3CD3A 2YUPA 1QKWA 4GBQA 2V1RA 1UURA 3VROA 2DNUA 2PNIA 2YUNA 1M61A 2RN8A 3UA7A 5AULA 2K79A 4LNPA 5EG3B 2ABLA 1FBZA 1MILA 1T3SA 2HDVA 5IHKA 2BZ8A 2JM8A 1UUSA 2PNBA 3N8MA 2BZYA 3TKZA 2F2VA 2LQNA 3EG0A 1IJRA 4F5AA 3N84A 1MW4A 1K76A 2EKHA 1QKXA 2RQTA 1W6XA 2JS0A 3S8LA 4CC7A 1K0SA 4OHDA 3OVEA 1NLOC 1HCSB 1HSQA 1ZUYA 1AYDA 2DILA 2K6DA 2DLZA 3QWYA 1S1NA 2EGEA 2IIMA 3GXXA 2GBQA 2JMCA 1O4CA 2OI3A 1FMKA 4EIHA 4AFSC 1O4BA 1SHDA 2EQIA 1GFDA 4RTTA 4JJCA 2D0NA 1PICA 1ZLMA 1WA7A 1NEGA 2LCSA 2DL5A 2ESWA 3M0TA 3PQZA 1JXMA 1D4WA 4GL9E 1LCJA 2LNXA 1SHBA 1WLPB 1O43A 1KSWA 1Y1UA 3VS3A 1UG1A 4Z89A 1TZEE 1O4EA 3S8NA 3THKA 1O42A 2LCTA 1WIEA 1BKMA 2A28A 3NGPA 2L4KA 3R6NA 1OPLA 3VS7A 4L1BB 3VS1A 4AFQC 1M3AA 5DC0B 1SHFA 2EOBA 1SHAA 2DLYA 2IUGA 4J9HA 2AZVA 2JT4A 3VS6A 3UATA 2O9SA 2K7AB 3PSJA 1JXOA 4WCIA 1BB9A 2RMOA 3PJPA 1PRMC 3REAB 4RTVA 3PFVA 1TG0A 3A98A 1IO6A 3QWXX 1PRLC 2MQIA 4Y92A 1BHFA 4FSSA 2KBTA 1CSKA 5KAZA 2HDAA 1JU5A 4CC2A 1T0HA 1M27C 2DCRA 1O4FA 1GFCA 2I0NA 1KFZA 1OO4A 2Y1MA 2L0AA 3CWGA 2KR3A 2RMXA 1O4PA 2BBUA 1VA7A 2O9VA 3O5ZA 3EACA 4Z8AA 3UF4A 1LUNA 5IBSA 4F17A 5IHIA 4LE9A 4RTXA 4RTWA 3GQIB 3EG2A 3I5SA 1T0JA 1AWOA 1AYAA 1ABOA 2E5KA 1NRVA 2V1QA 2MK2A 2RQWA 2W0ZA 3VRYA 3IN8A 4QSYA 4HCKA 4CC3A 4M4ZA 2Y3AB 1K0XA 3I5RA 2KNBB 4RTZA 2AKLA 4OMLA 2DL4A 1A0NB 2EVRA 1CWEA 2J06A 2PLDA 4WWQA 4A4CA 3HCKA 5HKZA 4OMQA 1YN8A 5GJWB 4HVWA 1RUWA 1O4LA 1WI7A 4CC4B 2KT8A 1UHCA 2CT4A 3SHWA 3VS5A 1BLJA 3N7YA 3BKBA 4K11A 2JYQA 2HEQA 2KT1A 1BBZA 1AZEA 3GXWA 1I3ZA 2DBKA 4LUEA 2EW3A 1UGVA 4XZ1A 2CR4A 2DJQA 1YNZA 3RNJA 5BO4A 1Z9QA 1RI9A 2EYWA 3EG1A 3M0PA 3VS0A 2CRHA 2NWMA 1U5SA 3BUMB 1AWXA 1WXTA 1VYUA 4OHIA 4HVUA 2L3QA 2GTOA 5ECAA 4F16A 1O4OA 1NZVA 2DM0A 3VS2A 1RQQC 3PVQA 4DEXA 4K45A 1BK2A 4OMPA 3PE0A 1NZLA 1G83A 3EGUA 1JWOA 2D8JA 1JYQA 2AK5A 1QADA 2H46E 2OJ2A 1XA6A 4NWGA 5FWCA 2LQWA 3HHMB 2YUQA 1X27A 4EIKA 4H1OA 1BM2A 2EYYA 2K9GA 5J3XA 4GLMA 4AFUC 1JO8A 3JV3A 2RQRA 4DGPA 1HD3A 1UHFA 2F2XA 3I9QA 5HKYA 3U23A 5L23A 2FCIA 3NHNA 2KNOA 2ECDA 4J9FA 2MCNA 3NMZC 4H34A 1YP5A 2IUIA 5GJHA 2W10A 2DRKA 2EYZA 2HUWA 3US4A 3VRZA 1O47A 5EHPA 1OPKA 1GCQC 3H41A 2D1XA 3PSKA 2RF0A 1HCTB 2DLPA 1AD5A 2MRJA 2L3SA 2JS2A 1BHHB 1QWEA 2EPDA 2JM9A 1D1ZA 2OAWA 1O41A 1TCEA 2XMFA 2CBLA 1X6BA 2IZVA 3IQLA 3IMJA 2RPNA 1SSHA 2X3XD 4OHLA 2JTEA 2H5KA 2CS0A 2EYVA 2CT3A 1M3CA 1NG2A 4J9EA 1CSZA 5EEQA 3REBB 1PNJA 5EELA 3EHQA 2KE9A 2DL3A 1ZUKA 2CDTA 2KGTA 4DGXA 1JYUA 1WX6A 3PVLA 1BLKA 1RPYA 1GHUA 2CSIA 4JJBA 1R1PA 3VS4A 1UUEA 3HIZB 2LNWA 2QDLA 4LN2A 2O88A 2KRNA 4ORZA 1O4DA 4OMMA 4JE4A 1QLYA 1O44A 1SHGA 4AFZC 1CKAA 1NLPC 1KIKA 2ROTA 1A81A 4TZIA 1I07A 1XOVA 3C0CA 4X6SA 1YWPA 4QT7A 1I0CA 1GBQA 2GSBA 3RBBB 4P9VA 2KK6A 3VGOA 1SKJA 1X6CA 1OOTA 2FG0A 2X3WD 2RQVA 1AEYA 1NYFA 1RJAA 1WXUA 3BUOB 4IIOA 4F59A 2DL7A 4D8DA 1F1WA 1BFIA 3BUNB 2DYBA 4ROJA 2DX0A 2LP5A 1FYNA 2B86A 2KXDA 1KA7A 1AWJA 1WXBA 4A4BA 2AKKA 1WYXA 1FYRA 2H8HA 1M27A 3IMDA 2OQ1A 3IN7A 1WFWA 2K79B 3WA4A 2DM1A 2D8HA 2CI8A 1T3LA 5IXBA 2XP1A 4GWFA 4U1PA 1O4RA 3T04A 4U17A 2EU0A 1JQQA 3MAZA 2LJ3A 1ZUUA 1RLQC 4DEYA 1AZGB 1YWOA 1FHSA 3ULRB 1M8MA 1SRLA 5I22A 1ZX6A 2K2MA 2PLEA 4LUDA 1KA6A 1CSYA 2CH4A 2PTKA 1PWTA 2PNAA 3KFJA 4JZ3A 3VRPA 1QWFA 4FL2A 2A08A 2VKNA 4ZNXA 2C0IA 1X2KA 2O31A 1H3HA 4K2RA 4E93A 3M0SA 2GNCA 1UTIA 1JEGA 5I6VA 5IBMA 2A36A 2M0YA 2EBPA 1NYGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KI7A 2H3EB 3CCVT 2J6KA 4MZPA 1FMVA 2VB6A 1WHJA 2VWFA 4FIBA 4C92E 2AUGA 2HSEB 4NS5A 3CMEA 4A63B 1O4HA 3KFVA 1IZ6A 4M7DD 1C0MA 2C0TA 2F2WA 1AYCA 3CMET 1QVGS 5EHRA 5GAOp 4N4GA 4M7DB 3HFNA 1R8OB 1H8KA 3UWNA 1RLPC 1G3SA 2MI6A 1JJ2P 5DLOA 2QYZA 1QVGA 2VUBA 3S3OA 4GPLB 3S8OA 3M0RA 2EYQA 3EHRA 3EAZA 2J05A 1KJWA 2KYBA 1Q7YR 1GCPA 1OU9A 1BFJA 2DK3A 5KCOA 1S72T 1UB4A 3JSCA 3PFSA 2YU7A 1Q7YU 1H9OA 2XDPA 5KE3A 1OYXA 4C0FA 1VQOQ 3DB3A 2K7AA 1C1AA 1VYTA 2DBMA 2EO6A 4C92F 1YJNT 2BIVA 1M2OA 4KGXB 1AWWA 2EKOA 3PMIA 3L2UA 2VYTA 4E6RA 1Q95G 3OW2S 1G2BA 1PD0A 4OF1A 2P0QA 5LJ5j 3RKWA 1GBRA 4A4HA 3HHTB 3CQTA 2DE0X 2B3OA 1M3BA 3V7RA 1K4US 1QW1A 4M75A 1SEMA 1UGRB 4JS4A 1WHHA 2FRWA 1E7OA 1BI2A 2RSYA 3MXCA 2EIFA 3MJXA 4LD6A 5GAOq 1O48A 1WJSA 1MMNA 1NM7A 2MK5A 3CPWP 3C7IA 3EGDA 1KG1A 2E4HA 1O4JA 2L3PA 1TUDA 5GMKj 3OYBA 4FBNA 5AYFA 2PZ1A 3OMGA 1ABQA 5L8RE 3CC4A 4JGHA 1GL5A 1Y96A 4K44A 1G5VA 4C5HA 1U06A 4A4GA 4F7UA 4RUGA 4NWFA 3SFMA 1G8XA 2BZXA 1VIFA 2JXBA 4A53A 5EC7A 1ZHIA 3SD4A 5LJ5d 4JLGA 1LKKA 3OA6A 1N8RR 4ZTJA 1SRMA 1ZQ1A 4J9IA 2IG0A 1M2VB 1UE9A 2X4WA 3TQ7P 1YJ9A 1PKTA 4E7HA 4JJDA 2DRMA 1M2VA 2IUHA 2YLBA 3QHSA 4X9DA 3PNWC 4II1A 1Z3KA 2MOXA 2COWA 1WHGA 1X01A 3VKIA 2EWNA 2JVVA 2V8JA 4JEGA 2GGRA 5GAN8 2E10A 3HL8A 2YLCA 3CCUQ 1B34B 1FU6A 2FPEA 2HZYA 4XTVA 1A07A 5AT1B 1Y57A 2KDSA 3HFOA 4QQGA 5HY6A 1A09A 1KQSP 1TS9A 4V2SA 5CDWA 3JCMf 3M7FA 4OB2B 1VQOA 1R1SA 2XG8D 2P0KA 1WJQA 4HA8A 1R0BG 4C0DC 5KYYB 1R1QA 3RMSA 2CP0A 3EFOA 3GPLA 1O4AA 5I2MA 1CJ1A 5DF6A 1PHTA 2V26A 4PJJA 3OB2B 1M90U 4GY5A 4JZ4A 4BE2A 3A8MB 2XU8A 3VROA 2DNUA 2YUNA 1S72Q 3QBYA 2K79A 4LNPA 5EG3B 3X24B 1T3SA 2A3LA 3N8MA 2JM8A 2BZYA 5GMKi 2OTJQ 4LDVA 3RERA 2FVUA 2RQTA 2JS0A 1K0SA 4OHDA 2FZCB 3OYFA 1ZUYA 4IUVA 1YIJA 2K6DA 2DLZA 1MMGA 3EGXB 1VQ9Q 3CBMA 2DEQA 1OU8A 2Z0WA 1O4CA 2PU9B 2OI3A 3TREA 1O4BA 1SHDA 2KVQG 4RTTA 4JJCA 1ZLMA 2LCSA 4PFOA 2ESWA 1IHVA 4XU0A 1D4WA 4TVRA 1U1SA 1KSWA 3QXEB 1MGQA 2LC4A 2WSCE 3LYVA 3CCMA 1FMWA 1O42A 2VV5A 1BKMA 1R77A 1VQ5Q 4NL2A 4XTXA 4L1BB 1X75C 3VS1A 2GFUA 5CCAA 2IUGA 5C0MA 5GANg 1WJRA 2O9SA 3LH0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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