2DVJA

Phosphorylated crk-ii
Total Genus 17
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
17
sequence length
228
structure length
227
Chain Sequence
MAGNFDSEERSSWYWGRLSRQEAVALLQGQRHGVFLVRDSSTSPGDYVLSVSENSRVSHYIINSSGPRPPVPPSPAQPPPGVSPSRLRIGDQEFDSLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPVSRSRQGSGVILRQEEAEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYRPASASVSALIGGNQEGSHPQPLGGPEPGPAQPSVNT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
publication title Structural basis for the transforming activity of human cancer-related signaling adaptor protein CRK.
pubmed doi rcsb
molecule keywords V-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog, isoform a
total genus 17
structure length 227
sequence length 228
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2dvjA02
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2dvjA01
1O43A 2EO6A 3CQTA 2JYQA 3EACA 2LNXA 1YNZA 1BFIA 1ABQA 1K76A 1MV0B 2L3SA 2ECDA 4NWGA 1O45A 2KYMA 1K9AA 2V1QA 1WLPB 1JU5C 2K7AA 2DL5A 5GJVB 4AFQC 1H3HA 3I5RA 4Z8AA 1BKLA 3K2MA 1O4QA 2M0YA 4GBQA 1R1PA 2RQRA 1P13A 4K44A 4K2RA 3EG2A 2AKLA 5IXBA 1V1CA 4Z89A 2MQIA 3I9QA 2PLEA 2LJ3A 1GBQA 1B07A 1BU1A 2LQNA 2EQIA 3M0SA 5L23A 1AWOA 1UJ0A 2LCSA 1KA7A 4X6SA 1SHFA 2LNWA 1GHUA 2W10A 4LN2A 3SHWA 5IBSA 2G6FX 2K79B 1WFWA 3IN8A 2HEQA 2CH4W 2IUGA 5EHRA 1Z9QA 1NYGA 2CSQA 3CBLA 5FW9A 3MXYA 4OMPA 3HHMB 2J6OA 1O4OA 1O4BA 1WIEA 1I1JA 1PRMC 4TZIA 2JS2A 2OAWA 5IXFA 1NLPC 2EGCA 2FRYA 4F59A 1LCJA 1SHDA 2QMSA 1WX6A 4LNPA 2CI8A 1BHHB 2LX7A 1GCPA 3VRZA 4J9IA 1OOTA 1FYNA 4F16A 2MRKA 2O88A 5EC7A 2XMFA 2J05A 5DC9A 5EG3B 2CUBA 2EVRA 3I35A 2GSBA 2EYWA 1D4WA 1PNJA 1X43A 2GQIA 4GLMA 1NZVA 3VS1A 4RTUA 1G2BA 1A81A 2HBWA 2H5KA 2RVFA 1BF5A 2LCTA 1CKBA 3VRYA 4AFSC 3THKA 1OEBA 1B3QA 1LKKA 2I0NA 2HSPA 1JYRA 2YUPA 1HSQA 3UYOA 2O9VA 1HJDA 4DGPA 2LQWA 2VIFA 5EHPA 2KBTA 3WA4A 4OHHA 1AD5A 1E6HA 2DL7A 2ED1A 2DA9A 1D1ZA 4OHDA 4J9EA 2A37A 2KNBB 1O4IA 1RUWA 4D8DA 1PHTA 2Y1NA 2C0IA 1ZLMA 4K11A 1GCQC 2DRMA 2LZ6B 2KK6A 2P4RA 3TKZA 3PSKA 4X1VA 3VRNA 1D4TA 3VROA 1NZLA 3CXLA 3HCKA 3I5SA 2GNCA 2K2MA 3PVQA 1YWPA 4J9HA 2MK2A 1YN8A 1ZSGA 2ENMA 5D0JA 5GJHA 1BBZA 1NEGA 2F2WA 1I3ZA 3OVEA 2B3OA 1UHFA 4IIMA 1SHAA 4JE4A 2PZ1A 1HCSB 1K0SA 3REAB 1QLYA 1X6GA 2DM0A 1TG0A 1AYCA 1U06A 2YDLA 4RTVA 3US4A 2CRHA 2VKNA 2LJ1A 2D8JA 1SPSA 4JEGA 2OJ2A 2C0TA 2JW4A 2FO0A 2PTKA 1O4PA 4AG2C 1GFDA 2ROTA 1AYAA 1WXBA 2HDXA 1SPRA 1UUSA 5AXIA 2FRWA 2DBKA 1MV3A 2RQWA 1U3OA 1H8KA 4KRTA 1FYRA 1T0JA 1QADA 2DLZA 3S8NA 4JPBW 2KYBA 2EOBA 1O4RA 2MOXA 2JS0A 1JQQA 2EGEA 2RQTA 4J9FA 2CI9A 3JV3A 2YUQA 3QWYA 2H8HA 3TL0A 2JM8A 1QKWA 1JWOA 1AOJA 1NM7A 1W70A 5HKWA 1ABOA 3PS5A 4ROJA 4E93A 2DBMA 1AZEA 4OMOA 2EU0A 2K7AB 4ESRA 2D0NA 1JU5A 3O5ZA 4M4ZA 2IIMA 1AWJA 3LH5A 1VYUA 1NEBA 4WCIA 4NWFA 1M30A 1ZX6A 2DJQA 2MIOA 2F2VA 5FWBA 1O4GA 1WDXA 4JZ4A 1M3AA 5IBMA 1AZGB 5GJWB 1O48A 1OV3A 1FBZA 2ESWA 1O4KA 2LMJA 4CC2A 3VS3A 4ZNXA 4P9VA 1GBRA 1U5SA 1KIKA 1MILA 1MW4A 1UTIA 4DEXA 1GL5A 1X27A 3VS0A 2GTJA 3ULRB 2K6DA 1K0XA 2FPDA 1WXUA 4GL9E 1HD3A 2JMAA 3BUWB 2FG0A 1NRVA 2PNBA 4F17A 1LKLA 1CWDL 1RLPC 3EHQA 1FBVA 4OMNA 1PKSA 2FEIA 4HVVA 1IS0A 5AULA 2AOBA 1PKTA 2K9GA 2CUDA 3GQIB 1RQQC 2DX0A 1W1FA 4R0KA 1RI9A 1HCTB 1CSZA 1I07A 2RQVA 3UATA 4F5AA 2K79A 2L0AA 5IHIA 4GPLB 4EY0A 2O9SA 3EGUA 4IIOA 4A63B 1AOTF 5GJIA 3VRPA 4DEYA 1SKJA 2GGRA 2CBLA 1WI7A 2EYXA 1FU5A 1GFCA 1TUDA 1O4NA 2IUIA 3NGPA 4LUEA 1WYXA 1F1WA 1O4AA 1Z3KA 1SPKA 1FU6A 3OB2B 2HUWA 3U23A 5HKZA 2L3TA 1TUCA 3QWXX 2L4KA 1K1ZA 1M61A 2BZ8A 4OMLA 2RMOA 3NMZC 2CREA 1UURA 3GXWA 4AFUC 2RN8A 1AB2A 1R1QA 1IO6A 1KSWA 1QKXA 1ZUKA 2SEMA 2X3WD 2KXDA 2CIAA 3S8OA 2L2PA 1MUZA 1AEYA 3A98A 3PE0A 4OMMA 4CC3A 4D8KA 4EIHA 4F5BA 3OP0A 1BG1A 1O41A 1YP5A 3TVTA 3CD3A 4EIKA 1K4US 1J3TA 2CT4A 2DLPA 2SHPA 2A28A 2J06A 2JMCA 1UDLA 1NYFA 1QG1E 5DC4A 3RNJA 5IHKA 1GCQA 2DILA 2JTEA 3PVLA 4E6RA 3VRQA 2EW3A 3H0FA 3PLFB 1VYVA 1Y1UA 4JJBA 3C7IA 1Y57A 1H9OA 1RPYA 1BFJA 2QDLA 2NWMA 5BO4A 4LUDA 4HVUA 4U1PA 1OPLA 4H34A 3OV1A 4XZ1A 3BUXB 2BTTA 3EAZA 2E5KA 3EG1A 2HDAA 2A08A 2J6KA 4HCKA 5ECAA 3EG3A 4CC7A 2YU7A 3M0PA 1SHGA 1S1NA 5IHNA 2OI3A 4Y92A 2CR4A 4FSSA 2BBUA 1BB9A 3H41A 1UFFA 4QSYA 2DL3A 1F2FA 4JZ3A 1OO3A 1FHSA 5FWCA 1A0NB 5HCKA 5IH2A 1M27C 1X2KA 2RMXA 1PWTA 3VS4A 1A08A 1O47A 4JJCA 2OQ1A 2CSIA 1QCFA 3VGOA 2HCKA 1EFNA 2KRMA 1WXTA 3FJ5A 2C9WA 2CDTA 1O4MA 3ZNIA 1UJYA 2JM9A 1RJAA 2W0ZA 3M7FA 3UF4A 2GE9A 3T04A 1T3SA 5I6VA 1O46A 3PQZA 4FL3A 5EELA 3UA6A 2F2XA 1H92A 2RPNA 1SSHA 1GRIA 3VS7A 1O4EA 1LCKA 2VWFA 2OZOA 2JXBA 2CT3A 4U17A 2CS0A 1E7OA 1UHCA 3BUOB 2BZYA 2DYBA 1VYTA 1O4JA 2AKKA 2EPDA 1KA6A 3RBBB 1CWEA 4FBNA 4J9CA 1KC2A 1XA6A 5I11A 2IUHA 2PLDA 3M0QA 1NG2A 2PNAA 1BKMA 1AVZC 3IQLA 2VVKA 3SEMA 1BMBA 5EEQA 2RF0A 1CSYA 2L3PA 1ARKA 3R6NA 2KNOA 1A1BA 3BUMB 2KEAA 1SEMA 5DC0B 1XOVA 4OHIA 1X6CA 2KT8A 2IZVA 3HIZB 3H0IA 2JT4A 4J9BA 2EYZA 2A36A 1QWFA 1AYBA 2V1RA 2D8HA 3M0TA 4OMQA 1AWWA 4ORZA 2SRCA 5J3XA 1X2QA 1KFZA 1E6GA 4J9GA 2Y3AB 2DRKA 3EG0A 3GBQA 4JJDA 2AUGA 2L6KA 1AWXA 1O4CA 1O44A 2Y1MA 3S9KA 1ZBJA 2M51A 2ECZA 2YSQA 4XZ0A 1Y0MA 1YWOA 1BLJA 1JO8A 3C0CA 2H46E 1AOUF 2DMOA 3M0UA 1CKAA 1JEGA 3KFJA 2ED0A 5HKYA 2EYYA 2KXCA 1NLOC 1A09A 4K45A 4RTWA 3ZL7C 1M8MA 3M0RA 4LE9A 4J9DA 5I22A 2C0OA 1JYUA 4RTXA 3CWGA 4H1OA 2YUNA 2MRJA 4HXJA 2GBQA 5DF6A 1I0CA 2RSYA 3REBB 1TCEA 2J6FA 4GWFA 2AZVA 2O31A 1YVHA 2EYVA 1BHFA 1QWEA 3IMDA 3NHNA 1A1AA 1O4FA 1BK2A 3VS5A 1BHHA 4OHLA 1RLQC 5KAZA 2KT1A 2AK5A 2KE9A 1O49A 1M3BA 1UE9A 3KFVA 1X69A 1CJ1A 1LUMA 2CH4A 3MAZA 1OPKA 1UUEA 2DL4A 1M3CA 3IMJA 1W6XA 3EHRA 2YUOA 2MCNA 1UECA 1YVLA 1YCSB 2AOAA 4HVWA 4JGHA 3MXCA 2LP5A 3VRRA 1G83A 2KRSA 1R1SA 1UG1A 2EBPA 1ZUYA 1B47A 2EKHA 2YT6A 2DM1A 2EL8A 3VS2A 3S8LA 3VS6A 1N5ZA 2D1XA 2RNAA 1A1CA 1O4DA 3GXXA 2B86A 1UGVA 2PNIA 2MC1A 1PRLC 4DGXA 1Z9ZA 2DNUA 1A07A 2BZXA 3TSWA 1TZEE 2DVJA 1BLKA 3IN7A 4RTZA 3NPFA 1A1EA 4RTTA 1FMKA 3TSZA 1WA7A 1WQUA 3PFVA 4QT7A 2GTOA 2LNHB 1BM2A 1LUNA 1X0NA 2HMHA 3BKBA 3N84A 1O4LA 4E68A 1SHBA 2X3XD 1O4HA 2LJ0A 1JXMA 3H0HA 2YSXA 4A4BA 2J7IA 2KRNA 2L3QA 1LUKA 4WWQA 4RTYA 4CC4B 2DL8A 1O42A 2O2OA 4Z88A 1AYDA 1M27A 2ETZA 2KROA 4AFZC 1ZFPE 3PSJA 2KR3A 2KGTA 3N7YA 1JXOA 1T0HA 4RUGA 2FPEA 3PJPA 4L1BB 1IJRA 4F14A 2NUZA 2XP1A 1LUIA 3BUNB 2DX1A 2ROLA 2ABLA 2EO3A 1X6BA 1KJWA 2DF6A 2DE0X 4AG1C 4P9ZA 2EGAA 3N8MA 2FPFA 3UA7A 2HDVA 2FCIA 2RORA 2DLYA 1SRLA 5CDWA 2RQUA 1SRMA 1T3LA 2DCRA 4OHEA 1ZUUA 1VA7A 2K3BA 4A4CA 1PICA 2EKXA 1JYQA 2AZSA 1OO4A 4FL2A 1CSKA 3OB1B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JAME 1BFIA 5GAOl 1VQLT 3C12A 2ZGWA 3SD4A 2ECDA 1JBMA 5GAMe 4C92D 3JCMf 3CMAA 4ZN3A 2K7AA 3G71T 4AFQC 3EFOB 3K2MA 3QZ5B 2M0YA 4BI3A 1P13A 3D7SB 1Q81R 3GNFB 1V1CA 3VUZA 3I9QA 2PLEA 1Y71A 3JCMb 1B07A 2LQNA 1Y96A 2GF7A 5L23A 1AWOA 1UJ0A 2LCSA 4X6SA 2LNWA 2LC4A 1Q95G 4M75G 4WTOB 5IBSA 2G6FX 1I5OB 2HEQA 2LX9A 2CH4W 1Z9QA 4C92F 3E1SA 3FEOA 3MXYA 3PGGA 2EWNA 4N0AC 3BE3A 1QW1A 1I1JA 1VQMT 4JRIA 1KC8U 2OAWA 3CCUQ 1K9MR 2CI8A 2LX7A 1GCPA 3FJPA 4J9IA 2RM4A 4F16A 5I2MA 3MO8A 5KYWB 1BI1A 1TS9A 2O88A 1PSEA 4QQGA 5EC7A 2XMFA 1YBYA 5DC9A 2EVRA 3CPFA 4J8OA 2GSBA 1Q86C 1D4WA 1X43A 2KMTA 3CCRQ 1NZVA 4C8QD 3VS1A 2E10A 2HBWA 2LCTA 3THKA 1OI1A 1JYRA 3UYOA 5EHPA 2VIFA 1OU9A 2KBTA 2K5IA 1AD5A 2RD1A 2XK0A 1UGQB 4C0DB 1D1ZA 4OHDA 1O4IA 3QG1A 3N5BB 2EFIA 4K11A 4HKEA 1M1KU 2DRMA 2KK6A 4M78A 5GAN5 1YI2Q 1M5Q1 3CCVT 1KD1U 3TKZA 1Q7YU 1NZLA 2GNCA 3LWIA 1YWPA 4PJMA 5D0JA 5GJHA 3UT1A 2JTFA 1IRXA 1NEGA 1YJNA 3CC7T 2B3OA 1BIBA 2EJGA 2DIQA 3MP1A 1SHAA 4JE4A 1HCSB 1K0SA 3GF5A 3CPWA 4TVRA 2PVGB 2YDLA 4RTVA 3M57A 1G3WA 1GXIE 1O4PA 4AG2C 1R0CB 1WXBA 4M75D 5J3BA 1SPRA 4C92B 2QK0A 2FRWA 3PMIA 3OYGA 2HL5C 1H8KA 4KRTA 1FYRA 3OYLA 3HFNA 1RABB 2DLZA 4JPBW 3EFSA 1JRIA 2RQTA 2HQEA 4J6WA 4D6WA 3A1PA 3QWYA 4UC4A 1IZ6A 3TL0A 1QKWA 4MMKA 5J39A 3JB9H 1W70A 5HKWA 1D1BA 3TQ7P 3MEUA 1AZEA 2EU0A 4ESRA 3WVDB 4M78G 1FMVA 3MP6A 2BIVA 4L5GA 4M75F 1ZX6A 2DJQA 2F2VA 4LXCA 1WDXA 1M3AA 1K73C 4EMKB 3MP8A 5KYUA 1OV3A 4B6MA 4KH0B 3CCLQ 2GFUA 1YCYA 3VS3A 4ZNXA 3CC4T 2DD5A 2ZPEB 1UTIA 3EGXA 2GTJA 1I8FA 1HD3A 3S3OA 2JMAA 2VC8A 1NRVA 3TCJA 4M7DE 1OQKA 1FBVA 4N0AA 5AULA 2QI2A 4J6XA 3CCMQ 1VQ8Q 3CCET 4C8QB 1I07A 2L0AA 5FRNA 3EGUA 3OYDA 4PFZA 3ASKA 3JCMe 2CP2A 2CBLA 2MYSA 1WI7A 2EYXA 3JB9I 1O4NA 2DZCA 4JLGA 1O4AA 4DQ2A 1BI3A 1H641 3WXMB 2BZ8A 4OMLA 3H9NA 1UURA 2JNGA 5CQYA 2RJDA 5GAN2 1KC8C 1IO6A 1QKXA 1ZUKA 3A8LB 2KXDA 2CP0A 3A98A 1EIFA 4DOWA 3TVTA 4NOYA 1VQPT 1J3TA 2AT1B 3RNJA 2OTLQ 3VRQA 3H0FA 3X20B 1VQNA 3OYIA 5FRMA 1RPYA 1K8AU 2QA4A 2NWMA 1I81A 2VGNA 2E41A 4HVUA 4H34A 1U1TA 3OV1A 1QVFS 3I55T 5KE3A 3EAZA 2E5KA 4LD9K 2HDAA 4M75B 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1JEG A;  3KFJ A;  2ED0 A;  5HKY A;  2EYY A;  2KXC A;  1NLO C;  1A09 A;  4K45 A;  4RTW A;  3ZL7 C;  1M8M A;  3M0R A;  4LE9 A;  4J9D A;  5I22 A;  2C0O A;  1JYU A;  4RTX A;  3CWG A;  4H1O A;  2YUN A;  2MRJ A;  4HXJ A;  2GBQ A;  5DF6 A;  1I0C A;  2RSY A;  3REB B;  1TCE A;  2J6F A;  4GWF A;  2AZV A;  2O31 A;  1YVH A;  2EYV A;  1BHF A;  1QWE A;  3IMD A;  3NHN A;  1A1A A;  1O4F A;  1BK2 A;  3VS5 A;  1BHH A;  4OHL A;  1RLQ C;  5KAZ A;  2KT1 A;  2AK5 A;  2KE9 A;  1O49 A;  1M3B A;  1UE9 A;  3KFV A;  1X69 A;  1CJ1 A;  1LUM A;  2CH4 A;  3MAZ A;  1OPK A;  1UUE A;  2DL4 A;  1M3C A;  3IMJ A;  1W6X A;  3EHR A;  2YUO A;  2MCN A;  1UEC A;  1YVL A;  1YCS B;  2AOA A;  4HVW A;  4JGH A;  3MXC A;  2LP5 A;  3VRR A;  1G83 A;  2KRS A;  1R1S A;  1UG1 A;  2EBP A;  1ZUY A;  1B47 A;  2EKH A;  2YT6 A;  2DM1 A;  2EL8 A;  3VS2 A;  3S8L A;  3VS6 A;  1N5Z A;  2D1X A;  2RNA A;  1A1C A;  1O4D A;  3GXX A;  2B86 A;  1UGV A;  2PNI A;  2MC1 A;  1PRL C;  4DGX A;  1Z9Z A;  2DNU A;  1A07 A;  2BZX A;  3TSW A;  1TZE E;  2DVJ A;  1BLK A;  3IN7 A;  4RTZ A;  3NPF A;  1A1E A;  4RTT A;  1FMK A;  3TSZ A;  1WA7 A;  1WQU A;  3PFV A;  4QT7 A;  2GTO A;  2LNH B;  1BM2 A;  1LUN A;  1X0N A;  2HMH A;  3BKB A;  3N84 A;  1O4L A;  4E68 A;  1SHB A;  2X3X D;  1O4H A;  2LJ0 A;  1JXM A;  3H0H A;  2YSX A;  4A4B A;  2J7I A;  2KRN A;  2L3Q A;  1LUK A;  4WWQ A;  4RTY A;  4CC4 B;  2DL8 A;  1O42 A;  2O2O A;  4Z88 A;  1AYD A;  1M27 A;  2ETZ A;  2KRO A;  4AFZ C;  1ZFP E;  3PSJ A;  2KR3 A;  2KGT A;  3N7Y A;  1JXO A;  1T0H A;  4RUG A;  2FPE A;  3PJP A;  4L1B B;  1IJR A;  4F14 A;  2NUZ A;  2XP1 A;  1LUI A;  3BUN B;  2DX1 A;  2ROL A;  2ABL A;  2EO3 A;  1X6B A;  1KJW A;  2DF6 A;  2DE0 X;  4AG1 C;  4P9Z A;  2EGA A;  3N8M A;  2FPF A;  3UA7 A;  2HDV A;  2FCI A;  2ROR A;  2DLY A;  1SRL A;  5CDW A;  2RQU A;  1SRM A;  1T3L A;  2DCR A;  4OHE A;  1ZUU A;  1VA7 A;  2K3B A;  4A4C A;  1PIC A;  2EKX A;  1JYQ A;  2AZS A;  1OO4 A;  4FL2 A;  1CSK A;  3OB1 B; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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