1LCKA

Sh3-sh2 domain fragment of human p56-lck tyrosine kinase complexed with the 10 residue synthetic phosphotyrosyl peptide tegqpyqpqpa
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
DNLVIALHSYEPSHDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Complex (kinase/peptide)
molecule keywords P56==LCK== TYROSINE KINASE
publication title Structure of the regulatory domains of the Src-family tyrosine kinase Lck.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 35
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1994-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1lckA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1lckA02
2E5KA 2GTJA 1A08A 1W6XA 1MW4A 1UG1A 4OHLA 1UUSA 1RI9A 4WCIA 5HCKA 1R1QA 4F14A 2J6KA 1GL5A 2A36A 3M0UA 4RTWA 4LE9A 2XMFA 3OV1A 3IN8A 1FYNA 2DE0X 3U23A 4Z89A 1FHSA 1G83A 2J6FA 1NM7A 1SPKA 2QMSA 3OP0A 1AZEA 2LQWA 2D0NA 1UGVA 2EOBA 4RTXA 1RLPC 4GL9E 1UECA 2LP5A 3I5SA 5HKYA 2A08A 1MILA 1X27A 2C0OA 3NPFA 4GLMA 1BLKA 1UE9A 1WIEA 2MC1A 3PS5A 3CD3A 1GBQA 1O44A 1ZX6A 2DBMA 4QT7A 3VS7A 2KEAA 3TSZA 1O4NA 2ROTA 4AFUC 2MK2A 2IZVA 5AXIA 1O4JA 4JGHA 3M0TA 1TZEE 1SHGA 4Z88A 2KYBA 3GXWA 4J9FA 1AWOA 2RQRA 4M4ZA 3M0SA 2LNHB 5IXBA 1JQQA 2AOAA 2LCTA 1BK2A 1QWFA 5IBSA 2EQIA 1YN8A 2L6KA 3EG1A 2K7AA 1CSKA 2CREA 1H3HA 1AYCA 2DX1A 4DGPA 5EG3B 2DBKA 2PZ1A 1ABOA 4AFZC 2EO6A 3M0QA 1QWEA 1SEMA 2HSPA 4OHEA 1O4GA 4A4CA 3RBBB 4FL2A 5IHNA 1A81A 3CBLA 2FPFA 4K11A 2NUZA 2DL8A 2O9SA 1JYUA 1JEGA 2HUWA 1A1CA 1BHFA 2CI8A 3MXCA 5DC9A 2OJ2A 1O4FA 1K76A 2CR4A 2YUQA 1CWEA 1UHFA 2O2OA 2KNOA 2VKNA 1SHBA 1R1PA 2CS0A 1NEBA 1SPSA 1AOUF 1BHHB 4IIOA 1O4EA 1BF5A 2LZ6B 3GXXA 5EEQA 5IH2A 2DLZA 1FU5A 1LUNA 1O46A 2HMHA 1XA6A 3VRYA 1KA7A 4FBNA 3UATA 2RORA 1GBRA 2LX7A 3I35A 3GBQA 5FW9A 1AOTF 4P9VA 4A63B 1M30A 2IUGA 4J9BA 1NG2A 2CBLA 1BU1A 3VGOA 1VA7A 4L1BB 2P4RA 1SRLA 1M27A 2KROA 4HVUA 4ZNXA 2KRMA 2C9WA 1AB2A 1HD3A 1E6HA 2K79B 2GBQA 1UTIA 3PE0A 4XZ0A 1F1WA 2EBPA 2HDXA 2A28A 3QWYA 4TZIA 1HCSB 4OMMA 2CIAA 1LUIA 2EGAA 2MIOA 3EAZA 1PHTA 4LNPA 1JXOA 2DF6A 3FJ5A 1OV3A 5IHIA 1O4IA 1O4MA 2W0ZA 1K4US 3WA4A 1BFIA 4GBQA 1XOVA 1BG1A 4AFQC 1O42A 2YUPA 2L3QA 2O31A 3TVTA 1ZBJA 1X6GA 1OEBA 2I0NA 2FRYA 1A1BA 2DL3A 4JJBA 5DC4A 4HVVA 3VS0A 2ECDA 4Y92A 2YT6A 1O45A 2J7IA 2KYMA 1ARKA 3N8MA 2FG0A 4XZ1A 1QG1E 2OAWA 1RPYA 4OHIA 4ESRA 4RTVA 1N5ZA 1QLYA 4F59A 4H34A 1Z3KA 1KA6A 1SSHA 2K2MA 4OMNA 4CC3A 3SEMA 1GFCA 1HCTB 1BLJA 3NGPA 1TCEA 5HKWA 3S8LA 3IMJA 1SHFA 3REAB 1MV0B 3I9QA 3VRNA 4F16A 2ETZA 1AZGB 2JS2A 3H0IA 1A07A 2IUHA 5IHKA 3H0HA 1JU5C 1AWXA 2FCIA 1BB9A 2GQIA 5I22A 2K3BA 2EYWA 5FWCA 2IUIA 1JYQA 2EKXA 4OMQA 1S1NA 1GFDA 2CSIA 3BUMB 1K0XA 4R0KA 1HSQA 4X6SA 2F2WA 5ECAA 2D1XA 1A0NB 3VRRA 5CDWA 1YWPA 5DC0B 4HVWA 2JMAA 5HKZA 2AOBA 1Y57A 1Z9ZA 1P13A 2RN8A 2O9VA 2ED0A 2F2XA 2SHPA 4JEGA 1CKAA 2PNBA 1NZLA 1BFJA 1OO4A 1YVLA 2ESWA 1M3AA 2BZXA 2MCNA 2VIFA 1X69A 2AZVA 2BZYA 3A98A 1IO6A 1O4DA 3CWGA 4P9ZA 1V1CA 2DX0A 1PWTA 3QWXX 1CSZA 2PTKA 3PJPA 2JT4A 2A37A 1A1EA 1O47A 1K0SA 1KSWA 4Z8AA 2PLEA 1X2KA 4NWGA 1E6GA 2O88A 1VYVA 2DLPA 1T0JA 2EO3A 2YDLA 4K2RA 5L23A 3S8OA 2YUOA 1WX6A 2H8HA 3OB1B 4IIMA 1KC2A 4H1OA 4WWQA 2Y1NA 3MAZA 5EHRA 4E68A 2C0IA 4DEYA 4GWFA 3UA7A 5D0JA 1IS0A 2CI9A 2IIMA 1SHDA 4OMOA 1BKMA 3BUXB 4OMPA 1ZFPE 1JO8A 2DL5A 1WDXA 3VS6A 4RTZA 3KFVA 4K45A 1Y0MA 1M8MA 2X3WD 2FPEA 4KRTA 1X0NA 1ZLMA 4ROJA 5KAZA 1B07A 2H46E 2M51A 3US4A 1K9AA 1R1SA 2L2PA 1WA7A 1CJ1A 3OVEA 1BM2A 4JZ4A 3EHQA 3ZNIA 1UFFA 2W10A 2LQNA 1AD5A 2RVFA 2M0YA 1NZVA 4JJCA 4E93A 2G6FX 3VRPA 2ENMA 2FO0A 1RJAA 1NYGA 1O4KA 5AULA 1JXMA 2ECZA 1NEGA 2Y1MA 5BO4A 2ED1A 2C0TA 2YSQA 1ZUYA 3M0RA 2FPDA 3S8NA 5EC7A 1OOTA 1W70A 1O4BA 2DILA 1AEYA 1OPLA 1LCJA 1UDLA 2PNIA 1FMKA 2JM9A 4F17A 3TL0A 1TG0A 4JJDA 3K2MA 2RQWA 1UHCA 1ABQA 1JYRA 1H9OA 1TUDA 2VWFA 1AYDA 2XP1A 2LJ1A 2OI3A 4DGXA 2RF0A 1SKJA 2AK5A 3VROA 2EKHA 1U06A 2HEQA 2K6DA 2DA9A 2LMJA 1GCPA 4EIHA 2YUNA 2DJQA 1AVZC 2MQIA 1J3TA 2ABLA 1SPRA 3NMZC 2RSYA 1PRMC 2RMXA 3N84A 2CH4W 1OPKA 1JU5A 1UJYA 1G2BA 4RTTA 3VS4A 1QADA 2D8HA 1UJ0A 3IN7A 4CC4B 4LN2A 1ZUKA 5I6VA 5IXFA 1O4RA 2KT1A 4U17A 1FBVA 3R6NA 3OB2B 2AZSA 1AYAA 2D8JA 1PKTA 1U3OA 2KRNA 1H92A 1WFWA 1NRVA 4HCKA 2J06A 2DMOA 3BKBA 2RNAA 2DM0A 4RUGA 1YVHA 2H5KA 1LCKA 1BHHA 3RNJA 3VRZA 2LNWA 3PSJA 2K7AB 1GCQC 1YNZA 3PVQA 1RUWA 1A1AA 1LKKA 1EFNA 1PKSA 2DL4A 2EYVA 3CXLA 1FBZA 2ROLA 2K9GA 2EYZA 2QDLA 2CT3A 1K1ZA 2KRSA 2LNXA 1T3SA 1VYTA 2KE9A 4FSSA 2RPNA 4EIKA 3MXYA 5J3XA 1M3CA 1BKLA 1SRMA 4CC2A 1RLQC 2EGCA 2CH4A 1GHUA 3C0CA 2CT4A 4K44A 2BTTA 1WI7A 2KXCA 5DF6A 2LJ0A 1O4CA 2F2VA 2L3TA 4JZ3A 1I0CA 1QCFA 1CKBA 1YCSB 1WQUA 4AFSC 4A4BA 4GPLB 2K79A 2AUGA 3EG3A 2MRKA 1JWOA 3H41A 1QKXA 4DEXA 3C7IA 4J9DA 1KIKA 2OZOA 5I11A 1BMBA 1Y1UA 1SHAA 5FWBA 4U1PA 1O4LA 3REBB 1FYRA 1IJRA 2RMOA 1O49A 1AYBA 1LKLA 3SHWA 4EY0A 4QSYA 2L3SA 3CQTA 1D4WA 3VS5A 3PLFB 3N7YA 2NWMA 2GE9A 1KFZA 3VRQA 2HDAA 2J6OA 3PVLA 1LUMA 2DCRA 2JTEA 4LUEA 5EELA 1T0HA 3M0PA 4CC7A 1FU6A 3PFVA 2JS0A 1O4OA 2AKLA 1CSYA 2KGTA 2MRJA 1X2QA 2V1RA 2KBTA 2FRWA 2Y3AB 1E7OA 4J9CA 1HJDA 1B47A 3T04A 1MUZA 2CUDA 2EPDA 2RQVA 1GRIA 2JYQA 2LCSA 2EVRA 1T3LA 3IQLA 1O43A 4OMLA 1AWJA 4JPBW 2L4KA 4NWFA 2CSQA 2RQUA 3THKA 2GSBA 3VS1A 1ZSGA 1TUCA 3ULRB 4X1VA 3LH5A 4FL3A 1OO3A 5GJHA 3EGUA 2EYYA 1NYFA 2EYXA 1I07A 2MOXA 4J9EA 4RTYA 1O41A 5GJIA 1UURA 1O4QA 3UYOA 1WXUA 2KR3A 1O4PA 2GNCA 3PSKA 2GGRA 3H0FA 1I1JA 2BZ8A 2HBWA 1A09A 1W1FA 3JV3A 2DLYA 2YU7A 1WYXA 1O4HA 5GJWB 1PICA 1B3QA 2EGEA 2B3OA 2JMCA 1NLPC 1PNJA 1O48A 2V1QA 2DYBA 3NHNA 3KFJA 3S9KA 3BUNB 1U5SA 2KNBB 2CRHA 1KJWA 1H8KA 4JE4A 1M61A 5IBMA 4OHDA 3TKZA 2KK6A 1X43A 2JW4A 2RQTA 2DM1A 1GCQA 4D8KA 1AWWA 2CUBA 4J9IA 2OQ1A 4AG1C 2YSXA 3ZL7C 4J9HA 3HCKA 3HIZB 1I3ZA 4E6RA 2B86A 2VVKA 4LUDA 4ORZA 4RTUA 1LUKA 2KT8A 1UUEA 2LJ3A 3IMDA 3M7FA 2SEMA 3VS3A 2EL8A 1NLOC 2DL7A 3BUWB 4F5AA 2SRCA 3PQZA 3VS2A 2PLDA 3EG0A 3EACA 1BBZA 1RQQC 2X3XD 1D4TA 1O4AA 1X6BA 2DRMA 2HCKA 3EG2A 3GQIB 1M3BA 2EW3A 2EU0A 1WXTA 3BUOB 4F5BA 1WXBA 3I5RA 1CWDL 1D1ZA 2AKKA 3O5ZA 5GJVB 3UF4A 1YP5A 4OHHA 4D8DA 1YWOA 2KXDA 1QKWA 1MV3A 1VYUA 5EHPA 2DVJA 2GTOA 1AOJA 4HXJA 2DRKA 2FEIA 1PRLC 2BBUA 2DNUA 1F2FA 3TSWA 2L3PA 1WLPB 3UA6A 1X6CA 2L0AA 1M27C 2CDTA 2PNAA 1ZUUA 3EHRA 2JXBA 1Z9QA 2JM8A 3HHMB 4AG2C 2HDVA 4J9GA 2J05A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YITA 3CC2A 2E41A 1XNIA 1WHGA 5HCKA 1R1QA 3DLMA 3M0UA 2EIFA 5LJ3f 2DE0X 4PJOE 3U23A 4Z89A 1FHSA 1SKUB 2LVMA 5CQXA 3LX7A 1SPKA 4M7DA 2HL5C 3CPWS 4RTXA 5GMKj 1X75C 3CCMQ 2LP5A 3I5SA 1VQMQ 2A08A 5HKYA 3EAEA 4XTUA 1MILA 3NPFA 4C92E 4JRIA 1JRIA 1O44A 8ATCB 4FM4B 4PFOA 1ZHIA 4EPCA 2IVWA 2ROTA 2MK2A 5AXIA 1PC0A 3V8KA 4JGHA 3M0TA 5GAOp 1TZEE 2KYBA 5KE2A 2RQRA 3S3NA 3M0SA 1UGRB 3KXTA 5IXBA 2LCTA 1BK2A 2EQIA 1VQPA 1CSKA 3BDUA 4HKEA 1S72Q 2DX1A 2QQ9A 4AFZC 2EO6A 1SEMA 2HSPA 3GOXA 4A4CA 3RBBB 5IHNA 1A81A 4K11A 2NUZA 2DL8A 2O9SA 5AYFA 1Y71A 1VOMA 1YJ9Q 1Q82R 2PQWA 3HRTA 3WVEB 2CR4A 4M77F 4P5NA 1NZ9A 3I56A 3DLLA 1BF5A 3OYYA 2XDBA 2YHTA 5IH2A 1O46A 1HXDA 4BUGA 4E7IA 1KD1C 3RKYA 5CK9A 7AT1B 1K8AR 2DXCA 3M57A 5FW9A 4P9VA 4M7AA 2IUGA 4J9BA 4O5VA 3EGDA 4L1BB 2P4RA 1SRLA 4F7UF 2HL3A 1R0BG 4JDSA 4JS4A 2OX7A 2EBPA 2EQMA 3RERA 3QWYA 5GANh 3A8OB 1VQKA 4A4HA 1PHTA 1OYXA 3FJ5A 1K4US 2PUOB 2EWNA 1OX9A 4AFQC 2L3QA 1N6AA 1OEBA 2HNIA 5KCOA 3JCMf 3LYIA 4Y92A 2YT6A 1QVGA 1H3ZA 2KYMA 1ARKA 4RG2A 3N8MA 2FG0A 1QG1E 2DIQA 5CKHA 5C6SA 1QLYA 4F59A 1VQ5T 1EX4A 2K2MA 1VQ4A 4E7SA 1B7TA 1BI0A 3CC2T 1TCEA 5HKWA 5KH6A 2CGHA 3REAB 3QYGB 2E10A 4OMFB 3VRNA 4F16A 2ETZA 2F5KA 3T9NA 2IUHA 2OAUA 1QP2A 3OYCA 2KGYA 2IUIA 4QW2A 1S1NA 2DTOA 3BUMB 2D1XA 1A0NB 3VRRA 1Q95G 5DC0B 2ATCB 2O9VA 3X24B 1FWZA 3OYJA 1YI2A 2PNBA 1NZLA 1BFJA 1DJ7B 2PVGB 3G71T 2XDPA 3A98A 2XKOC 2DX0A 2PTKA 1O47A 4J83A 3I55T 1K0SA 1KSWA 1X2KA 2O88A 2EO3A 3L1AA 2YDLA 4PK4A 3RIRA 1VQPT 4PJOB 1Q86U 1PD1A 3MAZA 2H3JA 4JRQA 4M78E 3PIPA 1SHDA 1ZBXA 1ZFPE 2DL5A 2NYSA 2P4TA 3GLXA 1IB8A 2FPEA 4C92B 4C5IA 1B07A 1MMDA 2M51A 5GAMg 2MF2A 2MWOA 4C5EA 1BM2A 3I56T 4JZ4A 2NLUA 4NOYA 4M7DD 2W10A 3QPHA 1WJRA 3CCQA 5GAN7 2EJGA 2L8DA 2GF7A 1YIJT 2FO0A 1NYGA 4L5GA 1JXMA 2ED1A 2C0TA 2RJCA 1ZUYA 2FPDA 1VQ5Q 3S8NA 3LWHA 2PVDB 3CC2Q 1D0XA 2QQAA 1LCJA 2PVOB 1M1FA 1R77A 1WHHA 3UT1A 2XK0A 4E2FB 2M0OA 1WQWA 2LQKA 1JYRA 1TUDA 2VWFA 1AYDA 2JTFA 1WHJA 3VROA 1VQ8A 1VQ9T 1U06A 2QA4A 2DA9A 1VQKT 2ABLA 4A4GA 2CH4W 3LH0A 2HQXA 4N4IA 2OTJT 2QI2A 1G2BA 3C95A 3QIIA 2KDSA 3VS4A 2DEQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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