1LCKA

Sh3-sh2 domain fragment of human p56-lck tyrosine kinase complexed with the 10 residue synthetic phosphotyrosyl peptide tegqpyqpqpa
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
DNLVIALHSYEPSHDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords P56==LCK== TYROSINE KINASE
publication title Structure of the regulatory domains of the Src-family tyrosine kinase Lck.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Complex (kinase/peptide)
total genus 35
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1994-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1lckA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1lckA02
2VWFA 3NPFA 1K76A 2HUWA 1M27C 2MK2A 1LKKA 1NG2A 2PNIA 2HCKA 2LNXA 1JQQA 2CT4A 3ULRB 1U06A 3EG2A 3M0RA 1O4GA 2EGEA 2ECZA 2EO3A 4M4ZA 1PNJA 3FJ5A 1MV3A 2W10A 2DBMA 5GJIA 1JEGA 2ESWA 1M27A 4CC7A 1BHFA 1SSHA 1QWEA 2ABLA 2SEMA 1CKBA 3H0HA 5FWCA 2AUGA 1O47A 2EYXA 2MRKA 4AFUC 5HCKA 1X6BA 2CR4A 1FU5A 1G83A 3SEMA 2EYWA 4HVVA 2CREA 4LUEA 4RTUA 3O5ZA 1K0SA 2DRKA 2MRJA 1W70A 3QWXX 4OMLA 2DLYA 1Z3KA 2ED1A 3GXXA 4RTZA 2O88A 4A4BA 4F59A 3UYOA 2GNCA 2DCRA 1H8KA 2AZSA 4RTWA 4GLMA 1O4JA 2DX1A 3EGUA 1YVLA 4JEGA 3ZNIA 1O49A 5L23A 1XA6A 2RQTA 1VYTA 2IUIA 2J7IA 3EG1A 1F2FA 2E5KA 1NZLA 3OB2B 2EPDA 2JXBA 4RUGA 2DYBA 5I11A 2D0NA 4AFQC 2OI3A 2CDTA 4Y92A 5EC7A 2O2OA 1D4WA 1TCEA 4E93A 1KC2A 2LX7A 4OMQA 1BG1A 1WFWA 3NGPA 1A1EA 4K2RA 1ZFPE 2KXDA 2J6OA 3N84A 3EHQA 2KRNA 2YUOA 1CWEA 1Z9ZA 3KFVA 1FYNA 2CH4W 2AKKA 2RF0A 4J9HA 3UF4A 4QSYA 2XP1A 2AK5A 1QKWA 3BUOB 1O4HA 1UTIA 2L3PA 1MILA 1YCSB 2CSIA 3VS0A 3I9QA 4NWFA 5FWBA 2D8HA 3C0CA 2IIMA 4U17A 5IBMA 2DLZA 2ROLA 1NM7A 1UE9A 2IUHA 2PNAA 5D0JA 3MAZA 4TZIA 1M3AA 1X2QA 3CXLA 1T0HA 1QADA 3GBQA 1KIKA 2KEAA 3BUNB 3VRYA 2V1QA 1KA7A 1X0NA 4GWFA 1QLYA 2LJ1A 4Z8AA 4DEXA 2P4RA 1JYUA 1AWWA 4RTVA 2K9GA 2Y1NA 4D8KA 1AOUF 1OOTA 1I0CA 1M3CA 1SKJA 4OMMA 1P13A 1D4TA 2PTKA 1U3OA 2AZVA 4DEYA 3OVEA 4K11A 2L4KA 2YDLA 1SPRA 4H34A 2DRMA 2JMCA 1FBZA 4F17A 1BLJA 1O4CA 2C0OA 3K2MA 5I6VA 1LUKA 5IBSA 4FSSA 5ECAA 3VS4A 2HBWA 3MXCA 3VRNA 3PSJA 1JXOA 4R0KA 2H8HA 2KBTA 1FBVA 2YSXA 5DF6A 1WXUA 1WLPB 1W6XA 4GBQA 2XMFA 2FPDA 4J9BA 3PSKA 1CSYA 4J9IA 4P9VA 3TSZA 2DLPA 1AYCA 1O48A 2BZYA 1J3TA 2DBKA 2O9VA 2RORA 1O41A 2J6FA 3RBBB 3IN8A 1R1QA 3I5RA 1YN8A 4OHHA 1AZEA 2L0AA 1X27A 2RNAA 2PZ1A 1M8MA 1E6HA 3EAZA 1YVHA 1ABQA 2FRWA 2EW3A 1K4US 4H1OA 4WCIA 2ED0A 3PFVA 5DC0B 2V1RA 3PE0A 3M0TA 2GSBA 2X3XD 3VS7A 1WX6A 1NLOC 1WYXA 2OJ2A 2ROTA 1LCJA 1AEYA 1PRMC 1WIEA 2QDLA 1QCFA 1X43A 2JT4A 2Y1MA 1BLKA 5IXBA 2GTOA 3S8OA 2MOXA 2YUQA 4RTYA 3NMZC 2DL5A 3REAB 2EBPA 1X2KA 2RSYA 2MC1A 2K6DA 4FBNA 2B86A 1PICA 1CJ1A 1O4KA 3VS6A 2YSQA 4IIMA 1WXTA 2CSQA 3HHMB 2OAWA 5GJHA 3IMDA 2RQVA 1A0NB 1OO4A 3GXWA 2M51A 2K7AB 1ZLMA 2KNOA 1A09A 2YUNA 2JYQA 4E68A 1LCKA 2C0IA 3EG3A 1NYFA 4J9GA 4JZ3A 1O4OA 5AXIA 3T04A 1CWDL 1ARKA 2DL4A 2CBLA 5J3XA 3TVTA 2PLDA 1SPKA 1ZUKA 4AG1C 2K7AA 2KK6A 2EVRA 3CWGA 1F1WA 2JTEA 2EL8A 1AOJA 1TG0A 2DILA 2HDVA 2BTTA 1YWPA 1H92A 2BZ8A 4KRTA 1AWXA 2IUGA 2K2MA 2KGTA 1CSZA 2LJ3A 1JU5A 2A37A 1H9OA 1SHBA 1AWJA 1WI7A 5BO4A 3PJPA 1HD3A 1UUEA 4J9EA 2K79B 2CUBA 2EQIA 2DMOA 3CD3A 1O44A 2FG0A 4JPBW 2LNWA 1N5ZA 1VYUA 1Y1UA 3PVQA 4X6SA 2CT3A 4X1VA 3PS5A 4ROJA 2GE9A 2AOBA 2RQUA 1SHGA 1I07A 3H41A 2LQWA 2J6KA 2MCNA 1O4DA 1E6GA 1H3HA 4LNPA 4LUDA 4D8DA 2FEIA 2KYBA 2RVFA 4JJBA 2RN8A 4OHDA 2LCTA 1Z9QA 2DNUA 2YT6A 3CQTA 1SPSA 1HCTB 3OB1B 1MV0B 1KFZA 4NWGA 1VYVA 1BK2A 5HKWA 1U5SA 3OV1A 1IS0A 1M30A 1WDXA 2SRCA 2DF6A 2LCSA 1HCSB 3S8LA 1WXBA 2C0TA 3VS5A 1GFCA 2GBQA 3UATA 1AZGB 1K9AA 1A08A 3UA7A 3VS2A 3I35A 1FMKA 2EGAA 1AYAA 1O4AA 1PRLC 1A1CA 2L2PA 4JJDA 1K1ZA 4LE9A 2ENMA 2A28A 4RTTA 1TUDA 2W0ZA 2F2WA 3BUXB 2GQIA 3H0IA 3M0UA 5CDWA 4F16A 1JWOA 2X3WD 2AKLA 2Y3AB 1RI9A 3I5SA 2CIAA 1SHFA 1RLQC 2PNBA 2RQWA 1RPYA 1OPKA 3JV3A 4OHEA 1BU1A 1AWOA 1NZVA 1V1CA 3EG0A 2KYMA 1JYRA 1LUNA 2IZVA 1FHSA 1FU6A 3EHRA 5IHIA 5IHNA 1NYGA 2EKHA 1BKMA 2H46E 3BKBA 1RUWA 2DA9A 1BM2A 4J9FA 1SHDA 2HSPA 2MQIA 2GTJA 1QG1E 2EO6A 1ABOA 1R1SA 1YWOA 2JM9A 2L6KA 2OZOA 1A1BA 1XOVA 2L3TA 1UURA 4GL9E 1GBQA 3NHNA 1UJYA 3CBLA 1T0JA 5HKYA 1O43A 2YUPA 4AG2C 2DVJA 1NEBA 1PKSA 1T3LA 2B3OA 2C9WA 1T3SA 3H0FA 4ZNXA 1YP5A 1AVZC 1NRVA 1FYRA 1D1ZA 4F5AA 1KA6A 3TSWA 4Z88A 1UHFA 1GFDA 1O4PA 3N8MA 4CC4B 2FPFA 3U23A 2CI9A 4DGPA 1A07A 5DC9A 1BFIA 1O4BA 3QWYA 4P9ZA 1AOTF 5HKZA 2EOBA 2RPNA 3KFJA 4HXJA 4J9CA 4FL3A 2F2XA 2CI8A 1OO3A 3IN7A 5I22A 4GPLB 2JS0A 3PVLA 1UECA 1JU5C 1GL5A 1JYQA 4OMOA 1PHTA 2ECDA 1W1FA 1X69A 2LP5A 3LH5A 3EACA 5GJWB 2KT8A 3VRQA 1SEMA 2EGCA 1NEGA 3THKA 4OHLA 1O4QA 1AD5A 2HDXA 1WQUA 2OQ1A 1O4FA 1BB9A 2EKXA 3VRZA 2FPEA 3BUWB 1ZUUA 2KROA 4OMNA 2FRYA 2VVKA 4L1BB 1HSQA 4QT7A 4U1PA 4A4CA 2CUDA 2D1XA 2ETZA 3N7YA 1UFFA 2KRMA 2CS0A 4HVWA 3M0SA 1KSWA 2G6FX 3A98A 4JZ4A 5IXFA 1LKLA 3HCKA 4JGHA 3TKZA 3VROA 4ESRA 1GCQC 2EYZA 1MW4A 1UUSA 3SHWA 2BBUA 5AULA 4LN2A 2FO0A 4A63B 3UA6A 1O4RA 1O4NA 1BF5A 1KJWA 2F2VA 2J05A 5DC4A 3US4A 2A36A 1R1PA 1B07A 1ZX6A 3RNJA 2HEQA 2JMAA 2LJ0A 2O9SA 1SHAA 2K79A 2J06A 1B47A 1RLPC 1WA7A 2RMOA 1GBRA 1LUIA 1O42A 2MIOA 2DM0A 1GCQA 4J9DA 1UJ0A 2DX0A 1B3QA 2A08A 1O4MA 1UG1A 2KT1A 4Z89A 1X6CA 2FCIA 3M0QA 5FW9A 1O4IA 2NUZA 3OP0A 2RQRA 1X6GA 2NWMA 1K0XA 3IMJA 1QKXA 2DJQA 2LNHB 4ORZA 2DL3A 1Y57A 2O31A 4K45A 1TUCA 2L3SA 5KAZA 2KE9A 1UHCA 2KNBB 2VKNA 5EEQA 1ZSGA 3PLFB 3VGOA 3HIZB 2PLEA 5GJVB 2M0YA 1BKLA 1VA7A 1BBZA 3TL0A 4EY0A 2JM8A 3VS3A 2I0NA 3VS1A 2D8JA 1M61A 2H5KA 5EHPA 1SRLA 1YNZA 4XZ1A 1I3ZA 1PKTA 3S9KA 4XZ0A 2KXCA 3VRPA 1O4EA 2GGRA 1TZEE 1JO8A 2CH4A 2L3QA 1BMBA 1SRMA 1ZBJA 3GQIB 5IH2A 5EELA 1OEBA 1LUMA 4K44A 3IQLA 2LMJA 4F14A 4OHIA 5IHKA 2EYYA 4JE4A 2DL8A 2CRHA 1IO6A 4F5BA 1GRIA 1BHHB 1OPLA 2JS2A 3S8NA 2LQNA 1PWTA 3WA4A 1GCPA 2HDAA 1CSKA 3MXYA 4HCKA 3M0PA 4E6RA 3ZL7C 2EYVA 4DGXA 3M7FA 1A1AA 1E7OA 1QWFA 1O4LA 2HMHA 3R6NA 2VIFA 4RTXA 1BHHA 2YU7A 1RJAA 3REBB 2DM1A 1M3BA 4CC3A 1O45A 4AFZC 4HVUA 1RQQC 2BZXA 2DL7A 2KR3A 4IIOA 1OV3A 1JXMA 2DE0X 4CC2A 1AYBA 4OMPA 4EIHA 1MUZA 1UGVA 1O46A 4FL2A 1CKAA 1S1NA 1EFNA 1G2BA 2KRSA 2JW4A 1Y0MA 4EIKA 3C7IA 4WWQA 5EHRA 3PQZA 2AOAA 1GHUA 2LZ6B 3BUMB 1NLPC 1I1JA 2K3BA 1UDLA 1HJDA 1BFJA 2EU0A 4AFSC 3VRRA 1A81A 1IJRA 2QMSA 4JJCA 1ZUYA 2SHPA 1AYDA 5EG3B 2RMXA 1AB2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4Y91A 3RERA 4M75C 2IG0A 5LJ5h 9ATCB 2DERA 1YI2T 2HCKA 3M9QA 2LNXA 3G6EQ 2FL7A 4OB1B 3EGDA 3LLRA 4M77C 3ULRB 5FU7C 1H3ZA 4J7IA 2XD0A 2JOYA 1O4GA 2HMAA 4M75G 3CC7A 3A1PA 4HCCA 1MMNA 3VKIA 3OS1A 4M75A 4CC7A 4QKUA 1SSHA 1QWEA 2VB6A 1CKBA 3H0HA 4M77G 1UEBA 2CR4A 4JDSA 3GF5A 3SEMA 3EAEA 2JN0A 2RB6A 3O5ZA 4KGXB 2DLYA 3KBGA 2O88A 3UYOA 2MMPA 3RDVA 2GNCA 4C5EA 1YVLA 5LL6S 2VGNA 2RI2A 2XK0A 5CO7A 3SDZA 1WHKA 2DK3A 3QSUA 5I11A 2D0NA 1I5OB 4AFQC 6AT1B 2CDTA 4DBHA 3GP8A 2O2OA 1D4WA 1TCEA 4E93A 1KC2A 2LX7A 4OMQA 3NGPA 3P8BB 2NUPA 1NPPA 2KRNA 1JJ2A 3OA6A 1M1KC 3CCEQ 2QG9B 1RACB 1RL2A 3A8OB 3RUXA 2RM4A 2EKOA 1O4HA 2LTOA 2L3PA 2CSIA 3X25B 2IIMA 1UB4A 1Q86U 2R5MA 2DLZA 4TZIA 3G4SQ 3CXCS 4BE1A 1X2QA 1T0HA 1KIKA 4Z02A 3ER0A 2EAYA 3VRYA 1Q7YC 3CC2Q 2LJ1A 2CP3A 1AWWA 1M1KR 1LPLA 3HRTA 1RABB 1AOUF 1UGPB 1SKJA 3G7ZA 4OMMA 1P13A 3CBPA 5I2MA 2YDLA 3CMET 1SPRA 4M78D 1FBZA 3HRSA 1QCOA 1BLJA 5I6VA 4FSSA 5ECAA 1NJIC 2HBWA 2GCXA 4DQ2A 1JXOA 1D0ZA 4IUQA 2H8HA 1BIBA 5LJ5e 4RCCA 1FBVA 1WLPB 4J9BA 2XMFA 1CSYA 3VUBA 4P9VA 2DLPA 1Q7YR 4ANJA 1J3TA 1M8VA 3GNGA 2RORA 1Y71A 2J6FA 3RBBB 4AMCA 1R1QA 1SSFA 3V8JA 1Y07A 5HK3A 2V8KA 2MK5A 3LGLA 2QAZA 1KC8R 1M8MA 4IURA 3MO8A 2FRWA 1K4US 4H1OA 4MZMA 4IKFA 3M0TA 3L2RA 1LCJA 1WX6A 4J6XA 1BLKA 4C5IA 3A8LB 2Z0WA 5C0MA 3E9GA 3JAME 4RTYA 3CEYA 1NJIR 2BUDA 2DL5A 1GXIE 1X2KA 4FBNA 2B86A 3OYKA 1BKBA 1KD1C 2K57A 4A54A 2YSQA 3HHMB 3SWNB 4BE2A 2RQVA 3IMDA 1VQLA 4F04B 2K7AB 1ZLMA 2CZ6B 1KQ1A 5CCAA 1NYFA 2V26A 4JZ3A 2JNGA 2ZZDA 4QQGA 4RG2A 2LQKA 2PVOB 1F1WA 2EQJA 2EL8A 1TG0A 2DILA 1QMCA 2BTTA 1AT1B 1QP3A 1H92A 4KRTA 1AWXA 2NYSA 3UT1A 2ZGWA 1KD1R 3MJXA 3RKWA 4PJLA 4PFPA 1JJ2P 3PJPA 1HD3A 3X26B 2KAFA 5CIUA 1VQ8T 2EJ9A 1I81A 1VYUA 3PFSA 1M5Q1 4MMKA 1KHCA 4ROJA 2AOBA 2QYZA 1WHHA 3LWHA 1SHGA 2LQWA 2J6KA 5GAOq 3JB9H 1E6GA 1H3HA 2FEIA 2CS7A 1M1KU 3RESA 1VQNQ 1Z9QA 4PFOA 1SPSA 5GAOp 1VYVA 3JSCA 1BK2A 2YLCA 5HKWA 1PSFA 1U5SA 1VIEA 1M30A 2LCSA 4C8QF 4EMHA 1HCSB 3S8LA 1TU0B 1F1BB 1LNXA 1GFCA 2PQWA 3CCLA 1AZGB 1FMKA 1AYAA 1O4AA 2L2PA 3EFSA 3CMAA 3PNWC 4RTTA 1Q7YU 2GQVA 4M7DC 2F2WA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3IQL A;  2LMJ A;  4F14 A;  4OHI A;  5IHK A;  2EYY A;  4JE4 A;  2DL8 A;  2CRH A;  1IO6 A;  4F5B A;  1GRI A;  1BHH B;  1OPL A;  2JS2 A;  3S8N A;  2LQN A;  1PWT A;  3WA4 A;  1GCP A;  2HDA A;  1CSK A;  3MXY A;  4HCK A;  3M0P A;  4E6R A;  3ZL7 C;  2EYV A;  4DGX A;  3M7F A;  1A1A A;  1E7O A;  1QWF A;  1O4L A;  2HMH A;  3R6N A;  2VIF A;  4RTX A;  1BHH A;  2YU7 A;  1RJA A;  3REB B;  2DM1 A;  1M3B A;  4CC3 A;  1O45 A;  4AFZ C;  4HVU A;  1RQQ C;  2BZX A;  2DL7 A;  2KR3 A;  4IIO A;  1OV3 A;  1JXM A;  2DE0 X;  4CC2 A;  1AYB A;  4OMP A;  4EIH A;  1MUZ A;  1UGV A;  1O46 A;  4FL2 A;  1CKA A;  1S1N A;  1EFN A;  1G2B A;  2KRS A;  2JW4 A;  1Y0M A;  4EIK A;  3C7I A;  4WWQ A;  5EHR A;  3PQZ A;  2AOA A;  1GHU A;  2LZ6 B;  3BUM B;  1NLP C;  1I1J A;  2K3B A;  1UDL A;  1HJD A;  1BFJ A;  2EU0 A;  4AFS C;  3VRR A;  1A81 A;  1IJR A;  2QMS A;  4JJC A;  1ZUY A;  2SHP A;  1AYD A;  5EG3 B;  2RMX A;  1AB2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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