1LCKA

Sh3-sh2 domain fragment of human p56-lck tyrosine kinase complexed with the 10 residue synthetic phosphotyrosyl peptide tegqpyqpqpa
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
DNLVIALHSYEPSHDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Complex (kinase/peptide)
molecule keywords P56==LCK== TYROSINE KINASE
publication title Structure of the regulatory domains of the Src-family tyrosine kinase Lck.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 35
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1994-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1lckA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1lckA02
1NYFA 3UA7A 4AFZC 1M61A 1QADA 2D8HA 2OAWA 1SPRA 4HVUA 4JJDA 2K7AB 2DF6A 4FSSA 4J9EA 4OMLA 2O2OA 2JW4A 2YSQA 2KEAA 1WLPB 2D0NA 2JXBA 4JZ3A 1GCQC 4FBNA 4FL3A 1WXTA 4JJBA 5I22A 1KSWA 2YUQA 2LJ0A 4J9HA 2DL4A 3PSKA 2FG0A 1YNZA 2CRHA 2RNAA 4J9BA 2OI3A 4GPLB 2KYMA 2L0AA 3M0TA 5IXBA 1AYAA 2LZ6B 1SHBA 1PKSA 2M51A 1HJDA 2BBUA 2AK5A 1TZEE 1K0XA 2IUHA 1T3SA 2KBTA 5CDWA 2YT6A 1BMBA 4U17A 1ABQA 1YWOA 2EO6A 2D1XA 3A98A 2DLZA 5GJIA 2ENMA 2K79A 2DJQA 2HBWA 2AUGA 2DVJA 4CC7A 1U3OA 1O4NA 2PZ1A 2CH4W 2BZYA 5GJHA 1BHHA 3M0RA 4JGHA 2PNIA 5IHIA 1M8MA 2FPDA 4P9ZA 1ARKA 2LMJA 2MK2A 1F1WA 1VYVA 2AZSA 3I35A 3VS0A 2PLDA 4EIKA 3R6NA 2C0IA 2AZVA 1H92A 4ZNXA 1BKLA 1OEBA 2JMCA 1BFJA 2EW3A 2GQIA 1I07A 3VS7A 2EKHA 2HUWA 1D4TA 2L3TA 5HKYA 2C0TA 1N5ZA 1BG1A 4F14A 4F17A 2RMXA 2FEIA 1O47A 2JT4A 1LUNA 1K76A 2K3BA 1JU5A 2EGAA 2OJ2A 2LJ1A 4DGPA 3H0FA 3REBB 2ABLA 2HDAA 1X27A 4IIOA 4K2RA 1A1BA 3PQZA 3EHQA 2MIOA 1IO6A 2YUPA 3PE0A 1Z9QA 2DM1A 2CIAA 2YSXA 2J06A 1G83A 1UECA 3EG0A 1R1SA 2CR4A 4U1PA 1GFCA 3VS6A 2MOXA 2EKXA 2JYQA 1AYCA 2FO0A 1UUEA 1D4WA 2SRCA 4E6RA 2EGCA 5IH2A 1CWEA 1YN8A 1O4JA 1J3TA 2KE9A 4LNPA 1M3CA 3OV1A 2CI9A 3HIZB 1BLJA 1V1CA 1LKKA 1O4GA 1O4EA 1AZGB 1VYUA 3IQLA 2P4RA 1ZBJA 1NYGA 4ROJA 4X6SA 1T3LA 5IHKA 2A36A 3CBLA 1ZUUA 2DMOA 2YDLA 1BHFA 3IMDA 2DYBA 1NM7A 4RTWA 5EHRA 4JJCA 2XP1A 3SEMA 1CKBA 4RTTA 5HKWA 1JQQA 1JO8A 5EC7A 1O41A 4XZ0A 1GCPA 1GCQA 2EYWA 3BUMB 3NHNA 1A08A 2A37A 1IJRA 1O46A 3TL0A 3VGOA 3VRPA 2J7IA 1LCKA 1AD5A 2RQWA 3OB1B 1H8KA 1QKWA 2GGRA 2CT4A 1OO4A 5EEQA 1AWWA 2IUIA 3EHRA 1TUDA 3EG3A 2KNBB 3PFVA 4E93A 2EVRA 1YCSB 2JS0A 3I5RA 2EU0A 1A1CA 4JZ4A 3VS2A 3M0QA 1PHTA 2DE0X 1Y0MA 1OV3A 1FYNA 1QKXA 4GWFA 1I1JA 2EL8A 1AVZC 1O4CA 1UHCA 1LUKA 2JMAA 2HEQA 1NRVA 2F2XA 2GTJA 4XZ1A 5HCKA 2F2WA 4AFSC 1K4US 2KNOA 2K7AA 2YUOA 4D8DA 4WWQA 1O4HA 1O4PA 3PVQA 5IXFA 4NWGA 4DEXA 4GL9E 2GBQA 1WIEA 1AWJA 1UJ0A 3REAB 5AXIA 1A07A 5DC4A 3BUXB 3N8MA 2PNBA 1FU5A 1AWOA 2PNAA 4CC4B 3IN7A 2RMOA 1RPYA 1CWDL 1JWOA 4Z8AA 1O4BA 1UURA 2MRKA 3HHMB 4R0KA 2KYBA 3N84A 2DRMA 1RUWA 2O9SA 2FRWA 2KXCA 1WX6A 1SHGA 2MRJA 4F5BA 1AEYA 4J9CA 4AFQC 1SHFA 2DM0A 4A63B 4F59A 1T0HA 1O4AA 1OO3A 1BFIA 2LNWA 3PSJA 4JE4A 2O88A 1BLKA 1JXOA 4QSYA 3S8LA 1SHAA 3OVEA 4J9FA 4F5AA 1CKAA 4HXJA 4HCKA 1GFDA 1UJYA 1JEGA 1NLOC 4OMOA 2EQIA 4OMMA 2CUBA 1M30A 1LUIA 1LUMA 4GBQA 1OPKA 2PTKA 2EBPA 2HSPA 4L1BB 5DC9A 1SKJA 2DRKA 2I0NA 2FPFA 2RPNA 3C0CA 1O4IA 2EYVA 2YU7A 4HVVA 3GXXA 4RTZA 4DGXA 4Z89A 1NEBA 3U23A 4H34A 2K79B 2O9VA 2A28A 1MV3A 2IZVA 2L6KA 3NGPA 2L2PA 1H9OA 2DL5A 2LQNA 1IS0A 1NZLA 2RVFA 4OMQA 1BHHB 2IUGA 1O4OA 1PRMC 3CQTA 1O4QA 2HDVA 1O4RA 1H3HA 4OHDA 1O48A 3US4A 5BO4A 3M0UA 1E6GA 4GLMA 3RBBB 1KA7A 1Y1UA 1AYDA 3PS5A 1WFWA 2DL8A 1T0JA 1AWXA 1SHDA 2KGTA 2CI8A 4OHHA 2EO3A 1PRLC 1HCTB 2MC1A 4LUEA 4CC2A 3EAZA 1XOVA 3ULRB 2LX7A 1ZFPE 1BF5A 1EFNA 1WA7A 2QMSA 4LUDA 4OHIA 1GBQA 1PKTA 2K9GA 1F2FA 1WXBA 4JPBW 3CWGA 2PLEA 2FPEA 2LJ3A 3M0PA 3S8NA 3C7IA 3KFJA 3TSWA 3VRRA 1M3AA 1QCFA 2FRYA 1K0SA 3GQIB 2K2MA 2HMHA 2CH4A 1RLQC 3IN8A 4ESRA 3M0SA 2LQWA 1YP5A 3GXWA 4A4CA 2BTTA 1TCEA 1JYQA 4KRTA 1X6CA 4M4ZA 2KK6A 1D1ZA 2ETZA 4A4BA 1O49A 5EHPA 2RQTA 2EYZA 5IBSA 1UFFA 1U5SA 1JXMA 1ZLMA 2YUNA 5L23A 5ECAA 1ABOA 3PLFB 1UGVA 4EIHA 1E7OA 4OMPA 1TG0A 2L3PA 2D8JA 3M7FA 2GE9A 4AG1C 3VS4A 1W1FA 1X43A 1LKLA 2MQIA 5EELA 1UDLA 1OOTA 2KT1A 1AOUF 2BZXA 2EYYA 2RF0A 3VRYA 1RLPC 1A09A 3VRQA 3UATA 2C0OA 3I5SA 4RTUA 4LN2A 2DCRA 1NEGA 1UTIA 2CSIA 3JV3A 1MUZA 1I0CA 2V1QA 2B3OA 3QWXX 2NUZA 3BKBA 1VA7A 2L3SA 1KIKA 3TSZA 2RSYA 1NG2A 2B86A 2DLYA 4J9GA 5FW9A 1G2BA 2GTOA 2RN8A 1FYRA 2ESWA 2EYXA 2GNCA 3NPFA 3MXYA 2OZOA 4RTYA 2NWMA 2DL7A 3EG2A 1FBVA 3ZL7C 3LH5A 4CC3A 1K9AA 1PNJA 1SPKA 4LE9A 1WQUA 5HKZA 4E68A 3KFVA 2ROTA 1CSKA 1HSQA 2EOBA 4Z88A 1AOTF 1Z9ZA 5FWCA 3OP0A 2AKKA 1OPLA 2IIMA 1RQQC 4K11A 1AYBA 2CDTA 4OHLA 1X6BA 2ED0A 2KROA 1WXUA 4F16A 2K6DA 1ZSGA 1KA6A 3NMZC 1O42A 1HCSB 1UG1A 1P13A 1UE9A 3TKZA 5GJVB 1I3ZA 2KXDA 2ED1A 3FJ5A 5D0JA 3EGUA 4RTXA 2RORA 1CSZA 2JM9A 1GBRA 2H8HA 2XMFA 2VVKA 3QWYA 4AFUC 3THKA 3VRZA 2RQRA 3BUNB 2CT3A 2KRMA 2AOBA 1AB2A 2ECZA 4EY0A 5IHNA 3PVLA 3K2MA 4DEYA 4TZIA 1CSYA 1X6GA 1S1NA 1RJAA 5I11A 1SPSA 4D8KA 1A0NB 2CS0A 1O43A 4K44A 1O4LA 3UYOA 1UUSA 2H46E 1WI7A 1VYTA 2L4KA 2CUDA 2SEMA 1QG1E 1GRIA 1FBZA 2HDXA 3MAZA 1O4DA 1NZVA 2CSQA 2W10A 2FCIA 2DX0A 3VS3A 4AG2C 1SRMA 2AKLA 3VS5A 2C9WA 5DC0B 3BUOB 2DNUA 5FWBA 3GBQA 1KFZA 1BB9A 1M27A 2DA9A 3BUWB 1CJ1A 1HD3A 2O31A 1JYRA 5AULA 1FHSA 1QLYA 1BK2A 1X2KA 4FL2A 1BU1A 2DX1A 4K45A 5GJWB 1ZUYA 1O45A 1FMKA 1O4KA 1W70A 4RTVA 1R1PA 1AOJA 1NLPC 1Y57A 1GL5A 1A1AA 1PWTA 2J6FA 4J9DA 3VRNA 2DILA 2X3WD 1W6XA 2OQ1A 2M0YA 3EACA 1QWFA 3O5ZA 1X2QA 3N7YA 4OHEA 4P9VA 3UA6A 1MV0B 1FU6A 4QT7A 1E6HA 1SSHA 1MILA 4H1OA 2VKNA 3HCKA 2RQVA 5IBMA 3H0HA 3S8OA 2SHPA 2V1RA 2LCSA 2LP5A 1Z3KA 4HVWA 2VIFA 1M27C 2DBKA 2AOAA 2KRSA 1M3BA 2CREA 4JEGA 2MCNA 1R1QA 2LNXA 2KRNA 1O44A 1O4FA 2KT8A 2RQUA 1PICA 1K1ZA 2X3XD 2E5KA 4ORZA 1B47A 5J3XA 1U06A 2DL3A 1WYXA 1AZEA 2J6OA 1A1EA 2KR3A 3H0IA 4J9IA 3OB2B 1JU5C 4IIMA 1O4MA 2L3QA 1YVHA 2HCKA 3ZNIA 1MW4A 2JM8A 3UF4A 2JS2A 1KC2A 1A81A 1ZX6A 2Y3AB 1B3QA 1ZUKA 1BBZA 2G6FX 1BM2A 2H5KA 5EG3B 5KAZA 3H41A 1YWPA 2GSBA 1SRLA 4RUGA 2LCTA 2QDLA 4NWFA 1B07A 2DBMA 3VROA 2W0ZA 1SEMA 2BZ8A 1JYUA 1WDXA 2Y1NA 2J05A 3PJPA 2DLPA 2EPDA 4X1VA 2F2VA 2ROLA 3VS1A 1YVLA 3SHWA 2Y1MA 2ECDA 3T04A 1RI9A 3EG1A 3CXLA 3IMJA 4WCIA 1X69A 2EGEA 3TVTA 2A08A 1BKMA 5DF6A 2J6KA 4Y92A 3MXCA 3S9KA 3I9QA 3RNJA 1LCJA 1XA6A 3WA4A 1UHFA 2LNHB 2VWFA 2CBLA 5I6VA 1TUCA 4OMNA 1KJWA 2JTEA 3CD3A 1GHUA 1X0NA 1QWEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NYFA 1M61A 4DBFA 1SPRA 2K7AB 2JW4A 4JZ3A 3I55A 1GCQC 2EQMA 1WXTA 5I22A 2LJ0A 4J9HA 3TU4K 3CCQA 2PUKB 5D6YA 4ZN1A 3M0TA 3OW2A 4IURA 1N6AA 1RAGB 1SHBA 1VQ9A 2BBUA 1T3SA 3M56A 1QVFP 4RKUE 2KAFA 2VXEA 1KD1C 2FZKB 3EGDA 3QDRB 5CDWA 2RHYA 4WF2A 1YWOA 4DOWA 2EO6A 1YITA 2DEQA 2ENMA 2DJQA 2AUGA 3LLRA 1MMDA 4GY5A 3FLGA 2CH4W 3DKMA 1VQLQ 1FX7A 1BHHA 3M0RA 2CYZB 1M1GA 4J83A 1XTDA 1BIAA 3OBYA 3WVEB 2LMJA 4IUUA 3L2RA 1X6OA 3R6NA 2VASA 2XU8A 1S72Q 2R57A 3JCMW 3OS0A 2YXYA 4ZNXA 1I07A 4FM4B 3VS7A 3G4ST 3CCLQ 1BG1A 2K4YA 2JT4A 3L1AA 1LUNA 2DETA 1JU5A 1WHLA 2LJ1A 4M75E 2IVWA 2ABLA 2PUOB 4DQ2A 1A1BA 3I56A 3EHQA 1IO6A 3PE0A 2YSXA 3RUXA 2H3JA 2QXFA 2MOXA 2PVDB 1HYOA 3EGXB 4E2FB 1D4WA 1CWEA 2LC4A 2PQWA 3CCSA 3X26B 4LNPA 2FHDA 3OV1A 4PJOG 1JJ2A 3L2QA 2P4RA 1ZBJA 2K2VA 2LCCA 1T3LA 4MDXA 5I21A 2QTVA 2ZCFB 2DMOA 3IMDA 3VUBA 2DYBA 3MEVA 1NM7A 4JJCA 1I5LA 5CAIA 1GCQA 3GF5A 2A37A 1IJRA 3VRPA 2K5FA 1D0YA 1VQ8T 3TEEA 3OB1B 4M7DE 2CT4A 4F7UE 3SD4A 3DB4A 2BE7D 3EHRA 4R56A 2JS0A 2LX9A 3I5RA 4JZ4A 5KYNA 1PHTA 4JDSA 1Y0MA 1OV3A 4JLIA 4E7KA 1I1JA 5DM7R 1UHCA 2JMAA 2JZ2A 2F2XA 2GTJA 2RHUA 4M7DB 2F2WA 2KY9A 3P8HA 4F7UB 4C8QD 3M54A 3A1PA 4NWGA 1BI2A 2GBQA 3REAB 3CCUA 2E3HA 4CC4B 3JCMe 2I2LA 2RMOA 3IN7A 1CWDL 1O4BA 3HHMB 4R0KA 2KYBA 5FROA 4QQGA 4LXCA 1SHGA 1SHFA 4L59A 1OO3A 1BFIA 3PSJA 2JTMA 2O88A 3JCMX 4L6V5 3CC2A 2VGNA 2LRAA 3OVEA 2A7YA 2FZCB 3AT1B 4Z02A 2VYTA 3CXCP 2WSCE 1LUIA 4X34A 1ZBXA 4L1BB 1UGPB 1U1TA 2RPNA 1O4IA 3EGDB 2EYVA 4EDUA 4DGXA 5CR2A 1KD1R 1WHMA 3OYBA 4C8QC 4A4KA 1MV3A 5CKHA 5J3BA 4PNOA 3NGPA 5LJ3f 2LRQA 2LQNA 1H9OA 2OTJT 2L6KA 1BHHB 2L5QA 2CZ6B 2XIDA 1O4OA 1VQOA 1PRMC 2HDVA 4OHDA 3M0UA 3OYLA 1KA7A 1Y1UA 1Q95G 1XJWB 4JRIA 2NYSA 5GAOm 1T0JA 1SHDA 1OX9A 1QCNA 1HCTB 1NBEB 4FIBA 3OW2S 1V29B 2RM4A 3ME9A 3OSVA 1ZFPE 1LPLA 4LUDA 2DJZA 1VQMA 4JPBW 4IUQA 1TU0B 2FPEA 3M0PA 3C7IA 3TSWA 1M3AA 1QCFA 4A53A 3OS1A 3IN8A 4QW2A 3M0SA 3PIPA 5DLQE 2LQWA 4PLLA 1JYQA 4M4ZA 5CCAA 2ETZA 4HKEA 2EQKA 4MZPA 4O5VA 3CMEQ 2CZ7B 3C12A 1ZLMA 1M1KC 3PLFB 1UGVA 2HL5C 2R58A 3L2UA 2L3PA 1U1SA 4QKUA 3M7FA 2GE9A 2YLBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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