1LCKA

Sh3-sh2 domain fragment of human p56-lck tyrosine kinase complexed with the 10 residue synthetic phosphotyrosyl peptide tegqpyqpqpa
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
DNLVIALHSYEPSHDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of the regulatory domains of the Src-family tyrosine kinase Lck.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Complex (kinase/peptide)
molecule keywords P56==LCK== TYROSINE KINASE
total genus 35
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1994-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1lckA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1lckA02
1E6HA 1OO4A 5EG3B 3NHNA 1G2BA 4CC2A 1GCQC 1GFCA 1CWDL 1JYUA 1ZSGA 2IUIA 3IMDA 1AYDA 5BO4A 1SRLA 4AFSC 1UUEA 2LZ6B 2ROLA 1O4AA 2Y1MA 1A81A 2DNUA 4R0KA 3H41A 2RMXA 1MW4A 1P13A 3BUWB 4RTVA 1BLJA 2AZVA 2VWFA 4F17A 2V1RA 2LNWA 4HVVA 5EELA 4WCIA 2EO3A 2JW4A 4OHLA 3VRZA 2DL7A 1OPKA 3I9QA 3S8LA 5EHRA 3VS2A 1LKKA 2EYVA 5DC9A 4XZ1A 4JJCA 4F5BA 1SSHA 3VROA 1FBVA 1BU1A 1QWFA 1R1SA 2EYYA 1TCEA 1D4TA 2KRNA 2OJ2A 1VYVA 2PNIA 2ED0A 3UF4A 1H92A 2EKXA 3PVLA 1WYXA 1YWPA 3OP0A 2M0YA 1VA7A 2KGTA 3LH5A 1OEBA 5FWBA 2YU7A 5GJIA 1W1FA 1FYNA 1UHCA 1GBRA 2A36A 2CUBA 4JGHA 4JE4A 2DE0X 4Z89A 2ETZA 2DX1A 2O88A 2ABLA 1NYGA 1SPKA 1W6XA 4P9VA 2H8HA 1ZUKA 2GNCA 1I1JA 1KA6A 1O4QA 2K79B 1PNJA 3O5ZA 1JYQA 4FL2A 1PKTA 2KEAA 2CI8A 5ECAA 1NYFA 1Y0MA 2FCIA 4E93A 3TKZA 1I07A 1BKLA 4JZ3A 2YUPA 1NLPC 2LJ0A 2DM1A 3M0RA 2DRMA 2HSPA 4K44A 4D8KA 1M27A 1NEGA 1G83A 3PVQA 2CRHA 3GXXA 2MIOA 5FW9A 2FO0A 2CUDA 2KR3A 2DX0A 4ZNXA 4IIMA 4DGXA 1M8MA 2CBLA 2BZXA 1JXMA 3M0QA 3TVTA 2D8HA 3C0CA 1O4LA 2RSYA 5IBSA 2BTTA 1NLOC 1SHFA 1SHDA 1UHFA 4J9FA 5DC4A 1WXUA 2KRMA 4X1VA 3BUXB 1TUCA 3EACA 2HDXA 2Y3AB 1CKAA 1AZGB 1H9OA 1GBQA 1NG2A 5DF6A 2F2WA 2JMCA 3H0HA 4CC7A 2K9GA 3OB1B 2DA9A 2L3SA 3MXCA 1WDXA 2YSXA 2L0AA 4J9GA 4GLMA 2KRSA 4RTTA 2A37A 3UA6A 1XA6A 2SEMA 1PRMC 1S1NA 1T3LA 2JT4A 2L3TA 2A28A 5IH2A 1M61A 1QKXA 4KRTA 4RTXA 4CC3A 2EYWA 1GHUA 1SRMA 2O31A 1W70A 3PQZA 1TUDA 1LUNA 4Z88A 1X6BA 2EU0A 1B3QA 2ED1A 1FYRA 2LJ1A 5AXIA 2EGCA 2JS2A 3NPFA 3VRRA 1AB2A 1EFNA 1UGVA 2PZ1A 1BB9A 2LNHB 4RTWA 1YNZA 1X2KA 5I6VA 2OI3A 2EYXA 4AFUC 1NZVA 1UECA 2L3QA 4OHDA 4EIKA 2YDLA 2HDAA 1QG1E 3N8MA 4J9CA 3T04A 5I22A 3JV3A 3QWYA 4DEYA 1K1ZA 2BZ8A 2J6FA 1O48A 2CT4A 3I5SA 1VYTA 1K0SA 1TG0A 1WXTA 2FPFA 4LE9A 1TZEE 2YT6A 2JYQA 1X43A 3VRNA 2LCTA 2EYZA 1PRLC 1O44A 4F5AA 2M51A 5CDWA 3EHQA 2IUGA 1WFWA 4HCKA 1OO3A 3RNJA 4ORZA 1T0JA 2JM9A 1BHFA 1B07A 2J6KA 2DILA 3EG1A 3VRPA 3PLFB 5KAZA 3PSKA 3FJ5A 1MILA 1YVLA 2XP1A 1KJWA 2RQRA 2YUNA 2QDLA 1AWOA 1SHBA 1X69A 1AOJA 2D1XA 4OMNA 1AYAA 2K6DA 2KNOA 1BBZA 2DL3A 1OPLA 4GPLB 4H1OA 2P4RA 3I35A 3S9KA 3NGPA 2AKKA 1PKSA 2YUOA 1K0XA 2DLPA 1UJYA 4A63B 4JJDA 1SPSA 3UATA 3TSWA 3CWGA 1WA7A 3CXLA 3S8OA 1JXOA 1OV3A 1JQQA 2PLEA 2JM8A 1F2FA 2K7AA 2KNBB 1CSKA 2DMOA 3H0FA 3VS3A 4CC4B 1AYCA 2L2PA 1R1PA 3VS6A 1ZUUA 1A08A 4J9IA 2OZOA 4F16A 1RJAA 1XOVA 1UTIA 1Y57A 3SEMA 4K45A 1X27A 4ESRA 1JYRA 1BG1A 2F2VA 3ZNIA 5GJWB 2EVRA 1Z9ZA 4E68A 2CH4W 3CBLA 1UJ0A 3EGUA 2KBTA 1BFIA 1JWOA 5HCKA 5J3XA 2GBQA 2DL4A 3RBBB 3REAB 2K2MA 2K3BA 5FWCA 4NWFA 1A1BA 2H46E 2VIFA 4OHHA 2JXBA 1FU5A 1NM7A 2OAWA 1NZLA 4F59A 2CH4A 1O4FA 2V1QA 2AOBA 2CR4A 4QSYA 2GTOA 1PICA 2RNAA 2EQIA 4U17A 1U06A 1AOUF 4P9ZA 1AYBA 2DCRA 1QKWA 2F2XA 5GJVB 2KK6A 1UURA 3BKBA 2X3WD 2RQVA 1SHAA 2EL8A 2C0IA 2GTJA 1BHHB 4OMOA 2L3PA 2JMAA 1AD5A 2EBPA 3WA4A 1BFJA 1O4EA 1F1WA 2X3XD 4LNPA 1A1CA 1AWWA 4RUGA 3BUOB 1HCSB 2Y1NA 2DYBA 1O4OA 2PNBA 4GL9E 5HKWA 5L23A 2CSQA 1H3HA 4F14A 2MRJA 1O4PA 2HDVA 1HSQA 2W0ZA 3M0PA 2K79A 1A09A 3KFVA 1HCTB 3EHRA 3VS4A 2RQTA 1GRIA 4J9HA 1O4IA 1O4HA 5D0JA 2DBKA 1SKJA 1LKLA 1AVZC 1VYUA 5IXBA 1LCKA 1WI7A 1YN8A 4AG1C 2VVKA 4DGPA 4DEXA 2KYMA 3M0SA 2RQWA 2KT1A 2KE9A 1BHHA 4FBNA 2MCNA 1I3ZA 4LUDA 1K4US 1GFDA 5IHNA 1UE9A 3VS1A 2FEIA 1O4JA 3S8NA 1CWEA 2D0NA 1MUZA 1RI9A 2EPDA 1M3BA 1A1AA 4HXJA 5IHIA 1O49A 3N84A 2LQNA 2KXDA 2CDTA 1H8KA 4L1BB 1KSWA 2CI9A 3GXWA 1R1QA 4EIHA 1O4RA 1KFZA 4OMQA 3MXYA 2EKHA 2LJ3A 2HUWA 1GCQA 2FRYA 2LQWA 1X6GA 2EO6A 2J05A 4FSSA 2C9WA 3NMZC 1YVHA 3GBQA 2C0TA 1OOTA 2MC1A 1N5ZA 1SHGA 1ZLMA 3GQIB 2RMOA 4JEGA 2RF0A 3K2MA 1O47A 4J9BA 3ZL7C 1PWTA 4JJBA 1IS0A 2I0NA 4OHIA 4J9DA 2CIAA 3PS5A 1KA7A 1YP5A 1NEBA 4JZ4A 3VS7A 1FMKA 1Z9QA 1BM2A 1O46A 1ZBJA 2HCKA 1ABQA 3VS0A 1ZX6A 1Z3KA 2OQ1A 2SHPA 3HIZB 2NWMA 2FRWA 1YWOA 2MOXA 1GCPA 2EW3A 4RTZA 5HKZA 3QWXX 1WIEA 2FPDA 1O4DA 1A0NB 4LN2A 2GSBA 2MRKA 3U23A 3ULRB 5EHPA 2B86A 4ROJA 1NRVA 1O4KA 2G6FX 4OMLA 1KC2A 4K2RA 4A4CA 2AUGA 1X6CA 5HKYA 1K76A 1O45A 1RLPC 2D8JA 3THKA 1QADA 4EY0A 2E5KA 1MV0B 1I0CA 1JEGA 3OB2B 1B47A 1WLPB 1RQQC 1YCSB 3EAZA 3HCKA 2AK5A 2DL5A 3US4A 1Y1UA 4D8DA 2O9VA 1U3OA 2AZSA 1D1ZA 3M0TA 2A08A 2O2OA 2DM0A 4WWQA 5DC0B 2HMHA 1ZUYA 1JU5C 3PJPA 1X0NA 4E6RA 2MK2A 1BF5A 3TSZA 1M3AA 2AKLA 4IIOA 2DBMA 1D4WA 1J3TA 5IXFA 3R6NA 1AWJA 1O4MA 2BZYA 1IJRA 1UUSA 2ECDA 2IIMA 2DLYA 1T0HA 2C0OA 2EGAA 2LX7A 2LCSA 3IN7A 1WX6A 4U1PA 1PHTA 2ENMA 2RPNA 5I11A 2LMJA 1GL5A 1UFFA 1QLYA 3EG2A 2HEQA 1AZEA 4X6SA 3M7FA 4K11A 4HVWA 1CKBA 2FG0A 3IN8A 2CSIA 4QT7A 4H34A 2KT8A 4AFZC 2DVJA 2JTEA 3HHMB 2O9SA 3H0IA 2MQIA 2LP5A 2B3OA 2DF6A 1FU6A 1AWXA 2PTKA 1BLKA 3C7IA 2NUZA 1LUKA 1T3SA 2PLDA 3SHWA 3EG3A 1E6GA 1ARKA 2YSQA 3REBB 3N7YA 1UDLA 1BMBA 4NWGA 2J7IA 5EEQA 1BK2A 2LNXA 1JO8A 1MV3A 1WXBA 4HVUA 1QCFA 4M4ZA 5EC7A 1JU5A 4XZ0A 2DLZA 2KYBA 1UG1A 1A1EA 1RLQC 2EOBA 2ESWA 5AULA 2FPEA 4GBQA 3A98A 2K7AB 2YUQA 3OVEA 4OMMA 2RQUA 3PSJA 2H5KA 1WQUA 2GE9A 4JPBW 2RORA 3M0UA 2IUHA 4A4BA 1CSZA 1O4GA 1KIKA 2CS0A 1M3CA 3IQLA 2CREA 3VGOA 1SEMA 3VRYA 3CD3A 2EGEA 2HBWA 1E7OA 1K9AA 4Z8AA 1O4BA 3OV1A 1CSYA 5IHKA 1HJDA 2RN8A 1AEYA 2DL8A 3VS5A 2L6KA 2SRCA 2L4KA 4TZIA 2KXCA 4RTUA 2ECZA 5GJHA 1M30A 2QMSA 1IO6A 1LCJA 1ZFPE 1LUMA 4AG2C 1O4CA 2W10A 2CT3A 2J06A 1FBZA 5IBMA 2ROTA 3VRQA 4OHEA 3BUNB 1O43A 2VKNA 2BBUA 2AOAA 1BKMA 4LUEA 1A07A 4Y92A 3CQTA 4J9EA 1LUIA 1M27C 1FHSA 2J6OA 1RPYA 2PNAA 2GQIA 4AFQC 3UA7A 3KFJA 3I5RA 3MAZA 4FL3A 2JS0A 1O41A 3TL0A 4OMPA 1RUWA 1X2QA 2XMFA 2KROA 2IZVA 1CJ1A 3UYOA 3EG0A 2DRKA 1QWEA 2DJQA 4RTYA 1HD3A 2RVFA 1O42A 1SPRA 4GWFA 1ABOA 1U5SA 3IMJA 2GGRA 3PE0A 3PFVA 1AOTF 1V1CA 3BUMB 1O4NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5GMKe 5GAN7 1TSFA 1E6HA 5EG3B 3NHNA 3PMIA 2DTHA 1WNLA 1ZSGA 2KQWA 4J7FA 1M4ZA 3M9QA 1WHMA 3CCUA 4LXCA 5GAMg 1TUGB 3CCRT 4PJOG 4OF1A 3H41A 5CKDA 5CQYA 4F7UF 2VWFA 3L2QA 2JW4A 2DL7A 3ZBDA 1RAHB 3VS2A 1SSHA 4AT1B 5IN1A 1FBVA 1R1SA 2EYYA 2FZGB 2X9HA 2M9UA 2OJ2A 5KYYB 5D6YA 2ED0A 1WYXA 1JJ2P 1OEBA 2DXCA 4KGVB 2ZPFB 3CC4A 4M77G 2HZYA 2EJ9A 5LL6S 1UHCA 1D0ZA 2A36A 2CUBA 1K9MR 4JE4A 4Z89A 1X75C 3OYCA 1R8OB 1SPKA 4P9VA 2H8HA 3CCMT 5GANd 2LQ8A 1UGPB 4FL2A 1PKTA 4M75E 3I56Q 1NYFA 2FCIA 4M75G 3TKZA 2YUPA 1NLPC 4DBHA 3PVQA 2FO0A 2DX0A 2XG8D 4ZNXA 4IIMA 2GFUA 3MEVA 1RAIB 2CBLA 2BZXA 3QKJA 5A0GA 2D8HA 1JB0E 2BTTA 1YI2A 1KD1C 1UHFA 1WXUA 1TUCA 3JCMb 2Y3AB 3GNFB 1CKAA 4OB2B 4J6WA 4BD3A 3HRTA 3CCJA 2K9GA 1TWBA 5HY6A 4ATOA 4J9GA 2KRSA 4RTTA 2A37A 3UA6A 2VGNA 2VB6A 1G3SA 3S3OA 5IH2A 1QKXA 2CZ7B 4RTXA 1GHUA 2O31A 1W70A 3PQZA 4Z88A 2ZPGB 4M75C 2EGCA 3NPFA 4XTWA 4MZPA 3J80E 4X34A 1EZZB 1YNZA 5I6VA 4RMOA 5KYXB 4E7KA 1QMCA 4BB7A 3QYHB 1UECA 2QQBA 3N8MA 4J9CA 2OTLQ 3T04A 4FW2A 3JCMe 1O48A 4C5HA 2CT4A 3MEAA 3I5SA 2MAMA 2YT6A 3VRNA 5KCHA 1ZA1B 2EKOA 4PL6A 1O75A 3TEEA 3JCMX 4M77F 2DILA 6AT1B 3V7SA 2DERA 3PSKA 5GAN3 1YVLA 4EDUA 3CCVT 4PJOA 1X69A 3OSVA 4OMNA 3X28B 4C8QF 3G71T 1BBZA 2DL3A 4GPLB 4H1OA 1S72T 3NGPA 1WJSA 2AKKA 1BYMA 1SKUB 1N9SA 4JJDA 1FMWA 2PQWA 3TSWA 3X26B 4EMGA 4F7UB 1WA7A 4KT0E 5LJ5e 1JXOA 1OV3A 3OS0A 2O4XB 1VQ9T 2JM8A 4M7AD 2KNBB 1V29B 4CC4B 2L2PA 3VUBA 5GAOm 1A08A 3K2TA 4FYYB 4F16A 1XOVA 3LGLA 3L2UA 1X27A 5GJWB 1Z9ZA 3CBLA 3EGUA 3OBWA 1XJWB 5J39A 4ZN1A 1ZA2B 4PFZA 4M78F 1Y96B 1YJWA 2K2MA 2K3BA 4NWFA 4OHHA 3SWNA 1MNEA 2NUTA 2OAWA 2VXEA 2Y4XA 2CH4A 5CO7A 2GTOA 5EG2A 2RNAA 1VIFA 2EQIA 1FX7A 2FZKB 4IUTA 3L42A 1N8RC 2DCRA 1BKBA 1QKWA 2KK6A 4A4GA 4FU6A 1VQMQ 2RQVA 3PNWC 2PVDB 2GTJA 1BHHB 3KUFA 2L3PA 1QCOA 3NFCA 2EBPA 1U1SA 1F1WA 2YRDA 3M5AA 2P0PA 4KBMB 4QVDA 4LNPA 4NL2A 2LCLA 4OGEA 4XTXA 1O4OA 1OYXA 4RCBA 4M7DG 3H6ZA 1YITQ 4F14A 3RMQA 5KYYA 2HDVA 1HSQA 4PJOB 2K79A 3VS4A 4RG2A 4J9HA 5LJ3j 1Q82U 2CKKA 5DLOA 1WI7A 1YN8A 4C8QE 4AG1C 2KYMA 4DQ2A 1K73C 3JCMQ 2KE9A 3BFMA 2XIDA 4FBNA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1E6H A;  1OO4 A;  5EG3 B;  3NHN A;  1G2B A;  4CC2 A;  1GCQ C;  1GFC A;  1CWD L;  1JYU A;  1ZSG A;  2IUI A;  3IMD A;  1AYD A;  5BO4 A;  1SRL A;  4AFS C;  1UUE A;  2LZ6 B;  2ROL A;  1O4A A;  2Y1M A;  1A81 A;  2DNU A;  4R0K A;  3H41 A;  2RMX A;  1MW4 A;  1P13 A;  3BUW B;  4RTV A;  1BLJ A;  2AZV A;  2VWF A;  4F17 A;  2V1R A;  2LNW A;  4HVV A;  5EEL A;  4WCI A;  2EO3 A;  2JW4 A;  4OHL A;  3VRZ A;  2DL7 A;  1OPK A;  3I9Q A;  3S8L A;  5EHR A;  3VS2 A;  1LKK A;  2EYV A;  5DC9 A;  4XZ1 A;  4JJC A;  4F5B A;  1SSH A;  3VRO A;  1FBV A;  1BU1 A;  1QWF A;  1R1S A;  2EYY A;  1TCE A;  1D4T A;  2KRN A;  2OJ2 A;  1VYV A;  2PNI A;  2ED0 A;  3UF4 A;  1H92 A;  2EKX A;  3PVL A;  1WYX A;  1YWP A;  3OP0 A;  2M0Y A;  1VA7 A;  2KGT A;  3LH5 A;  1OEB A;  5FWB A;  2YU7 A;  5GJI A;  1W1F A;  1FYN A;  1UHC A;  1GBR A;  2A36 A;  2CUB A;  4JGH A;  4JE4 A;  2DE0 X;  4Z89 A;  2ETZ A;  2DX1 A;  2O88 A;  2ABL A;  1NYG A;  1SPK A;  1W6X A;  4P9V A;  2H8H A;  1ZUK A;  2GNC A;  1I1J A;  1KA6 A;  1O4Q A;  2K79 B;  1PNJ A;  3O5Z A; 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 3IQL A;  2CRE A;  3VGO A;  1SEM A;  3VRY A;  3CD3 A;  2EGE A;  2HBW A;  1E7O A;  1K9A A;  4Z8A A;  1O4B A;  3OV1 A;  1CSY A;  5IHK A;  1HJD A;  2RN8 A;  1AEY A;  2DL8 A;  3VS5 A;  2L6K A;  2SRC A;  2L4K A;  4TZI A;  2KXC A;  4RTU A;  2ECZ A;  5GJH A;  1M30 A;  2QMS A;  1IO6 A;  1LCJ A;  1ZFP E;  1LUM A;  4AG2 C;  1O4C A;  2W10 A;  2CT3 A;  2J06 A;  1FBZ A;  5IBM A;  2ROT A;  3VRQ A;  4OHE A;  3BUN B;  1O43 A;  2VKN A;  2BBU A;  2AOA A;  1BKM A;  4LUE A;  1A07 A;  4Y92 A;  3CQT A;  4J9E A;  1LUI A;  1M27 C;  1FHS A;  2J6O A;  1RPY A;  2PNA A;  2GQI A;  4AFQ C;  3UA7 A;  3KFJ A;  3I5R A;  3MAZ A;  4FL3 A;  2JS0 A;  1O41 A;  3TL0 A;  4OMP A;  1RUW A;  1X2Q A;  2XMF A;  2KRO A;  2IZV A;  1CJ1 A;  3UYO A;  3EG0 A;  2DRK A;  1QWE A;  2DJQ A;  4RTY A;  1HD3 A;  2RVF A;  1O42 A;  1SPR A;  4GWF A;  1ABO A;  1U5S A;  3IMJ A;  2GGR A;  3PE0 A;  3PFV A;  1AOT F;  1V1C A;  3BUM B;  1O4N A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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