1LCKA

Sh3-sh2 domain fragment of human p56-lck tyrosine kinase complexed with the 10 residue synthetic phosphotyrosyl peptide tegqpyqpqpa
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
b'DNLVIALHSYEPSHDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQT'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords P56==LCK== TYROSINE KINASE
publication title Structure of the regulatory domains of the Src-family tyrosine kinase Lck.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Complex (kinase/peptide)
total genus 35
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1994-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1lckA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1lckA02
1CKAA 3I5SA 4FL3A 4K2RA 1UG1A 3VS4A 2CT3A 1JWOA 1NZLA 3PLFB 2KNBB 2EGCA 2W10A 1JXOA 2SEMA 1LUIA 4EY0A 1R1PA 1AEYA 1IJRA 4WWQA 2O2OA 4AG2C 1I1JA 4R0KA 3VS0A 2RQWA 1O45A 2KR3A 3M7FA 2DL3A 5BO4A 4F14A 1RQQC 2Y1MA 4J9GA 1BF5A 2PNAA 2M51A 1WX6A 2FPDA 3S8NA 1YWPA 3H0HA 2DA9A 4GPLB 1WDXA 1O41A 2K79A 3H41A 1SPKA 4D8KA 5DC0B 2YUQA 2DL4A 1CSKA 5IHNA 4GL9E 5EELA 3BUMB 2O31A 3VRZA 2AZVA 1G2BA 2L3PA 4J9IA 1O49A 1Z3KA 3ZL7C 2RN8A 1B3QA 1SSHA 3RBBB 2EPDA 1O4FA 1NLPC 1GCQC 2DVJA 2DLPA 2AZSA 2GTOA 3PFVA 2KXCA 1UHFA 1I3ZA 1GFDA 2DYBA 1GHUA 1FMKA 1KJWA 4CC4B 1U06A 1AWOA 4K44A 5AULA 4Z89A 1M3BA 1OPKA 1K76A 4KRTA 3VS1A 3BUXB 4LN2A 2NUZA 1K1ZA 2EL8A 2Y1NA 3K2MA 2MIOA 1BMBA 2JM9A 1K0XA 3OP0A 1WLPB 2ABLA 2KRSA 3UATA 4H34A 5HKWA 1O4CA 1AYCA 1JEGA 1X2KA 1SHBA 2DL7A 1JYRA 1K0SA 2CREA 3C7IA 1NM7A 2ECDA 2LX7A 2HUWA 3GXXA 3IMJA 2CUBA 2YUPA 3US4A 2C0TA 3M0PA 1A1AA 5IH2A 4OHHA 1RUWA 1AOTF 2DBKA 2DL8A 2PZ1A 1RLQC 1K9AA 1TUCA 1OO3A 3PSKA 2KT8A 1NRVA 3M0RA 5KAZA 2ROTA 1SHDA 2C0OA 2KK6A 1O4PA 1UECA 1BBZA 2KYBA 1GFCA 2LQWA 2K6DA 1A07A 1FYRA 2PNIA 2SRCA 2EOBA 2EYVA 3MXCA 1PWTA 2O88A 5DC9A 4LNPA 2DILA 1UHCA 2HEQA 1ZX6A 4X1VA 1YN8A 2YT6A 2YDLA 4JEGA 4OMLA 2DX1A 2FCIA 2CR4A 3IQLA 4F59A 2AK5A 2EYYA 3CD3A 4J9DA 4JPBW 2JS0A 2CRHA 3O5ZA 1HCTB 1AYBA 4AFUC 1I0CA 1Y1UA 1SRLA 1BK2A 5EEQA 1QKXA 2DL5A 1XOVA 1D4WA 1JYUA 4DEYA 2EYZA 3IN7A 1PRLC 2DMOA 1A08A 1T0HA 1BHHA 4P9ZA 1HCSB 3TL0A 4E93A 4HVWA 5FWBA 1NZVA 3EG2A 1TG0A 3MXYA 2RQUA 1BLKA 1YWOA 1RLPC 4QT7A 2YU7A 1ARKA 2K7AA 1O42A 2XP1A 2RQRA 1O48A 2GNCA 2JW4A 2DBMA 4NWFA 1AWXA 3VRNA 1O4MA 1O47A 4RTXA 4AG1C 1R1SA 1F2FA 1QKWA 1U3OA 2BZXA 2CS0A 1LCJA 2I0NA 3VS3A 2L4KA 1X0NA 1X27A 1O4DA 2B86A 2IUGA 2GGRA 5IXFA 1A1EA 2GE9A 2RQVA 1SHGA 1O4OA 1X69A 4F17A 2IUIA 3UF4A 2EU0A 1HJDA 4U17A 4GBQA 3VROA 2EKXA 1UJ0A 1ZSGA 3UA6A 1VYTA 5GJWB 3VRRA 3M0UA 4A4CA 4FBNA 1MILA 1AOUF 5I11A 1ZLMA 4Z8AA 1BHHB 1UURA 1QWFA 1JU5C 4EIKA 1H9OA 2DCRA 2DLYA 3IN8A 1VYVA 3MAZA 1UDLA 2EKHA 1SEMA 4LUEA 2K7AB 1UTIA 1N5ZA 5IBMA 4DGXA 1ABQA 2A28A 5HCKA 3C0CA 3PQZA 5CDWA 4LUDA 3S8LA 2YUOA 4D8DA 2MCNA 2JT4A 1QLYA 2H8HA 1WI7A 1YP5A 1M8MA 1WXBA 3PJPA 4LE9A 3NHNA 2PTKA 2W0ZA 1GCPA 2J6OA 1FBVA 1HD3A 1ZUKA 2CUDA 4K45A 3NGPA 2EQIA 1NEGA 1PKSA 3SHWA 1PHTA 1BFJA 3OB2B 1BLJA 1JU5A 3PVLA 2EO3A 1BKMA 3CWGA 2ETZA 4GWFA 2JM8A 1GRIA 1KA6A 2IUHA 1M3AA 4J9CA 4JZ3A 4RUGA 2RMXA 1OPLA 3M0TA 3KFVA 1T3LA 4JJCA 1O44A 5ECAA 4U1PA 2J6KA 3OVEA 3VS5A 5IXBA 3HCKA 2LQNA 2MK2A 1NEBA 4AFSC 1H8KA 1GL5A 3EACA 2A37A 4JJDA 1SPSA 5DF6A 1YVHA 1WQUA 3N7YA 1T0JA 2XMFA 2DF6A 4JZ4A 5FW9A 3REAB 2RORA 1GCQA 4JGHA 2HSPA 2AOAA 1TUDA 1CWDL 3HIZB 4ORZA 1WXUA 2DE0X 1QADA 1O4QA 2CDTA 2EO6A 1AYDA 2EYXA 1O4KA 2CI9A 1FYNA 2KYMA 3TSWA 1FU6A 2HDVA 2IZVA 4OMNA 2DNUA 2ED1A 2RMOA 2ENMA 5I22A 1BG1A 1ABOA 2JS2A 2LP5A 2FPEA 1M61A 2B3OA 1O4JA 3I5RA 1HSQA 1NYGA 2A36A 2C0IA 2AOBA 1SPRA 2K9GA 2V1RA 1LCKA 1UUSA 1SHAA 4K11A 3CQTA 3KFJA 3SEMA 3N84A 1X2QA 4AFQC 2QMSA 4HXJA 1IS0A 2HDAA 2OI3A 1RPYA 3EG0A 2DLZA 2OZOA 2H5KA 3WA4A 3S9KA 2F2XA 1WA7A 1O4IA 2FO0A 2CBLA 4QSYA 3ZNIA 2GQIA 5FWCA 2AKKA 1WYXA 1UGVA 1K4US 1O4GA 3THKA 4ZNXA 3PSJA 1G83A 2RNAA 4HVVA 2DJQA 3OV1A 1O4NA 1OO4A 1UFFA 5EHRA 3VS2A 1AD5A 2L3QA 3I9QA 3OB1B 2DRKA 2HBWA 2DM0A 1YNZA 2EGEA 2G6FX 4EIHA 4E6RA 3QWXX 2KGTA 1PKTA 3EG3A 1A0NB 1B47A 1FHSA 1ZUUA 1O4BA 1B07A 4AFZC 3PS5A 3ULRB 3H0IA 3BUWB 2GTJA 2H46E 4OHIA 4E68A 1WFWA 1O46A 1PICA 2DRMA 2LJ0A 1Y0MA 3TSZA 4IIMA 2KEAA 1UJYA 2BZYA 2D8JA 2CSQA 1P13A 1JQQA 3I35A 2ED0A 2MRJA 2FPFA 2FRYA 1M30A 4IIOA 1D4TA 2LNWA 4H1OA 4X6SA 3BUNB 4WCIA 1LUMA 3VGOA 5AXIA 5HKYA 4J9HA 1RI9A 2D1XA 4GLMA 1JXMA 2VIFA 3IMDA 2AKLA 1BM2A 2RQTA 4RTTA 2JTEA 3UYOA 5HKZA 1H3HA 1O4AA 2D0NA 2KBTA 1AWJA 3EHQA 1JYQA 2MQIA 5IBSA 1E7OA 1A1BA 1TCEA 4JE4A 1W1FA 1NYFA 1SKJA 2EBPA 1O4LA 1Z9ZA 4J9FA 1VA7A 2RSYA 3EHRA 5D0JA 5I6VA 2LJ1A 1ZFPE 5DC4A 3U23A 1NG2A 2HMHA 2KRNA 1TZEE 2GSBA 1I07A 2F2WA 2M0YA 4OMPA 2YSQA 1LUKA 2OQ1A 2EGAA 1X6CA 3VRYA 2NWMA 4OHLA 1X43A 3VRQA 3NMZC 3N8MA 1PRMC 1CKBA 1AYAA 1WXTA 2MOXA 5IHKA 1LKKA 2ESWA 3REBB 2F2VA 4JJBA 2LNHB 1W70A 2PNBA 4RTZA 2C9WA 3GXWA 2L6KA 1SRMA 1KSWA 1ZBJA 1SHFA 5L23A 2VWFA 2D8HA 2JMAA 2L3SA 3TKZA 2X3WD 1KIKA 3M0QA 2VVKA 5IHIA 1A09A 3RNJA 4RTWA 3GQIB 3A98A 2MC1A 1AWWA 1OV3A 2CIAA 2J06A 1Y57A 1M27C 2YUNA 2K2MA 1KFZA 2AUGA 4NWGA 2JYQA 4J9BA 4L1BB 2KT1A 1OOTA 2O9SA 3EG1A 2KROA 1QCFA 5EG3B 4OHEA 1U5SA 1RJAA 4HCKA 4ESRA 4OHDA 5EC7A 2E5KA 1LUNA 3H0FA 4OMMA 1NLOC 1D1ZA 5EHPA 4A4BA 2FG0A 2HDXA 2DM1A 1T3SA 1WIEA 1H92A 2JXBA 1O4HA 2BZ8A 1CJ1A 2LCTA 4TZIA 4XZ1A 2K3BA 1BHFA 2BTTA 1UE9A 1O4RA 2Y3AB 3BKBA 3S8OA 3QWYA 3BUOB 3CBLA 4ROJA 1BU1A 2K79B 2LJ3A 2RVFA 1M27A 4DGPA 2CSIA 3GBQA 4J9EA 4M4ZA 4F5AA 3EAZA 1BB9A 1AOJA 1IO6A 2J7IA 1AZEA 3HHMB 2J6FA 2P4RA 2ROLA 2FEIA 1F1WA 1BFIA 1XA6A 1OEBA 4OMOA 4FL2A 5GJHA 2RF0A 1LKLA 2EVRA 1MV0B 1PNJA 4CC2A 1YCSB 4RTYA 1A1CA 1YVLA 2CT4A 1KC2A 3T04A 1E6GA 2JMCA 1EFNA 2LZ6B 2QDLA 2VKNA 4RTVA 2EYWA 1UUEA 3PE0A 2OAWA 1J3TA 2KE9A 1CWEA 4A63B 3M0SA 2YSXA 4CC7A 2MRKA 1S1NA 5J3XA 4F5BA 1VYUA 2FRWA 1AZGB 1X6GA 5GJVB 3UA7A 3FJ5A 2OJ2A 2V1QA 2KNOA 2A08A 2J05A 3NPFA 1GBRA 1R1QA 3VRPA 2LCSA 2CH4A 1X6BA 2SHPA 2X3XD 2O9VA 4P9VA 2L2PA 1O4EA 1CSYA 4F16A 2GBQA 2BBUA 2L0AA 2PLDA 2KXDA 1MW4A 4DEXA 2EW3A 4RTUA 2DX0A 4Z88A 1FBZA 1MV3A 3VS6A 4OMQA 2L3TA 1E6HA 1ZUYA 2HCKA 3VS7A 3CXLA 3R6NA 1O43A 2LMJA 3EGUA 1FU5A 5GJIA 1Z9QA 2CI8A 1AB2A 1QWEA 2ECZA 1QG1E 3PVQA 2LNXA 1V1CA 4FSSA 1KA7A 3LH5A 4CC3A 1AVZC 2KRMA 1A81A 3TVTA 1M3CA 3JV3A 1JO8A 4HVUA 2PLEA 2RPNA 2CH4W 4Y92A 1BKLA 2IIMA 1CSZA 1W6XA 1GBQA 4XZ0A 1MUZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HK9A 5DLOA 1NZLA 4J6WA 1JXOA 3CC2A 2SEMA 1LUIA 1B34A 2MF2A 1D1CA 3X28B 3CCLA 3G6ET 1N6AA 1RAIB 2KR3A 3S6WA 2HSEB 3OYJA 5BO4A 3RMQA 2M51A 1YWPA 4KBMB 2QA4T 2RB6A 5DC0B 2DL4A 2YLBA 1MGQA 3OB9A 3CC7Q 4GL9E 1OZ2A 4M75F 3VRZA 3QXEB 1W2BA 3CXCS 4PKCC 2RJFA 3OYFA 1SSHA 1M1KU 2QQRA 2WSEE 1GCQC 3FC3A 1VQ4A 2RHZA 4JS5A 1BKBA 2DYBA 1GHUA 3CCQA 2DTIA 4CC4B 1AWOA 2NUTB 3UPUA 4A4KA 1OPKA 4B9WA 4C8QD 3VV0A 5GMKh 4OGEA 5GMKl 2X4YA 1K76A 3OBYA 2Y1NA 5I2SA 3OP0A 5CKHA 1WLPB 2XG8D 3JCMb 4II1A 3CCRA 1AYCA 1W4SA 8AT1B 2LRQA 3MPUB 1BI2A 2LX7A 3GXXA 1OQKA 1VOMA 1YCYA 5A0DA 1RLQC 1TUCA 1F1BB 1OO3A 3PSKA 3HRTA 1IRXA 2LQWA 5DC9A 2EOBA 3LGLA 2O88A 1YITA 1MMDA 1NJIR 2PQWA 2YT6A 3CCMT 2DEQA 2YDLA 2E4HA 2B8AA 4BY6C 2HKNA 1HCTB 5LJ5g 1AYBA 3L2RA 1Y1UA 5EEQA 1OX8A 1XOVA 1JYUA 1M1KC 4KULA 3S3OA 5GAN8 3H6ZA 4M7DE 4E93A 2VB6A 1K73R 2E41A 2QA4A 1RLPC 1ARKA 3RKWA 2XP1A 2E5QA 3LWHA 4EPCA 3X26B 5GMKj 2GNCA 1N27A 2JW4A 1VQKT 4LDXA 4PJLA 4RTXA 4FSXA 5DM7R 1BIBA 3VU3C 4EMHA 2I0NA 2MYSA 2E3IA 3LYVA 2B86A 5J3BA 2IUGA 1Q81U 3CXCA 2DERA 1SHGA 1O4OA 4XU3A 3M53A 2BKDN 1PD1A 1HJDA 1N9RA 3VROA 1NE8A 1UJ0A 1ZSGA 1VYTA 5GJWB 3VRRA 4PJOA 2ZPIB 4J7IA 3LYIA 4A4CA 1KC8R 4FBNA 5I11A 4EIKA 1H9OA 1K9MU 3PFSA 4ZGJB 3MAZA 1UDLA 4M78F 1SEMA 2RHIA 1WQWA 2K7AB 3SDZA 1YFNA 2QTXA 3S8LA 1VQNT 4L6V5 2H8HA 4E7SA 3JCMX 1M8MA 3JCMQ 4E7JA 4M77D 2J6OA 1HD3A 4A4GA 2EQIA 3SHWA 1UGPB 3M4YA 3HKSA 4M7DG 3OB2B 1JU5A 2K5FA 2DXUA 3GOXA 5LJ3f 4DOWA 3M0TA 3CCMA 1VQ8T 3KFVA 1O44A 3PMTA 3OYBA 2P0KA 4E7KA 3OVEA 5IXBA 2Y4XA 3CCSQ 1NEBA 4AFSC 2F69A 3I56T 1H8KA 3EACA 3N7YA 1XTDA 1RL2A 2IG0A 1T0JA 2XMFA 1K9MR 3HRUA 4J6YA 1I4K1 1I5LA 3HIZB 3MHXA 2DE0X 4XTWA 3MEAA 1KK7A 1AYDA 2CI9A 4ELYC 1Q81C 2KYMA 4FM4B 3URGA 2IZVA 4PLLA 3CC4Q 2ED1A 2K5LA 1UGQB 1BG1A 4YTLA 2LP5A 2FPEA 2FB7A 1VQKA 1ACMB 3H8ZA 1HSQA 1NYGA 2A36A 1WJRA 2HBPA 2FZKB 1SPRA 2DYIA 2E3HA 3SEMA 1EX4A 3DB4A 3JCMd 1IS0A 2RHUA 2OZOA 4RMOA 2CKKA 1V29B 2EKOA 3L2WA 3NTKA 2IVWA 2CS7A 2AKKA 3THKA 1G83A 4AT1B 5DLQE 1OO4A 1N8RU 1H641 4BUGA 3A8GB 1YJ9A 3I9QA 4BE2A 4B9XA 1YNZA 4Y91A 2VXEA 3M59A 4C8QB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CKA A;  3I5S A;  4FL3 A;  4K2R A;  1UG1 A;  3VS4 A;  2CT3 A;  1JWO A;  1NZL A;  3PLF B;  2KNB B;  2EGC A;  2W10 A;  1JXO A;  2SEM A;  1LUI A;  4EY0 A;  1R1P A;  1AEY A;  1IJR A;  4WWQ A;  2O2O A;  4AG2 C;  1I1J A;  4R0K A;  3VS0 A;  2RQW A;  1O45 A;  2KR3 A;  3M7F A;  2DL3 A;  5BO4 A;  4F14 A;  1RQQ C;  2Y1M A;  4J9G A;  1BF5 A;  2PNA A;  2M51 A;  1WX6 A;  2FPD A;  3S8N A;  1YWP A;  3H0H A;  2DA9 A;  4GPL B;  1WDX A;  1O41 A;  2K79 A;  3H41 A;  1SPK A;  4D8K A;  5DC0 B;  2YUQ A;  2DL4 A;  1CSK A;  5IHN A;  4GL9 E;  5EEL A;  3BUM B;  2O31 A;  3VRZ A;  2AZV A;  1G2B A;  2L3P A;  4J9I A;  1O49 A;  1Z3K A;  3ZL7 C;  2RN8 A;  1B3Q A;  1SSH A;  3RBB B;  2EPD A;  1O4F A;  1NLP C;  1GCQ C;  2DVJ A;  2DLP A;  2AZS A;  2GTO A;  3PFV A;  2KXC A;  1UHF A;  1I3Z A;  1GFD A;  2DYB A;  1GHU A;  1FMK A;  1KJW A;  4CC4 B;  1U06 A;  1AWO A;  4K44 A;  5AUL A;  4Z89 A;  1M3B A;  1OPK A;  1K76 A;  4KRT A;  3VS1 A;  3BUX B;  4LN2 A;  2NUZ A;  1K1Z A;  2EL8 A;  2Y1N A;  3K2M A;  2MIO A;  1BMB A;  2JM9 A;  1K0X A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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