1LCKA

Sh3-sh2 domain fragment of human p56-lck tyrosine kinase complexed with the 10 residue synthetic phosphotyrosyl peptide tegqpyqpqpa
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
DNLVIALHSYEPSHDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the regulatory domains of the Src-family tyrosine kinase Lck.
pubmed doi rcsb
molecule keywords P56==LCK== TYROSINE KINASE
molecule tags Complex (kinase/peptide)
source organism Homo sapiens
total genus 35
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1994-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1lckA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1lckA02
3PJPA 2LMJA 2ROTA 1O4HA 2K7AA 2YUQA 1FYRA 2FEIA 5DC4A 3UA6A 2JM8A 2LJ1A 2DCRA 3VS0A 3M0UA 1K0XA 3CXLA 2X3WD 4Y92A 2KE9A 2CS0A 2K2MA 4JGHA 4GPLB 4OMPA 2JS2A 3QWYA 1BKMA 3EG0A 1O47A 3PE0A 4XZ0A 1BHHB 1QWEA 2PNAA 1BKLA 1YP5A 4RTWA 1HJDA 1ABOA 1OPKA 3VGOA 3ZNIA 2FRYA 2KRSA 5IHNA 2KRNA 1A1CA 2GSBA 3ZL7C 2QMSA 1D1ZA 5IH2A 5DC9A 4RTXA 4RTTA 1NM7A 1U3OA 2JS0A 4FSSA 2DRMA 3M0QA 4CC2A 1LUMA 3UA7A 5IBSA 3M0PA 4OMLA 3VS6A 2MOXA 2DBKA 2EGEA 2DMOA 1OPLA 1QKWA 2PTKA 1M27A 1NLOC 1SEMA 3TSZA 4ROJA 1BFIA 1O4BA 1PHTA 4OHLA 1LUKA 2LP5A 1GFCA 1B3QA 1HSQA 1KSWA 1ABQA 2DL4A 1F1WA 1O4RA 2J06A 1GFDA 2K7AB 2Y1NA 5I22A 1XA6A 2L3TA 1H8KA 1BFJA 4RTVA 4XZ1A 2AZVA 1PICA 1WXBA 4JJDA 1GCPA 1PKTA 3EG3A 5HKYA 2EYXA 2YSQA 3TVTA 4K11A 3EHQA 1M3BA 2MCNA 2QDLA 2CT4A 2KBTA 3CQTA 2L0AA 1AOJA 1H3HA 1O4NA 2GTJA 1Z3KA 3QWXX 3JV3A 1OEBA 4AG2C 3KFVA 1VYVA 3PVQA 1RLPC 1LCKA 4OHDA 1FMKA 1I07A 4HCKA 4OHIA 1SPRA 4QT7A 4NWGA 2GNCA 3REBB 1X2QA 2L6KA 1X6CA 2YUPA 2F2WA 1M27C 1F2FA 1O43A 1BM2A 1D4TA 3PSKA 2EYWA 1ARKA 2PLEA 3PFVA 4RTUA 2H8HA 3I35A 2RN8A 1O4CA 1WIEA 1AYAA 2DYBA 3LH5A 5IBMA 3HCKA 4LUEA 3EGUA 2AUGA 5EG3B 2SRCA 1FBZA 3N8MA 2L3SA 2CI9A 4A63B 1GRIA 1U5SA 2DE0X 2GTOA 2V1QA 1GBRA 4J9HA 2RSYA 4LUDA 1AD5A 1UGVA 2HMHA 3NGPA 1IJRA 4GL9E 2LQNA 5IHKA 1O4QA 1A0NB 2MQIA 4K44A 1JXOA 1R1PA 1BLKA 1HD3A 2PZ1A 2DX1A 2SEMA 4Z8AA 2AOAA 2DX0A 4E93A 1WFWA 3THKA 2EGAA 2DVJA 3BKBA 1NRVA 3C7IA 3WA4A 4JPBW 3IMDA 2DM1A 1MILA 2DLYA 2F2XA 2JW4A 4A4BA 1NZLA 4J9IA 1A1EA 2HUWA 1A07A 1QKXA 2LJ0A 2DRKA 4DGPA 2MC1A 4HXJA 1T3LA 1M30A 4J9CA 2MRJA 4F5AA 2EU0A 2EKXA 1A09A 1JU5A 2HEQA 2DLPA 2W0ZA 1TUCA 1O4DA 1QCFA 2RVFA 3EHRA 1SSHA 2LCTA 2RQUA 1SPKA 2CH4W 1K9AA 1O44A 2BZYA 3A98A 1PKSA 5AULA 2DF6A 1BU1A 1JXMA 5FWBA 2LX7A 3ULRB 3O5ZA 2Y1MA 3CD3A 5DC0B 2EO6A 2BZXA 3H41A 3VRNA 4M4ZA 1WDXA 3UF4A 2CI8A 1FBVA 2EYVA 1W6XA 2ED1A 3U23A 2JTEA 1A08A 2H46E 2OZOA 1VYTA 1O4PA 5HKWA 2FG0A 1HCTB 1KIKA 1CSZA 2AOBA 3N84A 1FYNA 1UURA 4FL3A 1P13A 3NPFA 1CWEA 4E6RA 1UJYA 3VS2A 1MUZA 4ESRA 3BUXB 2RPNA 1UG1A 1BB9A 5FW9A 2GE9A 1OO4A 2KEAA 2ENMA 1IS0A 2ETZA 1Y57A 1JU5C 2EBPA 2HDAA 2J6OA 2IUGA 1QG1E 2FPDA 2GBQA 2O9VA 3CWGA 1TCEA 3OB2B 2JMAA 3RBBB 1M61A 1SHAA 3US4A 2LNXA 2AKLA 2DJQA 2KNBB 1JYUA 4F14A 1BBZA 2EYYA 1NZVA 3BUOB 1KA7A 1RUWA 2CUDA 3M0TA 5KAZA 2V1RA 1O4KA 4JZ4A 1W1FA 2RORA 1RLQC 1AYDA 1CJ1A 4OMMA 4A4CA 3FJ5A 2KNOA 1RQQC 1PRMC 3GQIB 1ZLMA 2K9GA 2P4RA 2Y3AB 3K2MA 4H1OA 4TZIA 4AFZC 2B3OA 1JEGA 4H34A 4ZNXA 4JJCA 2G6FX 3I5RA 1A81A 2EQIA 1M3CA 3VRPA 2DNUA 2CBLA 1JO8A 1VA7A 2M51A 4JEGA 1SRLA 2CRHA 1HCSB 1WYXA 1PWTA 1B47A 3M0RA 2F2VA 4GBQA 3OVEA 4LE9A 2VIFA 1NLPC 1A1AA 4L1BB 1K0SA 1LUNA 3VS1A 1XOVA 3EACA 2RF0A 3S8OA 4K45A 2IUIA 2AZSA 2LQWA 4KRTA 4JZ3A 4DGXA 2L4KA 2FO0A 1AWWA 2HDVA 2GQIA 3H0IA 3MAZA 2EW3A 4DEYA 2A08A 1SHBA 2ECDA 2CUBA 2CREA 4NWFA 2LNWA 2OJ2A 2DM0A 1BLJA 2JYQA 4AFQC 4QSYA 1YWOA 4J9GA 1O42A 1UHCA 3VRYA 1JYQA 1CKAA 1SKJA 2FPFA 1AB2A 3GBQA 1AEYA 5J3XA 3UATA 4FBNA 1E7OA 4EIKA 2GGRA 2ED0A 1AOTF 2EVRA 5AXIA 2B86A 1X6BA 2C0IA 1YVLA 2PNIA 1BMBA 2W10A 2YUNA 1H92A 4U1PA 1O4AA 2I0NA 2C0TA 5IXBA 2DLZA 1J3TA 3VRZA 1KC2A 1WI7A 2YDLA 3REAB 4AFUC 3BUNB 1TUDA 1K76A 4GWFA 3SEMA 3PLFB 4WCIA 1RPYA 2ABLA 2LJ3A 2AKKA 3GXWA 2A28A 1AYCA 4OMOA 1NYGA 2FCIA 2XP1A 1M8MA 2CSQA 4K2RA 4X6SA 1SHGA 1RI9A 2HCKA 2MK2A 2KT8A 3PS5A 5ECAA 2IUHA 1MV0B 1YWPA 4HVVA 4J9DA 2RQRA 2EKHA 4RTYA 2DILA 5I6VA 4CC7A 4FL2A 4JE4A 1Z9ZA 2IZVA 5EC7A 3I5SA 2SHPA 2D8HA 3VS5A 1AWJA 3VRRA 2KYMA 1YCSB 1YN8A 2JT4A 3S9KA 4OMQA 3IQLA 1WX6A 3BUWB 2JM9A 2VKNA 3VROA 1QADA 2LNHB 1K4US 1TZEE 5EHRA 1OV3A 1R1SA 1BK2A 3OP0A 1X2KA 1SRMA 3I9QA 2O2OA 1ZUYA 1FU6A 2VWFA 1AVZC 1PRLC 1LCJA 2YUOA 5IXFA 2J05A 4IIOA 1KFZA 2L3QA 4GLMA 1IO6A 2KGTA 4WWQA 1JWOA 1UDLA 2HSPA 3S8LA 1LKLA 2XMFA 2C0OA 1W70A 2FRWA 1RJAA 1O4JA 3NHNA 1O4FA 1R1QA 2KXCA 4D8DA 3EAZA 1O4GA 5EELA 2O88A 4Z89A 1SHDA 5HKZA 4P9ZA 1S1NA 1U06A 2YU7A 1I1JA 3IN8A 1ZBJA 2OAWA 4J9FA 1G83A 2D8JA 1UUSA 2KRMA 2O31A 3M7FA 1BG1A 1CSYA 3HHMB 1LUIA 1V1CA 4F17A 4HVWA 4X1VA 1G2BA 1O49A 3S8NA 2BBUA 2DA9A 2DL5A 2RMXA 3UYOA 1GCQA 3PVLA 1D4WA 5D0JA 3KFJA 2EGCA 4AFSC 5GJHA 1X69A 2ROLA 1GL5A 1QWFA 4CC3A 3GXXA 1UUEA 2DL3A 2C9WA 1BF5A 5IHIA 1EFNA 4EIHA 3T04A 1PNJA 4D8KA 1UECA 1T0HA 3M0SA 5GJWB 1GBQA 3SHWA 3OB1B 4R0KA 3VS4A 3IN7A 4LNPA 5I11A 1ZUUA 1ZFPE 2K6DA 2HBWA 1NEBA 1I0CA 1TG0A 1VYUA 1Z9QA 1K1ZA 4IIMA 1CKBA 2A36A 2DBMA 4P9VA 2E5KA 3PQZA 2K79A 4Z88A 1UHFA 1E6HA 2JMCA 2FPEA 2RNAA 4F16A 5CDWA 1AOUF 2NWMA 2CSIA 4DEXA 2EOBA 1N5ZA 2K3BA 2EYZA 1OO3A 1WA7A 1AWXA 1GCQC 1YNZA 3BUMB 2RQVA 2ECZA 2J6KA 2RQWA 4ORZA 1NEGA 2KYBA 1H9OA 3MXYA 4E68A 2D1XA 2A37A 5HCKA 3OV1A 5DF6A 1WLPB 2EO3A 1I3ZA 1WXUA 1FHSA 1LKKA 1ZSGA 2OI3A 1B07A 2EPDA 2NUZA 3RNJA 1O45A 4J9EA 1UE9A 2VVKA 5L23A 3H0HA 1MV3A 1UJ0A 2YSXA 4RTZA 3TSWA 4LN2A 2HDXA 2BZ8A 4F5BA 1ZX6A 2KR3A 1BHFA 5FWCA 4OHHA 1YVHA 1X0NA 3R6NA 1AZEA 1O4OA 3MXCA 1M3AA 4RUGA 1GHUA 1X43A 2JXBA 1JYRA 2CT3A 2YT6A 4OMNA 5BO4A 2EL8A 1SHFA 5EHPA 2D0NA 2K79B 5GJVB 3VRQA 2L2PA 1ZUKA 2AK5A 2M0YA 3VS7A 3NMZC 1T3SA 4OHEA 1O48A 1T0JA 3EG2A 4EY0A 4AG1C 2LCSA 1KJWA 2RQTA 1Y1UA 2KXDA 1WQUA 2PNBA 5GJIA 1WXTA 1E6GA 2X3XD 3VS3A 2J6FA 2LZ6B 1Y0MA 2MIOA 1KA6A 2DL7A 1OOTA 3EG1A 4U17A 2OQ1A 1CSKA 3C0CA 1O41A 2J7IA 2KK6A 2ESWA 2PLDA 3H0FA 2MRKA 3TL0A 2RMOA 2KROA 2DL8A 1JQQA 1QLYA 1BHHA 3HIZB 2CIAA 2O9SA 2H5KA 5EEQA 2CDTA 1O4EA 1UTIA 4JJBA 4CC4B 1AWOA 1O4MA 1X27A 1CWDL 3N7YA 2BTTA 1FU5A 1A1BA 1NG2A 1O4LA 2L3PA 4HVUA 4J9BA 1UFFA 1SPSA 1AYBA 2CR4A 1AZGB 1O4IA 4F59A 1MW4A 3CBLA 2KT1A 1X6GA 3IMJA 3PSJA 3TKZA 2IIMA 1O46A 1NYFA 2CH4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2X51A 2DVEA 2K7AA 2YUQA 1QCOA 5DC4A 3JB9D 2JM8A 2LJ1A 3VS0A 3L2VA 4Y92A 2CS0A 2K2MA 3OQ5A 4KBMB 4OMPA 1KC8U 1Q86C 3OYIA 4QQGA 2VXFA 4C8QA 4IUVA 1BKMA 2EQKA 5I2SA 1BHHB 1QWEA 1BKLA 1JBMA 1OPKA 4Y28E 3CMAT 3E9FA 2X4YA 1RAGB 4JRKA 1VQPQ 3ZL7C 3DB4A 4XU3A 1YJWQ 2MOXA 1OPLA 3QUIA 5CK9A 2CZ0B 2LP5A 3EGDA 1FX7A 1UGRB 4FW2A 1G5VA 3C4SA 1GFDA 4OMFB 2L3TA 5KYYB 2AZVA 2KAFA 2E6ZA 2OTJQ 4FSXA 4JJDA 3TCJA 1NZ9A 3EG3A 3FLGA 5CKFA 5HKYA 2E41A 2RI2A 2EYXA 2YSQA 1M3BA 2KBTA 1OU9A 3EG9A 2GTJA 1YJWA 3CCMT 2PVGB 3QWXX 3JV3A 1WJRA 3QIIA 4PLLA 3PVQA 2IG0A 1VQNT 2FZGB 4OHDA 4HCKA 4OHIA 2DEUA 1M2OA 3REBB 1RAAB 1X6CA 1K9MU 2O4XB 1BM2A 1D4TA 2EYWA 4C5GA 2H8HA 5M9OA 2OTJA 3I35A 3URGA 2WSEE 4LUEA 4OB1B 1FBZA 3JAME 4M7AA 2GF7A 3OYEA 2Y90A 1GRIA 1U5SA 1OX9A 5GANj 5FROA 1AD5A 2HMHA 2DXCA 3RIRA 3J81E 2CP0A 2LQNA 4E7IA 4K44A 2MQIA 1ZA1B 2DX1A 4Z8AA 2L5QA 4AT1B 2AOAA 3WXMB 1Y71A 3THKA 5CAIA 2EGAA 3C94A 1NRVA 3C7IA 4JPBW 2F2XA 4A4BA 1QVFP 1M8VA 3EFOA 2EWNA 1A07A 3OYCA 4IUQA 2MC1A 4HXJA 4J9CA 3SFMA 4D6WA 2HKQB 4WTOB 3QJ6A 1TOVA 1IRXA 4ZGDB 2HEQA 1TUGB 3RMQA 4B9XA 1O4DA 3CCSQ 1QCFA 1M1KU 1OQKA 4M77D 4FU6A 4XTWA 2MWPA 4C92B 5FWBA 3ULRB 3O5ZA 2Y1MA 2E12A 1D0XA 3H41A 4JRPA 3VRNA 4L59A 2JTEA 3L2RA 2F5KA 2K5IA 2YLBA 3EFSA 1C6VX 1HCTB 2XDDA 1P13A 1CWEA 4E6RA 5GMKm 2ZPIB 5FW9A 5FU7B 3JSCA 3I56T 1YITQ 1IZ6A 1QG1E 1QP2A 3VYHB 3VU3C 3CWGA 3OB2B 3US4A 1NJIR 2DJQA 1K8AU 3G4ST 1M1FA 3QSUA 2F1LA 3OW2S 2EYYA 1KA7A 1YIJT 2KNOA 2RHUA 3HP9A 4TZIA 1RI0A 5LJ3g 3L2QA 2P0KA 2JZ2A 1M3CA 5CKEA 1YITA 2DTIA 2DNUA 1VQ8T 2M51A 4Z02A 1HCSB 1WYXA 1B47A 2F2VA 1UGQB 2KDSA 1LOJA 4PJOB 4JS5A 1XOVA 3S8OA 4ATOA 3LW5E 2IUIA 3M9QA 4JRIA 2EQMA 2LCCA 2HDVA 2KGYA 3CCVT 3HPWA 4C8QE 3ME9A 2LVMA 5GAOp 1KQ1A 1O42A 3OW2A 2LC4A 1ZHIA 3G1JA 1Q82C 1C0MA 1CKAA 1AEYA 1YHQT 2RA2A 3UATA 4FBNA 1E7OA 4EIKA 5A2QE 1AOTF 2DK3A 3AHUA 1YVLA 2PNIA 2W10A 1H92A 4U1PA 2I0NA 3QYHB 1G8XA 2XHCA 2JVVA 2VUBA 4XQ3A 3CC7Q 1PSEA 1KQSA 1TUDA 1W4SA 1VOMA 4B6MA 4ZTFA 4GWFA 4ELZC 3PLFB 1WHJA 1I81A 2ABLA 1EIFA 1NYGA 2XI9A 1SHGA 1D3BB 4LD9K 2KT8A 2MI6A 1MV0B 4MZPA 2CZ1B 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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