4NWGA

Crystal structure of the tyrosine phosphatase shp-2 with e139d mutation
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
533
structure length
498
Chain Sequence
TSRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGAEKLLTEKGKHGSFLVRDSQSHPGDFVLSVRTGDSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDGDPNPVSDYINANIIMPEKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
publication title Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with E139D mutation
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 155
structure length 498
sequence length 533
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2013-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4nwgA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4nwgA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4nwgA03
4YAAA 3TL0A 1BF5A 1KA7A 4JBCA 1G7GA 2CBLA 2A8BA 2MQIA 1ZCKA 1LKLA 2LNWA 2HXPA 3OB2B 1PTYA 1O49A 3B7OA 3PSKA 2OZOA 3VS3A 1A09A 1BMBA 5EHPA 3CWGA 1YPTA 2YSXA 1ONYA 2PNAA 2F6TA 3BUXB 4H1OA 1LARA 5DC0B 2H4VA 1X0NA 1Q6JA 2SHPA 2GE9A 3QWXX 5K22A 1KSWA 5GTJA 2VIFA 4LUDA 3ZNIA 2MK2A 2HNQA 1OHDA 1O4DA 1NO6A 5DC9A 2NT2A 1AYDA 3D42A 1H9OA 1LYVA 1BKMA 4RHGA 3PQZA 1O47A 5LXQB 1CJ1A 2PLEA 3S9KA 1XRIA 1P13A 3N7YA 3T04A 3MOZA 4PYHA 1IJRA 1NZVA 2CFVA 1QADA 3S3EA 2EKXA 1YTWA 5EG3B 1XXVA 2DVJA 2G6ZA 1A1CA 2VEWA 4P9VA 1C86A 3S4OA 2K79B 1JU5A 4RH5A 2Y96A 1BZCA 2KNOA 1O4KA 2BGEA 3QCLA 2NZ6A 2RORA 1OETA 5GJIA 3CM3A 1JYQA 4XZ1A 5AULA 2VEVA 3BLTA 4NYHA 1UURA 5EHRA 2XP1A 2QBRA 3V0DA 3GXXA 2BGDA 2QEPA 1C85A 3H2XA 1OO4A 3BUNB 1A5YA 1U26A 3US4A 1WQUA 3UF4A 3QCGA 2ZMMA 1AD5A 3MXCA 1Q6PA 2MRJA 4D3PA 1M61A 1Q1MA 3V0JA 2B4SA 3MAZA 2I4EA 2EYYA 2B49A 1OEUA 3CD3A 4JNBA 3ZM2A 3VS6A 2YDUA 1O4PA 1D5RA 4EY0A 2OC3A 3GXHA 4JE4A 2ABLA 3EMUA 1YFOA 5KA7A 3CBLA 3QCKA 1NWEA 2CNHA 2MBCA 5EEQA 2F6ZA 1C84A 3QCDA 1OPLA 3VS0A 5KA4A 5KA0A 1JYUA 4JEGA 4Z6BA 2EO3A 4OHDA 1RPYA 1EENA 4HJPA 1XA6A 1LKKA 4GFVA 5I6VA 5KABA 1YVHA 1OEMX 1K9AA 1G7FA 1GWZA 2QDCA 4I8NA 3S3HA 1C88A 1C87A 3LJ8A 3QCHA 2PQ5A 1CSYA 1FQ1A 1PA1A 3O4UA 1AYBA 1FYRA 2QBSA 4EIHA 2AOAA 3ZMPA 4D3RA 4R30A 3O4SA 1SHBA 3KFJA 2QCJA 1I3ZA 1F2FA 3SMEA 1G1GA 4RDDA 2CNEA 1WAXA 2HVLA 1KC2A 2YU7A 3QCBA 2L6KA 3VRYA 3BRHA 1PA9A 1PH0A 2HUWA 3BUWB 1TZEE 2EU0A 4D3QA 2ETZA 1NRVA 4Y14A 2HCKA 2L3TA 4QAPA 1G83A 1CWEA 1O4HA 4YR8B 1SKJA 4QBWA 2CM2A 3MXYA 2PA5A 3EAXA 2AHSA 1O4QA 5AXIA 2J16B 2NV5A 1JF7A 1D4TA 2BBUA 3WA4A 3BUMB 5HKWA 3D1OA 1D4WA 1OHCA 4X6SA 3RZ2A 4GE5A 1Y57A 1I9SA 2C46A 2CR4A 3O5XA 1A1BA 2AUGA 1FU6A 1JYRA 2H46E 2BZLA 2H4GA 3OV1A 1V3AA 1QCFA 3OP0A 1NL9A 2CM3A 2F6WA 4OHLA 3OB1B 2I6MA 2CMCA 5KA3A 1AYCA 2I4HA 1O4NA 2M3VA 3D44A 5KA1A 1M3GA 2ESBA 1O44A 1KAKA 1A81A 1BHHB 3OVEA 5BX1A 4OHIA 4MBBA 3N0AA 1LUMA 3F9BA 4PVGA 3A5KA 2CIAA 3MOWA 1O4OA 2IUHA 1YZ4A 2P6XA 3EZZA 1D1ZA 4K44A 1BZHA 4F5AA 5IBMA 4WTYA 1BM2A 2B07A 4GRYA 3VS7A 1O4EA 3CWEA 3PSJA 3S8OA 3QKPA 1R1QA 3IMDA 1PTTA 3MMJA 4ICZA 2IMGA 2I6IA 3F41A 3EAZA 2JYQA 4QUMA 4ERCA 3QWYA 4WU3A 3F99A 4K45A 3IN7A 1FBVA 4QUNA 2IUIA 2LCTA 2QMSA 1PTVA 2FO0A 4KYQA 4RKKA 3PFVA 1BKLA 1SHDA 1WCHA 4JMKA 1MILA 3VS1A 2MC1A 4QSYA 5EELA 2NT7A 3A5JA 3PS5A 2OQ1A 3AWGA 2F6VA 2CRHA 2KK6A 1ZCLA 2F46A 2EO6A 1MW4A 2HNPA 2FCIA 3ZMQA 3O3LA 4NNDA 3AWEA 1O4RA 4GE2A 2LNXA 2MRKA 2RSYA 3PJPA 1SPRA 4GWFA 5DC4A 1IS0A 1OHEA 4F59A 4J51A 3NMEA 2GP0A 5BO4A 1ZZWA 3I80A 4ZN5A 3ZM3A 2P4DA 1OEVA 2C9WA 4KI9A 4M4ZA 1HCTB 1Q6MA 3QCFA 4XZ0A 4L1BB 2QCTA 4BPCA 1ECVA 5GJHA 3AWFA 4LUEA 2EOBA 4R0SA 2H8HA 2PT0A 1PYNA 3BM8A 2F71A 4NWFA 5KAAA 4WWQA 2B4PA 2GJTA 5J3XA 2HCMA 3NHNA 1FPRA 1QZ0A 3I7ZA 2IZVA 5HDEA 4OHHA 3HHMB 1ZFPE 3SR9A 2QBQA 2Y1NA 4F5BA 1SHAA 4A4BA 5K9VA 1YVLA 2FJNA 1AB2A 5IBSA 1OESA 2CMBA 2I4GA 2C0TA 2EL8A 5DF6A 2A3KA 5KA9A 1MKPA 5KA8A 3S3KA 4Y2EA 1SPSA 2HC2A 3M4UA 2ECDA 2Y3AB 1QXKA 4S0GA 2H4KA 1G1HA 4DGXA 1G4WR 4FL2A 1FMKA 4K11A 4HJQA 4RI5A 4GRZA 1B47A 1RJAA 1NZLA 2F70A 1I57A 2RMXA 3BLUA 1FPZA 2J17A 1GFYA 1LUIA 3RGOA 2Y2FA 4ZI4A 2H04A 5BZZA 1X24A 1R6HA 2PSZA 2Q05A 3VS2A 1EEOA 1F1WA 1G1FA 3VRZA 4WOHA 2QBPA 3M7FA 3VRRA 1O4CA 2FH7A 2AOBA 4E93A 1O4BA 1YWFA 2CM7A 1VHRA 3U96A 3V0EA 5CDWA 3QCMA 2PLDA 4D8KA 1O4FA 5HKYA 2OZ5A 1OEOX 1RQQC 1O42A 2BIJA 3QCCA 4HRFA 2CJZA 1CSZA 2C7SA 3OLRA 3D1QA 3HIZB 2WGPA 4FL3A 3C7IA 2VEYA 1BZJA 1PICA 2C0IA 2Y1MA 1FU5A 3ZM0A 2CM8A 3CXLA 1O41A 2CI8A 1U25A 1YTSA 4GE6A 2LQWA 5MMZB 2I42A 5K9WA 2I6PA 1LCJA 1FBZA 1GRIA 1O4MA 2H03A 1O4LA 3O4TA 3ZV2A 1A07A 1KAVA 3F81A 3N8MA 4K2RA 4B04A 4GFUA 3QCIA 4JGHA 3QCEA 1BFIA 4RI4A 2OUDA 3BKBA 1KA6A 1O48A 5K23A 2NLKA 2ZN7A 2VEUA 1ZC0A 2DXPA 4JMJA 2CS0A 1J4XA 1OPKA 1NZ7A 3OMHA 3GXGA 1WRMA 2PNBA 1XBOA 1O4JA 1NNYA 1L8KA 1AYAA 1JLNA 4R0TA 5AWXA 4ROJA 1RXDA 2HB1A 3D1HA 2FJMA 1O46A 4E68A 1O4AA 2HDXA 2AZRA 3IMJA 3F9AA 1Y1UA 3VS4A 1LUKA 2DLZA 5KAZA 4DGPA 1Q6NA 3S8NA 4U17A 3RO1A 4KYRA 1XM2A 1AOTF 1L8GA 1JWOA 2DM0A 2BV5A 2EYZA 3VS5A 3QCNA 2H5KA 4ZRTA 4BJOA 4QBEA 2HC1A 2CMAA 2I5XA 1Q6SA 3GQIB 3RGQA 2QDMA 1U24A 2I6OA 2G59A 2RF6A 1FHSA 4P9ZA 2B3OA 2K7AB 2LQNA 4FBNA 1PTUA 4WU2A 5D0JA 3TKZA 4OHEA 3QCJA 1SUGA 1HCSB 2HDVA 2OOQA 1X27A 1T49A 2C0OA 1LUNA 3VRQA 1UUSA 4GS0A 3IN8A 1G4US 1R1PA 3GXWA 1OO3A 2VEXA 1TCEA 2J16A 1AOUF 3PLFB 3N84A 4H34A 2CNIA 2PI7A 5K24A 4AZ1A 4TZIA 5HKZA 1GHUA 2HY3A 2DCRA 3S8LA 2B4OA 1RPMA 3V0IA 4QAHA 4RH9A 1A1AA 4GL9E 1BFJA 2CNFA 2R0BA 4NX8A 2I1YA 1T4JA 1YTNA 2B4UA 3BUOB 1A1EA 2DX0A 1O4IA 1R1SA 2CI9A 1O4GA 1X6CA 3VRPA 2GSBA 1C83A 1ONZA 3QKQA 3D9CA 1YGUA 1PXHA 5KA2A 1BHHA 3UYOA 1YGRA 1NWLA 3HCKA 2Q47A 2E0TA 1BG1A 2RVFA 1T48A 1YN9A 3VGOA 1AAXA 5BUGA 1BLJA 3I36A 3EU0A 5BZXA 4GPLB 1QG1E 4U1PA 2I75A 3S4EA 3V0FA 1BLKA 1Q6TA 1A08A 2EYVA 2NTAA 1I9TA 1O43A 2F6YA 4NWGA 2PTKA 1XXPA 4A4CA 2SRCA 2GWOA 1O45A 2DLYA 5J8RA 2I6JA 3ZM1A 2H02A 2L4KA 2JJDA 3VROA 1M27A 2HMHA 3EACA 4IKCA 1Z3KA 5M43A 3K2MA 2I3UA 2I3RA 2CNGA 4TVVA 1BHFA 1P15A 5K25A 1LQFA 3S3FA 1CWDL 5KACA 3V0GA 2IUGA 2F6FA 5KADA 2PBNA 3EB1A 2QDPA 1LCKA 3VRNA 3V0HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YAAA 3TL0A 1BF5A 1KA7A 2JFGA 1G7GA 2AM2A 2CBLA 4JBCA 2A8BA 2MQIA 1ZCKA 1LKLA 2LNWA 1P3DA 2HXPA 3OB2B 1PTYA 1O49A 3B7OA 3PSKA 2OZOA 3VS3A 1A09A 1BMBA 5EHPA 1GQQA 3CWGA 1YPTA 2YSXA 1ONYA 2PNAA 1EEHA 2F6TA 3BUXB 4H1OA 1LARA 5DC0B 2H4VA 1X0NA 1Q6JA 2SHPA 2GE9A 3QWXX 5K22A 1KSWA 5GTJA 2VIFA 4LUDA 3ZNIA 2MK2A 2HNQA 1OHDA 1O4DA 1GQYA 1NO6A 5DC9A 2NT2A 1AYDA 3D42A 1H9OA 1LYVA 1BKMA 4RHGA 3PQZA 1O47A 5LXQB 1CJ1A 2PLEA 3S9KA 1XRIA 1P13A 3N7YA 3T04A 3MOZA 4PYHA 1IJRA 1NZVA 2CFVA 1QADA 3S3EA 2EKXA 1YTWA 5EG3B 1XXVA 2DVJA 2G6ZA 1O5ZA 3ZM6A 1A1CA 2VEWA 4P9VA 1C86A 3S4OA 2K79B 1JU5A 4RH5A 2Y96A 1BZCA 2KNOA 1O4KA 2BGEA 3QCLA 2NZ6A 2RORA 1OETA 5GJIA 3CM3A 1JYQA 4XZ1A 5AULA 2VEVA 2KGYA 3BLTA 4NYHA 1UURA 5EHRA 2XP1A 2QBRA 3V0DA 3GXXA 2BGDA 2QEPA 1C85A 3H2XA 1OO4A 3BUNB 1A5YA 1U26A 3ZM5A 3US4A 1WQUA 3UF4A 3QCGA 2ZMMA 1AD5A 3MXCA 1Q6PA 2MRJA 4D3PA 1M61A 1J6UA 1Q1MA 3V0JA 2B4SA 3MAZA 2I4EA 2EYYA 2B49A 1OEUA 3CD3A 4JNBA 3ZM2A 3VS6A 2YDUA 1O4PA 1D5RA 4EY0A 2OC3A 3GXHA 4JE4A 2ABLA 3EMUA 1YFOA 5KA7A 3CBLA 3QCKA 1NWEA 2CNHA 2MBCA 5EEQA 2F6ZA 1C84A 3QCDA 4ZIYA 1OPLA 3VS0A 5KA4A 5KA0A 1JYUA 4JEGA 4Z6BA 2EO3A 4OHDA 1RPYA 1EENA 1UAGA 3PYZA 1XA6A 1LKKA 4HJPA 4GFVA 5I6VA 5KABA 2VTEA 2UUOA 1YVHA 1OEMX 1K9AA 1G7FA 1GWZA 2QDCA 4I8NA 3S3HA 1C88A 1C87A 3LJ8A 3QCHA 4C12A 2PQ5A 1CSYA 1FQ1A 4CVLA 1PA1A 3O4UA 1AYBA 1FYRA 2QBSA 4EIHA 2AOAA 3ZMPA 4D3RA 4QDIA 3O4SA 1SHBA 3KFJA 4R30A 2QCJA 1I3ZA 1F2FA 3SMEA 1G1GA 4RDDA 2CNEA 1WAXA 2HVLA 1KC2A 2YU7A 3QCBA 2L6KA 3VRYA 3BRHA 1PA9A 1PH0A 2HUWA 3BUWB 1TZEE 2EU0A 4D3QA 2ETZA 1NRVA 4Y14A 2HCKA 2L3TA 4QAPA 1G83A 4CVKA 1E8CA 1CWEA 1O4HA 4YR8B 1SKJA 4QBWA 2CM2A 3MXYA 2PA5A 4UAGA 3EAXA 2AHSA 5A5FA 1O4QA 5AXIA 2J16B 2NV5A 1JF7A 2AM1A 1D4TA 2BBUA 3WA4A 3BUMB 5HKWA 3D1OA 1D4WA 1OHCA 4X6SA 3RZ2A 4GE5A 1Y57A 1I9SA 2C46A 2CR4A 3O5XA 1A1BA 2AUGA 1FU6A 1JYRA 2H46E 2BZLA 2H4GA 2X5OA 1E0DA 3OV1A 1V3AA 1QCFA 3OP0A 1NL9A 2CM3A 2F6WA 2GCBA 4OHLA 3OB1B 2I6MA 2CMCA 2UUPA 5KA3A 1AYCA 2I4HA 1O4NA 2M3VA 3D44A 5KA1A 1M3GA 2ESBA 1O44A 1KAKA 1A81A 1BHHB 3OVEA 5BX1A 4OHIA 4MBBA 3N0AA 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1MKPA 5KA8A 3S3KA 4Y2EA 1SPSA 2HC2A 3M4UA 2ECDA 2Y3AB 1QXKA 4S0GA 2H4KA 1G1HA 4DGXA 1G4WR 4FL2A 1FMKA 4K11A 4HJQA 4RI5A 4GRZA 1B47A 1RJAA 1NZLA 2F70A 1I57A 2RMXA 3BLUA 1FPZA 2J17A 1GFYA 1LUIA 3RGOA 2Y2FA 4ZI4A 2H04A 5BZZA 1X24A 1R6HA 2PSZA 2Q05A 3VS2A 1EEOA 1F1WA 1G1FA 3VRZA 4WOHA 2QBPA 3M7FA 4CVMA 3VRRA 1O4CA 2FH7A 2AOBA 4E93A 1O4BA 1YWFA 5A5EA 2CM7A 2VORA 1VHRA 3U96A 3V0EA 5CDWA 3QCMA 2PLDA 4D8KA 1O4FA 3LYVA 5HKYA 2OZ5A 1OEOX 1RQQC 1O42A 2BIJA 3QCCA 4HRFA 2CJZA 1CSZA 2C7SA 3OLRA 3D1QA 3HIZB 2WGPA 4FL3A 3C7IA 2VEYA 1BZJA 1PICA 2C0IA 2Y1MA 1FU5A 3ZM0A 2CM8A 3CXLA 1O41A 2CI8A 1U25A 1YTSA 2Y67A 4GE6A 2LQWA 5MMZB 2I42A 5K9WA 2I6PA 1LCJA 1FBZA 1GRIA 1O4MA 2H03A 1O4LA 3O4TA 3ZV2A 1A07A 1KAVA 2Y66A 3F81A 3N8MA 4K2RA 4B04A 4QF5A 4GFUA 3QCIA 4JGHA 3QCEA 1BFIA 4RI4A 3K2TA 2OUDA 3BKBA 1KA6A 1O48A 5K23A 2NLKA 2ZN7A 2VEUA 1ZC0A 2DXPA 4JMJA 2CS0A 1J4XA 1OPKA 1NZ7A 3OMHA 3GXGA 1WRMA 2PNBA 1XBOA 1O4JA 1NNYA 1L8KA 1AYAA 1JLNA 1GG4A 4R0TA 5AWXA 4ROJA 1RXDA 2HB1A 3D1HA 2FJMA 1O46A 4E68A 1O4AA 2HDXA 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 2OOQ A;  1X27 A;  1T49 A;  2C0O A;  1LUN A;  3VRQ A;  1UUS A;  4GS0 A;  3IN8 A;  1G4U S;  1R1P A;  3GXW A;  1OO3 A;  2VEX A;  1TCE A;  2J16 A;  1AOU F;  3PLF B;  3N84 A;  4H34 A;  2CNI A;  2PI7 A;  5K24 A;  4AZ1 A;  4TZI A;  5HKZ A;  1GHU A;  2HY3 A;  2DCR A;  3S8L A;  2B4O A;  1RPM A;  3V0I A;  4QAH A;  4RH9 A;  1A1A A;  4GL9 E;  1BFJ A;  2CNF A;  2R0B A;  4NX8 A;  2I1Y A;  1T4J A;  1YTN A;  2B4U A;  3BUO B;  1A1E A;  2DX0 A;  1O4I A;  1R1S A;  2CI9 A;  1O4G A;  1X6C A;  3VRP A;  2GSB A;  1C83 A;  1ONZ A;  3QKQ A;  3D9C A;  1YGU A;  1PXH A;  5KA2 A;  1BHH A;  3UYO A;  1YGR A;  1NWL A;  3HCK A;  2Q47 A;  2E0T A;  1BG1 A;  2RVF A;  1T48 A;  1YN9 A;  3VGO A;  1AAX A;  5BUG A;  1BLJ A;  3I36 A;  3EU0 A;  5BZX A;  4GPL B;  1QG1 E;  4U1P A;  2I75 A;  3S4E A;  3V0F A;  1BLK A;  1Q6T A;  1A08 A;  2EYV A;  2NTA A;  1I9T A;  1O43 A;  2F6Y A;  4NWG A;  2PTK A;  1XXP A;  4A4C A;  2SRC A;  2GWO A;  1O45 A;  2DLY A;  5J8R A;  2I6J A;  3ZM1 A;  2H02 A;  2L4K A;  2JJD A;  3VRO A;  1M27 A;  2HMH A;  3EAC A;  4IKC A;  1Z3K A;  5M43 A;  3K2M A;  2I3U A;  2I3R A;  2CNG A;  4TVV A;  1BHF A;  1P15 A;  5K25 A;  1LQF A;  3S3F A;  1CWD L;  5KAC A;  3V0G A;  2IUG A;  2F6F A;  5KAD A;  2PBN A;  3EB1 A;  2QDP A;  1LCK A;  3VRN A;  3V0H A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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