4NWGA

Crystal structure of the tyrosine phosphatase shp-2 with e139d mutation
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
533
structure length
498
Chain Sequence
TSRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGAEKLLTEKGKHGSFLVRDSQSHPGDFVLSVRTGDSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDGDPNPVSDYINANIIMPEKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
publication title Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with E139D mutation
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 155
structure length 498
sequence length 533
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2013-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4nwgA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4nwgA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4nwgA03
3VS4A 5KA7A 1AOTF 1ZCKA 1O4LA 2LQWA 2CNIA 3V0FA 2PT0A 4QAPA 2XP1A 1YPTA 3US4A 2IUIA 1JYRA 2SRCA 2VEVA 2H8HA 4NX8A 5KA9A 1QADA 3PLFB 4HRFA 1OHEA 1U24A 1YTWA 1O44A 2H03A 2HC1A 2I4GA 2ZMMA 3ZM1A 1L8GA 3UYOA 3VRPA 1FBVA 2GP0A 3H2XA 2CNEA 4XZ1A 1YZ4A 5KADA 1EEOA 1Q6NA 5HDEA 2HCKA 3IMDA 4F5BA 2OOQA 2VEYA 1GWZA 2ABLA 4ZRTA 2LCTA 1EENA 2P4DA 3S8NA 1X0NA 1NWLA 1BM2A 2C0IA 1BG1A 1O4HA 3HHMB 2B4SA 1B47A 4RHGA 2Y2FA 3QCBA 2C46A 3F9AA 1LUKA 2NTAA 4D3RA 4I8NA 2I6MA 1A1CA 3QCGA 4AZ1A 4B04A 2PSZA 1JF7A 3A5KA 1G1GA 1Q6TA 3S8LA 1M27A 1O47A 3VRNA 2LNWA 2I6JA 3D9CA 2A3KA 1HCSB 5KAAA 3PJPA 4OHDA 3TL0A 2K7AB 2HNPA 2NV5A 3A5JA 2FO0A 4E68A 3MOWA 3QCNA 4RI5A 1FMKA 1AYBA 3O4UA 2GJTA 1OPLA 3O5XA 2QBRA 4JEGA 3NMEA 4Y14A 2SHPA 3EAXA 1SKJA 1Y1UA 1AOUF 3PSKA 4HJPA 3VRYA 1XXVA 3S4OA 4RI4A 5K9WA 3EMUA 2VEUA 3GXHA 2JYQA 3OVEA 1T4JA 4JMJA 4P9ZA 1BZHA 3QWXX 4QSYA 2F6ZA 3BKBA 2Y1NA 4OHHA 4PYHA 4QAHA 5KAZA 5KABA 1LQFA 4M4ZA 1JU5A 3MAZA 2CMAA 1A81A 1G7GA 3BLUA 2H5KA 4JE4A 1X6CA 3EZZA 4ERCA 3IN8A 1YN9A 1A1EA 1CSYA 2GE9A 1KAKA 2CM3A 2F6VA 4OHLA 3AWGA 5J8RA 1LUIA 2EKXA 1Y57A 2AHSA 2M3VA 4BJOA 3OV1A 3NHNA 4GE6A 3D42A 1X27A 1A07A 3BLTA 5KA3A 3O3LA 3ZM3A 1AYAA 2RORA 1I57A 1O4QA 1PICA 1QXKA 1O46A 2AUGA 4ZI4A 1WAXA 1O45A 1TCEA 4D3QA 2LQNA 4WU2A 3F81A 4TZIA 2CI8A 2HVLA 2L6KA 2Q05A 5K24A 2BZLA 2QDMA 2LNXA 5HKYA 2HMHA 3RZ2A 3S8OA 1O41A 2Y1MA 1I9SA 1Q6JA 1SUGA 2CM7A 2QDPA 3D1QA 3OLRA 4LUDA 3O4TA 3C7IA 2J17A 1LCJA 1RPMA 5CDWA 2G6ZA 2A8BA 1NRVA 3MXCA 5DC4A 5BO4A 2RMXA 3GXGA 2FCIA 2OQ1A 1O4NA 1IJRA 1MKPA 1YTNA 2KNOA 2C9WA 5DF6A 1I3ZA 4XZ0A 1LARA 2BV5A 3I7ZA 5BX1A 1YVLA 1BF5A 1PTUA 1NO6A 3QCKA 1LYVA 2ETZA 4NWFA 2EU0A 2CBLA 1BKLA 1A08A 3BUOB 4GE2A 2PNBA 4U17A 3S3EA 2CIAA 2FJNA 1LKKA 3V0EA 2PA5A 1FPRA 3BUWB 5IBMA 2NT2A 4RH9A 2B07A 3QCCA 1C86A 2YU7A 1LCKA 4GL9E 1OEMX 3CWEA 3IN7A 4FL2A 4JNBA 1IS0A 3QCIA 2CNGA 4K45A 3ZMQA 1F2FA 1OEOX 4F5AA 1O4FA 2I3UA 4H1OA 1XA6A 1M61A 1NNYA 3VS7A 3EACA 1NL9A 3V0HA 3CM3A 2F6WA 1SHDA 3F99A 1D5RA 1O49A 1KAVA 2HCMA 3VRRA 1O4GA 5K25A 1F1WA 1T49A 2FH7A 2GSBA 1G1HA 1OO4A 1G7FA 3AWFA 2CNFA 4MBBA 2F6FA 4RDDA 1PXHA 4LUEA 3OB2B 4D3PA 1G1FA 1C85A 1Q1MA 3RGOA 2E0TA 1M3GA 2CS0A 3BUNB 2Y96A 2Y3AB 1O4JA 1OHDA 1BLKA 3S9KA 5K22A 1G4WR 2H46E 2ECDA 2H4GA 1BHHA 5KA1A 1R1SA 1O4PA 3PFVA 1OHCA 3OMHA 4EIHA 1FBZA 1UUSA 1Q6MA 2F46A 2K79B 4YAAA 2EYVA 2VIFA 3S4EA 1GRIA 5D0JA 4DGPA 3QKPA 4GS0A 3CD3A 3ZM2A 2DLZA 2HUWA 1NZ7A 3S3KA 2MQIA 2H04A 4S0GA 2I4EA 2DX0A 1D4WA 5EG3B 2H02A 3M4UA 2FJMA 4QUMA 5KACA 1PTYA 3PQZA 1JLNA 1GHUA 1ECVA 1LKLA 1CJ1A 2QMSA 3CBLA 1NWEA 2QEPA 2YSXA 3GXWA 3UF4A 1ONZA 4Z6BA 3V0IA 1VHRA 2PQ5A 1A1AA 4RKKA 2DLYA 2CI9A 5GJIA 2BGDA 4U1PA 5AWXA 1YFOA 3SMEA 2HDVA 4OHIA 3CXLA 3QCMA 1CWEA 1D4TA 3LJ8A 1G83A 1RJAA 4JGHA 1WCHA 4A4BA 2PLEA 2QBPA 1C87A 3TKZA 3V0DA 3GXXA 4NWGA 4YR8B 2CMBA 2I75A 3EB1A 2L3TA 1JYQA 5AULA 2I6IA 2DM0A 1QG1E 4OHEA 2H4VA 1GFYA 5DC9A 1KA6A 1SHBA 2C0TA 3QCJA 5I6VA 1BHHB 4GRZA 3RGQA 1PTTA 1O4MA 5EHRA 4IKCA 2BBUA 1C88A 1PYNA 1AYDA 2AZRA 2F70A 5K23A 4GFUA 5GTJA 1OEUA 1FU5A 1R6HA 1XRIA 1WRMA 2MRJA 1A09A 1TZEE 4A4CA 1BFJA 1JWOA 5BZXA 2AOBA 3HIZB 3D1OA 4QUNA 1O4EA 2HY3A 3RO1A 1C84A 1ZZWA 3N0AA 5BUGA 4P9VA 4L1BB 4EY0A 3V0GA 1O4IA 1OO3A 2HXPA 2EOBA 4GE5A 1FYRA 1O4OA 2VEWA 1A1BA 5EHPA 3VROA 4DGXA 3AWEA 2NZ6A 3VRQA 1MW4A 2H4KA 1PA1A 1OETA 2EO3A 2NLKA 4FBNA 3B7OA 4E93A 4F59A 1ZC0A 4GRYA 1Q6SA 2F6TA 3VS0A 2WGPA 1A5YA 3QCFA 1SPSA 2DCRA 5BZZA 1YGUA 4WWQA 2B4OA 1BZCA 1BZJA 2OZ5A 1CWDL 3IMJA 5KA4A 1XXPA 5KA0A 2PNAA 1HCTB 4J51A 2VEXA 4RH5A 2CM8A 1WQUA 4ROJA 3BM8A 2CMCA 1BLJA 1SHAA 2CFVA 2B4PA 2G59A 2QDCA 4ZN5A 2ESBA 2R0BA 3MXYA 4K11A 3VGOA 1ONYA 4HJQA 1XM2A 3EAZA 4NYHA 1OPKA 2YDUA 2J16B 3VS6A 4KYRA 4TVVA 1L8KA 2OC3A 1RQQC 1C83A 5M43A 2MBCA 4Y2EA 2EO6A 2I6OA 3HCKA 3CWGA 4X6SA 3O4SA 4PVGA 1G4US 3U96A 3QCEA 3T04A 1I9TA 3N7YA 1PH0A 3F41A 1YVHA 2MRKA 3QKQA 1AD5A 4D8KA 2QBQA 1KC2A 3S3FA 1RXDA 4WOHA 2ZN7A 3BRHA 4GPLB 3M7FA 2QCTA 4QBEA 1KA7A 5EEQA 3N8MA 1O4AA 1J4XA 1K9AA 5GJHA 3PS5A 2CR4A 2MC1A 1QCFA 2PLDA 1O42A 1MILA 2IMGA 3EU0A 1U26A 5MMZB 1NZLA 1H9OA 3ZV2A 5DC0B 1O43A 3OP0A 1PA9A 3D1HA 3V0JA 2QBSA 5LXQB 1YTSA 1CSZA 2C7SA 2L4KA 1UURA 3WA4A 2HDXA 1KSWA 1NZVA 1X24A 1O4DA 2IZVA 2PTKA 1BMBA 1AAXA 5KA8A 2EL8A 1P13A 3KFJA 2RVFA 1V3AA 1O4CA 2PBNA 1U25A 4JMKA 3S3HA 4ICZA 1P15A 2B4UA 2GWOA 1ZCLA 1BKMA 2MK2A 1QZ0A 2QCJA 1FHSA 1Q6PA 1FQ1A 2I3RA 5K9VA 1YGRA 2CM2A 2F71A 1FU6A 2Q47A 4KYQA 4GWFA 3VRZA 2J16A 1JYUA 2JJDA 1OEVA 2I6PA 3I36A 1D1ZA 2RSYA 2KK6A 4BPCA 2I1YA 1R1QA 2EYYA 4GFVA 3VS1A 1AB2A 4JBCA 4QBWA 5J3XA 2C0OA 1Z3KA 2F6YA 5IBSA 2P6XA 3OB1B 3BUMB 4R0TA 3N84A 3VS2A 1YWFA 4WU3A 2I4HA 3VS3A 1LUMA 2CNHA 2AOAA 2CJZA 1T48A 4R0SA 3BUXB 1BHFA 3SR9A 4FL3A 1LUNA 2DVJA 1RPYA 3VS5A 3QCLA 4NNDA 2IUGA 2BIJA 2OZOA 3K2MA 3D44A 3QCDA 3MMJA 3PSJA 3GQIB 2I5XA 3ZM0A 5HKZA 5HKWA 4K44A 2RF6A 1OESA 2B49A 1O4RA 1PTVA 4WTYA 3I80A 2HB1A 2I42A 2PI7A 2DXPA 2BGEA 1XBOA 3F9BA 5EELA 3ZNIA 1AYCA 5KA2A 4R30A 2OUDA 1O4BA 2B3OA 3ZMPA 1SPRA 5AXIA 2IUHA 2HC2A 2NT7A 1R1PA 3MOZA 1BFIA 1FPZA 2HNQA 2EYZA 4KI9A 4H34A 4K2RA 3QCHA 1ZFPE 1O48A 1O4KA 2CRHA 3QWYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VS4A 5KA7A 1AOTF 1ZCKA 1O4LA 2LQWA 2CNIA 3V0FA 2PT0A 4QAPA 2XP1A 1YPTA 3US4A 2IUIA 1JYRA 2SRCA 2VEVA 2H8HA 4NX8A 5KA9A 1QADA 3PLFB 2VTEA 4HRFA 4C13A 1OHEA 1U24A 1YTWA 1O44A 2H03A 2HC1A 2I4GA 2ZMMA 3ZM1A 1L8GA 4CVMA 3UYOA 3VRPA 2X5OA 1FBVA 2GP0A 3H2XA 2CNEA 4XZ1A 1YZ4A 5KADA 1EEOA 1Q6NA 2XJAA 5HDEA 2HCKA 3IMDA 4F5BA 2OOQA 2VEYA 1GWZA 2ABLA 4ZRTA 2LCTA 1EENA 2P4DA 3S8NA 1EEHA 1X0NA 1NWLA 1BM2A 2C0IA 1BG1A 1O4HA 3HHMB 2B4SA 1B47A 4RHGA 2Y2FA 3QCBA 2C46A 3F9AA 1LUKA 2NTAA 4D3RA 4I8NA 2I6MA 1A1CA 3QCGA 4AZ1A 4B04A 2PSZA 1JF7A 3A5KA 1G1GA 1Q6TA 3S8LA 1M27A 2Y1OA 1O47A 3VRNA 2LNWA 2I6JA 3D9CA 2A3KA 1HCSB 5KAAA 3PJPA 4OHDA 2GCAA 3TL0A 2K7AB 2HNPA 2NV5A 3A5JA 2FO0A 4E68A 3MOWA 3QCNA 4RI5A 1FMKA 1AYBA 3O4UA 2GJTA 1OPLA 3O5XA 2QBRA 4JEGA 3NMEA 4Y14A 2SHPA 3EAXA 1SKJA 1Y1UA 1AOUF 3PSKA 4HJPA 3VRYA 5A5EA 1XXVA 3S4OA 2UUPA 4RI4A 5K9WA 3EMUA 2VEUA 3GXHA 2JYQA 3OVEA 1T4JA 1P31A 4JMJA 4P9ZA 1BZHA 3QWXX 4QSYA 2F6ZA 2Y67A 3BKBA 2Y1NA 4OHHA 2GC6A 4PYHA 4QAHA 5KAZA 5KABA 3ZL8A 1LQFA 4M4ZA 1JU5A 2WJPA 3MAZA 2CMAA 1A81A 1G7GA 3BLUA 2H5KA 4JE4A 1X6CA 3EZZA 4ERCA 3IN8A 1YN9A 1A1EA 1CSYA 2GE9A 1KAKA 2CM3A 2F6VA 4OHLA 3AWGA 5J8RA 1LUIA 2EKXA 1Y57A 2AHSA 2M3VA 4ZIYA 4BJOA 3OV1A 3NHNA 4GE6A 3D42A 1X27A 1A07A 3BLTA 5KA3A 3O3LA 2UAGA 3ZM3A 1AYAA 2RORA 1I57A 1O4QA 5A5FA 1PICA 1QXKA 1O46A 2AUGA 4ZI4A 1WAXA 1O45A 1TCEA 4D3QA 2LQNA 3K2TA 4WU2A 3F81A 4TZIA 2CI8A 2HVLA 2L6KA 2Q05A 5K24A 2BZLA 1JBVA 2QDMA 2LNXA 5HKYA 2HMHA 3RZ2A 3S8OA 4HV4A 1O41A 2Y1MA 1I9SA 1Q6JA 1SUGA 2CM7A 2QDPA 3D1QA 3OLRA 4LUDA 3O4TA 3C7IA 2J17A 1LCJA 1RPMA 5CDWA 3NRSA 2G6ZA 2A8BA 1NRVA 3MXCA 5DC4A 5BO4A 2RMXA 3GXGA 2FCIA 2OQ1A 1O4NA 1IJRA 1MKPA 1YTNA 2KNOA 2C9WA 5DF6A 1I3ZA 4XZ0A 1LARA 2BV5A 3I7ZA 5BX1A 1YVLA 1BF5A 1PTUA 1NO6A 3QCKA 1LYVA 2ETZA 2XPCA 4NWFA 2EU0A 2CBLA 1BKLA 1A08A 3BUOB 4GE2A 2PNBA 4U17A 3S3EA 2CIAA 2FJNA 1LKKA 3V0EA 2PA5A 1FPRA 2GC5A 3BUWB 5IBMA 2NT2A 4RH9A 2B07A 3QCCA 1C86A 2YU7A 1LCKA 4GL9E 1OEMX 3CWEA 3IN7A 4FL2A 4JNBA 1IS0A 3QCIA 2WTZA 2CNGA 4K45A 3ZMQA 1F2FA 1OEOX 4F5AA 1O4FA 2I3UA 4H1OA 1XA6A 1M61A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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