4D8KA

Crystal structure of a sh3-sh2 domains of a lymphocyte-specific protein tyrosine kinase (lck) from homo sapiens at 2.36 a resolution
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
NLVIALHSYEPSHDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Tyrosine-protein kinase Lck
publication title Crystal structure of a SH3-SH2 domains of a lymphocyte-specific protein tyrosine kinase (LCK) from Homo sapiens at 2.36 A resolution
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 32
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 4d8kA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4d8kA02
1B07A 1YN8A 2J05A 3TL0A 2KGTA 3FJ5A 4ORZA 4LNPA 4EIKA 1AOJA 1A0NB 4E6RA 4AFZC 3HHMB 1UDLA 1T3SA 2FCIA 4M4ZA 1O44A 4HVVA 4RTUA 1NM7A 3H0HA 2D0NA 4E93A 1AWJA 4AFUC 4L1BB 1HD3A 2Y1NA 3EACA 1QWFA 5IXFA 3VRPA 2DYBA 4E68A 2DL3A 2KEAA 5GJIA 1HJDA 2PLEA 2C9WA 1X6GA 4FBNA 2CT3A 4LUDA 1Y57A 2O2OA 2KBTA 4LUEA 2DBMA 2K2MA 1BHFA 1KC2A 3M0UA 1QG1E 1D4WA 2DA9A 5DC9A 1CKAA 4XZ1A 1D1ZA 2CUBA 1MV0B 3C7IA 4J9GA 1BFIA 2DLYA 2CH4A 2MQIA 1GBRA 4LN2A 2MCNA 1HCSB 2HSPA 4NWGA 1FMKA 2EOBA 1O42A 2D8HA 4FL2A 5GJVB 1AD5A 2FRWA 1KA6A 4K44A 1O48A 3OP0A 1RPYA 5IHNA 4F16A 1VA7A 1RUWA 1ZUUA 1H8KA 1NLPC 2J6OA 2LJ1A 1LCJA 3IMJA 2Y3AB 2A36A 1JXOA 3M0RA 2ROTA 1AWXA 1CJ1A 3C0CA 3CBLA 2ETZA 4EY0A 2VWFA 1UUEA 2L2PA 1E7OA 1A1BA 4HCKA 3ULRB 4JE4A 1AYCA 2KK6A 3IMDA 1RLQC 2KRSA 2VVKA 3VROA 4OMMA 1W70A 1WIEA 1A1EA 3EHQA 1KFZA 3VS7A 1EFNA 1SKJA 2DCRA 4WCIA 1NZLA 2IUIA 2K7AB 2KYMA 2L0AA 1WXUA 1V1CA 2LMJA 1I1JA 4X1VA 3EG3A 1JU5C 2YSQA 3VS6A 4F14A 1FBZA 4AG2C 4RTWA 1QKXA 2MIOA 2ED0A 2YUPA 5DF6A 1VYTA 5J3XA 3OVEA 1GFCA 2EGEA 1OPKA 3BKBA 1WI7A 1UE9A 1UG1A 1SPRA 3MXYA 1JO8A 2L3TA 2RNAA 1HCTB 1T3LA 1M3BA 2X3WD 3U23A 1O4RA 3H0IA 2EKHA 4OMPA 2K3BA 1CKBA 4QT7A 1BMBA 2LNXA 1UFFA 3CXLA 1E6GA 2AKKA 1F1WA 4GL9E 1UHFA 2DX1A 4GBQA 1CSZA 1ZUKA 2SRCA 4F5BA 2JMAA 1XOVA 3M0TA 2RMOA 4R0KA 4JJBA 5IHKA 1BM2A 1CWEA 1O4JA 1O4BA 4LE9A 1BU1A 5KAZA 1JU5A 1PNJA 1AZGB 1KA7A 2K79B 1RLPC 2FEIA 3HCKA 4D8KA 2HMHA 2EVRA 1BG1A 2L4KA 2JTEA 2KYBA 3I35A 2JW4A 2ECZA 2OZOA 1FHSA 2O9VA 2GE9A 5FWCA 1G2BA 2SEMA 4JPBW 4RTYA 1U06A 5I11A 2JT4A 2OQ1A 2DILA 1BFJA 1FU6A 2DX0A 3US4A 3RBBB 1R1PA 2CSIA 1O46A 4OHEA 2MRJA 1RI9A 2EPDA 1AYAA 1VYVA 2YUQA 1JXMA 3H0FA 1WXTA 3VS3A 2K7AA 2EKXA 2CREA 4XZ0A 1GFDA 2K9GA 1B3QA 3SHWA 2O31A 1X69A 2ENMA 2CUDA 2JM9A 2KE9A 3N7YA 1YWPA 3ZNIA 4H34A 1TZEE 5IXBA 2W0ZA 2CSQA 1RJAA 4RTVA 4JJDA 3GQIB 1U3OA 4KRTA 2DBKA 1SPSA 2BZXA 4FL3A 3CWGA 3VGOA 1Z9QA 4OHHA 1UTIA 1UJ0A 4CC2A 5AXIA 4F5AA 2O9SA 3RNJA 4OHDA 2LJ3A 1LKLA 1O43A 2C0OA 5ECAA 4X6SA 1HSQA 2DRKA 2M0YA 1JWOA 2RMXA 1M30A 1BLKA 2AKLA 2CT4A 1BF5A 1M27A 1O4LA 1CSYA 5I22A 5GJWB 3O5ZA 4JZ4A 1A81A 2AUGA 2CH4W 2RQVA 2SHPA 2OI3A 1O4QA 1X2QA 1O4DA 2DNUA 1PHTA 4Z89A 2Y1MA 1X27A 1WXBA 2LJ0A 2PNIA 2DLPA 3QWXX 1OV3A 1ZSGA 1CWDL 3VS5A 2RQWA 1AWWA 1NYFA 1UURA 5HKYA 3H41A 3REBB 2HBWA 1PWTA 3EGUA 4H1OA 1KSWA 1W1FA 2CIAA 3HIZB 1YVHA 1O4KA 3OB2B 1SEMA 1U5SA 1A07A 2EYXA 3I5RA 1JYQA 1UUSA 2LNWA 1NG2A 1ZFPE 3EAZA 3BUWB 2DF6A 3BUXB 3WA4A 3S8OA 2FRYA 1PKTA 1UGVA 4P9ZA 4OHLA 1UECA 2H5KA 1O4OA 2PNBA 3MAZA 2KT1A 1T0JA 4J9IA 3VS4A 2RF0A 3NPFA 1N5ZA 4P9VA 4EIHA 2KRNA 3SEMA 3UATA 1O4FA 1D4TA 2K6DA 2F2XA 4AFQC 3PS5A 1WFWA 2GNCA 1SRMA 4OMLA 2DM0A 2GQIA 1NEGA 4U1PA 5IBSA 2ESWA 2MOXA 4JZ3A 2ABLA 3UA7A 3PVLA 1O4IA 2H46E 1TCEA 3S8LA 3PVQA 5DC0B 2AK5A 2FPDA 1JYRA 1WLPB 1O47A 2PTKA 1GCQA 3VRZA 4CC7A 2EYYA 2RN8A 2V1QA 2EO3A 4NWFA 2GTOA 2KT8A 2BZ8A 4HXJA 1FU5A 1VYUA 5EG3B 5GJHA 2BZYA 3THKA 2B86A 2EO6A 2ECDA 1O4GA 2EQIA 1OPLA 2LP5A 1O4HA 3PQZA 2J7IA 2GSBA 1SHGA 2KR3A 2XMFA 1S1NA 3VRQA 3TSZA 2A37A 1AYBA 3REAB 4RTXA 4J9DA 2FPEA 1SHDA 1M3CA 2JM8A 1SHAA 1BBZA 2FG0A 3PJPA 2RQTA 3NGPA 1I07A 3OB1B 1BB9A 2EBPA 5EELA 1H3HA 3BUNB 1FYNA 1J3TA 2GBQA 4J9HA 5CDWA 1LUNA 3CQTA 2F2VA 1O4EA 4GPLB 1NZVA 1MV3A 1TUCA 2LQNA 2LQWA 1ZLMA 1A08A 1QADA 3KFJA 1K9AA 2KNOA 1LUMA 3LH5A 1Y0MA 1YCSB 4DEYA 3EG2A 2DE0X 1MILA 2LCTA 3ZL7C 2DJQA 3BUOB 1GBQA 1R1SA 5L23A 5EHPA 1NLOC 1A1CA 5AULA 2KROA 3PSKA 1H92A 2M51A 2BTTA 1ARKA 1M27C 2NUZA 3TKZA 1BHHB 3I9QA 2JS0A 1K1ZA 4CC4B 1GCPA 3IN8A 1K0SA 4QSYA 2KXDA 2C0IA 1QCFA 4Z8AA 1AYDA 1O4NA 4HVWA 1NRVA 2AOBA 1YP5A 5EEQA 1UJYA 2DMOA 3EG1A 1O41A 2IUGA 2JXBA 2VIFA 2CR4A 1M8MA 2O88A 1O4PA 3S9KA 4FSSA 1LUKA 1PICA 1XA6A 1X2KA 2L6KA 1M61A 4OMNA 4GWFA 5IBMA 3T04A 1ZUYA 1FBVA 2RORA 2K79A 1QKWA 1ZX6A 1LUIA 2EL8A 3BUMB 5FW9A 2YDLA 1RQQC 4OHIA 2YUOA 2QMSA 2EYWA 4DGPA 2CRHA 1UHCA 4F59A 2D1XA 2AZSA 2YUNA 1G83A 1AOTF 3CD3A 1MW4A 1NEBA 1Z9ZA 3OV1A 2RSYA 1O4AA 2DM1A 2ROLA 1ABQA 2V1RA 2IZVA 3VS0A 5DC4A 5IH2A 1P13A 2J6KA 4DEXA 4OMQA 3PE0A 3N8MA 1M3AA 3M0PA 4JEGA 3IQLA 2J06A 3TVTA 1WQUA 2CI8A 3VRRA 1FYRA 2GTJA 4A4BA 4IIMA 3VRNA 2DL8A 3M0QA 1AOUF 3MXCA 2AOAA 3A98A 2HEQA 1GCQC 1WYXA 1BHHA 1O4CA 2EYZA 1AVZC 4K11A 2KRMA 2DL7A 1PRMC 1JQQA 2LX7A 1YNZA 2OAWA 4ROJA 2C0TA 5HCKA 3VS2A 1A1AA 1X6BA 5EC7A 2VKNA 2YSXA 2I0NA 2HCKA 1SHFA 2PZ1A 4JJCA 1OO3A 1BLJA 2L3SA 2FO0A 1AEYA 2F2WA 3JV3A 4GLMA 2DL4A 1JEGA 1T0HA 1IJRA 2E5KA 2L3PA 4A63B 2MK2A 1QLYA 4HVUA 1YWOA 1PRLC 4F17A 1OO4A 3UA6A 5D0JA 1I3ZA 4RTTA 1X0NA 2EGAA 4Y92A 1GHUA 2JMCA 1Z3KA 2CDTA 1SPKA 2HDAA 3I5SA 5BO4A 3S8NA 5HKZA 1K4US 2JS2A 2HUWA 1MUZA 2W10A 1H9OA 2GGRA 4Z88A 1AZEA 4J9FA 4RTZA 2RVFA 4U17A 1E6HA 2HDXA 1SSHA 2DL5A 1I0CA 1Y1UA 5I6VA 4D8DA 2HDVA 3N84A 5EHRA 2J6FA 3GBQA 2EU0A 3PSJA 1F2FA 2CI9A 2KNBB 1K0XA 5HKWA 1TG0A 3TSWA 3PLFB 1A09A 4WWQA 1OEBA 3UF4A 2CBLA 3M7FA 2EGCA 1GL5A 2X3XD 2LZ6B 4K45A 1AB2A 1BK2A 1IS0A 1O49A 1LKKA 1X6CA 2YU7A 2MRKA 3R6NA 1WDXA 2PLDA 1SHBA 2P4RA 2KXCA 2G6FX 1YVLA 3M0SA 4ZNXA 2ED1A 4CC3A 1LCKA 2A08A 4OMOA 1W6XA 2B3OA 3NHNA 1JYUA 2D8JA 1GRIA 2L3QA 3PFVA 2RPNA 2MC1A 3EG0A 3UYOA 3IN7A 1KIKA 2EYVA 1NYGA 1BKLA 3VS1A 5IHIA 1ABOA 1O45A 1CSKA 1K76A 1R1QA 2EW3A 2BBUA 1KJWA 2YT6A 1BKMA 4K2RA 4J9CA 2PNAA 2LNHB 2DVJA 2IIMA 3VRYA 2LCSA 1O4MA 2A28A 3GXWA 3K2MA 4AG1C 1TUDA 1WX6A 3QWYA 2DLZA 2IUHA 2OJ2A 2RQUA 1AWOA 1X43A 2RQRA 2CS0A 2H8HA 2FPFA 1WA7A 4RUGA 5FWBA 3EHRA 1SRLA 3KFVA 1QWEA 4IIOA 4JGHA 4A4CA 4ESRA 1OOTA 2QDLA 2DRMA 1IO6A 2NWMA 4J9EA 2JYQA 1ZBJA 1PKSA 1B47A 3GXXA 2AZVA 4DGXA 4AFSC 4J9BA 2XP1A 3NMZC 4TZIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5GAMj 2XKOC 3TL0A 2KGTA 3LGFA 4IUTA 1VQKA 1UDLA 1BKBA 1MHNA 4M75A 1JB0E 4M4ZA 4NOYA 3KUFA 5LL6S 1TS9A 2D0NA 2NLUA 3R6OA 2Y1NA 5IXFA 3Q1JA 2DL3A 4PJOA 4E68A 1HJDA 2PLEA 3A1PA 2RHZA 5KE3A 3E9GA 1M1KC 2KBTA 1VQKT 2K2MA 1QG1E 3HL8A 3HPWA 2YLCA 1CKAA 4XZ1A 1KHCA 2IPOB 1UEBA 4J9GA 4EMKC 3CCET 2HSPA 2EOBA 3CCRA 2D8HA 1AD5A 4K44A 1O48A 4MZPA 2YWWA 2RA2A 3CC4T 3GPLA 1RPYA 2EIFA 5IHNA 3X26B 4F16A 1YI2A 3CCLQ 5CVIA 2LJ1A 1NLPC 3IMJA 2QA4A 1AWXA 4L59A 4JE4A 5IN1A 3CCRT 4E7LA 4C0FA 3IMDA 4FYWB 1W70A 4IUQA 2DXCA 1NZLA 4XU2A 3RR6A 2QA4T 1I5LA 2KYMA 2L0AA 1WXUA 5C0MA 2E10A 3VUZA 1QKXA 2MIOA 3OY9A 4WTOB 1OI1A 2OTLT 2EGEA 3BKBA 3MXYA 1SPRA 3A8OB 1HCTB 4RKUE 2WSEE 3CPFA 5CAIA 2MF2A 1AT1B 4OMPA 2YHTA 5KH6A 3QZ5B 2JN0A 3C12A 2AT1B 5LJ5e 2RMOA 4XQ3A 4JJBA 1O4BA 4LE9A 5KAZA 3JSCA 3JRZA 5KCOA 5GANj 1JU5A 1BI1A 1KA7A 2PVDB 2K79B 1H641 3WVEB 5C6SA 3LH0A 4CI0C 2EVRA 1BG1A 2JTEA 4J7IA 1K73U 3I35A 2JW4A 2ECZA 4RG2A 2KVQG 1WJSA 4FYVB 5CCAA 4C5HA 4RTYA 1U06A 1FU6A 2ZZDA 4JS4A 5GAN8 3RKYA 4BB7A 1U1SA 2BKDN 1AYAA 1VYVA 1VQ4T 3VS3A 1GFDA 5GAOl 1GXIE 2JM9A 1G3YA 2KE9A 4LDWA 2W0ZA 5KYXB 3GQIB 1SPSA 2BZXA 4DQ2A 1Z9QA 3OYEA 3H8ZA 1UJ0A 4CC2A 1VQMT 4LDXA 3M4GA 2O9SA 2CP2A 3EH1A 4QVCA 1LKLA 2HQXA 1O43A 4FSXA 5AYFA 3M53A 1TOVA 3DLMA 3PIOA 2CT4A 3P8BB 2GFUA 1M1KU 2JTMA 5KCHA 4FW1A 2VUBA 5GJWB 5I22A 4JZ4A 4N0AA 2CH4W 3PTAA 2SHPA 2OI3A 1K73R 1X2QA 2LRAA 1G3WA 3NTHA 3BW1A 4OB2B 3C4SA 2COWA 4Z89A 2LJ0A 3QWXX 4BI4A 5LJ3e 3VS5A 4L5GA 3CXCP 1M1FA 1NZ9A 5HKYA 4EPCA 2HBWA 1PWTA 3EGUA 1RAGB 2CIAA 7AT1B 3HIZB 4TVRA 1Y7XA 1YVHA 1JRIA 1OQKA 1SEMA 1A07A 2EYXA 5LJ5f 1JYQA 1S72Q 2LNWA 2EJFA 4C5IA 3VJPA 1G5VA 3BUWB 4OB0B 3S8OA 1PKTA 2FHDA 4MDXA 4GY5A 4XU1A 3QG1A 3CCLT 1O4OA 2KT1A 5DM7R 1T0JA 4J9IA 4BDZA 1G8XA 1OULA 4EIHA 2KRNA 3SEMA 2ZPHB 5GAOn 1D4TA 1VOMA 5J39A 2F2XA 1SRMA 4OMLA 1NEGA 2ESWA 3UA7A 4F7UE 3CD6Q 1TSFA 5DC0B 5J3BA 5GAMd 1WLPB 4M78F 4L6V5 5CK9A 4CC7A 3OYYA 1VQNQ 2QTXA 2EO3A 2EKOA 2BZ8A 1FU5A 2B86A 1VQ5Q 3OMCA 3CCQA 5L8RE 3PQZA 2J7IA 3VRQA 3TSZA 1AYBA 4J9DA 2MAMA 1SHAA 2FYKA 3NGPA 3OB1B 1BB9A 2K5LA 3FLGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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