2LQWA

Solution structure of phosphorylated crkl
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
303
structure length
302
Chain Sequence
b'MSSARFDSSDRSAWYMGPVSRQEAQTRLQGQRHGMFLVRDSSTCPGDYVLSVSENSRVSHYIINSLPNRRFKIGDQEFDHLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPAPRYPSPPMGSVSAPNLPTAEDNLEYVRTLYDFPGNDAEDLPFKKGEILVIIEKPEEQWWSARNKDGRVGMIPVPYVEKLVRSSPHGKHGNRNSNSYGIPEPAHAAQPQTTTPLPAVSGSPGAAITPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Crk-like protein
publication title Domain organization differences explain Bcr-Abl's preference for CrkL over CrkII.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 41
structure length 302
sequence length 303
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
A PF07653 SH3_2 Variant SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA02
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA03
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2lqwA01
2HMHA 2DL5A 1O4DA 1X0NA 1FHSA 2L3QA 1MV0B 2CUBA 2KNOA 1QWEA 2GNCA 3H0HA 1UG1A 2RMXA 4JZ4A 1BBZA 1KSWA 1M8MA 1BMBA 2ETZA 2ESWA 3SEMA 1BHFA 2CI8A 2H5KA 2HDXA 2Y1NA 1WXBA 1SSHA 2K7AA 3VS2A 3M0PA 4ESRA 4TZIA 1NLPC 4JPBW 1UUEA 1QG1E 2IUIA 1QCFA 2FPEA 4LNPA 1H92A 5GJHA 1UUSA 1JU5A 4JE4A 1RLPC 1ZUYA 2EYWA 1AOJA 2KYMA 1GCPA 3H0FA 4ZNXA 1PKSA 1O4AA 2QDLA 4IIOA 1WYXA 3LH5A 1CWEA 2EL8A 1GBQA 4FL2A 2CH4A 3VRYA 2OI3A 3BUNB 1NG2A 1OPKA 1H8KA 1JYUA 3MAZA 2D8JA 1ARKA 1X6CA 2CH4W 4F5AA 2KT1A 1O49A 3RBBB 4RTYA 2FRYA 2O88A 5IXFA 2JS0A 5DC9A 1QKWA 2YUQA 1AWOA 1RQQC 1SRMA 1FBVA 3EG0A 1A08A 1AEYA 2EQIA 2HDVA 2LCTA 1U3OA 1BFIA 2KT8A 2LZ6B 1A1EA 1NZLA 2MCNA 2X3XD 4CC3A 4LUDA 1Y1UA 4DEYA 3M7FA 4JZ3A 1CKAA 1M3BA 2DL7A 2Y3AB 2JS2A 4FBNA 2YUPA 1O41A 1TUCA 1LUKA 1T3SA 1M27A 2HDAA 3ULRB 4J9HA 4U17A 4OHHA 5D0JA 3VS1A 1K1ZA 1UFFA 2W0ZA 1UECA 1R1QA 1G2BA 3VRRA 2D8HA 1E6GA 1AB2A 2PNIA 1CJ1A 1O4HA 1TZEE 1XA6A 2PTKA 1YVHA 2CT3A 2DYBA 2J6OA 1T0HA 2L3PA 5I11A 1JYQA 1O46A 1UURA 1X27A 1WXUA 2DRKA 1O4OA 2DVJA 2RF0A 3TSWA 3EHRA 2PLEA 5J3XA 1O43A 1K0XA 2F2VA 1E7OA 2PLDA 2FPFA 1LCJA 3TL0A 2RQRA 2H8HA 4EIHA 2L3TA 1WIEA 2FCIA 5DC4A 1BLJA 3R6NA 3VS5A 4JGHA 1BLKA 2K2MA 3JV3A 1HJDA 1O44A 2IUGA 2RN8A 5IHNA 2B86A 4J9FA 1WI7A 1E6HA 1AOUF 1O4QA 4GLMA 2LX7A 2VVKA 1O4EA 2DA9A 2BZXA 1YWPA 1FU5A 2L2PA 1EFNA 4OMLA 1O4JA 4ROJA 2EVRA 3EAZA 2KEAA 4RTTA 1GHUA 2A28A 2EGAA 3VS0A 2FO0A 3VRQA 1PKTA 2YT6A 4F59A 2RQUA 4GL9E 4Y92A 2K7AB 2O9SA 1LKLA 1SHGA 2KRSA 5DC0B 5HCKA 2F2XA 4E68A 4QT7A 1OEBA 3M0TA 1W1FA 1R1SA 4F17A 4AFUC 1SHBA 3EHQA 1Y57A 2KK6A 3CXLA 4QSYA 4J9GA 1SHFA 2O2OA 2O31A 3MXCA 1UTIA 1GFDA 2V1QA 2BBUA 4EIKA 2LJ1A 2FRWA 4A63B 2LNWA 1T0JA 4OHEA 1K0SA 4H1OA 3RNJA 1PRMC 2DNUA 2O9VA 2EO6A 2KRNA 3K2MA 3M0UA 3EG3A 1PHTA 5GJWB 3OP0A 2JM8A 2KGTA 2DL3A 4XZ0A 1AWXA 2LP5A 1WDXA 1F2FA 4RTZA 2G6FX 2I0NA 4OHDA 3VRNA 4F5BA 1FYNA 1VYUA 4K44A 2AK5A 4LN2A 2A36A 4DEXA 1JEGA 2J7IA 3S8OA 3BUXB 3PVQA 5EHPA 1AVZC 4J9IA 2DF6A 2KXDA 1WA7A 5EEQA 2SEMA 5IH2A 5IBSA 1LCKA 1O48A 2HSPA 1HCTB 1LUNA 2DBMA 2DJQA 2KE9A 4EY0A 2KR3A 2PNAA 1AOTF 2Y1MA 2MQIA 2DRMA 1O47A 4L1BB 1A81A 1U06A 1Z9ZA 1I1JA 2JMAA 2RORA 1QLYA 3VS7A 1MW4A 3N84A 2YSQA 1M61A 4NWFA 1UJYA 3IN8A 3PVLA 1AYAA 4FL3A 1O4BA 2KYBA 1FYRA 2L3SA 2AUGA 2MIOA 5FW9A 4Z8AA 4M4ZA 4E6RA 1ZLMA 1BU1A 2C0TA 1P13A 1BHHA 1PICA 3IQLA 1RLQC 1UJ0A 1W70A 4HCKA 2QMSA 1YWOA 2LJ0A 1VA7A 2OJ2A 2F2WA 2CREA 3GBQA 1JXOA 5KAZA 1W6XA 4F14A 1N5ZA 4JJDA 1H3HA 1JWOA 5EELA 1BB9A 3I9QA 2ROTA 3PFVA 3BUWB 2MOXA 3QWYA 4J9CA 4JJBA 1IS0A 4RTXA 1NYFA 1O4RA 2GTOA 1LKKA 3CD3A 5IBMA 3QWXX 5EHRA 1A09A 2AZSA 1ZUKA 1OO4A 3EG2A 4AFZC 1RJAA 3UATA 3ZNIA 1ZSGA 2VWFA 1KA7A 2GBQA 2VIFA 4OMPA 1BM2A 1RUWA 3C0CA 2C0OA 1AZGB 1CSKA 3S8LA 2NWMA 4ORZA 2CSQA 2JXBA 1G83A 3SHWA 2NUZA 2DL4A 1X43A 2LCSA 1BK2A 2CS0A 2KXCA 1CSYA 2LQNA 1A1BA 2KRMA 1IO6A 1WXTA 1Y0MA 2HBWA 3OVEA 1TG0A 1O4PA 4JEGA 1Z3KA 3U23A 1OOTA 1X2QA 2SRCA 4CC4B 3TKZA 3N8MA 1GRIA 2FG0A 4D8KA 3OV1A 1BG1A 3M0RA 4J9BA 2RVFA 2MRKA 1UHCA 5IHIA 1NEBA 2OZOA 1O4MA 1WQUA 1QKXA 2EGEA 2YU7A 2LNXA 1AZEA 2EYXA 1O45A 2LNHB 2IUHA 1ZUUA 3FJ5A 4JJCA 3REAB 4HVUA 5EG3B 5AXIA 2ROLA 1AYBA 4OHIA 1ZBJA 1NZVA 3BUOB 3UA6A 2DE0X 4AG1C 3PS5A 2J05A 3EGUA 2YUOA 3VS4A 1D1ZA 2EKHA 1YNZA 1RPYA 3EACA 1NLOC 1KC2A 3WA4A 4Z88A 1O4GA 4P9ZA 2K79A 2JMCA 2CUDA 1GCQC 5IXBA 2LJ3A 1O42A 1BHHB 5GJVB 1CSZA 2GSBA 1O4CA 3PSJA 1GFCA 4NWGA 2RNAA 1X69A 2ED0A 5HKYA 3NMZC 1I07A 4A4CA 4J9DA 1BF5A 4CC7A 3PLFB 2RQVA 1CWDL 1KFZA 4OHLA 3US4A 1I3ZA 4F16A 3NHNA 4AFSC 2ECDA 1A0NB 1O4NA 1QADA 1U5SA 5DF6A 2FEIA 3A98A 2D1XA 2GTJA 1GBRA 5IHKA 3BUMB 2KBTA 4DGXA 1YVLA 4WCIA 2EPDA 5HKWA 2JTEA 2EBPA 1NRVA 1UGVA 3PSKA 1K9AA 2KROA 2CIAA 3REBB 2CSIA 2EGCA 2IZVA 2RQWA 2DM1A 1A07A 3IMDA 3TVTA 4Z89A 3PE0A 2EYZA 3CBLA 1AD5A 4OMOA 1NYGA 1WLPB 1GCQA 4A4BA 1S1NA 1X2KA 2HEQA 2RMOA 4CC2A 2MK2A 4K11A 1I0CA 2DMOA 1K76A 2YSXA 2K9GA 3MXYA 3PQZA 3O5ZA 1KJWA 1FU6A 2D0NA 2H46E 1PNJA 1JXMA 2EYYA 4HVWA 3H0IA 4J9EA 2MC1A 2DL8A 1RI9A 1M27C 2DILA 1OO3A 3HIZB 1MV3A 2DLPA 3N7YA 5FWBA 3EG1A 4OMNA 4R0KA 1AWWA 2V1RA 2AKKA 2LQWA 2PZ1A 4E93A 1FBZA 2JM9A 3TSZA 1WFWA 2AKLA 3M0SA 2FPDA 4RTWA 2LMJA 3IN7A 2EKXA 3S9KA 3VS6A 1JO8A 4LUEA 3VRZA 2OAWA 1D4WA 1TCEA 3CWGA 4HXJA 2ED1A 3T04A 2ECZA 4AG2C 2A37A 1HSQA 1M3AA 3I5SA 4RTVA 4FSSA 1J3TA 2VKNA 1F1WA 1VYTA 2HUWA 4X1VA 4WWQA 3GXXA 3UF4A 1R1PA 1SEMA 2DX0A 4P9VA 2OQ1A 2JYQA 2DBKA 1UDLA 2EW3A 4K2RA 3NGPA 2C0IA 1ZFPE 3UYOA 2CI9A 3CQTA 1CKBA 3IMJA 5BO4A 2K79B 3OB1B 2L0AA 5ECAA 1B07A 4LE9A 1KIKA 2L6KA 1SHAA 2RPNA 4OMQA 1M3CA 1T3LA 2JT4A 2B3OA 2RQTA 4U1PA 5HKZA 5L23A 1WX6A 1M30A 1MILA 2AOBA 3I5RA 3VGOA 1BKMA 2CRHA 2M51A 1AYCA 2CDTA 1XOVA 1X6BA 2DLYA 2SHPA 3S8NA 1VYVA 2CT4A 1ZX6A 2EU0A 2YUNA 1OPLA 2J06A 3I35A 2X3WD 2GE9A 1Z9QA 4HVVA 4IIMA 5FWCA 3C7IA 1A1CA 1BKLA 5EC7A 2J6FA 2K6DA 3H41A 1UHFA 1ABOA 1LUIA 1IJRA 2DLZA 4GWFA 2W10A 4H34A 1V1CA 2C9WA 2A08A 3GXWA 2XMFA 1SKJA 1AWJA 1SPSA 4OMMA 1LUMA 2GGRA 2L4KA 5AULA 2DX1A 1YP5A 2BTTA 1BFJA 2AOAA 2EOBA 2YDLA 2EYVA 4AFQC 1YCSB 1X6GA 4D8DA 1B47A 2P4RA 1K4US 1HD3A 5GJIA 1ABQA 2MRJA 2PNBA 2K3BA 1PWTA 2GQIA 3ZL7C 2CBLA 3OB2B 4X6SA 1HCSB 1AYDA 2RSYA 2J6KA 1JYRA 2BZYA 2KNBB 1KA6A 2BZ8A 4GPLB 1SRLA 3THKA 3UA7A 1JQQA 5I6VA 1O4IA 4XZ1A 1B3QA 1JU5C 2ABLA 3PJPA 2CR4A 5I22A 1O4KA 2HCKA 4GBQA 4RUGA 4RTUA 1GL5A 3M0QA 2JW4A 5CDWA 1QWFA 3VS3A 3HHMB 3BKBA 3KFJA 2DM0A 1YN8A 1O4LA 4KRTA 2E5KA 1NM7A 2M0YA 1SPRA 2EO3A 3HCKA 3KFVA 2ENMA 1SPKA 1A1AA 1OV3A 1D4TA 1SHDA 4K45A 3NPFA 1O4FA 4DGPA 2XP1A 1MUZA 1TUDA 1H9OA 2DCRA 2AZVA 3GQIB 3VRPA 1NEGA 1FMKA 1PRLC 2IIMA 3VROA 1UE9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FLXE 4JS4A 3BDUA 3CC7T 4OB2B 1RL2A 2RK1A 3H0HA 1UG1A 1KSWA 4J8OA 2E6NA 3SEMA 2H5KA 2GF7A 2Y1NA 4XU2A 4M75E 2ZPGB 4XTWA 3M53A 1WHMA 3CCET 1IXDA 4TZIA 1UUEA 2ZPBB 2H3JA 2DXCA 5GJHA 1D1CA 3QDRB 1H92A 1RLPC 1ZUYA 1R77A 2QI2A 1WYXA 4NS5A 1VQPA 3X28B 1RAAB 1H8KA 3MAZA 1SKUB 1RAIB 1EX4A 1MMGA 1ARKA 1G3WA 4RTYA 4F7UA 3CMAQ 2HMAA 4PFPA 2RJFA 2DTHA 2LVMA 1WJQA 3K2TA 4EDUA 2EQIA 2LCTA 1U3OA 1BFIA 2KT8A 2LZ6B 2K5FA 1NZLA 7AT1B 2DAQA 1KQSS 4CC3A 3OB9A 1QCOA 1NPPA 1YHQA 3CD6Q 1O41A 1TUCA 1LUKA 1T3SA 3KBGA 5D0JA 4OHHA 1C6VX 1UFFA 3C4SA 3JCMd 2VYTA 2YRDA 1YJWT 3CCRQ 4M77B 1CJ1A 2HZYA 1ZA2B 1QVGA 2CT3A 3TQ7P 1T0HA 1O46A 2BIVA 1UURA 4M7DD 4C8QE 5GANg 1O4OA 3PGGA 4O6JA 4R56A 3CMEA 5J3XA 5A2QE 2F2VA 2PLDA 5CKDA 1G3YA 3CC4A 2JUFA 1BLJA 2RI3A 2Y4XA 1BLKA 2K2MA 1M1KR 1VQOA 2B86A 4UC4A 1QVGS 2WSCE 3E1SA 4PJOD 2QQRA 1WI7A 1R0CB 2GQVA 1KC8C 3JCMV 2VVKA 3SD4A 1O4EA 1EFNA 4OMLA 4C8QC 4RMOA 2KEAA 4RTTA 1VQ5T 3WVDB 2FO0A 3VRQA 4F59A 1QVFP 2K7AB 1SHGA 2F2XA 4C0ZA 4QT7A 4IUVA 4KUIA 1R1SA 4F17A 4AFUC 4L5GA 1RAFB 5DLQE 4Y91A 2OTLA 1YIJQ 2BE9B 2O2OA 3MXCA 3M4YA 3GOXA 4O5VA 4EIKA 3CCQA 2OTJQ 2FRWA 1Q86U 4H1OA 4C92A 2KRNA 1Q7YC 5GJWB 2KGTA 2KAFA 1F2FA 1WDXA 2CZ7B 2DJZA 2G6FX 4N4HA 1Y96B 3QDFA 2A36A 3S8OA 3A8MB 2DF6A 4OMFB 3G71A 1WA7A 1VQ7T 1G5VA 4WF2A 3L2ZA 5IBSA 5AYFA 5GAN7 4PJLA 1AOTF 2MQIA 4LDYA 1A81A 1U06A 1Z9ZA 3CBMA 3CCVA 1K9MU 5KYXA 1QLYA 4XAXB 4DBQA 4Q5WA 1UJYA 3IN8A 3G4ST 1FYRA 3GNFB 1BU1A 1M1GA 2CZ1B 4EMHA 5FU7C 2QMSA 2RJCA 3MEAA 3PT9A 2DD4A 5HK3A 2KQWA 3RMSA 3S3OA 1H3HA 1JWOA 1OZ3A 2DK3A 2ROTA 4PFZA 5GAMj 2MOXA 1YBYA 1WHHA 2E4HA 3C12A 3OYMA 5LJ3h 1S72A 5GMKi 1W2BA 1ZSGA 2VWFA 4PJOG 1KA7A 2GBQA 1BM2A 1VQMQ 1RUWA 3C0CA 3TREA 1LPLA 1AZGB 3QUIA 2JXBA 2LT4A 4M77F 4BDZA 2DL4A 1KQ1A 1YJNA 4ZTJA 2LQNA 2E3HA 1Y0MA 2HBWA 3G6EA 2RH2A 1KD1U 4JEGA 1W2BS 2O4XB 1X2QA 4ELYC 4PKCC 1NZ9A 3OMCA 4D8KA 3OV1A 3HP9A 5IHIA 1NEBA 3OYCA 2DEQA 4C8QB 2OZOA 2V8JA 1ZUUA 2QA4T 3REAB 1B34A 1LNXA 1N9RA 1VQKQ 5AXIA 2ROLA 2QQBA 4EMGA 4QVDA 1AYBA 1ZBJA 3DB4A 4XU3A 4LDXA 3BUOB 2DE0X 1BI0A 3BW1A 4XTZA 3OS2A 3VS4A 5CKFA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4AG2 C;  2A37 A;  1HSQ A;  1M3A A;  3I5S A;  4RTV A;  4FSS A;  1J3T A;  2VKN A;  1F1W A;  1VYT A;  2HUW A;  4X1V A;  4WWQ A;  3GXX A;  3UF4 A;  1R1P A;  1SEM A;  2DX0 A;  4P9V A;  2OQ1 A;  2JYQ A;  2DBK A;  1UDL A;  2EW3 A;  4K2R A;  3NGP A;  2C0I A;  1ZFP E;  3UYO A;  2CI9 A;  3CQT A;  1CKB A;  3IMJ A;  5BO4 A;  2K79 B;  3OB1 B;  2L0A A;  5ECA A;  1B07 A;  4LE9 A;  1KIK A;  2L6K A;  1SHA A;  2RPN A;  4OMQ A;  1M3C A;  1T3L A;  2JT4 A;  2B3O A;  2RQT A;  4U1P A;  5HKZ A;  5L23 A;  1WX6 A;  1M30 A;  1MIL A;  2AOB A;  3I5R A;  3VGO A;  1BKM A;  2CRH A;  2M51 A;  1AYC A;  2CDT A;  1XOV A;  1X6B A;  2DLY A;  2SHP A;  3S8N A;  1VYV A;  2CT4 A;  1ZX6 A;  2EU0 A;  2YUN A;  1OPL A;  2J06 A;  3I35 A;  2X3W D;  2GE9 A;  1Z9Q A;  4HVV A;  4IIM A;  5FWC A;  3C7I A;  1A1C A;  1BKL A;  5EC7 A;  2J6F A;  2K6D A;  3H41 A;  1UHF A;  1ABO A;  1LUI A;  1IJR A;  2DLZ A;  4GWF A;  2W10 A;  4H34 A;  1V1C A;  2C9W A;  2A08 A;  3GXW A;  2XMF A;  1SKJ A;  1AWJ A;  1SPS A;  4OMM A;  1LUM A;  2GGR A;  2L4K A;  5AUL A;  2DX1 A;  1YP5 A;  2BTT A;  1BFJ A;  2AOA A;  2EOB A;  2YDL A;  2EYV A;  4AFQ C;  1YCS B;  1X6G A;  4D8D A;  1B47 A;  2P4R A;  1K4U S;  1HD3 A;  5GJI A;  1ABQ A;  2MRJ A;  2PNB A;  2K3B A;  1PWT A;  2GQI A;  3ZL7 C;  2CBL A;  3OB2 B;  4X6S A;  1HCS B;  1AYD A;  2RSY A;  2J6K A;  1JYR A;  2BZY A;  2KNB B;  1KA6 A;  2BZ8 A;  4GPL B;  1SRL A;  3THK A;  3UA7 A;  1JQQ A;  5I6V A;  1O4I A;  4XZ1 A;  1B3Q A;  1JU5 C;  2ABL A;  3PJP A;  2CR4 A;  5I22 A;  1O4K A;  2HCK A;  4GBQ A;  4RUG A;  4RTU A;  1GL5 A;  3M0Q A;  2JW4 A;  5CDW A;  1QWF A;  3VS3 A;  3HHM B;  3BKB A;  3KFJ A;  2DM0 A;  1YN8 A;  1O4L A;  4KRT A;  2E5K A;  1NM7 A;  2M0Y A;  1SPR A;  2EO3 A;  3HCK A;  3KFV A;  2ENM A;  1SPK A;  1A1A A;  1OV3 A;  1D4T A;  1SHD A;  4K45 A;  3NPF A;  1O4F A;  4DGP A;  2XP1 A;  1MUZ A;  1TUD A;  1H9O A;  2DCR A;  2AZV A;  3GQI B;  3VRP A;  1NEG A;  1FMK A;  1PRL C;  2IIM A;  3VRO A;  1UE9 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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