2LQWA

Solution structure of phosphorylated crkl
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
303
structure length
302
Chain Sequence
MSSARFDSSDRSAWYMGPVSRQEAQTRLQGQRHGMFLVRDSSTCPGDYVLSVSENSRVSHYIINSLPNRRFKIGDQEFDHLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPAPRYPSPPMGSVSAPNLPTAEDNLEYVRTLYDFPGNDAEDLPFKKGEILVIIEKPEEQWWSARNKDGRVGMIPVPYVEKLVRSSPHGKHGNRNSNSYGIPEPAHAAQPQTTTPLPAVSGSPGAAITPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Crk-like protein
publication title Domain organization differences explain Bcr-Abl's preference for CrkL over CrkII.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 41
structure length 302
sequence length 303
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
A PF07653 SH3_2 Variant SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA02
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA03
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2lqwA01
1O4MA 1SPKA 1NYGA 1U5SA 4AFZC 1AEYA 3PFVA 1K76A 3VS6A 4DGXA 2JMCA 4DEXA 4F59A 4OMLA 1O4EA 1AWOA 1TUCA 1CKBA 2K3BA 3QWXX 3VS4A 1FBZA 2FPEA 1LUNA 3GXXA 3S8OA 5IH2A 2K7AA 2FG0A 3CQTA 3VRZA 2OAWA 3QWYA 1T0HA 2HDXA 3ZNIA 3C0CA 2MRKA 5DF6A 1K1ZA 1SEMA 2GNCA 2L2PA 4RUGA 5I11A 1AOTF 1HJDA 1NRVA 1VYTA 1WX6A 2ABLA 5IXBA 1RPYA 1PRLC 4HXJA 3T04A 3I5RA 1M61A 3PLFB 2AK5A 1WI7A 2CH4A 2JXBA 2LQWA 2J7IA 2J06A 4AG2C 2BTTA 2JS2A 4XZ1A 1NG2A 5J3XA 2EGEA 4J9EA 4ESRA 1LUIA 1OO4A 1PICA 2ROTA 1U06A 4JJDA 1YWOA 1GCPA 2KGTA 4RTVA 1F2FA 2LNHB 4HCKA 4OHIA 3A98A 2GBQA 2HBWA 3U23A 1O48A 1T0JA 1MV3A 1JYUA 1KC2A 2RQRA 2O31A 1GFDA 2KK6A 4EY0A 4IIMA 2JT4A 2EW3A 2B3OA 4OHDA 1SHAA 2DCRA 1I0CA 2RQVA 3EACA 1BU1A 3PSJA 2C0IA 2M51A 1SHBA 4P9ZA 3N8MA 1FHSA 1M3BA 1O45A 3HHMB 3ZL7C 1RQQC 1BFJA 5EEQA 3CWGA 2YU7A 3IMJA 4IIOA 1QKWA 5GJIA 3RBBB 2H5KA 3TSZA 4H34A 5L23A 1O4NA 3OB2B 2IZVA 1QWEA 1O47A 1BFIA 4D8DA 1CSZA 1X6BA 2LJ3A 1WA7A 5IHNA 2L3TA 4JGHA 1CSKA 4ORZA 4GPLB 1ARKA 3M7FA 4E93A 1A1CA 2EKHA 2SRCA 2KNBB 4Z88A 4F17A 2D0NA 1S1NA 1KA6A 3FJ5A 2C0OA 2K79B 5HKWA 2NWMA 4J9FA 4CC4B 1B3QA 3R6NA 2L3PA 1ZUKA 1O4LA 1O4FA 1FU6A 1AWJA 2YT6A 1BM2A 3VRNA 2B86A 4AFUC 3M0SA 2A36A 3M0TA 3SHWA 4Z89A 1H3HA 2PLDA 1JYQA 2H8HA 1GRIA 2EYWA 2AZSA 2O9VA 1QWFA 2W10A 3M0RA 1AYCA 3I35A 2EYXA 3RNJA 2IUGA 3REAB 2EO6A 2O88A 1JO8A 2JS0A 2KBTA 1WYXA 1E6GA 2KT1A 2Y1MA 2XMFA 1NM7A 2MIOA 4OHHA 2PNBA 3PQZA 3S8LA 2V1RA 4K44A 3S8NA 1RI9A 2DMOA 2F2WA 2L3SA 4LUDA 2LMJA 1A1BA 1T3LA 4AG1C 2ECDA 1FU5A 4KRTA 1H92A 1E6HA 1JYRA 3EG2A 4J9CA 1AZEA 1SSHA 1PNJA 1JWOA 4A63B 2PZ1A 2KXCA 3TVTA 2CIAA 4AFSC 1KJWA 1W6XA 1KA7A 1AWWA 3MAZA 1PRMC 2J6KA 5I6VA 2P4RA 1WIEA 1A81A 4LUEA 4LNPA 2PTKA 1R1QA 1A08A 4H1OA 1BBZA 2L4KA 3OVEA 4NWFA 3US4A 2HCKA 2KNOA 1ZLMA 2YSXA 1UECA 4F5BA 4L1BB 2DLZA 2ETZA 3UYOA 1GBRA 4P9VA 3VS1A 2CT3A 2AOAA 2FCIA 2Y1NA 2LCSA 3VS0A 2CI8A 4ROJA 1YVHA 1LCJA 4JPBW 1BG1A 4WWQA 1O49A 4D8KA 1D4TA 1OPKA 2HDVA 4OHEA 2KXDA 3IN7A 1SRMA 2FEIA 1E7OA 1LUKA 1OPLA 1TZEE 2CRHA 1KFZA 3N7YA 3H0HA 5EHRA 2DL7A 2LJ0A 1O46A 2I0NA 2JTEA 3THKA 1I3ZA 1O42A 1X27A 2DNUA 1K0SA 1CSYA 2EPDA 2LJ1A 3SEMA 1M3CA 3PVLA 2EVRA 3PVQA 1M30A 1X43A 1O43A 1BLJA 3TSWA 2BZYA 2DE0X 2ECZA 3UA7A 1AYDA 5D0JA 2DLYA 2RQWA 2X3XD 2GTOA 4HVWA 3M0QA 2IUHA 5KAZA 3UF4A 2AKKA 2GQIA 2KT8A 2CBLA 1JEGA 5HCKA 4FL2A 1A09A 4J9HA 1G83A 4RTWA 1TUDA 1G2BA 2L3QA 4OMPA 2NUZA 4J9IA 1LUMA 2EOBA 1LKKA 2GGRA 2D1XA 2EO3A 1NEBA 2DA9A 1AYBA 4U1PA 3BUNB 2HDAA 2KYMA 3KFVA 2MRJA 2RPNA 1AWXA 1QADA 4GL9E 2F2VA 2OI3A 3EG3A 5GJVB 2J6OA 1RLQC 2AKLA 2LNXA 3VS5A 1OV3A 2GE9A 3GQIB 4HVUA 4J9BA 5HKZA 3H0FA 2DBKA 4DEYA 1JXMA 4A4CA 3M0UA 2YUOA 2DL8A 1XA6A 2OQ1A 1GFCA 3OP0A 2Y3AB 1QCFA 3IQLA 2DX0A 3OV1A 1TCEA 1NLPC 1BKMA 1X6CA 2CH4W 2YUNA 1LKLA 1UTIA 4ZNXA 1MV0B 2AZVA 1K0XA 1O4QA 1UHCA 3PJPA 1HCTB 3BUMB 4K2RA 2YUPA 1JU5C 2RMXA 1NEGA 2LX7A 3NMZC 4JJCA 1BHHA 3CD3A 1LCKA 2LZ6B 2IUIA 1K4US 1I1JA 4Z8AA 1GBQA 1NLOC 3VS2A 1RUWA 2DJQA 4R0KA 1YNZA 3EG1A 2RQUA 4JZ4A 1FYRA 1O4HA 1H9OA 4X6SA 2G6FX 2RMOA 4NWGA 2ED1A 1ZFPE 1WXUA 2YSQA 4RTYA 1YVLA 2VIFA 1OO3A 1X2KA 3MXYA 4JE4A 1EFNA 2KE9A 1W70A 1YN8A 5GJWB 5I22A 3VS3A 2HUWA 3BUOB 2EU0A 2MOXA 5CDWA 1FBVA 1ZSGA 2L6KA 2EYVA 1NZLA 1PKTA 1BLKA 1Z9ZA 5GJHA 1UJ0A 1BK2A 1O4IA 1QKXA 1KIKA 3C7IA 1SPRA 1Y0MA 1O4BA 2AOBA 2OZOA 1T3SA 1M3AA 2YUQA 4GBQA 2H46E 2DBMA 2PNIA 3EGUA 1O4PA 2D8HA 1WLPB 2JM8A 1ZBJA 4CC7A 2DL4A 1A1EA 1O4DA 4EIHA 2K7AB 4J9GA 3IN8A 2A28A 1IJRA 1GL5A 4HVVA 1CKAA 1QLYA 2ROLA 1IS0A 1R1PA 2QMSA 2RVFA 4K11A 2ED0A 4E6RA 1O44A 2BBUA 1UFFA 1BHFA 5HKYA 2BZXA 4J9DA 2EQIA 1OOTA 2GSBA 5EHPA 5FW9A 4F14A 4DGPA 2KEAA 2KYBA 1B07A 2RN8A 2YDLA 3GBQA 3O5ZA 3JV3A 2EKXA 5IBMA 2FO0A 4OHLA 1UDLA 1BKLA 1O4RA 1UHFA 1F1WA 2GTJA 3M0PA 1A1AA 1BB9A 4XZ0A 5AULA 1B47A 5IHKA 3VRYA 3HCKA 3S9KA 3ULRB 4WCIA 4LN2A 1Z3KA 5IXFA 2IIMA 1NZVA 2ENMA 1TG0A 2X3WD 1FMKA 2KRNA 3OB1B 2BZ8A 1WDXA 3PSKA 4CC3A 1GHUA 5BO4A 1O4CA 2M0YA 2JYQA 1CJ1A 3MXCA 1RLPC 3VGOA 2MCNA 1XOVA 1CWDL 1V1CA 3K2MA 3BUWB 4U17A 1X6GA 5IHIA 1BF5A 1NYFA 1O4AA 3VRPA 1AZGB 1UG1A 4FBNA 2CS0A 2CI9A 2RNAA 4EIKA 2PNAA 2RF0A 4QT7A 1KSWA 1PHTA 2KROA 2DL3A 3BUXB 2SHPA 2FRWA 2JM9A 1K9AA 4RTTA 1RJAA 3EAZA 1PKSA 1UJYA 1A0NB 1BHHB 3N84A 3PS5A 2DRKA 2DYBA 1W1FA 2J05A 1M8MA 1UUEA 1HCSB 4K45A 1SPSA 1ABOA 3I5SA 4AFQC 4OMOA 2AUGA 2DRMA 3VRRA 1ZUUA 3CXLA 1YCSB 5IBSA 4FSSA 1A07A 3NPFA 1ZUYA 5EC7A 2CSQA 1Z9QA 1FYNA 1GCQA 2ESWA 1MILA 2DX1A 3KFJA 4OMNA 2EYYA 1M27A 4OMQA 2MC1A 2RORA 2C0TA 1O41A 1R1SA 4OMMA 2CUBA 2DVJA 2EGCA 2FPFA 1WFWA 4F16A 2J6FA 3IMDA 4Y92A 1CWEA 2W0ZA 1O4GA 1AOUF 4TZIA 5DC9A 4FL3A 1AVZC 2O2OA 2K2MA 1SHGA 1IO6A 2D8JA 2VKNA 3NHNA 1UURA 2HEQA 5DC0B 2QDLA 1WQUA 2LP5A 3H0IA 1U3OA 3PE0A 2EL8A 3BKBA 1SRLA 3H41A 1ABQA 4LE9A 3I9QA 1O4JA 4GWFA 3VS7A 1AOJA 2DM1A 4JJBA 2XP1A 3UA6A 1UUSA 2F2XA 2HSPA 1P13A 1X2QA 4RTXA 1OEBA 4GLMA 5ECAA 2DILA 1MW4A 1WXBA 1I07A 1N5ZA 1Y57A 2K9GA 4X1VA 2DL5A 2JW4A 1AB2A 2OJ2A 2FRYA 1Y1UA 2DLPA 2DF6A 2L0AA 3TKZA 4JEGA 1WXTA 3EHQA 3EG0A 5EELA 2LQNA 2MK2A 3REBB 2DM0A 3WA4A 4E68A 1O4OA 5FWBA 4RTUA 1YWPA 1QG1E 5FWCA 4CC2A 1HD3A 2K79A 2O9SA 3EHRA 1MUZA 2MQIA 2CSIA 2CUDA 2HMHA 2LCTA 2CT4A 3UATA 1VYVA 2VVKA 4RTZA 2RQTA 1UE9A 3LH5A 1J3TA 5DC4A 2C9WA 4A4BA 2KR3A 2E5KA 2VWFA 1BMBA 2FPDA 1SHFA 3HIZB 1VA7A 5AXIA 5EG3B 2A08A 4JZ3A 3GXWA 1ZX6A 2JMAA 2K6DA 2EBPA 4M4ZA 1GCQC 1YP5A 3CBLA 3VRQA 1SHDA 1X69A 1M27C 4F5AA 2CREA 1H8KA 1HSQA 1X0NA 1VYUA 1O4KA 2V1QA 2LNWA 2RSYA 3NGPA 1SKJA 1JQQA 2CDTA 2KRMA 2EGAA 2EYZA 2CR4A 3TL0A 1PWTA 1AD5A 1D1ZA 1JXOA 2A37A 2SEMA 3VROA 2PLEA 4QSYA 1UGVA 1JU5A 1D4WA 1AYAA 2KRSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DVEA 1SPKA 1TUGB 3J80E 1K76A 2X51A 1AWOA 3MEVA 5IH2A 3QSUA 4LDUA 2A0FB 3UT1A 4IUQA 3C0CA 2GNCA 5LJ5j 3A8OB 1I5LA 1NRVA 1Q7YU 3I5RA 2WACA 3SB2A 2J7IA 1N8RU 1NBEB 3HRTA 4XZ1A 2H3JA 1LUIA 2ROTA 1U06A 3OYBA 1YWOA 2LCCA 2BUDA 1F2FA 3MP6A 4C0ZA 3U23A 1VQLQ 2DFUA 3CD6T 1KC2A 2RQRA 2O31A 2EW3A 3PIPA 3EG9A 3EACA 2HNIA 3BFMA 2M51A 3N8MA 1FHSA 1O45A 1BFJA 1WQWA 4M77E 3CWGA 3IMJA 2OTLA 2X9HA 2IZVA 1M1KU 4D8DA 1BKBA 1X6BA 4LXCA 2FYKA 2NUTB 1VIEA 4C92C 4NL2A 1A1CA 4Z88A 1WHKA 4JRQA 2O4XA 2D0NA 2DAQA 2VGNA 2CYZB 2DTIA 3FJ5A 4KT0E 2Y4YA 3K2TA 3QZ5B 3OQ5A 4A4GA 3INZA 5LJ3e 3MEAA 2L3PA 3RESA 2CGHA 3VRNA 2B86A 4AFUC 2HL5C 4BUGA 3SHWA 2K3XA 1RAHB 3HKSA 2R5MA 5LJ5g 2ZGWA 5KYWA 2O88A 3GPLA 1WYXA 3HP9A 2KT1A 4EMKA 4C92B 5HKCA 1JJ2A 3S8LA 5LJ5h 2MMPA 2V8IA 4M78C 4A4FA 2HQEA 2CKKA 2F1LA 1JWOA 3CCEA 2KXCA 3TVTA 1KJWA 1OX9A 3EGXA 1WIEA 3QHSA 4H1OA 1G3WA 2Y90A 2L4KA 3TCJA 4O5VA 1ZLMA 4LDWA 2DLZA 2ETZA 4FT2A 5CKEA 3CCJQ 2CT3A 2LRQA 2AOAA 2Y1NA 4HCCA 4ROJA 4M7AG 4X9CA 2CZ6B 3KUFA 1VQ9T 1Y96A 2EJGA 1D4TA 1OPKA 2HDVA 2HSEB 4M78B 1SRMA 1TZEE 4KGZB 3OY9A 1BI0A 5CKDA 1O46A 3G7ZA 2DNUA 4NS5A 3M4YA 3CMET 2EVRA 3PVQA 5IT9E 1Q81U 2DTHA 4OP0A 1O43A 2DE0X 2XK0A 4QKUA 1AYDA 5FLXE 3CCRQ 3QZ9B 4HVWA 3CCLA 3M0QA 5KAZA 2DD5A 3UF4A 1IHVA 2AKKA 4BACA 2BE7D 1OX8A 1JEGA 1IGQA 1QCNA 1VQNA 2HAXA 4PKCC 1G2BA 1VOMA 2L3QA 2DXUA 3M4GA 4OMPA 2EQMA 3M56A 4J9IA 3C12A 3JCMg 2D1XA 2COWA 4XTVA 2DA9A 1AYBA 4U1PA 3BUNB 2KYMA 2DPPB 3KFVA 2MRJA 2RA2A 1M9SA 2OI3A 5GJVB 1KHCA 3OYHA 3JCMh 3VS5A 3RMSA 4J9BA 4M75A 5HKZA 1JXMA 2YUOA 1KD1C 1GFCA 2DZCA 3OP0A 1VQ8A 2XDDA 3JCMf 3LYIA 2QA4A 3JCMd 1N6AA 1LKLA 1UTIA 4OB0B 1VQ5T 1K0XA 3PJPA 1YHQT 3L2ZA 3VUBA 4QW2A 1ZQ1A 1JU5C 3WXMB 1NEGA 3G1JA 4ANJA 2CZ0B 4QVZA 2LZ6B 2IUIA 4N0AA 3OS2A 1NLOC 5GAN2 5AT1B 1MMDA 1RUWA 3VKIA 3LW5E 2E70A 3G4SA 5EG2A 2G6FX 4Y91A 4ZGJB 1RL2A 4NWGA 4PNOA 4RTYA 1BCMA 3I55T 3OW2S 4LD6A 1X2KA 1G3YA 4M7DA 3VYGA 1EFNA 2KE9A 1WQ7A 5GJWB 4LD9K 3BUOB 1FBVA 2EYVA 1BLKA 2NUTA 1BK2A 2CP5A 3C7IA 2H3EB 1T3SA 2QEXT 1M3AA 2YUQA 1YITA 4B9WA 2JM8A 3CCRA 3NFCA 2K7AB 1X01A 4J9GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1O4M A;  1SPK A;  1NYG A;  1U5S A;  4AFZ C;  1AEY A;  3PFV A;  1K76 A;  3VS6 A;  4DGX A;  2JMC A;  4DEX A;  4F59 A;  4OML A;  1O4E A;  1AWO A;  1TUC A;  1CKB A;  2K3B A;  3QWX X;  3VS4 A;  1FBZ A;  2FPE A;  1LUN A;  3GXX A;  3S8O A;  5IH2 A;  2K7A A;  2FG0 A;  3CQT A;  3VRZ A;  2OAW A;  3QWY A;  1T0H A;  2HDX A;  3ZNI A;  3C0C A;  2MRK A;  5DF6 A;  1K1Z A;  1SEM A;  2GNC A;  2L2P A;  4RUG A;  5I11 A;  1AOT F;  1HJD A;  1NRV A;  1VYT A;  1WX6 A;  2ABL A;  5IXB A;  1RPY A;  1PRL C;  4HXJ A;  3T04 A;  3I5R A;  1M61 A;  3PLF B;  2AK5 A;  1WI7 A;  2CH4 A;  2JXB A;  2LQW A;  2J7I A;  2J06 A;  4AG2 C;  2BTT A;  2JS2 A;  4XZ1 A;  1NG2 A;  5J3X A;  2EGE A;  4J9E A;  4ESR A;  1LUI A;  1OO4 A;  1PIC A;  2ROT A;  1U06 A;  4JJD A;  1YWO A;  1GCP A;  2KGT A;  4RTV A;  1F2F A;  2LNH B;  4HCK A;  4OHI A;  3A98 A;  2GBQ A;  2HBW A;  3U23 A;  1O48 A;  1T0J A;  1MV3 A;  1JYU A;  1KC2 A;  2RQR A;  2O31 A;  1GFD A;  2KK6 A;  4EY0 A;  4IIM A;  2JT4 A;  2EW3 A;  2B3O A;  4OHD A;  1SHA A;  2DCR A;  1I0C A;  2RQV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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