2LQWA

Solution structure of phosphorylated crkl
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
303
structure length
302
Chain Sequence
MSSARFDSSDRSAWYMGPVSRQEAQTRLQGQRHGMFLVRDSSTCPGDYVLSVSENSRVSHYIINSLPNRRFKIGDQEFDHLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPAPRYPSPPMGSVSAPNLPTAEDNLEYVRTLYDFPGNDAEDLPFKKGEILVIIEKPEEQWWSARNKDGRVGMIPVPYVEKLVRSSPHGKHGNRNSNSYGIPEPAHAAQPQTTTPLPAVSGSPGAAITPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Crk-like protein
publication title Domain organization differences explain Bcr-Abl's preference for CrkL over CrkII.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 302
sequence length 303
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
A PF07653 SH3_2 Variant SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA02
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA03
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2lqwA01
1BK2A 3O5ZA 2KGTA 1BKMA 1UTIA 1F2FA 2O9SA 1YN8A 2X3XD 5IBMA 2JTEA 2YUPA 2E5KA 3NGPA 1BLJA 1JXMA 3KFJA 2MQIA 1E6GA 3K2MA 2GE9A 3SHWA 1GBRA 1O4AA 1TG0A 1P13A 1TCEA 2K79B 4QSYA 1KSWA 3GQIB 2L6KA 1OO3A 4U17A 1AYAA 4K44A 2C0OA 1E6HA 1U06A 5EEQA 2FPFA 2D8HA 4AG2C 5BO4A 1PKSA 2GGRA 1M27C 2O9VA 4RUGA 3N8MA 3T04A 4F5BA 3VS6A 2L3PA 2ROTA 1AEYA 3M0PA 3EAZA 5IXBA 1HCSB 2J6OA 1AOTF 2NWMA 5FWCA 1I3ZA 1LUKA 4LUDA 1X6BA 1O48A 3PE0A 2YSXA 1GHUA 2KRNA 1FBVA 1PRMC 4IIOA 2YSQA 2DL3A 2YUNA 1AWJA 2KT1A 4HCKA 4WCIA 2CREA 1GL5A 5J3XA 4F14A 1X6GA 2K2MA 3BUWB 1WLPB 2JMAA 1O49A 1OEBA 2RQRA 1NYFA 2LNWA 1PNJA 1GFCA 2BZYA 1M3AA 5D0JA 4A4BA 1H9OA 2DCRA 1BKLA 1A0NB 2DL8A 3M0TA 2K7AA 2DX1A 3JV3A 2H46E 1VYUA 4A63B 1OPKA 1NZLA 2DE0X 3PVQA 3BUXB 2O2OA 3BKBA 3PVLA 3N84A 1PKTA 2MRKA 1O4KA 1UJ0A 1MW4A 1NEBA 2DRKA 1M3BA 3MAZA 3TL0A 4AG1C 2DLYA 1NM7A 3QWXX 4ROJA 2CUDA 1XOVA 1BB9A 4LN2A 1G83A 3R6NA 5EC7A 1JQQA 2MOXA 1UHFA 4OMOA 2KR3A 1K76A 2JYQA 1V1CA 3UYOA 2J6KA 3I5SA 3SEMA 2HDAA 5EHPA 5GJVB 2DL7A 2W0ZA 1UURA 1D4WA 1R1SA 2RPNA 1BFJA 2IUIA 3H0FA 2EKHA 3UATA 2J05A 4OHLA 4E68A 1PRLC 2ETZA 3IN8A 1SHAA 1KA7A 4J9DA 1QLYA 1UE9A 2FPDA 3FJ5A 1NEGA 2C0IA 2PNBA 3VGOA 2DBMA 2LQWA 1O4IA 3VRQA 1KA6A 3S9KA 2H8HA 1K9AA 1O4GA 1BHFA 1FYNA 4M4ZA 3ZNIA 4JZ4A 3VS2A 1SHBA 1O44A 2PLDA 4K45A 1O4CA 4OHHA 2FRYA 3IMJA 1PWTA 4KRTA 1E7OA 2IIMA 4FBNA 1EFNA 1K1ZA 1O42A 3EHQA 2IUHA 4RTZA 3THKA 1RLQC 1BHHB 1O4JA 1GRIA 2HDXA 1LUMA 4P9VA 1LUIA 2LQNA 1WI7A 2HBWA 4LE9A 2RQTA 2DLZA 2LJ0A 2Y1MA 1O43A 5IHNA 3VS3A 1Y0MA 2RMOA 3REAB 3VS0A 5GJWB 1IO6A 1BBZA 4ORZA 2RF0A 4RTTA 5ECAA 1AWWA 1UECA 2MIOA 1YNZA 3OB1B 1O4MA 3IMDA 2JMCA 1FMKA 2KE9A 3M0UA 4HVVA 2K9GA 1JYQA 1WQUA 2C9WA 4GPLB 1ZLMA 2O31A 3NMZC 3HIZB 2P4RA 2EBPA 2OJ2A 4RTXA 3H0HA 4OHDA 1JYUA 1O4BA 4JE4A 1AWXA 4JPBW 1O4FA 1B47A 4AFQC 3GXXA 1O4NA 4NWGA 1JU5C 4HVWA 1R1PA 2DYBA 2FEIA 3EG0A 2GSBA 4GL9E 1WXBA 3I5RA 2LX7A 1AYBA 2AZSA 3UF4A 1WIEA 2HDVA 2L4KA 2GNCA 4JGHA 1YWOA 4OMNA 3MXYA 3N7YA 4GBQA 2HEQA 3TVTA 1K4US 3REBB 1A1BA 2F2XA 3EG3A 1VYVA 5HKYA 4OMPA 1BM2A 3OV1A 1N5ZA 2D1XA 3WA4A 2G6FX 2EYXA 2FPEA 5HCKA 2B3OA 1RJAA 1W1FA 4NWFA 4GWFA 1O46A 5EELA 3VRYA 1HSQA 2ENMA 3EG2A 4DEYA 1KC2A 2DILA 2V1RA 1AZGB 1UGVA 2FG0A 1T3LA 2YT6A 2ED1A 2CI9A 3BUOB 1O4OA 1SKJA 3PS5A 1M27A 1BMBA 2JXBA 1YP5A 1X0NA 2JW4A 1ABQA 2DM0A 1WXUA 3QWYA 4P9ZA 1B3QA 4RTVA 1Z9ZA 2EL8A 2MC1A 3PQZA 2CSQA 1LKLA 2AOAA 5HKWA 1RI9A 2LCSA 1O4DA 1I07A 1ZUYA 2L3QA 1WXTA 4JEGA 2KYMA 4F17A 1D1ZA 4JJBA 2A08A 1ZFPE 1AOJA 2K79A 2L2PA 1JO8A 1G2BA 2RMXA 4OMQA 4TZIA 5AXIA 1WFWA 1CSZA 1MV3A 1UUSA 2GTJA 2CS0A 2IZVA 1A1CA 1O4RA 3BUMB 1O45A 1NLPC 1SPSA 2DX0A 2RORA 3MXCA 3OB2B 4XZ1A 1UUEA 1GFDA 1SHGA 2CT4A 3LH5A 2CI8A 1H3HA 2EO6A 2AOBA 4ESRA 2DL5A 2RNAA 2X3WD 2D0NA 2EPDA 3EG1A 2SHPA 4J9FA 2J6FA 1YWPA 3KFVA 1UJYA 2EQIA 4DGXA 4JJDA 3UA6A 3ULRB 2L3TA 1A81A 3VRRA 2PNIA 1HD3A 1SPRA 4L1BB 5DF6A 1CSYA 1NLOC 2DRMA 1U3OA 1O4QA 1Z3KA 1CKAA 1WA7A 2GQIA 4ZNXA 3C0CA 3VS5A 1A08A 1GCQC 2HMHA 4EIHA 1O4HA 1X6CA 3CD3A 1CWDL 1NYGA 4D8DA 2EGCA 2IUGA 4CC3A 1X2QA 1ZUUA 3PLFB 2Y1NA 2HCKA 1ABOA 4Z8AA 4OMLA 1A09A 2YU7A 2GBQA 2HUWA 1CJ1A 2OQ1A 3HHMB 5DC4A 2RQWA 1VYTA 1X27A 1F1WA 2MK2A 1UFFA 1AWOA 3PSJA 4JZ3A 1QCFA 5CDWA 1TUCA 1ZUKA 3UA7A 5L23A 2BZXA 1AVZC 4J9IA 1LCKA 2J06A 1SRMA 2EO3A 1QWEA 2FCIA 2SRCA 2CIAA 2SEMA 4OHEA 1SHFA 1I1JA 2RVFA 5HKZA 5IBSA 3GXWA 2KRMA 1NG2A 1QKXA 3ZL7C 1NZVA 3I35A 2KXCA 1NRVA 4E6RA 3PJPA 2MCNA 2CT3A 2JT4A 2CRHA 3IQLA 2RQVA 2ROLA 1MILA 2QMSA 3TSWA 1WYXA 1W6XA 1BG1A 1AOUF 1AYDA 3CBLA 5FW9A 1SRLA 2DBKA 1GCPA 1PHTA 2YUQA 1O4PA 1XA6A 1OPLA 2A28A 3H41A 4J9CA 4X6SA 2B86A 1FYRA 2EYZA 2JM9A 2VKNA 2ED0A 2GTOA 4K11A 4EY0A 4Z88A 2PLEA 3C7IA 2KT8A 2CR4A 3A98A 4LNPA 1BHHA 2BZ8A 2KNOA 3VRNA 1M30A 1RLPC 1R1QA 1JU5A 4J9BA 1QADA 2JS0A 4FL2A 2EGAA 1BFIA 1FBZA 2LJ1A 2VWFA 4AFUC 2DF6A 1JWOA 1BLKA 4HVUA 1OV3A 3EGUA 2LZ6B 2EYWA 2RSYA 1UHCA 2AKKA 4QT7A 5IXFA 2PTKA 1I0CA 1KJWA 2CSIA 2XMFA 3I9QA 3M0SA 4CC4B 1M61A 2EU0A 2K7AB 2ECDA 1W70A 1K0XA 2CH4A 4CC7A 2KYBA 4J9EA 1WDXA 1A07A 2D8JA 2CUBA 2V1QA 2W10A 2EVRA 4H34A 1FHSA 2KXDA 4J9HA 1BU1A 1HJDA 2K6DA 2RN8A 3VRZA 4F59A 1ZX6A 1H8KA 4F16A 2LCTA 1AYCA 3S8OA 1OOTA 3RNJA 3OP0A 2EYYA 2JM8A 3GBQA 2KK6A 2FO0A 1Y1UA 3IN7A 3CQTA 1QKWA 1GBQA 2FRWA 1T0JA 3TKZA 2AKLA 2XP1A 4E93A 3S8NA 2L3SA 4JJCA 1KFZA 4RTYA 2L0AA 3EHRA 1SEMA 3CXLA 2LNHB 2KRSA 2I0NA 2A36A 3S8LA 2Y3AB 1T0HA 5EG3B 2EYVA 2AK5A 2KNBB 2YUOA 5GJHA 4OMMA 1X43A 2YDLA 1MUZA 1U5SA 4RTWA 2CBLA 4XZ0A 4A4CA 1TZEE 1B07A 2OI3A 1JEGA 4OHIA 2JS2A 1SSHA 2LNXA 1ZBJA 3EACA 2A37A 1RQQC 1M3CA 5FWBA 2DL4A 4FL3A 2RQUA 4K2RA 2CH4W 4R0KA 2EKXA 2F2WA 1KIKA 1RPYA 2DNUA 4RTUA 5KAZA 1CKBA 3H0IA 2ABLA 4LUEA 2KEAA 1VA7A 4IIMA 1O47A 3US4A 1YVLA 1QG1E 5AULA 3M0RA 3PSKA 1GCQA 2C0TA 3TSZA 1J3TA 4DGPA 1Z9QA 1YVHA 3CWGA 3M0QA 1BF5A 1ARKA 5EHRA 2F2VA 1O4LA 2QDLA 1H92A 2DLPA 1AB2A 1S1NA 4J9GA 3OVEA 2DMOA 4Y92A 2AZVA 1O41A 2LJ3A 2OAWA 3RBBB 2MRJA 2PNAA 5DC0B 4WWQA 2OZOA 1RUWA 3VROA 1TUDA 3NHNA 4GLMA 2BTTA 1AD5A 4AFZC 2KROA 1MV0B 2LP5A 1AZEA 1JYRA 5I6VA 1A1EA 1FU5A 1Y57A 3VS7A 4DEXA 1SPKA 2KBTA 2LMJA 1IS0A 4D8KA 3VS1A 2DA9A 1HCTB 1M8MA 2DM1A 2K3BA 1D4TA 2M0YA 1YCSB 1JXOA 1K0SA 1OO4A 3HCKA 2EGEA 1PICA 3M7FA 1LUNA 1A1AA 2VIFA 1CSKA 1T3SA 2EOBA 3U23A 1CWEA 1LCJA 1X2KA 1UDLA 5GJIA 2VVKA 5IHKA 3PFVA 4H1OA 1WX6A 2EW3A 2ECZA 1QWFA 4Z89A 2O88A 4CC2A 4U1PA 2CDTA 4F5AA 4EIKA 5I22A 5IH2A 1SHDA 3NPFA 1ZSGA 2NUZA 1LKKA 4FSSA 1UG1A 1X69A 2J7IA 1FU6A 3BUNB 3VRPA 5IHIA 2H5KA 2M51A 4HXJA 2DVJA 3VS4A 1IJRA 2AUGA 5DC9A 2PZ1A 2BBUA 5I11A 2DJQA 2HSPA 4AFSC 2ESWA 4X1VA 1O4EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RHUA 4N4HA 2CZ7B 3HRUA 1QVPA 2YUPA 1AT1B 2E5KA 3KFJA 1NZ9A 1ZA1B 2MQIA 1K8AR 5KE3A 2C06A 3LWHA 2GE9A 1YIJA 1LOJA 3G6EQ 1GBRA 5C6SA 1TCEA 5GMKe 2MPXC 1VQMA 1VQ7T 2HL3A 3GNGA 3LWIA 2VGNA 1M90C 1U06A 3HFOA 2D8HA 1C6VX 4AG2C 4IUPA 1PKSA 1U8RA 3EGDA 1X6OA 1VQ8A 2OTJQ 3VS6A 1VQPT 2ROTA 1SG5A 2CP7A 1AEYA 3EAZA 4FL6A 5IXBA 1I3ZA 3PE0A 1FBVA 1PRMC 2YSQA 2DL3A 1AWJA 1M1KR 1X6GA 1YJ9T 4KBMB 4ZN1A 1ZHIA 2MI6A 4P5NA 5CQYA 1H9OA 1D1CA 2CZ1B 3CCVA 2VB6A 2B8AA 2DL8A 5GAMd 1MHNA 3JV3A 2H46E 2EWNA 1VYUA 2DE0X 1PCXA 2MMPA 1PKTA 3GNFB 1UJ0A 1MW4A 1NEBA 1X75C 1M3BA 2DRKA 2M02A 2EQMA 2DLYA 3MAZA 3QWXX 4IUUA 4ROJA 2LT1A 1XOVA 3QZ5B 4BE1A 1NPPA 2O4XA 3M4GA 1K76A 3E19A 3SEMA 2W0ZA 1R1SA 4PLIA 2J05A 4M7DF 4E68A 4JJNK 7AT1B 4M75A 2RHZA 1YJWT 1X01A 1TSFA 3WXMB 2ETZA 3IN8A 3OYGA 1N27A 2P84A 2PNBA 3OB9A 1NEGA 3EG9A 1ZSZB 2ZPFB 2PVOB 3VRQA 2EQKA 1O4GA 3ZNIA 4EMKC 1VQ4A 3BDLA 2XG8D 4OMFB 1E7OA 2IIMA 2KI7A 4BY6B 2GFUA 1O42A 1Q82R 4IUTA 1BHHB 1G3WA 2LQNA 1VQ6T 2Y1MA 1Y0MA 5GJWB 1G5VA 4C92D 3JCMe 3RIRA 1YNZA 3IMDA 2K4YA 3OYIA 2RI2A 5I2MA 2MWPA 4GPLB 2VXFA 3G71T 2QTXA 3X24B 4M77D 4V2SA 4GY5A 2RH2A 2V8KA 4YTLA 4JE4A 1YHQQ 1B47A 3OYYA 3GXXA 4ZTJA 1M1FA 1JU5C 1R1PA 2GSBA 2R5MA 1WXBA 3I5RA 2K5LA 4LDVA 2LX7A 1AYBA 5C0MA 1YWOA 3MXYA 4E7LA 3QO3A 3X26B 2QEXT 3G4SQ 3TVTA 2HSEB 1OYXA 3REBB 3JB9I 3QHSA 2WSEE 2LCCA 4OMPA 1YJNA 1QVFP 3OV1A 4BE0A 1KD1R 1Q81U 2EYXA 1B34A 2FPEA 4OB3B 5HCKA 3PMIA 5L8RE 3HTRA 2B3OA 5GAN8 1WHJA 1KC2A 2DILA 2ED1A 3BUOB 3I56T 1SKJA 3QJYA 1X0NA 2FHDA 2JW4A 2DM0A 3QWYA 2F69A 2NUTA 1Z9ZA 2VXEA 3RMSA 1RI9A 1K9MC 3NTIA 2Z0WA 2L3QA 2ZPGB 5LJ5f 2KYMA 4MZPA 1WHGA 4QVZA 3VYHB 3KXTA 2K79A 1G3TA 4JLIA 2CP2A 3CXCP 3ZFJA 2IZVA 4FSXA 1O4RA 3HP9A 4MDWA 3BUMB 2V8JA 2BIVA 4C5IA 1YI2A 1UUEA 4KGVB 2LQKA 3J7AF 3OYNA 1KQSS 2CT4A 5LJ5h 2EJFA 1H3HA 2EO6A 2RNAA 2J6FA 4Q5WA 3G6ET 1RACB 3KFVA 2EQIA 4DGXA 3OMCA 3UA6A 3ULRB 1Y96A 4M7DB 1RABB 2PNIA 1CSYA 5FU7C 5GAMj 3MP1A 1Z3KA 1MMAA 1WA7A 2LDMA 4EIHA 2RI3A 2OTJT 5CO7A 4PJOC 3FJPA 1QW1A 2ZPEB 5IAYA 1ZUUA 4M7DG 5GAOp 5KCOA 3ZBDA 3M57A 2GBQA 2HUWA 1CJ1A 2OQ1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1GBQ A;  2FRW A;  1T0J A;  3TKZ A;  2AKL A;  2XP1 A;  4E93 A;  3S8N A;  2L3S A;  4JJC A;  1KFZ A;  4RTY A;  2L0A A;  3EHR A;  1SEM A;  3CXL A;  2LNH B;  2KRS A;  2I0N A;  2A36 A;  3S8L A;  2Y3A B;  1T0H A;  5EG3 B;  2EYV A;  2AK5 A;  2KNB B;  2YUO A;  5GJH A;  4OMM A;  1X43 A;  2YDL A;  1MUZ A;  1U5S A;  4RTW A;  2CBL A;  4XZ0 A;  4A4C A;  1TZE E;  1B07 A;  2OI3 A;  1JEG A;  4OHI A;  2JS2 A;  1SSH A;  2LNX A;  1ZBJ A;  3EAC A;  2A37 A;  1RQQ C;  1M3C A;  5FWB A;  2DL4 A;  4FL3 A;  2RQU A;  4K2R A;  2CH4 W;  4R0K A;  2EKX A;  2F2W A;  1KIK A;  1RPY A;  2DNU A;  4RTU A;  5KAZ A;  1CKB A;  3H0I A;  2ABL A;  4LUE A;  2KEA A;  1VA7 A;  4IIM A;  1O47 A;  3US4 A;  1YVL A;  1QG1 E;  5AUL A;  3M0R A;  3PSK A;  1GCQ A;  2C0T A;  3TSZ A;  1J3T A;  4DGP A;  1Z9Q A;  1YVH A;  3CWG A;  3M0Q A;  1BF5 A;  1ARK A;  5EHR A;  2F2V A;  1O4L A;  2QDL A;  1H92 A;  2DLP A;  1AB2 A;  1S1N A;  4J9G A;  3OVE A;  2DMO A;  4Y92 A;  2AZV A;  1O41 A;  2LJ3 A;  2OAW A;  3RBB B;  2MRJ A;  2PNA A;  5DC0 B;  4WWQ A;  2OZO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1BK2 A;  3O5Z A;  2KGT A;  1BKM A;  1UTI A;  1F2F A;  2O9S A;  1YN8 A;  2X3X D;  5IBM A;  2JTE A;  2YUP A;  2E5K A;  3NGP A;  1BLJ A;  1JXM A;  3KFJ A;  2MQI A;  1E6G A;  3K2M A;  2GE9 A;  3SHW A;  1GBR A;  1O4A A;  1TG0 A;  1P13 A;  1TCE A;  2K79 B;  4QSY A;  1KSW A;  3GQI B;  2L6K A;  1OO3 A;  4U17 A;  1AYA A;  4K44 A;  2C0O A;  1E6H A;  1U06 A;  5EEQ A;  2FPF A;  2D8H A;  4AG2 C;  5BO4 A;  1PKS A;  2GGR A;  1M27 C;  2O9V A;  4RUG A;  3N8M A;  3T04 A;  4F5B A;  3VS6 A;  2L3P A;  2ROT A;  1AEY A;  3M0P A;  3EAZ A;  5IXB A;  1HCS B;  2J6O A;  1AOT F;  2NWM A;  5FWC A;  1I3Z A;  1LUK A;  4LUD A;  1X6B A;  1O48 A;  3PE0 A;  2YSX A;  1GHU A;  2KRN A;  1FBV A;  1PRM C;  4IIO A;  2YSQ A;  2DL3 A;  2YUN A;  1AWJ A;  2KT1 A;  4HCK A;  4WCI A;  2CRE A;  1GL5 A;  5J3X A;  4F14 A;  1X6G A;  2K2M A;  3BUW B;  1WLP B;  2JMA A;  1O49 A;  1OEB A;  2RQR A;  1NYF A;  2LNW A;  1PNJ A;  1GFC A;  2BZY A;  1M3A A;  5D0J A;  4A4B A;  1H9O A;  2DCR A;  1BKL A;  1A0N B;  2DL8 A;  3M0T A;  2K7A A;  2DX1 A;  3JV3 A; 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