2LQWA

Solution structure of phosphorylated crkl
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
303
structure length
302
Chain Sequence
MSSARFDSSDRSAWYMGPVSRQEAQTRLQGQRHGMFLVRDSSTCPGDYVLSVSENSRVSHYIINSLPNRRFKIGDQEFDHLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPAPRYPSPPMGSVSAPNLPTAEDNLEYVRTLYDFPGNDAEDLPFKKGEILVIIEKPEEQWWSARNKDGRVGMIPVPYVEKLVRSSPHGKHGNRNSNSYGIPEPAHAAQPQTTTPLPAVSGSPGAAITPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Crk-like protein
publication title Domain organization differences explain Bcr-Abl's preference for CrkL over CrkII.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 41
structure length 302
sequence length 303
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
A PF07653 SH3_2 Variant SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA02
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA03
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2lqwA01
2BZ8A 3KFJA 5IHNA 2LP5A 4IIMA 1KA6A 1PKSA 1KJWA 2X3WD 1GHUA 4A4CA 1JYRA 4Z8AA 1ZFPE 2JT4A 4JJDA 1H9OA 3S8OA 3IMDA 2CH4W 2Y1NA 5EG3B 1MUZA 3O5ZA 2ETZA 4FL3A 2KK6A 4LUDA 1E7OA 4HXJA 2YSXA 2W0ZA 4WCIA 1J3TA 1UURA 2L3SA 2KROA 4Z89A 3JV3A 3S9KA 4ESRA 1GBQA 2J05A 2RNAA 1UJ0A 3T04A 1O4EA 5GJVB 1SPRA 1VYUA 4AFQC 3R6NA 1UTIA 2L0AA 1CJ1A 3VROA 2F2VA 2KNBB 2K79A 3CXLA 2KR3A 4AFUC 1NYGA 1YWPA 1O4IA 1JQQA 3GXXA 1BHHB 4DGXA 2D0NA 1H3HA 4XZ0A 2DYBA 3C7IA 3MXCA 5EC7A 1BMBA 2B86A 4JZ3A 1NZLA 2KE9A 4F5AA 4HVVA 1YVLA 1UHFA 2DMOA 4K11A 3I9QA 1FU5A 1WXBA 2PTKA 2F2XA 1M30A 1O4OA 4JZ4A 2H8HA 1O44A 3VS2A 2FG0A 1RLQC 2DRKA 5I22A 2FRYA 2X3XD 4Z88A 1QWEA 3N7YA 4U1PA 1X2QA 2VVKA 3VS5A 1T3SA 3H0IA 3OVEA 1QG1E 1R1QA 2J7IA 4OHHA 2MOXA 1MILA 2EGEA 1GRIA 1BLKA 1NLOC 2RSYA 1AVZC 3VRRA 2KXDA 1BBZA 2YSQA 2RF0A 1KIKA 3UF4A 1M27A 1O4FA 1T0JA 2DM0A 1ABOA 2C0TA 1NLPC 1SHGA 2FRWA 2O9SA 2JMCA 3GBQA 1O49A 1QLYA 1I0CA 2ED1A 2F2WA 5IH2A 3VRQA 1UE9A 1SEMA 2V1QA 4CC2A 2OJ2A 1SRLA 1GFDA 4J9CA 3PSKA 4A63B 1UGVA 2HMHA 3M0QA 2MC1A 1QWFA 2M51A 3RBBB 1JXMA 3M0PA 2GTOA 4J9IA 1O4BA 3IMJA 2JTEA 4F14A 3NHNA 3S8NA 1OPKA 4IIOA 2JM8A 4E93A 1EFNA 2OAWA 1K1ZA 4EIHA 2ED0A 1AOTF 1H8KA 2I0NA 5FW9A 2RN8A 2C9WA 5CDWA 1UUEA 3PJPA 1WXTA 1K76A 2O2OA 2RPNA 3N8MA 3EG3A 4OMPA 2DL5A 1HCTB 1PNJA 5DC0B 1G83A 3OB1B 2DX1A 2LX7A 4CC4B 2K7AB 2FO0A 2IUHA 4F59A 1AB2A 5FWBA 4F16A 4X1VA 2LZ6B 1A09A 1U5SA 2DL4A 2RQRA 4P9VA 4OMNA 3TL0A 2GBQA 2HUWA 1O4CA 1X0NA 2EO3A 3PVQA 3PSJA 5FWCA 2CI9A 2L4KA 2DBKA 4OMQA 2L3QA 2HDXA 5IHKA 2L6KA 5KAZA 3M0SA 1HCSB 1UDLA 2AOAA 2CIAA 2GNCA 1A81A 1AYDA 3EGUA 1O47A 1O4AA 3US4A 1RUWA 2JS0A 1D4TA 2G6FX 1HSQA 2IIMA 1R1SA 3TKZA 1RLPC 1RPYA 4K44A 3ZL7C 1PICA 2LNXA 1ZUKA 1ZX6A 2L3PA 1XA6A 3KFVA 1OO3A 1MW4A 2EO6A 1BF5A 2K7AA 1CKBA 2MQIA 3NMZC 2GQIA 2NWMA 4QT7A 3VS3A 1YCSB 1B47A 1LUMA 1BLJA 1QCFA 1JU5A 1CWEA 1UECA 3EG2A 2LJ1A 1JEGA 2W10A 2KEAA 2PNBA 5J3XA 2D8HA 3TSZA 1GCPA 4EIKA 3BUNB 3VRNA 1BG1A 1O4GA 2KYMA 4HVWA 1LKLA 4GBQA 4EY0A 1Y57A 3I5SA 3MAZA 1CSYA 1A07A 1SKJA 4OHLA 2B3OA 2FPEA 5EEQA 2ESWA 1GL5A 2IZVA 1WFWA 1A1BA 1O4DA 1PRLC 1QKWA 1FMKA 2RQWA 1NZVA 1O43A 1BU1A 2CUBA 2YDLA 2MK2A 1D1ZA 1ZUYA 5IBMA 5HCKA 2AKKA 2DLPA 2DF6A 2EYWA 3PLFB 3PQZA 1JWOA 4H34A 2KT1A 3VRZA 3OB2B 2SEMA 3C0CA 1SHFA 1T0HA 3M7FA 2XP1A 2VKNA 2JXBA 2LNWA 2YUQA 1PHTA 3MXYA 5BO4A 1OEBA 4NWFA 1LCKA 5EHPA 3VS7A 1UHCA 4J9GA 4OMMA 1BM2A 1TUCA 2RMOA 1FU6A 3I5RA 2NUZA 2RQVA 2JW4A 1RQQC 1YNZA 3UA6A 3SEMA 3BUOB 4RUGA 1AYAA 1O4JA 2GSBA 2AZVA 3CWGA 1O48A 2YUOA 2GE9A 2EBPA 3VS1A 2CS0A 4ORZA 2Y1MA 1JYQA 3M0RA 1NM7A 2K9GA 2MIOA 3EHQA 3EG1A 1WYXA 3K2MA 1TG0A 2JYQA 2SHPA 1NEGA 4LE9A 1BHHA 1FBZA 1BHFA 1AZGB 2LNHB 1LUKA 1PKTA 1YVHA 2AK5A 2KRMA 1O4LA 2LCTA 3LH5A 2EOBA 1NEBA 1M8MA 1HJDA 1F2FA 1M27C 5IXFA 1IJRA 4GLMA 1AYBA 3BKBA 1AWXA 1X43A 2K2MA 1JYUA 1K0SA 1OV3A 1JXOA 4RTYA 1X6GA 5DC4A 1TUDA 2RQTA 2GTJA 2RORA 2ABLA 5IBSA 2FEIA 1AOJA 2J06A 2LQNA 3EACA 2OQ1A 4JEGA 4QSYA 4HVUA 2XMFA 2KGTA 2L2PA 1AZEA 2KNOA 4AFZC 1YP5A 4H1OA 4JGHA 2DCRA 2DL8A 2ROTA 4OHEA 2EW3A 5GJHA 2HSPA 5GJIA 1O4NA 1KSWA 2IUIA 1QKXA 2KRNA 1OOTA 5I6VA 1M61A 2HDVA 4RTVA 3BUMB 3VRPA 2LQWA 2LJ3A 2BZXA 1BFJA 2CBLA 1W6XA 2DA9A 4XZ1A 2J6OA 4X6SA 1SPKA 2JM9A 3HIZB 2DNUA 1O4PA 1FYRA 1NRVA 4F5BA 1WIEA 2AKLA 1IO6A 2CUDA 2KYBA 3S8LA 1WX6A 5L23A 2DRMA 1X6CA 2O88A 4AG1C 2EQIA 1FYNA 1IS0A 1RJAA 1M3BA 4FL2A 4K2RA 1G2BA 4AFSC 1Y1UA 4K45A 2HDAA 1B3QA 2CSQA 2DBMA 1LUNA 3UATA 2DLYA 4RTXA 3N84A 1UJYA 1ABQA 1GCQC 2DL7A 1BKLA 2EYXA 3CQTA 2E5KA 3HHMB 5HKWA 5EELA 1I07A 1AD5A 2A08A 1O4KA 1ARKA 4LNPA 4WWQA 1KC2A 4LN2A 2YT6A 3I35A 1MV0B 2DILA 1FHSA 2CT4A 1A1EA 1SPSA 4E6RA 1V1CA 1P13A 1TCEA 4ZNXA 4GWFA 4KRTA 2ECDA 1M3AA 2PLEA 5AXIA 3H0FA 2AUGA 3A98A 2VWFA 5GJWB 2SRCA 2CDTA 5D0JA 1XOVA 1ZSGA 4DEYA 2P4RA 2ECZA 1SHDA 2BTTA 3VS6A 2RQUA 1A1AA 2EGCA 2MRKA 4RTUA 1WA7A 1Z9ZA 2QMSA 2A37A 1VYVA 3H41A 2M0YA 1WLPB 1X27A 3TSWA 2JMAA 2K79B 3CBLA 2AZSA 1Z3KA 1O46A 4RTZA 4DEXA 1WI7A 2DX0A 1GFCA 3UYOA 1X2KA 1NG2A 3IQLA 2H46E 1Z9QA 1TZEE 2ENMA 2KBTA 2IUGA 1ZUUA 3ZNIA 2DLZA 4R0KA 3M0UA 3VS4A 1UFFA 5IXBA 1QADA 4L1BB 4JE4A 1PWTA 2EGAA 2FPFA 3EG0A 4J9HA 4JPBW 4DGPA 2C0IA 1VYTA 1O4HA 2PNAA 3RNJA 1UG1A 3HCKA 3BUWB 2RVFA 4FBNA 4RTWA 1SHBA 1WDXA 1F1WA 1OO4A 2Y3AB 2FCIA 3VS0A 1PRMC 1X69A 4D8KA 2EL8A 4CC3A 5I11A 3EHRA 2O9VA 2HBWA 5IHIA 3OP0A 1ZLMA 1W70A 2A28A 2RMXA 4Y92A 1MV3A 1O42A 4TZIA 1YN8A 5HKYA 2LJ0A 3FJ5A 3QWYA 3EAZA 1OPLA 1K0XA 3ULRB 2EYZA 1T3LA 1K9AA 2DE0X 4J9BA 2CR4A 5ECAA 4RTTA 1CSZA 4LUEA 4P9ZA 2C0OA 1O4MA 3IN8A 2CRHA 1LUIA 2L3TA 1AWOA 1WQUA 4GL9E 1GBRA 1E6HA 3SHWA 2JS2A 2PLDA 2QDLA 3H0HA 2EU0A 4OMOA 1A08A 1R1PA 2CSIA 2EYVA 3NPFA 3GXWA 4A4BA 2OI3A 3PE0A 3VGOA 1H92A 1AYCA 2BBUA 3CD3A 1I1JA 1BKMA 1HD3A 1CKAA 1RI9A 2EYYA 2K6DA 2ROLA 1D4WA 1LCJA 5HKZA 2DJQA 1Y0MA 2A36A 1SRMA 2PNIA 2D8JA 1LKKA 2H5KA 1KA7A 4OHDA 4ROJA 4J9FA 3NGPA 2EVRA 2KT8A 2LMJA 3QWXX 4U17A 5EHRA 1A1CA 4F17A 3TVTA 1A0NB 3UA7A 4GPLB 2LCSA 1SSHA 2CI8A 1AOUF 4FSSA 1JO8A 1B07A 1M3CA 1O41A 1N5ZA 1AWWA 1VA7A 2D1XA 2DL3A 3WA4A 2EKXA 3M0TA 3PVLA 1CWDL 3VRYA 2DM1A 2CT3A 1U3OA 1WXUA 3U23A 3GQIB 2O31A 1I3ZA 1O4QA 3OV1A 1S1NA 4M4ZA 2V1RA 1K4US 2CREA 1NYFA 1KFZA 2EKHA 1E6GA 1SHAA 3PFVA 4D8DA 4JJCA 4E68A 2PZ1A 1ZBJA 3IN7A 4CC7A 2YUNA 2OZOA 2HCKA 1CSKA 2J6KA 4OHIA 1AEYA 2AOBA 4AG2C 4NWGA 2HEQA 1YWOA 3REAB 2YUPA 3BUXB 1FBVA 2MCNA 2KRSA 2J6FA 5DF6A 4J9EA 1GCQA 3PS5A 5DC9A 1U06A 1AWJA 4HCKA 2FPDA 4JJBA 4OMLA 2MRJA 3REBB 2CH4A 1BK2A 2BZYA 1O4RA 2KXCA 4J9DA 2VIFA 3THKA 1X6BA 5AULA 2K3BA 1BB9A 1O45A 2GGRA 1W1FA 1BFIA 1UUSA 1JU5C 2EPDA 2DVJA 2YU7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LWIA 1R8OB 2DD4A 4M7DG 1KA6A 1PKSA 3I56Q 4L59A 3UWNA 4PKCC 3FLGA 1NPPA 1H9OA 2IVWA 2VGMA 2CH4W 2Y1NA 2QEXT 5EG3B 1MUZA 4RMOA 4PK4A 2KK6A 3RUXA 4M78B 4BE1A 1UURA 5GAMh 1FX7A 2XHCA 2KROA 4QQDA 1XQHA 2RNAA 2J05A 4AFQC 1UTIA 2LDMA 1YHQQ 4AFUC 1YJWQ 1O4IA 1JQQA 1Q86C 2L89A 3VKIA 3OYGA 1KQ1A 2LNVA 3G71T 2VXEA 4C0GA 2DYIA 3G7ZA 4JRKA 4F5AA 4QW2A 3M4YA 4HVVA 2LRQA 1UHFA 2FYKA 2FG0A 2DRKA 2X35A 5I22A 4Z88A 3GIBA 3N7YA 1D1AA 5LJ5g 3OVEA 1QG1E 2MK5A 2ZGWA 2EGEA 1PSEA 1VQ8A 4JLIA 1MMDA 3OA6A 1AVZC 3SFMA 3VRRA 2MAMA 2YSQA 1KIKA 3EFOB 5CK9A 3PIOA 3M55A 1M1KR 1RAEB 4IUPA 5FLXE 2CZ7B 5KYUB 1SEMA 1LOJA 2OJ2A 1GFDA 3OSVA 3M59A 4A63B 2MC1A 1I81A 2GTOA 5DLOA 4F14A 3EG9B 1OPKA 2OAWA 3CC4Q 2ZZDA 2I0NA 1UUEA 3PJPA 3EGXB 3EG3A 2DL5A 3CPWS 4PJOD 1VQ5Q 4KUDK 3E2UA 2DX1A 2FO0A 4HT9A 2KQWA 5FWBA 1FMWA 4L5GA 2HNIA 2RHIA 1M1FA 2RQRA 4P9VA 4OMNA 1Q95G 2K5LA 1O4CA 1KC8C 3QJ6A 5FWCA 3RKWA 2CI9A 2L4KA 2DBKA 4OB0B 3CCUA 2I2LA 3M0SA 1HCSB 3CC4A 2QTXA 2E5QA 3EGUA 1O47A 1UB4A 1HSQA 3CD6T 3TKZA 1R1SA 1RAAB 1LPLA 1XA6A 2EO6A 1MW4A 1ZBXA 2GQIA 3MEAA 4QT7A 3VS3A 4HT8A 1YCSB 1Y7XA 5LJ5e 4OB3B 1NJIU 4LD6A 2VYTA 3EG2A 2LJ1A 1JEGA 2W10A 2PNBA 2D8HA 1VUBA 4EIKA 3BUNB 3VRNA 4EY0A 3NTHA 2M1HA 1VQ7T 2RB6A 2ESWA 5CKDA 2IPOB 1A1BA 1O4DA 4M78G 2E6NA 2XDPA 2HL3A 1O43A 2CUBA 2OAUA 2YDLA 1D1ZA 3I56T 3E9GA 2EYWA 3PLFB 4C92C 4GY5A 2MMPA 3SD4A 4MZPA 1U1SA 3FDRA 5GAN5 2VKNA 2JXBA 4N4GA 2LNWA 3MXYA 1TSFA 3VS7A 3PMIA 1UHCA 3LYIA 1TUCA 3M9QA 1FU6A 1TXQA 2JW4A 1H3ZA 2HQHA 3UA6A 1RAIB 1O4JA 2OTJQ 3A8OB 3CWGA 1VOMA 4ORZA 3FB9A 3GF5A 2Y1MA 4F7UF 5KYXA 1S72A 1KQSA 2K9GA 1D09B 1QCNA 3G4SQ 1YHQT 1M90R 1YJWT 1NEGA 1VQ8T 4LE9A 4J6YA 8ATCB 2LNHB 1VQLQ 1YVHA 2DERA 2AK5A 1NEBA 5A0DA 2D6FA 1IJRA 3PMTA 1K0SA 1QVGA 1N9SA 4RKUE 3OW2S 1X6GA 1W2BA 1V29B 4PFZA 3CMEQ 2GTJA 5IBSA 3M58A 2FEIA 1AOJA 2K5IA 4N4HA 5HY6A 2XMFA 3G6EQ 3G4SA 4XTXA 4JGHA 3HHTB 1IHVA 2DL8A 2HQEA 4DOVA 4ZN1A 1VQLA 2NUTB 1JB0E 2E1HA 3SWNC 1BFJA 2E65A 4KT0E 2J6OA 3LWHA 2DNUA 3VYGA 1O4PA 3BDLA 1QP3A 1N9RA 1IO6A 3BDUA 1WX6A 5L23A 4NS5A 4PJOB 1M3BA 3GPLA 1G2BA 2DBMA 3G6EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2Y3A B;  2FCI A;  3VS0 A;  1PRM C;  1X69 A;  4D8K A;  2EL8 A;  4CC3 A;  5I11 A;  3EHR A;  2O9V A;  2HBW A;  5IHI A;  3OP0 A;  1ZLM A;  1W70 A;  2A28 A;  2RMX A;  4Y92 A;  1MV3 A;  1O42 A;  4TZI A;  1YN8 A;  5HKY A;  2LJ0 A;  3FJ5 A;  3QWY A;  3EAZ A;  1OPL A;  1K0X A;  3ULR B;  2EYZ A;  1T3L A;  1K9A A;  2DE0 X;  4J9B A;  2CR4 A;  5ECA A;  4RTT A;  1CSZ A;  4LUE A;  4P9Z A;  2C0O A;  1O4M A;  3IN8 A;  2CRH A;  1LUI A;  2L3T A;  1AWO A;  1WQU A;  4GL9 E;  1GBR A;  1E6H A;  3SHW A;  2JS2 A;  2PLD A;  2QDL A;  3H0H A;  2EU0 A;  4OMO A;  1A08 A;  1R1P A;  2CSI A;  2EYV A;  3NPF A;  3GXW A;  4A4B A;  2OI3 A;  3PE0 A;  3VGO A;  1H92 A;  1AYC A;  2BBU A;  3CD3 A;  1I1J A;  1BKM A;  1HD3 A;  1CKA A;  1RI9 A;  2EYY A;  2K6D A;  2ROL A;  1D4W A;  1LCJ A;  5HKZ A;  2DJQ A;  1Y0M A;  2A36 A;  1SRM A;  2PNI A;  2D8J A;  1LKK A;  2H5K A;  1KA7 A;  4OHD A;  4ROJ A;  4J9F A;  3NGP A;  2EVR A;  2KT8 A;  2LMJ A;  3QWX X;  4U17 A;  5EHR A;  1A1C A;  4F17 A;  3TVT A;  1A0N B;  3UA7 A;  4GPL B;  2LCS A;  1SSH A;  2CI8 A;  1AOU F;  4FSS A;  1JO8 A;  1B07 A;  1M3C A;  1O41 A;  1N5Z A;  1AWW A;  1VA7 A;  2D1X A;  2DL3 A;  3WA4 A;  2EKX A;  3M0T A;  3PVL A;  1CWD L;  3VRY A;  2DM1 A;  2CT3 A;  1U3O A;  1WXU A;  3U23 A;  3GQI B;  2O31 A;  1I3Z A;  1O4Q A;  3OV1 A;  1S1N A;  4M4Z A;  2V1R A;  1K4U S;  2CRE A;  1NYF A;  1KFZ A;  2EKH A;  1E6G A;  1SHA A;  3PFV A;  4D8D A;  4JJC A;  4E68 A;  2PZ1 A;  1ZBJ A;  3IN7 A;  4CC7 A;  2YUN A;  2OZO A;  2HCK A;  1CSK A;  2J6K A;  4OHI A;  1AEY A;  2AOB A;  4AG2 C;  4NWG A;  2HEQ A;  1YWO A;  3REA B;  2YUP A;  3BUX B;  1FBV A;  2MCN A;  2KRS A;  2J6F A;  5DF6 A;  4J9E A;  1GCQ A;  3PS5 A;  5DC9 A;  1U06 A;  1AWJ A;  4HCK A;  2FPD A;  4JJB A;  4OML A;  2MRJ A;  3REB B;  2CH4 A;  1BK2 A;  2BZY A;  1O4R A;  2KXC A;  4J9D A;  2VIF A;  3THK A;  1X6B A;  5AUL A;  2K3B A;  1BB9 A;  1O45 A;  2GGR A;  1W1F A;  1BFI A;  1UUS A;  1JU5 C;  2EPD A;  2DVJ A;  2YU7 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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