2LQWA

Solution structure of phosphorylated crkl
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
303
structure length
302
Chain Sequence
MSSARFDSSDRSAWYMGPVSRQEAQTRLQGQRHGMFLVRDSSTCPGDYVLSVSENSRVSHYIINSLPNRRFKIGDQEFDHLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPAPRYPSPPMGSVSAPNLPTAEDNLEYVRTLYDFPGNDAEDLPFKKGEILVIIEKPEEQWWSARNKDGRVGMIPVPYVEKLVRSSPHGKHGNRNSNSYGIPEPAHAAQPQTTTPLPAVSGSPGAAITPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Domain organization differences explain Bcr-Abl's preference for CrkL over CrkII.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Crk-like protein
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 302
sequence length 303
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
A PF07653 SH3_2 Variant SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA02
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA03
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2lqwA01
1NG2A 2C0IA 2RMOA 2DE0X 2V1RA 1JXOA 2OJ2A 4KRTA 1EFNA 2CSIA 4RTVA 1BM2A 4ZNXA 1BHFA 2KRSA 4EIHA 1UE9A 1BMBA 1CWDL 2LCTA 1RJAA 1WFWA 2O31A 2O9VA 2PLEA 4ROJA 1JO8A 1SRLA 1TUCA 2DRKA 2MIOA 2MOXA 3VRQA 3CQTA 1Y0MA 4U1PA 2BTTA 1WI7A 1UECA 4GPLB 4JE4A 1A1EA 1BU1A 3BUMB 3C0CA 1OPKA 2CUDA 4Z89A 5IXBA 1M30A 2MC1A 5ECAA 1QWFA 3PE0A 1CSZA 3OV1A 1H8KA 4LNPA 2JM9A 4L1BB 2EYXA 1I3ZA 1PRLC 1LUMA 1BHHB 4J9HA 1QWEA 2K6DA 4OMQA 4TZIA 2P4RA 3K2MA 3UA6A 2KBTA 4HCKA 2KRMA 4A63B 2PZ1A 2KRNA 2ED1A 2BBUA 2EVRA 2YSXA 1OPLA 5J3XA 5EEQA 2L0AA 4DEXA 5GJWB 4R0KA 2LZ6B 3CWGA 5I6VA 3VROA 1O48A 1W6XA 1RUWA 2LJ1A 1HD3A 1M3CA 2AKKA 4OMPA 2F2XA 1KSWA 4CC3A 4LE9A 1QG1E 4DEYA 2IUHA 3HCKA 2EGAA 1OV3A 1NZLA 2A37A 2DM0A 1AWXA 1UURA 2DM1A 5IXFA 1X6GA 2EO6A 1GBRA 1BKLA 4Y92A 3IN7A 3CXLA 2EU0A 1SHFA 3U23A 2DILA 1SKJA 4RTYA 3EHRA 2K9GA 4NWFA 1CKBA 1D4TA 2LX7A 1TZEE 5CDWA 4JZ3A 1XOVA 4QSYA 2DL4A 4GBQA 2RQWA 2D1XA 3EGUA 2EKHA 3BUOB 5I22A 1UUSA 2CH4W 3S8LA 4AFSC 3FJ5A 1X2KA 3RNJA 2LJ0A 3UF4A 1O4GA 2C0TA 2CBLA 2YUQA 3SEMA 2A36A 4Z8AA 5EELA 5HKWA 5IHIA 3H41A 3ULRB 1B47A 3N7YA 4DGXA 2CI9A 2L2PA 2MQIA 3KFJA 3IMDA 4JJBA 3BUXB 1FBZA 4GWFA 1O4DA 1ZUKA 4HXJA 4H34A 1LKLA 1PWTA 4ORZA 1YWOA 3M0RA 3PSKA 5AULA 2ENMA 4JJCA 3OP0A 2CI8A 4JEGA 1HCSB 2IUGA 2AKLA 1O45A 2EW3A 2O88A 3EG1A 2KROA 3PS5A 1AVZC 2LQWA 1I07A 3NGPA 1O4BA 2KEAA 1BFIA 2BZYA 1ZLMA 1UJYA 2FO0A 3M0TA 2L4KA 2JXBA 1WQUA 2L6KA 5EG3B 1O4LA 1AYDA 4OMNA 1O44A 3EHQA 2RQTA 1K1ZA 2PTKA 3TVTA 4J9IA 2K7AA 3PSJA 2DBMA 1JXMA 3H0FA 1B3QA 4RTZA 3ZNIA 1AWWA 1O4IA 1WXUA 2IIMA 1YVLA 1WDXA 3VS5A 4WWQA 2W0ZA 1GCQA 1IS0A 4J9CA 2GNCA 2LNWA 2RN8A 3NMZC 2K79A 2Y1MA 1LCJA 2KT1A 2DNUA 1Z9QA 1GFDA 1OO3A 1UG1A 1BKMA 1T3SA 3THKA 1B07A 2KYBA 2J6KA 1NLPC 1PRMC 3GXWA 2W10A 1BB9A 3VRPA 3M0SA 1WIEA 1NM7A 2L3QA 2CT3A 2AZSA 3I5RA 2CS0A 1TG0A 3VRYA 2QDLA 1AEYA 1N5ZA 1ZFPE 1KIKA 4E93A 2DVJA 4OMLA 1O46A 3TL0A 1A08A 3KFVA 1AOUF 2MCNA 4GLMA 3A98A 4JZ4A 4RUGA 2YDLA 3VRRA 2DL8A 1GRIA 1VYVA 4HVVA 1AZGB 2DLZA 4F16A 2DF6A 1T0HA 2IZVA 1MV3A 5AXIA 2FCIA 2SEMA 2L3TA 1O4AA 1I1JA 2JTEA 2OI3A 4XZ1A 4EIKA 4X1VA 2H8HA 1HCTB 5I11A 3IMJA 2K3BA 3M0PA 5DC9A 1UHFA 4OHDA 2RMXA 2EYYA 2O2OA 2JT4A 4J9FA 1UHCA 2RQUA 1D4WA 2RQVA 2YUOA 2EYVA 2PNBA 3T04A 4J9BA 1NYFA 2PNAA 2CSQA 1AOTF 2VWFA 5BO4A 1O4CA 1YP5A 1A1AA 1JYUA 1RLQC 1FU6A 1OEBA 1QKWA 1HJDA 2PNIA 1NYGA 4CC4B 3M0QA 1X69A 5EC7A 1K76A 1O4HA 2NWMA 1MUZA 2RNAA 1M8MA 4AG1C 3HHMB 3EG3A 2F2WA 3H0HA 4Z88A 1Y1UA 1CSKA 4DGPA 3IQLA 5GJHA 2DCRA 1O4OA 4X6SA 3O5ZA 2DL3A 4LUEA 4A4BA 4OHHA 2OAWA 1MV0B 2JW4A 1SHAA 1O4PA 1VA7A 2DX1A 3MXCA 1BK2A 3NHNA 2B86A 1JYRA 2EKXA 3VS0A 1BBZA 2XMFA 4D8KA 2KK6A 3VGOA 1R1SA 1AB2A 1A1BA 4J9EA 1CSYA 2EGEA 1X6CA 1VYUA 1NZVA 3MAZA 1E7OA 2JS2A 2VIFA 2GQIA 1U3OA 1WYXA 1ARKA 1ZUYA 3UA7A 2LMJA 2IUIA 1KA6A 2GE9A 2ROLA 1W70A 4K45A 1KJWA 1MW4A 1YWPA 1A0NB 2EGCA 1H92A 2J6FA 5EHPA 3VS4A 4HVWA 4WCIA 2AOAA 2BZ8A 1KC2A 1P13A 3CD3A 1FYNA 5EHRA 2GTOA 1H3HA 3SHWA 3UYOA 2I0NA 3EAZA 4IIOA 1O4RA 1RPYA 4RTTA 2L3SA 2DL5A 2GBQA 1PHTA 1SEMA 2FPEA 3VRZA 1KFZA 1AWOA 3I35A 2B3OA 2DX0A 4M4ZA 5DF6A 1AWJA 1YN8A 3QWXX 3BUWB 3PLFB 2V1QA 2KYMA 5IH2A 3S8NA 1X0NA 1W1FA 1RQQC 2AUGA 5D0JA 4J9GA 1AYAA 3I5SA 3TKZA 5HKYA 1PKSA 4P9ZA 1UTIA 4AG2C 3PFVA 1AZEA 2LNHB 1XA6A 2HDVA 3VRNA 2LQNA 3N84A 5IBMA 3REAB 1IJRA 1GFCA 1OOTA 3PVLA 1BHHA 1WLPB 1UUEA 3BKBA 5FWBA 2EPDA 2RQRA 1JU5C 5GJIA 1JWOA 2VVKA 3VS7A 5GJVB 1CKAA 3MXYA 1O4KA 2CT4A 2MRKA 5FW9A 2F2VA 1BFJA 2D8JA 2ETZA 2C0OA 4GL9E 1NEGA 2M0YA 4FSSA 2X3WD 3S8OA 2EYWA 3LH5A 4QT7A 1F2FA 1U5SA 1SPRA 1O49A 3OVEA 2H5KA 2ECZA 1UJ0A 2EOBA 2FEIA 1R1QA 2FPDA 3VS6A 2LNXA 2D0NA 1M3AA 2LP5A 1SRMA 5HCKA 5IHNA 2EL8A 2JM8A 1FU5A 3EG2A 1V1CA 3OB2B 2YUNA 4JPBW 1OO4A 3VS2A 3I9QA 4HVUA 1O41A 4F5AA 5DC4A 4RTXA 1TUDA 5IBSA 1FHSA 1G83A 2CDTA 2DL7A 4F5BA 1SSHA 2A08A 2AK5A 2D8HA 2HCKA 3OB1B 2Y3AB 1YNZA 2K2MA 1UGVA 1F1WA 1JQQA 3US4A 2LCSA 2EO3A 1M61A 3JV3A 3GBQA 3TSWA 2ESWA 1GL5A 1U06A 4F17A 4CC2A 1T3LA 3UATA 2VKNA 4D8DA 1AOJA 1O4QA 2A28A 2ED0A 1LCKA 2KNBB 1MILA 3VS3A 2JMAA 1YVHA 1M3BA 1O42A 2AOBA 2O9SA 3IN8A 3QWYA 1O4NA 4IIMA 2SRCA 5HKZA 4ESRA 2YSQA 2CIAA 2KNOA 1FYRA 1G2BA 4H1OA 2M51A 1AD5A 4OMOA 2K7AB 2H46E 1O47A 2HDAA 1IO6A 3R6NA 3GXXA 1YCSB 2LJ3A 2C9WA 4K44A 4P9VA 2DLYA 4OHLA 1GCPA 2CH4A 2KT8A 1NLOC 2RSYA 1Z3KA 2MRJA 1BF5A 2DBKA 5IHKA 1JYQA 1WXTA 2DRMA 3ZL7C 2QMSA 1A07A 2K79B 2DA9A 1X27A 4F59A 1O4MA 2GGRA 2KE9A 2G6FX 3PVQA 4OMMA 2AZVA 1M27C 2OZOA 1M27A 2FG0A 1J3TA 4AFQC 1AYCA 3PJPA 1SPKA 2GSBA 1GHUA 2CREA 2HBWA 2KXCA 2JMCA 5FWCA 2JYQA 2OQ1A 1UDLA 4F14A 1S1NA 1D1ZA 1R1PA 4K2RA 3WA4A 1BG1A 1QCFA 3CBLA 1WA7A 2YU7A 2YT6A 4U17A 2MK2A 4A4CA 1GBQA 4J9DA 1ABOA 2JS0A 2DLPA 2DYBA 1AYBA 2PLDA 4K11A 2FPFA 1K4US 2HSPA 2NUZA 1A1CA 2L3PA 2RF0A 1SHBA 3HIZB 3S9KA 3VS1A 1WXBA 2SHPA 1E6GA 3GQIB 4JJDA 1X6BA 1X2QA 4LUDA 5DC0B 1O4JA 1QLYA 1KA7A 3PQZA 4EY0A 1K0SA 3N8MA 1FMKA 3NPFA 2DJQA 2HUWA 1Z9ZA 4LN2A 2EYZA 1I0CA 4E68A 4FL2A 2GTJA 1ZBJA 1ZUUA 2J6OA 1Y57A 2EBPA 1ABQA 4AFUC 2FRWA 2J06A 1SPSA 1HSQA 1K0XA 5L23A 4OHEA 2RPNA 4RTWA 4RTUA 3C7IA 1LKKA 2ROTA 1JU5A 1E6HA 2KGTA 4OHIA 4XZ0A 1NRVA 4NWGA 2KXDA 3BUNB 1NEBA 2HDXA 2CRHA 1LUIA 4FBNA 1PNJA 1O43A 2J7IA 1O4EA 2ECDA 1BLJA 2HEQA 1X43A 2YUPA 1RLPC 1H9OA 2KR3A 1T0JA 1TCEA 3M7FA 1WX6A 4CC7A 1ZX6A 2Y1NA 1CJ1A 2DMOA 1A81A 1O4FA 1LUNA 1PICA 1UFFA 2EQIA 2BZXA 1SHGA 2E5KA 3M0UA 4AFZC 1LUKA 3REBB 1ZSGA 1GCQC 2J05A 1SHDA 1BLKA 2X3XD 1JEGA 1FBVA 1RI9A 2RORA 2FRYA 1QKXA 5KAZA 4FL3A 2CUBA 2ABLA 2CR4A 3EACA 3EG0A 2HMHA 3TSZA 4JGHA 4E6RA 2XP1A 1PKTA 1VYTA 3RBBB 1CWEA 1A09A 1QADA 3H0IA 2RVFA 1K9AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NG2A 3P8BB 1V29B 2C0IA 2RMOA 2RHIA 2OJ2A 1VQ5A 1EFNA 4C92E 4RTVA 1BM2A 4ZNXA 3T9NA 5M9OA 1M90C 1UE9A 4M78E 3L2UA 2AT1B 1WFWA 2O31A 4JRPA 1TUCA 3A8MB 3CQTA 4A4HA 3CCVA 4M77F 2KI7A 2DTOA 5IXBA 3CCUT 2YRVA 3EH2A 2HBPA 4A54A 1LJOA 3PMTA 2Y90A 4FL6A 2P4RA 3N5BB 1ZBXA 4BDYA 3FDRA 2DXBA 2ED1A 1IHVA 1N9SA 3JB9D 1KQ2A 1Q82R 3OMCA 4DEXA 4PJOB 5CQYA 2QA4Q 1M3CA 2JTMA 5FLXE 2X4JA 4WTOB 1G3SA 1QG1E 4DEYA 3P8DA 4J7FA 5DLQE 1NZLA 1AWXA 5KYWB 5IXFA 2HL5C 5GMKe 3GOXA 3CXLA 1HK9A 3V8LA 2EU0A 4M7DD 1SKJA 3EHRA 1CKBA 1YIJA 2E65A 2XU8A 2E1HA 2GCXA 5CDWA 4JZ3A 1XOVA 1MNEA 4HCZA 3VUZA 4GBQA 2RQWA 5I22A 1YITT 1UUSA 4ZTFA 3S8LA 4AFSC 3FJ5A 1X2KA 3RNJA 2LJ0A 3UF4A 1O4GA 1BI1A 2P0PA 2C06A 5HKWA 3H41A 1YHQT 4DGXA 2MQIA 4M75A 3I56T 1KHIA 1N8RU 1O4DA 1YWOA 4JEGA 4A4GA 3CXCA 2IUGA 2KROA 2RD1A 1Y7XA 2A7YA 2LQWA 5CKDA 1PM3A 2MWPA 4FU6A 1ZLMA 1UJYA 2L4KA 1WQUA 2DVEA 2JVVA 1O4LA 3CCJT 3GLXA 2EYQA 4M7DB 4JS5A 1O44A 1VOMA 2V26A 4RG2A 4KUIA 3CBOA 4RTZA 1AWWA 2KDSA 5FU6C 1VQ8Q 1WXUA 4HKEA 2RJFA 4PJOC 4Y28E 1FMWA 1F1BB 3NMZC 2ZPFB 1Y07A 2KT1A 1Z9QA 2MPXC 5D6WA 1K8AU 1BKMA 4BI3A 5GAN6 4JUVA 3GXWA 4A4EA 2E3HA 1M2VA 1NM7A 5LJ5g 1NJIU 1ZFPE 2QDLA 4E93A 2XI9A 2DVJA 2ZPHB 3TL0A 1A08A 4C8QG 1AOUF 4CRIA 2MCNA 4GLMA 4JZ4A 4RUGA 4WF2A 2QAZA 1PC0A 1PSFA 1VYVA 4X9DA 2DF6A 2MAMA 1MV3A 5CIUA 2FCIA 3MEUA 1HXDA 3E9FA 4XZ1A 1YJWT 3LWHA 2VXEA 4BE0A 4F7UA 1HCTB 3IMJA 3VYHB 4OHDA 3M4YA 2RMXA 3X26B 2LTOA 5LJ5d 2PNBA 2LT1A 4FT2A 1I5OB 2E41A 3EH1A 4FW2A 2AHJB 4B6MA 1YP5A 1RLQC 1VQNA 1FU6A 4PJOF 3M0QA 2X4WA 1W4SA 1MUZA 2RNAA 1M8MA 3HHMB 1QVGA 1YI2A 2BE9B 2F2WA 1Y1UA 2E10A 3IQLA 1O4OA 1BI0A 2YLCA 2DL3A 2YRDA 4M7DC 2JW4A 2LDMA 2DX1A 1M1KR 2RHYA 2GFUA 1JYRA 2EKXA 3VGOA 1KK7A 1OZ3A 4J9EA 2YWWA 4IUQA 3HFOA 1NZVA 3MAZA 2VIFA 2GQIA 1U3OA 1ARKA 2LMJA 1W70A 3L2QA 1MW4A 1YWPA 2F69A 1H92A 3HL8A 3BY7A 2YHTA 2LT4A 9ATCB 5FRNA 5EHRA 2GTOA 3JCMc 3V7RA 1O4RA 4AT1B 3JB9F 5CKBA 4M77A 3CD6T 1PHTA 3VRZA 1KFZA 3I35A 1YN8A 3QWXX 2EQMA 4M75D 3RKYA 5D0JA 5HKYA 1PKSA 1OYXA 1YJNA 3EFRA 3G71T 2LNHB 1OU8A 2HDVA 5C6SA 2ZGWA 1Q7YR 3VRNA 4XK8E 5IAYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1NG2 A;  2C0I A;  2RMO A;  2DE0 X;  2V1R A;  1JXO A;  2OJ2 A;  4KRT A;  1EFN A;  2CSI A;  4RTV A;  1BM2 A;  4ZNX A;  1BHF A;  2KRS A;  4EIH A;  1UE9 A;  1BMB A;  1CWD L;  2LCT A;  1RJA A;  1WFW A;  2O31 A;  2O9V A;  2PLE A;  4ROJ A;  1JO8 A;  1SRL A;  1TUC A;  2DRK A;  2MIO A;  2MOX A;  3VRQ A;  3CQT A;  1Y0M A;  4U1P A;  2BTT A;  1WI7 A;  1UEC A;  4GPL B;  4JE4 A;  1A1E A;  1BU1 A;  3BUM B;  3C0C A;  1OPK A;  2CUD A;  4Z89 A;  5IXB A;  1M30 A;  2MC1 A;  5ECA A;  1QWF A;  3PE0 A;  1CSZ A;  3OV1 A;  1H8K A;  4LNP A;  2JM9 A;  4L1B B;  2EYX A;  1I3Z A;  1PRL C;  1LUM A;  1BHH B;  4J9H A;  1QWE A;  2K6D A;  4OMQ A;  4TZI A;  2P4R A;  3K2M A;  3UA6 A;  2KBT A;  4HCK A;  2KRM A;  4A63 B;  2PZ1 A;  2KRN A;  2ED1 A;  2BBU A;  2EVR A;  2YSX A;  1OPL A;  5J3X A;  5EEQ A;  2L0A A;  4DEX A;  5GJW B;  4R0K A;  2LZ6 B;  3CWG A;  5I6V A;  3VRO A;  1O48 A;  1W6X A;  1RUW A;  2LJ1 A;  1HD3 A;  1M3C A;  2AKK A;  4OMP A;  2F2X A;  1KSW A;  4CC3 A;  4LE9 A;  1QG1 E;  4DEY A;  2IUH A;  3HCK A;  2EGA A;  1OV3 A; 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