2LQWA

Solution structure of phosphorylated crkl
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
303
structure length
302
Chain Sequence
MSSARFDSSDRSAWYMGPVSRQEAQTRLQGQRHGMFLVRDSSTCPGDYVLSVSENSRVSHYIINSLPNRRFKIGDQEFDHLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPAPRYPSPPMGSVSAPNLPTAEDNLEYVRTLYDFPGNDAEDLPFKKGEILVIIEKPEEQWWSARNKDGRVGMIPVPYVEKLVRSSPHGKHGNRNSNSYGIPEPAHAAQPQTTTPLPAVSGSPGAAITPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
publication title Domain organization differences explain Bcr-Abl's preference for CrkL over CrkII.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Crk-like protein
total genus 41
structure length 302
sequence length 303
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
A PF07653 SH3_2 Variant SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA02
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqwA03
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2lqwA01
3GQIB 3BKBA 1GHUA 2ED0A 1U5SA 1G83A 1O44A 2L3PA 1GRIA 1R1PA 5I11A 4X6SA 2KE9A 2DL7A 4J9EA 1A09A 1WXBA 2BZXA 2GNCA 2PZ1A 1W70A 5EG3B 4JZ4A 1RUWA 4ZNXA 1O4JA 1QKXA 2DF6A 2JS2A 4DEXA 2L3SA 2LJ1A 2K79A 1OO3A 3EACA 1BHHB 2BTTA 1MILA 4GWFA 3SHWA 4FBNA 2RNAA 4AFZC 4K11A 1OOTA 1O43A 1O4MA 2YUQA 2K7AB 1UFFA 1X6CA 4Z88A 1O42A 1SKJA 4KRTA 4OHIA 2DX1A 2J05A 4JPBW 2CRHA 5GJVB 4AG2C 4U17A 4JJCA 3KFVA 1AZGB 1WXTA 3MXCA 3JV3A 1NG2A 3LH5A 4JEGA 3N7YA 1AOJA 3IN7A 2K3BA 3GXXA 2DE0X 4OHHA 1Y57A 2I0NA 1O4BA 1UDLA 1BKMA 4RTYA 1LUMA 4WCIA 2FRWA 2J6FA 3S8LA 1R1QA 1FU6A 2LCSA 2DLZA 2V1QA 5DC0B 3M7FA 3VRPA 4E6RA 4Y92A 2X3WD 5CDWA 2DRMA 2MIOA 4DEYA 3VRZA 2GBQA 4OMQA 1O4OA 1O4RA 1SRLA 1A08A 2PLEA 2DLPA 2RMXA 2DJQA 2NWMA 1AZEA 4D8DA 2MRJA 3H0HA 3M0TA 1BHHA 4JGHA 3RBBB 1X2KA 1D1ZA 5IBSA 1FMKA 2KXDA 3M0SA 1T0JA 1RPYA 3K2MA 2EYYA 1QG1E 1CJ1A 2VVKA 2IIMA 1X69A 1MUZA 5KAZA 2MRKA 4ESRA 1UG1A 2E5KA 1G2BA 3VS1A 2CDTA 2B86A 3VRQA 4FSSA 1FHSA 2K7AA 4EY0A 3H0IA 1A1AA 1F2FA 4F5BA 1OV3A 3N8MA 1PKTA 1FU5A 2J06A 2O31A 1TUDA 4OMOA 1GBRA 2CI9A 2H46E 1UUSA 1GCPA 1UECA 1XOVA 2JS0A 1XA6A 4L1BB 5GJHA 1IO6A 1O41A 2GGRA 4DGXA 4U1PA 1IS0A 4NWGA 4HVUA 3OVEA 3EGUA 2L4KA 2QDLA 4OMNA 1H9OA 1A07A 1O48A 1M27A 4HVWA 1M3AA 1BB9A 2Y1NA 3VROA 1T3LA 3EAZA 4RTUA 2HUWA 3VRYA 4F5AA 4F16A 1HCTB 2D8JA 2KYBA 1JWOA 1QWEA 2EU0A 2IUIA 1VYVA 4DGPA 2AOBA 1QKWA 1VYUA 1CSZA 1PKSA 2JYQA 4QT7A 1WYXA 2KT8A 1GFDA 2K79B 2YUPA 5IHNA 3TSWA 3CBLA 1PRLC 2AKLA 1YWPA 2A28A 5FWBA 5FW9A 3PVQA 2DVJA 2RQTA 1D4TA 3BUOB 2EYWA 1YN8A 1UE9A 3M0UA 3ULRB 1Y0MA 1Z9ZA 2M0YA 2KRMA 3M0RA 1WXUA 1A0NB 2SHPA 3PFVA 4ROJA 4A4CA 4RTZA 2MQIA 3IQLA 5I6VA 2SRCA 5IHIA 4R0KA 2L6KA 2K9GA 1CSYA 2ROLA 5EEQA 1HCSB 2OAWA 1KFZA 2Y1MA 1Z3KA 1NZLA 1O4HA 1SHBA 1WDXA 1NLPC 1ZFPE 4CC2A 4JE4A 2EKXA 2KXCA 2DBMA 4FL3A 2L0AA 1KA7A 4HXJA 1JYUA 1HD3A 1O45A 2J7IA 3HIZB 2HDXA 1PRMC 1VA7A 2W10A 1LUIA 2J6KA 1TG0A 1X43A 5DF6A 1NLOC 2L2PA 1YNZA 5L23A 2D0NA 3O5ZA 2KNOA 3BUNB 2DM1A 3VS5A 3HHMB 5DC4A 2EL8A 1BLJA 2EGAA 2VWFA 1SHFA 3VS0A 1FYNA 4AG1C 3VS2A 2YDLA 1O4KA 2BZYA 1EFNA 3C0CA 1RQQC 2FPEA 1YVLA 2JXBA 1AOTF 3VS4A 2AZSA 1KJWA 1FBVA 2RVFA 4Z89A 1I3ZA 1X6BA 2CH4A 3QWXX 2RQWA 1QCFA 2DL3A 4JZ3A 5IBMA 1BMBA 2LNXA 2OQ1A 4X1VA 4CC4B 3REAB 4WWQA 2FO0A 2CIAA 3PJPA 1M27C 2FRYA 1KSWA 3TKZA 5HKWA 4GPLB 4J9GA 4K45A 2A37A 1H8KA 2DNUA 2IUHA 1RLQC 2DBKA 2LCTA 2JMCA 2FG0A 2KR3A 4RTWA 2LQNA 2KGTA 1O49A 1BLKA 2KROA 1WX6A 2GTJA 3PVLA 3CD3A 2LNWA 1SHDA 2L3QA 2X3XD 2FCIA 2XP1A 1B47A 1AYDA 3BUMB 2AK5A 2JW4A 2KEAA 1BFIA 3A98A 3S8OA 1JYQA 3TL0A 2RQUA 3EHRA 2L3TA 1S1NA 2OZOA 1ZX6A 1A1CA 1WLPB 1O4DA 2RSYA 1JU5A 1PHTA 4XZ0A 1U06A 1B07A 4LNPA 4J9CA 2ECZA 2JT4A 2GSBA 3OV1A 2CT3A 1SPSA 3ZNIA 3PE0A 1AYBA 3CQTA 1LKKA 2EGEA 1O47A 4AFSC 2LNHB 4J9FA 2CREA 1UHFA 3BUXB 1TZEE 1W1FA 1TUCA 3NMZC 2CT4A 1LKLA 3PLFB 2ABLA 2F2XA 3NHNA 2EO3A 1OEBA 1AWWA 4E68A 2W0ZA 4OMPA 3QWYA 2EGCA 1YP5A 3SEMA 2ED1A 1NYGA 3VGOA 4J9BA 1E7OA 3M0PA 2DX0A 3GXWA 3H41A 5BO4A 5IXBA 2HMHA 2OJ2A 1UGVA 5FWCA 1K0SA 2EYZA 1GCQA 1M61A 2A36A 5EHPA 3WA4A 2ESWA 4OHDA 4E93A 4K2RA 1KIKA 3CWGA 1R1SA 2YUOA 1O4LA 2HBWA 1O4EA 1ZUKA 3VRRA 4RTTA 1YWOA 5IH2A 1UJ0A 3R6NA 2B3OA 4FL2A 4F17A 2JM8A 2KBTA 1P13A 1YVHA 4OMMA 1U3OA 1CSKA 1K1ZA 1E6HA 1X6GA 3M0QA 2AZVA 1KC2A 2EBPA 4QSYA 2RORA 2DA9A 1ZUYA 1SPRA 1BBZA 1H3HA 4J9HA 2EPDA 2VIFA 1UHCA 4LUEA 1TCEA 2IZVA 1N5ZA 1FYRA 3PQZA 2YUNA 3NPFA 4CC3A 5DC9A 2EQIA 4OMLA 1BK2A 1I1JA 3UA7A 3EG1A 4JJDA 5EHRA 1M30A 2JTEA 1D4WA 1ARKA 2DL4A 4OHLA 2O88A 2RMOA 1CWDL 1UJYA 4F59A 2AOAA 2PNAA 2QMSA 1PICA 2YT6A 3CXLA 3PS5A 1KA6A 3HCKA 1JXOA 1GL5A 2F2WA 2HCKA 2LJ0A 2EW3A 3C7IA 1LUKA 2G6FX 2MK2A 2CSQA 1OPLA 1K76A 4XZ1A 5I22A 3ZL7C 2DL5A 3UA6A 1QLYA 2GQIA 5GJIA 2DLYA 2ROTA 1GBQA 1ABOA 1K0XA 5AXIA 4A4BA 3EG2A 4IIOA 1LCKA 2ETZA 2K2MA 1X0NA 1SPKA 3U23A 4EIKA 2GE9A 3OB1B 1A1EA 1PWTA 2A08A 4IIMA 4M4ZA 5IXFA 2LX7A 2DMOA 2ENMA 3TSZA 3PSJA 5J3XA 2FEIA 3UF4A 2LMJA 1Y1UA 1AOUF 4AFQC 4TZIA 1GCQC 1VYTA 1MV0B 1M3BA 4P9ZA 1AYAA 3I5RA 1JXMA 1AB2A 2O2OA 2BZ8A 3S9KA 2O9SA 1LCJA 1WQUA 1QWFA 2KNBB 1BM2A 2DRKA 2DYBA 3I35A 2MC1A 2RF0A 2EKHA 1M3CA 2VKNA 1UTIA 1K9AA 3VS7A 4OHEA 1NRVA 1BHFA 2FPFA 4LE9A 1JYRA 1UUEA 3GBQA 4GL9E 1BF5A 1MV3A 3IN8A 3RNJA 1BKLA 2KRNA 2CUDA 2O9VA 4RTVA 2YU7A 2LP5A 1SEMA 1AYCA 1O4CA 1BU1A 1ABQA 1PNJA 1RI9A 2PLDA 2D8HA 3REBB 2NUZA 1BFJA 1JQQA 4H1OA 2HEQA 1O4FA 2CR4A 4ORZA 1NYFA 1IJRA 2DM0A 3UATA 1NM7A 1O46A 3MXYA 2LZ6B 2YSQA 1O4NA 1A81A 2BBUA 5HKYA 4RUGA 3IMDA 3H0FA 4NWFA 1W6XA 1I07A 3KFJA 1CWEA 2CBLA 5AULA 5EELA 1UURA 1ZSGA 1NZVA 2C0IA 1CKBA 5EC7A 2CSIA 4HVVA 3EG0A 1QADA 1HJDA 2ECDA 2FPDA 2MOXA 2J6OA 1LUNA 4Z8AA 1AVZC 1AWXA 2PNBA 1X2QA 3I9QA 2AUGA 3VRNA 1T3SA 2EYVA 1J3TA 3MAZA 2EO6A 5HCKA 4AFUC 4RTXA 2DL8A 1AWJA 4JJBA 3I5SA 2H8HA 1FBZA 1M8MA 2Y3AB 1ZBJA 2CUBA 1BG1A 2HDVA 3EHQA 1Z9QA 4HCKA 2CS0A 2DILA 3NGPA 1SRMA 3UYOA 1O4PA 1JEGA 4LN2A 1E6GA 2EOBA 4K44A 2M51A 5HKZA 3US4A 5D0JA 2PTKA 1MW4A 3OB2B 5ECAA 2JM9A 3BUWB 1O4GA 2SEMA 1K4US 2EYXA 3FJ5A 4D8KA 3S8NA 1SHGA 2RN8A 2IUGA 1ZUUA 4LUDA 1SHAA 2D1XA 2LQWA 1WA7A 2RQVA 1O4QA 1AD5A 2AKKA 3VS3A 3PSKA 3VS6A 3T04A 1YCSB 1WI7A 2HSPA 1NEGA 2JMAA 2HDAA 2OI3A 2RPNA 1O4AA 2MCNA 4A63B 1B3QA 2YSXA 1T0HA 2RQRA 4P9VA 2V1RA 1H92A 2PNIA 1A1BA 2KK6A 2F2VA 2C0OA 4J9IA 1X27A 1NEBA 3TVTA 4GLMA 1JU5C 1OO4A 2LJ3A 4J9DA 5GJWB 1OPKA 1F1WA 3IMJA 2C0TA 2H5KA 1O4IA 1AWOA 4GBQA 1ZLMA 5IHKA 2CI8A 1HSQA 1I0CA 1SSHA 2GTOA 2K6DA 2KRSA 1RJAA 2P4RA 2DCRA 4EIHA 1GFCA 4F14A 2EVRA 2C9WA 3EG3A 1RLPC 2CH4W 3N84A 1CKAA 1WIEA 3THKA 1V1CA 1WFWA 3OP0A 2KYMA 4CC7A 2XMFA 4H34A 2KT1A 1JO8A 1AEYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BKDN 2ED0A 1O44A 1G83A 1GRIA 2CP6A 3VKIA 1WXBA 4LDWA 5D6XA 3OSSC 1QKXA 2DF6A 2JS2A 2K4YA 3M54A 4DEXA 1S72Q 2L3SA 2LJ1A 2K79A 4KUDK 1OO3A 2BTTA 5KYYA 1FWZA 4GWFA 1O43A 1O4MA 3CC2Q 2K7AB 3EGDA 1SKJA 4KRTA 3C95A 3QBYA 3KFVA 2A3LA 3I56Q 1VQLT 3RKXA 2I0NA 2O4XA 1BKMA 4RTYA 2J6FA 2DLZA 2V1QA 3M7FA 2AIRB 4Y92A 1OU8A 2DRMA 2MIOA 4DEYA 3VRZA 1VQKA 4OMQA 1KD1U 3CC2A 3L1AA 4D8DA 4ELYC 2E41A 1BHHA 3RBBB 1X2KA 4N0AA 5GAMj 1RPYA 1QQJA 3I56A 2QA4T 2VVKA 3E19A 5KAZA 4MZTA 2CDTA 2B86A 2KDSA 4EY0A 1OV3A 1VQ6Q 1GBRA 2CP3A 2CI9A 1UECA 1D1BA 1QVGS 1IO6A 4DGXA 4U1PA 4MZPA 4NWGA 4JS5A 2QDLA 4XTXA 4HVWA 1M3AA 1T3LA 3EAZA 4RTUA 4F5AA 2IUIA 1QWEA 1NZ9A 1VYVA 1KD1C 4DGPA 2AOBA 1VQ5Q 1YJNA 1K73R 3QHSA 2JVVA 3OW2S 2JYQA 4QT7A 3J7AF 2KT8A 2YUPA 3TSWA 3CMET 2AKLA 1MMAA 2A28A 5FWBA 1VQ6A 1RAFB 2DERA 1D4TA 2EYWA 1UGRB 1UE9A 2K3YA 3ULRB 2XG8D 1A0NB 1AT1B 2NUTB 2JZ2A 2MQIA 2JTFA 2SRCA 5IHIA 4XTYA 1CSYA 5EEQA 3KUFA 1Z3KA 2CP0A 1O4HA 5C0MA 1WDXA 1ZFPE 1D0ZA 4CC2A 4ZN3A 2EKXA 2KXCA 1JYUA 1V29B 1YITA 1VQ7T 1TG0A 2QI2A 5DF6A 1LVKA 4QVZA 2L2PA 4J8OA 3HHMB 4JRQA 2HQXA 5DC4A 2E1HA 2FVUA 4E7LA 2KMTA 2D0QB 3VS2A 3NTHA 1RQQC 3S3NA 1YVLA 2ZZDA 1RAAB 3CPWS 1AOTF 1QP3A 5AYFA 1KJWA 2CH4A 4JZ3A 1BMBA 2ZCFB 1OX8A 2RHXA 4CC4B 3REAB 2JTMA 4WWQA 2CIAA 2V8JA 3PJPA 1YHQT 2FRYA 3TKZA 1H8KA 2DNUA 1RLQC 2DBKA 2JMCA 4FCYA 4RTWA 4BI3A 1VQNT 2QGGA 1O49A 2GTJA 1I81A 1VQ9Q 3QDFA 3CD3A 1HXDA 3G6ET 1SHDA 3QZ9B 2XP1A 3BUMB 2AK5A 1BFIA 1OX9A 3A98A 2RQUA 3VUZA 3WXMB 3EHRA 4C8QE 2L3TA 1S1NA 1VQPT 4D6WA 3M5AA 4XK8E 3CC4T 1Q81U 2OZOA 1TOVA 5J3BA 3EFRA 1Y96B 2YXYA 1WLPB 2B8AA 1JU5A 4HKEA 3L2ZA 1I5LA 1PHTA 4XZ0A 4X9DA 4L6V5 2JT4A 4V2SA 2CT3A 3TQ7P 2EAYA 2VV5A 5KCOA 2RJEA 4KUIA 3GNGA 1TUCA 3NMZC 2CT4A 1LKLA 2CP2A 2IVWA 4P5NA 3SD4A 4OMPA 2EGCA 3JCMJ 1K8AC 4IURA 1E7OA 2DX0A 3H41A 4C8QB 3SDZA 1UGVA 3TREA 3OYAA 1M61A 4KGXB 2F5TX 1Q81C 2RHUA 1U8RA 1YJ9T 1PCXA 2P4TA 1Q82R 3WA4A 2ESWA 4OHDA 3CD6A 3CWGA 1LOJA 4C92B 2DYIA 2RJCA 5IH2A 1UJ0A 3R6NA 2COYA 3JRZA 1YVHA 3X28B 1U3OA 2OTLT 1E6HA 3M0QA 5J39A 3OYNA 2F5KA 1H3HA 2VIFA 1UHCA 3FRNA 1TCEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3GQI B;  3BKB A;  1GHU A;  2ED0 A;  1U5S A;  1G83 A;  1O44 A;  2L3P A;  1GRI A;  1R1P A;  5I11 A;  4X6S A;  2KE9 A;  2DL7 A;  4J9E A;  1A09 A;  1WXB A;  2BZX A;  2GNC A;  2PZ1 A;  1W70 A;  5EG3 B;  4JZ4 A;  1RUW A;  4ZNX A;  1O4J A;  1QKX A;  2DF6 A;  2JS2 A;  4DEX A;  2L3S A;  2LJ1 A;  2K79 A;  1OO3 A;  3EAC A;  1BHH B;  2BTT A;  1MIL A;  4GWF A;  3SHW A;  4FBN A;  2RNA A;  4AFZ C;  4K11 A;  1OOT A;  1O43 A;  1O4M A;  2YUQ A;  2K7A B;  1UFF A;  1X6C A;  4Z88 A;  1O42 A;  1SKJ A;  4KRT A;  4OHI A;  2DX1 A;  2J05 A;  4JPB W;  2CRH A;  5GJV B;  4AG2 C;  4U17 A;  4JJC A;  3KFV A;  1AZG B;  1WXT A;  3MXC A;  3JV3 A;  1NG2 A;  3LH5 A;  4JEG A;  3N7Y A;  1AOJ A;  3IN7 A;  2K3B A;  3GXX A;  2DE0 X;  4OHH A;  1Y57 A;  2I0N A;  1O4B A;  1UDL A;  1BKM A;  4RTY A;  1LUM A;  4WCI A;  2FRW A;  2J6F A;  3S8L A;  1R1Q A;  1FU6 A;  2LCS A;  2DLZ A;  2V1Q A;  5DC0 B;  3M7F A;  3VRP A;  4E6R A;  4Y92 A;  2X3W D;  5CDW A;  2DRM A;  2MIO A;  4DEY A;  3VRZ A;  2GBQ A;  4OMQ A;  1O4O A;  1O4R A;  1SRL A;  1A08 A; 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