4M4ZA

Sh3 and sh2 domains of human src-like adaptor protein 2 (slap2)
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
158
structure length
152
Chain Sequence
TAVALGSFPLSLRLGEPLTIVSEDGDWWTVLSEVSGREYNIPSVHVAKVSHGWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQTRRGSYSLSVRLSRPASWDRIRHYRIHCLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSELADDICCLLKEPCVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of Src-like adaptor protein 2 reveals close association of SH3 and SH2 domains through beta-sheet formation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Src-like-adapter 2
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
total genus 36
structure length 152
sequence length 158
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 4m4zA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4m4zA02
1UTIA 2O31A 4K45A 2CT3A 1CWDL 2DA9A 4HVVA 4E68A 3VRZA 5HKWA 2NWMA 3I5RA 1KSWA 4NWGA 3EG3A 2AOBA 1UECA 1JYRA 2YUPA 2KNBB 3S8OA 4LUDA 2EKXA 2C0OA 4FL2A 1WXUA 2DLYA 2OZOA 4D8DA 1U5SA 3TKZA 1R1QA 1PKSA 1MV0B 2KBTA 1X0NA 1MUZA 2KYMA 1HCTB 1AZGB 1O4QA 1ZUYA 5AXIA 2CUDA 1A1CA 1QLYA 2FO0A 1I07A 2D8HA 2O88A 2L3PA 1O4BA 4RTYA 1Y1UA 3T04A 3EG1A 4FL3A 3S9KA 4J9GA 3VS5A 1AB2A 1BU1A 1K0XA 2KK6A 1G83A 4U17A 2EQIA 2KRSA 2PNIA 3IN7A 3IN8A 2VWFA 5IHNA 2L6KA 1KIKA 3VROA 4H34A 3BUXB 4A63B 1M3AA 1GBQA 1JXOA 2DRMA 5GJHA 2GTOA 1UDLA 1NM7A 2J6KA 4GBQA 2JM8A 1HSQA 4D8KA 3OP0A 3TL0A 2VKNA 1V1CA 2K2MA 3NHNA 3VS4A 1P13A 3IMDA 1UFFA 2F2VA 4F16A 5DC0B 1O4EA 4OMOA 1QWEA 2BZXA 2LJ0A 5HCKA 2FPEA 4RTZA 1JU5A 2DLPA 4LE9A 1MW4A 1QKXA 3JV3A 1SHAA 1WQUA 2EVRA 3VS3A 3H0HA 3VRYA 1WX6A 2HBWA 1T0JA 3NPFA 1GL5A 2LJ1A 4CC4B 4AFSC 1NYGA 2DYBA 5BO4A 3VS1A 2DM0A 1UGVA 3I5SA 1IS0A 2RQWA 3BUWB 1O4GA 4QT7A 1M3BA 1U06A 2FCIA 4HVUA 1TZEE 4E93A 2EGEA 2ENMA 2FPDA 4ZNXA 2LCSA 1MILA 5I22A 2IUIA 5L23A 1RQQC 2CUBA 3GQIB 1X43A 1GHUA 1Y0MA 1AEYA 2KT1A 3UATA 2OQ1A 2JMAA 1X6BA 1RLQC 1RJAA 1O47A 2IIMA 1PKTA 1E7OA 2M51A 5IBSA 1NG2A 5HKZA 3EG0A 2EO3A 1OPKA 2K79A 2L4KA 1M27C 4JGHA 1O4DA 1ZUKA 2KGTA 3LH5A 3M0QA 2KRNA 1FYRA 2YUNA 3PVQA 2RMOA 3CQTA 4ORZA 2CI9A 2DJQA 2RQVA 1K0SA 1M30A 1YWOA 2OJ2A 1O41A 2DL8A 2DLZA 2LNXA 1CSKA 2ROTA 2YT6A 2IUGA 3CWGA 1BG1A 2DF6A 2PNAA 2X3WD 1SSHA 2HDXA 2K6DA 3THKA 5D0JA 2JT4A 1OOTA 1AYDA 3VRRA 2K7AB 2E5KA 3HIZB 1AYBA 2EW3A 2EBPA 2PLEA 2LMJA 2XP1A 3QWXX 2AUGA 1O4HA 2EGCA 1O4OA 1NEGA 4LNPA 2SHPA 4F5BA 3S8LA 2BZ8A 2XMFA 2OAWA 3IMJA 2LP5A 2JYQA 2OI3A 3OVEA 1OPLA 1O4FA 3HHMB 4J9EA 1JEGA 2L2PA 1R1SA 3KFJA 1JQQA 1Z9QA 2L0AA 1H92A 1SPSA 2A37A 2ABLA 1SRLA 3GXXA 1OEBA 1TUCA 2DE0X 3EGUA 1O4IA 2BBUA 2VIFA 1SHFA 3QWYA 5IBMA 1BHFA 5GJVB 1ABOA 3GBQA 1R1PA 1UHCA 2DRKA 1B47A 1GCPA 4J9BA 1D4TA 1UURA 1M3CA 2DX0A 3PQZA 1NLOC 4A4CA 5EC7A 1OO4A 1AZEA 4OHLA 2DMOA 3VRQA 2YUOA 4AFQC 2DBMA 2GTJA 3PS5A 2LQNA 3C7IA 1OO3A 2AZVA 1SPKA 3M0RA 3BUOB 4IIMA 1AWWA 1YVLA 3EAZA 5EG3B 1X2QA 1JU5C 1JO8A 2JTEA 4M4ZA 1WLPB 5DF6A 2DX1A 1BKMA 1KC2A 4JEGA 3RNJA 2ED0A 2JS0A 5EHRA 3OV1A 2JXBA 3M0PA 1M61A 4FSSA 3A98A 4EY0A 3C0CA 1BM2A 1Z9ZA 2AK5A 2HSPA 2HDAA 5HKYA 2HCKA 2QMSA 2A08A 3WA4A 2P4RA 1NRVA 2CDTA 1AOTF 2VVKA 1FHSA 2RQRA 2J05A 4CC7A 4OHIA 4OMPA 2DL7A 4RTWA 4RTUA 5DC9A 4Z89A 1QADA 1I3ZA 3CBLA 2DILA 2DM1A 3VS2A 2JW4A 1YCSB 4OMLA 3VS6A 3M0TA 2O9VA 4JJDA 3OB2B 5EELA 2AOAA 3MXYA 1RUWA 1N5ZA 2J7IA 5EEQA 2HEQA 2CSQA 4F14A 2EOBA 2DCRA 2LCTA 2RORA 2KRMA 4J9CA 2FRWA 1VYTA 2V1RA 3CXLA 2C0IA 1LUMA 2K79B 3ULRB 1ZX6A 3ZNIA 1T3LA 1AOJA 2C0TA 4CC3A 4DGXA 5DC4A 3TSWA 2I0NA 2CI8A 3EG2A 1A1AA 3PSKA 1NLPC 1UG1A 2FRYA 5GJWB 4OMNA 1O44A 2ECZA 1WXTA 4H1OA 3BUMB 2KR3A 1SHDA 1I1JA 1QG1E 1LCKA 2DVJA 2L3QA 1UJYA 4X6SA 1IO6A 2J6OA 3I9QA 2BZYA 1O4JA 1SPRA 1YVHA 4AG1C 1F2FA 3N8MA 3PVLA 1UUEA 2G6FX 4EIHA 4DGPA 3U23A 4JPBW 3SEMA 1O4CA 2GGRA 1PNJA 2CH4A 4TZIA 1O4NA 1HD3A 1KA7A 1A1BA 2RN8A 1PWTA 3UA6A 1BHHB 5IXFA 2H8HA 1SRMA 3I35A 4ROJA 5IXBA 3NMZC 2B3OA 4EIKA 1IJRA 3VS7A 1UE9A 2LJ3A 3PJPA 1ARKA 2PLDA 5I6VA 2D1XA 2YU7A 2Y1NA 3OB1B 1ZBJA 1FYNA 2KXDA 1AWJA 1HCSB 5CDWA 4GL9E 3FJ5A 1TUDA 1H8KA 2F2WA 1GBRA 4R0KA 1LKLA 4RUGA 2ROLA 2CSIA 1FU6A 3N84A 2FG0A 1ZFPE 3UF4A 4E6RA 4K11A 4J9FA 1WDXA 1O4MA 3BUNB 1SKJA 5FWCA 2MC1A 1T0HA 1LKKA 1A0NB 4L1BB 2RNAA 1NYFA 1O48A 1BFIA 2RQTA 1BB9A 4P9VA 1SHBA 4DEXA 2W10A 1T3SA 1VYUA 2C9WA 1BLKA 3IQLA 3M0UA 2KXCA 4Y92A 3US4A 1YNZA 2J6FA 2YDLA 1BBZA 1LUNA 4OMMA 1KA6A 4K44A 2AKLA 1LUIA 2EYVA 2Y3AB 1KFZA 1W70A 2CIAA 1AWXA 3H41A 1ZSGA 3M7FA 2NUZA 3MXCA 1H3HA 2EPDA 4LUEA 1YN8A 2EGAA 4AFZC 1BFJA 4XZ0A 2PTKA 2Y1MA 1Z3KA 3UA7A 1ZUUA 4OHEA 2KEAA 1O4LA 2SRCA 1A81A 2X3XD 1AYCA 2DL3A 1JYQA 3S8NA 1OV3A 2AZSA 1AD5A 1WFWA 3GXWA 4GLMA 1NZVA 2H46E 2GQIA 1W6XA 1AVZC 1JXMA 3CD3A 1CSYA 1CSZA 1O49A 4NWFA 4A4BA 4KRTA 2AKKA 2GBQA 2K7AA 1E6GA 5I11A 1QCFA 2DNUA 2CR4A 1VA7A 2HUWA 1U3OA 1RPYA 3BKBA 1O43A 3VRNA 1AYAA 4K2RA 3KFVA 1BF5A 1J3TA 1NEBA 1UHFA 1X6CA 4F59A 1FBZA 4JJBA 1QWFA 2RF0A 1KJWA 2KE9A 5J3XA 1H9OA 2EYYA 3MAZA 4XZ1A 4ESRA 2MOXA 5FWBA 4IIOA 5IHKA 2L3SA 2K9GA 2IZVA 5ECAA 1O42A 2ECDA 4FBNA 5EHPA 2ED1A 4AG2C 2J06A 2CRHA 3UYOA 2A28A 1K4US 2JMCA 1B3QA 1X27A 4AFUC 1O46A 5IH2A 1GCQA 4CC2A 3R6NA 3NGPA 1VYVA 2CH4W 1UUSA 1BLJA 3VS0A 1QKWA 4DEYA 1X6GA 2HDVA 2H5KA 5KAZA 4J9IA 1D1ZA 2CBLA 1GCQC 1RLPC 2RQUA 2HMHA 1NZLA 1O4RA 1PRMC 1K9AA 2RPNA 1XA6A 2EU0A 2MRKA 1WI7A 1K76A 3EHQA 4QSYA 2MK2A 1MV3A 3K2MA 2ESWA 2QDLA 1AWOA 4J9HA 4X1VA 4F5AA 1I0CA 4J9DA 2F2XA 1E6HA 2FPFA 1A07A 1O4PA 2GSBA 2SEMA 1GFCA 2LNWA 2RVFA 1O4AA 2RMXA 5GJIA 1K1ZA 4F17A 1SEMA 1A09A 2MQIA 2V1QA 2EO6A 2KROA 3PLFB 3HCKA 2B86A 3PE0A 1A1EA 4U1PA 1O4KA 1PICA 4RTXA 1A08A 2O9SA 1UJ0A 3TVTA 2YSXA 3TSZA 1D4WA 1Y57A 2RSYA 1WA7A 2JM9A 5AULA 4RTTA 2LZ6B 1G2BA 1JYUA 2YUQA 2KNOA 2K3BA 3EACA 1YWPA 1PHTA 1BKLA 5FW9A 1FBVA 3ZL7C 3VGOA 1YP5A 2CT4A 2EYXA 3N7YA 2PNBA 1XOVA 3H0FA 4JZ4A 2D8JA 4JJCA 3REAB 4OHHA 1CKBA 2DL4A 1WYXA 1TCEA 2JS2A 1GRIA 4RTVA 2ETZA 3PSJA 2MIOA 3H0IA 1O45A 3VRPA 1CJ1A 3PFVA 3REBB 1LCJA 2YSQA 1JWOA 2L3TA 1BK2A 4HXJA 4GPLB 2W0ZA 2LX7A 3RBBB 2D0NA 2FEIA 1RI9A 2GNCA 4Z88A 2GE9A 2BTTA 2LQWA 1WXBA 2EYZA 1HJDA 4WWQA 1CKAA 4GWFA 2KYBA 2PZ1A 4Z8AA 1ZLMA 2EL8A 4OHDA 3O5ZA 1X69A 4P9ZA 4HCKA 1BMBA 1X2KA 1GFDA 2LNHB 4OMQA 5IHIA 1M8MA 2M0YA 2A36A 4WCIA 4JE4A 1F1WA 2KT8A 1W1FA 3EHRA 2MCNA 1BHHA 1FU5A 1PRLC 1S1NA 1CWEA 1LUKA 1M27A 2O2OA 2EKHA 2CS0A 1WIEA 4HVWA 2CREA 2DBKA 2DL5A 1B07A 1AOUF 2IUHA 4JZ3A 1ABQA 2MRJA 1FMKA 1EFNA 3SHWA 2EYWA 1TG0A 4LN2A 1SHGA 3M0SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RI5A 2KAFA 1YI2A 4KBMB 2CT3A 1CWDL 2DA9A 3R6OA 3A5ZB 4C92A 1KSWA 4NWGA 1YJNQ 4FYWB 2EKXA 2XDPA 1N8RU 4D8DA 1R1QA 1MV0B 1X0NA 1MUZA 2F5TX 2MPXC 1AT1B 3CBPA 1HCTB 1R0BG 2RK2A 4BE1A 5AXIA 1A1CA 1OULA 2RB6A 5GANd 4BE0A 1IHVA 4JJNK 2FO0A 2D8HA 1QVFP 2O88A 3PGGA 4JLGA 4N4GA 6AT1B 3EG1A 2I2LA 4J9GA 4M77C 4O5VA 4JS5A 2D6FA 2QTXA 4LDWA 2EQUA 2KRSA 3FIFA 3IN7A 2EWNA 2VWFA 5IHNA 3CCLQ 3HL8A 1KIKA 3VROA 4H34A 4A63B 1JXOA 1JB0E 4GBQA 2P0KA 2E12A 3OP0A 1Q95G 4JDSA 1P13A 3VS4A 2R5AA 4OMOA 3RMSA 1QWEA 4EMKC 1VQNT 1JU5A 2DLPA 5AYFA 1OX8A 2EVRA 3CCST 3MP1A 1WHGA 1WGSA 3VYHB 1VQKA 1AHJB 3CCJA 2LJ1A 5C0MA 2PUKB 5FU7C 3CXCS 3RERA 1UGVA 2H3JA 3JCMg 3C94A 2XG8D 2EGEA 2K4YA 2IUIA 1GHUA 1Y0MA 3M59A 5A0GA 1RLQC 2XU8A 3RR6A 1PKTA 1E7OA 1QQJA 1NG2A 1UEBA 1YHQA 4LDVA 1M27C 4JGHA 1O4DA 3INZA 3QO3A 2KGTA 5GAOm 1FYRA 5CKBA 1ZSZA 3L42A 4QVCA 1M30A 2BE7D 2DD4A 1CSKA 1K8AR 1HXDA 2YXYA 3BE3A 5LJ5d 3OYIA 3RKWA 3PIPA 3V7CA 3CWGA 4C0DB 2PNAA 3CMEQ 1YIJA 1OOTA 3VRRA 4XU3A 3JAME 2YLCA 2L5QA 2PLEA 4KH0B 2AUGA 1O4HA 4M78E 5KCOA 3S8LA 2XMFA 2EJ9A 1M1GA 4LXCA 4EDUA 5CCAA 4J9EA 3FC3A 3DLLA 3KFJA 1Z9QA 2K2VA 2L0AA 1H92A 3E19A 1N27A 2A37A 2VUBA 2ABLA 1SRLA 1VQ9T 3GXXA 2P0QA 1QVFA 5CVIA 3CD6Q 1EX4A 5KE2A 2DD5A 1ABOA 3GBQA 1R1PA 2IPOB 2DRKA 3LYVA 3PQZA 2A7YA 1NLOC 4A4CA 5EC7A 3LX7A 2DMOA 5DLQE 1C0MA 1K9MC 2AZVA 1SPKA 4IIMA 2HSEB 2VB6A 2QEXT 1JO8A 4M4ZA 4GY5A 5DF6A 2DX1A 4A4FA 2MWOA 4F7UB 2PQWA 3OV1A 2DZCA 5GAMe 4FSSA 3C0CA 2AK5A 5HKYA 2QMSA 2E41A 2A08A 2P4RA 1D09B 4FT2A 1TU0B 1AOTF 2VVKA 3E2UA 2RQRA 4JRPA 2LT4A 4EMHA 1I3ZA 2DILA 4EPCA 1M1KC 4XU1A 3VS6A 4JJDA 5HY6A 1RUWA 4DBFA 5EEQA 1B34A 3QHSA 2CSQA 4F14A 1TOVA 2LCTA 1WHMA 2RORA 4WTOB 1KD1C 1WPYA 1VYTA 4IURA 4J5YA 3CXLA 2C0IA 3VV0A 3ULRB 1Y7XA 5DC4A 4ZTJA 4P5NA 3MEUA 4OMNA 3QDRB 1XNIA 2ECZA 5GAMj 5GAN3 1WXTA 1RABB 4XTUA 4M77G 1VQKQ 3CCJQ 2L3QA 4IUUA 1IO6A 2QDYB 2RD1A 1SPRA 4PLIA 5GAMh 4M7DA 3N8MA 1S72A 2EQKA 3MPUB 4JPBW 2RHXA 3SEMA 4KGZB 3DB4A 1O4NA 1HD3A 1BCMA 1PWTA 1BIBA 2DFUA 1MNDA 4FIBA 5IXFA 3I35A 1YJ9A 1QVGP 3CCQQ 2HD0A 2B3OA 3VS7A 5D6WA 4FW2A 1ARKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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