2LQNA

Solution structure of crkl
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
303
structure length
303
Chain Sequence
MSSARFDSSDRSAWYMGPVSRQEAQTRLQGQRHGMFLVRDSSTCPGDYVLSVSENSRVSHYIINSLPNRRFKIGDQEFDHLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPAPRYPSPPMGSVSAPNLPTAEDNLEYVRTLYDFPGNDAEDLPFKKGEILVIIEKPEEQWWSARNKDGRVGMIPVPYVEKLVRSSPHGKHGNRNSNSYGIPEPAHAYAQPQTTTPLPAVSGSPGAAITPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Domain organization differences explain Bcr-Abl's preference for CrkL over CrkII.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Crk-like protein
total genus 52
structure length 303
sequence length 303
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
A PF07653 SH3_2 Variant SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqnA02
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqnA03
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2lqnA01
2F2VA 1IJRA 1JYUA 1A08A 4ESRA 4CC2A 3VRZA 2L0AA 2K79A 1GFDA 2HUWA 5I6VA 2QMSA 1NEBA 2G6FX 1AYAA 2VIFA 2IUIA 2NUZA 5DC4A 2EYXA 1HD3A 1OOTA 1SHBA 5I11A 2HCKA 2OAWA 1JXMA 2EO6A 1O4RA 2DM0A 3VRYA 5CDWA 4P9ZA 1VYUA 2EO3A 2HSPA 2J6OA 1WDXA 4QSYA 1AOJA 3GXXA 3EG1A 4HVVA 1O4NA 5IHIA 3MXYA 1YVHA 2KRMA 3BUNB 3BUXB 1EFNA 1S1NA 4LE9A 1RPYA 2RNAA 3VROA 1M8MA 3U23A 1HCTB 3NHNA 4FSSA 2W10A 2CI8A 3C0CA 1K1ZA 1X0NA 1NZVA 1O4LA 3IN7A 1O4FA 2BZ8A 1ZBJA 1SHGA 2JM8A 1PKSA 3VS5A 2CRHA 2DX1A 1KC2A 5GJHA 1M3BA 2M51A 1NLPC 2RPNA 4D8DA 2KBTA 2HDAA 4JJBA 4IIMA 3TSZA 5GJIA 2IUHA 2VKNA 3M7FA 1F1WA 2CS0A 1ZLMA 1E6HA 2HDVA 1GCQA 2K7AA 1U06A 4KRTA 1K9AA 1NYFA 4X1VA 3OV1A 2P4RA 1Y1UA 1K4US 1X6GA 4JPBW 1UG1A 3UATA 4LN2A 1O4JA 2L4KA 1TZEE 1WLPB 3EG0A 3R6NA 2KK6A 3PS5A 1OO3A 3JV3A 2JM9A 1Y0MA 3T04A 3PVQA 1NLOC 1T3LA 2D8JA 1KA6A 1GRIA 2ROLA 1QKWA 1YN8A 2C0OA 2DM1A 1T3SA 3UA7A 2RORA 2H8HA 2OI3A 5EELA 1W70A 1AWOA 4GPLB 2KT8A 1MV0B 2I0NA 4U1PA 2DYBA 1A07A 1WIEA 4J9GA 4E68A 4CC7A 1HJDA 2K9GA 4A63B 2F2XA 4DEXA 2L2PA 4K45A 2FEIA 1D4WA 2CDTA 2LZ6B 2KE9A 1H9OA 1HCSB 1B3QA 1UHCA 2KNOA 2BZXA 2GTJA 1KIKA 4JE4A 1NG2A 1W6XA 2CBLA 2BTTA 1FYRA 4Y92A 1LKKA 3TSWA 1O4QA 1QKXA 3EGUA 1OO4A 1FU5A 2CT3A 2ENMA 2MRJA 1KA7A 5AXIA 4OHIA 4LUDA 4OHHA 2JW4A 4RTXA 3GBQA 3O5ZA 5I22A 3BKBA 3EACA 3N84A 1AWJA 3LH5A 1NYGA 1ZSGA 2K7AB 3BUMB 2D0NA 1LKLA 3BUOB 1TUDA 1WYXA 1MW4A 2MIOA 3TVTA 2QDLA 5HCKA 4F5BA 1O44A 1UECA 1QLYA 2H46E 5IHNA 4L1BB 4OHDA 2DLPA 2EYVA 1ZUYA 4EIKA 1O48A 1BKLA 2CSIA 1AYBA 3OB1B 3TKZA 1JO8A 2PLEA 1NEGA 4GBQA 1O4GA 1O4MA 2CUDA 2JS2A 2K2MA 3KFVA 1JYQA 1X6CA 3CD3A 1YVLA 2VWFA 4CC3A 1O45A 5BO4A 1AB2A 1CSYA 2XP1A 5AULA 2KNBB 3N7YA 2JMCA 2KRNA 1JQQA 1TCEA 1E6GA 1SHFA 5IXFA 2FPFA 2BZYA 2AKLA 2LQWA 2PNAA 4JJDA 1AVZC 3VS4A 1XOVA 4A4CA 5HKZA 2B86A 1OEBA 4OMMA 5FWCA 1UJYA 2J6KA 1BHHB 2EGCA 1O4PA 1FMKA 2RSYA 2JYQA 2EW3A 2LX7A 2J05A 2EKXA 3VS1A 5L23A 1BBZA 1AZEA 2HBWA 1Y57A 1YWOA 4LNPA 1A09A 1FBZA 2O31A 1TG0A 1SEMA 1N5ZA 1O41A 1WQUA 4XZ0A 1D4TA 3UF4A 2PNIA 2DLYA 2YUNA 1CWDL 3NMZC 4OMNA 1X43A 1U3OA 1SHAA 2LJ3A 2LCSA 4CC4B 3M0TA 3H0HA 1H3HA 2EL8A 3UYOA 4ORZA 2MCNA 2AUGA 1GBRA 5KAZA 3S9KA 2W0ZA 1AWXA 2AZVA 2YUQA 2IZVA 4NWFA 1PKTA 4QT7A 2DMOA 3QWXX 2HEQA 5EHRA 2LJ1A 5HKYA 4HVUA 1X6BA 4FBNA 2GTOA 1JWOA 2RMXA 2DL5A 2CH4W 1QWFA 2EPDA 3EG2A 4XZ1A 4TZIA 2AKKA 4GL9E 2A36A 2JS0A 2DL8A 5EC7A 4J9CA 2IUGA 5EG3B 1ZUUA 1BF5A 1K0XA 1J3TA 2J6FA 3VRNA 2JMAA 2GNCA 2DBKA 1M61A 2GGRA 1TUCA 2GSBA 4RTYA 2PLDA 1PRLC 1UUEA 2CUBA 2MK2A 2YU7A 3A98A 1T0HA 2HDXA 3HIZB 2V1QA 5IBSA 2KYBA 2DLZA 2ABLA 1A0NB 3OVEA 2RQWA 1Z9QA 1G83A 1NM7A 2O9SA 2M0YA 4DGXA 4J9DA 2CIAA 1OV3A 3NGPA 1D1ZA 2KEAA 3RBBB 1KSWA 2EYWA 1B07A 2SHPA 2J06A 4AFSC 2D1XA 3IQLA 3I35A 3REAB 3REBB 1IS0A 3CWGA 2DBMA 1LCKA 1AOTF 4ROJA 1I1JA 2DL3A 4FL3A 3HCKA 1BKMA 2DE0X 4OMLA 1O4BA 4EY0A 3IMJA 1BM2A 3PSJA 3M0PA 1LUMA 2K6DA 4AG2C 5J3XA 2RVFA 2KT1A 1I07A 1KFZA 1O47A 3VGOA 3VRQA 1OPLA 4F14A 2FPDA 2KROA 4LUEA 5FW9A 1CSKA 2DRKA 1VA7A 1WXTA 1XA6A 3H0FA 4F5AA 2J7IA 1SSHA 1WFWA 2E5KA 3PSKA 4AFUC 1O4CA 2MC1A 1X2KA 5ECAA 2SEMA 2ECZA 2L3QA 5EEQA 1SHDA 2RN8A 2YT6A 3EHQA 1LUIA 1NZLA 1MUZA 3WA4A 2KYMA 1O43A 4JZ4A 1O4IA 4K44A 1O4AA 1RJAA 2EKHA 4M4ZA 4GLMA 2LMJA 1PRMC 1WX6A 3H41A 2C9WA 1GCPA 3SEMA 1I0CA 1W1FA 4IIOA 2K3BA 5IH2A 4NWGA 1LUNA 1M3CA 2YDLA 2CT4A 1Z9ZA 1SRLA 1CJ1A 1BHHA 3CQTA 1BB9A 3M0RA 1ABOA 1UFFA 1X69A 2CREA 1GHUA 2C0IA 1JU5A 3US4A 4R0KA 5DF6A 3IN8A 1U5SA 3PE0A 3VS0A 4DEYA 1BLJA 4H34A 1MV3A 2YSQA 3CXLA 1AZGB 2DJQA 2GBQA 3GQIB 1WXUA 1M27A 1HSQA 2LNWA 2RQUA 4HVWA 1BMBA 4HCKA 4F16A 1GFCA 4RTZA 1T0JA 4JEGA 1M30A 1B47A 1ARKA 1SPRA 4J9EA 2HMHA 3C7IA 3S8NA 1K0SA 2EU0A 3THKA 3ZL7C 2CR4A 2FO0A 4OMPA 1ZFPE 1AD5A 1WI7A 2JXBA 3UA6A 1BLKA 4AG1C 2L6KA 2FG0A 2DCRA 2YUPA 1O4OA 2ETZA 2KGTA 2LJ0A 4Z8AA 2H5KA 3OB2B 2EYZA 2B3OA 5DC0B 2DL4A 2AZSA 1JYRA 4RTVA 2MQIA 4GWFA 5GJVB 4RTTA 3PJPA 1AWWA 4JGHA 1GL5A 2CI9A 2L3TA 3EAZA 1H8KA 1SPSA 3NPFA 1SPKA 1GCQC 3VS6A 3H0IA 3VS7A 1AOUF 3GXWA 3S8LA 3VRRA 1RLQC 2FRWA 4FL2A 5GJWB 4X6SA 1I3ZA 2FPEA 1LCJA 2LCTA 4F17A 1QWEA 3TL0A 3MXCA 1QG1E 3VRPA 2RQTA 4Z89A 3EG3A 1UGVA 4OMQA 1KJWA 2AOAA 3I5RA 1R1PA 1F2FA 3MAZA 2KXDA 1M27C 2Y1MA 1BFJA 3EHRA 3M0SA 2KRSA 1O42A 4J9BA 1VYTA 3QWYA 2LQNA 1AYDA 1ZUKA 2CH4A 3SHWA 1RQQC 5IHKA 2SRCA 3IMDA 4U17A 1FU6A 5IBMA 2EQIA 4JJCA 2X3XD 1UE9A 1O4KA 2K79B 2OJ2A 1VYVA 2LP5A 2VVKA 1YCSB 2DNUA 2DL7A 1SRMA 3I9QA 2C0TA 4F59A 2ESWA 1X2QA 1RUWA 2OQ1A 4P9VA 1JXOA 1LUKA 2EGEA 3OP0A 3PLFB 2D8HA 2DVJA 1ABQA 1A1CA 1BU1A 4K11A 1O4DA 1A81A 1O49A 2DX0A 1P13A 1UHFA 2A37A 2RQVA 4J9FA 2EYYA 1YP5A 3K2MA 1WXBA 2AK5A 1YNZA 1CSZA 2LNXA 1M3AA 1RI9A 5HKWA 2GE9A 2OZOA 2O88A 1OPKA 2KR3A 4AFZC 2ECDA 5DC9A 1AEYA 1O4EA 1A1EA 1UTIA 5EHPA 5IXBA 1BFIA 2ROTA 4J9HA 2L3PA 3VS3A 2X3WD 4RTWA 3M0UA 2EOBA 1V1CA 1X27A 2XMFA 3N8MA 1ZX6A 3I5SA 4K2RA 2FRYA 2V1RA 3ZNIA 4JZ3A 1MILA 3PVLA 3HHMB 3PFVA 4D8KA 2ED0A 4RUGA 3FJ5A 2RF0A 1O4HA 1IO6A 2PNBA 4AFQC 4RTUA 2DA9A 1RLPC 2O2OA 2MOXA 1R1SA 3M0QA 1UURA 1G2BA 2PTKA 4WWQA 4EIHA 1A1BA 3VS2A 2Y1NA 4OMOA 4E6RA 4DGPA 1AYCA 1R1QA 2EGAA 1O46A 1NRVA 2F2WA 1QADA 1PNJA 2A08A 1H92A 1A1AA 1BG1A 2NWMA 1Z3KA 3PQZA 2FCIA 1BHFA 3KFJA 3RNJA 2ED1A 1UDLA 2JTEA 2CSQA 2PZ1A 1E7OA 1UUSA 1JU5C 2GQIA 2O9VA 2RMOA 2AOBA 1PWTA 1SKJA 2EVRA 2L3SA 4HXJA 2DRMA 3ULRB 4J9IA 1FYNA 1K76A 1PHTA 4WCIA 2BBUA 2RQRA 5FWBA 3CBLA 3BUWB 5D0JA 4E93A 2Y3AB 2EBPA 1YWPA 4Z88A 1UJ0A 2YSXA 2IIMA 2KXCA 1BK2A 1QCFA 4OHLA 4H1OA 4OHEA 2DILA 2YUOA 2DF6A 1JEGA 4ZNXA 2MRKA 1WA7A 1PICA 1FHSA 1CKAA 4A4BA 1CWEA 2LNHB 2A28A 2JT4A 1FBVA 1GBQA 3S8OA 1CKBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KYYA 4BE0A 5I21A 2DIGA 2HUWA 3CCQQ 5I6VA 2QMSA 1NEBA 1AYAA 3OW2P 2NUZA 3QKJA 5DC4A 1OOTA 4NL2A 1SHBA 4ANJA 2LT1A 2RHYA 3G4ST 2EO6A 2DM0A 5GAN4 1QVFP 1QMCA 2NLUA 2J6OA 1Y71A 3JCMf 1WDXA 1AOJA 5GANh 2ZPHB 3GXXA 1K73U 4ZGJB 3BUNB 2KRMA 1EFNA 1HCTB 1BI2A 1FXXA 4BDZA 3MEUA 3U23A 2JJ9A 3JCMb 1BIAA 3NHNA 3HFNA 2F5KA 1Q82U 4C92G 1K1ZA 3H9NA 4PNOA 2A0FB 2JM8A 4E7LA 2CRHA 2DX1A 1KC2A 2KBTA 4E7IA 3CXCA 4FCYA 1W2BA 4IIMA 4YTLA 4OB2B 3TSZA 5GJIA 5FU7B 3M7FA 1F1WA 4DA4A 1ZLMA 1GCQA 2HKQB 1N6AA 1U06A 4KRTA 3CCLT 3OYFA 2R58A 2K57A 2KAFA 4BUGA 4BY6B 2P4RA 1Y1UA 1K4US 1K9MC 1UG1A 3CCRQ 1Q82R 3R6NA 2DYIA 1Y0MA 3WXMB 2DEQA 4M77B 5D7UA 1RAGB 1LPLA 1QKWA 2C0OA 3UA7A 1T3SA 2K5FA 5GAOn 2YRCA 3J7AF 2DYBA 3E2UA 4QQGA 4M77G 3CMEA 3ZEHA 2DTOA 4CC7A 2F2XA 1ZSZC 2FEIA 2IPOB 2M02A 3L42A 2LZ6B 1UHCA 5KH6A 2KNOA 3RMQA 2BZXA 1KIKA 1NG2A 2BTTA 1OO4A 4M7AG 2MRJA 1KA7A 3L2VA 1JJ2P 4OHHA 1V76A 1R77A 1YJNQ 4BI3A 5FU6B 1AWJA 1RADB 2K7AB 3BUMB 4C92A 1LKLA 3BUOB 5GAMj 1MW4A 3TVTA 2QDLA 2DXBA 1UECA 1QLYA 3HL8A 4LD9K 5GANg 4OHDA 4BE1A 2PLEA 3GLXA 1NEGA 4XU1A 1O4GA 2O4XA 2K2MA 1JYQA 4IKFA 4J8OA 5AULA 2KNBB 3MHXA 2E10A 1JQQA 2OTLQ 4E47A 2JTMA 2LQWA 1Q7YC 2B86A 2DO3A 1U1TA 2FHDA 5FWCA 3PIPA 2RJCA 2RSYA 2VYTA 2J05A 3VS1A 2MK5A 2JVVA 3V8LA 2HBWA 2VUBA 1KC8U 1Y57A 1FBZA 3N5BB 3CCSA 3H8ZA 3OSSC 3X26B 4PJNA 3X24B 1M90R 3HPWA 2HAXA 1X43A 2XG8D 2Y4YA 4CC4B 2ZPEB 1GXIE 3M0TA 2KMTA 3H0HA 4NWFA 3BE3A 2HKNA 2HEQA 2LJ1A 5HKYA 3JCMX 1QWFA 4XZ1A 3CCVT 3QZ9B 4GL9E 4J9CA 3CEYA 5EG3B 1ZUUA 3QXEB 3CD6A 1M61A 2DBKA 2GSBA 2CUBA 5GAOq 2OAUA 3OYDA 4NOYA 1RAIB 1YI2A 2EYQA 3A98A 3JCMV 4C92E 5IBSA 2DLZA 2RQWA 2O9SA 1UGPB 4J9DA 1OV3A 3NGPA 2KEAA 3RBBB 2EYWA 2COYA 1B07A 1VQMA 2J06A 1I4K1 5GAOl 2D1XA 2RI5A 3REAB 5GANd 2H3JA 2QQ9A 3HCKA 3FRNA 3HFOA 2F69A 1O4BA 1BM2A 3PSJA 1M1KR 2E64A 4AG2C 1JRIA 1R0CB 3JCMe 1I07A 1KFZA 3VRQA 3PMIA 5FW9A 1VQ6Q 1CSKA 1VA7A 1WXTA 4A53A 3H0FA 1M5Q1 2DZCA 3PSKA 2K3YA 2K2VA 2XHCA 5ECAA 5EEQA 2ZPBB 3EHQA 1H3ZA 2KYMA 3EG9A 3QG1A 1O4AA 1YBYA 1D09B 1M9SA 1KD1U 3V8JA 5GAMf 2C9WA 1GCPA 1MMNA 1I0CA 1W1FA 3R6OA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2DA9 A;  1RLP C;  2O2O A;  2MOX A;  1R1S A;  3M0Q A;  1UUR A;  1G2B A;  2PTK A;  4WWQ A;  4EIH A;  1A1B A;  3VS2 A;  2Y1N A;  4OMO A;  4E6R A;  4DGP A;  1AYC A;  1R1Q A;  2EGA A;  1O46 A;  1NRV A;  2F2W A;  1QAD A;  1PNJ A;  2A08 A;  1H92 A;  1A1A A;  1BG1 A;  2NWM A;  1Z3K A;  3PQZ A;  2FCI A;  1BHF A;  3KFJ A;  3RNJ A;  2ED1 A;  1UDL A;  2JTE A;  2CSQ A;  2PZ1 A;  1E7O A;  1UUS A;  1JU5 C;  2GQI A;  2O9V A;  2RMO A;  2AOB A;  1PWT A;  1SKJ A;  2EVR A;  2L3S A;  4HXJ A;  2DRM A;  3ULR B;  4J9I A;  1FYN A;  1K76 A;  1PHT A;  4WCI A;  2BBU A;  2RQR A;  5FWB A;  3CBL A;  3BUW B;  5D0J A;  4E93 A;  2Y3A B;  2EBP A;  1YWP A;  4Z88 A;  1UJ0 A;  2YSX A;  2IIM A;  2KXC A;  1BK2 A;  1QCF A;  4OHL A;  4H1O A;  4OHE A;  2DIL A;  2YUO A;  2DF6 A;  1JEG A;  4ZNX A;  2MRK A;  1WA7 A;  1PIC A;  1FHS A;  1CKA A;  4A4B A;  1CWE A;  2LNH B;  2A28 A;  2JT4 A;  1FBV A;  1GBQ A;  3S8O A;  1CKB A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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