2LQNA

Solution structure of crkl
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
303
structure length
303
Chain Sequence
b'MSSARFDSSDRSAWYMGPVSRQEAQTRLQGQRHGMFLVRDSSTCPGDYVLSVSENSRVSHYIINSLPNRRFKIGDQEFDHLPALLEFYKIHYLDTTTLIEPAPRYPSPPMGSVSAPNLPTAEDNLEYVRTLYDFPGNDAEDLPFKKGEILVIIEKPEEQWWSARNKDGRVGMIPVPYVEKLVRSSPHGKHGNRNSNSYGIPEPAHAYAQPQTTTPLPAVSGSPGAAITPLPSTQNGPVFAKAIQKRVPCAYDKTALALEVGDIVKVTRMNINGQWEGEVNGRKGLFPFTHVKIFDPQNPDENE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Crk-like protein
publication title Domain organization differences explain Bcr-Abl's preference for CrkL over CrkII.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 52
structure length 303
sequence length 303
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
A PF07653 SH3_2 Variant SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqnA02
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2lqnA03
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2lqnA01
2CUDA 1XA6A 2P4RA 3UA7A 2IUGA 3M7FA 2OJ2A 1Y1UA 2YUOA 5EG3B 3PJPA 2O2OA 4CC4B 2A28A 1P13A 2AK5A 1ARKA 1FHSA 2DNUA 1OPKA 2HMHA 4IIOA 1BB9A 3UF4A 2CR4A 3SEMA 3VRNA 2EVRA 1X6CA 1O48A 5IBSA 4E93A 1ZUYA 2LNHB 4RTZA 1YWPA 3PVQA 2CSQA 1UURA 3VS7A 1J3TA 1QWFA 5HCKA 2K6DA 2PTKA 1O4HA 2L4KA 2ROLA 2PZ1A 4AFZC 3VS3A 1FU5A 1HD3A 3IMJA 2CI8A 1RUWA 1MUZA 1AYAA 3OP0A 1IO6A 1O42A 1AOTF 1GCQA 1LCKA 2KXCA 4RUGA 2LX7A 1BMBA 4RTTA 2XP1A 2EPDA 1D4TA 2XMFA 2KNOA 1S1NA 1QKWA 1AWJA 4K11A 2DX0A 3N8MA 1D4WA 3TSZA 2W0ZA 1GL5A 2LZ6B 1NLOC 1OEBA 1HSQA 2KRSA 3EHRA 2NWMA 2JMCA 1D1ZA 2PLEA 3LH5A 3PSJA 4HVWA 1KJWA 2D1XA 2JM9A 5I11A 5DF6A 3ZL7C 3BKBA 1Y0MA 4DEXA 1VYUA 1O4DA 3IQLA 3PQZA 2ETZA 1CJ1A 2ESWA 4QT7A 1FYNA 1U3OA 1T3LA 2OAWA 1JQQA 1BM2A 1UJ0A 4F17A 1AZEA 2IUHA 2KXDA 4EIKA 1M8MA 3QWYA 3EG2A 2PNAA 1YVLA 2DLYA 2KYBA 1NG2A 1BFJA 3ZNIA 4CC7A 1V1CA 4U17A 2ED0A 2YT6A 3NPFA 2RSYA 3NHNA 3IN7A 2HCKA 1SEMA 3CBLA 3OB1B 1I1JA 1LCJA 2EGAA 2J7IA 1O4IA 5GJHA 1A81A 1GFDA 1NZVA 2CS0A 4OMOA 1AD5A 1Y57A 2O88A 1LKLA 1CSKA 3RBBB 2K3BA 1NRVA 2B3OA 2FG0A 1UHFA 3NMZC 3UYOA 1X6BA 3H0HA 2A08A 3KFVA 4LN2A 4OMPA 4D8DA 1ZFPE 3JV3A 2CIAA 1UHCA 1M3CA 1ZLMA 1NYFA 1KSWA 5IBMA 2DM1A 4J9CA 2BZYA 1K76A 1KFZA 1ZX6A 3BUXB 3RNJA 4RTVA 1AZGB 4HVVA 4JJDA 4DEYA 2K7AB 1SHFA 3HCKA 3VRRA 1OV3A 3EGUA 4JZ3A 1KA6A 1AOUF 1JU5A 4H34A 2DRKA 1UUSA 2KEAA 3O5ZA 2LQWA 4AFQC 4OMLA 3MXYA 5KAZA 1WXTA 1GRIA 2OQ1A 4NWGA 1O4QA 2M0YA 2LJ0A 2MOXA 3VS0A 1NLPC 1SSHA 2JM8A 4M4ZA 3VGOA 2GTOA 5AXIA 1O49A 1JEGA 1JYUA 2K2MA 2KGTA 2KR3A 2C0TA 1QADA 1R1SA 3GQIB 1GCQC 1YVHA 4OHLA 5L23A 3BUWB 3GXXA 3VROA 1PRLC 1JO8A 3UATA 1N5ZA 1O4AA 3HIZB 1F1WA 1F2FA 2DILA 2D0NA 2LNWA 2JT4A 1OPLA 4XZ1A 4CC2A 3ULRB 1O4OA 1SHGA 2OZOA 1X43A 1K0SA 2MC1A 2RMXA 3H0FA 3EHQA 2BZXA 1O45A 2J06A 2AKLA 1CSYA 1E7OA 1U06A 2ECZA 1O4BA 1M3AA 3TKZA 1Z3KA 2CREA 2JXBA 2LP5A 2DL3A 1RPYA 2LCTA 2YUPA 1WQUA 1O4JA 4GPLB 1FBVA 2EKXA 1WXBA 5IXBA 1YCSB 4Z8AA 2CI9A 2AZSA 1WI7A 1AVZC 2DL7A 3TSWA 1NZLA 2DX1A 1I0CA 4A63B 1BBZA 1H92A 2AUGA 1BKMA 3THKA 2MRJA 1M27A 5FWCA 3CXLA 2L3SA 1X0NA 2RORA 1ABQA 3MAZA 2LJ3A 1SPSA 2DM0A 1ABOA 2YUQA 1BHHB 3EACA 3S9KA 5EEQA 1GBQA 1XOVA 5ECAA 1BFIA 4WWQA 2FPFA 3M0RA 4Z89A 4XZ0A 1ZSGA 4OMQA 2EOBA 1AWXA 3I5RA 2VIFA 1BF5A 4AFUC 4AG2C 1SRMA 2HUWA 1YWOA 2H5KA 3H0IA 1EFNA 3I9QA 1BK2A 1TZEE 2K7AA 4TZIA 2HEQA 2W10A 3UA6A 3T04A 1VA7A 2A37A 2KYMA 1G83A 1CKAA 1UGVA 3MXCA 2EYVA 1O4LA 2ABLA 2I0NA 5HKYA 2X3XD 3REAB 2GGRA 1O46A 2CT3A 2O31A 4X6SA 1WA7A 1O4RA 1NYGA 4DGXA 1OO4A 1WIEA 1QG1E 1PRMC 4K44A 5EHRA 2L0AA 2JMAA 2RN8A 2V1QA 5J3XA 2KNBB 3KFJA 2AKKA 1TG0A 1E6GA 3S8OA 4AFSC 2DYBA 1HCTB 3CQTA 2EW3A 2SHPA 4JPBW 1SPKA 3VRYA 3VRZA 2H46E 3PLFB 5FW9A 1VYTA 2RNAA 4OHDA 1IJRA 2RQRA 1X6GA 2YU7A 1ZUUA 3US4A 4Z88A 5CDWA 1NEGA 1TUDA 2G6FX 1VYVA 3M0PA 4OHEA 5AULA 2C0OA 1WFWA 2DF6A 1JYQA 1A1BA 1K0XA 1E6HA 2DA9A 1K4US 1R1QA 5GJVB 5IHNA 1MV0B 4HVUA 3PS5A 1AWOA 4JJBA 1BKLA 4ORZA 3BUNB 1I07A 1CWDL 1K9AA 2X3WD 4HCKA 2ED1A 3VS2A 4JJCA 2LNXA 3WA4A 2YUNA 1OO3A 2RPNA 4K2RA 4ROJA 1AOJA 2EBPA 4JGHA 2VKNA 4F5AA 4F16A 1W6XA 4J9FA 3VS5A 1KC2A 2K9GA 1UUEA 1X2QA 2J6KA 3VS1A 1BLJA 1M3BA 1QCFA 3M0SA 2Y3AB 2DL4A 1AEYA 2DE0X 3EG1A 5EELA 1W70A 2EGEA 2FEIA 1O4GA 3IN8A 1Z9QA 1UG1A 1FMKA 2RMOA 1JYRA 2FRWA 3OVEA 4GL9E 2LJ1A 1YN8A 1BG1A 2LMJA 1M27C 3IMDA 4QSYA 2LCSA 2O9SA 4J9DA 1H9OA 3QWXX 1BHFA 1BLKA 1AWWA 1B3QA 2JS2A 2RQVA 4HXJA 1GFCA 3BUMB 1I3ZA 1B47A 5GJWB 3TL0A 4JE4A 2K79B 1KA7A 4FBNA 4KRTA 2GSBA 1NM7A 2JW4A 2EYWA 3VRQA 2C0IA 2MQIA 4RTWA 2DJQA 4GLMA 2SEMA 4F14A 2HSPA 1H3HA 4FL3A 3I35A 4L1BB 2FO0A 2MCNA 3A98A 2CRHA 2F2XA 2DBKA 1GCPA 2FRYA 2JTEA 3EG3A 2EU0A 4GWFA 1YP5A 2AZVA 4LNPA 2KT1A 1PKTA 3N84A 3VS4A 1SHDA 2AOAA 4E6RA 2KE9A 1Z9ZA 2JYQA 2GBQA 3PFVA 1CWEA 3OV1A 1NEBA 1WXUA 1JXOA 1AB2A 1HJDA 4FSSA 5EHPA 2D8JA 4RTUA 2PNBA 5I22A 1BU1A 4EIHA 2KRNA 4JZ4A 3VS6A 3GXWA 1UECA 1CSZA 1SHAA 2DMOA 1K1ZA 1TUCA 1O4NA 2VWFA 2HBWA 2JS0A 2EO6A 2CBLA 2L3TA 2DLPA 2CH4W 2BTTA 4J9IA 4R0KA 2ECDA 4AG1C 4ESRA 1AYCA 1O4PA 4OHIA 3S8NA 1O41A 1ZBJA 2A36A 2RQWA 1O4EA 1FYRA 1O47A 1B07A 2C9WA 1RQQC 3VRPA 1O4KA 1A0NB 5DC9A 1QWEA 1PNJA 3U23A 1O4FA 2EO3A 2BZ8A 2KROA 2SRCA 1RLPC 4J9GA 4U1PA 5DC4A 1HCSB 4EY0A 1GBRA 2QMSA 2FPEA 2CSIA 5HKWA 2Y1MA 1H8KA 1PWTA 2CH4A 3REBB 2YSXA 2HDXA 5BO4A 2J6FA 2J05A 2EYXA 1JXMA 1JU5C 3GBQA 1PHTA 2CT4A 2ROTA 2DL5A 1QLYA 2FPDA 4J9BA 1PICA 1TCEA 3HHMB 2B86A 3R6NA 4F5BA 1GHUA 3C0CA 2FCIA 2EGCA 2GNCA 2KT8A 3EAZA 3N7YA 2EQIA 1T0HA 1ZUKA 4ZNXA 4CC3A 1SRLA 1RLQC 1KIKA 1W1FA 1WDXA 3EG0A 2DL8A 4J9EA 5EC7A 2GTJA 2K79A 2H8HA 5FWBA 2IZVA 4IIMA 4LUEA 2IUIA 4E68A 2DLZA 1LUMA 3BUOB 1U5SA 3M0TA 1O44A 3TVTA 2EYYA 2L6KA 4LE9A 1AYDA 1AYBA 1CKBA 1MW4A 1A09A 5IHKA 2OI3A 2LQNA 2KBTA 1UE9A 4RTXA 1M61A 2DCRA 2VVKA 3C7IA 5IXFA 2RF0A 2L3QA 2BBUA 2MK2A 4K45A 1A07A 2D8HA 5D0JA 1LUNA 2YDLA 4A4BA 2E5KA 2HDVA 3PE0A 3CWGA 2EL8A 2DVJA 2J6OA 2MIOA 2F2WA 4Y92A 1A1AA 2MRKA 2EYZA 2YSQA 1M30A 2RQTA 2DRMA 2F2VA 2DBMA 2Y1NA 1UDLA 3H41A 2RVFA 4JEGA 3CD3A 1BHHA 2L2PA 1UJYA 2QDLA 1OOTA 4LUDA 1YNZA 5IH2A 5GJIA 1WYXA 1SHBA 1UFFA 2KRMA 2L3PA 1LUKA 1FU6A 1LUIA 4X1VA 2CUBA 2PNIA 3SHWA 1A1EA 4RTYA 2CDTA 1LKKA 1WX6A 1T0JA 4OMMA 1RI9A 3M0UA 2HDAA 4OMNA 1IS0A 1MILA 4A4CA 5IHIA 4FL2A 1O43A 4D8KA 3PVLA 2EKHA 3I5SA 1SPRA 1PKSA 2AOBA 2RQUA 2GQIA 2M51A 1JWOA 1RJAA 1QKXA 2O9VA 2NUZA 4P9ZA 4OHHA 1R1PA 4J9HA 2GE9A 2PLDA 5I6VA 2IIMA 3NGPA 5HKZA 1FBZA 3M0QA 3OB2B 2V1RA 1UTIA 1G2BA 2KK6A 3K2MA 2ENMA 3PSKA 1O4MA 1X2KA 1WLPB 1A1CA 4H1OA 1T3SA 1SKJA 3S8LA 1X27A 4NWFA 5DC0B 1X69A 3FJ5A 4DGPA 4WCIA 1O4CA 1A08A 1MV3A 4P9VA 4GBQA 4F59A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XDBA 3BFMA 4L59A 2QGGA 2YXYA 4BUGA 2FZCB 2PVDB 3M7FA 2CP5A 2KSSA 5DLOA 5GANg 2YUOA 3PJPA 5LJ5f 4IUVA 3CCST 2DIQA 2ZPHB 2CZ6B 2HMHA 4IIOA 1BB9A 2M9UA 3CCUT 4ZGDB 1X6CA 2NLUA 4XU2A 1ZUYA 1UGPB 2QA4Q 1YWPA 4QW2A 1WJRA 1O4HA 3IMJA 2OAUA 2CI8A 1GCQA 1LCKA 2KXCA 2HMAA 4C8QG 4RTTA 2EPDA 3A5ZB 3LLRA 1YI2Q 4DBFA 4C92B 3CMEQ 2KNOA 4YTLA 5LJ5d 4K11A 3MP8A 2DX0A 3N8MA 1D4WA 2X4JA 2HKQB 1OZ3A 1GL5A 4M77A 2X4WA 3EHRA 2NWMA 3M53A 2AT1B 3M9QA 2D1XA 2GFAA 4O6JA 4RCBA 3CCMT 3PGGA 4FM4B 1JJ2S 3CCQT 1CJ1A 3FJPA 4O5VA 4QT7A 3L2WA 3CC7Q 3M58A 4ZGEB 2E64A 5GAOr 1YJNA 1PM3A 3GF5A 2PVGB 3FRNA 5J26A 4EMGA 2ED0A 3JCMf 5CKDA 3HFOA 2RB6A 3M59A 1TTHB 2GFUA 4IURA 3OB1B 1K9MU 1Q7YU 3C4SA 5LJ3h 3JCMg 2F69A 1AD5A 1Y57A 3C95A 5D6WA 2QEXQ 3T9NA 3RBBB 1WHGA 1WHJA 1QMCA 3NMZC 1C0MA 4BE0A 3UYOA 2DPPB 3CCUA 2JTMA 4D8DA 3JV3A 3OYDA 1M3CA 3F70A 1NYFA 2CP0A 2DM1A 1SSFA 4PKCC 1ZX6A 4XTWA 3G4SA 4DEYA 1SHFA 3HCKA 5KH6A 3G6EA 3RESA 4AFQC 5CQXA 4KUIA 4KH1B 1VQ9T 1EIFA 2K4YA 3CCMA 3VGOA 5AXIA 2QGFB 2KQWA 3GQIB 2KR3A 1K9MC 4LDWA 5HY6A 1Q7YC 2LRAA 5L23A 2HBPA 1PRLC 3CCQA 1VIFA 3UATA 1N5ZA 3META 4M7AC 3UPUA 5KYYA 4M75D 3D7SB 1RL2A 3PNWC 3ULRB 2DD4A 4FW1A 2NYSA 2ECZA 5GAN6 3TKZA 1Z3KA 2JXBA 1FMVA 2IVWA 4M78A 1VQMQ 1WQUA 1FBVA 2EKXA 1YJWQ 4ME7A 2CI9A 4MDXA 4XU1A 1VIEA 3X24B 1AVZC 2DL7A 3LH0A 3TSWA 1IHWA 3RKYA 1I0CA 4A63B 4KT0E 3M54A 3THKA 5FWCA 3MAZA 3CC4T 1NJIU 1ABOA 2VASA 2ZPBB 2LVMA 5ECAA 5LJ3f 1W2BA 2H3EB 1M5Q1 2XICA 1V76A 2VIFA 1AWXA 3I5RA 1BF5A 2ZCFB 5LJ3g 4RKUE 4E7KA 3I9QA 3EH1A 3CPWS 2W10A 3T04A 4FYWB 3HRTA 3MEAA 5GAMj 2EYVA 2HZYA 1VQ9A 3HFNA 1O4LA 5GMKe 3R6OA 4WF2A 2XDPA 1NYGA 1KHCA 4D6WA 3AT1B 3LW5E 4K44A 2L0AA 2KNBB 4M77D 3KFJA 2AKKA 3S8OA 2RI5A 2DYBA 4PFPA 1HCTB 1G3TA 2SHPA 3CCVA 3H8ZA 3VRYA 1YHQT 4C92C 5FW9A 1NJIC 1ZA1B 4FYVB 5J3BA 4BY6B 4RG8A 4R55A 5GANj 1YJ9T 4LDXA 4OHDA 3US4A 1NEGA 2G6FX 1OYXA 1JYQA 1A1BA 1B7TA 1K0XA 5KYUB 1KC8R 1R1QA 1VQLQ 1G8XA 1JBMA 2Z0WA 3PT9A 3PS5A 2KK4A 2K5IA 4JUVA 3NTIA 2X3WD 2DTHA 4QVCA 2MWPA 1BKBA 2K2VA 3S3OA 1TUGB 3RUXA 2RPNA 3WA4A 5A2QE 4K2RA 4ROJA 3DB4A 1IRXA 5GAN2 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2CH4 A;  3REB B;  2YSX A;  2HDX A;  5BO4 A;  2J6F A;  2J05 A;  2EYX A;  1JXM A;  1JU5 C;  3GBQ A;  1PHT A;  2CT4 A;  2ROT A;  2DL5 A;  1QLY A;  2FPD A;  4J9B A;  1PIC A;  1TCE A;  3HHM B;  2B86 A;  3R6N A;  4F5B A;  1GHU A;  3C0C A;  2FCI A;  2EGC A;  2GNC A;  2KT8 A;  3EAZ A;  3N7Y A;  2EQI A;  1T0H A;  1ZUK A;  4ZNX A;  4CC3 A;  1SRL A;  1RLQ C;  1KIK A;  1W1F A;  1WDX A;  3EG0 A;  2DL8 A;  4J9E A;  5EC7 A;  2GTJ A;  2K79 A;  2H8H A;  5FWB A;  2IZV A;  4IIM A;  4LUE A;  2IUI A;  4E68 A;  2DLZ A;  1LUM A;  3BUO B;  1U5S A;  3M0T A;  1O44 A;  3TVT A;  2EYY A;  2L6K A;  4LE9 A;  1AYD A;  1AYB A;  1CKB A;  1MW4 A;  1A09 A;  5IHK A;  2OI3 A;  2LQN A;  2KBT A;  1UE9 A;  4RTX A;  1M61 A;  2DCR A;  2VVK A;  3C7I A;  5IXF A;  2RF0 A;  2L3Q A;  2BBU A;  2MK2 A;  4K45 A;  1A07 A;  2D8H A;  5D0J A;  1LUN A;  2YDL A;  4A4B A;  2E5K A;  2HDV A;  3PE0 A;  3CWG A;  2EL8 A;  2DVJ A;  2J6O A;  2MIO A;  2F2W A;  4Y92 A;  1A1A A;  2MRK A;  2EYZ A;  2YSQ A;  1M30 A;  2RQT A;  2DRM A;  2F2V A;  2DBM A;  2Y1N A;  1UDL A;  3H41 A;  2RVF A;  4JEG A;  3CD3 A;  1BHH A;  2L2P A;  1UJY A;  2QDL A;  1OOT A;  4LUD A;  1YNZ A;  5IH2 A;  5GJI A;  1WYX A;  1SHB A;  1UFF A;  2KRM A;  2L3P A;  1LUK A;  1FU6 A;  1LUI A;  4X1V A;  2CUB A;  2PNI A;  3SHW A;  1A1E A;  4RTY A;  2CDT A;  1LKK A;  1WX6 A;  1T0J A;  4OMM A;  1RI9 A;  3M0U A;  2HDA A;  4OMN A;  1IS0 A;  1MIL A;  4A4C A;  5IHI A;  4FL2 A;  1O43 A;  4D8K A;  3PVL A;  2EKH A;  3I5S A;  1SPR A;  1PKS A;  2AOB A;  2RQU A;  2GQI A;  2M51 A;  1JWO A;  1RJA A;  1QKX A;  2O9V A;  2NUZ A;  4P9Z A;  4OHH A;  1R1P A;  4J9H A;  2GE9 A;  2PLD A;  5I6V A;  2IIM A;  3NGP A;  5HKZ A;  1FBZ A;  3M0Q A;  3OB2 B;  2V1R A;  1UTI A;  1G2B A;  2KK6 A;  3K2M A;  2ENM A;  3PSK A;  1O4M A;  1X2K A;  1WLP B;  1A1C A;  4H1O A;  1T3S A;  1SKJ A;  3S8L A;  1X27 A;  4NWF A;  5DC0 B;  1X69 A;  3FJ5 A;  4DGP A;  4WCI A;  1O4C A;  1A08 A;  1MV3 A;  4P9V A;  4GBQ A;  4F59 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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