2ABLA

Sh3-sh2 domain fragment of human bcr-abl tyrosine kinase
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
MGPSENDPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVNSLEKHSWYHGPVSRNAAEYLLSSGINGSFLVRESESSPGQRSISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHHSTVADGLITTLHYPAP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Intramolecular interactions of the regulatory domains of the Bcr-Abl kinase reveal a novel control mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ABL TYROSINE KINASE
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 37
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1996-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2ablA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2ablA02
4HCKA 2PTKA 2YUOA 4JZ3A 2QMSA 5CDWA 4D8KA 3US4A 1CSKA 2DMOA 2JMAA 1KC2A 1AYBA 2J6OA 3THKA 1ZX6A 1P13A 2AUGA 2RQUA 3R6NA 1BFIA 1X6CA 2LNHB 5GJVB 2LNXA 4J9FA 1JU5C 2A08A 5AXIA 1WDXA 1KJWA 1JXOA 4J9HA 2IUIA 5EELA 3S9KA 2CI8A 1NEBA 2DL3A 4Y92A 1GHUA 1HJDA 4LN2A 4X6SA 5DC4A 2KRMA 2DE0X 4HXJA 2LZ6B 2LJ1A 4HVUA 1FU6A 2L2PA 1X69A 2JT4A 2DX0A 3M0RA 5IH2A 2YUNA 3CQTA 4CC7A 1AWXA 1KIKA 1BBZA 1FU5A 1JXMA 1KFZA 4J9BA 3VROA 1K0SA 2BBUA 2YSXA 1NLPC 3PSJA 5DF6A 1O4KA 1H92A 2L3SA 3VS1A 1UDLA 2CI9A 1K76A 4HVWA 2HDAA 2L0AA 4RTXA 1VYTA 4A63B 4ROJA 5I11A 2IUHA 5L23A 4CC3A 1AWOA 2HMHA 2H46E 3EACA 2PLEA 2DL7A 2AZVA 4GLMA 5FW9A 3PSKA 3BUOB 2O9VA 2GBQA 1R1PA 2DBKA 2EW3A 1MILA 1QG1E 1BB9A 1JYRA 4RTTA 4NWGA 4OMLA 1GCPA 2O31A 1V1CA 3I5SA 1BKLA 3C7IA 2JM8A 3H41A 2LJ3A 2PNIA 3I9QA 2JW4A 1OV3A 1CSZA 4JE4A 2DL5A 3PJPA 1O4LA 2EYZA 2DNUA 1BU1A 5AULA 1UUEA 1Y0MA 2JTEA 2DF6A 1W70A 2BTTA 3QWYA 1YVLA 1O48A 1O44A 1BHHB 3MXCA 2LQNA 1U5SA 2OAWA 1A07A 1AZGB 3PQZA 2EGCA 1UURA 3FJ5A 5GJIA 3VRPA 3C0CA 2MK2A 1AWJA 1JO8A 1LKLA 4LNPA 2DLPA 1EFNA 1FMKA 2DLYA 2J6FA 1D1ZA 2K6DA 3OB1B 1WX6A 1SHGA 2KYMA 1QLYA 1ZLMA 5IBSA 2MCNA 2C0IA 1T3LA 3GXWA 2EYYA 1ZFPE 2K7AB 4JJBA 3M0PA 2RMOA 1RLQC 1NZVA 4JJCA 3M0UA 1FBVA 2V1QA 2SEMA 3VRYA 4F16A 2FG0A 1WA7A 2RMXA 1PKSA 4KRTA 1ABQA 1LUIA 4J9CA 4F5AA 1E7OA 2CUBA 4AFSC 1O46A 1E6HA 3VGOA 1MUZA 2ROTA 2HUWA 2AK5A 2KEAA 1SPSA 1OOTA 2AOBA 1YCSB 2DM1A 4K2RA 1X2KA 3ZL7C 2EYVA 3VRRA 1WQUA 4ESRA 1SRLA 2GQIA 3GQIB 5IBMA 3N8MA 1RI9A 2ECZA 4JZ4A 1O4QA 2JS2A 1QKWA 1GCQC 2EVRA 2FPFA 1GL5A 1SEMA 1JWOA 2ABLA 1A1AA 3CD3A 2K79B 3PS5A 3VS5A 4AFZC 2P4RA 4U1PA 2PZ1A 1AYAA 5DC0B 2BZ8A 4RTVA 1BLKA 1O4PA 1A1BA 3OB2B 1MW4A 2ED0A 2CSIA 2KE9A 2ROLA 2FPEA 3PFVA 3I35A 1O49A 2FRWA 3KFVA 2OJ2A 1VA7A 4OHDA 1WIEA 4DEXA 2AOAA 2YDLA 4M4ZA 4AFQC 1WXUA 1AD5A 4E68A 4L1BB 3REAB 2A28A 4RTUA 4H1OA 1K9AA 1BKMA 2A36A 1PWTA 2GTOA 1GFDA 2CBLA 2KK6A 1UJYA 1WXTA 1O4MA 1VYVA 2EOBA 2L3TA 4FL2A 4QSYA 5EHRA 1TUCA 1T0JA 4RTWA 3N84A 3EGUA 2C0OA 4LE9A 3S8OA 1M27C 4ORZA 4FBNA 1O4IA 1GBQA 2MIOA 2VKNA 2RQTA 2LCSA 1SHAA 4GWFA 2NWMA 2CUDA 5HCKA 1KA6A 2EKHA 3VRQA 4IIMA 3RBBB 4LUEA 1NEGA 4Z8AA 1O47A 1RUWA 1A09A 2KT1A 2SRCA 3VS7A 3TL0A 1UGVA 2CT4A 2X3XD 2O2OA 3NPFA 3VS6A 1OPKA 4J9EA 1XOVA 2EKXA 5I6VA 1WLPB 2KYBA 5IXFA 3MXYA 2J05A 4RUGA 2B3OA 1AOUF 3GBQA 1QKXA 3IMDA 4J9DA 1CWDL 2PNAA 3CBLA 1B47A 4DGXA 2KR3A 1G83A 1RPYA 2MRKA 2CREA 2IIMA 2PNBA 2SHPA 1Y1UA 1NYGA 1WI7A 2X3WD 4EIKA 1NLOC 1X43A 3S8NA 2OI3A 3SHWA 4J9IA 1LCKA 3PVLA 4CC4B 4TZIA 4JPBW 1JU5A 3WA4A 4AG1C 4ZNXA 3ZNIA 4E93A 4QT7A 2PLDA 3BUXB 2GE9A 2OQ1A 3PE0A 1JQQA 1XA6A 1S1NA 4OHEA 2ESWA 4OHLA 3I5RA 2HCKA 1M27A 1ZUYA 4JGHA 2EGAA 1GBRA 3IQLA 2YUQA 5FWCA 1BMBA 4EY0A 3EG3A 1SPRA 1Y57A 1HSQA 2DRMA 2CT3A 4GBQA 2CH4A 2KXDA 3T04A 2LCTA 2LQWA 2EL8A 1IS0A 1IO6A 1YN8A 1O4GA 1CWEA 2JM9A 1UTIA 2YT6A 2EO3A 2K3BA 1AZEA 2FRYA 2CRHA 1WYXA 2JMCA 1UHFA 2C0TA 2YU7A 1QWFA 5D0JA 3LH5A 2RPNA 2RQVA 1UG1A 3UA7A 1X2QA 4J9GA 1OO4A 3UA6A 1MV3A 2JXBA 1M30A 2GNCA 2YUPA 3BUMB 1ARKA 1F2FA 1I07A 4P9VA 4DEYA 2KT8A 2BZYA 1J3TA 2RORA 1GFCA 4RTYA 1BFJA 4XZ1A 4OHIA 2DLZA 1O4EA 2CSQA 1ABOA 5EEQA 2L4KA 1SRMA 1SHFA 1M3CA 1AWWA 3NHNA 2C9WA 4FL3A 2CR4A 2Y1MA 4EIHA 4F17A 2LMJA 3KFJA 2K9GA 1CKAA 3VS2A 2HDVA 1OEBA 3S8LA 2RN8A 3ULRB 2W10A 1I1JA 1H3HA 1O45A 1H9OA 3K2MA 2NUZA 1PRLC 4LUDA 1O41A 2L6KA 1JEGA 1ZSGA 2B86A 1HCSB 2IZVA 2O9SA 2GTJA 1W1FA 4P9ZA 2ED1A 3IN8A 1O4AA 2DJQA 1KA7A 2VIFA 5HKWA 2EU0A 1UJ0A 3H0IA 1A81A 2LP5A 1O4FA 4H34A 4K11A 4K45A 4OMNA 2J06A 2OZOA 1M8MA 1QWEA 4F59A 2EPDA 2O88A 4JEGA 3QWXX 2HBWA 1ZUUA 1AOJA 2KXCA 1TCEA 3UATA 4F14A 3H0FA 4U17A 1WXBA 3NMZC 2DYBA 5GJWB 1O42A 5HKYA 3EG0A 2DVJA 1AVZC 2ENMA 1BHHA 1B3QA 1LUNA 1O4NA 3TVTA 1PHTA 3EG1A 1FHSA 2AZSA 1JYQA 3HIZB 2GGRA 2J7IA 1ZUKA 2LX7A 3PVQA 2CS0A 2D8JA 1E6GA 2FO0A 1OO3A 2QDLA 3H0HA 1GCQA 2RVFA 1ZBJA 3UYOA 1Z9QA 1T0HA 5FWBA 2MC1A 3BKBA 1PICA 5IHKA 1M3BA 1SHBA 2L3QA 2FCIA 3TSWA 2RQRA 4RTZA 2RNAA 2D8HA 3OVEA 2A37A 3TSZA 1FBZA 3CXLA 3TKZA 2K7AA 4FSSA 3VS4A 3EG2A 1K1ZA 3M7FA 4NWFA 4WWQA 3M0QA 2V1RA 1Z9ZA 1M61A 1M3AA 1SPKA 2HEQA 3EHQA 1NG2A 2Y3AB 1UE9A 4OHHA 1VYUA 1O4JA 1SSHA 2DL8A 3M0TA 1AB2A 4OMQA 1TG0A 2VWFA 1O4HA 3BUWB 2XP1A 2K2MA 2DILA 1YWOA 4AFUC 1OPLA 2VVKA 1G2BA 1FYRA 3VS0A 1BK2A 3RNJA 2H5KA 2BZXA 2MQIA 3IN7A 1IJRA 5J3XA 4HVVA 2HDXA 1N5ZA 1SHDA 2KNBB 1RJAA 3MAZA 1H8KA 2IUGA 2EGEA 1A08A 1AYDA 1PRMC 2AKKA 1NZLA 4OMMA 1LUKA 4CC2A 1NM7A 1NRVA 3A98A 3U23A 2ECDA 3N7YA 2K79A 1X6BA 4JJDA 1U06A 2RF0A 3EAZA 3PLFB 5HKZA 2DRKA 2DCRA 2F2WA 3GXXA 1CJ1A 2Y1NA 2LNWA 1RQQC 5EG3B 1TUDA 1A1EA 2CH4W 1B07A 1D4TA 2EO6A 1BG1A 2DBMA 2M0YA 1PNJA 1LCJA 3VRNA 5ECAA 1YP5A 2KRNA 4Z89A 3M0SA 1O43A 2E5KA 4IIOA 2EYXA 1R1SA 1FYNA 2G6FX 1UHCA 4F5BA 2D0NA 2YSQA 4K44A 2D1XA 4X1VA 3CWGA 2KRSA 3HCKA 3VRZA 5EHPA 3JV3A 1X6GA 4GPLB 1R1QA 3UF4A 1BM2A 5IHIA 4E6RA 4D8DA 2FPDA 1AYCA 1O4DA 1QCFA 2RSYA 5IXBA 2RQWA 1UECA 5IHNA 1I0CA 1MV0B 5I22A 2EYWA 1X0NA 3O5ZA 1GRIA 1BF5A 2EBPA 1A1CA 5BO4A 1BLJA 4Z88A 2LJ0A 2H8HA 3VS3A 1UFFA 1AOTF 3IMJA 2DX1A 1U3OA 2CDTA 2DM0A 2DL4A 4DGPA 1YVHA 1F1WA 3HHMB 1T3SA 2KROA 5KAZA 4GL9E 2J6KA 4R0KA 1LUMA 2CIAA 1Z3KA 2XMFA 3REBB 1HCTB 5DC9A 4A4BA 1CSYA 1YWPA 5EC7A 1JYUA 1PKTA 1K4US 2AKLA 3SEMA 2EQIA 2L3PA 2KGTA 3OP0A 1TZEE 4OMOA 3EHRA 1LKKA 4AG2C 1O4BA 1YNZA 2MOXA 2F2VA 2F2XA 1O4RA 1A0NB 2M51A 1O4OA 2W0ZA 2FEIA 2I0NA 1RLPC 1WFWA 3OV1A 1W6XA 2DA9A 2HSPA 2JS0A 1CKBA 4XZ0A 3NGPA 1SKJA 1UUSA 2ETZA 4WCIA 1AEYA 2GSBA 2KNOA 1I3ZA 1KSWA 4A4CA 2KBTA 3BUNB 1D4WA 1X27A 1O4CA 1K0XA 1BHFA 1QADA 2JYQA 2MRJA 1HD3A 1NYFA 5GJHA 4OMPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HCKA 2YUOA 2QMSA 4C92G 1Q86U 1BI1A 3HL8A 5LJ5f 2QGFB 3RKWA 1CSKA 2YXYA 4C92D 1AYBA 1QP2A 3LGLA 3O8VA 2HL3A 2RO0A 2MMPA 4PJMA 5GJVB 1G3WA 4IUTA 2MF2A 3CCQT 5AXIA 2LVMA 1N8RR 2XU8A 1KJWA 4J9HA 1BIAA 1R77A 3S9KA 3OYIA 2DL3A 1D1BA 1VQ4T 3FIFA 3H9NA 4F04B 2KRMA 2PU9B 4X6SA 2LZ6B 2VGMA 2LJ1A 4HVUA 1Y71A 4FM4B 1X69A 1KIKA 1VQ5A 3FLGA 1QVGS 3HSBA 2YSXA 1NLPC 5DF6A 1O4KA 5HK0A 3VS1A 4L59A 4RTXA 2JTMA 3CMAQ 2R5AA 4ROJA 1FMVA 3EACA 1FWZA 1WHMA 2DL7A 1IHVA 5DY9A 3PSKA 3OYGA 4C8QF 4J7FA 1QG1E 1BB9A 4NWGA 4OMLA 3I5SA 1BKLA 3C7IA 2H3JA 2JM8A 2PNIA 3I9QA 1AHJB 1UUEA 4BI3A 2JTEA 3QWYA 1TUGB 1O44A 1BHHB 2LQNA 3NTKA 1AZGB 1KC8U 1UURA 3CC4T 4M7AD 1LKLA 1YCYA 1M5Q1 1OX8A 2VUBA 2HQEA 3DLLA 4PJNA 2KYMA 4Y91A 2EYYA 4JJBA 1KD1R 2RMOA 1NZVA 1M4ZA 1WHKA 4O5VA 4F16A 1JRIA 1WA7A 3CCLQ 1VQ9T 4J9CA 4F5AA 5DM7R 1M90C 2E3IA 3CCUT 3CMAA 1MUZA 4F7UG 2ROTA 5CKEA 2JVVA 3OYBA 1OOTA 4C92C 4PNOA 4K2RA 3LH0A 2LQ8A 5FLXE 2EYVA 2GQIA 1K9MC 1RI9A 1BI2A 2NUPA 2RM4A 1O4QA 1MNEA 4KUIA 1QKWA 3JCMh 2EVRA 1GL5A 4AFZC 3GNGA 3MPUB 2P4RA 5DC0B 2EJFA 1RAIB 1M2VA 1RAEB 2FPEA 4M75A 4FIBA 1VA7A 4E7JA 1RL2A 1VIFA 3Q1JA 2QQAA 1N8RC 3SB2A 4L1BB 3REAB 2LT1A 4RTUA 2YLBA 2A36A 2GTOA 3A5ZB 1TTHB 2CBLA 2KK6A 1VYVA 2K5IA 1Y96B 1VQLQ 1D1CA 4M77G 2C0OA 4LE9A 2YRVA 4OB2B 3VYGA 5FU7B 1SHAA 2QI2A 3CCLA 4GWFA 4MDXA 5HCKA 3RBBB 3QO3A 1WHHA 1A09A 4E7SA 3TL0A 3PNWC 1I5LA 3NPFA 1R0BG 5I6VA 3OSSC 4BDYA 3GBQA 1VQ8Q 4CI0C 2QQBA 4ELZC 2QGGA 4DGXA 2MRKA 1NYGA 2E6NA 4BUGA 1WI7A 4EIKA 1X43A 4TZIA 1IXDA 1JU5A 3WA4A 3C95A 1FX7A 4Y28E 2GE9A 3PE0A 4OHEA 2V8IA 1FXXA 1BMBA 4EY0A 5I21A 4KT0E 1Q7YR 4N4HA 1KQ2A 2E65A 2JM9A 3AHUA 3AT1B 1UTIA 2RD1A 4XAXB 1WYXA 4OF1A 1WQ7A 3BDLA 2DO3A 2MWOA 2K5FA 3LH5A 2JN0A 2HKNA 1VQLA 4M7DA 1KD1C 5LL6S 2HNIA 5HY6A 5KCOA 1UGQB 3EGXB 4P9VA 2XIDA 1YFNA 3SFMA 4RTYA 4ELYC 1ABOA 1NJIU 2ZZDA 4LDYA 2Y1MA 4JUVA 3MEAA 3S8LA 1PG5B 3ULRB 2W10A 4O6JA 3EFRA 1H3HA 2OX7A 2EAYA 2NUZA 4LUDA 1NZ9A 2IZVA 2M0OA 1W1FA 4JRIA 4P9ZA 1O4AA 2DJQA 5GMKe 2KI7A 4M77C 2KSSA 2VIFA 4LD6A 2RK2A 4M78E 4M78B 2ZCFB 1O4FA 4K11A 2Y4YA 4OMFB 4N4IA 2DJZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4HCK A;  2PTK A;  2YUO A;  4JZ3 A;  2QMS A;  5CDW A;  4D8K A;  3US4 A;  1CSK A;  2DMO A;  2JMA A;  1KC2 A;  1AYB A;  2J6O A;  3THK A;  1ZX6 A;  1P13 A;  2AUG A;  2RQU A;  3R6N A;  1BFI A;  1X6C A;  2LNH B;  5GJV B;  2LNX A;  4J9F A;  1JU5 C;  2A08 A;  5AXI A;  1WDX A;  1KJW A;  1JXO A;  4J9H A;  2IUI A;  5EEL A;  3S9K A;  2CI8 A;  1NEB A;  2DL3 A;  4Y92 A;  1GHU A;  1HJD A;  4LN2 A;  4X6S A;  5DC4 A;  2KRM A;  2DE0 X;  4HXJ A;  2LZ6 B;  2LJ1 A;  4HVU A;  1FU6 A;  2L2P A;  1X69 A;  2JT4 A;  2DX0 A;  3M0R A;  5IH2 A;  2YUN A;  3CQT A;  4CC7 A;  1AWX A;  1KIK A;  1BBZ A;  1FU5 A;  1JXM A;  1KFZ A;  4J9B A;  3VRO A;  1K0S A;  2BBU A;  2YSX A;  1NLP C;  3PSJ A;  5DF6 A;  1O4K A;  1H92 A;  2L3S A;  3VS1 A;  1UDL A;  2CI9 A;  1K76 A;  4HVW A;  2HDA A;  2L0A A;  4RTX A;  1VYT A;  4A63 B;  4ROJ A;  5I11 A;  2IUH A;  5L23 A;  4CC3 A;  1AWO A;  2HMH A;  2H46 E;  3EAC A;  2PLE A;  2DL7 A;  2AZV A;  4GLM A;  5FW9 A;  3PSK A;  3BUO B;  2O9V A;  2GBQ A;  1R1P A;  2DBK A;  2EW3 A;  1MIL A;  1QG1 E;  1BB9 A; 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