2ABLA

Sh3-sh2 domain fragment of human bcr-abl tyrosine kinase
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
b'MGPSENDPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVNSLEKHSWYHGPVSRNAAEYLLSSGINGSFLVRESESSPGQRSISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHHSTVADGLITTLHYPAP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ABL TYROSINE KINASE
publication title Intramolecular interactions of the regulatory domains of the Bcr-Abl kinase reveal a novel control mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 37
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1996-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 2ablA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 2ablA02
1H8KA 1GBRA 2KK6A 1CKBA 1N5ZA 1XOVA 1E7OA 1CJ1A 1O4NA 4J9EA 2DM0A 1CKAA 1BG1A 1SPRA 3K2MA 4JE4A 1TG0A 2DNUA 1RQQC 3RBBB 1H3HA 2KBTA 2MIOA 2PZ1A 2EKXA 2GBQA 2RQWA 4OMQA 4F59A 1I0CA 1LKKA 2RORA 2F2VA 1UJ0A 2YSQA 3EG1A 1KFZA 1CWDL 1U3OA 1A09A 2YSXA 4QSYA 3M0PA 2CBLA 2KXCA 1K0XA 1IJRA 5IHKA 4K45A 3REAB 1JU5A 1UE9A 3OVEA 1OPLA 1X6BA 1GFCA 2A28A 2L0AA 2VKNA 4X1VA 3M0SA 5DC9A 4RTYA 1VYVA 4F14A 2RQTA 1AYCA 1YCSB 4HXJA 1NEGA 4FL2A 3T04A 2DCRA 1X69A 3VRZA 4CC3A 4OMMA 3OP0A 1ZFPE 2LJ3A 1SRMA 4DEYA 1BHFA 2MRJA 2MRKA 2NWMA 2Y1NA 4F5BA 3NGPA 5IBMA 2AUGA 1QG1E 4OMOA 2DL4A 2DE0X 1FYRA 4IIMA 3VGOA 2CSIA 3BKBA 3OB2B 1YNZA 1UJYA 2KXDA 1KA6A 5ECAA 2HDVA 1M27A 1YWOA 5HKZA 1I07A 1OV3A 2JMCA 5IHIA 3PLFB 5IHNA 2HMHA 1PICA 1RPYA 1WI7A 1AZEA 3UF4A 2CDTA 1VYUA 3M0TA 1A08A 1V1CA 2J6KA 4L1BB 1O42A 4LNPA 4OMPA 1KJWA 2KRMA 3H0FA 1M61A 1O4QA 5I6VA 2IUIA 1GFDA 2A36A 2FRWA 1SPKA 2C0OA 2SEMA 1NLPC 4RTUA 2DL5A 2J6FA 3VRQA 3VROA 3EG3A 2K2MA 3BUNB 1JXMA 1F2FA 3NHNA 1FHSA 3SHWA 2BZ8A 2EL8A 1QCFA 1BKMA 1Z9QA 2P4RA 2JM9A 4HCKA 1SHFA 4JZ3A 1A1BA 2B86A 1O4KA 1SHAA 3N8MA 2BTTA 2HCKA 1H9OA 4K44A 1LCJA 1O4GA 3US4A 3PE0A 1O4OA 3HIZB 2EBPA 5EELA 1O4AA 4RUGA 1BF5A 1U5SA 4J9FA 1A07A 1FU5A 3EAZA 1O45A 3I5SA 1LCKA 4X6SA 1WA7A 1ARKA 1B47A 1VA7A 1PKSA 2D8JA 1IS0A 1PHTA 2DMOA 3VS5A 1R1QA 1WXUA 2DL3A 1HD3A 2C9WA 1QADA 1LUKA 1AWJA 2J05A 3LH5A 2BZXA 1FBZA 1UUSA 4Y92A 2DLPA 1NM7A 1MV3A 2L2PA 3C7IA 2LQWA 1JEGA 2CH4A 2LQNA 2DA9A 2RPNA 1A0NB 4AFQC 5D0JA 2VWFA 2EGAA 1NEBA 4AG1C 1Y0MA 1HSQA 2A08A 2LP5A 1BLJA 1KIKA 2YT6A 4Z89A 2CI9A 2KRSA 1K0SA 1O46A 2L3QA 1BHHB 4JZ4A 3S9KA 2KYBA 2RSYA 1WLPB 3UA7A 1SPSA 2ECDA 4DGPA 3ULRB 1X43A 4ZNXA 3S8OA 2HDAA 1ZUYA 1D1ZA 4J9GA 2PLDA 2CIAA 4J9IA 2W0ZA 4AFSC 1GCQA 3QWYA 2L3SA 2X3XD 1AYDA 1X27A 4A4BA 1UECA 5FWCA 2GTJA 2DRKA 1BBZA 1NYFA 1UG1A 2IUGA 4CC4B 2GNCA 2PNIA 1O49A 2B3OA 2W10A 4GWFA 1WXBA 2FEIA 2YUNA 1AZGB 3EACA 4E6RA 1NG2A 2EYXA 3ZL7C 5IXFA 2K3BA 2ETZA 1BFIA 1AWXA 1TUDA 1O4DA 1Y1UA 1BMBA 2RQUA 3VRPA 4P9ZA 1BM2A 2SRCA 4LE9A 2L3TA 2HSPA 4AFZC 2FCIA 4J9DA 2F2XA 5EG3B 2EGCA 2O88A 2JM8A 5GJWB 1BLKA 2H8HA 3GQIB 4OMNA 3PQZA 4ORZA 4NWFA 2AOBA 2RNAA 1CSZA 5EHRA 1O4IA 1HJDA 2YUPA 4LN2A 4JGHA 4F5AA 1I3ZA 1AWWA 2M51A 2O9SA 4J9CA 1PRMC 1JWOA 1GRIA 2K7AB 1UFFA 4JJCA 3VS7A 2X3WD 1O4CA 1E6HA 4KRTA 1J3TA 2PTKA 4EIHA 2EYWA 2L3PA 3IQLA 1WX6A 3JV3A 1WFWA 3M7FA 2YU7A 1AYAA 4FSSA 4DGXA 1O4HA 3M0UA 3PVLA 4DEXA 1UHFA 3H0HA 4H34A 2FRYA 1SHDA 3TKZA 3PS5A 4FL3A 1SEMA 1FMKA 1QWFA 2DBMA 2RF0A 1LUMA 3IN8A 4E68A 2ROLA 3UATA 5HCKA 1O43A 4LUDA 1W6XA 1A1AA 1JYUA 1P13A 2O2OA 4NWGA 4J9HA 3GBQA 2L6KA 2JYQA 2EKHA 2CS0A 1WYXA 2JXBA 1CSYA 1NRVA 2PNBA 3TSWA 5HKYA 2ESWA 1U06A 3I5RA 3I9QA 1D4WA 2KYMA 2ENMA 1MILA 2RMXA 2DX1A 3PJPA 1WQUA 3NPFA 2M0YA 1ZBJA 4RTWA 1X2QA 2F2WA 2V1QA 2KR3A 4LUEA 1K4US 1CWEA 1X0NA 1YVLA 2CH4W 4M4ZA 2CI8A 1RLQC 3VS6A 1O4FA 1KA7A 2OZOA 1UHCA 2GSBA 1LUNA 1O4EA 3CXLA 1NLOC 1T3LA 1GCPA 3VS0A 1FYNA 1KSWA 1X6GA 4WCIA 2GE9A 1RLPC 2O9VA 2MC1A 1LUIA 5GJHA 1JYRA 3H0IA 1BB9A 2XMFA 5IXBA 1AVZC 3N84A 4XZ0A 5DC0B 2YDLA 2LCSA 2YUQA 5KAZA 4U1PA 1UGVA 1AOUF 1UUEA 4J9BA 4JEGA 2J7IA 1BKLA 2EQIA 1O4BA 3GXWA 2L4KA 2JW4A 5DF6A 1ABOA 3EG2A 4OHIA 2AKKA 3HHMB 1Z9ZA 2C0TA 2HDXA 2IIMA 1RJAA 2V1RA 3TL0A 2CT4A 2RVFA 2LJ1A 1TZEE 2EYZA 3OB1B 5HKWA 1HCTB 3R6NA 3C0CA 1AWOA 1O4RA 1X6CA 2K6DA 2HUWA 4RTZA 2DF6A 1UTIA 2ABLA 3VRNA 3ZNIA 3BUMB 4F16A 3U23A 2OAWA 4D8KA 2OJ2A 1YN8A 1MUZA 2SHPA 1H92A 5EHPA 4A4CA 2YUOA 1K9AA 1ZLMA 1UDLA 1A81A 3IMJA 1W70A 2G6FX 1B07A 2DM1A 2OI3A 2LCTA 1SHGA 2EYVA 1W1FA 1T3SA 1GCQC 1ZX6A 3VRRA 1AB2A 1O41A 2MQIA 1O4LA 1S1NA 2ECZA 2JTEA 2KT1A 3H41A 2AOAA 4RTTA 4OHHA 3IN7A 2IZVA 2DYBA 2ED1A 4JJDA 2NUZA 2Y3AB 1UURA 1QKWA 1SSHA 2I0NA 2AK5A 4RTXA 4EY0A 2EGEA 3PSKA 5GJVB 1RUWA 5FW9A 3TVTA 1GHUA 3VS3A 2DX0A 3BUXB 3EHRA 2RN8A 1BU1A 4JJBA 3MXYA 1KC2A 2D1XA 1BHHA 4U17A 1K76A 5J3XA 3VRYA 2GTOA 4CC2A 2MK2A 2LNXA 2KGTA 4E93A 1JU5C 2K79A 2EU0A 2JS0A 2DL8A 1O48A 2DL7A 2KT8A 2VVKA 1YP5A 2LNHB 3S8NA 1Z3KA 1Y57A 4CC7A 2XP1A 2KEAA 1AEYA 3VS1A 3VS2A 2FO0A 1WXTA 5AULA 4TZIA 2GGRA 4OHEA 3N7YA 1ZSGA 1NZVA 4OHLA 1GL5A 1G2BA 2LX7A 2HEQA 1MW4A 2MOXA 5GJIA 4AFUC 5DC4A 1MV0B 1M27C 2JS2A 1M8MA 4ESRA 1E6GA 5BO4A 3M0RA 2EVRA 2DLZA 2D8HA 1B3QA 4QT7A 1FBVA 2VIFA 2A37A 2DRMA 4K11A 3S8LA 2KNBB 5EC7A 3I35A 4A63B 1M3BA 3CBLA 4Z88A 2O31A 1K1ZA 3REBB 4P9VA 1OOTA 5L23A 1AD5A 1PWTA 4GL9E 3TSZA 3KFJA 1PRLC 1BK2A 1GBQA 1ZUUA 1JXOA 2CREA 1NYGA 1ABQA 3CQTA 2DVJA 2BBUA 3PFVA 3RNJA 4GBQA 1G83A 2ROTA 1QLYA 1O4PA 2PLEA 3WA4A 2CT3A 2EOBA 2ED0A 2DILA 3KFVA 2AZVA 3GXXA 2KRNA 1WDXA 3UYOA 1RI9A 2K7AA 1AOTF 3CWGA 2KROA 3MXCA 1BFJA 2Y1MA 2AZSA 2D0NA 1X2KA 4GLMA 3BUOB 3EG0A 1JQQA 2CR4A 2CUBA 2K9GA 3O5ZA 1O44A 1ZUKA 1AYBA 1TUCA 1QWEA 4H1OA 2KE9A 2LZ6B 3THKA 1OO4A 1AOJA 1M3CA 2CUDA 4AG2C 1A1EA 5FWBA 1YWPA 1O4JA 2MCNA 2QMSA 5EEQA 1O4MA 4RTVA 1PNJA 2RQRA 1SRLA 2RMOA 2CRHA 2EO3A 1O47A 2FPDA 3VS4A 4GPLB 1QKXA 2PNAA 5AXIA 2JT4A 2DJQA 3IMDA 4IIOA 1F1WA 3CD3A 4JPBW 3EGUA 2RQVA 2LMJA 4WWQA 3PSJA 4XZ1A 2GQIA 1OEBA 3PVQA 1NZLA 3SEMA 2JMAA 1XA6A 1JO8A 3OV1A 5CDWA 2HBWA 4ROJA 3A98A 2J6OA 3QWXX 4EIKA 1VYTA 4Z8AA 3FJ5A 2CSQA 2LJ0A 5I11A 4F17A 2EPDA 2FPEA 4HVVA 4D8DA 1LKLA 2IUHA 1M30A 2KNOA 3NMZC 1WIEA 4OMLA 1D4TA 1CSKA 4OHDA 5IBSA 1M3AA 1R1SA 1SKJA 3HCKA 2EW3A 1T0HA 1JYQA 2E5KA 2DLYA 2AKLA 2FPFA 4HVWA 5IH2A 2EYYA 1I1JA 1IO6A 2FG0A 2J06A 4HVUA 5I22A 1SHBA 1TCEA 2OQ1A 3M0QA 2H46E 3EHQA 2BZYA 3UA6A 3BUWB 1EFNA 1OPKA 1A1CA 1FU6A 1OO3A 2K79B 2C0IA 1HCSB 1YVHA 4K2RA 3MAZA 2LNWA 2QDLA 4R0KA 2DBKA 4FBNA 1PKTA 2EO6A 2H5KA 1T0JA 1R1PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GBRA 3D7SB 3M56A 4EDUA 1XOVA 1E7OA 2DM0A 4JUVA 1SPRA 3K2MA 1OU8A 3G6ET 4OMFB 2EFIA 4F59A 5GAMf 4XK8E 1TS9A 3QUIA 2F2VA 4IUQA 1CWDL 1EX4A 2QASA 2KXCA 1WHGA 3JCMg 4K45A 4JLGA 4MDXA 2MK5A 1YCSB 3T04A 3RESA 2DCRA 2X4XA 1QMCA 1SRMA 1MMAA 2YRVA 4FT4A 4F5BA 1C0MA 1QG1E 1Y71A 3VGOA 4IIMA 1KA6A 2H3JA 3CPWA 1VQOQ 5HKZA 1YWOA 2JMCA 2RH2A 3EFRA 3EH2A 1IREB 2KMTA 2CKKA 1IRXA 3GNGA 3M0TA 4C5IA 3JB9G 1OX8A 4HCCA 4A53A 1O4QA 1M61A 1WPYA 5CKDA 2P0PA 2K2MA 3S3OA 1QCFA 2L5QA 1VQOA 1Z9QA 2P4RA 2JM9A 2ZPEB 3ZEHA 3OYLA 1Q86R 3I56T 1LCJA 3LX7A 3M5AA 2EBPA 1O4AA 3X24B 4RUGA 3OYGA 1U5SA 4J9FA 1A07A 4L5GA 1LCKA 1WJSA 1H3ZA 1PD0A 1WA7A 1B47A 1VA7A 2DAQA 4DBFA 1VQMQ 1R1QA 3OA6A 3CD6T 2BE9B 3CPWP 3CCRT 3LH5A 2BZXA 2JUFA 1N8RR 1VQ7T 3NTHA 3X28B 1VQ6T 2YLCA 2DA9A 4AFQC 4EPCA 1HSQA 2LP5A 4Y91A 4PJNA 5KCOA 3QSUA 4ZGDB 8AT1B 1U1TA 2CI9A 1ZSZC 4BI8B 3J80E 1K0SA 1VQMA 2P0KA 3S6WA 1BHHB 1VIFA 1SSFA 2RSYA 2F5TX 4M78F 1TTHB 4Q5WA 2EWNA 4ZNXA 1ZUYA 1D1ZA 1U1SA 2PUOB 2QXFA 2V8IA 3JB9H 4MMKA 2KGYA 3CCQT 1HK9A 1SG5A 1X27A 4C92E 1AYDA 2ATCB 4FU6A 2DRKA 3JCMV 1NYFA 4FT2A 4CC4B 3GNFB 2W10A 4M77F 2EIFA 3EACA 3ZL7C 2DXBA 1TUDA 3H8ZA 1O4DA 1Y1UA 3RUXA 1BMBA 3VRPA 2CP6A 2QA4T 4P9ZA 2R5AA 3QO3A 1BM2A 1FX7A 3PTAA 4ME7A 2PVGB 1IXDA 1YJWQ 3MHXA 3OYFA 2OTJT 5CKFA 1KC8R 3C12A 5LL6S 5AYFA 3PQZA 5CKHA 3QJ6A 2AOBA 2RNAA 3KUFA 1CSZA 1KHCA 4LN2A 1HJDA 3HTRA 3X26B 1UFFA 2X3WD 3L2ZA 4J7IA 3VUBA 3OYHA 1WHHA 4EIHA 3V8LA 4B9XA 2Y4YA 5CKBA 2HQEA 3L2VA 1YJWA 2Y4XA 3H0HA 3JCMQ 4FL3A 3QZ5B 1QWFA 2RF0A 1I5LA 2VV5A 1ACMB 1VQNQ 2COZA 3BW1A 4JRQA 4C92A 2E12A 1JYUA 1UGQB 2L6KA 2HBPA 2EKHA 1CSYA 4PFOA 5HKYA 2QGFB 2ESWA 2QEXQ 1NBEB 4ZGEB 5GANe 1GXIE 3OYDA 2XG8D 1MGQA 2KSSA 5J39A 1K4US 1RAHB 1X0NA 1CWEA 1LPLA 2HKQB 2LT1A 3CCLT 3VS6A 1O4FA 2DTHA 1UHCA 3P8BB 4C0DC 4QQGA 1O4EA 3CXLA 1T3LA 2DK3A 5LJ5f 1VQNA 1BIAA 3CC2Q 3VS0A 1KSWA 2DXUA 3FLGA 3L2UA 2RI3A 2GE9A 1VQKT 5CK9A 5HKCA 2YHTA 1ZSZB 3ZFJA 3GF5A 1QP3A 2K5LA 3URGA 2F5KA 4JLIA 3OS2A 2QEXA 4QW2A 3TREA 5KAZA 2HAXA 4J9BA 4PLIA 1BKLA 2EQIA 3CCJT 4KGVB 1VQ5T 5DF6A 4JS5A 1ABOA 3EG2A 3SD4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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