4NWGA

Crystal structure of the tyrosine phosphatase shp-2 with e139d mutation
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
533
structure length
498
Chain Sequence
TSRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGAEKLLTEKGKHGSFLVRDSQSHPGDFVLSVRTGDSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDGDPNPVSDYINANIIMPEKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with E139D mutation
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
total genus 155
structure length 498
sequence length 533
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2013-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4nwgA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4nwgA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4nwgA03
4FL3A 2OOQA 2Y1MA 2A3KA 5GJIA 2Y3AB 5KAZA 4YR8B 1KSWA 2ECDA 3IN8A 4K2RA 2VEUA 1PA1A 4BJOA 1ZCLA 5GTJA 3QKPA 4RI5A 1O42A 1OHEA 2I1YA 1RPMA 4AZ1A 5BZXA 1LCKA 2F6VA 3NMEA 1G7FA 1SPRA 1HCSB 3EU0A 1O4BA 1KAKA 1PTYA 2NTAA 3VS1A 1XRIA 1C84A 1T48A 3D1OA 3O3LA 1M61A 4GRYA 1I9SA 3PLFB 2ESBA 4D8KA 2CNGA 2NZ6A 2EL8A 1O4IA 1BLKA 1KA7A 4QSYA 2C7SA 2J17A 2MRKA 1U24A 4NX8A 2AOAA 2CM3A 5KA7A 4P9VA 4ZI4A 1X27A 1WCHA 3QCKA 3BRHA 1BF5A 2OC3A 4H1OA 4WU3A 3SMEA 1QADA 2HXPA 1LUNA 1AYDA 3TL0A 1SUGA 1U25A 2HDVA 2F6ZA 5KA3A 4NWGA 3B7OA 4HJQA 2Y1NA 5AWXA 2L4KA 2I3RA 1AYBA 3CD3A 1I3ZA 1QG1E 2HUWA 5K25A 1NRVA 4RKKA 1O43A 2I4GA 1F1WA 4Y2EA 3S8LA 2VEWA 1L8GA 2GP0A 3O4UA 4IKCA 1KA6A 1BHHA 1JLNA 3EZZA 1OPLA 4U17A 1RPYA 4ZRTA 5KA9A 3V0HA 3M4UA 3A5JA 3CWGA 3QCCA 2DLZA 5EHPA 1SHDA 1BG1A 1OPKA 3QWYA 2F6FA 2J16B 3CM3A 3MXYA 3T04A 1OHDA 1YZ4A 3D42A 3S3FA 4RHGA 1FU5A 5HKWA 3VS4A 2QDMA 1LUMA 3OV1A 4LUEA 1NZVA 1YGUA 2QCTA 2HB1A 4JNBA 1GRIA 1UUSA 2CIAA 1U26A 2HNPA 3LJ8A 2ETZA 2OZ5A 3MOWA 5BUGA 1LARA 1X24A 1QXKA 2LCTA 4GPLB 2H4KA 1CSZA 3GXXA 2LNXA 3M7FA 2PT0A 3VRPA 3V0IA 1QCFA 3V0JA 4PYHA 1TZEE 3N0AA 1QZ0A 2PBNA 1A1CA 2MQIA 5DC9A 3QCEA 1WAXA 4QBEA 1D4WA 1O4NA 5K23A 1P13A 1A1AA 1HCTB 2AOBA 1G1HA 2PLEA 4E93A 1A5YA 4R0TA 5IBSA 1SPSA 1P15A 4ICZA 2MBCA 3AWEA 2GSBA 2IUHA 3O4SA 2XP1A 2CNFA 4OHEA 1R1PA 2P6XA 1Z3KA 3MMJA 1OEVA 3ZM0A 2LNWA 1OO3A 4E68A 1AOUF 1CWDL 2MRJA 3MXCA 3VS0A 1R1SA 2I75A 1RQQC 3V0EA 1OEOX 5KABA 3IN7A 4D3QA 1NZ7A 2RVFA 1G1GA 3ZM2A 4F5BA 3MAZA 1BM2A 2ABLA 1BZCA 1PA9A 1C86A 2IUGA 3F99A 1SHAA 3PSJA 4FL2A 4QBWA 3D1HA 1Y57A 3QCNA 5K9WA 4QAHA 2LQNA 3BUXB 4HRFA 1H9OA 3EAZA 2HC1A 2I5XA 4Y14A 1Q6JA 2Q47A 2EYZA 2YSXA 3US4A 1JU5A 1JF7A 2NT2A 3EB1A 3S4EA 1CWEA 2G6ZA 2HMHA 5KA0A 3S3KA 1A81A 1R1QA 1FPZA 2CNHA 3MOZA 2L3TA 2F6YA 3HIZB 3V0GA 1K9AA 4LUDA 2FCIA 1O4AA 2LQWA 3HHMB 1D4TA 1JYQA 1IJRA 2YDUA 4XZ1A 2PQ5A 1Q6TA 1LCJA 1VHRA 1LYVA 1XXVA 5GJHA 1FHSA 2SHPA 2NLKA 3WA4A 2CM2A 3S8NA 1AAXA 1FMKA 2H03A 4JE4A 2CR4A 1ECVA 2A8BA 3OLRA 3GXHA 2CS0A 2CI8A 2CI9A 2VIFA 5DF6A 1Q1MA 2GWOA 2NV5A 3VS3A 4R0SA 1O45A 1AYAA 4U1PA 3N8MA 5DC4A 1J4XA 5KA4A 1O4MA 5K22A 2PLDA 3QCIA 2F6WA 2C0TA 3PS5A 1CJ1A 3V0DA 1YVHA 1LQFA 2JYQA 1I57A 2Y2FA 3ZV2A 1PH0A 2K7AB 3BUMB 1EEOA 2PA5A 2VEXA 3QWXX 3VRYA 3VS7A 2HNQA 2I6MA 3ZMPA 4RH9A 3CXLA 2F71A 5EEQA 1RXDA 4JMKA 3H2XA 3S3EA 4X6SA 3OB2B 4B04A 1NO6A 2QDCA 1Q6SA 2KK6A 3PSKA 2DM0A 1YGRA 3D1QA 3O5XA 3ZM1A 3K2MA 3BKBA 4A4CA 1JWOA 1NWLA 4JGHA 3SR9A 3BUNB 4F5AA 3OB1B 3ZNIA 5BX1A 2FJMA 3BUWB 5EELA 3BUOB 2I6IA 2QMSA 4NYHA 2CM8A 1X6CA 1GHUA 1BHFA 3BM8A 1O4RA 2J16A 4NNDA 1YTNA 5KACA 1BZJA 2BBUA 1A07A 2H4VA 3OP0A 3VRRA 1O4LA 2B4OA 2I6JA 1O48A 3N84A 1R6HA 2CMCA 1IS0A 2SRCA 3BLTA 5IBMA 3VGOA 2HDXA 5BO4A 3IMDA 1ZC0A 3F41A 5K9VA 5M43A 1UURA 4GS0A 1JYRA 2H4GA 3IMJA 1D5RA 3EAXA 2BZLA 2DCRA 1FQ1A 3C7IA 4JMJA 1A09A 2P4DA 3A5KA 2H02A 2WGPA 3QCBA 1GWZA 3VRNA 4RI4A 4K44A 4DGXA 1Y1UA 5KA1A 2CM7A 2DX0A 4BPCA 5D0JA 4FBNA 1C83A 3RGQA 1PTVA 1O4QA 4D3RA 3F81A 2B4UA 1ZZWA 2EO6A 2C0IA 3VRQA 3NHNA 2I3UA 4JBCA 1PTTA 2MK2A 3BLUA 2K79B 4NWFA 1Q6PA 1ZCKA 2R0BA 1O4CA 4WOHA 4WTYA 3QCJA 3F9AA 4S0GA 2BGEA 1BZHA 2B3OA 2QDPA 3D9CA 5AXIA 2BGDA 3I80A 5LXQB 4M4ZA 3PJPA 4DGPA 2RORA 1NNYA 2PSZA 2EU0A 2OZOA 4R30A 2B49A 1KC2A 2H46E 3PFVA 1MKPA 2VEVA 3EMUA 3QCMA 2RMXA 4HJPA 4RH5A 1T4JA 3RZ2A 4PVGA 2QBSA 2HCKA 4GE5A 1LUKA 3EACA 2HVLA 1O4PA 1Q6MA 3ZMQA 2EYYA 1PYNA 1X0NA 3AWGA 5AULA 2QBPA 3QCHA 3GQIB 2PNBA 2AZRA 3O4TA 4GFUA 2OUDA 5HDEA 5MMZB 2VEYA 2CNIA 5KAAA 1YVLA 1PTUA 1C88A 2YU7A 3OVEA 5I6VA 2BIJA 4QUNA 1RJAA 4GWFA 5KADA 2DLYA 4OHHA 5J3XA 1XBOA 2RF6A 2ZMMA 2HC2A 1C85A 1A08A 1JYUA 2EYVA 3VROA 5EG3B 2G59A 4H34A 2CMBA 1MW4A 3QCFA 2DVJA 1Q6NA 4GE6A 4JEGA 2KNOA 1FPRA 4KI9A 4XZ0A 1YWFA 1YPTA 2IUIA 2CJZA 3I7ZA 1L8KA 1O41A 1O4KA 1ZFPE 4D3PA 3QCGA 4ERCA 1YTSA 4K11A 1FU6A 1BKMA 4YAAA 2B4PA 1O46A 1FBVA 1AOTF 1LKKA 2CBLA 1M3GA 1O4FA 4RDDA 1LUIA 3QKQA 1BHHB 3N7YA 2I4HA 3S4OA 2B4SA 2F6TA 1B47A 3I36A 4MBBA 2I6OA 2I42A 1OESA 5HKZA 4KYQA 2GE9A 3ZM3A 1BLJA 3PQZA 1OEUA 1BMBA 1KAVA 1O44A 2CNEA 4ROJA 2E0TA 4TZIA 1NZLA 2H5KA 3VS2A 1I9TA 2AHSA 1D1ZA 1XA6A 5KA8A 3OMHA 2MC1A 2I6PA 1AD5A 2IMGA 1ONZA 2I4EA 3V0FA 1XXPA 1XM2A 5J8RA 3U96A 3S9KA 1O4JA 2AUGA 1A1BA 3CBLA 1BFIA 2C46A 4GFVA 4J51A 3HCKA 2F46A 2GJTA 2NT7A 3D44A 1FBZA 1TCEA 5KA2A 2QBQA 3GXWA 4WU2A 2HCMA 2H8HA 3TKZA 1V3AA 2B07A 1OHCA 2F70A 4GE2A 4I8NA 2M3VA 4K45A 1PXHA 2RSYA 2QCJA 2FJNA 4WWQA 2QEPA 2CMAA 1G83A 1FYRA 4OHLA 1G7GA 3QCDA 1ONYA 3VS5A 1AB2A 4TVVA 2CRHA 2PTKA 3UYOA 1O49A 1AYCA 2Y96A 4QAPA 3F9BA 3S3HA 2HY3A 1O4HA 3KFJA 2EOBA 1SKJA 3AWFA 4KYRA 4Z6BA 3VS6A 4F59A 2EKXA 5DC0B 4GRZA 2OQ1A 2FH7A 1BKLA 3VRZA 2QBRA 2EO3A 4OHDA 1NL9A 1LKLA 4GL9E 1O4GA 3QCLA 4P9ZA 1O4DA 2H04A 5EHRA 2C0OA 4EY0A 3RO1A 1BFJA 1CSYA 2ZN7A 1WRMA 2BV5A 4A4BA 1G1FA 1G4WR 2Q05A 1MILA 4OHIA 1PICA 2CFVA 1O4OA 2L6KA 4QUMA 3GXGA 1O47A 3UF4A 4EIHA 1OO4A 2FO0A 2C9WA 1OETA 1YN9A 2DXPA 2JJDA 5K24A 1G4US 3RGOA 1YFOA 1SHBA 1OEMX 2PNAA 1O4EA 1A1EA 1C87A 4L1BB 3CWEA 5CDWA 1WQUA 2IZVA 4ZN5A 1M27A 3S8OA 1T49A 1F2FA 1NWEA 5HKYA 2PI7A 1GFYA 5BZZA 1YTWA 1EENA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FL3A 2OOQA 2Y1MA 2A3KA 5GJIA 2Y3AB 5KAZA 2GCAA 4BUCA 4YR8B 2F00A 1KSWA 2ECDA 3IN8A 4K2RA 2VEUA 3QCZA 1PA1A 4BJOA 1ZCLA 5GTJA 3QKPA 4RI5A 1O42A 1OHEA 2I1YA 1RPMA 4AZ1A 5BZXA 1LCKA 2F6VA 1P31A 3NMEA 1G7FA 1SPRA 1HCSB 3EU0A 1O4BA 1KAKA 1PTYA 2NTAA 3VS1A 1XRIA 1C84A 1T48A 3D1OA 3O3LA 1M61A 4GRYA 1I9SA 3PLFB 2ESBA 4D8KA 2CNGA 2NZ6A 2EL8A 1O4IA 1BLKA 1KA7A 4QSYA 2C7SA 2VTDA 2J17A 2MRKA 1U24A 4NX8A 2AOAA 2CM3A 5KA7A 4P9VA 4ZI4A 1X27A 1WCHA 3QCKA 3BRHA 1BF5A 2OC3A 4H1OA 4WU3A 3SMEA 1QADA 2HXPA 1LUNA 1AYDA 3TL0A 3MVNA 1SUGA 1U25A 2HDVA 2F6ZA 4CVLA 5KA3A 4NWGA 3B7OA 4HJQA 2Y1NA 5AWXA 4CVMA 2L4KA 2I3RA 1AYBA 3CD3A 1I3ZA 1QG1E 2HUWA 5K25A 1NRVA 2VTEA 4RKKA 1O43A 2I4GA 1F1WA 4Y2EA 3ZM5A 3S8LA 2VEWA 1L8GA 1J6UA 2GP0A 3O4UA 1KA6A 1BHHA 1JLNA 4IKCA 3EZZA 1OPLA 2XPCA 4U17A 1RPYA 4ZRTA 5KA9A 3V0HA 3M4UA 3A5JA 3CWGA 3QCCA 2DLZA 5EHPA 1SHDA 1BG1A 1OPKA 3QWYA 2F6FA 2J16B 3CM3A 3MXYA 3T04A 1OHDA 1YZ4A 3D42A 3S3FA 4RHGA 2Y67A 1FU5A 5HKWA 3VS4A 2AM2A 2QDMA 1LUMA 3OV1A 4LUEA 1NZVA 1YGUA 2QCTA 2HB1A 4JNBA 3LK7A 1GRIA 1UUSA 2CIAA 1U26A 2HNPA 3LJ8A 2ETZA 3PYZA 2OZ5A 3MOWA 2WJPA 5BUGA 1LARA 1X24A 1QXKA 2LCTA 4GPLB 2H4KA 1CSZA 3GXXA 2LNXA 3M7FA 2PT0A 3VRPA 2Y66A 2LRAA 3V0IA 1QCFA 3V0JA 4PYHA 1TZEE 3N0AA 4C13A 1QZ0A 2PBNA 1A1CA 2MQIA 5DC9A 3QCEA 1WAXA 4QBEA 1D4WA 2GC6A 1O4NA 5K23A 1P13A 1A1AA 1HCTB 2AOBA 1G1HA 2PLEA 4E93A 1A5YA 2XJAA 5IBSA 4R0TA 3UAGA 1SPSA 1P15A 4ICZA 2MBCA 3AWEA 2GSBA 2IUHA 2KGYA 3O4SA 2XP1A 2CNFA 4OHEA 1R1PA 2P6XA 1Z3KA 3MMJA 1OEVA 3ZM0A 2GCBA 2LNWA 1OO3A 2JFGA 4E68A 1AOUF 5A5EA 1CWDL 2MRJA 3MXCA 3VS0A 1R1SA 2I75A 1RQQC 3V0EA 1OEOX 5KABA 3IN7A 4D3QA 1NZ7A 2RVFA 1G1GA 1O5ZA 3ZM2A 4F5BA 3MAZA 1BM2A 2ABLA 1BZCA 1PA9A 1C86A 2IUGA 2UUOA 3F99A 1SHAA 3PSJA 4FL2A 4QBWA 3D1HA 1Y57A 3QCNA 5K9WA 4QAHA 2LQNA 3BUXB 4HRFA 1H9OA 3EAZA 2GC5A 2HC1A 2I5XA 4Y14A 2VOSA 1Q6JA 2Q47A 2EYZA 2YSXA 3US4A 1JU5A 1JF7A 2NT2A 3EB1A 3S4EA 1CWEA 2G6ZA 2HMHA 5KA0A 3S3KA 5A5FA 1A81A 1R1QA 1FPZA 2CNHA 3MOZA 2L3TA 2F6YA 3HIZB 3V0GA 1K9AA 4LUDA 2FCIA 4ZIYA 1O4AA 2LQWA 3HHMB 1D4TA 1JYQA 1IJRA 2AM1A 2YDUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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