4NWGA

Crystal structure of the tyrosine phosphatase shp-2 with e139d mutation
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
533
structure length
498
Chain Sequence
TSRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGAEKLLTEKGKHGSFLVRDSQSHPGDFVLSVRTGDSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDGDPNPVSDYINANIIMPEKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with E139D mutation
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
total genus 155
structure length 498
sequence length 533
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2013-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4nwgA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4nwgA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4nwgA03
3QCNA 2CJZA 3V0DA 4GE6A 2PT0A 5HKZA 3O4SA 1A1EA 1D5RA 4WOHA 3BKBA 1O4QA 3V0IA 1R1QA 2RVFA 5IBMA 2CIAA 1T49A 2L3TA 1O45A 1XM2A 2EO6A 3BUOB 2QDCA 1G7FA 2QDPA 3D44A 1NZVA 5K9WA 4KYRA 4K11A 1SHAA 2JYQA 1T48A 1TZEE 3BUMB 4R0SA 1F1WA 3BUWB 4ERCA 3M4UA 1LQFA 4IKCA 3VS0A 1A1BA 2NLKA 2B3OA 1AYCA 5LXQB 2CS0A 3QCMA 4ZRTA 1OEUA 4L1BB 2H5KA 3GXWA 1LUMA 2RF6A 1L8KA 5MMZB 2EKXA 3QCIA 2J17A 3RGOA 1TCEA 1KSWA 4ICZA 3QWYA 4JNBA 4QAHA 5D0JA 3S8OA 1X6CA 2L4KA 2EYYA 3OV1A 3S8NA 1SPRA 2KK6A 4GPLB 2CM8A 2F70A 3VS1A 1JU5A 3TL0A 3D1OA 1G4US 2H46E 1O4RA 2FH7A 2HNPA 1O48A 5AXIA 1UURA 5KAZA 2PTKA 4GS0A 4GFUA 1BHFA 2BGDA 4J51A 1KC2A 4LUDA 2J16B 3BRHA 4JMKA 2DLZA 1OHCA 3O5XA 1FU5A 2C0OA 1YGUA 2NZ6A 4ZN5A 1AD5A 1FYRA 2I3UA 2MRKA 4K44A 3OB2B 3V0JA 2SRCA 2IMGA 4BJOA 5K9VA 4WU2A 2I6JA 1NWLA 2R0BA 4XZ1A 1KAKA 1V3AA 4A4BA 2H4GA 2F6ZA 4GRYA 1BM2A 1PTVA 1I3ZA 5I6VA 3ZV2A 1NO6A 1KAVA 1Q1MA 4NWFA 3BLUA 3QCJA 3U96A 2WGPA 4QBEA 5KA2A 2EOBA 2M3VA 3QCGA 4NX8A 4DGXA 2DVJA 5K24A 2B4OA 2ZMMA 2CI9A 3GXXA 3CBLA 4XZ0A 5DC4A 4GFVA 2I75A 2Y1MA 3S3HA 4TVVA 3QCDA 2CFVA 2HB1A 1WQUA 1O4NA 3BUXB 2F6FA 1C87A 1AYBA 1L8GA 3QCLA 1O43A 4RH5A 3K2MA 2C46A 4P9ZA 1SKJA 5HKWA 2H03A 2CM2A 2HCMA 1RPMA 1G83A 1YWFA 1ZZWA 4KI9A 1O44A 2HMHA 5EHPA 1ZCLA 3RZ2A 3A5JA 4JE4A 5DF6A 1O46A 3QWXX 1VHRA 2FJNA 3UYOA 3D9CA 1RXDA 5J8RA 3EACA 2MC1A 1O4JA 1JYUA 3MXYA 2QBPA 5BUGA 3V0EA 2C7SA 1BG1A 5KACA 2I4EA 2B4UA 1U24A 5KAAA 5KA9A 1O4AA 2C0IA 3PJPA 4WU3A 5DC0B 4JEGA 3EZZA 5KA4A 1SHDA 1K9AA 2PNAA 3PS5A 4A4CA 1X24A 3ZNIA 2NTAA 4OHDA 1B47A 5BX1A 2ETZA 1WAXA 1ECVA 1OEVA 5HDEA 1WCHA 2QMSA 3RGQA 3S3EA 4OHEA 1O4OA 2QCJA 2GSBA 2CMBA 2HDXA 2DXPA 1YVHA 1O4FA 3MXCA 4LUEA 2CM7A 3QKQA 1I57A 4NYHA 1Q6TA 3QCKA 3VS7A 1BF5A 4HJPA 4JBCA 1A1AA 1C84A 2CNGA 1O4LA 1J4XA 3EU0A 1XXVA 5GJIA 2H02A 1IS0A 4FL2A 1OPKA 5EG3B 3S4EA 4QSYA 2QDMA 2EO3A 1KA6A 4D8KA 2F6WA 3V0GA 3V0FA 1PTUA 1PICA 3VS6A 1YVLA 2Y96A 4B04A 2GJTA 4PYHA 3F9AA 3GXHA 2YSXA 1AB2A 1X27A 2G59A 2OZ5A 5EEQA 4ROJA 2I4GA 4YR8B 1NZ7A 2I5XA 3QCFA 2Y3AB 2QBQA 1R1PA 2GWOA 4P9VA 4F5AA 1LKKA 3OP0A 1G7GA 3LJ8A 1O42A 4ZI4A 3QCCA 5J3XA 2BV5A 2LQNA 5KADA 2DM0A 3IN8A 1SHBA 2MBCA 3EAXA 3V0HA 4WTYA 1KA7A 2A3KA 4GWFA 1O4CA 4I8NA 3PFVA 3TKZA 1X0NA 1ZFPE 1XBOA 2HC2A 1EENA 4FBNA 1LARA 1CWEA 2CM3A 3I80A 2QCTA 4RI4A 1G4WR 2K79B 1AOTF 3AWGA 1BHHA 2H8HA 1R1SA 2CMAA 3GQIB 3VS3A 1O47A 1JYRA 4K45A 3S8LA 1P15A 3O3LA 3T04A 5IBSA 3OB1B 1QG1E 3NMEA 4DGPA 2Y2FA 3F99A 5KA7A 1A5YA 2QEPA 1FPRA 3F81A 1Q6SA 2AOAA 2MQIA 3HIZB 4WWQA 2CNFA 2HC1A 2LNXA 2F6VA 3EB1A 1H9OA 4KYQA 4MBBA 4U1PA 1FMKA 5BZZA 4S0GA 4PVGA 1O49A 2HCKA 5KABA 4JGHA 3N84A 3BLTA 3D42A 1YN9A 2H04A 3SR9A 1UUSA 1JLNA 4R30A 1AYAA 1A81A 2AUGA 2MK2A 1QXKA 4H1OA 1BFIA 1OPLA 2GE9A 2BIJA 1LCJA 2EYVA 1OETA 4QUMA 5AWXA 1U25A 1YTNA 2HVLA 4R0TA 2OOQA 1BZHA 2PI7A 1CSZA 2CNIA 1NZLA 2ESBA 3VRYA 1RQQC 4EY0A 4RI5A 4AZ1A 1OEMX 1EEOA 2I6PA 1YGRA 2FJMA 1NL9A 1SPSA 2I6OA 4X6SA 1O4IA 2AHSA 5K23A 2VEVA 1ONYA 4QAPA 4FL3A 3VGOA 4NWGA 3M7FA 1SUGA 1O41A 4RDDA 2RMXA 3ZM0A 3I36A 1NNYA 1O4EA 1G1HA 2K7AB 2YDUA 1O4BA 3IMJA 1BZJA 2KNOA 1G1FA 2BBUA 1BLKA 4EIHA 1A1CA 2H4KA 1PTYA 3PLFB 4RKKA 3OVEA 1NWEA 1ZCKA 4D3RA 1BKLA 3HCKA 4TZIA 2CNEA 2ECDA 4Z6BA 3QCHA 1PA1A 1HCTB 3N8MA 1D4WA 1BKMA 4OHHA 3EAZA 1BLJA 4GRZA 2VIFA 2HUWA 3ZM1A 1GRIA 2OQ1A 2PBNA 4BPCA 5K25A 2LQWA 5KA1A 5BO4A 3PSKA 1PXHA 1PTTA 4GE2A 5K22A 2FCIA 4NNDA 1LKLA 3VRQA 1M3GA 1D4TA 3D1QA 5HKYA 1I9TA 1LYVA 3CM3A 2F71A 1OEOX 4E68A 4H34A 3VRZA 3WA4A 3IMDA 2I3RA 1O4PA 4OHIA 3AWEA 3S3KA 4D3PA 1M27A 2LCTA 3IN7A 2NT2A 1CWDL 5EHRA 1Y57A 1BZCA 1BHHB 4U17A 1Y1UA 2JJDA 2PA5A 1RPYA 4OHLA 1PA9A 1XRIA 2CR4A 2I6IA 2OZOA 1O4MA 2PSZA 1LUKA 4M4ZA 1O4GA 2RSYA 2VEWA 3CWEA 3BUNB 2PQ5A 3S4OA 2I4HA 1O4HA 2IUHA 4Y2EA 1MKPA 1ONZA 1A08A 1RJAA 2P4DA 3QKPA 5KA3A 4HJQA 2DLYA 2MRJA 2QBSA 5M43A 2VEUA 1OHDA 1OO3A 4RH9A 1YPTA 1JYQA 1C88A 2HY3A 4D3QA 3QCBA 2PLDA 1I9SA 2GP0A 2H4VA 2QBRA 3EMUA 5GTJA 2DCRA 2C0TA 4HRFA 1BFJA 3VS4A 2VEYA 2Y1NA 3F41A 1GFYA 1QZ0A 3US4A 1JF7A 1F2FA 2FO0A 2IUIA 2NV5A 3O4TA 3S3FA 1MILA 2A8BA 3VRRA 3BM8A 2F46A 1IJRA 2DX0A 2F6TA 3VRPA 3VROA 1G1GA 2B4PA 1M61A 1HCSB 3VS2A 2I1YA 1FHSA 2LNWA 1Q6MA 3MOZA 3MOWA 3MMJA 1FBZA 3S9KA 2B4SA 3CXLA 3RO1A 3D1HA 2OUDA 2AOBA 3ZMQA 3NHNA 2AZRA 1QADA 1NRVA 3OLRA 5EELA 3SMEA 1MW4A 1CSYA 3PSJA 3N7YA 4GE5A 3I7ZA 1C83A 2B49A 3MAZA 3HHMB 2I6MA 2G6ZA 1JWOA 1OESA 1Q6PA 1WRMA 3PQZA 3N0AA 3OMHA 3ZM3A 2XP1A 2L6KA 3F9BA 2CI8A 1XXPA 3H2XA 1LCKA 1YZ4A 5CDWA 5DC9A 1FQ1A 3UF4A 3AWFA 2HXPA 1CJ1A 2PLEA 2ABLA 4QBWA 1ZC0A 1O4KA 1Q6JA 4F59A 1D1ZA 2I42A 4GL9E 2PNBA 2Q47A 2IZVA 3ZM2A 1AOUF 3B7OA 1U26A 1GHUA 1YTWA 1YTSA 2P6XA 1XA6A 2SHPA 3QCEA 1QCFA 2CMCA 2HNQA 2BGEA 2RORA 4Y14A 1OHEA 3GXGA 4RHGA 1PH0A 5KA0A 2EL8A 2BZLA 1AAXA 1LUIA 2CNHA 2J16A 1FU6A 2CRHA 3ZMPA 1C86A 4E93A 5GJHA 4YAAA 1C85A 1R6HA 3CWGA 3VS5A 2B07A 1LUNA 1BMBA 1Q6NA 2YU7A 2EYZA 3CD3A 2HDVA 3KFJA 1A09A 4QUNA 2VEXA 1P13A 2E0TA 2OC3A 1FPZA 2CBLA 2F6YA 2C9WA 2ZN7A 1Z3KA 1OO4A 1A07A 2Q05A 3O4UA 1GWZA 3VRNA 1T4JA 2NT7A 1PYNA 2IUGA 1YFOA 5KA8A 3C7IA 4K2RA 1AYDA 4JMJA 2EU0A 5AULA 1FBVA 5BZXA 4F5BA 3A5KA 1O4DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QCNA 2CJZA 3V0DA 3UAGA 4GE6A 2PT0A 5HKZA 3O4SA 1A1EA 1D5RA 4WOHA 3BKBA 1O4QA 3V0IA 1R1QA 2RVFA 5IBMA 2CIAA 1T49A 2L3TA 1O45A 1XM2A 2EO6A 5A5FA 2F00A 3BUOB 2QDCA 1G7FA 2QDPA 3D44A 1NZVA 5K9WA 4KYRA 4K11A 1SHAA 2JYQA 1T48A 1TZEE 3BUMB 4R0SA 1F1WA 3BUWB 4ERCA 3M4UA 3N2AA 1LQFA 2AM1A 4IKCA 3VS0A 1A1BA 2NLKA 2B3OA 1AYCA 5LXQB 2CS0A 2GCAA 3QCMA 1OEUA 4L1BB 2H5KA 4QF5A 4ZRTA 3GXWA 4CVKA 1LUMA 2RF6A 1L8KA 5MMZB 2EKXA 3QCIA 2J17A 3RGOA 1TCEA 1KSWA 4ICZA 3QWYA 4JNBA 2XJAA 4QAHA 5D0JA 3S8OA 1X6CA 2L4KA 2EYYA 2UAGA 3OV1A 3S8NA 1SPRA 2KK6A 4GPLB 2CM8A 2F70A 3VS1A 1JU5A 3TL0A 3D1OA 1G4US 2H46E 1O4RA 2FH7A 2HNPA 1O48A 5AXIA 1UURA 5KAZA 2PTKA 4GS0A 4C13A 4GFUA 1BHFA 2BGDA 4J51A 1KC2A 4LUDA 2J16B 3BRHA 1E0DA 2VORA 4JMKA 2DLZA 1OHCA 3O5XA 1FU5A 2C0OA 1YGUA 2NZ6A 4ZN5A 1AD5A 1FYRA 2I3UA 2MRKA 4K44A 3OB2B 3V0JA 2SRCA 2IMGA 4BJOA 5K9VA 4WU2A 2I6JA 1NWLA 2R0BA 4XZ1A 1KAKA 1V3AA 4A4BA 2H4GA 2F6ZA 4GRYA 1BM2A 1PTVA 1I3ZA 5I6VA 1UAGA 3ZV2A 1NO6A 1KAVA 1Q1MA 4NWFA 3BLUA 3QCJA 3U96A 2WGPA 4QBEA 5KA2A 2X5OA 2EOBA 2M3VA 3QCGA 4NX8A 4DGXA 2DVJA 5K24A 2B4OA 2ZMMA 2CI9A 3GXXA 3CBLA 4XZ0A 5DC4A 4GFVA 2I75A 2Y1MA 3S3HA 4TVVA 3QCDA 2CFVA 1GQQA 2HB1A 1WQUA 1O4NA 3BUXB 2F6FA 1C87A 1AYBA 1L8GA 3QCLA 1JBWA 1O43A 4RH5A 3K2MA 2C46A 4P9ZA 1SKJA 1W78A 5HKWA 2AM2A 2H03A 2CM2A 2WJPA 2HCMA 1RPMA 1G83A 1YWFA 1ZZWA 2Y66A 4KI9A 1O44A 2HMHA 5EHPA 1ZCLA 3RZ2A 3A5JA 4JE4A 5DF6A 3ZL8A 1O46A 3QWXX 1VHRA 2FJNA 3UYOA 2Y67A 3D9CA 1RXDA 5J8RA 3EACA 2MC1A 1O4JA 1JYUA 3MXYA 1P3DA 2QBPA 5BUGA 3V0EA 2C7SA 1BG1A 5KACA 2I4EA 2B4UA 1U24A 5KAAA 5KA9A 1O4AA 2C0IA 3PJPA 4WU3A 5DC0B 4JEGA 3EZZA 5KA4A 1SHDA 1K9AA 2PNAA 3LYVA 3PS5A 4A4CA 3ZNIA 1X24A 2GC6A 2NTAA 4OHDA 1B47A 5BX1A 2ETZA 1WAXA 1ECVA 1OEVA 5HDEA 1WCHA 2Y1OA 2QMSA 2GC5A 3RGQA 3S3EA 4OHEA 1O4OA 2QCJA 2GSBA 2CMBA 2HDXA 2DXPA 1YVHA 1O4FA 3MXCA 4LUEA 2CM7A 3QKQA 1I57A 4NYHA 1Q6TA 3QCKA 4BUBA 3VS7A 1BF5A 4HJPA 4JBCA 1A1AA 1C84A 2CNGA 1O4LA 1J4XA 3EU0A 1XXVA 5GJIA 2H02A 1IS0A 4FL2A 1OPKA 1J6UA 5EG3B 1FGSA 3S4EA 4QSYA 2QDMA 2EO3A 1KA6A 4D8KA 2F6WA 3V0GA 3V0FA 1PTUA 1PICA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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