4OHDA

Leopard syndrome-associated shp2/a461t mutant
Total Genus 145
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
145
sequence length
526
structure length
494
Chain Sequence
TSRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDGKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHSDYINANIIMPEFEPKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSTGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Molecular basis of gain-of-function LEOPARD syndrome-associated SHP2 mutations.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 145
structure length 494
sequence length 526
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2014-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4ohdA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4ohdA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4ohdA03
2BBUA 1U24A 1OEVA 2MC1A 3VRZA 3S8NA 1RPYA 3UF4A 2PI7A 2EYVA 5KADA 3OB1B 2XP1A 3UYOA 2LCTA 2C0OA 2ABLA 2LNXA 1PYNA 3D1HA 1G1FA 4YAAA 1MILA 2WGPA 4ZN5A 2BV5A 3MOZA 2I75A 3QCMA 2HNPA 4JEGA 2PA5A 3A5KA 4AZ1A 1BFIA 4GE5A 3GXXA 1KA6A 1AOUF 2BZLA 3O5XA 2CM3A 5AWXA 1LYVA 3V0IA 4BJOA 1P13A 2I4HA 3TKZA 2IUHA 2FJNA 2H04A 4F59A 3CWEA 3PLFB 3MXCA 2EU0A 1SHBA 2ESBA 3BM8A 1LUIA 2RORA 1O45A 5HKYA 3ZM0A 2F46A 2DVJA 2C0TA 2IUGA 2I4EA 4JBCA 2GJTA 3RGOA 3S4OA 1HCSB 2QEPA 2IZVA 2F6TA 4GRZA 1G1HA 3ZMQA 1KA7A 4GPLB 4JGHA 2VEUA 4QBWA 5CDWA 2ECDA 3EACA 2BGDA 1D5RA 4D8KA 1A1EA 2QDCA 3IN7A 3QCGA 1IJRA 3PSJA 1PTUA 3QCEA 1JYRA 1LUNA 1YTNA 5KA3A 2H5KA 1X24A 3CM3A 3T04A 2RF6A 3ZM1A 2B49A 4PVGA 3O4TA 4WWQA 3BUXB 3N8MA 1I3ZA 4E68A 2H03A 1CSZA 1YTWA 3H2XA 4NWGA 5M43A 1U25A 4DGPA 3ZV2A 2CFVA 5KA7A 2CNHA 3OP0A 2PLDA 3D44A 5K24A 2EKXA 1OHCA 2Y3AB 1I9TA 5HDEA 1TZEE 1NZLA 1AAXA 1OO4A 3VRNA 5J3XA 2DXPA 5KAAA 2QBQA 1PTTA 1O43A 1C86A 3I7ZA 3PSKA 3D1QA 3D42A 1U26A 1H9OA 3I36A 2CJZA 2I6PA 4NNDA 1O44A 3VRYA 1SHDA 5EEQA 3VGOA 1O4DA 2I4GA 4JE4A 1BHFA 2L3TA 2NZ6A 2AHSA 1O4PA 2A8BA 2PT0A 2B4SA 2VEYA 1GWZA 3V0HA 2P6XA 1GHUA 3BUWB 1OPLA 1FBVA 2DM0A 1QXKA 4H1OA 3VRPA 4JMKA 4RH9A 1AYAA 3O4UA 5KACA 1JYUA 2EO6A 2CBLA 2CMCA 3AWFA 2NT7A 2DX0A 3RZ2A 1R1SA 3VRQA 3VS0A 4J51A 4TVVA 2CNIA 2C7SA 2EYYA 1X27A 3CWGA 1WRMA 4R30A 1BKLA 1BMBA 2YDUA 2JJDA 2EYZA 5IBMA 2OC3A 4ICZA 3GXHA 1QADA 2I6OA 2IMGA 3S3FA 1SHAA 4RI5A 5K23A 2CNFA 5HKZA 4QUNA 5GTJA 1BKMA 4GS0A 1BHHA 2HC1A 1XM2A 1BLJA 2P4DA 5EHRA 2RMXA 1ZCKA 1WQUA 3D1OA 2JYQA 3F9BA 3QCBA 2ZMMA 2E0TA 4MBBA 3U96A 3BKBA 1YZ4A 4H34A 2H46E 1GRIA 2CM2A 1O4JA 3F81A 3VS7A 2R0BA 4ROJA 3QCKA 1O4AA 1O41A 2FCIA 1JYQA 2F6FA 1A1AA 1O4GA 2OZOA 3CXLA 2HB1A 4QUMA 1LKLA 4XZ0A 2HUWA 2MRJA 1CWEA 1BLKA 3HHMB 1NWLA 1P15A 3I80A 3ZM2A 4B04A 2NV5A 1IS0A 3QKQA 3WA4A 2AOAA 4GL9E 3HIZB 4RH5A 1NWEA 3V0GA 1C83A 2PBNA 2PSZA 4OHDA 3O3LA 1O4MA 2C9WA 2Y96A 5KA8A 1O4KA 3KFJA 1Y1UA 3S4EA 1CSYA 1KAVA 3GXWA 2QCJA 3QWYA 1XXPA 1Q6MA 2I5XA 1M3GA 2F6VA 4D3QA 1BG1A 4ZRTA 2VIFA 3N7YA 1BHHB 5KAZA 3EU0A 2AZRA 3S3HA 1FQ1A 1JWOA 5GJIA 1BF5A 1F1WA 1I57A 3B7OA 1V3AA 3OV1A 4K11A 2MQIA 1ECVA 2QMSA 3IMDA 3VRRA 2PNAA 3CD3A 2HXPA 4YR8B 1XA6A 4R0TA 5KA0A 2LQNA 1FYRA 1C84A 2A3KA 3PQZA 5K22A 4NWFA 3QCJA 4RI4A 1FU6A 2CRHA 1D4TA 1O4LA 1Z3KA 5BUGA 4GE6A 1C88A 1Q6JA 5AULA 5K25A 1AOTF 1OEMX 1PA9A 1WCHA 4F5AA 2CI9A 4OHEA 4KI9A 4X6SA 2VEWA 1XXVA 5DC0B 1OHDA 1YGUA 4S0GA 2HDVA 2CM7A 2HVLA 3QCCA 1MKPA 4TZIA 4GFVA 2B3OA 5I6VA 3AWGA 2F6YA 1CWDL 1D4WA 3EAXA 2CM8A 4WU2A 2Q05A 4E93A 1ZZWA 1A09A 3MOWA 3VS3A 4JMJA 1YTSA 4A4BA 1BZJA 1NZ7A 2I3UA 3F99A 2L6KA 4QSYA 3RGQA 3EAZA 2DCRA 5K9VA 5BO4A 1HCTB 3OMHA 2H8HA 2CR4A 3SMEA 1O4QA 1R1PA 2OOQA 1LCJA 3NMEA 4R0SA 3V0JA 3BRHA 4NYHA 1FU5A 3MAZA 3PJPA 1YVLA 2YU7A 1G1GA 1YWFA 2CMAA 2J16A 3V0EA 3ZMPA 2EO3A 4KYQA 2I6JA 1ZC0A 3A5JA 1BZHA 2MBCA 3LJ8A 1LUKA 4OHHA 1A07A 1CJ1A 4F5BA 1A1CA 3F9AA 2I3RA 4HJQA 4HJPA 5LXQB 1PH0A 1D1ZA 1O46A 2I6IA 3ZNIA 3S3EA 5BX1A 4ZI4A 1LUMA 4FBNA 5MMZB 5KA9A 1T49A 3V0FA 2LNWA 3HCKA 3SR9A 1GFYA 2EOBA 3M7FA 1PTYA 2HCMA 4FL2A 2FO0A 5KA2A 1BZCA 3RO1A 4OHLA 4Z6BA 4JNBA 3ZM3A 4K2RA 1SPRA 2QBRA 1I9SA 1C87A 1QG1E 2PQ5A 5DC4A 1YN9A 4BPCA 1QZ0A 3EMUA 4XZ1A 1A1BA 1ZCLA 5EELA 4GE2A 2FJMA 3D9CA 5EHPA 1PXHA 1VHRA 1FPZA 2NT2A 3EZZA 3V0DA 1JF7A 1L8KA 2CNGA 3VS4A 1FPRA 3QCHA 2J16B 5BZZA 4EIHA 2H4VA 2I1YA 1G7GA 3VS1A 1O4IA 3QCNA 2QDPA 4K45A 4QAHA 4HRFA 1NRVA 2HC2A 4M4ZA 1ONZA 2VEVA 1Q6TA 4IKCA 3S8LA 1FHSA 3PS5A 2PNBA 1O49A 4D3RA 4A4CA 2SHPA 1WAXA 2GSBA 4OHIA 1L8GA 3AWEA 3VS5A 1Q6NA 1T48A 1OETA 2NTAA 2BGEA 5AXIA 2GE9A 2CMBA 2LQWA 3BLUA 3GQIB 1JLNA 1M61A 1O47A 2VEXA 3S3KA 2QDMA 4QAPA 2RVFA 1O4RA 1O4EA 1EEOA 4I8NA 4U17A 1NL9A 2F6WA 4Y2EA 1A08A 1KAKA 4QBEA 1O42A 5K9WA 2DLZA 1G4WR 1XBOA 4ERCA 1OO3A 2NLKA 1B47A 1LCKA 1R6HA 3BUNB 3S9KA 1PICA 1G4US 2Y1NA 2BIJA 4WOHA 2Y2FA 2F70A 1RXDA 2GP0A 4RDDA 1O4FA 1EENA 1G7FA 3QCDA 3N84A 1K9AA 4RKKA 3US4A 1AB2A 2B4PA 4GFUA 2HCKA 1TCEA 5HKWA 2QBSA 1G83A 2AUGA 2IUIA 2B07A 2G6ZA 1QCFA 1OHEA 1Y57A 1LQFA 5EG3B 2H02A 5KABA 3F41A 1AYBA 2OUDA 2YSXA 1T4JA 1RPMA 2G59A 3PFVA 2M3VA 5DF6A 3O4SA 3S8OA 2PTKA 1ONYA 2HY3A 1O4BA 1O4CA 1SKJA 1MW4A 5DC9A 1AYCA 2GWOA 2FH7A 1LKKA 1AD5A 1RQQC 5D0JA 4DGXA 1A5YA 3BUMB 1FMKA 5KA1A 1X0NA 3EB1A 2B4OA 2SRCA 2HNQA 2RSYA 1OEOX 3K2MA 1OEUA 1M27A 1AYDA 2I42A 3OLRA 2CNEA 2AOBA 4RHGA 4LUEA 3TL0A 1PTVA 1O4OA 2F6ZA 3M4UA 4NX8A 2CS0A 1X6CA 5J8RA 1LARA 2Q47A 4WTYA 2J17A 4D3PA 1ZFPE 3C7IA 1O48A 3VROA 3QKPA 5IBSA 1YVHA 1UURA 3OVEA 2PLEA 3BUOB 3IMJA 1C85A 2K79B 2L4KA 3CBLA 3QWXX 2C46A 1SPSA 1RJAA 3MXYA 1BM2A 4U1PA 2OQ1A 1YPTA 2HDXA 2MK2A 1NO6A 4P9VA 2H4KA 3QCLA 4GRYA 4PYHA 2QBPA 1UUSA 2MRKA 2DLYA 1BFJA 3OB2B 1A81A 4EY0A 2HMHA 2Y1MA 1J4XA 1JU5A 2I6MA 1Q1MA 2CIAA 3QCIA 1F2FA 1NNYA 2C0IA 5GJHA 3N0AA 4WU3A 4LUDA 4KYRA 5KA4A 1O4HA 1YFOA 1YGRA 2K7AB 2CI8A 3BLTA 1Q6PA 4L1BB 2KK6A 1R1QA 1Q6SA 1SUGA 4GWFA 3QCFA 1KSWA 2H4GA 1PA1A 2OZ5A 3GXGA 4K44A 2EL8A 3MMJA 4P9ZA 4FL3A 2B4UA 2KNOA 1XRIA 1FBZA 3NHNA 1NZVA 5BZXA 1O4NA 1OESA 2ZN7A 2QCTA 2ETZA 3VS6A 3IN8A 2F71A 4Y14A 1KC2A 1OPKA 3VS2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BBUA 1U24A 1OEVA 2MC1A 3VRZA 3S8NA 1RPYA 3UF4A 2PI7A 2EYVA 5KADA 3OB1B 2XP1A 3LYVA 3UYOA 2LCTA 1P31A 2C0OA 4HV4A 2ABLA 2LNXA 4CVMA 1PYNA 3D1HA 1G1FA 4YAAA 1MILA 2WGPA 4ZN5A 2BV5A 3MOZA 2I75A 3QCMA 2HNPA 4JEGA 2PA5A 3A5KA 4AZ1A 1BFIA 4GE5A 3GXXA 1KA6A 1AOUF 2BZLA 3O5XA 2CM3A 5AWXA 1LYVA 3V0IA 4BJOA 1P13A 2I4HA 3TKZA 2IUHA 2FJNA 2H04A 4F59A 3CWEA 3PLFB 3MXCA 2EU0A 1SHBA 2ESBA 3BM8A 4QF5A 1LUIA 3ZM5A 2RORA 1O45A 5HKYA 3ZM0A 2F46A 2DVJA 2C0TA 2IUGA 2I4EA 4JBCA 2GJTA 3RGOA 3S4OA 1W7KA 1HCSB 2QEPA 2IZVA 2F6TA 4GRZA 1G1HA 3ZMQA 1KA7A 4GPLB 4JGHA 2VEUA 4QBWA 2Y1OA 5CDWA 2ECDA 3EACA 2AM1A 2BGDA 1D5RA 4D8KA 1A1EA 2QDCA 3IN7A 3QCGA 1IJRA 3PSJA 1PTUA 3QCEA 1JYRA 1LUNA 1YTNA 5KA3A 2H5KA 1X24A 3CM3A 3T04A 2RF6A 2VTEA 3ZM1A 2B49A 4PVGA 3O4TA 4WWQA 3BUXB 3N8MA 1I3ZA 4E68A 2H03A 1CSZA 1YTWA 3H2XA 4NWGA 5M43A 1U25A 4DGPA 3ZV2A 2CFVA 5KA7A 2CNHA 3ZM6A 3OP0A 2PLDA 3D44A 5K24A 2EKXA 1OHCA 2UAGA 2Y3AB 1I9TA 2WTZA 5HDEA 5A5EA 1TZEE 1NZLA 1AAXA 1OO4A 3VRNA 5J3XA 2DXPA 5KAAA 2QBQA 1PTTA 1O43A 1C86A 3I7ZA 3PSKA 3D1QA 1GG4A 1U26A 1H9OA 3D42A 3I36A 2CJZA 2I6PA 4NNDA 1O44A 3VRYA 1SHDA 5EEQA 3VGOA 1O4DA 2I4GA 4JE4A 1BHFA 2L3TA 2NZ6A 2AHSA 1O4PA 2A8BA 2PT0A 2B4SA 2VEYA 1GWZA 3V0HA 2P6XA 1GHUA 3BUWB 1OPLA 1FBVA 2DM0A 1QXKA 4H1OA 3VRPA 4JMKA 4RH9A 1AYAA 3O4UA 5KACA 1JYUA 2EO6A 2CBLA 2CMCA 3AWFA 2NT7A 2DX0A 3RZ2A 1R1SA 3VRQA 3VS0A 4J51A 4TVVA 2CNIA 2C7SA 2EYYA 1X27A 5A5FA 3CWGA 1WRMA 4R30A 1BKLA 1BMBA 2YDUA 2JJDA 2EYZA 5IBMA 2OC3A 4ICZA 3GXHA 1QADA 2I6OA 2IMGA 3S3FA 1SHAA 4RI5A 5K23A 2CNFA 5HKZA 4QUNA 5GTJA 1BKMA 1P3DA 3N2AA 4GS0A 1BHHA 2HC1A 1XM2A 1BLJA 2P4DA 5EHRA 2RMXA 1ZCKA 1WQUA 3D1OA 2JYQA 3F9BA 3QCBA 2ZMMA 2E0TA 4MBBA 3U96A 3BKBA 1YZ4A 4H34A 2H46E 1GRIA 2CM2A 1O4JA 3F81A 3VS7A 2R0BA 4ROJA 3QCKA 1O4AA 1O41A 2FCIA 1JYQA 2F6FA 1A1AA 1O4GA 2OZOA 3CXLA 2HB1A 4QUMA 1LKLA 4XZ0A 2HUWA 2MRJA 1CWEA 1BLKA 3HHMB 1NWLA 1P15A 2VTDA 3I80A 3ZM2A 2NV5A 4B04A 1IS0A 3QKQA 3WA4A 2AOAA 4GL9E 3HIZB 4RH5A 1NWEA 3V0GA 1C83A 2PBNA 2PSZA 4OHDA 3O3LA 1O4MA 2C9WA 2Y96A 5KA8A 1O4KA 3KFJA 1Y1UA 3S4EA 1CSYA 1KAVA 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 3GXG A;  4K44 A;  2EL8 A;  3MMJ A;  4P9Z A;  4FL3 A;  2B4U A;  2KNO A;  1XRI A;  1FBZ A;  3NHN A;  1NZV A;  5BZX A;  1O4N A;  1OES A;  2ZN7 A;  2QCT A;  2ETZ A;  3VS6 A;  3IN8 A;  2F71 A;  4Y14 A;  1KC2 A;  1OPK A;  3VS2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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