4OHIA

Leopard syndrome-associated shp2/q510e mutant
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
526
structure length
502
Chain Sequence
SRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDDKGESNDGKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKVKQGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDSDYINANIIMPEKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAEYRFIYMAVQHYIETLQRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Molecular basis of gain-of-function LEOPARD syndrome-associated SHP2 mutations.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 158
structure length 502
sequence length 526
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2014-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4ohiA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4ohiA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4ohiA03
2WGPA 2ZN7A 1TZEE 1O4GA 2CNFA 4RDDA 3CBLA 4JMJA 2GE9A 1CJ1A 2E0TA 4D3QA 5AULA 3V0EA 1O43A 1FMKA 1BKLA 1M61A 1YN9A 5IBSA 2BZLA 2PBNA 1KA7A 2GSBA 3BUWB 1T48A 2MRJA 3EAZA 4WTYA 1A5YA 1SHDA 1B47A 3BUNB 3S8NA 3S3FA 3TKZA 4OHEA 2DX0A 4F5AA 4ROJA 1LQFA 3S3KA 3SR9A 2DXPA 3BKBA 4K11A 1JYUA 3ZMQA 5AWXA 3VS0A 4B04A 1F1WA 1AYCA 1C86A 1R1SA 1PA1A 1O4NA 2BGEA 1BZCA 2K7AB 2CM2A 1LUIA 2VEYA 5DC0B 2F71A 2H8HA 1KAKA 1KA6A 2C0OA 5IBMA 3BLTA 2EOBA 1X24A 4NWFA 1JLNA 3O4TA 2BGDA 4QAHA 1KAVA 3QCBA 2CI9A 4WU2A 3D42A 4PYHA 1CSZA 1BG1A 1O4QA 4QAPA 1O4AA 2F6VA 1IS0A 1OPLA 2RMXA 4NNDA 2EYZA 5AXIA 2I1YA 2HUWA 2PNAA 2PT0A 4YR8B 3VRZA 3GXXA 1R1PA 5DC9A 3VS3A 3QCLA 4OHDA 2I6MA 3V0DA 3V0IA 2MC1A 3US4A 3PQZA 3IN8A 2H5KA 2H46E 1FBVA 1YTWA 1YVLA 4K45A 1O4EA 2I3RA 1FQ1A 1LARA 2Q47A 1Q6TA 2PTKA 1L8GA 2FH7A 5BO4A 2VEVA 1YVHA 2I42A 1OPKA 5EHRA 2CMAA 3EMUA 4JEGA 2AZRA 2QBPA 1G4WR 1GHUA 3IMJA 2Y2FA 3O3LA 4S0GA 2ZMMA 2RVFA 1PH0A 2KK6A 1ZCKA 1GWZA 2CMBA 2FJNA 3S8LA 3QCJA 2JJDA 1HCSB 1SUGA 2CNGA 2HB1A 3OLRA 5BX1A 1M27A 2P4DA 2NV5A 2RF6A 1LCJA 1NZLA 3D44A 2YSXA 3OB2B 3F41A 2QBRA 3QCEA 2NZ6A 4WOHA 5KA8A 1O4HA 2I4EA 5J8RA 1A1CA 1NO6A 1T4JA 1KSWA 3PJPA 1LKKA 1A09A 1G83A 2NLKA 1O47A 1BF5A 3CD3A 2B49A 4ICZA 3QCIA 5KA3A 4JE4A 2AHSA 3D1HA 3S8OA 3VS7A 1Q6JA 1YWFA 4ZN5A 1A81A 4RI4A 2DCRA 2PLDA 1CSYA 1G1FA 2B4OA 2C9WA 2GJTA 2YU7A 2NT7A 4JBCA 1BMBA 2B3OA 4F5BA 2PLEA 5K9VA 2L4KA 5K25A 1BFJA 3S4OA 1X27A 4I8NA 2CJZA 2H4VA 1YZ4A 3I7ZA 1H9OA 3MXYA 3HHMB 5KAAA 2HCMA 3K2MA 1Z3KA 3RZ2A 2VEWA 4QBEA 2IMGA 3QCDA 1LUNA 4ZI4A 1FPRA 5HKWA 2FJMA 2OQ1A 1ONYA 1GFYA 2MK2A 1T49A 2Y1MA 2H02A 1BZHA 3V0FA 1MW4A 2HC2A 2M3VA 1ONZA 2PSZA 1X0NA 1EENA 5K24A 1PXHA 2QBSA 2H04A 3A5JA 4HRFA 1BZJA 4WWQA 1O49A 4Y14A 2HY3A 1NRVA 2A8BA 3QWXX 1NZVA 1BHFA 3T04A 3V0HA 1L8KA 2L6KA 2VIFA 3MAZA 1O45A 1UURA 2MBCA 2QDPA 5BZXA 4ERCA 1EEOA 3F81A 3VS6A 2BIJA 3C7IA 1V3AA 1O42A 4GL9E 1SHBA 2MQIA 4J51A 4H34A 3RGOA 2Y96A 5DC4A 4GRYA 4A4CA 3CWGA 1Y1UA 1I57A 4JGHA 3PSJA 3QKQA 2HDXA 2LNXA 3SMEA 3F9BA 1ZCLA 4U17A 2RSYA 3O4UA 3VRYA 3VS5A 2KNOA 1PTYA 4BJOA 2HNQA 1R6HA 1OHDA 1XA6A 1FU6A 1AOUF 1FHSA 3MMJA 4D3RA 1O4MA 1QZ0A 1JU5A 1PICA 1CWEA 1ZFPE 1PTUA 2YDUA 3VRPA 4GS0A 2SHPA 3QCMA 3ZM3A 4LUDA 3N7YA 1QXKA 2CR4A 1O4BA 2B4PA 1D1ZA 2CNHA 4U1PA 1BHHB 1AOTF 4DGXA 3CWEA 3O4SA 5CDWA 1NWEA 3PFVA 2EO3A 2CI8A 2F6YA 1U26A 2P6XA 4Y2EA 2NT2A 4XZ1A 4A4BA 2H4GA 4D8KA 5KA4A 2Y3AB 3B7OA 4DGPA 4RHGA 1WQUA 4AZ1A 5GJIA 2I6JA 5EEQA 2C0IA 4FBNA 1A1EA 1SPSA 2CRHA 1XM2A 1OHCA 2DLYA 4NWGA 2C0TA 4XZ0A 1G1GA 2A3KA 4QUNA 5EELA 1AB2A 1HCTB 1OESA 2I5XA 3N0AA 3BLUA 3ZMPA 2AOAA 3UF4A 5KA7A 4HJPA 1FBZA 3I80A 1O4KA 5K23A 2VEUA 2G6ZA 1O4RA 3MXCA 2FCIA 1YTNA 1QCFA 4D3PA 1O4LA 4RKKA 5KAZA 4EIHA 4E68A 5LXQB 3OB1B 3NMEA 5KADA 3VRQA 3IMDA 1TCEA 2EL8A 3HIZB 3NHNA 3PSKA 3U96A 2EO6A 1C88A 3VS2A 2IZVA 2LQWA 3D1QA 2DVJA 3GQIB 3QWYA 3VRRA 1NL9A 1ZC0A 1RPMA 3EACA 1LKLA 3BUXB 1YGRA 4GE6A 1AYAA 4NYHA 1UUSA 1XXVA 1QADA 5J3XA 4TVVA 1OEUA 1JWOA 4JMKA 3M7FA 1O46A 3V0GA 3CXLA 1C87A 3D1OA 5EG3B 1Q1MA 4IKCA 3EAXA 2I3UA 1BM2A 1O48A 1D4WA 1FPZA 1AAXA 1Q6PA 4JNBA 5BUGA 2VEXA 1WAXA 2R0BA 1RXDA 4M4ZA 2AUGA 3CM3A 4RH5A 1OETA 5HKZA 1LUMA 1U25A 4H1OA 3O5XA 2C7SA 2SRCA 1U24A 2HVLA 5KA9A 2DLZA 3M4UA 2EYYA 2OZOA 1WCHA 2JYQA 2QDCA 3S9KA 1CWDL 2HC1A 5HKYA 1SHAA 3OVEA 4OHLA 3VROA 1G7FA 2GP0A 1JYQA 5KABA 4RI5A 5M43A 1RJAA 2CIAA 3PLFB 1I9SA 2C46A 4K2RA 4TZIA 1P15A 1M3GA 4R0SA 1OHEA 3N84A 5DF6A 3BM8A 1IJRA 1Q6MA 4GE5A 3N8MA 1O41A 3BRHA 4R0TA 4MBBA 1AD5A 2G59A 1O4JA 2LNWA 2CS0A 5D0JA 3RGQA 1YGUA 4ZRTA 2PNBA 1O4DA 3QKPA 2IUIA 5HDEA 1WRMA 2QCJA 1I3ZA 1D4TA 1XBOA 1C85A 3GXHA 5BZZA 3HCKA 3QCHA 3KFJA 1J4XA 1BFIA 2DM0A 5I6VA 1BHHA 2LQNA 1O4FA 1PTTA 1YFOA 2F46A 2J16B 1O4CA 4E93A 3BUOB 1PTVA 3A5KA 1R1QA 1KC2A 1NNYA 2F6FA 1SKJA 3UYOA 3ZM2A 1Q6NA 1K9AA 3S3HA 1A07A 1AYDA 2ESBA 3WA4A 2QDMA 3QCFA 2LCTA 4WU3A 3OV1A 2Q05A 3EZZA 3D9CA 1ECVA 2ECDA 1G7GA 2QBQA 4LUEA 2BBUA 4QBWA 3ZM0A 1RQQC 2PA5A 5GTJA 4P9VA 5GJHA 1SPRA 2IUHA 1OEMX 1G1HA 1FYRA 4KYQA 1BLKA 2H03A 3VRNA 1O4IA 1MKPA 2PQ5A 1OO3A 2CFVA 2HNPA 1O4PA 4GE2A 2Y1NA 1G4US 2OZ5A 2QMSA 3ZNIA 4FL2A 5K22A 3V0JA 1A1BA 2GWOA 1NWLA 1BLJA 5EHPA 2CM7A 2CM8A 4GFVA 2RORA 2K79B 3IN7A 2QCTA 5KA0A 1YPTA 2HMHA 3AWEA 3EU0A 2HXPA 1LUKA 2NTAA 2F6WA 2CBLA 3PS5A 3MOWA 3AWGA 4GRZA 1NZ7A 4QUMA 3OMHA 1X6CA 4EY0A 1AYBA 2QEPA 4GFUA 1BKMA 2EU0A 2ABLA 1XXPA 2I4GA 5K9WA 1LYVA 1C83A 2H4KA 3ZM1A 4QSYA 2CMCA 4GWFA 3VS4A 3GXWA 1VHRA 3QCGA 2HCKA 4HJQA 1Q6SA 3F9AA 1RPYA 4R30A 2XP1A 2B07A 2J17A 2OC3A 2I6PA 3MOZA 4KI9A 1MILA 2I6IA 4KYRA 4NX8A 3S4EA 2HDVA 4PVGA 3ZV2A 3QCCA 2AOBA 1P13A 1PA9A 1PYNA 1Y57A 1F2FA 1ZZWA 2BV5A 3LJ8A 4P9ZA 4K44A 3VS1A 1OEOX 4FL3A 2F70A 4BPCA 2F6ZA 3QCKA 4F59A 1QG1E 2OOQA 1JYRA 3S3EA 1OEVA 2CM3A 5KACA 2F6TA 4YAAA 3I36A 1O4OA 2B4UA 1XRIA 1GRIA 5KA2A 1A1AA 2PI7A 3H2XA 2OUDA 4GPLB 2I4HA 3RO1A 1O44A 1LCKA 4X6SA 5KA1A 1YTSA 2CNEA 3QCNA 2B4SA 5MMZB 3F99A 3GXGA 2J16A 1FU5A 3AWFA 2EYVA 2ETZA 2EKXA 2I6OA 2CNIA 3BUMB 3OP0A 4Z6BA 3VGOA 1OO4A 1D5RA 4OHIA 4L1BB 2I75A 3EB1A 4RH9A 2IUGA 1C84A 3TL0A 2FO0A 2MRKA 2L3TA 1I9TA 1A08A 4OHHA 1JF7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2WGPA 2ZN7A 1EEHA 1TZEE 4C12A 1O4GA 2CNFA 4RDDA 3CBLA 4JMJA 2GE9A 1CJ1A 2E0TA 4D3QA 5AULA 2VTEA 3NRSA 3V0EA 1O43A 1FMKA 1BKLA 1M61A 1YN9A 5IBSA 2BZLA 2PBNA 3QCZA 1KA7A 2GSBA 3BUWB 1T48A 2MRJA 3EAZA 4WTYA 1A5YA 1SHDA 1B47A 3BUNB 3S8NA 3S3FA 2JFHA 3TKZA 4OHEA 2DX0A 4F5AA 4ROJA 1LQFA 3S3KA 3SR9A 2DXPA 3BKBA 4K11A 1JYUA 3ZMQA 5AWXA 3VS0A 4B04A 1F1WA 1AYCA 1JBVA 1C86A 1R1SA 1PA1A 1W78A 1O4NA 2BGEA 1BZCA 2K7AB 2CM2A 1LUIA 2VEYA 5DC0B 2F71A 2H8HA 1KAKA 1KA6A 2C0OA 5IBMA 3BLTA 2EOBA 1X24A 4NWFA 1JLNA 3O4TA 2BGDA 4QAHA 1KAVA 3QCBA 2CI9A 4WU2A 3D42A 4PYHA 1CSZA 1BG1A 1O4QA 4QAPA 1O4AA 2F6VA 3PYZA 1IS0A 1OPLA 2RMXA 4CVLA 4NNDA 2EYZA 5AXIA 2I1YA 2HUWA 2PNAA 1GG4A 2PT0A 4YR8B 3VRZA 3GXXA 1R1PA 5DC9A 3VS3A 3QCLA 4OHDA 2I6MA 3V0DA 3V0IA 2MC1A 3US4A 3PQZA 3IN8A 2H5KA 2H46E 1FBVA 1YTWA 2XJAA 1YVLA 4K45A 4CVMA 2VORA 1O4EA 4BUBA 4CVKA 2I3RA 1FQ1A 1LARA 2Q47A 1Q6TA 2PTKA 1L8GA 2FH7A 5BO4A 4UAGA 2VEVA 4HV4A 1YVHA 2I42A 1OPKA 5EHRA 2CMAA 3EMUA 4JEGA 2AZRA 2QBPA 1G4WR 1GHUA 3IMJA 2Y2FA 3O3LA 4S0GA 2ZMMA 2RVFA 1PH0A 2KK6A 1ZCKA 1GWZA 2CMBA 2FJNA 1JBWA 3S8LA 3QCJA 2JJDA 1HCSB 1SUGA 2CNGA 2HB1A 2AM1A 3OLRA 5BX1A 1M27A 2P4DA 2NV5A 2RF6A 1LCJA 1NZLA 3D44A 2YSXA 3OB2B 3F41A 2QBRA 2UAGA 2NZ6A 3QCEA 4WOHA 5KA8A 1O4HA 1FGSA 2I4EA 5J8RA 1A1CA 1NO6A 1T4JA 1KSWA 3PJPA 1LKKA 1GQQA 1A09A 1G83A 2NLKA 1O47A 1BF5A 3CD3A 2B49A 4ICZA 3QCIA 5KA3A 4JE4A 2AHSA 3D1HA 3S8OA 3VS7A 1Q6JA 4QF5A 1YWFA 4ZN5A 1A81A 4RI4A 4QDIA 2DCRA 2PLDA 1CSYA 1G1FA 2B4OA 2C9WA 2GJTA 2YU7A 2NT7A 4JBCA 1BMBA 2B3OA 4F5BA 2PLEA 5K9VA 2L4KA 5K25A 1BFJA 3S4OA 1X27A 4I8NA 2CJZA 2H4VA 1YZ4A 3I7ZA 1H9OA 3MXYA 3HHMB 5KAAA 2HCMA 3K2MA 1Z3KA 3RZ2A 2Y67A 2VEWA 4QBEA 2IMGA 3HN7A 3QCDA 1LUNA 4ZI4A 1FPRA 5HKWA 2FJMA 2OQ1A 1ONYA 1GFYA 2MK2A 1T49A 2Y1MA 2H02A 1BZHA 3V0FA 1MW4A 2HC2A 2M3VA 2XPCA 4ZIYA 1ONZA 2PSZA 1X0NA 1EENA 5K24A 1PXHA 2QBSA 2H04A 3A5JA 4HRFA 1BZJA 4WWQA 1O49A 4Y14A 2HY3A 1NRVA 2A8BA 3QWXX 1NZVA 1BHFA 3T04A 3V0HA 5A5FA 1L8KA 2L6KA 2VIFA 3MAZA 1O45A 1UURA 2MBCA 2QDPA 5BZXA 4ERCA 1EEOA 3F81A 3VS6A 2BIJA 4BUCA 3C7IA 1V3AA 1O42A 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 2ETZ A;  2EKX A;  2I6O A;  2CNI A;  3BUM B;  3OP0 A;  4Z6B A;  3VGO A;  1OO4 A;  1D5R A;  4OHI A;  4L1B B;  2I75 A;  3EB1 A;  4RH9 A;  2IUG A;  1C84 A;  3TL0 A;  2FO0 A;  2MRK A;  2L3T A;  1I9T A;  1A08 A;  4OHH A;  1JF7 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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