4DGPA

The wild-type src homology 2 (sh2)-domain containing protein tyrosine phosphatase-2 (shp2)
Total Genus 154
50100150200250300350400450020406080100120140160
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
526
structure length
499
Chain Sequence
SRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDDKGESNDGKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDSDYINANIIMPEKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Structural and Mechanistic Insights into LEOPARD Syndrome-Associated SHP2 Mutations.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
total genus 154
structure length 499
sequence length 526
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2012-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4dgpA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4dgpA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4dgpA03
3S3EA 1O42A 4ZI4A 2I6MA 3TKZA 2NTAA 2EL8A 2I3UA 2Q05A 5BX1A 3B7OA 3MXYA 3RO1A 3OVEA 1EEOA 4ICZA 2CM7A 1V3AA 4KYRA 1RPYA 1ONZA 2EYZA 1BZCA 4QAPA 1SPRA 2HC2A 1ECVA 1I9TA 5HKYA 3VRQA 5DF6A 4GE5A 2GE9A 3ZV2A 3PS5A 3QWYA 3CXLA 1KA7A 2R0BA 1O4KA 3IN7A 2RSYA 1GFYA 1YN9A 2AUGA 2EO3A 1BFIA 1O4GA 1BKMA 2AZRA 2PNAA 4OHHA 1M3GA 2F6TA 3QCDA 2E0TA 1PTYA 3BUNB 2B4SA 1R1PA 2QDMA 4J51A 4YR8B 1BM2A 3EAZA 2I75A 2KNOA 3I36A 1O4DA 2BGEA 2F6WA 1XRIA 1M61A 3V0JA 1YZ4A 4OHLA 3ZM2A 4HRFA 2SHPA 1AYDA 4JBCA 1NRVA 1BF5A 1GRIA 2PI7A 1TZEE 2NLKA 1BLJA 2LNXA 2F6FA 5KA7A 1M27A 3I7ZA 1SKJA 3VS6A 2H4VA 1MILA 1B47A 3QCJA 2HVLA 3BLTA 3EZZA 4QAHA 2CNIA 1OHDA 2HCMA 1PA9A 3QCEA 1BZHA 1OEVA 1O48A 5HKWA 3D42A 5DC9A 3D9CA 3EAXA 2CM3A 1KAKA 3CM3A 5KABA 5EHPA 1G1FA 2QCTA 3F99A 2Y1NA 1R1SA 1YTNA 2MBCA 3US4A 5D0JA 4RDDA 4R0SA 2IZVA 3BLUA 2VIFA 3N7YA 3BUOB 5LXQB 1GHUA 4BPCA 3QCKA 2LQNA 4FL3A 4Y14A 5AXIA 3O4TA 5DC4A 5HDEA 5HKZA 2Q47A 2B07A 2I4HA 2RVFA 3ZM0A 2L3TA 3RZ2A 5KA1A 1A07A 1NWLA 1TCEA 4LUDA 1MKPA 2EYYA 2B4PA 4JE4A 1Q1MA 2DLYA 2B3OA 2H4GA 4K11A 2J16B 4ROJA 1FU6A 1O4EA 3VRRA 1LCKA 2EO6A 3TL0A 1SUGA 3RGOA 2RMXA 2H02A 2LQWA 1AAXA 4NWFA 1C84A 3N0AA 5KA4A 2YSXA 4GFUA 2VEYA 1ZCLA 2F71A 1O4LA 3IMJA 2BZLA 1MW4A 4GRYA 1D4TA 3K2MA 4XZ0A 2PTKA 4L1BB 3EU0A 4GE2A 4Z6BA 2F6ZA 5KA2A 1JWOA 1O43A 4U17A 3VS1A 4KYQA 1BFJA 3QCBA 1T49A 1O4CA 2PBNA 3N84A 2B4OA 4QUMA 3HIZB 3S4OA 2HXPA 3O4UA 1RQQC 2C0IA 1JYUA 1YPTA 4D3PA 2FO0A 1O4OA 2PNBA 4GPLB 4D8KA 1G4US 2I5XA 2I4EA 2VEXA 1YVLA 3MAZA 3VS4A 4OHDA 1J4XA 3EMUA 1WAXA 2OZ5A 1AYAA 2H03A 2P6XA 3AWFA 3IMDA 3H2XA 3QWXX 4GE6A 4RKKA 3I80A 5GJIA 1D5RA 4PYHA 2I42A 1P13A 1FHSA 2IUGA 3VS5A 5J8RA 2GWOA 4RI5A 3ZNIA 1ZZWA 2CNFA 3S3HA 2A8BA 3F9BA 2CMBA 5K25A 2FH7A 3F41A 2C0TA 1PTTA 1QXKA 5IBSA 1BZJA 1PXHA 2ZMMA 3NMEA 2CI8A 4ZRTA 1A1CA 1A08A 1NWEA 2CM8A 1EENA 1QZ0A 1BMBA 4NWGA 5EHRA 3BM8A 5AWXA 4GRZA 1AYCA 1JLNA 4M4ZA 2K79B 1Q6PA 1YVHA 4PVGA 4KI9A 1WCHA 2H46E 5I6VA 3S8NA 1RPMA 1ZC0A 1O41A 3HCKA 1NL9A 1O4MA 1X24A 5KACA 2VEUA 2NT7A 3CWEA 5J3XA 2L4KA 5KA8A 2BGDA 3IN8A 1O4AA 1QCFA 2PLDA 5K22A 1PICA 4D3RA 2MRJA 3BUXB 1NNYA 2QBSA 2ZN7A 1BLKA 1R6HA 2Y96A 4P9VA 4E93A 4RH5A 1KC2A 1O4QA 2IUHA 1O47A 2C7SA 1O4BA 3VS3A 4GS0A 2CI9A 2GSBA 2LNWA 3CBLA 1RJAA 3V0GA 3ZM3A 4Y2EA 2F6VA 1A09A 1CSYA 4P9ZA 2MQIA 3S4EA 1CWEA 5EELA 1G7FA 5KADA 2EKXA 3PLFB 1OESA 2HDXA 3WA4A 1YWFA 3ZM1A 3D44A 1X6CA 2F46A 1PH0A 2BV5A 3VRZA 3HHMB 1ZCKA 1JYRA 3M7FA 2YU7A 2AOAA 1BKLA 5KAZA 1F2FA 3VRPA 4ZN5A 4BJOA 1XXVA 5KAAA 1KSWA 1SHAA 1SHBA 4E68A 3VRNA 1WRMA 3D1OA 3LJ8A 3CD3A 2NZ6A 2PA5A 1FPZA 1G1GA 2BBUA 1O4IA 2DLZA 1CWDL 1P15A 2FJNA 4AZ1A 2EOBA 3OB1B 4K44A 3EB1A 1O4HA 2CS0A 4JGHA 2OUDA 1D4WA 3AWEA 3A5KA 2SRCA 1IS0A 1LUMA 2PLEA 1YGUA 1X27A 3GXWA 2HY3A 1WQUA 3MOZA 3QKPA 2CMAA 2IUIA 1U24A 1FBVA 1I3ZA 1OPKA 2A3KA 4GFVA 1G83A 2HNQA 1FQ1A 3V0FA 2QBRA 4X6SA 2PSZA 4D3QA 1LCJA 4RH9A 1O4FA 2NV5A 3S8LA 4QSYA 5DC0B 5K9VA 1AOTF 3GXHA 2HCKA 3VROA 1PYNA 1VHRA 5KA9A 2AOBA 1YFOA 2I1YA 1C86A 2GP0A 2CNGA 3U96A 1OPLA 1LUIA 1Q6TA 2HB1A 2K7AB 1D1ZA 1KA6A 3PFVA 2QDCA 3PQZA 4JMJA 2ESBA 4NX8A 1IJRA 1JU5A 2ABLA 1YTSA 3VGOA 4MBBA 1YGRA 3N8MA 1ZFPE 2MK2A 1PTVA 2MC1A 1T4JA 2J17A 1UURA 2CNHA 2I4GA 4K2RA 2B4UA 2RORA 1F1WA 2CR4A 3SR9A 4A4CA 3QCFA 1BHHA 2ETZA 4XZ1A 1C83A 5BZXA 3BRHA 4WOHA 2XP1A 1H9OA 3CWGA 3VS0A 1XXPA 3S3KA 5KA0A 2OZOA 2JJDA 5IBMA 3QCHA 4R0TA 4QBWA 1G1HA 2I6OA 2DXPA 2CJZA 1Q6MA 4NNDA 4GL9E 1JYQA 2QDPA 4QUNA 3V0EA 3UYOA 4OHEA 3A5JA 2F70A 1CJ1A 5M43A 1KAVA 2PT0A 3OMHA 1OEOX 2C9WA 3PSJA 2C46A 2CNEA 2B49A 2Y3AB 4EY0A 2QMSA 1C87A 3SMEA 3C7IA 3QCNA 1LQFA 2IMGA 4NYHA 4H34A 1NZ7A 1AYBA 4TZIA 1Q6JA 3M4UA 2QCJA 1A81A 3D1QA 1X0NA 3BUMB 1OETA 3MOWA 2H04A 3GQIB 1O44A 3S9KA 1L8KA 2F6YA 3BKBA 1I57A 1K9AA 1QG1E 2VEVA 5K23A 4WWQA 5K9WA 4B04A 1OO3A 4WU3A 1Q6SA 1XA6A 1U26A 2AHSA 2QBPA 1O4NA 4HJPA 2GJTA 1SPSA 1YTWA 4JNBA 1OO4A 1I9SA 1A1EA 4JMKA 1UUSA 1O4PA 3UF4A 2QBQA 1BG1A 1XM2A 4RI4A 1QADA 2CRHA 1GWZA 3QCCA 1A1BA 2JYQA 5EEQA 4S0GA 4OHIA 5BUGA 2Y2FA 1RXDA 4RHGA 4WU2A 2G59A 2EYVA 1BHFA 3QCIA 3PSKA 1AOUF 1AB2A 1T48A 4QBEA 2M3VA 1JF7A 4YAAA 2HUWA 3F81A 3PJPA 3RGQA 4EIHA 2CBLA 1LKLA 3GXXA 4F5BA 1XBOA 2VEWA 3F9AA 2Y1MA 2CFVA 2HMHA 5AULA 3S3FA 1LARA 2NT2A 3EACA 3V0HA 4WTYA 1R1QA 1O4JA 2L6KA 3QCLA 4F59A 1C85A 2P4DA 1OHEA 2DX0A 2J16A 2PQ5A 2KK6A 1L8GA 1C88A 2FJMA 4JEGA 2FCIA 1NO6A 1HCSB 1LKKA 4ERCA 2HDVA 4FL2A 3OLRA 3MXCA 1FU5A 4H1OA 2DVJA 1Q6NA 1PA1A 1Y1UA 5EG3B 3NHNA 4IKCA 3VRYA 2CMCA 1OEMX 1CSZA 2CIAA 4FBNA 2HNPA 4F5AA 2OOQA 1SHDA 4DGPA 3O3LA 5BZZA 4K45A 5GJHA 3VS2A 3O5XA 2I3RA 1U25A 3QCGA 2I6PA 3V0IA 1G7GA 2H4KA 1Y57A 3KFJA 2H8HA 3ZMQA 3OB2B 3OP0A 3BUWB 3AWGA 2CM2A 1A1AA 1NZVA 4LUEA 1OHCA 2HC1A 3QKQA 5CDWA 2MRKA 1LYVA 4I8NA 3OV1A 2DM0A 5GTJA 4HJQA 4GWFA 4A4BA 1FPRA 2BIJA 2YDUA 3S8OA 2RF6A 1NZLA 2QEPA 4R30A 1O45A 2OC3A 5K24A 5KA3A 3O4SA 1OEUA 4TVVA 1FMKA 2I6JA 2WGPA 1O46A 2G6ZA 3MMJA 1AD5A 2OQ1A 1LUNA 2C0OA 1A5YA 3V0DA 3T04A 3VS7A 5MMZB 2H5KA 3QCMA 1O49A 2ECDA 1G4WR 1ONYA 1PTUA 2DCRA 3D1HA 1LUKA 2LCTA 2I6IA 1FBZA 5BO4A 4DGXA 1O4RA 4U1PA 3ZMPA 1Z3KA 3GXGA 1BHHB 2EU0A 1HCTB 1FYRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3S3EA 1O42A 4ZI4A 2I6MA 3TKZA 2NTAA 4CVMA 1P3DA 2EL8A 2I3UA 2Q05A 3ZL8A 5BX1A 3B7OA 3MXYA 3RO1A 3OVEA 1EEOA 4ICZA 2CM7A 1V3AA 4KYRA 1RPYA 1ONZA 2EYZA 3MVNA 1BZCA 4QAPA 1SPRA 2HC2A 1ECVA 1I9TA 5HKYA 3VRQA 5DF6A 4GE5A 2GE9A 3ZV2A 3PS5A 3QWYA 3CXLA 1KA7A 2F00A 2R0BA 1O4KA 3IN7A 2RSYA 1GFYA 1YN9A 2AUGA 2EO3A 1BFIA 1O4GA 1BKMA 2AZRA 2PNAA 4OHHA 1M3GA 2F6TA 3QCDA 2E0TA 1PTYA 3BUNB 2B4SA 1R1PA 2QDMA 4J51A 2Y68A 4YR8B 1BM2A 3EAZA 2I75A 2KNOA 3I36A 1O4DA 2BGEA 2F6WA 1XRIA 1M61A 3V0JA 1YZ4A 4OHLA 3ZM2A 4HRFA 2SHPA 1AYDA 4JBCA 1NRVA 1BF5A 1GRIA 2PI7A 1TZEE 2NLKA 1BLJA 2LNXA 2F6FA 5KA7A 1M27A 3I7ZA 2Y1OA 1SKJA 3VS6A 2H4VA 1MILA 1B47A 3QCJA 2HVLA 3BLTA 3EZZA 4QAHA 2CNIA 1OHDA 2HCMA 1PA9A 3QCEA 1BZHA 1OEVA 1O48A 5HKWA 3D42A 5DC9A 3D9CA 3EAXA 2CM3A 1KAKA 3CM3A 5KABA 5EHPA 1G1FA 2QCTA 3F99A 2Y1NA 1R1SA 1YTNA 2MBCA 3US4A 5D0JA 4RDDA 4R0SA 2IZVA 3BLUA 1P31A 2VIFA 3N7YA 3BUOB 5LXQB 1GHUA 4BPCA 3QCKA 2LQNA 4FL3A 1E8CA 4Y14A 5AXIA 3O4TA 5DC4A 5HDEA 4ZIYA 5HKZA 1O5ZA 2Q47A 2B07A 2I4HA 2RVFA 3ZM0A 2L3TA 3RZ2A 5KA1A 1A07A 1NWLA 5A5EA 1TCEA 4LUDA 1MKPA 2EYYA 2B4PA 4JE4A 1Q1MA 2DLYA 2B3OA 2H4GA 4K11A 2J16B 4ROJA 1FU6A 1O4EA 3VRRA 1LCKA 2EO6A 3TL0A 1SUGA 3RGOA 2RMXA 2H02A 2LQWA 1AAXA 4NWFA 1C84A 3N0AA 5KA4A 2YSXA 4GFUA 2VEYA 1ZCLA 2F71A 1O4LA 3IMJA 2BZLA 1MW4A 4GRYA 1D4TA 3K2MA 4XZ0A 2PTKA 4L1BB 3EU0A 4GE2A 4Z6BA 2F6ZA 5KA2A 1JWOA 1O43A 4U17A 3VS1A 2UAGA 4KYQA 1BFJA 3QCBA 1T49A 2VOSA 1O4CA 2PBNA 3N84A 2B4OA 4QUMA 3ZM5A 3HIZB 3S4OA 2HXPA 2Y66A 3O4UA 1RQQC 2C0IA 1JYUA 1YPTA 4D3PA 2FO0A 1O4OA 2PNBA 4GPLB 4D8KA 1G4US 2I5XA 2I4EA 2VEXA 1YVLA 3MAZA 3VS4A 2JFHA 4OHDA 1J4XA 3EMUA 1WAXA 2OZ5A 4CVKA 1AYAA 2H03A 2P6XA 3AWFA 3IMDA 3H2XA 3QWXX 4GE6A 4RKKA 3I80A 3UAGA 5GJIA 1D5RA 4PYHA 2I42A 1P13A 1FHSA 2IUGA 3VS5A 5J8RA 2GWOA 4RI5A 3ZNIA 1ZZWA 2CNFA 3S3HA 2A8BA 2UUPA 3F9BA 2CMBA 5K25A 2UUOA 2FH7A 3F41A 2C0TA 1PTTA 1QXKA 5IBSA 1BZJA 1PXHA 2ZMMA 3NMEA 2CI8A 4ZRTA 1A1CA 1A08A 1NWEA 2CM8A 1EENA 1QZ0A 1BMBA 4NWGA 5EHRA 3BM8A 5AWXA 4GRZA 1AYCA 1JLNA 1W78A 4M4ZA 2K79B 1Q6PA 1YVHA 4PVGA 1GG4A 1JBWA 4KI9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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