4DGPA

The wild-type src homology 2 (sh2)-domain containing protein tyrosine phosphatase-2 (shp2)
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
526
structure length
499
Chain Sequence
SRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDDKGESNDGKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDSDYINANIIMPEKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural and Mechanistic Insights into LEOPARD Syndrome-Associated SHP2 Mutations.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 154
structure length 499
sequence length 526
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2012-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4dgpA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4dgpA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4dgpA03
1A1AA 1Q6NA 1OEOX 2L3TA 4K2RA 2I6MA 3US4A 3QKQA 1OEUA 4GS0A 2FO0A 2H4GA 1Y57A 2JYQA 3ZM0A 3BUNB 3SMEA 2K79B 3ZM2A 2QDCA 1EEOA 2QBRA 2PTKA 1C84A 1O46A 1Q6PA 5MMZB 1O4KA 1BHHA 4GL9E 4KYQA 1JF7A 5J8RA 2L6KA 1MKPA 1BZCA 1NL9A 2HB1A 3CWGA 2C7SA 3PS5A 1O44A 1JYRA 3VS7A 4ZN5A 1YPTA 4S0GA 1TZEE 3PSKA 2J16A 4JE4A 1ONYA 2MRJA 2B4PA 2F6VA 4F5AA 1O4IA 3QCNA 3ZMQA 3D9CA 3OB2B 2HUWA 2HC2A 1O4JA 3RGQA 1O4PA 2CNFA 3BLTA 1LCKA 1OHEA 2YDUA 3QCBA 4GE2A 4H34A 1T49A 2DXPA 2ZMMA 3EMUA 3I7ZA 3S8OA 3VRRA 2F6WA 2NT7A 5AULA 1CWEA 2I3RA 3K2MA 2CS0A 5GJHA 2I3UA 1QXKA 3UF4A 4AZ1A 4RDDA 4OHIA 2LQWA 1NWEA 3VRPA 1BFJA 3MMJA 4JMJA 1FPZA 1CSZA 1M27A 1PA1A 4DGPA 5KA9A 1D1ZA 1WRMA 5KA8A 1K9AA 1YZ4A 1G7FA 4JNBA 1AYDA 1WAXA 1I3ZA 3CXLA 4GWFA 1YTNA 3F99A 2AHSA 3HCKA 3QWXX 4MBBA 4WOHA 4U1PA 4LUDA 4WWQA 3UYOA 4R0SA 1AAXA 2VEVA 4HJPA 1SHDA 2OZOA 3B7OA 3D1QA 3GXHA 2XP1A 5J3XA 5KA2A 4D3PA 2B4UA 3I36A 4GRZA 2C0OA 1NNYA 2I4GA 3NHNA 1FPRA 3EB1A 3LJ8A 5K22A 5KA7A 1L8GA 1FMKA 2CM2A 3QCMA 1RQQC 1Q6JA 1BF5A 2I42A 2QDPA 3V0JA 2CM7A 3VROA 1YFOA 2ABLA 2MBCA 1GWZA 2HCKA 3RZ2A 1U26A 3OV1A 1ECVA 2OQ1A 2HDVA 4QSYA 2RORA 3QCKA 3BUXB 5K25A 3F81A 5CDWA 3VS6A 1P13A 5IBSA 3QCEA 4JBCA 1O4QA 1RPMA 2G59A 5KA1A 2H46E 1BKMA 1LYVA 2SHPA 2B4SA 1IJRA 3BLUA 1CWDL 3VRNA 2A3KA 4XZ0A 2PI7A 2OOQA 1O4AA 4JEGA 4D8KA 2LNXA 1JU5A 4WU2A 1G7GA 1R1PA 1FHSA 5K24A 2MC1A 1O4DA 4X6SA 4GE5A 3OVEA 1Z3KA 2NTAA 2GWOA 1A5YA 1GHUA 2BGDA 5I6VA 1PXHA 2PSZA 2ETZA 2YSXA 1O4OA 4RI4A 2H4VA 1ZCKA 3S3EA 1LUKA 2IUGA 4A4CA 4ZI4A 3A5KA 5BX1A 1LKLA 2RVFA 2QBSA 1O4LA 1O4CA 2BV5A 3RGOA 1YGUA 4LUEA 3VS1A 1C85A 2OC3A 3PSJA 3BM8A 4RH5A 2GP0A 2NV5A 5DC0B 3F9AA 1AD5A 2F46A 3BKBA 3M4UA 2NLKA 2MK2A 2PLEA 1LUNA 1T4JA 5EG3B 1OESA 3VRQA 1LUIA 2ESBA 2J17A 4KI9A 2I4EA 2HVLA 4GRYA 2PNBA 1M3GA 3D1HA 4RI5A 1O42A 2H8HA 2VEUA 3ZM1A 5BUGA 1BLKA 5KAZA 5K9WA 2Y96A 4QBEA 4BPCA 3N0AA 1OEMX 3M7FA 3QCJA 2P6XA 2EKXA 1WCHA 1LKKA 2AOAA 4R0TA 5HKWA 3MOZA 2I1YA 4GFUA 4PVGA 5AXIA 5KA3A 1O43A 4YR8B 4I8NA 4E93A 1MILA 4E68A 3H2XA 2CMBA 2B3OA 5DC4A 2NT2A 3D1OA 3OB1B 5EEQA 3TL0A 2F71A 5KADA 4GFVA 1U24A 1FBVA 3O4UA 2PNAA 1YTSA 3EAZA 2CM3A 2HC1A 2RMXA 2G6ZA 2Y3AB 1HCSB 4K45A 1U25A 2CNHA 1QZ0A 1R6HA 1BG1A 1AYAA 2CMCA 3MXCA 1I9TA 4RKKA 3S3FA 3S8NA 2BZLA 3AWFA 1O48A 1BHFA 3GXXA 1Q6SA 4R30A 1XA6A 4L1BB 1WQUA 5HKZA 3WA4A 1BZJA 3V0FA 4ERCA 1PA9A 4D3RA 4HRFA 2HMHA 4B04A 1UURA 1KAKA 5D0JA 3S3KA 1PTVA 2QCTA 2R0BA 3BUMB 1YVHA 3PFVA 1P15A 4H1OA 1Q6TA 1FQ1A 1G83A 1ONZA 1ZC0A 3PQZA 2EL8A 1LQFA 1O45A 1SPRA 2QMSA 2Q47A 3CWEA 3RO1A 2HNQA 2H02A 2CI8A 4RH9A 5HDEA 4WTYA 5IBMA 1D4TA 2I5XA 4OHEA 2VEXA 4XZ1A 3V0DA 4Y2EA 1L8KA 3N8MA 2F6YA 3KFJA 2OUDA 3IN7A 3V0IA 1Y1UA 2CFVA 1O47A 3HHMB 1XRIA 2FH7A 2EYVA 2QCJA 4QBWA 4EIHA 2M3VA 3NMEA 3VS0A 3V0HA 1PTTA 1FYRA 3BUOB 3IMJA 2H03A 1JYQA 3VS4A 1YWFA 2HCMA 3EZZA 4KYRA 3VS2A 3AWEA 1BM2A 2CIAA 1OO4A 1FBZA 5DF6A 1F1WA 2IMGA 2GJTA 1B47A 3T04A 3OMHA 2PBNA 4HJQA 3SR9A 1EENA 1G1HA 3S4OA 1PICA 1JWOA 3N7YA 3QCCA 4F59A 3OLRA 2B07A 2FJNA 2PT0A 2RSYA 2LCTA 1LCJA 2CR4A 1O4RA 1OEVA 2I4HA 5EELA 2Q05A 1OETA 2B49A 1TCEA 2I6JA 3MAZA 2EO6A 3S4EA 1G4WR 1PYNA 2Y1NA 3O4TA 3QCHA 1VHRA 2CRHA 3VS5A 1Q1MA 3U96A 1NZVA 2QBQA 2CM8A 1BHHB 3QWYA 2EYZA 1O4FA 1A81A 1LUMA 1KA7A 2PQ5A 5KA4A 2CBLA 1AOTF 1T48A 4ZRTA 3EAXA 4GPLB 1AYBA 4EY0A 2MRKA 3QKPA 1O4BA 1RJAA 2Y2FA 2I6OA 1A08A 3N84A 3PJPA 1SPSA 2EU0A 2HNPA 2BBUA 1YGRA 2GSBA 1OO3A 1C86A 1G1FA 1G1GA 3F9BA 3CBLA 1M61A 2AUGA 4OHHA 3AWGA 5BZXA 4F5BA 2HDXA 1C88A 3GXWA 4ICZA 5HKYA 2IZVA 3D44A 3MOWA 3ZV2A 2F6FA 4Y14A 3V0EA 1X6CA 1O4MA 1YN9A 3C7IA 2HXPA 5GTJA 1SKJA 1ZFPE 2L4KA 1BKLA 2DX0A 3IMDA 1V3AA 1ZCLA 3MXYA 1X0NA 1BZHA 1D4WA 2QEPA 2I75A 3I80A 1F2FA 1JYUA 1D5RA 2F6ZA 2F6TA 2RF6A 5KAAA 1BMBA 4IKCA 1SHBA 1FU5A 1NWLA 4A4BA 3S8LA 2NZ6A 1NO6A 2AZRA 1YTWA 4YAAA 4TVVA 3ZNIA 1QCFA 1RXDA 4NX8A 3A5JA 1A09A 1R1SA 2LQNA 4DGXA 2I6IA 2DLYA 2HY3A 2PA5A 1O4HA 2C9WA 2C0TA 5DC9A 1GFYA 2QDMA 2DM0A 1QG1E 4JGHA 1FU6A 1O4NA 1O4GA 4FL3A 2K7AB 1C83A 3S3HA 5AWXA 2FCIA 1OHCA 2B4OA 2P4DA 1JLNA 1G4US 2PLDA 4J51A 1A1CA 2C46A 1UUSA 5EHPA 2CNEA 3O5XA 1MW4A 1X24A 4K44A 1SUGA 1I57A 3VRYA 1BLJA 1KA6A 4ROJA 4OHDA 2KK6A 1NRVA 3O4SA 3ZM3A 4QAHA 1PTUA 4RHGA 2VIFA 1CJ1A 1NZLA 3CD3A 2MQIA 5GJIA 4D3QA 2E0TA 2ZN7A 5EHRA 1XBOA 1BFIA 1AB2A 4Z6BA 1RPYA 3IN8A 3OP0A 2VEYA 2H5KA 5BZZA 4NWGA 3QCIA 1O49A 2DVJA 2CMAA 1R1QA 2EOBA 4WU3A 1O4EA 3EACA 4M4ZA 2AOBA 3QCLA 2CJZA 2DCRA 1PTYA 3VGOA 2ECDA 1XXPA 1ZZWA 1H9OA 1HCTB 3QCGA 5KACA 2CNIA 1IS0A 2EO3A 3O3LA 1J4XA 1I9SA 1A1EA 2C0IA 3ZMPA 4TZIA 1QADA 4FL2A 3S9KA 4QUMA 4K11A 2KNOA 3F41A 4FBNA 1AOUF 2JJDA 1A1BA 2YU7A 3QCFA 2A8BA 1XXVA 4NNDA 3PLFB 3EU0A 1C87A 1OHDA 2FJMA 2SRCA 1OPLA 4BJOA 1YVLA 2H04A 3BUWB 2BIJA 1PH0A 5K9VA 4OHLA 1LARA 1A07A 4NYHA 2IUHA 3GQIB 3TKZA 1KAVA 4JMKA 4NWFA 2CI9A 2VEWA 4QUNA 1O41A 3VS3A 2H4KA 5KA0A 1GRIA 1Q6MA 4P9ZA 2GE9A 1AYCA 2IUIA 1SHAA 2CNGA 3BRHA 5LXQB 1CSYA 2QBPA 5M43A 5K23A 1X27A 2Y1MA 4PYHA 2DLZA 2F70A 5KABA 1XM2A 5BO4A 1OPKA 2J16B 4U17A 1KSWA 1NZ7A 2WGPA 3V0GA 4P9VA 2BGEA 3QCDA 3HIZB 3CM3A 4QAPA 2I6PA 2EYYA 1KC2A 2OZ5A 3GXGA 2LNWA 4GE6A 3D42A 3VRZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1A1AA 1Q6NA 1OEOX 2L3TA 4K2RA 2I6MA 3US4A 2GCAA 1OEUA 3QKQA 2FO0A 2H4GA 4GS0A 1Y57A 2JYQA 3ZM0A 3BUNB 3SMEA 2K79B 5A5FA 3ZM2A 2QDCA 1EEOA 2QBRA 2PTKA 1C84A 1O46A 1Q6PA 5MMZB 1O4KA 1BHHA 4GL9E 4KYQA 1JF7A 2GC5A 1GG4A 5J8RA 2L6KA 1UAGA 1MKPA 1BZCA 1NL9A 2HB1A 3CWGA 2C7SA 3PS5A 1O44A 1JYRA 3VS7A 4ZN5A 1YPTA 4S0GA 1TZEE 3PSKA 2J16A 4JE4A 1ONYA 2MRJA 2B4PA 2F6VA 4F5AA 1O4IA 3QCNA 3QCZA 3ZMQA 2XJAA 3D9CA 5A5EA 3OB2B 2HUWA 2HC2A 1O4JA 3RGQA 1O4PA 2CNFA 2AM1A 3BLTA 1LCKA 1OHEA 2YDUA 3QCBA 4GE2A 4H34A 1T49A 2DXPA 2KGYA 2ZMMA 3EMUA 3I7ZA 3S8OA 3VRRA 2F6WA 2NT7A 5AULA 2Y66A 1CWEA 2I3RA 3K2MA 2CS0A 5GJHA 2I3UA 1QXKA 3UF4A 4AZ1A 4RDDA 4OHIA 2LQWA 1NWEA 3VRPA 1BFJA 3MMJA 4JMJA 1FPZA 1CSZA 1M27A 1PA1A 4DGPA 1E8CA 5KA9A 1D1ZA 1WRMA 5KA8A 1K9AA 1YZ4A 1G7FA 4JNBA 1AYDA 1WAXA 1I3ZA 3CXLA 4GWFA 1YTNA 3F99A 2AHSA 3HN7A 3HCKA 3QWXX 4MBBA 4WOHA 4U1PA 4LUDA 4WWQA 3UYOA 4R0SA 1AAXA 2VEVA 4HJPA 1SHDA 2OZOA 3B7OA 3D1QA 3GXHA 2XP1A 5J3XA 5KA2A 3N2AA 4D3PA 2B4UA 3I36A 4GRZA 2C0OA 1NNYA 2I4GA 3NHNA 1FPRA 3EB1A 3LJ8A 5K22A 5KA7A 1L8GA 1FMKA 2CM2A 2UUPA 3QCMA 1RQQC 1Q6JA 4CVKA 1BF5A 1O5ZA 2I42A 2QDPA 3V0JA 2CM7A 3VROA 1YFOA 2ABLA 2MBCA 1GWZA 2HCKA 3RZ2A 1U26A 1J6UA 3OV1A 1ECVA 2OQ1A 1W7KA 2HDVA 4QSYA 2RORA 3QCKA 3BUXB 5K25A 3F81A 4BUCA 5CDWA 3VS6A 1P13A 1EEHA 5IBSA 3QCEA 4JBCA 1O4QA 1RPMA 2Y67A 2G59A 5KA1A 2H46E 1BKMA 1LYVA 2SHPA 2B4SA 1IJRA 3BLUA 1CWDL 3VRNA 2A3KA 4XZ0A 2PI7A 2OOQA 1O4AA 4JEGA 4D8KA 2LNXA 1JU5A 4WU2A 1G7GA 1R1PA 1FHSA 5K24A 2MC1A 1O4DA 4X6SA 4GE5A 3OVEA 1Z3KA 2NTAA 2GWOA 1A5YA 1GHUA 2BGDA 5I6VA 1PXHA 2PSZA 2ETZA 2YSXA 1O4OA 4RI4A 2H4VA 1ZCKA 3S3EA 1LUKA 2IUGA 4A4CA 4ZI4A 3A5KA 5BX1A 2Y1OA 1LKLA 2RVFA 2QBSA 1O4LA 1O4CA 2BV5A 2VORA 1YGUA 3RGOA 4CVLA 4LUEA 3VS1A 1C85A 2OC3A 3PSJA 3BM8A 4RH5A 2GP0A 2NV5A 5DC0B 3F9AA 1AD5A 3LYVA 2F46A 3BKBA 3M4UA 2NLKA 2MK2A 2PLEA 1LUNA 1T4JA 5EG3B 1OESA 3VRQA 1LUIA 2ESBA 2J17A 4KI9A 2I4EA 2HVLA 4GRYA 2PNBA 1M3GA 3D1HA 4RI5A 1O42A 2H8HA 2GC6A 2VEUA 3ZM1A 1BLKA 5KAZA 5BUGA 2Y96A 5K9WA 4QBEA 2WTZA 4CVMA 4BPCA 3N0AA 1OEMX 3M7FA 3QCJA 2P6XA 2EKXA 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2VOSA 3OMHA 2PBNA 4HJQA 3SR9A 1EENA 1G1HA 2JFGA 3S4OA 1PICA 1JWOA 2UAGA 3N7YA 3QCCA 4F59A 3OLRA 2B07A 2FJNA 2PT0A 2RSYA 2LCTA 1LCJA 2CR4A 1O4RA 1OEVA 4C12A 1JBVA 2I4HA 5EELA 2Q05A 1OETA 2B49A 1TCEA 2I6JA 3MAZA 2EO6A 3S4EA 1G4WR 1PYNA 2Y1NA 3O4TA 3QCHA 1VHRA 2CRHA 3VS5A 1Q1MA 2Y68A 3U96A 1NZVA 2QBQA 2CM8A 1BHHB 3QWYA 2EYZA 1O4FA 1A81A 1LUMA 3K2TA 1KA7A 2PQ5A 5KA4A 2CBLA 1AOTF 1T48A 4ZRTA 3EAXA 4GPLB 1AYBA 4EY0A 2MRKA 3QKPA 1O4BA 1RJAA 2Y2FA 2I6OA 1A08A 3N84A 3PJPA 1SPSA 2EU0A 2HNPA 2BBUA 1YGRA 2GSBA 1OO3A 1C86A 1G1FA 1G1GA 3F9BA 3CBLA 1M61A 2AUGA 4OHHA 3AWGA 5BZXA 4F5BA 2HDXA 1C88A 3GXWA 4ICZA 5HKYA 2IZVA 3D44A 3MOWA 3ZL8A 3ZV2A 1P31A 2F6FA 4Y14A 3V0EA 1X6CA 1O4MA 1YN9A 3C7IA 2HXPA 5GTJA 1SKJA 1ZFPE 2L4KA 1BKLA 2DX0A 3IMDA 1V3AA 3PYZA 1ZCLA 3MXYA 1X0NA 3MVNA 1BZHA 1D4WA 2QEPA 2I75A 3I80A 1F2FA 1JYUA 1D5RA 2F6ZA 2F6TA 2RF6A 5KAAA 1BMBA 4IKCA 1SHBA 1FU5A 1NWLA 4A4BA 3S8LA 2NZ6A 1NO6A 2AZRA 1YTWA 4YAAA 4TVVA 3ZNIA 1QCFA 1RXDA 2AM2A 2JFFA 4NX8A 3A5JA 1A09A 1R1SA 2LQNA 4DGXA 2UUOA 1GQQA 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 5KAB A;  1XM2 A;  5BO4 A;  1OPK A;  2J16 B;  4U17 A;  1KSW A;  1NZ7 A;  2WGP A;  3V0G A;  4P9V A;  2BGE A;  3QCD A;  3HIZ B;  3CM3 A;  4QAP A;  2I6P A;  2EYY A;  1KC2 A;  2OZ5 A;  3GXG A;  2LNW A;  4GE6 A;  3D42 A;  3VRZ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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