5I6VA

Structure of f285s, a cancer-associated mutation of the oncogenic phosphatase shp2
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
523
structure length
488
Chain Sequence
SRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPSDHTRVVLHDGDPNEPVSDYINANIIMPEKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural and Functional Consequences of Three Cancer-Associated Mutations of the Oncogenic Phosphatase SHP2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 158
structure length 488
sequence length 523
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2016-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 5i6vA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 5i6vA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 5i6vA03
3EACA 2CMCA 1OO3A 1D4WA 1NL9A 1JU5A 1OHDA 4K11A 2E0TA 2MRJA 3I7ZA 5K22A 3D44A 2G59A 1I9TA 3RO1A 1X0NA 1QADA 2B3OA 4WU2A 3ZM3A 3QCBA 5KAAA 2LNWA 1BG1A 1O4KA 3WA4A 2KK6A 1GHUA 1YGUA 2HCMA 3RGOA 4D8KA 5KA1A 2CM7A 1A5YA 2P6XA 1P15A 2Q47A 1AAXA 4GFUA 2QBPA 1OEUA 1O45A 3MXYA 3N7YA 3PSKA 2ECDA 3PLFB 1Q6NA 1R1SA 1OEVA 1AYAA 3NHNA 3S8OA 4MBBA 5KA2A 1NNYA 3MXCA 2HNQA 3QCLA 1B47A 2VEXA 2H46E 5I6VA 3C7IA 1KA7A 1M27A 1JLNA 3IN7A 5BX1A 2CBLA 2I5XA 5HKYA 1G7FA 3N84A 1H9OA 1O4LA 4R0TA 3AWEA 4M4ZA 1P13A 5K23A 1PH0A 2A3KA 1Q6MA 2F71A 3BLTA 5IBSA 4ZN5A 2EYYA 3ZM0A 4D3RA 2HMHA 1O42A 5EEQA 1BZCA 1FMKA 5HKWA 1SUGA 1A1EA 1KSWA 1BHHA 3N0AA 2FJNA 1XA6A 4YAAA 2IUIA 3QCDA 1O4MA 1O4FA 5KA9A 1OEMX 1O4CA 2F6VA 2EO6A 3EMUA 1YGRA 2B07A 4OHLA 2DX0A 1YWFA 1O4AA 1TZEE 3QCIA 4Y14A 3VS3A 3VRYA 2PI7A 3VRRA 2OOQA 4LUEA 1OHCA 2M3VA 4A4CA 1CSZA 1ZCLA 1JYUA 5EG3B 4F5AA 4A4BA 1Q6JA 1Y57A 2SHPA 1MKPA 1LKKA 3OVEA 1AOUF 1FPRA 2QCJA 5BZXA 3EB1A 1O43A 1PICA 2JJDA 1J4XA 4ERCA 3BUOB 1AB2A 2F6ZA 3UF4A 5HKZA 2C0TA 2HDVA 1YTWA 3EU0A 1G4WR 2CS0A 1G83A 3PSJA 4NYHA 3IN8A 2MBCA 5LXQB 5M43A 1A1BA 2XP1A 3HIZB 3CWEA 5AULA 3D42A 2GE9A 1Q6SA 2BZLA 4I8NA 1LUIA 5KA7A 2VEVA 2CFVA 4PVGA 1NZ7A 1T4JA 1R1PA 3O3LA 3AWFA 4WU3A 1O46A 1SHAA 1O4PA 3F41A 1Q1MA 3T04A 1VHRA 2PLDA 3VS0A 2PNBA 2QCTA 4LUDA 2F6FA 2LQNA 3GXWA 2CR4A 2AHSA 2HVLA 1PXHA 3V0IA 1FBVA 2PBNA 2I6OA 4K45A 1WCHA 1OO4A 1BHFA 4JE4A 5J3XA 1QG1E 3F81A 3MMJA 5IBMA 1PTVA 1JYQA 3O4UA 3SR9A 2EU0A 3ZM2A 1NWEA 2BGDA 1A08A 3QCGA 4RKKA 2FCIA 2I6JA 4TVVA 1JYRA 3QCKA 2CI9A 1IS0A 1SHBA 3S3FA 2EKXA 3S8LA 2C0IA 3F9AA 4B04A 3M7FA 1CJ1A 1ZCKA 1O4HA 2F70A 3VRZA 2HB1A 3D9CA 2EOBA 2QMSA 3OB1B 5KABA 1YVHA 1O47A 3CD3A 3D1QA 1O4JA 2I4GA 2NT2A 3V0JA 4RI5A 1LQFA 4QBEA 2J17A 5GJHA 2LCTA 1L8GA 2BIJA 2PSZA 4HRFA 2MC1A 5K24A 2DLYA 1YN9A 2NTAA 3EAXA 4IKCA 1ONZA 4JEGA 2I6IA 3IMDA 1L8KA 1T49A 1BZHA 1WRMA 2HUWA 1MILA 3QWXX 3PQZA 1GWZA 2H4VA 2P4DA 1SHDA 1C84A 3BM8A 1R6HA 4HJQA 2PQ5A 2RMXA 1ZC0A 3S3KA 4KYQA 3US4A 3S4OA 2PA5A 1BF5A 3B7OA 5KA0A 4JMKA 2RVFA 3PJPA 1XRIA 3VROA 1OEOX 1BFJA 3V0DA 2A8BA 1CSYA 4JBCA 1O4BA 1NO6A 2DLZA 1BFIA 3QCFA 1X27A 2RF6A 1RPMA 2CRHA 1O4GA 3GXHA 3TL0A 3U96A 3BKBA 2QDPA 1QCFA 4P9ZA 3RGQA 3V0FA 1BHHB 3BLUA 2BV5A 1SPSA 4R30A 5KA3A 2J16A 1NWLA 2I6MA 3RZ2A 1KC2A 2Y96A 3VS5A 2OUDA 5K9VA 3EZZA 2CNIA 5KA4A 4BPCA 1AYCA 4FL2A 3VS6A 2C0OA 4D3QA 1D5RA 2DXPA 5K25A 2IUGA 1KAKA 2CMAA 1T48A 1UUSA 5HDEA 1OESA 4J51A 1RJAA 2L4KA 2L3TA 2DCRA 1BLKA 4QUMA 4NWGA 1O4OA 1OPKA 2EL8A 2HDXA 1O4EA 4OHHA 1G1GA 2MRKA 2CMBA 2CNHA 5BZZA 4WWQA 5BO4A 1G4US 1G7GA 2H4GA 4NX8A 2CNGA 2H04A 4KI9A 3BUWB 2GJTA 3OV1A 4U17A 3QCMA 2EYVA 2C46A 2PT0A 4QUNA 3LJ8A 2C7SA 2I4HA 2OC3A 2NLKA 1BKMA 3BUMB 1PTUA 1LYVA 1A1CA 1Q6TA 3V0GA 2FO0A 1PA1A 3S9KA 2OZ5A 2OQ1A 5DC4A 1AOTF 5CDWA 1XBOA 1XM2A 1F2FA 2CNFA 1A1AA 4OHDA 3QKPA 4ZRTA 3GXGA 1WQUA 2C9WA 2DVJA 1FHSA 4GL9E 1RQQC 4K44A 4GWFA 4ROJA 1O44A 2I6PA 1BMBA 4L1BB 2YU7A 3OP0A 1LKLA 2B49A 2IZVA 4P9VA 1NZVA 2K7AB 5EHRA 1YPTA 3QKQA 4X6SA 4RDDA 4H1OA 5EHPA 3VS4A 4S0GA 1D4TA 2KNOA 3I80A 2F6WA 4BJOA 3VRPA 2HC2A 1LCJA 3K2MA 3PFVA 2H02A 2ABLA 2PNAA 3VGOA 4GS0A 1WAXA 2JYQA 1YFOA 2I4EA 1MW4A 2SRCA 1PTTA 4EIHA 4ZI4A 3VRNA 2OZOA 1O4QA 4KYRA 4QAHA 1AD5A 3F99A 2BGEA 1AYBA 2AZRA 1R1QA 2MK2A 1RPYA 4E93A 4NNDA 3VS2A 1NRVA 1FU6A 1KAVA 1GFYA 2GWOA 4PYHA 5AWXA 2QBSA 2F46A 3O4TA 4FBNA 1U24A 4F59A 5MMZB 3I36A 1F1WA 1C85A 1M3GA 5EELA 1HCTB 2I42A 5KACA 3BUNB 3QCCA 5D0JA 2ETZA 1O49A 2NT7A 3HCKA 1JF7A 3QCNA 3HHMB 2CM8A 3AWGA 2CNEA 3MOZA 1FQ1A 1LUKA 1QXKA 3D1HA 2GP0A 2NV5A 4XZ0A 3MOWA 1HCSB 1OPLA 3OB2B 4GE5A 2G6ZA 2HXPA 4RH5A 2FJMA 2QEPA 2VEUA 2GSBA 4U1PA 1BKLA 3GXXA 3VS1A 4DGPA 2QDMA 4R0SA 1FU5A 1X6CA 5KA8A 2H8HA 2RORA 5GJIA 4RI4A 4GPLB 1A81A 2HY3A 2IMGA 2Y1MA 1YVLA 4K2RA 1G1HA 3CM3A 5DF6A 4GE2A 1BZJA 2ZMMA 2H5KA 1PA9A 1U26A 1O41A 2J16B 2CJZA 5BUGA 3S3HA 4JNBA 3ZMPA 1PTYA 1CWDL 4E68A 1UURA 3O4SA 1O48A 2Y2FA 5GTJA 3QCEA 3A5KA 2PTKA 1BLJA 4GRZA 1RXDA 1C87A 1A09A 2HCKA 3QCHA 1K9AA 1O4RA 2VIFA 1YTNA 2I3RA 1CWEA 1M61A 1C86A 3EAZA 4TZIA 4GRYA 3N8MA 4F5BA 2Y3AB 2CI8A 1NZLA 1IJRA 1SKJA 2QBRA 4JMJA 3TKZA 1ZZWA 3BUXB 2Y1NA 3S3EA 5KADA 3QWYA 2CIAA 1Z3KA 1LUNA 2B4OA 2EO3A 1LCKA 2LNXA 3IMJA 2BBUA 1YZ4A 2WGPA 4RHGA 2CM2A 1GRIA 1U25A 4QBWA 2YSXA 1OETA 2H4KA 3SMEA 1FPZA 2VEWA 2FH7A 3ZM1A 4NWFA 1I3ZA 2K79B 3MAZA 4DGXA 5J8RA 1A07A 4JGHA 5KAZA 3QCJA 4FL3A 4OHEA 1JWOA 4H34A 3V0EA 1O4DA 2LQWA 3UYOA 3BRHA 3GQIB 1ZFPE 1I57A 1XXPA 4HJPA 2Q05A 1AYDA 4EY0A 2AOAA 3VRQA 4D3PA 4AZ1A 4YR8B 3CWGA 3V0HA 3S4EA 2F6YA 3KFJA 3VS7A 1ONYA 4WTYA 4GE6A 1YTSA 4OHIA 3H2XA 3NMEA 1C83A 4ICZA 1EEOA 5K9WA 1G1FA 2EYZA 3CXLA 3F9BA 2RSYA 1C88A 1XXVA 2I1YA 2HC1A 2QBQA 2ZN7A 2ESBA 1TCEA 1LARA 3ZMQA 2HNPA 4RH9A 1D1ZA 1Q6PA 1SPRA 2YDUA 1LUMA 4Y2EA 1FYRA 1X24A 1V3AA 2PLEA 2IUHA 2B4PA 2QDCA 1O4NA 3PS5A 4WOHA 3ZV2A 5DC9A 2F6TA 3A5JA 1FBZA 2B4UA 2AUGA 2VEYA 3D1OA 2L6KA 2H03A 1OHEA 2NZ6A 5DC0B 1I9SA 1ECVA 2AOBA 1PYNA 1O4IA 4QAPA 4Z6BA 1Y1UA 2DM0A 2CM3A 2MQIA 3CBLA 2R0BA 3S8NA 1BM2A 2I3UA 3OMHA 1QZ0A 4QSYA 1KA6A 2B4SA 3OLRA 3O5XA 3M4UA 3ZNIA 5AXIA 4GFVA 4XZ1A 2I75A 1EENA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EACA 2CMCA 1OO3A 1D4WA 1NL9A 1JU5A 1OHDA 4K11A 2E0TA 2MRJA 3I7ZA 5K22A 3D44A 2G59A 1I9TA 3RO1A 1X0NA 1QADA 2B3OA 4WU2A 3ZM3A 3QCBA 5KAAA 2LNWA 1BG1A 1O4KA 3WA4A 2KK6A 1GHUA 1YGUA 2HCMA 3RGOA 4D8KA 5KA1A 2CM7A 1A5YA 4ZIYA 2P6XA 1P15A 2Q47A 3K2TA 1AAXA 4GFUA 2Y68A 2QBPA 1OEUA 1O45A 3MXYA 3N7YA 3PSKA 2ECDA 3PLFB 1Q6NA 1R1SA 1OEVA 1AYAA 3NHNA 2JFGA 3S8OA 5A5FA 4MBBA 5KA2A 1NNYA 3MXCA 1EEHA 2HNQA 3QCLA 1B47A 2VEXA 2H46E 5I6VA 3C7IA 1KA7A 1M27A 1JLNA 3IN7A 5BX1A 2CBLA 2I5XA 5HKYA 1G7FA 3N84A 1H9OA 1O4LA 4R0TA 3HN7A 3AWEA 4M4ZA 1P13A 5K23A 1PH0A 2A3KA 1Q6MA 2F71A 3BLTA 5IBSA 4ZN5A 2EYYA 3ZM0A 2Y67A 4D3RA 2VORA 2HMHA 1O42A 5EEQA 1BZCA 1FMKA 5HKWA 1SUGA 1A1EA 1KSWA 1BHHA 3N0AA 2FJNA 1XA6A 4YAAA 2IUIA 3MVNA 3QCDA 1O4MA 1O4FA 2AM1A 5KA9A 1OEMX 1O4CA 2F6VA 2EO6A 3EMUA 1YGRA 2B07A 4OHLA 2DX0A 1YWFA 1O4AA 1TZEE 3QCIA 4Y14A 3VS3A 3VRYA 2PI7A 3VRRA 2OOQA 4LUEA 1OHCA 2M3VA 4A4CA 1CSZA 1ZCLA 2GC5A 1JYUA 5EG3B 4F5AA 4A4BA 1Q6JA 1Y57A 2SHPA 1MKPA 1LKKA 3OVEA 1AOUF 1FPRA 2QCJA 5BZXA 3EB1A 1O43A 1PICA 2JJDA 1J4XA 4ERCA 3BUOB 1AB2A 2F6ZA 3UF4A 5HKZA 2C0TA 2HDVA 1YTWA 3EU0A 1G4WR 2CS0A 1G83A 3PSJA 1E8CA 4NYHA 3UAGA 3IN8A 2MBCA 5LXQB 5M43A 1A1BA 2XP1A 2JFFA 3HIZB 3CWEA 5AULA 3D42A 1GQYA 1UAGA 2GE9A 1Q6SA 2BZLA 4I8NA 1LUIA 5KA7A 2VEVA 2CFVA 2GC6A 4PVGA 1NZ7A 1T4JA 1R1PA 3O3LA 3AWFA 4WU3A 1O46A 1SHAA 1O4PA 3F41A 1Q1MA 2KGYA 3T04A 1VHRA 2PLDA 3VS0A 2PNBA 2QCTA 4LUDA 2F6FA 2LQNA 3GXWA 2CR4A 2AHSA 2HVLA 1PXHA 3V0IA 2LRAA 1FBVA 2PBNA 2I6OA 4K45A 1WCHA 1OO4A 1BHFA 4JE4A 5J3XA 1QG1E 3F81A 3MMJA 5IBMA 1PTVA 1JYQA 2UAGA 3O4UA 3SR9A 2EU0A 3ZM2A 1NWEA 2BGDA 1A08A 3QCGA 4RKKA 2FCIA 2I6JA 4TVVA 1JYRA 3QCKA 2CI9A 1IS0A 1SHBA 3S3FA 2EKXA 3S8LA 2C0IA 3F9AA 4B04A 3M7FA 1CJ1A 1ZCKA 1O4HA 1P31A 2F70A 3VRZA 2HB1A 3D9CA 2EOBA 2QMSA 3OB1B 5KABA 1YVHA 1O47A 3CD3A 3D1QA 1O4JA 2I4GA 2NT2A 3V0JA 4RI5A 1LQFA 4QBEA 2J17A 5GJHA 2LCTA 1L8GA 2BIJA 4HV4A 1GG4A 2PSZA 4HRFA 2MC1A 5K24A 2DLYA 1YN9A 2NTAA 3EAXA 4IKCA 1ONZA 1J6UA 4JEGA 2I6IA 2X5OA 3IMDA 1L8KA 1T49A 1BZHA 1WRMA 2HUWA 1MILA 3QWXX 3PQZA 1GWZA 2H4VA 2P4DA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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