5I6VA

Structure of f285s, a cancer-associated mutation of the oncogenic phosphatase shp2
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
523
structure length
488
Chain Sequence
SRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPSDHTRVVLHDGDPNEPVSDYINANIIMPEKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural and Functional Consequences of Three Cancer-Associated Mutations of the Oncogenic Phosphatase SHP2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 158
structure length 488
sequence length 523
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2016-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 5i6vA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 5i6vA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 5i6vA03
1O4BA 1GRIA 1A5YA 2PBNA 2BIJA 2IUGA 3KFJA 4GE5A 5KA1A 3VS5A 1D1ZA 3PQZA 3ZMQA 3BLTA 3F9AA 1O4HA 3NHNA 2FH7A 1JYQA 1SUGA 5BZZA 2OUDA 2G59A 3MAZA 5I6VA 1G1FA 1WQUA 2NT2A 1GFYA 3V0FA 1YTWA 3ZMPA 2QEPA 4NX8A 5M43A 1WAXA 1AYCA 2PTKA 4P9VA 4B04A 4WWQA 1GHUA 2HXPA 2ABLA 1NZLA 2I5XA 3VS2A 2PI7A 4ZI4A 2MBCA 2EYVA 4NNDA 3T04A 1A1BA 2LCTA 1LCKA 1X6CA 1AD5A 4U1PA 1LQFA 1O46A 5K22A 5GJHA 3GQIB 3VS1A 2H02A 1NWLA 4BJOA 1SHDA 1Q6MA 1TZEE 2LNWA 1IJRA 2MQIA 2B4UA 1OHCA 2QDMA 4GE6A 4E93A 2RSYA 1AYAA 2K7AB 2F46A 2ZN7A 4K45A 3HIZB 2P6XA 3QCCA 1A09A 1SKJA 1ONZA 3O5XA 4AZ1A 5HKZA 2C0IA 5BZXA 3TKZA 2I6IA 3S3HA 1LCJA 3VRZA 3QCBA 2HCMA 4EY0A 2EO3A 2A3KA 2Y3AB 1OHDA 4GE2A 1P13A 3MXCA 4GRYA 2EYZA 1XXVA 2P4DA 1NL9A 4TVVA 4KYQA 1LUNA 4R0SA 5EG3B 1KA6A 3EZZA 1LARA 3O4UA 5KA0A 2R0BA 1KA7A 2Y96A 5EHRA 1WCHA 1A07A 2CM3A 2PNAA 3GXGA 1ZFPE 2IMGA 4F5BA 4A4CA 1RXDA 5HKYA 1JU5A 2C0TA 1G83A 1HCSB 3IN8A 2L3TA 2BGDA 2ZMMA 1PTUA 2Y1MA 1AB2A 2F6ZA 4QBWA 1OEUA 1O4DA 4R30A 1O4JA 1X0NA 1U24A 3S4EA 3N0AA 2QBRA 1I3ZA 2Q47A 3GXWA 3F9BA 4GWFA 1LUMA 1A1AA 4FBNA 3UYOA 2CNIA 1L8GA 4IKCA 3BUMB 2HC1A 4HJQA 2RORA 1O47A 1FPRA 2HY3A 3VS6A 4NWFA 2QDPA 3EAXA 1F2FA 2VIFA 1VHRA 3S8NA 2AOBA 1XRIA 3D1OA 3S3EA 2I4EA 2EYYA 2OOQA 1LKLA 1JF7A 1A81A 1PYNA 1Q6JA 2HCKA 3QCKA 1YPTA 2CI9A 2F6WA 1O44A 4JEGA 2DLYA 2K79B 2QDCA 5J3XA 4HJPA 3CM3A 2C9WA 1FU5A 1G4US 3PJPA 3QKQA 4I8NA 2I4HA 3ZM1A 3ZV2A 2FJMA 4RDDA 1CSZA 3VRQA 1OEVA 3BRHA 1SHBA 5KA2A 3CWGA 5MMZB 1NWEA 1MKPA 1ZCKA 4PYHA 1OEOX 5KA9A 2FCIA 3IMDA 1X27A 1LKKA 3RO1A 4BPCA 1AYDA 5KACA 1V3AA 4WU3A 2VEXA 2PLEA 4X6SA 5DC9A 3I7ZA 5EEQA 1MW4A 1U25A 2HMHA 2L6KA 2J16B 3O4SA 4RKKA 1QADA 1WRMA 3QCEA 4YAAA 1Q6SA 3A5KA 4GPLB 2SHPA 1QZ0A 5KABA 2I1YA 1BHHB 3S3KA 2I4GA 1FU6A 5KA8A 3U96A 1RPMA 2J17A 1R1SA 1NRVA 2NLKA 4RI5A 3I36A 2NV5A 2AHSA 2B4SA 2QBSA 4EIHA 2C7SA 1PTYA 1M61A 2ETZA 5EELA 1G7FA 2YU7A 3EMUA 3QCNA 5IBMA 4JMJA 4ZN5A 1SPRA 2BBUA 1ZC0A 5K9WA 3RGOA 1NZVA 2VEUA 4K2RA 2VEWA 3QWYA 1PA1A 1FYRA 1YZ4A 2DCRA 2YSXA 2B4OA 3VS4A 2DLZA 4S0GA 4JBCA 4QUMA 2F6FA 2I42A 2HDVA 3QCHA 3US4A 2MRKA 1F1WA 3QCMA 2CIAA 3EU0A 4RH9A 5IBSA 1KAVA 3RGQA 1R1QA 1C85A 1H9OA 4ICZA 5K24A 2YDUA 3BM8A 1YVHA 2OQ1A 3QKPA 1C83A 1CJ1A 2I75A 3QCDA 2HNQA 5K25A 2DVJA 3D1QA 2H5KA 5KADA 4OHHA 2FO0A 3VROA 1O4EA 2CJZA 3S4OA 1R1PA 3D42A 3H2XA 1O42A 2KNOA 2BGEA 1O4FA 1OHEA 1LUKA 1SHAA 1PICA 4WU2A 1O4GA 1Q1MA 1ECVA 2I6PA 1BHFA 4XZ1A 1D5RA 3VS7A 2C0OA 3QCIA 3N84A 3I80A 1FPZA 1LYVA 5KA3A 1O4CA 1OEMX 2CR4A 2A8BA 2BZLA 1J4XA 4WTYA 4KYRA 3F99A 2B07A 2CNGA 4DGXA 2OC3A 3PFVA 2CNFA 2NZ6A 4QBEA 3V0IA 1BFJA 1BZJA 1YGUA 5BO4A 4JMKA 4NYHA 4DGPA 2FJNA 2IUHA 1M3GA 4JNBA 1BG1A 5HKWA 3IN7A 4NWGA 3N7YA 1PH0A 1QG1E 1O4NA 3SMEA 2QCTA 1I9TA 4D8KA 1PTTA 2AZRA 4KI9A 1A1CA 1K9AA 2F6VA 3AWGA 3MMJA 4J51A 2B3OA 5KA7A 5CDWA 1A08A 2GSBA 1C86A 2JYQA 1C88A 2ECDA 2AOAA 4TZIA 3PS5A 4XZ0A 3ZNIA 3EB1A 4JE4A 5AXIA 5DC4A 3VS0A 3OVEA 3CBLA 1NZ7A 2E0TA 3BUXB 3HHMB 5D0JA 4Y2EA 4ZRTA 1FQ1A 4PVGA 1MILA 1G1GA 1BLJA 4YR8B 2LNXA 2F6YA 3D9CA 4QUNA 2I6OA 3M4UA 4GRZA 2PA5A 3CWEA 2LQWA 1NNYA 3EAZA 3S9KA 3F81A 3F41A 2GWOA 4OHDA 2OZ5A 3V0JA 2J16A 2RMXA 3WA4A 2H03A 2NT7A 3VRNA 4GFVA 1D4TA 5KAZA 4QAHA 3D44A 2OZOA 2XP1A 4RH5A 1BFIA 3QCJA 1KSWA 1JYRA 4A4BA 1JYUA 1Q6NA 3D1HA 3OLRA 1YVLA 1JWOA 3IMJA 1BZCA 2HB1A 3M7FA 3N8MA 2EOBA 5GTJA 3S3FA 3EACA 2CM7A 4RI4A 4R0TA 4Y14A 3TL0A 2IUIA 2QMSA 1Y1UA 2PQ5A 5DC0B 1QXKA 5DF6A 4GS0A 1G4WR 1O4LA 4H34A 2MRJA 1YGRA 2C46A 1EENA 2H4VA 1CWDL 1RJAA 1O41A 1YN9A 1XA6A 1FBZA 4L1BB 2GE9A 2CFVA 2AUGA 1A1EA 1ZZWA 1XM2A 3O4TA 4FL2A 1BF5A 2CNEA 3V0HA 1PXHA 5KAAA 4K11A 3QCLA 1KC2A 1PA9A 3OB2B 4D3RA 2GJTA 2B49A 2CMCA 2IZVA 2F71A 2HC2A 1T4JA 1M27A 2CI8A 1I9SA 1JLNA 1OO4A 1LUIA 3VRPA 1T48A 2M3VA 1RPYA 3CD3A 1CWEA 2MC1A 3HCKA 1O4IA 1BKLA 4OHLA 2ESBA 2Q05A 3GXHA 3V0DA 2LQNA 3PSKA 1GWZA 1O48A 1XBOA 1D4WA 4F59A 2B4PA 4ERCA 3C7IA 4E68A 3PSJA 5AULA 2Y1NA 1C84A 5K9VA 3OB1B 4JGHA 1I57A 2H46E 2VEVA 2RVFA 2DX0A 3AWEA 1ONYA 5AWXA 2PNBA 1ZCLA 1U26A 2EL8A 3PLFB 1C87A 2I6JA 3BUNB 5BX1A 3OP0A 1R6HA 1B47A 1O45A 3BKBA 2H4GA 3K2MA 3V0GA 1QCFA 3BUOB 3QCGA 2QBQA 3AWFA 1BKMA 1AOTF 1G1HA 1AAXA 2GP0A 2QBPA 2CRHA 3V0EA 2PLDA 3ZM0A 4RHGA 3MOWA 1P15A 2G6ZA 3QCFA 4U17A 3VRRA 2HUWA 3S8OA 2H4KA 2NTAA 3NMEA 4MBBA 1X24A 3GXXA 2CM8A 3OMHA 4K44A 1O4OA 1BM2A 1Q6PA 1OO3A 1OESA 3MOZA 4QSYA 1FBVA 2EKXA 4D3PA 1AYBA 2I3UA 4GL9E 4ROJA 2WGPA 5EHPA 2CNHA 2CBLA 1G7GA 1Z3KA 2HDXA 1CSYA 2H04A 3MXYA 4HRFA 2PT0A 1O4RA 3VGOA 4F5AA 1O49A 3A5JA 2L4KA 2EO6A 1BMBA 5KA4A 3ZM3A 1YFOA 3CXLA 1O4AA 2DM0A 1O4PA 2PSZA 5LXQB 3BLUA 4WOHA 4LUEA 2RF6A 3VS3A 1O4QA 3O3LA 1SPSA 5BUGA 1FMKA 2CMBA 2KK6A 4OHEA 3UF4A 4OHIA 5GJIA 3BUWB 1BHHA 1NO6A 1T49A 2VEYA 4Z6BA 4D3QA 4GFUA 2F6TA 1TCEA 2SRCA 2F70A 3ZM2A 1UUSA 1Q6TA 4LUDA 1O4KA 2CM2A 3B7OA 1O4MA 1AOUF 1BZHA 1HCTB 4M4ZA 3LJ8A 3QWXX 1O43A 2BV5A 2CMAA 1IS0A 1YWFA 3VRYA 2DXPA 1OPKA 2MK2A 2HNPA 4QAPA 1EEOA 4FL3A 3OV1A 2HVLA 1XXPA 2JJDA 1UURA 2CS0A 1PTVA 2EU0A 1RQQC 5J8RA 1Y57A 5K23A 1YTNA 5HDEA 4H1OA 2QCJA 2Y2FA 1OPLA 4P9ZA 1L8KA 2H8HA 3SR9A 3RZ2A 1OETA 2I3RA 1KAKA 1BLKA 1FHSA 2I6MA 1YTSA 3S8LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1O4BA 1GRIA 1A5YA 2PBNA 2BIJA 2IUGA 3KFJA 4GE5A 5KA1A 3VS5A 1D1ZA 3PQZA 3ZMQA 3BLTA 3F9AA 1O4HA 3NHNA 2FH7A 1JYQA 1SUGA 3LK7A 5BZZA 2OUDA 2G59A 3MAZA 5I6VA 1G1FA 1WQUA 2NT2A 1GFYA 3V0FA 1YTWA 3ZMPA 2QEPA 2UAGA 4NX8A 5M43A 1WAXA 1AYCA 2PTKA 4CVKA 4P9VA 4B04A 4WWQA 1GHUA 2HXPA 2ABLA 2UUOA 1NZLA 3LYVA 3VS2A 2I5XA 2PI7A 4ZI4A 2MBCA 2EYVA 4NNDA 3T04A 1A1BA 2LCTA 1LCKA 1X6CA 1AD5A 4U1PA 1LQFA 1O46A 1P31A 5K22A 5GJHA 3GQIB 3VS1A 2H02A 1NWLA 4BJOA 1SHDA 1Q6MA 1TZEE 2LNWA 1IJRA 2MQIA 2B4UA 1OHCA 2QDMA 4GE6A 4E93A 2RSYA 1AYAA 2K7AB 2F46A 2ZN7A 4K45A 3HIZB 2P6XA 3QCCA 1A09A 4CVMA 1SKJA 1ONZA 3O5XA 4AZ1A 5HKZA 2C0IA 5BZXA 3TKZA 3MVNA 3ZL8A 2I6IA 3S3HA 1LCJA 3VRZA 3QCBA 2HCMA 4EY0A 2EO3A 2A3KA 2Y3AB 1OHDA 2GC6A 4GE2A 1P13A 3MXCA 1GG4A 4GRYA 2EYZA 1XXVA 2P4DA 1NL9A 4TVVA 4KYQA 1LUNA 4R0SA 5EG3B 1KA6A 3EZZA 1LARA 3O4UA 5KA0A 2R0BA 1KA7A 2Y96A 5EHRA 1J6UA 1WCHA 1A07A 2CM3A 2PNAA 3GXGA 1ZFPE 2IMGA 4F5BA 2KGYA 4A4CA 5HKYA 1RXDA 1JU5A 2C0TA 1G83A 1HCSB 3IN8A 2L3TA 2BGDA 2ZMMA 1PTUA 2Y1MA 1AB2A 2F6ZA 2XJAA 4QBWA 1OEUA 1O4DA 4R30A 1O4JA 2JFFA 1X0NA 1U24A 3S4EA 3N0AA 2QBRA 1I3ZA 2Q47A 3GXWA 3F9BA 4GWFA 1LUMA 1A1AA 4FBNA 3UYOA 2CNIA 1L8GA 4IKCA 3BUMB 2HC1A 4HJQA 2RORA 1O47A 1FPRA 2HY3A 3VS6A 4NWFA 2QDPA 3EAXA 1F2FA 4C12A 2VIFA 1VHRA 1O5ZA 3S8NA 2AOBA 1XRIA 3D1OA 3S3EA 2I4EA 2EYYA 2OOQA 1LKLA 1JF7A 1A81A 1PYNA 1Q6JA 2HCKA 3QCKA 1YPTA 2CI9A 2F6WA 1O44A 4JEGA 2DLYA 2K79B 2QDCA 5J3XA 4HJPA 3CM3A 2C9WA 1FU5A 1G4US 3PJPA 3QKQA 2UUPA 4I8NA 2I4HA 3ZM1A 3ZV2A 2LRAA 2FJMA 4RDDA 1CSZA 3VRQA 1OEVA 3BRHA 1SHBA 5KA2A 3CWGA 5MMZB 1NWEA 1MKPA 1ZCKA 4PYHA 1OEOX 5KA9A 2FCIA 3IMDA 1X27A 1LKKA 3RO1A 4BPCA 1AYDA 5KACA 4QDIA 1V3AA 4WU3A 2VEXA 2PLEA 4X6SA 5DC9A 3I7ZA 5EEQA 2WTZA 1MW4A 1U25A 2HMHA 2L6KA 2J16B 3O4SA 4RKKA 1QADA 4QF5A 1WRMA 3QCEA 4YAAA 1Q6SA 3A5KA 4GPLB 2SHPA 1QZ0A 5KABA 2I1YA 1BHHB 3S3KA 2I4GA 1FU6A 5KA8A 3U96A 1RPMA 2J17A 1R1SA 1NRVA 3NRSA 2NLKA 4RI5A 3I36A 2NV5A 2AHSA 2B4SA 2GC5A 4EIHA 2C7SA 1PTYA 2QBSA 1M61A 2ETZA 5EELA 1G7FA 2YU7A 3EMUA 3QCNA 5IBMA 4JMJA 3ZM5A 4ZN5A 1SPRA 2BBUA 1ZC0A 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 1PTV A;  2EU0 A;  1RQQ C;  5J8R A;  1Y57 A;  5K23 A;  1YTN A;  5HDE A;  4H1O A;  2QCJ A;  2Y2F A;  1OPL A;  4P9Z A;  1L8K A;  2H8H A;  3SR9 A;  3RZ2 A;  1OET A;  2I3R A;  1KAK A;  1BLK A;  1FHS A;  2I6M A;  1YTS A;  3S8L A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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