The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
145
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sequence length |
516
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structure length |
480
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Chain Sequence |
NINDLKLTLSKAGQEHLLRFWNELEEAQQVELYAELQAMNFEELNFFFQKAIEGFRMEPVPREVLGSATRDQDQLQAWESEGLFQISQNKVAVLLLAGGQVAYPKGMYDVGLPSRKTLFQIQAERILKLQQVAEKYYGNKCIIPWYIMTSGRTMESTKEFFTKHKYFGLKKENVIFFQQGMLPAMSFDGKIILEEKNKVSMAPDGNGGLYRALAAQNIVEDMEQRGIWSIHVYCVDNILVKVADPRFIGFCIQKGADCGAKVVEKTNPTEPVGVVCRVDGVYQVVEYSEISLATAQKRSSDGRLLFNAGNIANHFFTVPFLRDVVNVYEPQLQHHVAQKKIPYVDTQGQLIKPDKPNGIKMEKFVFDIFQFAKKFVVYEVLREDEFSPLKNADSQNGKDNPTTARHALMSLHHCWVLNAGGHFIDENGSRLPAIPRSATVPIQCEISPLISYAGEGLESYVADKEFHAPLIIDENGVHEL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structures of two human pyrophosphorylase isoforms in complexes with UDPGlc(Gal)NAc: role of the alternatively spliced insert in the enzyme oligomeric assembly and active site architecture.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
UDPGLCNAC PYROPHOSPHORYLASE (AGX2)
|
| total genus |
145
|
| structure length |
480
|
| sequence length |
516
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
2.7.7.23: UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase. |
| pdb deposition date | 2001-08-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01704 | UDPGP | UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases | ||
| Alpha Beta | Alpha-Beta Complex | Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A | Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2OI7 A; 2I5K A; 2Z86 A; 4KPX A; 1R7V A; 1G9R A; 4FRQ A; 1H7H A; 1ZI4 A; 1O23 B; 5C47 A; 1R82 A; 3SXB A; 2VXM A; 1KWS A; 1NF5 B; 3RMV A; 3V0N A; 3OC9 A; 3ST8 A; 4DDZ A; 2ICY A; 3F1Y A; 1JV3 A; 1R80 A; 4YS8 A; 3I0C A; 3USQ A; 2RIY A; 4B42 A; 1H5S D; 1ZCU A; 4KNX A; 5FV9 A; 1OMZ A; 5CQM X; 4MYB A; 3POL A; 4M2A A; 3IOI A; 2RJ9 A; 2V0K A; 2VS5 A; 2AH9 A; 3V0L A; 2OI6 A; 1VGT A; 3D8V A; 2PGY A; 4XWI A; 4B4G A; 4B5B A; 4M2B A; 1NMM B; 4HCQ A; 5C1L A; 3I0K A; 3QVB A; 1H5S B; 4G3Q A; 3V8Z A; 5C4B A; 1FWY A; 2ICX A; 4NAK A; 3D5N A; 3JTJ A; 1FG5 N; 4BQH A; 1OQM B; 4NAI A; 3EE5 A; 1MC3 A; 2QKX A; 2AM5 A; 2Y7A A; 3CKO A; 4HO4 A; 3FOQ A; 1R7Y A; 3V0M A; 1O7O A; 2YC3 A; 2FY7 A; 1ZJ0 A; 3RSB A; 2MZB A; 4CJB A; 4ARW A; 5FU8 A; 4KC2 A; 1H5T B; 1ZCY A; 2FYD B; 2FYB A; 3OH4 A; 1IIM A; 1VGZ A; 1WT1 A; 2E3D A; 4ZDQ A; 4K6R A; 5IDS A; 4FRP A; 5CQP A; 2XMH A; 1FR9 A; 2QGI A; 2RJ1 A; 1E5K A; 4KRV A; 3Q4S A; 4HO3 A; 2GGO A; 1YRO B; 1XZ6 A; 1NHE B; 3NGW A; 1S4O A; 1FZW A; 2O1F A; 4FRM A; 5CMF X; 2AEC A; 3BCV A; 5BXC A; 3SXC A; 3U2V A; 1H4C A; 5CMJ A; 1LZJ A; 1S4N A; 1V82 A; 2YQH A; 1O7Q A; 1G23 A; 1HJL A; 1G97 A; 2W0V A; 2V0J A; 4GBP A; 1MP3 A; 5CQN X; 4EE5 A; 4B3U A; 1H7G A; 1TW5 A; 1VZT A; 1NKH B; 1H7L A; 2AES A; 1ZHJ A; 3IOJ A; 1G95 A; 1VGU A; 5C3D A; 5AJN A; 3V0Q A; 2AGD A; 3V91 A; 4AAW A; 4HOC A; 5J49 A; 2PGV A; 3CKQ A; 2BO4 A; 4FCE A; 4HO6 A; 5EIY A; 1GX4 A; 1VZU A; 3U0Y A; 2ZU9 A; 4P02 A; 2DPW A; 5HS2 A; 1TW1 A; 4D11 A; 2JCK A; 3T7O A; 3DJ4 A; 4Y9X A; 4D48 A; 2WE9 A; 3I0D A; 4Y64 A; 3SX5 A; 3N9W A; 3PKQ A; 4M4K A; 5FTV A; 1H4E A; 3CGX A; 4E1K A; 1LZI A; 1H5T A; 1ZI3 A; 3GUE A; 3SX7 A; 3ZF8 A; 1W57 A; 1QWJ A; 4G3P A; 3OAM A; 3SXA A; 2AM4 A; 3OGZ A; 1EZI A; 4UEG A; 2V0L A; 2Y4M A; 5C1H A; 3PNN A; 1SS9 A; 1ZJ3 A; 4AYL A; 1LVW A; 4CJ8 A; 1G8O A; 3CU0 A; 5C4E A; 1GQC A; 1QGQ A; 3LW6 A; 5C1G A; 4B2W A; 4ECM A; 1Z90 A; 4B4B A; 4KQL A; 1H4D A; 5AJP A; 2OI5 A; 4EEO A; 4JIS A; 1TVY A; 1W77 A; 3Q7U A; 5EJZ A; 4FRE A; 3PKP A; 1H7T A; 1YP4 A; 1R7T A; 2A8W A; 2P72 A; 2XME A; 4HG6 A; 3K8D A; 2WVL A; 3I0J A; 1S4P A; 3R3I A; 1MP5 A; 2Y4L A; 1JVD A; 4ASY A; 5CQL X; 3CKV A; 3E26 A; 3F1C A; 5IDT A; 1FOA A; 1JVG A; 4B4M A; 1H5R B; 2OEG A; 2WGZ A; 5C49 A; 1PZY B; 2V0H A; 3U2U A; 2WVK A; 5DDT A; 4KXO A; 1YP3 A; 1FRW A; 2X5S A; 2VSI A; 3I0E A; 2RJ0 A; 3ZGG A; 2RIT A; 1V83 A; 2AM3 A; 4Y6U A; 3OH3 A; 4NAL A; 2NXV A; 1R7U A; 2XWN A; 3BRK X; 4FRD A; 4AC3 A; 5FU0 A; 5C36 A; 4MND A; 3I0I X; 1ON8 A; 4IRQ A; 4ASJ A; 2VD4 A; 5FYE A; 2P6W A; 5C8R A; 1VGW A; 4KC1 A; 2E8B A; 2PA4 A; 2Y4K A; 4HO9 A; 4IRP A; 2WEE A; 3V8Y A; 1ZJ1 A; 1H7F A; 2PX7 A; 4EE4 A; 4FQW A; 4Y63 A; 1WT2 A; 2RIX A; 1LL3 A; 5CQO A; 5CMG X; 3O3P A; 2WAW A; 1NWG B; 3TQD A; 1G3L A; 4KC4 A; 1INI A; 4J18 A; 4KT7 A; 3ZLL A; 5CMH A; 4DEC A; 5C4C A; 1R81 A; 2VS4 A; 4B2X A; 1ZDG A; 3OH2 A; 5IFY A; 1VM8 A; 2Y6P A; 1HM9 A; 3V90 A; 3FWW A; 3E25 A; 3IOH A; 1G1L A; 4LW6 A; 1H3M A; 5AJO A; 3I0H A; 2VS3 A; 1ZDF A; 4JD0 A; 2X5Z A; 1LZ0 A; 2V0I A; 2W0W A; 1H5S A; 2X60 A; 4M28 A; 4CJC A; 2XWM A; 3TZT A; 3OKR A; 2YQS A; 4Y7G A; 1YP2 A; 1FXJ A; 2Z87 A; 5FTS A; 1G0R A; 1ZI1 A; 3I0G A; 1OMX A; 1HM8 A; 4EEM A; 5DDV A; 3OH0 A; 1VZX A; 1JYK A; 4BMA A; 1ZJP A; 1H5S C; 3R2W A; 1H7Q A; 3DUV A; 4G3S A; 1QG8 A; 4G87 A; 3SXG A; 4KPZ A; 4EEG A; 2FYA A; 2A8U A; 1VH3 A; 4Y7U A; 4D11 C; 2X65 A; 2Y4J A; 2O1H A; 4EEA A; 1JYL A; 1TZF A; 3D98 A; 4R7P A; 3KIA A; 3U2W A; 2UX8 A; 4Y7T A; 3SX3 A; 1HJJ A; 1INJ A; 1ZJO A; 2Q4J A; 3CKN A; 4FRA A; 4D0T A; 5C4D A; 1LZ7 A; 5C4F A; 2FYC B; 3RMW A; 2APC A; 1HM0 A; 3JUK A; 4Y6N A; 3U2T A; 4LW3 A; 4HO5 A; 3ZLK A; 3SXD A; 1FGG A; 1GQ9 A; 2YCM A; 1MP4 A; 3ZGF A; 1VPA A; 4EE3 A; 1PZT A; 3K8E A; 4AYJ A; 2FFV A; 1O0R A; 1IIN A; 1FR8 A; 4FRO A; 2RJ4 A; 5C3A A; 3SPT A; 1R7X A; 1ON6 A; 2YC5 A; 2VSH A; 2I5E A; 1ZCV A; 2D0J A; 4HO0 A; 4NAN A; 1WT0 A; 1WT3 A; 2OEF A; 4L41 C; 3OH1 A; 3V0P A; 4CVH A; 3SX8 A; 1HV9 A; 2I7B A; 3U2X A; 1FXO A; 4KNR A; 2XWL A; 4D0Z A; 2BO6 A; 1H7E A; 2D7R A; 4FRB A; 2RJ8 A; 5L6V A; 4P00 A; 5JQQ A; 1FGX A; 1XHB A; 1LL2 A; 2P73 A; 3USR A; 3I0F A; 1QGS A; 2VFZ A; 1WVC A; 1GWV A; 2BO7 A; 3T7N A; 1WSZ A; 1ZIZ A; 1G93 A; 1NQI B; 3I0L A; 1ZJ2 A; 1K4V A; 2ZU8 A; 3V0O A; 2YQC A; 2D7I A; 2WVM A; 5L6S A; 1ZI5 A; 2AE7 A; 1EYR A; 2RIZ A; 3CKJ A; 1GWW A; 2RJ6 A; 5FUH A; 5I1F A; 1JV1 A; 4HO8 A; 4Y7V A; 3T7M A; 2RJ5 A; 5CMI A; 5C3B A; 5C48 A; 2O1G A; 2JCO A; 1GA8 A; 4Y62 A; 4EVW A; 3SXE A; 4DE7 A; 1V84 A; 2JCL A; 2RJ7 A; 2YES A; 2BO8 A; 2JCJ A; 1G2V A; 1GX0 A; 4Y7F A; 3Q80 A; 3U0X A; 1FO9 A; 1LL0 A; 4FRH A; 5C38 A; 5EJ1 A; 3DK5 A; 1I52 A; 2ZU7 A; 2FFU A; 1VIC A; 2YQJ A; 2VXL A; 2CU2 A; 1H5R A; 3HL3 A; 1FO8 A; 4HO2 A; 4C2S A; 2GGQ A; 3JUJ A; 4FRL A; 1VH1 A; 1ZCT A; 1W55 A; 2QH5 A; 4FCU A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2OI7 A; 2I5K A; 2Z86 A; 4KPX A; 1R7V A; 1G9R A; 4FRQ A; 1H7H A; 1ZI4 A; 1O23 B; 5C47 A; 1R82 A; 3SXB A; 2VXM A; 1KWS A; 1NF5 B; 3RMV A; 3V0N A; 3OC9 A; 3ST8 A; 4DDZ A; 2ICY A; 3F1Y A; 1JV3 A; 1R80 A; 4YS8 A; 3I0C A; 3USQ A; 2RIY A; 4B42 A; 3G6J B; 4MIX A; 4O6N A; 1H5S D; 2PN5 A; 1ZCU A; 4KNX A; 5FV9 A; 5JPM A; 1OMZ A; 5CQM X; 4MYB A; 3POL A; 4M2A A; 3IOI A; 2RJ9 A; 2V0K A; 2VS5 A; 2AH9 A; 3V0L A; 2OI6 A; 1VGT A; 3D8V A; 2PGY A; 4XWI A; 4B4G A; 4B5B A; 4FXK A; 4M2B A; 5D91 A; 1NMM B; 2MHG A; 4HCQ A; 5C1L A; 3I0K A; 3QVB A; 1H5S B; 4G3Q A; 3V8Z A; 5C4B A; 1FWY A; 2ICX A; 4NAK A; 3D5N A; 3JTJ A; 1FG5 N; 4BQH A; 1OQM B; 4NAI A; 3EE5 A; 1MC3 A; 4FXG B; 2QKX A; 2AM5 A; 2Y7A A; 3CKO A; 4HO4 A; 3FOQ A; 1R7Y A; 5FO7 B; 3V0M A; 1O7O A; 2YC3 A; 3PFG A; 1ZJ0 A; 2FY7 A; 3RSB A; 2MZB A; 4CJB A; 4ARW A; 5FU8 A; 4KC2 A; 1H5T B; 1ZCY A; 2FYD B; 2FYB A; 3OH4 A; 1IIM A; 1VGZ A; 1WT1 A; 2E3D A; 4ZDQ A; 4K6R A; 5IDS A; 4FRP A; 5CQP A; 2XMH A; 1FR9 A; 2QGI A; 2RJ1 A; 1E5K A; 4KRV A; 3Q4S A; 4HO3 A; 2GGO A; 1YRO B; 1XZ6 A; 1NHE B; 3NGW A; 1S4O A; 1FZW A; 2O1F A; 4FRM A; 5CMF X; 2AEC A; 3BCV A; 5BXC A; 3SXC A; 3U2V A; 1H4C A; 5CMJ A; 1LZJ A; 1S4N A; 1V82 A; 2YQH A; 1O7Q A; 1G23 A; 2OYR A; 1HJL A; 1G97 A; 2W0V A; 2V0J A; 4GBP A; 1MP3 A; 5CQN X; 4EE5 A; 4B3U A; 1H7G A; 4OQD A; 1TW5 A; 1VZT A; 1NKH B; 1H7L A; 4O6M A; 3PX3 A; 2AES A; 1ZHJ A; 3IOJ A; 1G95 A; 1VGU A; 5C3D A; 5AJN A; 3V0Q A; 2AGD A; 3V91 A; 4AAW A; 4HOC A; 5J49 A; 2PGV A; 4Q7C A; 3CKQ A; 2BO4 A; 4FCE A; 4HO6 A; 5EIY A; 1GX4 A; 1VZU A; 3U0Y A; 2ZU9 A; 4P02 A; 2DPW A; 3HRZ B; 5HS2 A; 1TW1 A; 4D11 A; 4FXG A; 2JCK A; 3T7O A; 3DJ4 A; 4Y9X A; 4D48 A; 5JTW A; 2WE9 A; 3I0D A; 4Y64 A; 3SX5 A; 3N9W A; 3PKQ A; 4M4K A; 5FTV A; 1H4E A; 3CGX A; 4E1K A; 1LZI A; 1H5T A; 1ZI3 A; 3PFH A; 3GUE A; 3SX7 A; 3ZF8 A; 2J0B A; 1W57 A; 1QWJ A; 2I07 B; 4G3P A; 3OAM A; 3SXA A; 3FRP G; 2AM4 A; 5FO9 B; 3OGZ A; 1EZI A; 2A74 B; 4UEG A; 2V0L A; 2Y4M A; 5C1H A; 2C0N A; 3PNN A; 1SS9 A; 1ZJ3 A; 4AYL A; 4FIX A; 1LVW A; 4CJ8 A; 1G8O A; 3CU0 A; 5C4E A; 1GQC A; 1QGQ A; 3LW6 A; 5C1G A; 4B2W A; 4ECM A; 1Z90 A; 4B4B A; 4KQL A; 1H4D A; 5AJP A; 4FIY A; 2OI5 A; 4EEO A; 4JIS A; 1TVY A; 1W77 A; 3Q7U A; 5EJZ A; 4FRE A; 3PKP A; 2WIN B; 1H7T A; 1YP4 A; 1R7T A; 2A8W A; 2P72 A; 2XME A; 4HG6 A; 3K8D A; 2WVL A; 3I0J A; 1S4P A; 3R3I A; 1MP5 A; 2Y4L A; 1JVD A; 4ASY A; 5CQL X; 3CKV A; 3E26 A; 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