4D0ZA

Galnac-t2 crystal soaked with udp-5sgalnac, mea2 and manganese (higher resolution dataset)
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
495
structure length
495
Chain Sequence
b'KVRWPDFNQEAYVGGTMVRSGQDPYARNKFNQVESDKLRMDRAIPDTRHDQCQRKQWRVDLPATSVVITFHNEARSALLRTVVSVLKKSPPHLIKEIILVDDYSNDPEDGALLGKIEKVRVLRNDRREGLMRSRVRGADAAQAKVLTFLDSHCECNEHWLEPLLERVAEDRTRVVSPIIDVINMDNFQYVGASADLKGGFDWNLVFKWDYMTPEQRRSRQGNPVAPIKTPMIAGGLFVMDKFYFEELGKYDMMMDVWGGENLEISFRVWQCGGSLEIIPCSRVGHVFRKQHPYTFPGGSGTVFARNTRRAAEVWMDEYKNFYYAAVPSARNVPYGNIQSRLELRKKLSCKPFKWYLENVYPELRVPDHQDIAFGALQQGTNCLDTLGHFADGVVGVYECHNAGGNQEWALTKEKSVKHMDLCLTVVDRAPGSLIKLQGCREDDSRQKWEQIEGNSKLRHVGSNLCLDSRTAKSGGLSVEVCGPALSQQWKFTLNL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords POLYPEPTIDE N-ACETYLGALACTOSAMINYLTRANSFERASE 2
publication title Substrate-Guided Front-Face Reaction Revealed by Combined Structural Snapshots and Metadynamics for the Polypeptide N- Acetylgalactosaminyltransferase 2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/peptide
total genus 164
structure length 495
sequence length 495
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.4.1.41: Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase.
pdb deposition date 2014-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00535 Glycos_transf_2 Glycosyl transferase family 2
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4d0zA02
3.90.550.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A 4d0zA01
1Z0HA 2JCLA 3OH3A 4F34A 1V6UA 3OJVA 2BO4A 3A07A 1GX4A 2Y6PA 3CKNA 1DFQA 2AM4A 3I0LA 3Q7YA 2ICXA 5EJ1A 1H7TA 4LO2C 1R80A 3AKIA 1ON6A 5CMFX 4A7KA 1H5SD 1HWNB 1BFGA 4I6IA 1CE7B 2ESUA 3VT2A 3WINC 9ILBA 2BEAA 2BO6A 4Y62A 3K8DA 4J2XA 5BXRA 4DDZA 2FDBM 4P0KA 4I3NA 1VM8A 4FQWA 5J49A 1GQ9A 1YP2A 1V6WA 3H6QA 1MC3A 2RJ1A 4I4VA 2Q3NB 3HOMA 2VLCA 3O4BA 2X60A 5C4EA 4JQ0A 2QKXA 3CRHA 3EF2A 3OH1A 1HV9A 3JUKA 4BQHA 1VH1A 3QR5A 1DLLA 1PWAA 3O4OA 4EB2B 3V0LA 4Y7GA 3CU1B 3SXAA 4I4OA 3AZWA 1GWVA 3UD8A 1H4DA 3CA1A 1R8NA 1QXMA 4ZA3B 1LZ7A 2OI5A 3POLA 2J3PA 4I4PA 4D48A 1VZTA 2Y9XE 1NZKA 4I4UA 4LO3A 4QKRA 1XHBA 5F8SA 5FYEA 3W9TA 3IOHA 2E8BA 3BCVA 1YROB 4KNXA 3U0YA 2R9KB 1FWYA 2I5KA 5IDSA 1FO8A 4D0ZA 3N7LA 2APCA 1HWOB 4E1KA 3F1CA 1AVWB 3FFZA 3FWWA 4FCEA 5AJNA 4H9WA 4IONA 4R6UB 3UD9A 4DCKC 2RJ0A 2ZU9A 3I0HA 4FRDA 3ILAA 3CA6A 2XWLA 1QQLA 4F83A 1AF9A 1LZIA 2ERMA 4AN6A 5DUYA 1G2VA 2RIYA 4IZXA 3TZTA 1FWUA 1ISVA 2A8UA 1BLAA 4B4GA 1WD4A 4I96A 5C1LA 4L4HA 4I37A 4P02A 1N4KA 5CMJA 1S4OA 3RSJA 3SXGA 4I4SA 1G97A 2GGOA 1NQIB 1ZJPA 1R7XA 3BAVA 4HOCA 2YQSA 4IHZA 3SXEA 3D7WB 5FTSA 1FOAA 4FRLA 4IY8A 1ZI1A 4DE7A 1R81A 1W55A 4I0YA 3OGGA 2E4MC 4JP0A 1WSZA 4NANA 3A22A 1VH3A 2V0LA 3E25A 5IFYA 3I0IX 4I4XA 1XG6A 4I8MA 3T7NA 3QVBA 3T7OA 3WO4A 4M28A 1ZCYA 2HZ9A 2D1ZA 3IM6A 2BFHA 3FJ8A 4QD2B 1TOOA 1E0OA 1EZIA 3OGZA 2M49A 4GP3A 4I2SA 4JRAA 2VXLA 5FNWA 1G9BA 2GGQA 1IINA 1EYRA 5FU0A 5C1HA 4B3UA 4G1RA 2WEEA 1G1LA 4ARWA 5L6SA 4IQPA 2NXVA 2Z48A 3BA7A 2NM1A 2DRYA 3H6RA 1G9DA 2AM5A 2VFZA 3DUVA 4GOYA 4Y7VA 1ZJOA 2KI4A 2NP0A 2XOAA 1INIA 5CQMX 1S4NA 1Z4SA 2NVHA 3FJEA 3V8ZA 5CMGX 2KI6B 3ST8A 3SPTA 4CJBA 1E5KA 1VICA 2V0HA 1G9RA 4AYLA 1HM9A 5CQPA 4Q9PA 1WBCA 1AXMA 3RMXA 4FVVA 3OKRA 4EEEB 2Y7AA 2VXMA 3V0QA 1DFCA 2FYDB 3DJ4A 3O49A 4ISRA 4OUJA 1TP0A 4ZFUB 5I1BA 2I7BA 2V0JA 5CMHA 3V0NA 2AECA 1S0CA 5CQOA 3U2WA 1JYLA 2UUSA 1K5VA 2VSHA 5D61A 2Q9XA 1FRWA 4MNDA 3FJAA 5F8WA 4JISA 4ASYA 7I1BA 1EYLA 5C3AA 1FWVA 4J2SA 2VSAA 1LZ0A 3HBWA 1A8DA 3UJ4A 3V0OA 3AJ6A 2DPWA 2Z87A 3RMWA 3SX8A 2OI6A 4G9NA 3JRRA 3SX7A 2VU9A 4FROA 5AJOA 1HJJA 4FRQA 4OEGA 1H4EA 1HJLA 1PC8B 3MPPG 4G6MA 5EHAA 4TLPA 5G00A 1H4CA 4QC4A 1FV2A 1HKNA 3F1RA 1MP3A 2HWAA 1L2HA 1FO9A 3S8KA 3U2TA 3HALA 1RZOB 2WVLA 4Y6NA 3PKPA 5C8RA 3OBRA 1GGPB 1ZI3A 1DZDA 2Y9WC 2YQJA 1AVAC 4LO1A 3V0BB 4Q91A 2Q4JA 3IOIA 4P0LA 3AKGA 3LLPA 4QD2C 4XKIA 1QGSA 1VPAA 3JUJA 1HCDA 3FUOA 4OWKA 4G3QA 4CJ8A 1VGUA 4G3PA 3U2XA 5DVHA 2AXMA 1O23B 3I0KA 1VZXA 1JTCA 1FXOA 2FYAA 2RIZA 2P39A 4GOVA 2PGYA 4Y7FA 5FU8A 1II4A 1JVGA 5BOWA 5C38A 3ZXDA 3BAHA 3CQAA 4HO9A 4X38A 4L41C 1BFBA 1ILR1 4AN7B 3N7JA 1R7UA 2RSTA 2V0IA 3FOQA 4ENDA 6I1BA 4B2XA 2F8XC 4JKXB 1WT2A 1QGQA 1O0RA 2W0WA 4B5BA 2D22A 4HA2A 3H6RB 2JCOA 1V6XA 1QQKA 3D8VA 3BB2A 4KT7A 4ZFWB 4FREA 2GZBA 4LO3C 4EFPA 5C47A 2X2TA 2I1BA 3D98A 3U0XA 3FJFA 4Z9WB 3HMYA 2D24A 1ISZA 3O4AA 2LIEA 3C9ZA 3WO2A 2PGVA 3PKQA 4M2BA 3O4CA 1FGAA 4HR6C 3ZC9A 4ZBVB 4XFTA 4D0TA 2BO8A 2RJ6A 2W0VA 4K6RA 1MD6A 1OMXA 1VGZA 4EFQA 4FRPA 4HO0A 1KNMA 3IIRA 1S0DA 2NTDA 3VWCA 3KMVA 4J2YA 4EKXB 2RJ9A 2XMEA 5I1FA 4OWJA 3WA1A 4Q9GA 5BQUC 4KEKA 4QALA 2P72A 1IT0A 4Y6UA 4I4QA 1AVXB 5HPZA 1V83A 3N7MA 5C1GA 1IRPA 1Q1UA 1MP5A 1TIEA 3RMVA 2PA4A 4CVHA 4JD0A 2ZU8A 1HCEA 4D11A 1BLDA 2YESA 1ISXA 2FFVA 1S0EA 3FJBA 1O7OA 2RJ7A 5FTVA 2ZQNA 1G93A 1ABRB 2Y4MA 4NALA 3O4DA 1V6VA 3CA3A 3WINA 4CJCA 1WVCA 3CKOA 1WT0A 2Y4KA 3E26A 1OMZA 3SXBA 3VSFA 3O3PA 5BP5A 2OEFA 2K4AB 1BFCA 4KXOA 3I0DA 5HS2A 1R82A 3I2XA 5BXPA 2RJ8A 1R8OA 1RG8A 1NMMB 1DQGA 5JMCA 1FZWA 4IRPA 2FGFA 5CMIA 3CRGA 1I1EA 2OI7A 1EV2A 1G95A 1DIWA 3BRDA 4J23B 1H7QA 3CA4A 1JT3A 3NBEA 4UEGA 4YS8A 3CAHA 1INJA 1GX0A 1LL2A 3CKJA 3I0GA 4M4KA 1TWMA 4FRBA 2AAIB 3FJIA 1FMMS 5FZZA 1WT3A 2QH5A 3I0FA 4LW3A 4ZKTB 2KH2A 4B2WA 4G3SA 2X65A 1O7QA 3BADA 1IHKA 1I52A 3AH4A 5L6VA 2F2FA 2YC5A 4ECMA 1R7TA 1VZUA 4BMAA 1H7FA 1ITBA 5C36A 1SR4A 3AZVA 1RY7A 1YP3A 5C3BA 1G82A 1TTUA 2QN4A 4JKQA 3OC9A 2NZ9A 4LO0C 3UD7A 3ZGGA 3ZGFA 4II0A 4ASJA 1UPSA 3H6SE 4M2AA 3CKQA 1CVSA 3FJ9A 3PUBA 4OEFA 2WE9A 4Z8SB 4I4YA 2QGIA 4AAWA 3NBDA 2VSEA 2VUAA 1IRAX 2WVMA 1FGXA 3OJ2A 1AFCA 1J0SA 4IZEA 5JLVA 2I5EA 3JTJA 3ZLKA 4LO7B 1QWJA 2ET2A 3RTJB 1HM0A 3AJ5A 2O1FA 4GAIA 3P53A 3V79C 1FXJA 1ISYA 3V0MA 4HG6A 4JAWA 3U2UA 2LIQA 1FGGA 2VS3A 2AH9A 1OQMB 1TW5A 4KC2A 31BIA 5CQNX 2DS0A 1W3FA 2BEBA 5AJPA 2DREA 3BAOA 2FYBA 1FR8A 3FGMA 2RG9B 3SXCA 1IJTA 4LO1C 4C2SA 5C48A 3S8JA 1W3GA 3K8EA 1AVUA 2KKIA 4KRVA 4XWIA 3USQA 3ZX7A 3V0AA 5B2HA 5EJZA 1K5UA 4AC3A 1IILA 3R4UA 4YOLA 2BO7A 4X39A 2VD4A 1WBAA 3EE5A 3V91A 4OW4A 4KBBA 1MP4A 2VXTI 3NBCA 2L5XA 4HO5A 2VS4A 1Q03A 2MZBA 8I1BA 2D43A 3OGFA 3ZC8A 3WO3A 2V0KA 4HO6A 2VSIA 3A23A 4EEGA 1T4QA 1TWEA 4DEPA 2CU2A 1K4VA 4P00A 3FJJA 1BA7A 3LW6A 3ZXGA 1G23A 4G87A 2D7RA 4KPZA 4FCUA 3SNVA 2FY7A 3FJKA 3I2AA 4H04A 1S0GA 2ZR1B 3Q7WA 2D7IA 2X5ZA 3RSBA 5FUHA 5EC5A 3O44A 1TFMB 4D8HA 1W57A 2RQ9A 1ZCTA 4PC4A 1ZIZA 2YC3A 3OAMA 4A7ZA 3WMUA 4ZOTA 2Z86A 3OH4A 3UDAA 2WAWA 3CA5A 4QKSA 1S0FA 2WVKA 4USPA 5JQQA 1S0BA 4KC3A 1I1BA 4QO3A 2VXRA 1ZCUA 1ZDFA 2AE7A 4HO3A 3HSMA 3V90A 4LO7C 1HIBA 3V0PA 1ZJ1A 2RJ4A 1M2TB 3JUTA 1G8OA 1S0LA 1PUUB 1W77A 1YBIA 4EVWA 5EIYA 1YF8B 3F1YA 3CKVA 4KQLA 1OQLB 3R4SA 4HO8A 3MALA 3FJCA 1PZYB 3IM7A 2YCMA 1NHEB 1H5SA 2KLLA 1S4PA 4D11C 3CA0A 1MC9A 1ZI4A 1WT1A 1ZHJA 5FV9A 5BXCA 3I29B 3TC2A 5BXTA 2AGDA 4EFRA 1DJSB 3V8YA 5DDVA 3AH1A 3O3QA 3RTIB 1JT5A 1H5RA 3F62B 2UX8A 5BP5C 3OJMA 1RMLA 5BXSA 1DZCA 5D62A 1H5TA 5C4FA 2K43A 4Y7TA 1LL3A 1NKHB 1BASA 3HN1A 3SX5A 2VS5A 4AYJA 2HWMA 1GA8A 4KC4A 5F8YA 3IM5A 1NF5B 3D5NA 4FRHA 4KC1A 1JV1A 1FN0A 3Q4SA 1NUNA 3HL3A 2P23A 3PG0A 4GP0A 3I0CA 4LO2A 1D0HA 2YQCA 3OH2A 1VCLA 2XWMA 3V0AB 5FNXA 3ZF8A 3T7MA 4X37A 5FZUA 4HO4A 4NAKA 4EEAA 1YP4A 3T8SA 3FUQA 2JCJA 3WMVA 1KWSA 5C4DA 1EPWA 2D23A 2D0JA 4J18A 1ZCVA 1FQ9A 1JT7A 1JV3A 2NYYA 1R7VA 4KNRA 4LW6A 4G9MA 4WBCA 4GBPA 2MLLB 4IYBA 2IWTB 1YXWA 3CRIA 1QG8A 2F2FC 2E3DA 3SX3A 5GAQA 3K1XA 2RIXA 2ICYA 3BX1C 4QBCA 2AM3A 5C4BA 1SR4C 3E8LC 3N0KA 1ZDGA 1BFFA 3Q7XA 4FRMA 2QYIB 3OBTA 3P6IA 5D63A 2Y4JA 4Y64A 4EE4A 2ZQOA 4ZFYB 2OEGA 1JT4A 3FJDA 4EE5A 1G9CA 5BQUA 3AKFA 3BA4A 5DSSB 1ZJ0A 3IAGC 4OEEA 3PNNA 1VGWA 2Y9FA 5F90A 1HWPB 4I7IA 1PUMB 4XFUA 1VGTA 4B4BA 1JLYA 1JLXA 4LO8B 4L4IA 4ISQA 1W3AA 5CQLX 3NBNA 3Q80A 3BTAA 1LL0A 1TW1A 2P73A 2YQHA 1Z2VA 2Y4LA 3V0BA 2XWNA 2DRZA 2O1GA 2Y9GA 4B42A 4HJJA 4ZLBB 4Y9XA 4DECA 2WRYA 1IIMA 3LTQA 3BA5A 3PHZA 3POKA 4I1EA 1H5SB 3R3IA 2FFUA 1WD3A 4ZGRB 2WGZA 3DK5A 4XFSA 1LVWA 5E24E 4FRAA 2GO2A 4IRQA 3BRGC 3Q7UA 2RITA 1V84A 1H5RB 1H5TB 1EVTA 2MC2A 3N7KA 1G9AA 1FG5N 1YYNA 1XYFA 3NJ5A 1PZZA 1XZZA 3RMYA 1ZJ3A 4I4RA 1GWWA 3BRKX 3CGXA 2WBCA 1TVYA 4G6JA 1P63A 4CJMA 3TQDA 2MIBA 2E4MA 1JQZA 1JY0A 5DZUA 1R7YA 2X5SA 3GUEA 4HO2A 21BIA 3VT0A 3BAUA 1FV3A 1FMZA 5FZYA 1FR9A 3CU0A 4P0JA 5C4CA 3IOJA 1BARA 1T9FA 4OWLA 1SZ6B 4KEJA 4FGFA 5BVPI 3USRA 4Y7UA 4P6AA 1V82A 4EEOA 3SXDA 1HWMB 1Z90A 4ZDQA 4QBVA 3ZLLA 4B4MA 1NWGB 3N9WA 3R2WA 4Y63A 4EE3A 4GAFA 1H7EA 3VEQA 4LO0A 3OH0A 2A8WA 5DDTA 1ZJ2A 2AFGA 5IDTA 1G3LA 3VSZA 4A7YA 41BIA 1F31A 1HM8A 4J2KA 4NAIA 4KPXA 2O1HA 2ZU7A 1H7HA 4HCQA 1M16A 2XMHA 1Q04A 3PMEA 3I0JA 2D20A 1G0RA 3VUOA 3AH2A 1LZJA 1ISWA 5C49A 1DQOA 3VT1A 2YUGA 3NGWA 4MYBA 2JCKA 1PZTA 3B9UA 2RJ5A 1SS9A 2X2SA 4DENA 4R7PA 1H5SC 2Z49A 1TZFA 2PX7A 3O5WB 3BAQA 4EEMA 2FYCB 2AQZA 4I1BA 3BAGA 4IY9A 1ZI5A 2AESA 1YTOA 4USOA 3FJHA 2IHOA 2FO1A 1H7GA 1XZ6A 2K8RA 3U2VA 2D44A 3QYDA 3AKHA 5EG6C 3BRFA 1GQCA 3UJ0A 1JVDA 3I0EA 2HW9A 3P6JA 3KIAA 1IOBA 4JPZA 4KEIA 1ON8A 1JYKA 4X3AA 5C3DA 1H3MA 1ONKB 3A21A 2P6WA 1H7LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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