4D0TA

Galnac-t2 crystal soaked with udp-galnac, ea2 peptide and manganese
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
KVRWPDFNQEAYVGGTMVRSGQDPYARNKFNQVESDKLRMDRAIPDTRHDQCQRKQWRVDLPATSVVITFHNEARSALLRTVVSVLKKSPPHLIKEIILVDDYSNDPEDGALLGKIEKVRVLRNDRREGLMRSRVRGADAAQAKVLTFLDSHCECNEHWLEPLLERVAEDRTRVVSPIIDVINMDNFQYVGASADLKGGFDWNLVFKWDYMTPEQRRSRQGNPVAPIKTPMIAGGLFVMDKFYFEELGKYDMMMDVWGGENLEISFRVWQCGGSLEIIPCSRVGHVFRKQHPYTFPGGSGTVFARNTRRAAEVWMDEYKNFYYAAVPSARNVPYGNIQSRLELRKKLSCKPFKWYLENVYPELRVPDHQDIAFGALQQGTNCLDTLGHFADGVVGVYECHNAGGNQEWALTKEKSVKHMDLCLTVVDRAPGSLIKLQGCREDDSRQKWEQIEGNSKLRHVGSNLCLDSRTAKSGGLSVEVCGPALSQQWKFTLNLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords POLYPEPTIDE N-ACETYLGALACTOSAMINYLTRANSFERASE 2
publication title Substrate-Guided Front-Face Reaction Revealed by Combined Structural Snapshots and Metadynamics for the Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 167
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.4.1.41: Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase.
pdb deposition date 2014-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00535 Glycos_transf_2 Glycosyl transferase family 2
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4d0tA02
3.90.550.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A 4d0tA01
3O4CA 3WMVA 1IRPA 1ISYA 4JPZA 1JT5A 3V0AA 1JV3A 5BVPI 4X38A 4D0TA 1M16A 3N7MA 1FOAA 2QYIB 5BXTA 2IHOA 4I4PA 1L2HA 1YP3A 1DQOA 3T7NA 4HO5A 1EPWA 2AM4A 1ZI3A 4GAFA 3FWWA 3HL3A 3AZVA 3O4BA 5AJPA 1OMZA 5IDSA 1G8OA 3ST8A 3CU1B 5CMHA 4D11C 4L4HA 3ZLLA 2ZQOA 4QBVA 4YOLA 1FV3A 5D61A 4PC4A 3I0EA 1H5TA 7I1BA 3SX8A 3Q7WA 1KWSA 1ILR1 1H7FA 1ZI1A 1BFGA 4B3UA 1HM8A 3CRIA 4B4BA 1R7UA 2FYAA 1JT4A 4X37A 3VWCA 4G3SA 3SPTA 3FFZA 4EFPA 1G9BA 3N7LA 4HO8A 1Q04A 1T4QA 3IAGC 4EFQA 1R7VA 1SS9A 5F90A 3IM5A 3OBTA 3LW6A 1FO8A 4EFRA 2WRYA 1VH1A 4CJ8A 2PA4A 1R81A 3TQDA 1EYLA 2VXMA 3BCVA 5FU8A 1EV2A 1G82A 4J18A 4M2BA 3O4DA 5HPZA 2D22A 1OQMB 3AKFA 2V0KA 2DPWA 3ZGGA 3K8DA 1INIA 1LZJA 5L6VA 2Z48A 4ZA3B 1TIEA 1LZ0A 1HWPB 6I1BA 2E4MA 1G9DA 4IRPA 2KI4A 2R9KB 4HO3A 4CJMA 2RJ8A 4D0ZA 2D43A 1YP2A 1H4EA 5C3BA 1TP0A 1RG8A 1VGWA 5C4BA 3ZXGA 4BQHA 2ZQNA 3UD7A 3RSBA 4ASJA 4LO2C 1G97A 1MP4A 4J23B 2P73A 41BIA 3W9TA 3CKOA 1FWVA 1LL2A 1TZFA 3I0HA 2RIZA 3UD8A 3BAHA 1DFCA 4LO3C 1DLLA 3O49A 5EC5A 4EB2B 1R7TA 2AE7A 3A22A 3FJDA 3NBEA 2AESA 1ISXA 4Y7UA 1FGAA 4D8HA 4LO7B 2RJ6A 3Q80A 1GGPB 2Y4KA 1ZDGA 3V0PA 3OGFA 1YROB 4P0KA 5BP5A 1LL0A 3AZWA 4EEOA 1BFCA 2FFVA 3R4SA 2AQZA 5BQUA 1FRWA 3PHZA 5DDVA 4IY9A 4Q9PA 3BA7A 5F8SA 4IONA 1O0RA 2PGVA 4JP0A 2X2SA 4J2SA 2ERMA 3PUBA 2CU2A 3FJAA 1FG5N 4J2YA 1YF8B 4ZFUB 3P53A 1G2VA 3UJ0A 2OEFA 2RJ5A 2DREA 5D63A 3OJVA 2BEBA 2RIXA 3ZGFA 3MALA 5EG6C 4GOVA 1S4OA 1NQIB 4FRPA 1HM0A 4B4GA 3BAVA 3R2WA 4QD2B 1W77A 3O44A 4ENDA 5D62A 4Y7FA 4NAKA 1WBAA 4G9NA 1W55A 5CQLX 1DZCA 3WA1A 5EHAA 4B4MA 1BLDA 3FJFA 2D23A 4I7IA 2WEEA 1T9FA 1VGZA 2ICXA 2I5KA 2HW9A 1V83A 4I8MA 1H5SD 1ZHJA 1VZUA 1ABRB 1RMLA 2VSEA 2FYCB 4B2XA 3Q4SA 4G6JA 2YC3A 3OKRA 4ZBVB 2AFGA 4G9MA 2VD4A 4KEIA 3HOMA 4OW4A 3F1CA 3BAUA 2AECA 3BAQA 5EIYA 5C1HA 2Y4JA 1PZTA 1W3GA 1R80A 4JRAA 2BO6A 2Y9FA 1JT3A 1W57A 1FWUA 4AN7B 3BA4A 2APCA 3IOIA 3JTJA 3A21A 4LO7C 1J0SA 2JCKA 4I37A 4LO1A 4OEEA 3QVBA 3LTQA 5FV9A 4I1BA 3SNVA 2VS4A 1QXMA 1WT0A 3U2TA 4I3NA 4L41C 1GX4A 2Y4LA 2KH2A 1D0HA 4Z9WB 1WT1A 3CKNA 2M49A 2RQ9A 3D98A 2Y9WC 4KBBA 4P0JA 1ZJ0A 4FRAA 4R7PA 3CQAA 2KKIA 4EKXB 4I1EA 2V0LA 3ZLKA 1TOOA 4P00A 3F1RA 2P39A 4JISA 3U2WA 2PX7A 1PZYB 4OUJA 1LL3A 3AJ6A 3CA0A 4E1KA 5B2HA 1NZKA 5IDTA 5L6SA 3FJKA 3O4AA 3U2UA 3OJ2A 4XKIA 2X60A 3A07A 5C47A 2JCJA 1K5UA 5C4DA 2FFUA 2VU9A 1JLXA 4I4SA 5C3DA 4FCUA 1FMMS 3U2XA 1R8NA 4QD2C 1IOBA 2NYYA 3S8JA 1S0LA 1NF5B 4FCEA 2Q4JA 3Q7UA 4MNDA 1LZ7A 4EEGA 2YC5A 3DK5A 1BARA 1ZDFA 3HSMA 5DUYA 2E4MC 1SZ6B 1QGSA 3IOJA 1IJTA 3EF2A 3WINA 2E3DA 3PKQA 4J2KA 3SXAA 3FUQA 4JKQA 2VUAA 4OEFA 4F83A 1R8OA 5FTSA 21BIA 2VXRA 2K4AB 3AKGA 3WO4A 1TW1A 2V0JA 4Y7TA 1FGXA 5C1LA 4MYBA 1HWMB 4P0LA 2OI7A 3I0GA 3I29B 2I1BA 3FJBA 1YP4A 3A23A 2YCMA 1TW5A 1GWWA 2OI6A 1Q1UA 2I5EA 1F31A 3FOQA 4B2WA 1DIWA 4C2SA 1II4A 2AH9A 2D7IA 1H5SB 3BRDA 5C38A 1QGQA 3OH1A 4K6RA 2ZU9A 3JUTA 1DFQA 3WMUA 2WBCA 2MLLB 3FJCA 1A8DA 2L5XA 4LO0A 3GUEA 4KNXA 2F2FC 4QKRA 2KI6B 2LIQA 3BB2A 5BQUC 5JLVA 2P72A 3CA1A 5DSSB 2UX8A 3I0DA 4GAIA 3SXEA 2VXTI 1LVWA 2HWAA 4I6IA 1FXJA 2Z49A 2VXLA 3P6IA 2YQJA 4I4UA 3SX5A 4FVVA 3OAMA 3ZC8A 1O7OA 3AKHA 3OGGA 4OWJA 1JVGA 2Y4MA 2OEGA 2Z87A 9ILBA 1IIMA 1ZCVA 3SX7A 3AH2A 3SXDA 3ZC9A 1JT7A 4Q9GA 3VUOA 2GO2A 4J2XA 1H7HA 1AF9A 5I1BA 2YESA 3CU0A 1AVAC 5E24E 4Y6UA 4FRHA 1ZCTA 3UD9A 3V90A 1H5RA 3V0AB 3RMVA 5EJ1A 1M2TB 4AYJA 1ZJ2A 1ZJOA 4CVHA 2BO4A 3I0LA 3Q7XA 4P6AA 4IRQA 2VSHA 5CQOA 3U0XA 1IINA 3H6RA 1VCLA 2RJ4A 2WE9A 1CVSA 3N7KA 4M4KA 1O23B 3V0OA 1FR9A 1XZZA 1IRAX 1EVTA 1QQLA 2BFHA 4L4IA 1VH3A 3WO2A 2RJ9A 4KXOA 5C49A 4Y64A 1QWJA 3SX3A 3BRFA 5FNWA 5CMJA 4G3PA 3K1XA 4I96A 2W0VA 4KC1A 4A7ZA 4OEGA 1H5TB 1VZTA 2NXVA 4H04A 1G95A 2JCLA 2VSIA 3E26A 5BXPA 4USOA 3NGWA 4B5BA 4M28A 2I7BA 5J49A 2X65A 3I0CA 2XWLA 2RITA 4NAIA 2AAIB 1FGGA 1H5SC 4IY8A 1Z4SA 2D7RA 2O1FA 4LO1C 1NUNA 2WVMA 3IOHA 2DRYA 1S0GA 4TLPA 3N0KA 1BFFA 1XYFA 1Q03A 3CAHA 1VGTA 4LW6A 3BA5A 5C1GA 3USRA 4D11A 5F8YA 5C36A 1G9CA 1S0DA 1WBCA 1W3FA 2FY7A 4FRQA 4I4YA 1JQZA 1WT3A 1ISWA 2NVHA 2VS3A 3OH0A 2QKXA 4KC2A 4HA2A 1ON6A 1WT2A 3V0QA 4IHZA 2XWMA 1TVYA 1H3MA 3ZXDA 1JYKA 2FYDB 3OC9A 1GWVA 3POKA 2VSAA 4EVWA 5DDTA 1AFCA 1MP5A 1FXOA 5C4FA 4ZFWB 2ZR1B 5DZUA 2RG9B 3CA5A 4II0A 1E5KA 2RJ0A 1H5RB 1JLYA 3HALA 3PKPA 2FGFA 4Q91A 3BX1C 3FJEA 1ZCUA 3V0NA 3KMVA 4EE3A 3AH1A 1FZWA 4ZOTA 4ZDQA 3H6RB 2VLCA 3PG0A 3WINC 4B42A 1R7YA 3BADA 1V82A 2VS5A 4FQWA 1IILA 1SR4A 1WVCA 1FO9A 1HCDA 2MIBA 4FGFA 1BLAA 1ZCYA 1V6WA 1LZIA 3H6SE 3VT1A 2DS0A 4JAWA 1IT0A 1INJA 4OWKA 4QBCA 1NWGB 4HOCA 3OJMA 4EEEB 1JVDA 1NHEB 1R82A 3SXBA 2AXMA 3FUOA 1G23A 1G9RA 4JQ0A 4GOYA 3VEQA 2O1GA 4D48A 2X5SA 2UUSA 1H7TA 1OQLB 4LO2A 4Y6NA 3T7MA 1DZDA 1AVWB 2K8RA 5CQPA 3V8YA 1I1BA 2J3PA 2ICYA 1V6VA 2W0WA 1VICA 4G1RA 3I0JA 3SXGA 1ZI5A 4X39A 4LO0C 2VFZA 4YS8A 1H7GA 4HO0A 4KRVA 3FJJA 4IQPA 1JTCA 3B9UA 2Z86A 3CA6A 4NANA 4KC3A 4QKSA 1S0BA 1VPAA 3AJ5A 3S8KA 1JY0A 5FUHA 2F8XC 3RTIB 3ZF8A 3T7OA 3O4OA 4FRDA 4H9WA 3LLPA 2K43A 4Y7VA 3OH4A 1ISVA 4Y7GA 4GBPA 2MC2A 1HJJA 1R7XA 1I1EA 2V0HA 4HCQA 1PWAA 4ECMA 1H4CA 3FJ8A 4GP0A 5G00A 3V0LA 1VGUA 2V0IA 3DJ4A 5EJZA 3JUJA 2PGYA 1O7QA 1YTOA 3IIRA 3D7WB 1EYRA 5C4EA 2XMEA 1I52A 3USQA 3BAOA 1S0FA 2KLLA 1W3AA 4UEGA 3U0YA 4CJBA 3I0IX 1BA7A 1N4KA 3OBRA 2NP0A 3D8VA 1MC3A 5CMIA 2AM3A 1UPSA 3HBWA 3E8LC 2AGDA 2E8BA 1QG8A 1H7LA 4DDZA 3RSJA 4HJJA 2X5ZA 3V79C 1NKHB 4F34A 3UDAA 3QYDA 2WGZA 2OI5A 1V6XA 5BP5C 3E25A 4HO6A 3R3IA 3V0BA 2D1ZA 4I0YA 4KPZA 1ISZA 1HWOB 3FGMA 4KPXA 3ZX7A 4XWIA 3PMEA 1HWNB 2LIEA 4I4QA 4CJCA 3F62B 4JKXB 1RZOB 2X2TA 1PC8B 2YQSA 5FU0A 5F8WA 3CA3A 3V91A 2BEAA 2YQCA 1JYLA 4DECA 2QH5A 3O3QA 4QC4A 1FWYA 2RJ1A 3H6QA 8I1BA 4ISRA 4AC3A 4DE7A 1DJSB 2BO7A 2GGOA 5BXRA 2P6WA 3TZTA 4KEJA 4HO9A 2Y9GA 3CRHA 4NALA 2Y6PA 4HR6C 2WVLA 1H7QA 1GA8A 1WD4A 5FZYA 2WAWA 5C3AA 1RY7A 1E0OA 1HIBA 3F1YA 4FRLA 3VSZA 3NBNA 1ON8A 1VZXA 3JRRA 5I1FA 1H4DA 2Q3NB 2BO8A 1H7EA 2Y9XE 4ZGRB 3NJ5A 1HM9A 1ZIZA 3BRGC 1AVUA 4AAWA 4A7KA 1BASA 2GZBA 4FREA 4IYBA 4I4XA 3FJIA 3R4UA 2D44A 2D24A 1ZJPA 3QR5A 4IZEA 1ZJ1A 2NM1A 1SR4C 1OMXA 1Z0HA 4I4OA 3BRKX 4ARWA 1XZ6A 1HKNA 3RMYA 2QGIA 3C9ZA 4HO2A 4P02A 1ZI4A 2ET2A 2YQHA 4FRBA 1AXMA 3Q7YA 3TC2A 1S4PA 4KNRA 1S4NA 2RSTA 5IFYA 5C4CA 4KQLA 4M2AA 4ZFYB 3V0BB 3CA4A 2ESUA 4X3AA 3D5NA 31BIA 3NBCA 4R6UB 1IHKA 1FMZA 2JCOA 2RJ7A 3OH3A 4OWLA 5FZZA 4LW3A 2D0JA 3UJ4A 5BOWA 2MZBA 1YXWA 4XFTA 1BFBA 4XFUA 3O5WB 3VSFA 1G9AA 3RMWA 3ILAA 1G1LA 3DUVA 4EE4A 5DVHA 3T8SA 5C8RA 4GP3A 2Q9XA 3V8ZA 4AN6A 4Y63A 3FJHA 1DQGA 4DENA 3O3PA 1JV1A 4Y9XA 3KIAA 2ZU8A 4EEMA 1XHBA 1WD3A 2GGQA 1S0EA 2F2FA 4QO3A 5FNXA 1G93A 2NZ9A 1TTUA 2O1HA 2HWMA 4KEKA 5JMCA 3I2AA 3I0KA 2Y7AA 1ONKB 1TFMB 2QN4A 4I4RA 4DCKC 1V84A 1CE7B 4A7YA 5FZUA 4G87A 5CMFX 4DEPA 4QALA 3BAGA 4WBCA 3I2XA 1TWEA 1GQ9A 5FYEA 2FYBA 3U2VA 2HZ9A 2A8UA 1FQ9A 2FDBM 1G3LA 4IZXA 1FV2A 1P63A 3NBDA 3OGZA 2IWTB 1ITBA 1ZJ3A 1K4VA 1NMMB 5FTVA 1QQKA 1YYNA 1Z2VA 3FJ9A 1AVXB 2FO1A 3JUKA 1FN0A 4I2SA 3PNNA 4XFSA 4ZLBB 3HMYA 4EEAA 3VT2A 1VM8A 4BMAA 3K8EA 3IM6A 5BXCA 2NTDA 3AH4A 4LO3A 3CKJA 3I0FA 5C48A 3BTAA 1PUUB 4G6MA 4KT7A 1XG6A 3WO3A 1V6UA 5AJOA 5AJNA 3SXCA 3MPPG 3N9WA 4HG6A 4I4VA 4EE5A 1YBIA 1FR8A 4Y62A 1S0CA 1Z90A 5CQNX 3RMXA 4FRMA 1GQCA 2XWNA 4HO4A 4AYLA 2P23A 3N7JA 1H5SA 4ZKTB 4USPA 2ZU7A 3CGXA 3OH2A 4G3QA 5HS2A 1MC9A 2DRZA 3VT0A 4JD0A 1MP3A 1EZIA 2RIYA 5BXSA 1WSZA 1MD6A 2D20A 4ISQA 4ASYA 1PUMB 1TWMA 1GX0A 5GAQA 3CKVA 3EE5A 1HV9A 2AM5A 1KNMA 5CMGX 4LO8B 2YUGA 1G0RA 4Z8SB 3P6JA 3POLA 3RTJB 4FROA 1HCEA 2XOAA 3AKIA 1K5VA 1PZZA 2WVKA 3V0MA 5JQQA 4KC4A 3CRGA 3IM7A 2A8WA 1HJLA 5CQMX 2XMHA 3CKQA 3HN1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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