4D0TA

Galnac-t2 crystal soaked with udp-galnac, ea2 peptide and manganese
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
KVRWPDFNQEAYVGGTMVRSGQDPYARNKFNQVESDKLRMDRAIPDTRHDQCQRKQWRVDLPATSVVITFHNEARSALLRTVVSVLKKSPPHLIKEIILVDDYSNDPEDGALLGKIEKVRVLRNDRREGLMRSRVRGADAAQAKVLTFLDSHCECNEHWLEPLLERVAEDRTRVVSPIIDVINMDNFQYVGASADLKGGFDWNLVFKWDYMTPEQRRSRQGNPVAPIKTPMIAGGLFVMDKFYFEELGKYDMMMDVWGGENLEISFRVWQCGGSLEIIPCSRVGHVFRKQHPYTFPGGSGTVFARNTRRAAEVWMDEYKNFYYAAVPSARNVPYGNIQSRLELRKKLSCKPFKWYLENVYPELRVPDHQDIAFGALQQGTNCLDTLGHFADGVVGVYECHNAGGNQEWALTKEKSVKHMDLCLTVVDRAPGSLIKLQGCREDDSRQKWEQIEGNSKLRHVGSNLCLDSRTAKSGGLSVEVCGPALSQQWKFTLNLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords POLYPEPTIDE N-ACETYLGALACTOSAMINYLTRANSFERASE 2
publication title Substrate-Guided Front-Face Reaction Revealed by Combined Structural Snapshots and Metadynamics for the Polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase 2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 167
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.4.1.41: Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase.
pdb deposition date 2014-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00535 Glycos_transf_2 Glycosyl transferase family 2
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4d0tA02
3.90.550.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A 4d0tA01
2Y9WC 4TLPA 3UJ0A 1LVWA 1NF5B 4EE4A 3I0CA 3KMVA 4K6RA 3IOJA 4YS8A 1O7OA 4B4BA 2X5ZA 2QYIB 5F90A 1Z4SA 2WVMA 3DJ4A 1DFQA 2FO1A 3TQDA 3I0DA 1V6UA 1TW1A 4IRQA 3BX1C 2YUGA 4QKRA 4DEPA 1DZCA 2VU9A 4JKQA 2ZU8A 4FROA 3DUVA 2VS5A 2Y9FA 5JMCA 3O44A 2MLLB 1NMMB 4NAIA 2R9KB 1R81A 2I7BA 2W0WA 3SXBA 1FXOA 3VT2A 1TIEA 3JRRA 1FGAA 2GGOA 1MP4A 1JTCA 4NAKA 3T7MA 3U2WA 5L6VA 5IFYA 3UDAA 3JTJA 3JUKA 1R8NA 1WBAA 2QKXA 4L41C 1NWGB 5BQUC 2WAWA 3HMYA 5EJZA 1IILA 4HA2A 1NUNA 3TZTA 3CA3A 3FJ9A 2FYDB 3OH2A 4Y62A 5CMHA 3SXCA 3AH4A 4Q91A 1TOOA 4ENDA 3V8ZA 2VXRA 1JVGA 2D1ZA 1ZJ0A 4Y6NA 2FGFA 3MALA 1ONKB 5D62A 4ASJA 1HWPB 3RTJB 3OJVA 1LZJA 2YQHA 3I0IX 3A07A 1G8OA 41BIA 1GX0A 4MYBA 4LO0C 4ZLBB 3O3QA 1FG5N 1OMZA 1IJTA 3I2XA 1I52A 2AXMA 4JRAA 3AH1A 1FOAA 1HJJA 3I29B 4HO6A 1ISXA 3V0BA 3FJIA 3FJBA 1CVSA 1MP5A 3QVBA 5CQLX 5FTVA 4KC4A 1TZFA 3RSBA 2BFHA 3OBTA 4X38A 4ZFYB 2XMEA 3SNVA 2Y4KA 2V0HA 3U0YA 3O3PA 4IYBA 1YROB 4L4IA 1R80A 5AJOA 1ZJ3A 1DLLA 4OWKA 4EE5A 2JCOA 3BAUA 1V6VA 3FJDA 5CQPA 1EV2A 1EPWA 4DCKC 4G6JA 5EG6C 5BOWA 2P73A 2ZR1B 4GP3A 1FR9A 4EFPA 3ZGFA 2OI5A 3CA4A 4KC1A 1ISZA 3OGZA 1ON6A 3NBNA 1FMMS 3N9WA 3NGWA 2I5EA 3RMXA 4I4VA 1H5RB 1H7TA 2HZ9A 3V79C 2X5SA 2BEBA 4A7ZA 3CKQA 3DK5A 2P72A 3FJEA 2KH2A 4GAFA 4E1KA 1AVWB 3CRGA 4IY8A 4KQLA 5J49A 1HWOB 1G2VA 1ON8A 1W57A 2XOAA 1WT1A 4ZFUB 2D24A 2PGVA 4EKXB 1WD4A 3P53A 3WMVA 2GGQA 5DSSB 3N7MA 4FRQA 4J2SA 1IRPA 2E8BA 4B5BA 4I37A 1ZJ2A 2HWAA 2QN4A 4J23B 4IZXA 4H04A 4F34A 1LL3A 1JT4A 4LO0A 3SXEA 1TFMB 3VEQA 2E4MC 1R82A 3IOHA 2D20A 2RJ6A 1VGTA 3D8VA 1W3AA 1R7TA 3UJ4A 2Y6PA 4QD2C 1FV3A 4I96A 8I1BA 3FJHA 2Q4JA 1YYNA 4QBVA 4M28A 3V0PA 4Y64A 5FNXA 4IZEA 4CJ8A 1H7HA 1NKHB 1PZYB 1VCLA 1QQKA 3S8JA 3WO2A 1O23B 1VH1A 1ZJOA 4NANA 3I0EA 3NBDA 3E25A 4G3QA 4ZOTA 3D7WB 2KI4A 4XWIA 2ESUA 2AFGA 3USRA 2PGYA 1S4OA 1FN0A 4B4MA 2VLCA 2K4AB 5C38A 3U2XA 1K4VA 3T7OA 3FWWA 1HIBA 2RJ9A 1S0DA 3NBCA 2Y4MA 1AVXB 3VSFA 5C3AA 4EEMA 4ZA3B 2DREA 2I1BA 5HS2A 2RIZA 2VXTI 5BXRA 1HM8A 3OAMA 1G97A 1V82A 1YTOA 5C47A 3AZVA 5FU0A 2AM4A 4B2WA 2BO4A 5DZUA 1ZJPA 1EYRA 2Q3NB 3IM5A 3ZC8A 3CA6A 1H7QA 3BTAA 4LO1C 4QD2B 3V0MA 1H5SD 2APCA 1XHBA 5FV9A 1YP2A 2RJ5A 3ZLLA 3H6SE 3AJ6A 4ZBVB 4CVHA 2NM1A 2PX7A 2BEAA 1DIWA 4I8MA 1BARA 1DQGA 2E4MA 1V6WA 4JKXB 1JLXA 2VFZA 4DECA 3I2AA 3K1XA 1HV9A 2XWNA 1W55A 4HO5A 3UD9A 2O1FA 4ECMA 1D0HA 5AJPA 1MP3A 2KKIA 4Y7VA 4XFUA 1H4EA 1Z0HA 3UD7A 3Q7UA 5CMIA 2RJ1A 1Q04A 3O4AA 1KNMA 4G9NA 2BO6A 4EEGA 2YQJA 3FJAA 4LO3C 1DJSB 4QKSA 2DRYA 5B2HA 4LW3A 2YC5A 4QALA 4R6UB 3BA5A 4XFSA 2ZQOA 3WA1A 4KEKA 3OH3A 2AE7A 4MNDA 5C4EA 2BO8A 3H6RB 2WEEA 3FJ8A 3OH0A 3QYDA 3HOMA 2MZBA 3PKQA 1JV3A 1AXMA 3AKHA 2ERMA 3RSJA 3Q80A 3NJ5A 4J18A 4B2XA 5E24E 5BXCA 2RJ0A 3CQAA 2LIQA 3A22A 4Y7FA 3K8DA 1MD6A 4I1EA 1QQLA 2QH5A 1XG6A 1G93A 1ZHJA 9ILBA 2PA4A 1IINA 1H5TB 2VS3A 1HCEA 2P6WA 4KPXA 1S4PA 2X60A 1G0RA 2GZBA 1G1LA 1R7YA 2I5KA 4LO2A 2OEGA 3CU0A 5C1HA 5I1FA 5D61A 2IHOA 3OGGA 1LL0A 5C48A 1YF8B 5FUHA 3O4BA 4HO4A 1JVDA 2WE9A 1BLAA 3BRKX 3Q7WA 3BRGC 1VZUA 3CA0A 1ZDFA 1LZIA 1GA8A 4G3SA 1T9FA 1XZZA 1W3GA 4JQ0A 4EFQA 1G95A 2V0LA 1P63A 3Q7XA 4M4KA 3Q4SA 3WO4A 1WVCA 3CRHA 3USQA 4P00A 4AN6A 3RTIB 1EZIA 1BFBA 4GOYA 2HW9A 3ZC9A 2XMHA 4KC2A 3SX7A 1ISVA 2D7RA 1PUUB 3WINC 2Z86A 1AVUA 4ZFWB 5DUYA 1INJA 4P0KA 2QGIA 3F1CA 3LW6A 3LTQA 1NHEB 2FYAA 4KPZA 2UUSA 3WMUA 2K8RA 5FZZA 1W77A 3OH4A 4KEIA 4LO7C 3R4SA 3R3IA 7I1BA 1VGWA 2A8WA 3F1RA 3OGFA 2OEFA 2Y4LA 3V8YA 4USOA 1FR8A 1S0CA 4KBBA 5BP5C 2YQSA 2ZU7A 3C9ZA 3CKJA 2P23A 3OC9A 2VXLA 1TP0A 5IDSA 2V0JA 2JCJA 3JUJA 1YP4A 1G3LA 4GP0A 4HO0A 2NTDA 4AAWA 2DRZA 4PC4A 4QO3A 1S4NA 3AZWA 1TVYA 1SR4C 4KXOA 1AF9A 2NP0A 5BQUA 5CMGX 1M2TB 4Y6UA 1FWUA 3CRIA 4OEGA 2XWLA 1N4KA 1W3FA 1QGSA 3N7LA 1F31A 2AAIB 4JD0A 1VZXA 4QC4A 3PUBA 1FO8A 1H5RA 1R7XA 4OW4A 3NBEA 1H3MA 1VZTA 4G87A 1Q1UA 1ZI3A 4KNXA 3IM6A 4OWLA 2WGZA 5CQOA 3S8KA 4JAWA 5DDVA 3SXAA 5CMJA 3LLPA 1GGPB 3SX3A 1G9BA 1FGXA 4LO7B 1GWVA 3IIRA 1EVTA 4AC3A 2NVHA 1XYFA 4I4OA 1HWMB 5I1BA 3K8EA 5CQMX 2FYBA 3BRDA 3WINA 4R7PA 2RIXA 4BQHA 1FV2A 2P39A 1ILR1 3ZX7A 1LL2A 3I0HA 2Q9XA 3W9TA 3PKPA 3MPPG 3FGMA 2VSHA 3V0QA 2X2TA 3AKGA 4Y7UA 4DDZA 1S0LA 1FXJA 1H7GA 2X65A 4BMAA 3I0LA 5F8WA 1WT3A 2AH9A 4KT7A 1PZTA 1FMZA 2D23A 1IOBA 1ZCYA 2LIEA 4OUJA 2E3DA 2HWMA 4FCUA 1S0EA 4NALA 5FU8A 1GQCA 1DQOA 3EF2A 4B3UA 1ZI4A 2YQCA 3ZXDA 3HN1A 4A7YA 2RJ7A 4M2BA 4EEOA 1PUMB 1ZDGA 2Z87A 1K5UA 1WT0A 3AKIA 2MC2A 1ZCVA 3BCVA 3CA1A 5EIYA 3ZGGA 4FRMA 1TW5A 1JT5A 1Z90A 1PZZA 4B4GA 1GWWA 2WRYA 5JLVA 1YXWA 3OH1A 3BA4A 1V83A 4Q9PA 4Z9WB 3IAGC 4ARWA 1I1BA 3FUQA 1Q03A 4M2AA 3F62B 1PWAA 1JT3A 2NXVA 5DDTA 4A7KA 4FQWA 2D44A 5C36A 4FCEA 4I2SA 2O1HA 3ILAA 1O7QA 1O0RA 2VSAA 3SXGA 4IRPA 2AGDA 4F83A 3F1YA 2VUAA 3BB2A 4DENA 3O4DA 1S0FA 1G9CA 4G3PA 4FRLA 3FFZA 3SX5A 2RJ4A 4UEGA 1CE7B 4XKIA 3FUOA 1WT2A 1YP3A 1RMLA 3D5NA 2YC3A 2ET2A 1SS9A 4HO8A 3O5WB 3ST8A 1VPAA 3CGXA 4I0YA 1JYKA 3POKA 1MC9A 2V0KA 4GOVA 1S0BA 3KIAA 4JISA 4D0TA 4I4PA 1H4DA 1AVAC 4L4HA 2L5XA 3BAVA 3QR5A 2Y9GA 4OEEA 5BXTA 4GBPA 3T7NA 4D48A 3BRFA 1DFCA 4Y7TA 4I7IA 3V0NA 1JV1A 2V0IA 1INIA 2AM3A 2NYYA 1HCDA 4I4UA 5C3BA 2WBCA 3VT1A 1R7VA 3H6RA 2XWMA 1ZI1A 1G82A 1WD3A 1E0OA 1IT0A 4EVWA 1BASA 2F8XC 2Y4JA 2DPWA 3HALA 4IY9A 4LO1A 2RSTA 3TC2A 1OMXA 3V0OA 1TWMA 5GAQA 5C49A 4D11C 1BLDA 1S0GA 4ISQA 3RMVA 4ZDQA 4AN7B 4P6AA 4J2YA 2M49A 3N0KA 1ZJ1A 4GAIA 4LO8B 1H5TA 4FRBA 3O4OA 4II0A 2ICYA 1FQ9A 4IHZA 4EEEB 5EC5A 1RZOB 3T8SA 5FTSA 1G9AA 1RY7A 1HWNB 1MC3A 2WVLA 4FRAA 5C3DA 1ITBA 4Y9XA 1LZ7A 4FRPA 4EE3A 4X3AA 3O49A 1H7LA 3OJMA 1JYLA 3SXDA 3CU1B 1FZWA 2VS4A 4LO3A 2AECA 4YOLA 4LW6A 1QXMA 2X2SA 3P6JA 1ISWA 4HCQA 31BIA 4EFRA 1J0SA 5D63A 3BA7A 4ISRA 4I4SA 1ZIZA 3RMWA 1ISYA 3GUEA 1I1EA 1H5SC 4FGFA 3FJKA 1E5KA 2D0JA 3O4CA 1ABRB 1EYLA 3BAQA 3I0GA 3VSZA 1VH3A 3ZF8A 5JQQA 3V0BB 4QBCA 6I1BA 1BFCA 1QGQA 3FOQA 1YBIA 3UD8A 4D8HA 1JLYA 2F2FC 3HSMA 4I1BA 5BXSA 3BAHA 1QWJA 3FJCA 2O1GA 4OWJA 2ZQNA 5EHAA 1V6XA 5G00A 1H7FA 1HM9A 3POLA 2W0VA 1OQLB 4HOCA 3SX8A 4D11A 1H4CA 2RIYA 4G6MA 4ZGRB 2D7IA 1HKNA 1JQZA 2J3PA 1R7UA 2KLLA 2RG9B 3BAOA 1V84A 2D22A 3R4UA 1GX4A 5C1LA 1Z2VA 1ZI5A 3R2WA 2JCLA 2OI7A 5BXPA 3AH2A 2MIBA 3OKRA 1A8DA 4B42A 3SPTA 1FGGA 4HO3A 5C1GA 2FY7A 2FDBM 1BA7A 1HJLA 4EEAA 3OJ2A 1DZDA 4Y63A 4CJMA 1H5SB 3OBRA 4HO9A 3U2VA 3WO3A 4CJCA 1AFCA 4FREA 1II4A 3U0XA 1PC8B 4Y7GA 3A23A 3V0LA 5C4CA 21BIA 2IWTB 2A8UA 3E26A 3AKFA 3EE5A 4G1RA 3VT0A 1HM0A 2Y9XE 1OQMB 1VICA 1H5SA 2FFVA 3U2TA 2VSEA 1JT7A 1FWYA 3Q7YA 4KEJA 5BP5A 3V0AB 1QG8A 2RITA 3D98A 3AJ5A 2AM5A 3PNNA 5C4DA 3IOIA 5BVPI 4P0JA 1NQIB 5L6SA 4FRDA 1WSZA 4AYJA 4P0LA 4J2XA 4X37A 2OI6A 2F2FA 2NZ9A 3PHZA 2ZU9A 1GQ9A 4XFTA 4Z8SB 4JPZA 1SR4A 4X39A 2DS0A 3BADA 3V0AA 5FYEA 4HR6C 1VM8A 3ZLKA 4KRVA 1L2HA 4ASYA 1XZ6A 2D43A 1T4QA 4D0ZA 4J2KA 5F8YA 3I0FA 4DE7A 2JCKA 4EB2B 4I4QA 3A21A 1FWVA 3CKNA 5IDTA 1TTUA 3P6IA 5EJ1A 1SZ6B 1IRAX 1H7EA 3HL3A 3HBWA 3VUOA 3V91A 2KI6B 3N7JA 4IQPA 5FZUA 4C2SA 4I4YA 2AQZA 2YCMA 1IHKA 4JP0A 4I3NA 5C8RA 3PMEA 4G9MA 1M16A 3ZXGA 1ZCUA 2AESA 1UPSA 1G9DA 2ICXA 4HG6A 3FJFA 4CJBA 1VGZA 1WBCA 4I4XA 4P02A 3RMYA 3E8LC 4FVVA 2UX8A 4ZKTB 1JY0A 5DVHA 3I0JA 3N7KA 5FNWA 2Z48A 1RG8A 3VWCA 3IM7A 4WBCA 5F8SA 5AJNA 4LO2C 2Y7AA 4Q9GA 1NZKA 2WVKA 3I0KA 4OEFA 2VD4A 4KC3A 5HPZA 2RJ8A 2Z49A 3BAGA 4AYLA 1TWEA 1BFGA 2VSIA 3V90A 4HJJA 2RQ9A 1KWSA 3CA5A 4KNRA 3U2UA 5CMFX 1R8OA 3JUTA 5C4FA 1K5VA 3B9UA 4H9WA 1G23A 5C4BA 4USPA 4I6IA 3H6QA 4HO2A 3CAHA 1VGUA 2CU2A 1FRWA 1G9RA 1LZ0A 3CKOA 5CQNX 4FRHA 2FFUA 3FJJA 3CKVA 1ZCTA 2FYCB 2GO2A 4I4RA 1IIMA 5FZYA 1FO9A 4IONA 1BFFA 2K43A 2BO7A 2VXMA 2YESA 3PG0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Y9WC 4TLPA 3UJ0A 1LVWA 1NF5B 4EE4A 3I0CA 3KMVA 4K6RA 3IOJA 4YS8A 1O7OA 4B4BA 2X5ZA 2QYIB 5F90A 1Z4SA 2WVMA 4O6MA 3DJ4A 1DFQA 2FO1A 3TQDA 3I0DA 1V6UA 1TW1A 4IRQA 3BX1C 2YUGA 4QKRA 4DEPA 1DZCA 2VU9A 4JKQA 2ZU8A 4FROA 3DUVA 2VS5A 2Y9FA 5JMCA 3O44A 2MLLB 1NMMB 4NAIA 2R9KB 1R81A 2I7BA 2W0WA 3SXBA 1FXOA 3VT2A 1TIEA 3JRRA 1FGAA 2GGOA 1MP4A 1JTCA 4NAKA 3T7MA 3U2WA 5L6VA 5IFYA 3UDAA 3JTJA 3JUKA 1R8NA 1WBAA 2QKXA 4L41C 1NWGB 5BQUC 2WAWA 3HMYA 5EJZA 1IILA 4HA2A 1NUNA 3TZTA 3CA3A 3FJ9A 2FYDB 3OH2A 4Y62A 5CMHA 3SXCA 3AH4A 4Q91A 1TOOA 4ENDA 3V8ZA 2VXRA 1JVGA 2D1ZA 1ZJ0A 4Y6NA 2FGFA 3MALA 1ONKB 5D62A 4ASJA 1HWPB 3RTJB 3OJVA 1LZJA 2YQHA 3I0IX 3A07A 1G8OA 41BIA 1GX0A 4MYBA 4LO0C 4ZLBB 3O3QA 1FG5N 1OMZA 1IJTA 3I2XA 1I52A 2AXMA 4JRAA 3AH1A 1FOAA 1HJJA 3I29B 4MZFB 4HO6A 1ISXA 3V0BA 3FJIA 3FJBA 1CVSA 1MP5A 3QVBA 5CQLX 5FTVA 4KC4A 1TZFA 3RSBA 2BFHA 3OBTA 4X38A 4ZFYB 2XMEA 3SNVA 2Y4KA 2V0HA 3U0YA 3O3PA 4IYBA 1YROB 4L4IA 1R80A 5AJOA 1ZJ3A 1DLLA 4OWKA 4EE5A 2JCOA 3BAUA 1V6VA 3FJDA 5CQPA 1EV2A 1EPWA 4DCKC 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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