150LA

Conservation of solvent-binding sites in 10 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEILRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Conservation of solvent-binding sites in 10 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 54
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 150lA00
182LA 236LA 1CV6A 120LA 155LA 198LA 3SN6R 1L00A 1L24A 1C60A 1L95A 3HT8A 4ARLA 171LA 195LA 209LA 1QS9A 3SB9A 1OV5A 1L80A 245LA 2RBRA 1OVHA 122LA 3C80A 1L10A 1T8GA 2ANVA 1CV5A 1OVKA 139LA 2RH1A 1L0JA 1C6NA 1C6KA 167LA 149LA 1PQIA 1L0KA 3F9LA 3GUPA 127LA 4EKSA 1L53A 251LA 1L61A 1L26A 131LA 3HTBA 2LCBA 1L48A 1PQJA 3C8SA 200LA 255LA 3G3VA 1QTVA 1KNIA 150LA 1DYFA 1L29A 2RAYX 2RBOA 1L01A 1L54A 1WTHA 2OTYX 3DN8A 1LYFA 4W56A 1C62A 3HDFA 3FADA 4EKPA 3HU8A 1L59A 1G1WA 1OWZA 123LA 1XJTA 126LA 168LA 1L20A 1C68A 145LA 2B70A 1KY1A 1L76A 2B74A 7LZMA 4I7NA 1L64A 1C6MA 3PDSA 1SSWA 1L55A 2ANXA 191LA 1C67A 1CX7A 250LA 2B6ZA 1L06A 103LA 1L68A 2RBSA 258LA 1ZURA 1L96A 238LA 1LW9A 1L08A 1K28A 2OTZX 1LYIA 4EKRA 2A4TA 1P7SA 3K2RA 1CV3A 113LA 262LA 1L84A 1L31A 1L36A 3HTFA 104LA 225LA 3DN0A 1G0MA 1P2LA 1G0PA 3HUQA 4I7OA 142LA 1L73A 119LA 1QS5A 2RBNA 3JR6A 4ZPUA 3HU9A 189LA 2B73A 118LA 1JQUA 3HH6A 3DN2A 206LA 4PK0A 163LA 3NY8A 1KY0A 1G1VA 3NY9A 3HTGA 178LA 1L03A 172LA 1L12A 144LA 1QUDA 1L52A 4OO9A 4AQNA 1PQMA 1ZWNA 1C61A 1L71A 3G3WA 1DYBA 1L04A 1L70A 3C8RA 1L65A 169LA 4I7RA 129LA 1G07A 3CDTA 1L22A 1L39A 4DAJA 1L72A 4ARMA 232LA 1LI6A 1PQOA 1D3FA 260LA 3NYAA 1L57A 3G3XA 1L33A 1C66A 199LA 3LZMA 4W59A 1DYAA 1G0JA 1L07A 1D2WA 1L23A 1NHBA 216LA 201LA 1L34A 4I7SA 1C6CA 1P2RA 1LGUA 3DMVA 5I14A 1L81A 1L89A 185LA 4W54A 3SB7A 2RB0X 1OYUA 3HT6A 146LA 3GULA 1DYDA 1D9WA 3L64A 1CX6A 1L13A 2B72A 1L21A 3GUKA 3RZEA 223LA 1SX7A 242LA 222LA 1DYGA 3C82A 1L14A 1L25A 1L93A 2LZMA 1LYGA 1P37A 3FA0A 4PJZA 1L56A 2L78A 173LA 1L79A 1CU3A 4GRVA 3VW7A 1LPYA 1C63A 1C64A 1CVKA 1SSYA 1CUPA 1QTDA 219LA 2Z6BA 181LA 2F32A 5LZMA 259LA 1I6SA 1SWYA 151LA 1PQDA 257LA 3HUKA 4IAPA 159LA 192LA 1P46A 1G0GA 6LZMA 1L98A 164LA 4YXAC 3GUIA 1L97A 3SBBC 3OE6A 3C7WA 1LI2A 230LA 3D4SA 1QT8A 1L92A 158LA 1LYDA 1KS3A 1L37A 254LA 2B6TA 2O4WA 1C6AA 3HUAA 1XEPA 2B75A 2Q9EA 102LA 243LA 1L16A 1QUOA 212LA 3SB6A 2RAZX 4DJHA 1L45A 3HWLA 110LA 1T8FA 4I7LA 4S0WA 1C6JA 1T6HA 1OWYA 109LA 138LA 1L27A 1P6YA 2B6YA 3HT7A 161LA 1L40A 1C6BA 176LA 125LA 3V2WA 1DYEA 2F47A 3HTDA 1CV1A 1L91A 2LC9A 1D3MA 186LA 1L94A 4EJ4A 140LA 4ARMB 3SB8A 4W58A 1C6IA 3C83A 2HUKA 1LLHA 235LA 141LA 1QUGA 224LA 196LA 1LYJA 237LA 1LGWA 2OU8A 2OE7X 1T8AA 162LA 174LA 1D2YA 2B7XA 3C8QA 1L60A 112LA 210LA 226LA 1OVJA 184LA 4DKLA 1L87A 1C6HA 3DKEX 1L63A 252LA 211LA 2HUMA 128LA 2QB0B 147LA 2OE4X 1CU5A 1C6GA 1P64A 2B6WA 1C6FA 1L47A 1C6QA 4EKQA 2O7AA 1JTMA 1L83A 160LA 249LA 2NTGA 1L69A 253LA 3GUJA 3SBAA 3C7YA 1CV0A 1L28A 3V2YA 2CUUA 1L50A 1L30A 4K5YA 3DN3A 1C6EA 1QT5A 1QTBA 4ARJA 1KW7A 2NTHA 3CDRA 1G06A 4YXCA 229LA 240LA 4ARPA 187LA 1L51A 4I7JA 1L74A 217LA 1L05A 1C6LA 241LA 2QARC 1L02A 1L82A 1P56A 1C69A 4W57A 1G0LA 1L88A 3F8VA 1C6DA 4GBRB 1PQKA 3CDOA 3DN6A 2F2QA 1L42A 1QT7A 1SX2A 2OU0X 1L38A 1JTNA 1L77A 1G0QA 2OU9A 3CDQA 165LA 180LA 4W51A 1LYEA 1LGXA 166LA 2IGCA 197LA 4I7PA 143LA 1L66A 1QTCA 1CTWA 218LA 2HULA 2RB1X 1C65A 1ZYTA 3UONA 1LI3A 115LA 1LYHA 1QTZA 1L58A 3CDVA 1QT4A 3OE0A 4I7KA 1DYCA 175LA 1EPYA 3DN4A 3C81A 1L90A 1L49A 188LA 1KW5A 3HH5A 1L32A 227LA 3OE8A 1L75A 220LA 244LA 1P36A 4ARQB 4EPFA 2RB2X 1CU2A 3DNAA 4YX7C 3HH4A 246LA 183LA 1L15A 1CUQA 1LWKA 156LA 1CU0A 1OV7A 4LZMA 3L2XA 247LA 2RBPA 1P5CA 157LA 111LA 261LA 228LA 107LA 4I7TA 1B6IA 2Q9DA 4E97A 1L67A 256LA 1L35A 1G0KA 1CU6A 3HH3A 205LA 3PBLA 1L44A 1QSQA 148LE 1QT6A 1QTHA 2OEAX 4ARQA 4EXMA 1QSBA 177LA 231LA 152LA 1L99A 3RUNA 1L62A 1LWGA 4W53A 215LA 4I7MA 1C6PA 130LA 1T97A 3GUOA 234LA 137LA 1TLAA 1L43A 3DMZA 1QUHA 1L18A 1L11A 190LA 1CV4A 3SB5A 3QAKA 1L46A 233LA 1SWZA 1L17A 214LA 2B6XA 213LA 1XJUA 3HDEA 3EMLA 3ODUA 1L86A 1D3NA 170LA 248LA 3GUMA 4I7QA 3C7ZA 1L85A 3HT9A 1L41A 114LA 239LA 3DN1A 3GUNA 2O79A 4EPIA 3FI5A 4LDLA 108LA 1L09A 221LA 4W52A 1QT3A 3DMXA 2OE9X 4LDOA 4W55A 1L19A 2RBQA 4LDEA 1C6TA 3OE9A 1D3JA 1P3NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IP5A 182LA 2EQLA 4YEMA 1VATA 5I4WA 1C60A 1QS9A 2Z18A 245LA 1GF5A 2RBRA 1OVHA 4ETCA 1L10A 1LHJA 1GB7A 2ANVA 1GDWA 1UC0A 5F14A 1GFAA 5HNLA 1GFGA 1BWHA 1SQ2L 149LA 1GF0A 3F9LA 127LA 4EKSA 2BQIA 131LA 3HTBA 1INUA 2ZWBA 1J1XY 1KNIA 2YDGA 1IR9A 1L01A 2PC2A 4WM1A 2OTYX 4B49A 2ZQ3A 1LZNA 4BADA 3DN8A 1HERA 1LYFA 4W56A 3HDFA 5KXMA 3FADA 1G1WA 1BQLY 1XJTA 168LA 1L20A 2B70A 3OJPA 1L76A 2B74A 5KXTA 1CNSA 3PDSA 191LA 1QDTA 1YILA 2DQDY 5HMVA 1YANA 4NG1A 5FSTA 1JJ0A 4WG7A 1LW9A 4N9RA 4XJFA 1LYIA 3HTFA 1P2LA 4H8ZA 4ML7A 4H94A 1B7OA 3JR6A 2RBNA 4ZPUA 1QSWA 2W1MA 1UA6Y 118LA 3RU5A 2LZTA 3HH6A 4HV2A 2BQHA 1DPXA 1WVUA 4PK0A 1FN5A 4LT1A 5FHWA 1C43A 1FBIX 4OOTA 2W1LA 144LA 4J7VA 1T6VL 5LIOA 4OO9A 3W6BA 4AQNA 2BQOA 1PQMA 2FBDA 4NGJA 1GB5A 3A8ZA 3C8RA 1UACY 4I7RA 129LA 2G4PA 2MEBA 2DQFC 1L72A 1VAUA 1VFBC 1LI6A 2BLYA 260LA 3WUMA 3G3XA 2YBNA 2D4IA 1C66A 199LA 3LZMA 4W59A 1L07A 1L34A 3DMVA 1OUBA 4QEQA 4J0LA 3GULA 1D9WA 133LA 4OWEA 1ZV5L 1HENA 4DD7A 2D6BA 1SX7A 3WYHA 3LYZA 3C82A 1MELL 1OUFA 1L14A 1L93A 3TMVA 1LYGA 3AW7A 1N4FA 4PJZA 1C10A 1GE3A 2L78A 3VW7A 4GRVA 3AZ5A 1CUPA 5DN4A 2F32A 4KT3A 1NWGA 2MEIA 3HUKA 257LA 4IAPA 1G0GA 6LZMA 3A95A 164LA 3OE6A 135LA 158LA 1L37A 1C6AA 3EXDA 1XEPA 1LSCA 1EQ5A 4NEBA 1L45A 110LA 1T8FA 1O23A 1DQJC 3D9AC 1OWYA 109LA 1AZFA 4EMNA 1CKGA 4MSTA 134LA 176LA 3AZ7A 3AZ6A 3HTDA 4OWAA 1CV1A 1GF7A 4H9AA 4EJ4A 1CKHA 1JEFA 4ARMB 3SB8A 2MEDA 1LMAA 1IY4A 1REYA 3TXGA 1QUGA 1LYJA 4IJ4A 2OE7X 1FLWA 4LFPA 2B7XA 3A6CY 1L87A 1LJNA 2Y8PA 4M6DA 1XGRC 211LA 4OWCA 2OE4X 1C6GA 1C6FA 1ZVHL 3CB7A 1JTMA 249LA 5LAGA 253LA 2BQCA 3FE0A 1GAZA 1L50A 1G7IC 4GCDA 5KXSA 4YENA 2NWDX 4LGKA 1QDRA 4NHQA 1GE2A 3G3AB 1BWIA 2HUBA 4N0JA 3AZ4A 217LA 1C6LA 1L02A 1TAYA 3F6ZA 2Z2FA 1C69A 4H9FA 2D4KA 3DN6A 2MEEA 3LZTA 2OU0X 5LA8A 2OU9A 1LZCA 2Q0MX 4UWNA 5A3ZA 1LYEA 4GCEA 4LYMA 1LZBA 218LA 2HULA 3TXFA 1B5YA 1ZYTA 3UONA 115LA 1DXJA 1QTZA 175LA 4WM4A 188LA 1FLQA 220LA 244LA 1YL0X 5KY1A 1EQ4A 4N1EI 1P36A 3HBHA 2RB2X 1CU2A 1JTOL 1FLYA 1UICA 246LA 4XN6A 3EO5A 1GWDA 1L15A 2BQGA 1GBXA 156LA 1CKDA 3M3UA 3L2XA 4G4BA 1P5CA 5HMJA 111LA 228LA 4GLAA 1J1OY 1ALCA 1AM7A 1LZ9A 1L44A 4B4JA 1QT6A 4RW2A 1LKRA 177LA 152LA 1L99A 1LWGA 1RJCB 4W53A 4RLNA 5B06A 8LYZA 3GUOA 1XEIA 4NFVA 137LA 1TLAA 1WQNA 3B6LA 3DMZA 1QUHA 3EBAB 5LVHA 1D0MA 1UCOA 233LA 4DT3A 1LYSA 1V7TA 4H8XA 1GAYA 213LA 1DZBX 3LZ2A 2DKVA 4I7QA 3C7ZA 1L85A 114LA 1LJFA 1CJ9A 2O79A 4DD9A 3FI5A 1IR7A 5FELA 4W55A 4NSHA 1C6TA 1LZ1A 1A2YC 4W96A 198LA 1LKSA 2GV0A 4WO6A 4ARLA 2LYZA 3ATOA 209LA 4CFPA 3SB9A 1B5WA 5KXNA 1LYOA 4WLDA 2YBJA 3C80A 5EBHA 4NSJA 4WMGA 3WH1A 1FKVA 139LA 3HBEX 5B1GA 1PQIA 1L0KA 3GUPA 3IWRA 1IOCA 4H9BA 1PQJA 5B07A 200LA 2MEHA 4HTKA 2XJWA 1LZDA 1DYFA 1LSGA 2HEDA 2RBOA 1VEDA 1L54A 4TSCA 5C6JA 4L41A 9LYZA 4H9CA 1C62A 3HBDA 4EKPA 1WQPA 4LYBA 1CKFA 1OWZA 2IFFY 1LCNA 1C68A 1EQEA 1GFRA 7LZMA 5C6IA 1T3PA 3GXRA 1C6MA 1L55A 1WQQA 1FLUA 1C67A 2XBSA 2HEBA 5ILCA 4U3XB 1ZURA 238LA 2H9KA 1AKIA 4Z98A 2OTZX 3K2RA 4OWHA 1GHLA 5LAFA 1L36A 3DN0A 3HUQA 1L73A 1CJ6A 1BGIA 1QS5A 3DN2A 4G4HA 3T36A 3NY8A 1GF9A 1G1VA 1GB0A 1LSPA 178LA 1LJKA 2BQKA 1GE1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IP5 A;  182L A;  2EQL A;  4YEM A;  1VAT A;  5I4W A;  1C60 A;  1QS9 A;  2Z18 A;  245L A;  1GF5 A;  2RBR A;  1OVH A;  4ETC A;  1L10 A;  1LHJ A;  1GB7 A;  2ANV A;  1GDW A;  1UC0 A;  5F14 A;  1GFA A;  5HNL A;  1GFG A;  1BWH A;  1SQ2 L;  149L A;  1GF0 A;  3F9L A;  127L A;  4EKS A;  2BQI A;  131L A;  3HTB A;  1INU A;  2ZWB A;  1J1X Y;  1KNI A;  2YDG A;  1IR9 A;  1L01 A;  2PC2 A;  4WM1 A;  2OTY X;  4B49 A;  2ZQ3 A;  1LZN A;  4BAD A;  3DN8 A;  1HER A;  1LYF A;  4W56 A;  3HDF A;  5KXM A;  3FAD A;  1G1W A;  1BQL Y;  1XJT A;  168L A;  1L20 A;  2B70 A;  3OJP A;  1L76 A;  2B74 A;  5KXT A;  1CNS A;  3PDS A;  191L A;  1QDT A;  1YIL A;  2DQD Y;  5HMV A;  1YAN A;  4NG1 A;  5FST A;  1JJ0 A;  4WG7 A;  1LW9 A;  4N9R A;  4XJF A;  1LYI A;  3HTF A;  1P2L A;  4H8Z A;  4ML7 A;  4H94 A;  1B7O A;  3JR6 A;  2RBN A;  4ZPU A;  1QSW A;  2W1M A;  1UA6 Y;  118L A;  3RU5 A;  2LZT A;  3HH6 A;  4HV2 A;  2BQH A;  1DPX A;  1WVU A;  4PK0 A;  1FN5 A;  4LT1 A;  5FHW A;  1C43 A;  1FBI X;  4OOT A;  2W1L A;  144L A;  4J7V A;  1T6V L; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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