3C7ZA

T4 lysozyme mutant d89a/r96h at room temperature
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYASLDAVRHCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Contributions of all 20 amino acids at site 96 to the stability and structure of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteriophage t4
total genus 54
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3c7zA00
3HTGA 1KW5A 3C7YA 1C6FA 1CVKA 1L03A 3V2WA 3DN1A 1C6QA 1LYDA 199LA 1OVKA 1K28A 3NY8A 1G0MA 1DYEA 1L94A 3HT7A 4EKRA 186LA 2B72A 1G1VA 4I7TA 1C61A 3HU9A 137LA 3DN2A 1L81A 3SB8A 220LA 3HUKA 2F32A 1L73A 2ANXA 189LA 2QARC 123LA 1QTZA 5LZMA 1L87A 1LYHA 1CX7A 3GUNA 1L25A 1P7SA 1C6HA 1C65A 1L11A 3C83A 2LZMA 3FI5A 1QT5A 1C67A 2B7XA 1SSYA 234LA 4ZPUA 1QTVA 1T8AA 1KY0A 1QTBA 1T8GA 1L64A 4I7NA 1L20A 1QT8A 155LA 2OU0X 200LA 192LA 1QTHA 1G0QA 160LA 1C6DA 3SB5A 1LWGA 1QTDA 1L24A 1OYUA 1C6JA 3DN3A 148LE 4I7KA 2OTZX 231LA 217LA 3GUIA 128LA 1G0LA 1OV5A 1L04A 162LA 230LA 1L79A 2RBNA 3DKEX 1L38A 2F47A 2B70A 1D3JA 4ARJA 102LA 1QSQA 205LA 3ODUA 4IAPA 1QS5A 3HU8A 4W59A 1WTHA 1D3FA 1L39A 107LA 4EJ4A 3VW7A 1C6IA 185LA 4DJHA 1JTNA 1C6TA 180LA 1JTMA 1LI2A 232LA 1C6EA 1L28A 4LDEA 1C6MA 1LPYA 3GUJA 1L89A 4DAJA 3HUQA 1LGXA 1L97A 3SB9A 3CDRA 4EPIA 1L51A 1LGUA 1L30A 4GBRB 1L92A 2NTGA 1DYGA 4ARMB 1SX7A 1TLAA 1I6SA 2OE4X 1C6NA 201LA 1L01A 1L85A 3C7ZA 141LA 4S0WA 1QSBA 2L78A 2LCBA 4ARMA 2B75A 175LA 1LYFA 104LA 1NHBA 3F9LA 1QUGA 223LA 2OE9X 1QT3A 1L35A 4I7RA 1L69A 4PJZA 103LA 2CUUA 1SWZA 254LA 3L64A 1L16A 2O7AA 249LA 3HH5A 2OE7X 1XEPA 2B74A 6LZMA 2B6TA 3NY9A 1L95A 4E97A 1L26A 4AQNA 3HT8A 3RZEA 4I7PA 110LA 1G06A 3OE9A 4GRVA 4W56A 2Q9EA 3LZMA 3HH3A 197LA 1LYEA 1L29A 4W55A 4LDOA 4YXCA 1PQJA 3G3WA 3HT9A 1L80A 4I7JA 1OWYA 4W54A 2OTYX 3DMXA 3SBAA 1OVJA 4W51A 171LA 157LA 1L34A 211LA 1PQIA 127LA 259LA 3DNAA 156LA 1L56A 176LA 3G3XA 4W58A 1P56A 4I7MA 1G07A 1KW7A 1QT7A 3SBBC 163LA 1PQKA 1QT4A 120LA 144LA 1P2RA 1L76A 244LA 3HH4A 1KNIA 1CU6A 1CV6A 3JR6A 238LA 1KY1A 209LA 3D4SA 4EKSA 2HULA 142LA 2RH1A 1G0PA 196LA 198LA 4I7OA 1QTCA 2IGCA 2O4WA 4EKPA 3DN6A 4LZMA 1L08A 1T97A 1L93A 5I14A 1L86A 1CX6A 1L33A 1L44A 1L71A 233LA 1L13A 1L96A 2RAZX 1DYCA 3GUKA 152LA 1L05A 4PK0A 1L46A 1LYGA 1L55A 4I7QA 1L23A 1CV1A 1JQUA 3C82A 3OE0A 1L17A 149LA 1G0GA 1L53A 235LA 2RBPA 1D9WA 243LA 182LA 3FA0A 239LA 4ARQB 206LA 3C8SA 1CUPA 1L10A 2A4TA 1C63A 3NYAA 1L65A 187LA 1L09A 2RAYX 3UONA 1L70A 1L0JA 1L91A 1G0JA 1P2LA 3OE6A 131LA 1QT6A 2HUMA 2B6YA 221LA 4YXAC 1C66A 177LA 114LA 3CDOA 214LA 1DYFA 2ANVA 1L19A 2LC9A 1LYJA 1L21A 1ZURA 4DKLA 250LA 1L27A 118LA 1LYIA 3HWLA 1SWYA 1L63A 255LA 1L0KA 1L12A 1L18A 236LA 4W52A 109LA 145LA 215LA 1L22A 1PQMA 125LA 159LA 1P3NA 111LA 1P64A 1L74A 1L37A 1P5CA 1C69A 195LA 3GUMA 138LA 1CV3A 237LA 261LA 129LA 1L59A 2O79A 1T8FA 2B73A 1LLHA 1C6KA 3CDVA 2NTHA 1T6HA 1L57A 1G0KA 2B6ZA 2Q9DA 3HUAA 4ARPA 3HTBA 183LA 1QUHA 2RBOA 1L58A 3HTDA 1L40A 3HDFA 2F2QA 7LZMA 4EXMA 252LA 3L2XA 1XJUA 212LA 1L49A 4I7LA 1C6GA 1P37A 147LA 3F8VA 240LA 151LA 213LA 1SSWA 1L32A 1L88A 161LA 1D3NA 1L90A 256LA 258LA 2RB2X 2RBSA 1L60A 170LA 257LA 3HTFA 1L68A 3HH6A 1L07A 3V2YA 168LA 210LA 3SN6R 1P46A 178LA 3G3VA 4ARLA 1D2YA 229LA 218LA 1PQOA 1L83A 115LA 1L15A 143LA 1CU0A 1QUDA 1ZWNA 173LA 1C60A 139LA 3DN0A 2OU9A 1CV5A 2Z6BA 1L47A 1L45A 1C6BA 1L02A 169LA 4YX7C 242LA 2RB0X 1LW9A 164LA 190LA 2B6XA 225LA 224LA 112LA 1QS9A 1LI3A 188LA 3PDSA 1G1WA 247LA 2B6WA 174LA 1L48A 253LA 1L67A 1L66A 262LA 3GUOA 1CU5A 1DYBA 3HT6A 1CV4A 1P36A 146LA 166LA 1LWKA 1L77A 2RBQA 3C81A 4K5YA 191LA 222LA 1SX2A 1L36A 3GULA 1C6PA 3CDQA 1CU3A 181LA 130LA 1KS3A 1L00A 3C8RA 3DN8A 3DMVA 3K2RA 1ZYTA 1CV0A 3GUPA 108LA 1D2WA 1OVHA 1L52A 1C6AA 119LA 1CU2A 2QB0B 1L75A 3CDTA 246LA 1L31A 3C7WA 4ARQA 1B6IA 3RUNA 167LA 2OEAX 1LGWA 1PQDA 158LA 1L50A 1L14A 1L98A 3DN4A 150LA 4OO9A 113LA 3SB7A 1L72A 165LA 4W57A 4W53A 1DYDA 3QAKA 126LA 3HDEA 1LI6A 2OU8A 1D3MA 1C62A 1C6LA 1DYAA 216LA 122LA 4LDLA 1QUOA 1C6CA 184LA 1EPYA 1L54A 1CUQA 219LA 3OE8A 3EMLA 3C8QA 4EKQA 1OV7A 3SB6A 1P6YA 226LA 1C64A 1L62A 1CTWA 3FADA 1L43A 1OWZA 4EPFA 140LA 3DMZA 245LA 227LA 3PBLA 1L41A 2RBRA 1C68A 1XJTA 1L82A 172LA 1L42A 1L06A 2HUKA 2RB1X 4I7SA 1L61A 260LA 3C80A 248LA 1L99A 1L84A 241LA 228LA 251LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4D9ZA 3WXUA 1LYOA 132LA 1IP3A 1HF4A 1C6QA 1AM7A 1OVKA 1D0KA 4HTQA 1G0MA 1DYEA 1L94A 1LZBA 2HUBA 4XJFA 1G1VA 4I7TA 1C61A 1LOZA 3WU7A 1B0DA 3WUMA 1H6MA 2I6ZA 2F32A 1IWWA 4PRUA 1IC7Y 189LA 4PJ2C 1BB7A 1LJNA 123LA 4G4BA 4OOOA 3FI5A 1KIQC 1QT5A 2DQIY 3GXRA 5DLAA 4GN4A 5LVIA 3BKHA 4LYOA 1SSYA 4GCCA 1QTVA 1TBYA 4N9RA 1OUCA 4HTKA 1HEOA 5E4PA 3D3DA 2DQFC 1G0QA 1VDPA 4NWHA 1IWTA 4XN6A 5HQ1A 1C6JA 3DN3A 4KT3A 1GF7A 3OK0A 231LA 1F6SA 2DQDY 3WUNA 1IR8A 3KAMA 1V7TA 230LA 5AMYA 2BQOA 1BHZA 2F47A 1UC0A 2B70A 4A7DA 1I20A 3CSQA 3QY4A 3CT0A 4IAPA 1QUSA 4B49A 3LZ2A 4M4OA 3W6EA 1L39A 4NHPA 4EJ4A 3VW7A 1C6IA 185LA 1C6TA 5IDDA 1PZYA 1GE0A 1GEZA 3A34A 4B1AA 1LGXA 3N9AA 4CJ2A 4EPIA 4H94A 1GBZA 1L30A 1DYGA 2CGIA 2Z2FA 1C6NA 201LA 2OE4X 1B7SA 1OUBA 2BQLA 4DT3A 141LA 1IORA 1GFUA 1QSBA 1VDSA 2B75A 1NHBA 2YBHA 4I7RA 103LA 254LA 5APCA 4DWXA 2BQCA 5I53A 3L64A 4N5RA 1QDTA 3HH5A 4XADA 3P66A 2B6TA 5LYMA 1BVKC 1L95A 1L26A 1B5VA 3HT8A 3AW6A 1MLCE 4GRVA 4QY9A 3TXKA 3LHMA 4DQ5A 1NMMA 2BQHA 1L29A 1PQJA 4H9IA 1EQ4A 1I1ZA 1LSMA 3TXGA 1GB9A 1LSAA 171LA 157LA 2XTHA 211LA 5F14A 2EQLA 3FI7A 1OUJA 1GF5A 1LJJA 5II3A 1IR7A 1YQVY 4I7MA 3A3QA 4ETBA 2BQAA 4YEOA 3TMVA 144LA 244LA 5KXPA 1CU6A 1CV6A 1HERA 1P2CC 238LA 4XJBA 1G0PA 2W1MA 1G7HC 4G49A 2BQEA 3WU9A 2IGCA 1GFKA 2O4WA 4QEQA 1HEPA 1CX6A 1L33A 1L71A 5IHGA 1L13A 1O23A 1GDWA 5FEKA 1L46A 1OUAA 4J0LA 1L55A 1JQUA 2MEBA 2RBPA 1I56A 4WOAA 206LA 5I5QA 2A4TA 1C63A 2AUBA 3NYAA 3OJPA 6LYZA 3B0KA 4LYCA 1L91A 1YROA 1NDMC 4H9AA 1XGQC 4YXAC 1C66A 177LA 1DI4A 4NHQA 1L19A 2LC9A 2MEGA 1LPIA 1LHIA 1CJ9A 250LA 1GBYA 4WM2A 1JJ1A 2HTXA 1L63A 4G4CA 2BQBA 3P65A 1L18A 109LA 4NGYA 1D6PA 1P64A 2G4NA 1L74A 1SLYA 3A92A 1LSCA 1WVUA 1L59A 4XJGA 2O79A 1T8FA 3TXDA 1C6KA 4Z41A 4LT0A 1LZ5A 4GN3A 1LZ9A 4IASA 1CJ8A 1UA6Y 1UIHA 2YBLA 4AGAA 2F2QA 4I7LA 1C6GA 1VEDA 240LA 5A3ZA 1B7OA 5JENB 1GFEA 1YKXX 213LA 4TTDA 1DPXA 1GF0A 1GBWA 161LA 4LGKA 1D3NA 1L60A 5B06A 3LN2A 3ATOA 5KXXA 1LHKA 3V2YA 4OW1A 168LA 210LA 178LA 1UIDA 1LHMA 5EBHA 1YAOA 5F9UA 1L83A 3AZ6A 4YENA 2FYDA 1UIBA 1CU0A 1QUDA 4W96A 1C60A 139LA 1A4VA 4N1EI 1LZ4A 1L45A 5LA8A 4LFPA 169LA 1LW9A 1V7SA 164LA 2B6XA 3N9EA 1ALCA 1CV4A 1LMPA 2MEEA 146LA 2XQOA 4K5YA 1SX2A 3TXFA 1LZ6A 1C6PA 1FBIX 3EBAB 3C8RA 3G3AB 2VB1A 1D0LA 1D2WA 1C6AA 1QQYA 4DD2A 1WTMA 4TX7A 2MEDA 1B6IA 1CJ6A 4LYTA 1OUFA 1PQDA 4I0CA 1L50A 5KY1A 1L98A 4KPMA 3DN4A 150LA 3SB7A 1DPWA 1IIZA 1GB6A 1L72A 165LA 3QAKA 1C7PA 126LA 3HDEA 1F10A 1QSWA 3EO5A 4WO9A 1C62A 1DYAA 1JIYA 5K7OA 1GB2A 184LA 1L54A 1CUQA 2H5ZA 3OE8A 1VDQA 1OV7A 1WQRA 1EL1A 4GLAA 1C64A 1ZV5L 1L62A 1B2KA 3AGHA 5C6JA 1JUGA 4E3UA 4EPFA 1IO5A 227LA 1L41A 172LA 4GCFA 2DBTA 1HHLA 5KXYA 2D6BA 241LA 5B59A 4LZTA 3BKVA 1H87A 3HTGA 3QNGA 3TXHA 1C6FA 1L03A 4GCDA 1IOTA 3G3BB 3TXBA 1ZMYL 1LJIA 1K28A 4EKRA 2LHMA 1VAUA 3HU9A 1NHEA 1L81A 3WVYA 4WM5A 2ANXA 4WL7A 3CT1A 2QARC 5LZMA 1L87A 1CX7A 1L25A 4J1AA 3C83A 3WPKA 1IC5Y 1C67A 1IEEA 2BPUA 2CWIA 3CSZA 2B7XA 1FKQA 1IWYA 234LA 3WPLA 5ILCA 1T8AA 1KY0A 1T8GA 1L64A 5J7CA 155LA 2OU0X 194LA 6LYTA 2WARA 1C6DA 2I25L 3P4ZA 4UWNA 1QUTA 4H93A 1OYUA 1YKZX 4YOPA 4I7KA 3A93A 1GE1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4D9Z A;  3WXU A;  1LYO A;  132L A;  1IP3 A;  1HF4 A;  1C6Q A;  1AM7 A;  1OVK A;  1D0K A;  4HTQ A;  1G0M A;  1DYE A;  1L94 A;  1LZB A;  2HUB A;  4XJF A;  1G1V A;  4I7T A;  1C61 A;  1LOZ A;  3WU7 A;  1B0D A;  3WUM A;  1H6M A;  2I6Z A;  2F32 A;  1IWW A;  4PRU A;  1IC7 Y;  189L A;  4PJ2 C;  1BB7 A;  1LJN A;  123L A;  4G4B A;  4OOO A;  3FI5 A;  1KIQ C;  1QT5 A;  2DQI Y;  3GXR A;  5DLA A;  4GN4 A;  5LVI A;  3BKH A;  4LYO A;  1SSY A;  4GCC A;  1QTV A;  1TBY A;  4N9R A;  1OUC A;  4HTK A;  1HEO A;  5E4P A;  3D3D A;  2DQF C;  1G0Q A;  1VDP A;  4NWH A;  1IWT A;  4XN6 A;  5HQ1 A;  1C6J A;  3DN3 A;  4KT3 A;  1GF7 A;  3OK0 A;  231L A;  1F6S A;  2DQD Y;  3WUN A;  1IR8 A;  3KAM A;  1V7T A;  230L A;  5AMY A;  2BQO A;  1BHZ A;  2F47 A;  1UC0 A;  2B70 A;  4A7D A;  1I20 A;  3CSQ A;  3QY4 A;  3CT0 A;  4IAP A;  1QUS A;  4B49 A;  3LZ2 A;  4M4O A;  3W6E A;  1L39 A;  4NHP A;  4EJ4 A;  3VW7 A;  1C6I A;  185L A;  1C6T A;  5IDD A;  1PZY A;  1GE0 A;  1GEZ A;  3A34 A;  4B1A A;  1LGX A;  3N9A A;  4CJ2 A;  4EPI A;  4H94 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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