3OJPA

D52n mutant of hen egg white lysozyme (hewl)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTNYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title D52N Mutant of Hen Egg White Lysozyme (HEWL)
rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ojpA00
4LT0A 3B0OA 4H94A 2HEDA 4M6DA 1XEKA 1C45A 4IJ4A 5FSTA 4OOTA 1REYA 2CJLA 4TWSA 3ZVQA 5KXTA 1ZVHL 4P2EA 4PHIA 4LYOA 1F6RA 1HNLA 1YANA 2C8OA 1QDTA 1CNSA 1GB7A 2HTXA 3W6EA 1GHLA 1P2CC 1H6MA 1OUFA 1LJGA 4WL7A 1JTTL 1RE2A 1VDPA 3HBEX 4TTDA 2W1LA 3TXGA 1C10A 1IR7A 4Z41A 4KT3A 4XJFA 4B4JA 1I1ZA 1UIHA 3RNXA 3W6BA 1VDQA 1UIFA 5J7CA 1YAQA 1LJJA 1YKZX 4QGZA 3WVXA 1GDWA 4OWBA 3WULA 4GN3A 1EQ5A 1YROA 2DQEY 3W6DA 1GF4A 2GV0A 4NGOA 2FYDA 2MEHA 1A2YC 1D0LA 4XENA 4HTNA 5A3EA 8LYZA 1HF4A 4RW2A 4NWEA 1YKYX 1LZAA 4PPOA 5C6LA 1YILA 5HMJA 2ZIJA 3GXRA 1AZFA 1GPQC 2BQNA 4H92A 2HEAA 5E9RA 4NEBA 4LFXA 1E8LA 1IC7Y 4UWNA 4OWAA 5FCPA 1YAMA 1GE3A 1KXXA 4HV2A 3TXJA 3WUMA 1LKRA 5KKJA 1BWJA 1HEQA 3TXBA 1AT5A 3RZ4A 5F9XA 1IOCA 4LT1A 4B1AA 1D6QA 1LSBA 2FYCA 1LZBA 1CKGA 5LVGA 1BVXA 5DM9A 1XFPL 4N1CC 1LMCA 2F2NA 1LJ3A 1LJFA 4B4IA 3LYOA 5KY1A 2BQFA 1YIKA 1RJCB 5IDDA 4H9EA 5I54A 1LZ8A 1Z55A 4GCBA 1QSAA 3AGHA 1JSFA 1IP3A 2LHMA 4PRUA 4N9RA 1UIEA 4DC4A 3B0KA 1REZA 3WPJA 1GAYA 1LSDA 1OUDA 1XEIA 1LJHA 5FHWA 2HECA 1TBYA 4ET9A 4II8A 1NQIA 4WLTA 1LMOA 3QE8A 3OK0A 4NFVA 4R0FA 4H9FA 1LZYA 4ZEEA 2F4GA 5KXLA 3AGGG 3HBHA 1B7SA 1T3PA 2IFFY 1YL1X 3EBAB 5DN4A 1IC5Y 1DXJA 3ULRA 1FLQA 4UWVA 4Z46A 1GEZA 3B6LA 4H8ZA 4PJ2C 1HEWA 3LN2A 2DQAA 4XJIA 4H9IA 1LSNA 2Z39A 1LMPA 1NDMC 1HSWA 3P65A 4LYTA 4DDCA 1ALCA 1LJIA 2EQLA 3G3AB 1VFBC 2WARA 4GLVA 4HPEA 4WG1A 1JISA 1G7MC 3WUAA 3CSQA 1BWHA 3A90A 5D5FA 4ET8A 1PZYA 3WMKA 1LTMA 3QY4A 3SP3A 4H9AA 3A3QA 1V7TA 1TCYA 2BQJA 3W3EA 1JKAA 2LYZA 1WTMA 1IP4A 1HEMA 4HV1A 2MEEA 3WXTA 4CHXA 5M1YA 4FDYA 3W6CA 4DD3A 5F81A 1JKCA 1HELA 2G4QA 3B72A 2BLYA 3T36A 1HC0A 1GBXA 1C43A 1GDXA 1LZ9A 1OUHA 1IY3A 2HU3A 1WTNA 2A7FA 5HNLA 1LYZA 4FJRA 4HP0A 5KXYA 1YAOA 1B7RA 1YQVY 1HFXA 1I20A 4RDSA 5HNCA 4DD2A 2BQLA 2LYMA 5JENB 3WVYA 1CKCA 1LHLA 1OUIA 1UIGA 4J1BA 1LZDA 1FLWA 1CKFA 4DDBA 1LZ5A 2MEAA 4G49A 1B7PA 207LA 2DQDY 4NGJA 2BQKA 1LHIA 4NGWA 4X3BA 1QUSA 2RSCA 2NWDX 4EOFA 4GCCA 4XN6A 1B0DA 3CSRA 1CJ6A 3CB7A 5I4XA 1OUGA 4CGEA 5KXZA 2MEDA 1GFHA 4ETAA 3WL2A 4NG8A 1GBWA 2VB1A 2YBNA 1JHLA 3W6FA 1IWWA 1LHJA 4ZFPA 3LYZA 4HPIA 1UBZA 1JITA 2ZILA 4XJGA 4YEOA 5L3HA 5ILFA 1GB8A 4ETDA 4NGKA 5LAFA 5KXWA 5B05A 4NHQA 1H87A 1LKSA 1REXA 4D9ZA 2B5ZA 2DQHY 2YBJA 1G7IC 4H8YA 4NSHA 1XGRC 2X0AA 5C6JA 4J7VA 4CJ2A 4NGLA 3HFMY 2BQDA 1GFTA 1GFRA 1BGIA 1LSGA 1DZBX 1KIQC 4BS7A 3CT5A 2EPEA 4GN5C 1MLCE 2ZWBA 4NHIA 5KXXA 3TXDA 2MEFA 3ZEKA 1JWRA 3WUNA 3TMUA 4DDAA 3ZVQB 1GB5A 1EL1A 2Z38A 1LMQA 4W96A 1ZV5L 5HLLA 1GBOA 4DD7A 1WQMA 4G4BA 1IORA 1GE1A 2D4KA 1BB5A 1TAYA 1GXXA 4HJZA 3AJNA 4B4EA 1CKDA 2XJWA 3A93A 1B7OA 4LYCA 5APFA 1G7JC 1GB9A 1LSPA 5IELA 1DPWA 1LYSA 4J0LA 1GAZA 4LZTA 2W1YA 4MCKA 4NG1A 1INUA 2EIZC 5C6IA 4H91A 2CGIA 5L9JA 3MGWA 1GFVA 1GB0A 2HEFA 1LHKA 4H9BA 4A7DA 3B0IA 4RW1A 4ETBA 1GWDA 154LA 1LZSA 1LPIA 1JUGA 2G4PA 1N4FA 2ZQ3A 1GFAA 1REMA 4GN4A 4MSTA 4N8ZA 5LIOA 5HQ1A 4NHTA 3A96A 4B0DA 1NWGA 3N9AA 1B7LA 4LGKA 1UC0A 1GFUA 1RCMA 2MEGA 5FELA 3IJVA 5KXOA 4HJYA 3AZ7A 2AUBA 3D3DA 4NIJA 5FEKA 3TXEA 4ANRA 1OUAA 1IOQA 7LYZA 1IC4Y 4QEQA 5KXSA 4WM3A 3P4ZA 1GF7A 1ZMYL 4YEMA 3K3TA 4WM5A 1BB7A 2LZTA 4H1PA 4WL6A 2H9JA 3TXFA 1LZRA 2FBDA 4WM2A 1HHLA 1B7NA 2BQAA 4NSJA 4G4CA 1ZVYB 4OWCA 5LINA 1LZNA 3AGIA 4LT2A 5F16A 1DI5A 4WMGA 4N5RA 1BHZA 1JKBA 1JJ0A 1LSZA 1LMTA 1LZTA 4LYMA 3EO5A 4NY5A 4WG7A 1OQMA 2HUBA 1QTKA 1B5YA 2A7DA 4TX7A 1LZEA 1LOZA 1WVVA 2HEBA 3A34A 1DKKA 4TUNA 3CQLA 4BAFA 2MEBA 1HEPA 1FDLY 1LZGA 4YOPA 4I8SA 5B59A 4KXIA 1IP5A 5ILCA 2YVBA 4I0CA 2BAAA 1IWXA 1GF3A 3M3UA 1CKHA 2Y8PA 1DQJC 1UIDA 2Z2EA 1AT6A 5KKIA 1W6ZA 3CSZA 1JJ1A 2D91A 3WPKA 2Q0MX 4OWEA 4HSFA 2HU1A 2N5ZA 4U3XB 3BKHA 1IY4A 1F10A 4MR1A 4TSCA 1B2KA 1T6VL 4LFPA 2F30A 4DD1A 1QIOA 3WH1A 1IR8A 1B5ZA 1W08A 5AMYA 4BADA 2DQGY 4J1AA 1CJ8A 4CFOA 1OUEA 1PS5A 1LZCA 1JTOL 1BQLY 4WM6A 4ETCA 4H90A 4WM4A 1UCOA 1LHHA 2D4JA 2ZIKA 3F6ZA 1FKVA 1SQ2L 1BB6A 2I25L 2PC2A 3LZ2A 4N0JA 1IP1A 4OW1A 1GB2A 4Z3MA 1IO5A 4XYYA 3FI7A 1OUJA 153LA 1OUBA 1GF6A 1IVMA 5T3FA 4DWXA 4WM1A 1GBZA 1LMAA 1DI4A 1LZ6A 2D4IA 3GXKA 4DD0A 1CJ7A 4R6CA 1TEWA 2CWIA 1WQQA 4LYBA 5F9UA 1QQYA 4E3UA 4DYGA 3A67Y 3WW6A 1IP7A 1VATA 2BQGA 2FBBA 2ZNXY 3AZ5A 1GFJA 1BB3A 1B7QA 4KL7A 4XJHA 4KPMA 193LA 4C5FA 1EQEA 1GB3A 3A3RX 3N9EA 1F6SA 2BQMA 3CT0A 2YBHA 1A4VA 3WW5A 2YSSC 133LA 4G4HA 2HEEA 5DN5A 3ATOA 4OOOA 1IR9A 1IP6A 1HERA 2YBIA 4PRQA 2MECA 3A91A 1G7HC 4AGAA 5IHGA 2BQEA 5LA5A 1WQOA 2G4NA 4C3WA 1UA6Y 5LYTA 3M18B 5I53A 1O23A 1FN5A 1FLYA 2EKSC 3ATNA 1LSAA 1IWUA 2Z18A 6LYTA 5B1GA 5LAGA 1VAUA 1IP2A 2H5ZA 1OP9B 5LYZA 1LJEA 3RT5X 1D6PA 4H93A 1EQ4A 4H9HA 1C46A 3E3DA 3AW6A 2CDSA 2W1MA 5I5QA 4G9SA 3TMVA 1CJ9A 2YDGA 2Z12A 3LZTA 2I6ZA 4HTKA 4NHPA 4NGZA 4WLDA 4GCFA 1LHMA 4YF2A 1QSWA 1AM7A 1LCNA 5EBHA 3P66A 5KXPA 1XGPC 1YAPA 1DKJA 1HFYA 4NSIA 1UUZC 2C8PA 4QDNA 1SLYA 2ZYPA 3IJUA 1B7MA 1NBYC 1NMMA 2F4AA 5KXKA 2ZQ4A 1WVUA 4IASA 3VWOA 1UIBA 9LYZA 1KXYA 1WQNA 1NKHA 2BPUA 3BKVA 1KIPC 3T6UA 3D9AC 4WLXA 3AZ6A 5LXWA 1DPXA 4LYZA 5D5CA 1B5UA 4H8XA 4YM8A 1HFZA 4QY9A 1QTEA 1NDGC 2BQCA 1GEVA 3LYMA 3WXUA 5I4YA 1B5XA 1GF9A 2Z2FA 1HEOA 1IOSA 1WQRA 5LVJA 1QUTA 3CT1A 2YBMA 3W6AA 1FBIX 1HENA 1B5WA 4GLAA 1D0KA 1LAAA 3WPLA 1LYYA 5APCA 4Z98A 1JIYA 3J6KA 1DI3A 3TXIA 2DQCY 3LYTA 1LJNA 4DT3A 1IWVA 3P64A 1IWTA 4XADA 4L41A 4HTQA 1LZ1A 5KXRA 1AKIA 4NHSA 2IHLA 1B9OA 1KIRC 2MEIA 1LSCA 5LVKA 1GE4A 3IWRA 4RLNA 5E4PA 1RI8B 5KXMA 1GFGA 1VEDA 4BAPA 3KAMA 4XJDA 5K7OA 1BWIA 1GBYA 5HMVA 2W1XA 2H9KA 4NSGA 2BQHA 1KXWA 1FLUA 1IOTA 1IEEA 4WO9A 1LZ4A 4NWHA 4GCDA 2LYOA 4TSBA 4HJVA 1HMKA 4RLMA 1YKXX 4UWUA 5I4WA 132LA 3G3BB 5B06A 3WYHA 1UIAA 4WLYA 3HBDA 1J1OY 3EXDA 2ZYCA 4GCEA 1OUCA 1JPOA 1B5VA 4NGYA 4ZIXA 1NF5A 1XEJA 3J4GA 4O34A 4AXTA 1GF0A 3RU5A 5A3ZA 1XGTC 4H9CA 4IATA 1RFPA 1LSEA 3A94A 1LSMA 1NBZC 5APEA 208LA 1JKDA 1VDTA 4EMNA 2BLXA 4YENA 2DQIY 1YL0X 5II3A 194LA 2BQIA 3AZ4A 2DKVA 3AB6A 3OJPA 4PGJB 4W94A 3RW8A 4DD9A 1GE2A 3N9CA 3AW7A 1WQPA 1GB6A 3A95A 3EMSA 1BVKC 1XSFA 4OWHA 1QDRA 4WOAA 6LYZA 2YBLA 1HSXA 1IWYA 1TDYA 1JJ3A 2BQOA 2DQFC 2DQJY 2Z37A 5KXNA 5LA8A 4ETEA 134LA 5FDJA 1LSYA 1I56A 4NGIA 3QNGA 1XGQC 1NHEA 3WU8A 3A6CY 1HMLA 1J1XY 1VDSA 1GD6A 5APDA 1BB4A 3LHMA 5LYMA 1GFEA 1F0WA 5B07A 1UACY 3TMXA 2ZNWY 3TMWA 3FE0A 1GBSA 1D9UA 5F14A 5L3IA 1LJKA 4LT3A 5B1FA 1LJ4A 1JEFA 4WO6A 3TXKA 1GF5A 1UICA 1JTPL 2LZ2A 3A92A 1J1PY 1GFKA 1LMNA 3A6BY 2DBTA 5LVIA 4N1EI 2XBSA 1LSFA 3WU9A 3A8ZA 5LVHA 4XJBA 1IX0A 1V7SA 1C7PA 1JSEA 2I26L 2XBRA 3TXHA 5KJ9A 3P68A 5DL9A 1XGUC 4M4OA 4CFPA 1IWZA 1C08C 4B49A 1LYOA 1FKQA 1MELL 4NGVA 1GXV2 2XTHA 1GE0A 1G7LC 3AYQA 2BQBA 4ML7A 3WU7A 2Z19A 135LA 5DLAA 1IIZA 1D0MA 2D6BA 1GF8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L51A 1G0MA 1XEKA 4IJ4A 5FSTA 3ZVQA 4P2EA 3CDTA 1F6RA 1HNLA 1YANA 2C8OA 4I7KA 4LDLA 1CNSA 3RZEA 1H6MA 1CUQA 1JTTL 4TTDA 1CUPA 1UIHA 1VDQA 1UIFA 3WVXA 4OWBA 3W6DA 1DYDA 1HF4A 4RW2A 1L12A 4NWEA 5HMJA 3GXRA 1LYGA 5I14A 1L76A 2BQNA 109LA 5E9RA 1E8LA 1L60A 1YAMA 3TXJA 3VW7A 1AT5A 5F9XA 4LT1A 1L57A 243LA 1CTWA 1LPYA 1L39A 1CKGA 1BVXA 1L11A 1LJ3A 1LJFA 2BQFA 1Z55A 1IP3A 4N9RA 3WPJA 162LA 1REZA 1GAYA 1OUDA 4ET9A 4YX7C 4H9FA 188LA 3HBHA 1IC5Y 232LA 1FLQA 1L61A 4H8ZA 249LA 2DQAA 4H9IA 2Z39A 164LA 3HDEA 4ARQA 4DDCA 1SWYA 2EQLA 4HPEA 3CSQA 4ET8A 1XJTA 1L71A 1LTMA 1G1VA 4H9AA 2BQJA 3W3EA 2LYZA 3HH5A 3HT8A 2B70A 2B6ZA 4CHXA 3W6CA 5F81A 1JKCA 3T36A 4LZMA 1L62A 1HC0A 1C43A 1IY3A 4ARQB 1D3NA 248LA 4FJRA 1B7RA 1L43A 3JR6A 5JENB 1OV5A 1CKCA 185LA 3WVYA 1FLWA 1CKFA 1LZ5A 4G49A 207LA 3SB9A 4X3BA 2NWDX 4EOFA 1B0DA 3CSRA 3CB7A 4I7SA 5KXZA 1G0LA 1GFHA 2B72A 2YBNA 3PDSA 3W6FA 4PK0A 2QARC 5LAFA 1H87A 148LE 1P7SA 2DQHY 2YBJA 1G7IC 2X0AA 1L83A 3HFMY 1GFRA 1CV4A 1KIQC 3CT5A 1MLCE 3ZEKA 1JWRA 4DDAA 1GB5A 1ZV5L 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4LT0 A;  3B0O A;  4H94 A;  2HED A;  4M6D A;  1XEK A;  1C45 A;  4IJ4 A;  5FST A;  4OOT A;  1REY A;  2CJL A;  4TWS A;  3ZVQ A;  5KXT A;  1ZVH L;  4P2E A;  4PHI A;  4LYO A;  1F6R A;  1HNL A;  1YAN A;  2C8O A;  1QDT A;  1CNS A;  1GB7 A;  2HTX A;  3W6E A;  1GHL A;  1P2C C;  1H6M A;  1OUF A;  1LJG A;  4WL7 A;  1JTT L;  1RE2 A;  1VDP A;  3HBE X;  4TTD A;  2W1L A;  3TXG A;  1C10 A;  1IR7 A;  4Z41 A;  4KT3 A;  4XJF A;  4B4J A;  1I1Z A;  1UIH A;  3RNX A;  3W6B A;  1VDQ A;  1UIF A;  5J7C A;  1YAQ A;  1LJJ A;  1YKZ X;  4QGZ A;  3WVX A;  1GDW A;  4OWB A;  3WUL A;  4GN3 A;  1EQ5 A;  1YRO A;  2DQE Y;  3W6D A;  1GF4 A;  2GV0 A;  4NGO A;  2FYD A;  2MEH A;  1A2Y C;  1D0L A;  4XEN A;  4HTN A;  5A3E A;  8LYZ A;  1HF4 A;  4RW2 A;  4NWE A;  1YKY X;  1LZA A;  4PPO A;  5C6L A;  1YIL A;  5HMJ A;  2ZIJ A;  3GXR A;  1AZF A;  1GPQ C;  2BQN A;  4H92 A;  2HEA A;  5E9R A;  4NEB A;  4LFX A;  1E8L A;  1IC7 Y;  4UWN A;  4OWA A;  5FCP A;  1YAM A;  1GE3 A;  1KXX A;  4HV2 A;  3TXJ A;  3WUM A;  1LKR A;  5KKJ A;  1BWJ A;  1HEQ A; 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 4O34 A;  4AXT A;  1GF0 A;  3RU5 A;  5A3Z A;  1XGT C;  4H9C A;  4IAT A;  1RFP A;  1LSE A;  3A94 A;  1LSM A;  1NBZ C;  5APE A;  208L A;  1JKD A;  1VDT A;  4EMN A;  2BLX A;  4YEN A;  2DQI Y;  1YL0 X;  5II3 A;  194L A;  2BQI A;  3AZ4 A;  2DKV A;  3AB6 A;  3OJP A;  4PGJ B;  4W94 A;  3RW8 A;  4DD9 A;  1GE2 A;  3N9C A;  3AW7 A;  1WQP A;  1GB6 A;  3A95 A;  3EMS A;  1BVK C;  1XSF A;  4OWH A;  1QDR A;  4WOA A;  6LYZ A;  2YBL A;  1HSX A;  1IWY A;  1TDY A;  1JJ3 A;  2BQO A;  2DQF C;  2DQJ Y;  2Z37 A;  5KXN A;  5LA8 A;  4ETE A;  134L A;  5FDJ A;  1LSY A;  1I56 A;  4NGI A;  3QNG A;  1XGQ C;  1NHE A;  3WU8 A;  3A6C Y;  1HML A;  1J1X Y;  1VDS A;  1GD6 A;  5APD A;  1BB4 A;  3LHM A;  5LYM A;  1GFE A;  1F0W A;  5B07 A;  1UAC Y;  3TMX A;  2ZNW Y;  3TMW A;  3FE0 A;  1GBS A;  1D9U A;  5F14 A;  5L3I A;  1LJK A;  4LT3 A;  5B1F A;  1LJ4 A;  1JEF A;  4WO6 A;  3TXK A;  1GF5 A;  1UIC A;  1JTP L;  2LZ2 A;  3A92 A;  1J1P Y;  1GFK A;  1LMN A;  3A6B Y;  2DBT A;  5LVI A;  4N1E I;  2XBS A;  1LSF A;  3WU9 A;  3A8Z A;  5LVH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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