230LA

T4 lysozyme mutant m6l
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFELLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Context-dependent protein stabilization by methionine-to-leucine substitution shown in T4 lysozyme.
pubmed rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 230lA00
212LA 4GRVA 1L89A 3DMZA 1QTDA 4W51A 5I14A 3GUKA 1QTCA 1G0GA 144LA 1D3JA 151LA 3L64A 118LA 173LA 4PJZA 1L53A 168LA 3DN6A 1L61A 1L49A 110LA 3HTGA 1C6CA 176LA 2RBQA 157LA 1L47A 1L16A 1PQMA 1C6FA 216LA 1DYFA 1PQOA 201LA 1CV4A 1L31A 230LA 3L2XA 2B73A 3SN6R 1L08A 1QTHA 1L72A 226LA 1CU6A 1L80A 1L39A 1G1WA 1CV0A 1L45A 3HU9A 178LA 1G0LA 1L96A 1L93A 1L92A 239LA 4EKQA 1QSBA 1L37A 3C81A 1KNIA 3DN0A 3F8VA 1L29A 1C65A 1L95A 111LA 224LA 1PQKA 2B6YA 3D4SA 1DYBA 2OU8A 1L58A 213LA 4I7KA 1SSYA 1C6AA 3CDRA 1L44A 4W59A 122LA 162LA 1CUQA 2A4TA 1L86A 3HT6A 244LA 4IAPA 3GULA 189LA 1D2WA 3SBAA 1D2YA 1PQIA 1L02A 3ODUA 3HH4A 1L59A 1I6SA 3G3WA 2B74A 1PQJA 3FA0A 4ZPUA 211LA 1G1VA 231LA 1LW9A 4S0WA 1DYGA 1C6KA 4W57A 3SBBC 142LA 1L12A 1LYDA 4YX7C 1P2LA 1DYDA 2ANVA 225LA 1D9WA 258LA 3C7ZA 2B75A 161LA 2RB0X 1L52A 3DN4A 1L82A 169LA 4YXCA 139LA 1L77A 249LA 1L34A 2F2QA 3C8QA 156LA 223LA 3HT7A 1P7SA 1L69A 1L32A 1D3MA 1L64A 191LA 1L40A 3GUMA 2RB2X 1L73A 3DN8A 1L55A 252LA 170LA 3DKEX 1L22A 143LA 2HULA 3NY8A 175LA 1L0JA 3HH5A 126LA 1L85A 3HUAA 229LA 4PK0A 1L84A 1KW7A 3PDSA 1L87A 1L17A 3FI5A 1L05A 159LA 2O79A 4I7MA 218LA 180LA 247LA 2RB1X 3C7YA 2OU0X 1DYAA 1C6JA 3OE9A 3SB5A 1QT6A 1KY0A 259LA 3HTFA 1L75A 260LA 1CV6A 1CU3A 2OE9X 3DMXA 2LC9A 1OVJA 104LA 4W53A 3GUPA 4ARMB 4EKRA 251LA 3C8SA 1QTVA 2B72A 220LA 1LYHA 3HH6A 242LA 1QT4A 1L03A 2OE7X 158LA 240LA 2OU9A 123LA 1L09A 120LA 4AQNA 1QTZA 1L74A 1L00A 1LYGA 1L42A 1SWYA 1L97A 2L78A 257LA 3HUKA 4ARLA 221LA 119LA 1C67A 1P46A 205LA 1L48A 1LYFA 198LA 1LGWA 2B70A 130LA 3HTBA 1C6BA 1C6DA 1L76A 3LZMA 227LA 183LA 1JTMA 4EPIA 1LYIA 199LA 3HT9A 3PBLA 4K5YA 232LA 149LA 2LZMA 1T6HA 1OWYA 2QARC 4I7RA 1G0QA 4I7QA 261LA 1L98A 1C6QA 219LA 1T97A 1G07A 233LA 1L27A 1C63A 3VW7A 4ARQA 167LA 1P56A 1QT5A 131LA 182LA 1L10A 2RH1A 1C6MA 200LA 1PQDA 1QTBA 3CDOA 4DAJA 112LA 1SX2A 2B6XA 3HWLA 1C6GA 3SB9A 3G3VA 1L24A 2OEAX 146LA 256LA 1L41A 1L14A 1L04A 2IGCA 1CUPA 3HTDA 160LA 1CU0A 2Z6BA 107LA 1CU5A 155LA 3RUNA 1ZURA 3C83A 209LA 3DN2A 1C66A 4W55A 3C80A 171LA 129LA 2Q9EA 3HU8A 1C6TA 184LA 1TLAA 3K2RA 1C61A 1L63A 250LA 1C6NA 1L65A 1T8GA 152LA 1CX7A 1K28A 1L90A 1EPYA 1SX7A 4OO9A 228LA 1JTNA 3HT8A 3GUJA 1LWGA 147LA 3EMLA 3C82A 1C6HA 1G0KA 1KY1A 1G0MA 1CV3A 1QUHA 4ARPA 195LA 1DYCA 3OE0A 2OE4X 2LCBA 3V2YA 1OVKA 4LZMA 248LA 1NHBA 7LZMA 210LA 215LA 2NTHA 3FADA 1L38A 1L19A 245LA 1C68A 217LA 1L94A 1L66A 148LE 1G06A 4E97A 3F9LA 4W58A 1LGUA 3CDVA 1P37A 4ARQB 102LA 4GBRB 1L57A 6LZMA 4I7LA 3GUIA 1P2RA 1LYEA 137LA 214LA 2B6ZA 2ANXA 1L01A 1QUGA 2RBOA 4I7SA 114LA 2O4WA 3NY9A 3SB6A 1LWKA 1QUDA 1LLHA 4DJHA 1CV5A 1L99A 222LA 1C6LA 1L46A 2Q9DA 164LA 1P3NA 1L21A 4EJ4A 3UONA 2F47A 1SWZA 115LA 3C7WA 1L36A 4EPFA 166LA 4I7JA 1B6IA 2RBNA 2RBPA 128LA 181LA 165LA 1G0JA 2RAYX 1CVKA 2RAZX 4ARJA 2B7XA 4EKSA 1OV5A 1T8FA 196LA 3CDQA 4LDOA 163LA 262LA 1G0PA 2NTGA 4LDEA 1DYEA 1SSWA 241LA 1QT3A 4ARMA 2RBRA 4LDLA 5LZMA 1OVHA 1XJTA 1D3NA 3JR6A 1P5CA 1P6YA 1L81A 4I7NA 1L67A 1LGXA 192LA 1L91A 1CTWA 237LA 1C64A 3HDFA 1CV1A 1KS3A 190LA 4W56A 3V2WA 1L30A 1C69A 1L60A 2B6WA 1XJUA 236LA 1L33A 1C6IA 1L54A 1LYJA 103LA 3HDEA 1WTHA 3RZEA 1CU2A 3DN3A 3G3XA 1P36A 3DNAA 3OE8A 1T8AA 185LA 174LA 1L70A 238LA 4DKLA 1L51A 1D3FA 109LA 1P64A 3HH3A 1L23A 3NYAA 1QSQA 1C6EA 1KW5A 127LA 4I7PA 172LA 3DN1A 1OYUA 1L56A 2F32A 3QAKA 1L0KA 197LA 2OTZX 1QS9A 2O7AA 1JQUA 4I7OA 1QT8A 3C8RA 1L13A 1L79A 3CDTA 1L15A 1L83A 140LA 113LA 145LA 1OWZA 234LA 2CUUA 206LA 3OE6A 1L25A 1L62A 1L88A 1L20A 177LA 1L06A 3GUNA 235LA 188LA 141LA 1QT7A 3HUQA 3DMVA 1ZWNA 254LA 255LA 4W52A 4EXMA 1L68A 2OTYX 2RBSA 150LA 1QS5A 3SB7A 1L71A 4YXAC 1C6PA 243LA 3SB8A 187LA 4W54A 186LA 108LA 1L28A 3GUOA 1L18A 1LPYA 2B6TA 253LA 1XEPA 1C62A 4I7TA 1L07A 1LI3A 2QB0B 246LA 1ZYTA 125LA 4EKPA 2HUKA 1L43A 1L11A 1C60A 1L26A 1CX6A 1QUOA 1OV7A 138LA 1L50A 1LI6A 1L35A 1LI2A 2HUMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HP0A 4GRVA 4DD2A 3DMZA 1HEQA 1EL1A 3L64A 5KXPA 168LA 1TEWA 3DN6A 2BQMA 5IHGA 1C6CA 3A93A 134LA 1GFHA 1D0KA 3EBAB 201LA 5B1FA 1LJJA 4HJVA 193LA 1HERA 1BWHA 1CU6A 1L39A 1LJKA 1WQQA 4HPIA 2B5ZA 1L45A 3HU9A 1G0LA 1L93A 239LA 1QSBA 3C81A 2YVBA 111LA 2G4PA 4H1PA 1AT6A 1B2KA 2OU8A 4GCFA 1JISA 1C6AA 3IJVA 1OUBA 2HUBA 1GHLA 2A4TA 2XTHA 2Z39A 3HFMY 1GF7A 3HT6A 4PJ2C 3WW6A 1QIOA 1IWVA 3SBAA 1V7TA 1L02A 3WVXA 1LZ6A 1OUHA 1JITA 1UIEA 4S0WA 4NHQA 5KXLA 1IC7Y 3SBBC 142LA 1LYDA 4NFVA 4YX7C 5LYZA 4NGZA 169LA 1I1ZA 4YXCA 139LA 249LA 2ZNXY 4AXTA 207LA 1G7LC 2N5ZA 4P2EA 1L69A 4EMNA 5E4PA 2IHLA 4OWHA 191LA 1L40A 2RB2X 3CT0A 4NGJA 3K3TA 4OW1A 3NY8A 3HUAA 1GFEA 1W6ZA 1BB3A 1CKGA 1KW7A 1L05A 2O79A 5I5QA 4DC4A 2RB1X 1LZCA 1QT6A 1PZYA 1KY0A 259LA 2LYOA 4LT2A 1CV6A 1LZNA 4LYTA 1HFXA 2RSCA 3HH6A 1IC5Y 1RFPA 1HC0A 4X3BA 3A67Y 123LA 1CKHA 3LHMA 2L78A 3ULRA 1LJIA 1NDGC 1P46A 2YBLA 2MEAA 1L48A 2MEBA 1LYFA 4XJIA 1LMPA 1GF0A 4NGKA 4ML7A 4PRQA 1C6BA 1C6DA 3P65A 3LZMA 4EPIA 1LOZA 4J7VA 199LA 3TXJA 3HT9A 2BQDA 3VWOA 5I4XA 5LAFA 1OWYA 1IWZA 2QARC 4B4EA 1G0QA 3CSRA 1C6QA 1BB7A 1QDRA 3B0OA 4HSFA 1C63A 3WUNA 167LA 1P56A 4DQ7A 182LA 1LTMA 3FE0A 5LVGA 1C6MA 2LHMA 200LA 3B0IA 5KJ9A 3EXDA 2B6XA 1YILA 4GLVA 1L24A 146LA 1LZ5A 4DD7A 4WG1A 1IOCA 4HTNA 1T3PA 1GE0A 1NWGA 1D9UA 160LA 2Z6BA 1CU5A 1ALCA 3RUNA 5D5FA 3EMSA 1LZGA 1GXV2 209LA 4W94A 5L3IA 4DD0A 3C80A 3A6CY 4PGJB 3HU8A 1QTEA 3K2RA 4NWHA 1C6NA 1T8GA 5AMYA 1SX7A 1GBYA 3EMLA 4WO9A 1HMKA 4ARPA 4GN5C 3V2YA 1OVKA 1IOSA 3OJPA 215LA 3FADA 4TSBA 1OUJA 1L19A 4YM8A 2ZYPA 217LA 148LE 4NIJA 1G06A 1IWTA 4NGWA 1LGUA 5A3ZA 1GF5A 1P37A 4NSHA 4ARQB 102LA 4GBRB 1GWDA 2BPUA 1P2RA 4GCDA 4NGVA 137LA 2ZYCA 4I7SA 1LSGA 3SB6A 1QUDA 1BVKC 1REXA 1L99A 3W6FA 3A8ZA 1IP7A 1C45A 1SLYA 2Y8PA 1LSZA 2Q9DA 1WVVA 2F47A 1SWZA 115LA 1UIDA 4EPFA 1YKYX 166LA 3TXDA 181LA 3LYOA 2RAYX 1CVKA 2DQGY 4OOOA 4HV1A 2B7XA 1T8FA 1DYEA 1QT3A 2RBRA 3QE8A 5LVIA 1LYSA 4AGAA 4NHPA 1L67A 1O23A 3WPKA 1L91A 1C64A 1KS3A 1L30A 1C69A 1L60A 2B6WA 1RI8B 1LSEA 1C6IA 4WLTA 1CJ6A 1NBZC 1GB0A 4LT3A 4XJHA 1LHKA 4GCEA 4H91A 3NYAA 1KW5A 127LA 1GFUA 172LA 3DN1A 1OYUA 1L56A 2F32A 2ZQ3A 2BQCA 3A34A 1LHHA 5APCA 2DQCY 1YAOA 5APFA 5LINA 1HNLA 1JQUA 5KXSA 1QT8A 1L79A 2HEDA 145LA 206LA 177LA 1L06A 3WU9A 141LA 2IFFY 5LYMA 1C43A 4CHXA 3A94A 5L3HA 1JEFA 2DQEY 5LXWA 1L68A 2OTYX 4LYCA 4FDYA 2RBSA 1QS5A 3SB7A 3J6KA 1C6PA 1VDPA 1AM7A 4W54A 108LA 4QEQA 1LMAA 1OUCA 4I7TA 4Z3MA 1GBWA 4BAFA 4ZEEA 1ZYTA 4LYBA 4XN6A 4EKPA 2BQJA 2HUKA 1L26A 4H93A 1LSDA 2G4QA 1LI2A 2YBIA 2HUMA 1IOQA 1QTDA 4TWSA 1DPWA 144LA 1UA6Y 1D3JA 1LSCA 4D9ZA 1BWIA 1L49A 1L61A 5LVKA 1YAMA 2F2NA 1PQOA 4GCBA 2BQHA 4FJRA 3L2XA 3A6BY 3SN6R 2HEAA 2HU1A 1L72A 1BB4A 226LA 1JTPL 1KIPC 5KKIA 2ZILA 5KXMA 1B7LA 4G4BA 2EKSC 1L96A 1L92A 4H94A 5HMVA 1L37A 1C7PA 5F9UA 1KNIA 2MEFA 3AGHA 3DN0A 1KIRC 1C65A 2GV0A 4G4CA 3WUAA 4OWCA 4I0CA 3D4SA 1CKDA 4ETBA 5KXWA 4I7KA 1LPIA 3CDRA 4TTDA 1HFYA 5DLAA 3TXHA 1PQIA 2BQBA 3HH4A 1L59A 3G3WA 2B74A 1KXYA 3ATNA 1PQJA 1G1VA 4XJGA 231LA 1JJ1A 1DYGA 1C08C 2F4GA 4W57A 1P2LA 1J1XY 3N9EA 4LGKA 1LJGA 5B05A 3GXRA 2B75A 161LA 2RB0X 3TXIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4HP0 A;  4GRV A;  4DD2 A;  3DMZ A;  1HEQ A;  1EL1 A;  3L64 A;  5KXP A;  168L A;  1TEW A;  3DN6 A;  2BQM A;  5IHG A;  1C6C A;  3A93 A;  134L A;  1GFH A;  1D0K A;  3EBA B;  201L A;  5B1F A;  1LJJ A;  4HJV A;  193L A;  1HER A;  1BWH A;  1CU6 A;  1L39 A;  1LJK A;  1WQQ A;  4HPI A;  2B5Z A;  1L45 A;  3HU9 A;  1G0L A;  1L93 A;  239L A;  1QSB A;  3C81 A;  2YVB A;  111L A;  2G4P A;  4H1P A;  1AT6 A;  1B2K A;  2OU8 A;  4GCF A;  1JIS A;  1C6A A;  3IJV A;  1OUB A;  2HUB A;  1GHL A;  2A4T A;  2XTH A;  2Z39 A;  3HFM Y;  1GF7 A;  3HT6 A;  4PJ2 C;  3WW6 A;  1QIO A;  1IWV A;  3SBA A;  1V7T A;  1L02 A;  3WVX A;  1LZ6 A;  1OUH A;  1JIT A;  1UIE A;  4S0W A;  4NHQ A;  5KXL A;  1IC7 Y;  3SBB C;  142L A;  1LYD A;  4NFV A;  4YX7 C;  5LYZ A;  4NGZ A;  169L A;  1I1Z A;  4YXC A;  139L A;  249L A;  2ZNX Y;  4AXT A;  207L A;  1G7L C;  2N5Z A;  4P2E A;  1L69 A;  4EMN A;  5E4P A;  2IHL A;  4OWH A;  191L A;  1L40 A;  2RB2 X;  3CT0 A;  4NGJ A;  3K3T A;  4OW1 A;  3NY8 A;  3HUA A;  1GFE A;  1W6Z A;  1BB3 A;  1CKG A;  1KW7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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