156LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFANSLAMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 156lA00
3OE8A 4ARPA 1L52A 230LA 2F47A 2OU9A 3CDTA 2Q9EA 1L71A 3C7YA 260LA 1L63A 1L68A 4EPIA 1B6IA 4DAJA 4W54A 165LA 1I6SA 1CU0A 4I7NA 170LA 1LWKA 4ZPUA 2O4WA 1C60A 1L16A 178LA 3L64A 1KY0A 195LA 4ARJA 1C6MA 1DYEA 1ZYTA 1T6HA 167LA 1SWZA 213LA 236LA 233LA 4AQNA 4W55A 1L84A 227LA 1L09A 4LZMA 1QTZA 1L17A 1L38A 122LA 125LA 1QUOA 2HUKA 219LA 1L06A 2OE9X 2OU0X 3DN3A 1C67A 130LA 257LA 3SN6R 1XJTA 1LWGA 146LA 1CUPA 221LA 3HT7A 235LA 4EJ4A 1L65A 1L58A 3SB7A 1OV5A 1LYJA 1L99A 1L18A 1L39A 1P37A 226LA 1LGXA 217LA 245LA 2B72A 3NYAA 126LA 3F9LA 4YXCA 3EMLA 2LCBA 1P56A 3CDVA 3DMVA 4I7SA 2O79A 1JTMA 5I14A 1L27A 1L00A 3L2XA 113LA 2HUMA 1L42A 3C8RA 4EKQA 1PQJA 247LA 3HTBA 3LZMA 1T8FA 1L35A 1LPYA 1CTWA 1L37A 1L07A 3QAKA 4OO9A 118LA 1D2YA 190LA 1G0LA 3UONA 2B74A 2QARC 1L73A 1QT3A 2QB0B 1C61A 3JR6A 1C6PA 1L97A 2B75A 1L88A 1C69A 3DN2A 3F8VA 1L53A 241LA 3DN6A 1LYEA 1QTHA 1DYBA 198LA 1CV6A 1L0KA 1P46A 1ZURA 3HUAA 1L96A 3V2WA 1NHBA 4LDEA 4E97A 1L32A 3HTFA 164LA 149LA 3HU8A 1L28A 3FA0A 4DJHA 1L03A 1P3NA 205LA 4GRVA 4S0WA 3C80A 192LA 4EKRA 185LA 3SB9A 3GUKA 3HT6A 1C68A 1C6AA 184LA 231LA 248LA 1DYGA 103LA 1L44A 3HH3A 183LA 1L45A 3HH5A 4W52A 151LA 1L23A 1C6DA 1L90A 1P36A 201LA 1L74A 1G1WA 1L75A 1L04A 137LA 1QT7A 1T97A 1C6KA 220LA 1L69A 1L77A 1L66A 240LA 1QT6A 3GUNA 3HTDA 182LA 1PQIA 2B70A 2ANXA 238LA 1CV4A 172LA 2LZMA 1L13A 3FADA 1QUGA 1DYDA 1KW5A 1CVKA 3DN4A 157LA 249LA 1LYGA 1L89A 1L50A 3OE6A 4EXMA 2B6WA 2RH1A 242LA 211LA 2F32A 1L01A 1L47A 1P6YA 3DN0A 1OYUA 160LA 3SB6A 1JQUA 2RBOA 2RAZX 1KS3A 232LA 104LA 1L94A 4IAPA 159LA 3SB5A 1C6BA 3OE9A 123LA 1C66A 4PK0A 1C6FA 181LA 1LW9A 1KNIA 1LGUA 1L85A 3GUIA 4W51A 3C8QA 256LA 3DNAA 210LA 1L31A 3C7WA 3C81A 180LA 2OEAX 3GUOA 4I7JA 1C65A 1T8GA 1PQMA 196LA 1L24A 3ODUA 1C63A 1LI2A 1CV1A 218LA 3CDRA 1L79A 1C6GA 3G3VA 1LLHA 253LA 3C8SA 3HUQA 2RBQA 212LA 176LA 4I7MA 1PQKA 250LA 1C6HA 1P64A 2OE7X 186LA 175LA 177LA 162LA 1SX7A 2RAYX 166LA 1SSWA 1L92A 1C6JA 1L15A 1L36A 4LDLA 4W53A 2OTZX 2OTYX 3GUMA 155LA 2IGCA 222LA 161LA 1C6TA 1G0GA 251LA 4K5YA 2LC9A 4YX7C 127LA 102LA 2NTGA 3K2RA 1G06A 156LA 1L19A 1G0MA 114LA 1C6QA 252LA 173LA 1C64A 4I7LA 1L29A 1L91A 246LA 1LYHA 1L22A 107LA 1SX2A 3V2YA 6LZMA 4EKPA 3HU9A 228LA 7LZMA 1L30A 2RBSA 2B73A 1XEPA 4GBRB 5LZMA 1L10A 1PQOA 1QT5A 1QT8A 1OVJA 2RB1X 3SBAA 1QTVA 4ARMA 1QSBA 2RB2X 112LA 2CUUA 115LA 1L40A 243LA 3VW7A 129LA 1L41A 4W58A 3C82A 111LA 3HH6A 4EKSA 3HH4A 1L70A 3CDOA 2RBNA 3DMZA 1G0JA 2Z6BA 259LA 3NY9A 3HDEA 1L25A 3OE0A 1L83A 1PQDA 187LA 1CU6A 4W56A 1L57A 1OWYA 3FI5A 4ARQA 1C6IA 140LA 1L49A 1QS9A 1L11A 1D3NA 110LA 1D3JA 2B6ZA 3D4SA 1L0JA 237LA 3GUPA 1QTDA 2L78A 4W57A 1D3FA 1D9WA 3HWLA 1L20A 1P2RA 145LA 1LYDA 3HUKA 2B6XA 1CU5A 1L61A 1G1VA 1CX7A 108LA 225LA 1L33A 147LA 3HTGA 144LA 1L76A 1L86A 3DN1A 131LA 1L82A 3HDFA 1JTNA 234LA 1LI6A 1G0PA 1CU3A 1D3MA 1L81A 1QS5A 1L43A 1L26A 1L34A 1OWZA 2ANVA 3RUNA 1OVHA 1L05A 4I7KA 1L54A 3PDSA 174LA 4I7RA 1CV5A 2OE4X 1G0QA 239LA 1LI3A 3CDQA 138LA 1G07A 109LA 1CV0A 1L64A 4I7PA 1CUQA 1OV7A 4YXAC 128LA 261LA 4I7QA 152LA 2RBRA 191LA 1K28A 1L56A 1L46A 188LA 1L95A 1L51A 197LA 1KY1A 3HT9A 4PJZA 1QUHA 169LA 1CV3A 1QSQA 200LA 3DN8A 255LA 1L98A 1XJUA 139LA 3GULA 214LA 3SBBC 2A4TA 120LA 1L62A 209LA 4DKLA 1QTBA 1C6CA 3NY8A 1L59A 1G0KA 2B7XA 1LYIA 229LA 1ZWNA 1TLAA 1L80A 3C83A 2RBPA 1P2LA 3DMXA 262LA 1L72A 224LA 142LA 4I7OA 258LA 1C6LA 1EPYA 254LA 2RB0X 4W59A 1L55A 3RZEA 1P5CA 141LA 1L67A 4ARMB 3G3WA 3PBLA 1LYFA 215LA 1L48A 4LDOA 2OU8A 1DYAA 1CX6A 119LA 3SB8A 1L02A 4I7TA 244LA 1WTHA 1L12A 1L21A 1L60A 2B6TA 1C6EA 1P7SA 1L93A 3HT8A 1QUDA 171LA 1DYFA 2B6YA 206LA 1L87A 3G3XA 4ARQB 1DYCA 2NTHA 168LA 223LA 1CU2A 1C6NA 143LA 148LE 1T8AA 1QT4A 1L08A 158LA 1QTCA 1L14A 2F2QA 1SWYA 216LA 4EPFA 189LA 2Q9DA 1D2WA 1OVKA 1C62A 3DKEX 4ARLA 3GUJA 2O7AA 1KW7A 2HULA 3C7ZA 1LGWA 199LA 150LA 1SSYA 163LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TMWA 1BB4A 2OU9A 3D3DA 2Q9EA 1LZ5A 165LA 3M18B 1I6SA 1LWKA 4LFXA 2O4WA 1C60A 3IWRA 2BLYA 1BB7A 3L64A 4ARJA 1IP7A 4G4CA 1VAUA 1SWZA 213LA 1LKSA 3WW6A 4AQNA 5ILCA 1QTZA 1L17A 1LJ4A 3DN3A 2OU0X 1FN5A 5LXWA 3TMVA 5LVIA 1CUPA 5D5CA 4TWSA 4ETEA 1L65A 1OUHA 4H9HA 1YKXX 1C45A 1L99A 7LYZA 4B4JA 3NYAA 4YXCA 1IR9A 4I8SA 1TAYA 4H9EA 1QIOA 1IVMA 2HUMA 1LYYA 1B7QA 1GWDA 4EKQA 4HSFA 1T8FA 1D6PA 1LPYA 5APDA 4OO9A 2Z38A 118LA 3HBEX 1G0LA 3W3EA 3EMSA 1W6ZA 1C6PA 3CSRA 3DN2A 241LA 3DN6A 1LYEA 2BQHA 1MELL 1L0KA 1B5UA 1NHBA 3ZEKA 3HTFA 2YBIA 1L28A 2BQBA 4GN5C 1P3NA 2I25L 3C80A 3G3BB 3SB9A 3GUKA 5AMYA 1DPWA 1LHMA 1GFTA 2YBJA 103LA 5KXTA 5DN4A 1IR7A 1L45A 3QE8A 4NHTA 3HH5A 4W52A 1V7TA 2ZQ3A 1C6DA 201LA 4DD7A 1FLYA 5ILFA 2HU1A 137LA 6LYTA 1C6KA 220LA 1L66A 1QT6A 3GUNA 4DQ7A 1L13A 1QUGA 5B06A 1CJ6A 1KW5A 3P68A 1CVKA 157LA 1IP6A 1L89A 2IHLA 211LA 2F32A 4O34A 1L47A 4XYYA 1GBYA 1LKRA 1B5XA 1WQPA 2RBOA 3LZ2A 3RZ4A 4IAPA 1C6BA 1GBSA 1KNIA 1L85A 4W51A 5HNLA 256LA 2ZIJA 2OEAX 2FBBA 1C65A 1T8GA 4RW2A 3LZTA 1CV1A 1ZVHL 1BQLY 1L79A 1LLHA 5HMVA 3C8SA 1HFXA 2BQJA 4NY5A 1LZ8A 1XGPC 4Z41A 1LMOA 3FE0A 1W08A 1P64A 2OE7X 1UACY 1DI4A 1XGQC 3P66A 1IP2A 3AZ5A 3IJVA 1OUFA 1GF7A 1D0LA 1C6JA 1EQEA 3LYMA 4WM5A 5APCA 5FDJA 1BB6A 161LA 1DKKA 2LC9A 1F6RA 127LA 102LA 1N4FA 4ETCA 1WVVA 1LSBA 5LVHA 3K3TA 4OW1A 114LA 1LJEA 1GXV2 1SX2A 2DQEY 1GFGA 4W94A 3V2YA 6LZMA 4EKPA 5FSTA 1LHJA 7LZMA 3A91A 2XJWA 1PQOA 1FKQA 3B0OA 1OQMA 1QT8A 1OVJA 2RB1X 1B2KA 1QTVA 4ARMA 1TCYA 1QSBA 112LA 1FLWA 2CUUA 1L40A 1JJ3A 1REZA 5L9JA 3C82A 1WTMA 4DC4A 1GDWA 3HH4A 3CDOA 4CGEA 1LAAA 5A3ZA 3NY9A 4DD1A 1GB6A 1PQDA 187LA 1CU6A 2LHMA 4ML7A 1WQRA 1IIZA 1B7PA 110LA 1D3JA 2B6ZA 237LA 1D9UA 2L78A 1GFJA 4TUNA 1P2RA 1RCMA 2B6XA 1L61A 4AGAA 108LA 3GXRA 4MR1A 1GDXA 4ETAA 4NIJA 1GF5A 2XTHA 1B0DA 1BB3A 4ANRA 1L82A 4WOAA 3HDFA 1JTNA 1B7NA 2G4PA 1WQMA 1JISA 3WUMA 4YM8A 3MGWA 1L34A 1C10A 1UIAA 4TX7A 1IORA 239LA 1LI3A 3CDQA 1GB2A 109LA 1LMAA 4HTNA 4UWNA 1L64A 4I7PA 3EO5A 4AXTA 1JPOA 4I7QA 2HU3A 2RBRA 4LFPA 1C46A 1L95A 197LA 5LA5A 4CHXA 169LA 1QSQA 4J0LA 1IWXA 4B1AA 2H5ZA 1L62A 5KXXA 4OWCA 3NY8A 1L59A 3TMUA 1UIBA 1ZWNA 2DQHY 1TLAA 2BAAA 4HPEA 3DMXA 4E3UA 1VDPA 2RB0X 1L55A 1LYOA 3N9AA 2YBHA 1L67A 1LMTA 3AZ6A 3F6ZA 4KT3A 5HNCA 3HBDA 4I7TA 3W6EA 244LA 1B5YA 4ZFPA 1L60A 1L93A 5E9RA 3HT8A 1BGIA 3A3QA 1HEMA 4OOTA 5APFA 1LZSA 1CU2A 1UIHA 148LE 4EMNA 1GBOA 158LA 1FLUA 1QTCA 3E3DA 1GF9A 2Q9DA 3AW6A 4FDYA 5LVJA 1J1PY 1KXYA 1MLCE 1OVKA 4NGIA 150LA 1HEOA 2D4KA 1XGTC 1LSGA 1CKCA 3TXGA 4HJVA 1L52A 230LA 2F47A 3CDTA 3C7YA 4EPIA 1OP9B 1B6IA 1HEPA 5LVGA 4DAJA 4UWVA 4WM1A 2CWIA 3TXFA 2ZQ4A 4QEQA 4WLTA 1GB9A 4BAPA 2BQDA 1DYEA 1BVKC 1JSFA 236LA 4XJIA 4W55A 227LA 2EKSC 4LZMA 5KXRA 1QUOA 2HUKA 1H6MA 4A7DA 219LA 4Z46A 2OE9X 257LA 146LA 1CKFA 221LA 3HT7A 2BLXA 4H8ZA 235LA 4EJ4A 1L58A 3SB7A 1GF4A 133LA 1L39A 1P37A 3WXUA 226LA 217LA 3F9LA 2W1MA 3ZVQB 1XEKA 4LT2A 2O79A 1L27A 3L2XA 4CJ2A 3C8RA 1PQJA 1JJ1A 1L35A 4NGJA 3A93A 4XJBA 1F10A 4LYZA 1L37A 1L07A 1D2YA 190LA 3UONA 4J1AA 4WO9A 2DQJY 1QT3A 2QB0B 1IR8A 1L97A 2B75A 2ZWBA 1L88A 5DLAA 3WUNA 4XJDA 1XGUC 1HFYA 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4X3BA 1GB3A 4H8YA 1LJHA 4G9SA 1E8LA 3OE0A 1L83A 1LHHA 4CFPA 2DBTA 1O23A 1JTPL 1L57A 4WG1A 1HMLA 1C6IA 140LA 1HFZA 1L49A 1IP4A 1D3NA 2Z18A 3VWOA 3HBHA 3WXTA 1D9WA 1B5WA 1LPIA 145LA 1LYDA 1IC4Y 1CX7A 2I6ZA 1B7MA 225LA 1QDTA 2FYCA 1HEQA 2MEEA 2A7DA 144LA 1HELA 2YBNA 1L86A 131LA 1UBZA 1GFKA 5EBHA 1D3MA 3CT5A 1F6SA 4LYBA 2BQEA 1XGRC 1L05A 1L54A 4I7RA 1GE3A 1GAYA 207LA 2BQNA 1AZFA 1OV7A 4YXAC 5JENB 1XEJA 4DDCA 1ALCA 5KXMA 4II8A 208LA 1YAQA 191LA 1L56A 1L46A 1TDYA 5FELA 4PJZA 1GB7A 200LA 3OK0A 4OWAA 255LA 3ATOA 1A4VA 139LA 3SBBC 2C8OA 4WLDA 120LA 1LZRA 1C6CA 4IJ4A 4MSTA 4WM6A 3AGGG 1YKZX 4YENA 1P2LA 1L72A 3ZVQA 4I7OA 1LJFA 2YSSC 254LA 1EPYA 4W59A 2WARA 1P5CA 1LSAA 4PPOA 141LA 5KJ9A 3LYTA 3PBLA 4C3WA 215LA 1L48A 3ATNA 1LJNA 2OU8A 1FLQA 1CX6A 1GF6A 2B5ZA 4GCDA 1LZ9A 1G7MC 4J1BA 4IATA 4U3XB 4BAFA 1QUDA 3G3XA 2B6YA 1LHLA 1DYCA 2NTHA 4WLYA 143LA 1QT4A 2HECA 1DZBX 4EPFA 216LA 1JSEA 4D9ZA 3A6CY 1LMNA 2VB1A 4NSIA 1IO5A 3SP3A 2G4NA 2Z12A 3AW7A 1JWRA 1VFBC 1GBXA 260LA 1L63A 4GN4A 154LA 4DWXA 1TEWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3TMW A;  1BB4 A;  2OU9 A;  3D3D A;  2Q9E A;  1LZ5 A;  165L A;  3M18 B;  1I6S A;  1LWK A;  4LFX A;  2O4W A;  1C60 A;  3IWR A;  2BLY A;  1BB7 A;  3L64 A;  4ARJ A;  1IP7 A;  4G4C A;  1VAU A;  1SWZ A;  213L A;  1LKS A;  3WW6 A;  4AQN A;  5ILC A;  1QTZ A;  1L17 A;  1LJ4 A;  3DN3 A;  2OU0 X;  1FN5 A;  5LXW A;  3TMV A;  5LVI A;  1CUP A;  5D5C A;  4TWS A;  4ETE A;  1L65 A;  1OUH A;  4H9H A;  1YKX X;  1C45 A;  1L99 A;  7LYZ A;  4B4J A;  3NYA A;  4YXC A;  1IR9 A;  4I8S A;  1TAY A;  4H9E A;  1QIO A;  1IVM A;  2HUM A;  1LYY A;  1B7Q A;  1GWD A;  4EKQ A;  4HSF A;  1T8F A;  1D6P A;  1LPY A;  5APD A;  4OO9 A;  2Z38 A;  118L A;  3HBE X;  1G0L A;  3W3E A;  3EMS A;  1W6Z A;  1C6P A;  3CSR A;  3DN2 A;  241L A;  3DN6 A;  1LYE A;  2BQH A;  1MEL L;  1L0K A;  1B5U A;  1NHB A;  3ZEK A;  3HTF A;  2YBI A;  1L28 A;  2BQB A;  4GN5 C;  1P3N A;  2I25 L;  3C80 A;  3G3B B;  3SB9 A;  3GUK A;  5AMY A;  1DPW A;  1LHM A;  1GFT A;  2YBJ A;  103L A;  5KXT A;  5DN4 A;  1IR7 A;  1L45 A;  3QE8 A;  4NHT A;  3HH5 A;  4W52 A;  1V7T A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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