159LA

Control of enzyme activity by an engineered disulfide bond
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLAMLQAKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Alanine scanning mutagenesis of the alpha-helix 115-123 of phage T4 lysozyme: effects on structure, stability and the binding of solvent.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 159lA00
1L61A 4I7KA 2RBPA 1L43A 3LZMA 3HU9A 2RAZX 1L90A 3CDTA 186LA 1P2RA 195LA 1L67A 1L27A 1QT8A 127LA 171LA 1G0LA 1L99A 211LA 3DN1A 257LA 1G0GA 4LDLA 1CVKA 3HT6A 162LA 161LA 2Q9DA 3DNAA 1QT7A 2OU0X 4DJHA 2OE7X 2OU9A 3DMXA 3FADA 1L26A 3L2XA 1L35A 1DYAA 1L94A 1SX2A 258LA 2OE4X 1SSYA 223LA 3GUJA 3SB9A 176LA 1PQJA 3FA0A 2B6TA 4W58A 1D3FA 1L72A 1QTCA 2B6ZA 3NY8A 3HU8A 1C6BA 3RUNA 4EKSA 1G0MA 1C61A 3HH4A 1L97A 3V2WA 4EKRA 1L75A 4EXMA 1L16A 1L41A 3F9LA 4EKQA 3OE9A 2HUMA 1L04A 201LA 1L57A 1L12A 1C6JA 2B6WA 4I7RA 1L56A 230LA 1LYDA 2B75A 2ANXA 4DAJA 1QSBA 1C6TA 229LA 175LA 1L03A 4W53A 1L64A 1LI3A 1L92A 3HT7A 3HT8A 1C6IA 4W56A 1LYGA 122LA 1C6HA 1CV5A 1QTDA 1NHBA 2Z6BA 180LA 2RB0X 1L50A 3HTBA 4OO9A 3CDVA 1LGWA 1L15A 3GUPA 1L00A 138LA 1C6FA 2B70A 2A4TA 3RZEA 1CUPA 1L01A 170LA 1P3NA 218LA 1C67A 1KY0A 1DYBA 4LDOA 3HTDA 188LA 118LA 1L60A 181LA 1C6DA 247LA 143LA 1PQKA 242LA 3NYAA 3HT9A 1L81A 1L42A 1L38A 233LA 249LA 2B6YA 191LA 1L31A 1L44A 1G06A 4EPFA 189LA 2RH1A 224LA 1L10A 1L96A 3PDSA 4LZMA 1C6CA 165LA 1P37A 1LGXA 1C6KA 3GUIA 3VW7A 241LA 1C66A 1CU3A 102LA 2L78A 4E97A 2RBSA 4ARJA 1CV1A 2OU8A 1L48A 1QT6A 1C68A 232LA 2OE9X 1L74A 3GUMA 1P36A 112LA 1P46A 1KW5A 144LA 1T97A 1D3NA 1G0KA 1QT3A 1C62A 4YXCA 1DYCA 147LA 4I7NA 4YXAC 1SWZA 1L55A 1L07A 1KNIA 1L34A 231LA 2B7XA 4ARLA 192LA 3L64A 1T8GA 5I14A 1L58A 260LA 146LA 4GRVA 142LA 1KS3A 110LA 2B6XA 2RB2X 1L20A 1L30A 1LPYA 1C63A 3SBAA 1L13A 2RBQA 1L11A 157LA 213LA 1EPYA 221LA 1LW9A 1T8AA 251LA 1LI6A 6LZMA 3FI5A 1D3JA 2O4WA 1L93A 3DMVA 4W59A 1L65A 1LGUA 261LA 3HDEA 4PJZA 2IGCA 3SB5A 2F32A 167LA 1L0JA 1KY1A 3HTGA 2O7AA 3DN4A 234LA 245LA 3UONA 225LA 196LA 140LA 183LA 3HUAA 1L22A 4IAPA 1QUHA 2RB1X 1SX7A 1L25A 210LA 3NY9A 152LA 173LA 3SN6R 150LA 172LA 1CU6A 1PQDA 3DMZA 1L86A 3JR6A 3C80A 1C6GA 114LA 216LA 1TLAA 1L29A 4ZPUA 1LYFA 156LA 1C6LA 3SB7A 2NTHA 1CU0A 1OYUA 1CTWA 1L06A 2NTGA 4GBRB 2RBNA 1C65A 107LA 1KW7A 3D4SA 1LLHA 4W52A 246LA 4I7TA 1L18A 2HULA 187LA 1L28A 3HDFA 1G0JA 166LA 1P56A 3C82A 200LA 1C6PA 1L33A 1ZYTA 1L84A 1L82A 1CV3A 3DN3A 2RAYX 1SWYA 178LA 119LA 3DN8A 3V2YA 4AQNA 1LYEA 206LA 214LA 123LA 4PK0A 1L83A 1G0QA 3HWLA 1C6MA 2QARC 3HH3A 1ZURA 3CDQA 2LZMA 149LA 205LA 262LA 240LA 254LA 4S0WA 164LA 104LA 1L32A 155LA 129LA 1L0KA 2RBRA 1L51A 243LA 227LA 1L79A 1CX6A 3C8SA 1L59A 1LI2A 1P6YA 1D9WA 1WTHA 1L85A 1L91A 2B73A 1CU5A 1DYGA 2F47A 3DN6A 7LZMA 1L71A 1L23A 1OV7A 4I7JA 1L36A 159LA 1L89A 1L87A 1L21A 1P2LA 1L05A 244LA 1L46A 1L53A 238LA 139LA 237LA 1L63A 1JTMA 163LA 1PQMA 236LA 1QUDA 2Q9EA 1L49A 1L17A 184LA 1C6QA 1CV6A 3C7ZA 3HH6A 1CX7A 2B72A 1CV0A 1L54A 3HH5A 1LWGA 1QT5A 131LA 1OWZA 199LA 1QUGA 3PBLA 1LYIA 4W51A 1T6HA 1SSWA 1P5CA 3GUNA 1L40A 158LA 1LWKA 3K2RA 1QS5A 1K28A 1C64A 2B74A 4ARPA 113LA 3G3WA 3C8RA 3ODUA 3SBBC 5LZMA 1L47A 1L45A 1L66A 222LA 2OEAX 3OE8A 1C69A 1L39A 160LA 255LA 130LA 4DKLA 1D3MA 4I7QA 2HUKA 1QTBA 1L76A 1C6EA 1L09A 1QTVA 1L95A 228LA 3C81A 2ANVA 3C7YA 151LA 3G3XA 1DYDA 4W55A 3GUKA 4EJ4A 174LA 137LA 190LA 2RBOA 3GUOA 3EMLA 1L88A 259LA 220LA 169LA 185LA 248LA 141LA 1L24A 111LA 219LA 4I7MA 1XJUA 3HUKA 4EPIA 4W54A 3SB6A 1L02A 1OWYA 1QS9A 1QUOA 4ARQB 3DN0A 1C6NA 3GULA 4I7OA 1L14A 1CV4A 1OVJA 3CDOA 3QAKA 1L37A 1G07A 1B6IA 4ARQA 3C83A 128LA 1QTHA 3G3VA 3HUQA 4I7PA 4EKPA 3F8VA 2CUUA 3CDRA 1L73A 2LC9A 1L08A 4K5YA 1XEPA 198LA 1L70A 4YX7C 2F2QA 145LA 3OE0A 4ARMA 4I7LA 2OTYX 250LA 1L52A 1G1WA 235LA 1C60A 148LE 1D2WA 1D2YA 197LA 1L68A 1CU2A 1G1VA 1C6AA 1LYHA 1OVHA 1I6SA 1CUQA 1L80A 115LA 212LA 182LA 239LA 3OE6A 120LA 2O79A 1XJTA 1OVKA 3C8QA 4W57A 1DYFA 252LA 1JTNA 3HTFA 1DYEA 217LA 226LA 3DKEX 1G0PA 2LCBA 209LA 3DN2A 126LA 1OV5A 1QT4A 253LA 4LDEA 1JQUA 2OTZX 168LA 1PQIA 109LA 1P7SA 1L98A 1L62A 3SB8A 1L77A 177LA 2QB0B 103LA 4I7SA 125LA 1LYJA 4ARMB 1QTZA 1ZWNA 1P64A 108LA 1T8FA 1L69A 1QSQA 256LA 1L19A 3C7WA 215LA 1PQOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I7KA 2RBPA 2RAZX 3CDTA 186LA 195LA 3AW6A 1BWIA 4M4OA 171LA 1JKCA 1G0LA 5KXYA 1IY4A 1LZ6A 211LA 1CVKA 162LA 1IP4A 1JPOA 3BKHA 4DJHA 2OU9A 1L26A 3L2XA 1CJ8A 1B2KA 1DYAA 2H9KA 1SSYA 1CKDA 1JEFA 2B6TA 4W58A 1L72A 1GF3A 3NY8A 4YEOA 1GHLA 1F6RA 1WTNA 4EKSA 1C61A 5C6JA 1BQLY 3OJPA 2I26L 3OE9A 1L57A 2LYMA 4HTNA 5LYMA 1GFAA 1OUHA 2DQIY 2F2NA 1GFEA 4DQJA 1QSBA 1C6TA 3HBHA 175LA 4W53A 4LZTA 1RFPA 1H6MA 1LYGA 1RJCB 1NKHA 2RB0X 1LJIA 1NHEA 1L15A 3GUPA 3F6ZA 4PRQA 1L01A 4NSIA 4ET9A 1P3NA 4ZIXA 1C67A 1KY0A 133LA 1NMMA 1GPQC 1OUGA 3HT9A 3IJVA 2HU1A 3W6CA 5F16A 1IORA 4EPFA 1HMKA 1IP7A 2DQJY 1LZAA 3A34A 1LYZA 1LGXA 1C6KA 2MEHA 3VW7A 1IOQA 1CU3A 1UIBA 6LYTA 1F0WA 1GFHA 4E97A 4B1AA 1GBWA 3WPKA 1UUZC 4QY9A 1IWZA 3WMKA 3AGGG 1QT6A 5L9JA 1QUTA 232LA 5LA5A 1LZRA 2CDSA 2XQOA 1C62A 1IEEA 4OOTA 1EL1A 2F30A 1SWZA 1L55A 1L07A 2HEFA 1G7HC 5F9UA 4HV1A 1KNIA 1LYOA 1JHLA 3LYOA 1L34A 1GFJA 4LT0A 4LT3A 146LA 4GCCA 142LA 2B6XA 2RB2X 3P65A 5KJ9A 1GEVA 2Z2FA 1WQRA 1LPYA 5I53A 5L3HA 3SBAA 2BAAA 1L13A 4NHPA 1L11A 1LMQA 4M6DA 1FLQA 1OUJA 1T8AA 1LI6A 3FI5A 2O4WA 3DMVA 1LGUA 4PJZA 1RE2A 2C8OA 3TMVA 1KY1A 3AZ5A 1YILA 3DN4A 234LA 245LA 225LA 1GBOA 5KXRA 1ZMYL 3HUAA 4NEBA 1QUHA 1CJ6A 210LA 3NY9A 1QQYA 1A4VA 1LSGA 2ZNXY 5APEA 5FCPA 150LA 2X0AA 4TSBA 2WARA 1C6GA 1LJKA 114LA 4NSGA 4C3WA 1LYFA 1GAZA 4YM8A 3SB7A 3LYTA 1OUIA 4ETDA 2NTGA 2RBNA 5FSTA 1QSAA 1LZSA 5I4WA 1KW7A 1LLHA 246LA 1L18A 2HULA 2I6ZA 5IDDA 1GXXA 1RI8B 200LA 2A7DA 2Z2EA 4B49A 3A96A 2Y8PA 3TXFA 2FYCA 214LA 2D4IA 4KT3A 1C43A 1L83A 2QARC 4BS7A 1ZURA 3CDQA 1XEIA 205LA 262LA 4S0WA 4WLTA 1IP3A 2YSSC 4KXIA 3LN2A 4H1PA 1L51A 1L79A 1CX6A 3C8SA 1RCMA 3TXJA 1WTHA 1BB3A 1L23A 2AUBA 1L36A 4WLXA 4H8YA 1I20A 1L21A 2ZILA 4TSCA 1IOCA 5D5CA 1SQ2L 237LA 1JTMA 1F10A 4J0LA 1FLWA 1QUDA 1L49A 1GE0A 1CV6A 2B5ZA 1GAYA 3WU8A 4HPEA 1L54A 4XN6A 1QT5A 131LA 199LA 2IHLA 1W08A 1LZYA 1WQMA 1KXXA 4NGOA 2B74A 3G3WA 5AMYA 1L45A 4B4EA 1HERA 1KXWA 2BPUA 4ETAA 3A93A 3CT1A 2FBBA 130LA 2HUKA 4WG1A 4MCKA 1L09A 2ANVA 137LA 1UIHA 4DC4A 4LFXA 1LZCA 3P4ZA 1XGPC 1XJUA 4EPIA 2YDGA 5B07A 5B1GA 3G3BB 1C6NA 2DQFC 4WLDA 5KXMA 1LJEA 1L14A 1CV4A 1BGIA 1C08C 1OVJA 1LMCA 2BQNA 4H9IA 4NHQA 1UIEA 2DQGY 1GB3A 1IWYA 2BQEA 1LSCA 4LYZA 2ZNWY 1P2CC 4XJDA 1L73A 1LZEA 1LJ3A 1VAUA 2CWIA 1XEPA 4YX7C 4CFOA 4WM4A 207LA 1LSPA 3CSZA 1B5VA 4NG1A 5B06A 3AGIA 148LE 3WXUA 5DN5A 5KXPA 1OUAA 1CU2A 1DPWA 1C6AA 1IC7Y 4WM5A 239LA 2YBIA 4ANRA 115LA 182LA 1G7MC 1XJTA 1OVKA 4QEQA 4UWUA 1HFZA 3WL2A 3T6UA 1UCOA 1UBZA 5M1YA 168LA 3CT5A 3AZ6A 4HJYA 1LMPA 4G4BA 4G9SA 1INUA 103LA 2BQIA 1QTZA 1IOSA 1IP2A 108LA 1YROA 1L19A 3W3EA 4H94A 1WVVA 1GF4A 1PQOA 1L61A 5F9XA 4DWXA 1GF8A 1YAMA 3LZMA 3M18B 5LVIA 1L90A 1L67A 1L27A 3WULA 4YOPA 5KXNA 1FKQA 1ZV5L 3HT6A 3GXKA 2D91A 161LA 1FKVA 3DNAA 3WW6A 2OU0X 2OE7X 5KXLA 3DMXA 5LAGA 2XBRA 1DZBX 1IWVA 2OE4X 3GUJA 3SB9A 2BLYA 2VB1A 1PQJA 5HNLA 3FA0A 1XEJA 4FDYA 2LYZA 3RUNA 1G0MA 2IFFY 1GF9A 1IC5Y 1L75A 5FHWA 3RW8A 2LHMA 2HUMA 201LA 1L12A 2ANXA 4DAJA 1JSEA 3TMXA 1LHIA 1FDLY 229LA 1L03A 1QUSA 3A67Y 1CV5A 4PRUA 1NHBA 4J1AA 3TXIA 2BQOA 4OO9A 3CDVA 4NHSA 138LA 1D0KA 1BVXA 1C6FA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4I7K A;  2RBP A;  2RAZ X;  3CDT A;  186L A;  195L A;  3AW6 A;  1BWI A;  4M4O A;  171L A;  1JKC A;  1G0L A;  5KXY A;  1IY4 A;  1LZ6 A;  211L A;  1CVK A;  162L A;  1IP4 A;  1JPO A;  3BKH A;  4DJH A;  2OU9 A;  1L26 A;  3L2X A;  1CJ8 A;  1B2K A;  1DYA A;  2H9K A;  1SSY A;  1CKD A;  1JEF A;  2B6T A;  4W58 A;  1L72 A;  1GF3 A;  3NY8 A;  4YEO A;  1GHL A;  1F6R A;  1WTN A;  4EKS A;  1C61 A;  5C6J A;  1BQL Y;  3OJP A;  2I26 L;  3OE9 A;  1L57 A;  2LYM A;  4HTN A;  5LYM A;  1GFA A;  1OUH A;  2DQI Y;  2F2N A;  1GFE A;  4DQJ A;  1QSB A;  1C6T A;  3HBH A;  175L A;  4W53 A;  4LZT A;  1RFP A;  1H6M A;  1LYG A;  1RJC B;  1NKH A;  2RB0 X;  1LJI A;  1NHE A;  1L15 A;  3GUP A;  3F6Z A;  4PRQ A;  1L01 A;  4NSI A;  4ET9 A;  1P3N A;  4ZIX A;  1C67 A;  1KY0 A;  133L A;  1NMM A;  1GPQ C;  1OUG A;  3HT9 A;  3IJV A;  2HU1 A;  3W6C A;  5F16 A;  1IOR A;  4EPF A;  1HMK A;  1IP7 A;  2DQJ Y;  1LZA A;  3A34 A;  1LYZ A;  1LGX A;  1C6K A;  2MEH A;  3VW7 A;  1IOQ A;  1CU3 A;  1UIB A;  6LYT A;  1F0W A;  1GFH A;  4E97 A;  4B1A A; 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