1CKCA

T43a mutant human lysozyme
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRAANYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
publication title Contribution of intra- and intermolecular hydrogen bonds to the conformational stability of human lysozyme(,).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ckcA00
4DD9A 1UA6Y 4WLYA 1DQJC 5A3ZA 1NF5A 1W08A 5APFA 1JKBA 3WW5A 4NHPA 5F81A 1NQIA 1IWZA 3A94A 1FLUA 1D0MA 3BKHA 5IELA 1ALCA 2A7FA 2MEIA 3WUAA 4PPOA 4B0DA 1HEQA 4CJ2A 4WLTA 8LYZA 1DI4A 5B07A 1IOTA 1LYOA 4H8ZA 3TXGA 208LA 4RW2A 5KXWA 3AZ7A 1FKQA 1OUAA 1GE1A 2FBDA 4NG1A 1FLYA 1LZTA 4LT3A 1IWYA 2FYCA 1YAQA 1GDXA 4UWVA 4R6CA 1TBYA 4M6DA 1DPWA 1B7RA 1LHMA 1HMLA 4Z98A 5FHWA 4NHTA 4DD2A 4LYOA 4OWEA 1GB6A 4DDAA 2BQKA 5EBHA 1WQNA 1IWWA 1A4VA 2DQHY 4N8ZA 3LN2A 1LZ5A 4H9AA 4AGAA 134LA 4C3WA 4GCCA 2G4QA 1HELA 4DD7A 4WG7A 3F6ZA 2LYOA 2BQHA 3A34A 3D9AC 4H93A 1GPQC 5F9XA 3J4GA 1FLWA 4FDYA 2FBBA 4NGKA 5FDJA 3RT5X 1NBYC 1RI8B 1XSFA 1XFPL 4HV2A 4XYYA 3AGIA 2LZ2A 1IX0A 1RE2A 1AKIA 4TSBA 2F4AA 1C10A 2HU3A 2ZYCA 1IC7Y 2XBSA 3LZ2A 5E9RA 1UUZC 2ZNWY 2BQEA 1LSPA 1V7SA 1G7HC 3TXBA 1F6SA 1CKGA 4HPIA 3WU9A 3WL2A 1XEJA 1QTEA 4LYTA 4NGZA 3WUNA 1JHLA 5F16A 4P2EA 1F6RA 2F2NA 4XJIA 4DYGA 3OK0A 3WULA 5C6JA 1UBZA 5I4WA 4G4BA 1JKAA 4ZFPA 1GBSA 1NWGA 4WOAA 3ZVQA 154LA 1JJ0A 4E3UA 5IDDA 1LZNA 2F30A 1N4FA 4H9BA 5DL9A 1QSWA 1YROA 5FEKA 2IFFY 3WPJA 2MEEA 2RSCA 1FKVA 1T3PA 4LT2A 4IASA 4UWUA 5LYTA 1B5VA 2BLXA 1C46A 1B7QA 1EQ5A 2HEDA 1V7TA 4H8YA 1O23A 5KXSA 1DZBX 4OOTA 3TMXA 3W6CA 2XBRA 4HPEA 1VAUA 4ETEA 1GBWA 1WVVA 5LYZA 4HSFA 4EOFA 4HJYA 4B4IA 1HFZA 1GF4A 2YBJA 3ATNA 4YEOA 5J7CA 3QY4A 1LJ3A 3HBHA 4RLMA 4MCKA 3HBDA 2ZYPA 2AUBA 2MEFA 2ZQ4A 1D0KA 1IO5A 3E3DA 4N1EI 3AJNA 133LA 1MELL 1LZCA 2MEAA 5KJ9A 2BLYA 3LYZA 3P65A 4OWHA 3P4ZA 4NGVA 4KXIA 1GFVA 3P64A 5D5CA 6LYTA 1OUBA 5KXPA 3WU7A 4N0JA 2G4NA 1LMTA 2Z39A 2BQNA 4NWHA 2DQJY 2H9KA 1VFBC 1JSEA 4DC4A 1YAPA 1BVXA 2VB1A 5KXTA 2DQDY 4GN4A 1CKFA 1DI3A 1GBZA 2DQEY 4II8A 1GBOA 1LZ9A 2EKSC 1LPIA 5ILFA 1LSEA 4XJBA 2HEBA 1KXWA 1GE2A 1LZ4A 4TWSA 1GWDA 1HSXA 1VDQA 1LHHA 1QTKA 4PRUA 1UCOA 2I25L 2D4IA 3TXHA 1NDMC 1LJIA 2MEGA 3KAMA 4NHIA 4WM5A 2DQCY 5HQ1A 1IORA 1BWHA 4NIJA 1LJHA 4D9ZA 3B0KA 1SQ2L 1TAYA 1IY4A 5KXLA 2W1XA 3LYMA 1OUGA 1C43A 1JTPL 2DQAA 1LSAA 4XJHA 2F4GA 2ZILA 5KXYA 1GF3A 4NY5A 3A6CY 4HJVA 4KPMA 1F10A 5DN5A 2HTXA 1VDTA 1XEIA 3A92A 1LAAA 5HMJA 4Z46A 3W3EA 5LVGA 1ZVYB 4J1AA 1JWRA 2ZWBA 1LSDA 4LFXA 4RW1A 4ETCA 1IWXA 1JEFA 1LJNA 3AGHA 3AZ6A 1LSYA 3D3DA 1GE4A 4HTNA 3FE0A 1JTTL 1LZRA 1VEDA 4WM4A 1LSCA 3G3BB 2BQBA 4WM6A 1HENA 4G49A 3TXFA 1AT5A 2YSSC 3EXDA 5F14A 1CJ6A 4LFPA 1LHJA 2MEHA 3G3AB 5I4YA 5I4XA 1NBZC 3B72A 4HJZA 4CFPA 1JUGA 1HHLA 4LZTA 2BQMA 5E4PA 2IHLA 4XN6A 2BQGA 1LZ8A 2Z38A 1BB3A 1IY3A 1J1XY 1NMMA 4MR1A 1OUIA 4MSTA 1JISA 1IP6A 1LZEA 1TEWA 3BKVA 2I6ZA 1QIOA 4LT0A 4XADA 3TXKA 4NSJA 4WLXA 1IP7A 3WUMA 2W1YA 3SP3A 1HMKA 4N1CC 5IHGA 2EIZC 1IC4Y 5B1FA 3A3RX 1JTOL 5II3A 3IJUA 1GE3A 1QDRA 1RFPA 2BAAA 2EPEA 5DLAA 5KY1A 4NSHA 1YKYX 2BQJA 4I8SA 4ML7A 4WG1A 1WQRA 1IIZA 2H9JA 3IWRA 1GFRA 2BQCA 4EMNA 4YOPA 1GE0A 4YF2A 4WMGA 4GCFA 1LSGA 4WL6A 1KXYA 4QEQA 3N9CA 4UWNA 4ETBA 2ZNXY 4AXTA 4WM1A 2CJLA 1OQMA 3B6LA 2DQFC 1DXJA 4OWBA 4XENA 4KT3A 5APCA 3TMWA 3WMKA 3CB7A 1UIGA 1G7IC 1WTNA 1Z55A 4LYBA 1ZV5L 1ZVHL 3B0IA 4TUNA 1B7NA 1LZ1A 1GFAA 2BQFA 1LJEA 4W96A 3AGGG 5L3IA 153LA 2EQLA 1GDWA 1DKKA 1LTMA 3OJPA 1PS5A 2W1MA 4BAFA 1HEWA 4Z41A 5D5FA 2ZIKA 4NWEA 2LYMA 5LIOA 1KIQC 1INUA 4ETAA 3A8ZA 4Z3MA 1OUJA 1REYA 5B05A 1IP3A 1OUDA 1P2CC 1B5XA 3W6EA 1AZFA 4OW1A 1EQ4A 1HFYA 1D0LA 2C8OA 3RW8A 1GF8A 135LA 3CT0A 1UIHA 2HEFA 5DN4A 3A67Y 1B5WA 1IP4A 5APEA 4CHXA 4H91A 4YEMA 3IJVA 4TTDA 4X3BA 1GF0A 1KIRC 2D4JA 4I0CA 4QDNA 3ZEKA 1RJCB 4BS7A 1BQLY 1B7LA 3WPKA 1BB6A 4B4EA 5AMYA 5M1YA 5APDA 1HSWA 3RNXA 1B2KA 1FDLY 5I5QA 4GLVA 1IVMA 3W6BA 1XGPC 1LSNA 4QGZA 5FELA 1YILA 1JIYA 4GN3A 3VWOA 1XGQC 5HMVA 3CT1A 1BWIA 3A91A 4B4JA 2B5ZA 4N5RA 3T36A 4M4OA 3WW6A 3J6KA 4G4HA 4DD3A 3HBEX 2BQOA 1IR8A 1BB5A 4LYMA 1UIFA 1G7MC 1LJJA 2WARA 4BADA 1LKRA 1YAOA 1JKDA 1LZBA 1I20A 3EBAB 5B1GA 4HTQA 1GB5A 1WQMA 207LA 5FCPA 4GCDA 5LA8A 1REZA 3WXTA 4NEBA 1I1ZA 1IWUA 2CDSA 2H5ZA 3GXKA 4OOOA 1UC0A 3WU8A 1JJ1A 1LSBA 1J1PY 5HLLA 1LKSA 1YKXX 2CGIA 2D6BA 3A95A 5KXMA 3AYQA 4IATA 5I54A 1GFHA 4XJDA 1IR7A 2C8PA 4NFVA 3AB6A 5C6IA 1B7SA 3W6DA 1UIAA 1IOCA 3LZTA 4NGLA 1GF7A 4N9RA 1GFKA 1GB2A 5HNLA 1REXA 1D6QA 4H9IA 4NGIA 2ZQ3A 4H9HA 1W6ZA 1YIKA 4WL7A 1D6PA 5L9JA 1GBYA 1B9OA 1BVKC 5KXNA 2MEDA 1LHLA 1IP1A 1HERA 1LJKA 1NKHA 1TCYA 2LZTA 1LZDA 3TXDA 4DDBA 1QUSA 2Q0MX 4NG8A 1CKDA 4OWAA 4H92A 4PJ2C 4LYZA 3M18B 3QNGA 1WQQA 3N9AA 4PRQA 3T6UA 4J1BA 1UICA 1IP2A 1PZYA 4U3XB 1HC0A 1IEEA 2XTHA 5LXWA 4ZEEA 1BB7A 2HECA 4WO9A 1OUEA 3WPLA 4YM8A 1GF5A 1LMNA 2MECA 2HEAA 1WTMA 1NDGC 4GLAA 4ET8A 4WLDA 1LZGA 4O34A 4OWCA 1AM7A 1IOSA 1T6VL 2G4PA 1YAMA 1B5YA 2Z2EA 5DM9A 5JENB 1CJ7A 1LZYA 1FLQA 4LT1A 1LHIA 3W6AA 1LYYA 1LZSA 1VDSA 3A3QA 3WXUA 3WH1A 1GXXA 4HP0A 2Z2FA 1EL1A 1LSFA 1GBXA 1LYSA 1XGTC 3CQLA 1C45A 1GB7A 3WVYA 4CGEA 1GF9A 4H90A 1HEPA 3CSZA 1LSZA 1GB0A 1LYZA 1OUFA 5LVHA 3CT5A 2I26L 4H9EA 4RDSA 1HNLA 5LVKA 2HU1A 3ULRA 3W6FA 1UIDA 1UIEA 4WM2A 4BAPA 5KXRA 2BQIA 2Z19A 4L41A 1GEVA 3A96A 4TSCA 2GV0A 2ZIJA 1LSMA 3RU5A 4ZIXA 1GXV2 1LJ4A 1H6MA 2CWIA 4H94A 5F9UA 5B59A 4LYCA 1QSAA 1IR9A 3MGWA 1OUHA 3CSQA 4WO6A 1SLYA 3WVXA 1QQYA 2Z12A 5I53A 1RCMA 1LZ6A 1JPOA 2HUBA 2N5ZA 1G7JC 3ATOA 2BPUA 3CSRA 4FJRA 4NHQA 1FN5A 3TXEA 5A3EA 5KXXA 2LHMA 4IJ4A 3LHMA 2DBTA 1GB3A 5ILCA 1EQEA 2LYZA 4B49A 1HEMA 1NHEA 4YENA 3TMUA 1GB9A 1WVUA 3GXRA 5FSTA 4CFOA 1IWVA 3EMSA 1GD6A 193LA 2D91A 5KXZA 1YQVY 3LYTA 3LYOA 5K7OA 4GCBA 4HTKA 1TDYA 4GN5C 1GAZA 4NSIA 4NSGA 3RZ4A 1E8LA 1B7PA 2D4KA 1KXXA 1GFTA 1QUTA 1GFEA 4H9FA 2A7DA 4H1PA 1GEZA 4NGYA 1HFXA 1IC5Y 1VDPA 2BQLA 5LYMA 2FYDA 132LA 4J7VA 5KXOA 5LAGA 5HNCA 1GFGA 3P68A 5KXKA 1LMCA 1BHZA 3ZVQB 1UIBA 4A7DA 1B5ZA 1FBIX 4DDCA 2DQGY 1LJGA 2X0AA 1ZMYL 2Y8PA 4DD1A 4QY9A 4NGJA 1DPXA 3AZ4A 1IP5A 1BB4A 5LINA 1LCNA 3M3UA 3AZ5A 3N9EA 1C7PA 1A2YC 1IWTA 1J1OY 4GCEA 2BQDA 2YBIA 1UACY 1JJ3A 3B0OA 5L3HA 5C6LA 4LGKA 1GF6A 1LMOA 3AW7A 3TMVA 5KKJA 1WQPA 3TXJA 4H9CA 4KL7A 1G7LC 5T3FA 1XEKA 3TXIA 1LOZA 1CJ9A 1GFJA 1LJFA 2NWDX 1CJ8A 1YL0X 1GFUA 5LVIA 3A6BY 4G9SA 1B7MA 4C5FA 1OP9B 194LA 2DKVA 3HFMY 3A93A 4NGWA 2HEEA 9LYZA 1GB8A 2PC2A 1CKCA 1XGUC 1REMA 3A90A 4PGJB 5LVJA 1GAYA 1C08C 1AT6A 4B1AA 4DD0A 1LMPA 1I56A 3P66A 3QE8A 4DT3A 1YKZX 7LYZA 2YBHA 1HF4A 1LMQA 3FI7A 3WYHA 1B5UA 1DI5A 1KIPC 3AW6A 1DKJA 5B06A 1JITA 1JSFA 1YL1X 1MLCE 4XJFA 3EO5A 1LZAA 4ANRA 2YBMA 1IOQA 2MEBA 4PHIA 1WQOA 1LMAA 2XJWA 1QDTA 2DQIY 1LHKA 4ETDA 4ET9A 1BWJA 2W1LA 1VATA 1BGIA 2YDGA 1GHLA 4H8XA 4R0FA 4NGOA 4TX7A 4XJGA 1CKHA 1CNSA 4J0LA 1HEOA 2YVBA 5KKIA 2YBLA 4RLNA 1B7OA 4WM3A 4DWXA 4HV1A 1JKCA 3K3TA 2YBNA 1H87A 5LAFA 6LYZA 2BQAA 1B0DA 1D9UA 2Z18A 2Z37A 4G4CA 1XGRC 4NHSA 4W94A 5LA5A 1YANA 1F0WA 1OUCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1UA6Y 3WW5A 5APFA 4NHPA 1D0MA 1C60A 1IOTA 3L64A 3HU8A 114LA 3GUPA 1GE1A 3JR6A 1FLYA 195LA 1LZTA 2FYCA 4EKRA 3DN0A 4M6DA 1TBYA 4W53A 164LA 4DD2A 2BQKA 1WQNA 103LA 3GUJA 1QT7A 3LN2A 1LZ5A 3CDQA 4H9AA 1HELA 4DD7A 1QUGA 3HDEA 4FDYA 5FDJA 2FBBA 260LA 2A4TA 2LZ2A 1IX0A 1C6IA 1AKIA 173LA 217LA 256LA 2RAZX 1LSPA 3TXBA 4HPIA 4IAPA 4EPFA 1QTEA 4NGZA 4OO9A 4P2EA 5C6JA 1DYBA 1C67A 5IDDA 178LA 161LA 1L98A 3HUAA 1DYAA 1QSWA 3C7ZA 2RB1X 2F47A 1DYEA 5LYTA 4LT2A 1B5VA 5KXSA 1CV0A 4ETEA 1WVVA 5LYZA 4EOFA 4B4IA 1L30A 2F32A 2YBJA 4RLMA 3EMLA 2AUBA 2ZQ4A 4E97A 112LA 1IO5A 3E3DA 251LA 2OE9X 2MEAA 3LYZA 218LA 3FI5A 1OUBA 3WU7A 1LMTA 2Z39A 2BQNA 4NWHA 4EPIA 1C6JA 4DC4A 1BVXA 2VB1A 1C6EA 1GBZA 4II8A 1GBOA 1CTWA 1GE2A 1L21A 1LZ4A 1L51A 1NDMC 2MEGA 3KAMA 4NHIA 4NIJA 1LJHA 1D3MA 1L10A 3LYMA 1L03A 3A6CY 1C68A 2HTXA 5HMJA 1ZVYB 1JWRA 4RW1A 1LSYA 1LZRA 3FE0A 1VEDA 255LA 2BQBA 4W56A 4WM6A 1AT5A 5F14A 4LFPA 2MEHA 5I4YA 1D3JA 4YX7C 1CVKA 1LZ8A 2Z38A 1IY3A 163LA 3BKVA 1QIOA 3TXKA 4EJ4A 3WUMA 5II3A 1JTOL 1L32A 1RFPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4DD9 A;  1UA6 Y;  4WLY A;  1DQJ C;  5A3Z A;  1NF5 A;  1W08 A;  5APF A;  1JKB A;  3WW5 A;  4NHP A;  5F81 A;  1NQI A;  1IWZ A;  3A94 A;  1FLU A;  1D0M A;  3BKH A;  5IEL A;  1ALC A;  2A7F A;  2MEI A;  3WUA A;  4PPO A;  4B0D A;  1HEQ A;  4CJ2 A;  4WLT A;  8LYZ A;  1DI4 A;  5B07 A;  1IOT A;  1LYO A;  4H8Z A;  3TXG A;  208L A;  4RW2 A;  5KXW A;  3AZ7 A;  1FKQ A;  1OUA A;  1GE1 A;  2FBD A;  4NG1 A;  1FLY A;  1LZT A;  4LT3 A;  1IWY A;  2FYC A;  1YAQ A;  1GDX A;  4UWV A;  4R6C A;  1TBY A;  4M6D A;  1DPW A;  1B7R A;  1LHM A;  1HML A;  4Z98 A;  5FHW A;  4NHT A;  4DD2 A;  4LYO A;  4OWE A;  1GB6 A;  4DDA A;  2BQK A;  5EBH A;  1WQN A;  1IWW A;  1A4V A;  2DQH Y;  4N8Z A;  3LN2 A;  1LZ5 A;  4H9A A;  4AGA A;  134L A;  4C3W A;  4GCC A;  2G4Q A;  1HEL A;  4DD7 A;  4WG7 A;  3F6Z A;  2LYO A;  2BQH A;  3A34 A;  3D9A C;  4H93 A;  1GPQ C;  5F9X A;  3J4G A;  1FLW A;  4FDY A;  2FBB A;  4NGK A;  5FDJ A;  3RT5 X;  1NBY C;  1RI8 B;  1XSF A;  1XFP L;  4HV2 A;  4XYY A;  3AGI A;  2LZ2 A;  1IX0 A;  1RE2 A;  1AKI A;  4TSB A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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