2B73A

T4 lysozyme mutant l99a at 100 mpa
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Cooperative water filling of a nonpolar protein cavity observed by high-pressure crystallography and simulation
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 61
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2b73A00
1L20A 1ZWNA 1CU3A 225LA 1LYFA 1C6GA 2LZMA 4W56A 1QUHA 3V2WA 1L82A 3G3WA 3HH5A 1L25A 1LWKA 4EPFA 2CUUA 1DYBA 4EKPA 1QT8A 178LA 239LA 4ARMB 1L61A 3D4SA 3DN6A 162LA 1L04A 3HU8A 3HWLA 1CUPA 3VW7A 1C6EA 1QSBA 231LA 148LE 1SWYA 1JTNA 3GULA 3HT8A 230LA 2B73A 229LA 1PQMA 1LGUA 3C81A 1L43A 3DN0A 1L52A 2LC9A 3GUKA 131LA 1D2WA 3HUKA 1L33A 164LA 1OWYA 1L36A 1SX7A 3C80A 5I14A 1CX7A 251LA 236LA 170LA 1K28A 1L73A 247LA 1LYIA 187LA 1L23A 4YXAC 4I7JA 1L68A 1L29A 198LA 1L11A 3HT6A 1C67A 1L15A 2B6ZA 161LA 1L88A 3CDQA 1QTZA 1LWGA 1C6MA 3QAKA 1L92A 195LA 1QUOA 219LA 4I7OA 209LA 1SSWA 1L00A 1L84A 1D3NA 119LA 1L01A 252LA 1DYFA 3SB8A 111LA 150LA 1QTBA 2B75A 1QT3A 2RB2X 1KY1A 3F8VA 1C6TA 2QB0B 4DAJA 1L13A 125LA 1LYJA 1G06A 1C63A 2RBQA 1G1VA 1LYEA 103LA 2ANXA 4EJ4A 1L89A 147LA 3ODUA 1ZURA 143LA 4ARMA 1C64A 3C83A 4GBRB 118LA 2RB1X 3FADA 3C7ZA 1PQOA 3V2YA 2Q9DA 3SN6R 1D3MA 3C7WA 1L60A 211LA 3HUQA 114LA 2OEAX 1XEPA 3RZEA 127LA 182LA 4I7QA 176LA 1CU2A 1XJUA 1D3FA 166LA 2NTHA 2B7XA 200LA 1CU0A 1P37A 3HDFA 4ZPUA 2RBOA 4I7PA 1L63A 1L66A 1L02A 1LYGA 3CDOA 156LA 1EPYA 1L71A 3SB9A 4I7KA 3G3VA 241LA 201LA 232LA 192LA 4W52A 2B6XA 3C7YA 1OYUA 108LA 1L05A 1LYHA 4W51A 1L86A 1L0JA 1PQDA 3HU9A 4DKLA 104LA 242LA 1QT4A 1C6QA 4I7SA 4I7NA 215LA 2O79A 3SBBC 1L21A 1QS5A 1G0QA 1JTMA 3JR6A 123LA 248LA 168LA 1L44A 1G0PA 1KW7A 2OE7X 3GUIA 245LA 4S0WA 1L35A 1T8FA 3NY8A 1P36A 2L78A 1T8AA 3GUPA 2Q9EA 169LA 1XJTA 3HT9A 4EKQA 1P3NA 3UONA 1KW5A 3SBAA 1SWZA 224LA 259LA 177LA 1L47A 4K5YA 1C68A 1L97A 255LA 3HT7A 3DN1A 1CU6A 1DYAA 107LA 240LA 4ARLA 3CDRA 173LA 2O4WA 1LI6A 1B6IA 226LA 3C8RA 1C6DA 3DN3A 2HUKA 2RBPA 4EKRA 205LA 2RAZX 1L45A 142LA 1L30A 1QTHA 102LA 1L72A 1L98A 1P56A 234LA 3FI5A 254LA 258LA 129LA 1OV7A 246LA 180LA 3PDSA 1CV3A 1CV6A 212LA 115LA 1L70A 3L64A 191LA 184LA 1CUQA 1LYDA 4I7MA 1G0GA 1L49A 1L58A 4GRVA 1L80A 243LA 1L40A 167LA 1L51A 3GUJA 1T6HA 159LA 1LLHA 3DMVA 3HTGA 4PJZA 235LA 4EXMA 1L38A 1LGXA 4IAPA 1QUDA 1P2RA 1CV1A 3CDTA 1C60A 2HUMA 1QT5A 3G3XA 2HULA 244LA 4ARJA 190LA 1CX6A 1C6IA 222LA 4I7LA 221LA 1L50A 261LA 2B72A 1LI2A 1QT7A 3L2XA 2B74A 1QTDA 113LA 223LA 1CTWA 3F9LA 2RH1A 158LA 2OE9X 130LA 227LA 1L62A 1QTVA 1L10A 1TLAA 1L56A 3HH6A 4W59A 2IGCA 1G0MA 257LA 2RAYX 1L76A 1C6NA 1CV4A 1CV0A 189LA 3DN4A 1C6HA 1L85A 1OWZA 4ARPA 1L24A 160LA 1P2LA 2RBSA 3DKEX 1C6CA 3PBLA 217LA 4W57A 1LW9A 1G0JA 210LA 1P5CA 2OU8A 4W54A 1L64A 183LA 2B6TA 1L07A 1L31A 3RUNA 1P7SA 238LA 1G1WA 1C62A 1L53A 1L93A 3OE9A 1L32A 2OTYX 1L54A 1L77A 4I7TA 1L87A 122LA 196LA 1OVJA 1G0KA 146LA 4EKSA 1QT6A 2OE4X 228LA 1NHBA 3LZMA 3HDEA 1L22A 1JQUA 1QSQA 1L67A 1P6YA 149LA 1G07A 1L18A 4YX7C 1D2YA 250LA 3GUOA 1SX2A 3DMZA 2B70A 110LA 1C66A 262LA 249LA 4AQNA 1C61A 3HUAA 4OO9A 1L39A 1L83A 233LA 3DMXA 1L57A 1P64A 1LGWA 1C6AA 218LA 3GUNA 1L94A 4LZMA 1L27A 109LA 4LDEA 1L19A 1L42A 4W58A 1C6PA 1L34A 3DN8A 1L41A 4W53A 172LA 1C6JA 3OE0A 3SB5A 1C6BA 3HH4A 2F2QA 1D9WA 197LA 1L79A 1L03A 1G0LA 2ANVA 1L09A 1DYGA 3EMLA 1DYDA 3DN2A 199LA 2OU0X 253LA 1SSYA 4ARQB 2OTZX 2B6YA 126LA 3C8QA 3K2RA 1L74A 1L55A 4EPIA 1DYCA 174LA 3CDVA 1DYEA 3SB7A 1I6SA 1L26A 1PQKA 175LA 4DJHA 2Z6BA 3SB6A 1QTCA 1L96A 120LA 186LA 1CVKA 1OVHA 216LA 185LA 3NY9A 3HTBA 1PQIA 1C69A 112LA 4YXCA 3C82A 220LA 1L90A 1KNIA 1CV5A 171LA 139LA 1L48A 1L81A 1L99A 2RB0X 1L14A 1OVKA 1ZYTA 3HTDA 1C6KA 137LA 2A4TA 157LA 2RBNA 2RBRA 1L16A 140LA 138LA 2F47A 1D3JA 1C6LA 2O7AA 3OE8A 1QS9A 1L17A 145LA 1T8GA 213LA 1L95A 4LDOA 188LA 1C65A 1L37A 4W55A 151LA 3HH3A 3GUMA 2QARC 1T97A 2LCBA 4E97A 3HTFA 1LI3A 1L12A 1L59A 1CU5A 1PQJA 6LZMA 144LA 1L0KA 260LA 1L28A 1KS3A 1P46A 206LA 1L08A 1WTHA 128LA 3DNAA 237LA 1LPYA 2F32A 2OU9A 165LA 1L06A 256LA 7LZMA 2NTGA 1QUGA 3NYAA 4I7RA 3OE6A 2B6WA 152LA 1OV5A 4ARQA 1C6FA 1L75A 3C8SA 3FA0A 141LA 4LDLA 163LA 1L91A 1KY0A 181LA 4PK0A 1L69A 5LZMA 1L46A 155LA 214LA 1L65A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ULRA 4GCFA 5HMJA 1LMPA 2LZMA 4W56A 1J1OY 1L82A 3HH5A 1LWKA 4EPFA 1IC5Y 1OUJA 3A6BY 4DD3A 4ARMB 4NWHA 2WARA 3DN6A 162LA 1L04A 3P4ZA 2A7FA 1B5VA 1DZBX 1ZVHL 1YL1X 1GB3A 4Z41A 4RLMA 4DD9A 2F2NA 4WLDA 1DPWA 1FN5A 1QTEA 1GFJA 2CDSA 3GUKA 4XN6A 5A3EA 3HUKA 3A6CY 1L36A 2W1YA 3C80A 1CX7A 4I0CA 4NGZA 1LJKA 3WU9A 3WMKA 3A93A 1L73A 1LYIA 4IATA 1GE3A 1IY3A 1VDQA 3EBAB 1GD6A 3GXKA 1QDTA 3G3BB 1L88A 2ZNXY 3LN2A 1GFHA 3W6CA 3QAKA 1GXV2 1L00A 4NGKA 1L84A 1L01A 1G7JC 1IOSA 3SB8A 1OUFA 1TCYA 1NBZC 1KY1A 2BQIA 1L13A 1GF0A 1LYJA 4LYMA 3J4GA 4QEQA 1YAMA 1ZURA 1IEEA 4R6CA 2MEEA 1JKBA 4ETBA 2CWIA 2Q9DA 3SN6R 3C7WA 3HUQA 3RZEA 1LMCA 1LZRA 166LA 1O23A 2NTHA 1LHMA 4AXTA 4NIJA 156LA 1EPYA 1KIPC 3SB9A 3G3VA 2HU3A 4XJDA 1DI5A 1IP2A 4J1AA 2B6XA 1BQLY 4WO9A 1EL1A 108LA 3ZVQA 1L05A 2YBMA 4XADA 4UWNA 2AUBA 1C08C 1C6QA 4N1EI 4I7NA 4YF2A 2Z37A 5KXOA 1DQJC 3A94A 3SBBC 4HV1A 3WYHA 1QUSA 1LZTA 248LA 2BQDA 3GUIA 1NKHA 4S0WA 5C6LA 1T8FA 1T8AA 4WM3A 1CKFA 1JPOA 1P3NA 3UONA 4Z3MA 4DD2A 1EQ5A 1C68A 255LA 1CU6A 240LA 4ARLA 1REMA 3QY4A 3WXTA 193LA 1HF4A 1LJ3A 4GN3A 4B4IA 1L98A 234LA 1JSEA 4YENA 258LA 3TMXA 180LA 2HTXA 115LA 1L70A 1B7NA 3L64A 1OUDA 1BGIA 3T6UA 4TX7A 1L58A 243LA 1QSAA 194LA 3TXJA 159LA 1H6MA 1LLHA 3HTGA 235LA 3CDTA 4XJBA 3RW8A 2DQFC 4TWSA 3OK0A 1ALCA 1IY4A 4CGEA 1GBYA 5LYTA 222LA 4I7LA 1IR9A 221LA 2B72A 5LVIA 1QTDA 1T6VL 5C6IA 4M6DA 2XQOA 1PS5A 2HU1A 3HH6A 2IGCA 1G0MA 1GF3A 4II8A 3CSRA 1F6SA 5APDA 4ARPA 1OWZA 3TXDA 4DD0A 1C6CA 1G0JA 3D9AC 2BQNA 1CKCA 3WU8A 5DN5A 1LMTA 2D6BA 1LYOA 1G1WA 1C62A 1L53A 3EMSA 1W08A 1L54A 122LA 5LVKA 5LAFA 2YBLA 1YAPA 5LVGA 1IWUA 2F4GA 196LA 2LHMA 2Y8PA 5FELA 2D91A 4NSJA 4EKSA 1WQRA 4NFVA 1YIKA 4WG1A 1JQUA 1QSQA 1L67A 2MEGA 4MSTA 1KXYA 1LJHA 1GEVA 4NSGA 1Z55A 4H8XA 3LZTA 249LA 1C61A 4J7VA 3DMXA 4EMNA 218LA 1L94A 1F10A 1L27A 1GE2A 1HSWA 1LJEA 4RDSA 1JKCA 3SB5A 3OE0A 3HH4A 1L79A 1DYGA 3EMLA 1IP4A 1BB6A 1HFYA 2OU0X 253LA 1G7HC 1OUAA 3GXRA 2DQDY 1GBWA 3LYMA 4WM4A 5FDJA 1D9UA 5C6JA 1PQKA 4WG7A 4DJHA 3A8ZA 3SB6A 2HUBA 1QTCA 5FSTA 1CVKA 5LIOA 2YVBA 1H87A 1C69A 2HEDA 1YANA 1A4VA 1BB4A 4DYGA 1G7IC 2HEFA 4LYOA 1L48A 1L81A 4H9HA 4WL6A 2BLXA 3W3EA 1C6KA 1MELL 1OUBA 5KXLA 4GLAA 138LA 1C6LA 1NDGC 4DDAA 1GAZA 213LA 3TMUA 1CKGA 1C65A 1LHIA 1T97A 5KXSA 5LA5A 3HTFA 5ILFA 1L12A 1CU5A 153LA 1N4FA 2LYOA 1L0KA 2YBNA 3LZ2A 260LA 1UIBA 1P46A 1KXWA 5KKIA 1LYSA 128LA 4PRUA 165LA 2ZYPA 1QUGA 2EQLA 3OE6A 5LINA 2B6WA 3OJPA 1IP6A 1L75A 4NG8A 141LA 163LA 1L91A 4LYCA 1UICA 2Z38A 1UUZC 4PK0A 3A95A 1LSCA 3B72A 1NBYC 5II3A 2BQFA 3EXDA 1IWZA 4ET8A 4XJHA 5B59A 1GB2A 1I1ZA 1LHLA 4NSHA 3P65A 1XGTC 1LMAA 3B0KA 4AGAA 1UACY 4OWBA 1JTOL 2MEIA 2BQOA 1RFPA 1C43A 3VW7A 1GFGA 1QSBA 1SWYA 4XJFA 3A3RX 4CHXA 5KJ9A 1GDWA 1IP7A 1WTNA 5B06A 3DN0A 1L52A 1A2YC 4B4JA 1L33A 1SX7A 1UBZA 1VAUA 1XGPC 251LA 236LA 170LA 3P64A 1P2CC 4OWCA 1BWHA 1UIHA 4DDCA 1K28A 1JTPL 1FLUA 5ILCA 1NQIA 2GV0A 3K3TA 2BQBA 198LA 3SP3A 1C67A 1L15A 1LZAA 3TXEA 3CDQA 1GDXA 1C6MA 3CT1A 9LYZA 4GCCA 1DI4A 4I7OA 4RW1A 3CT0A 3FE0A 150LA 1T3PA 2B75A 5LAGA 4DAJA 125LA 1GFRA 2VB1A 1G06A 2RBQA 1G1VA 103LA 2ANXA 5KY1A 1IP3A 4H90A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ULR A;  4GCF A;  5HMJ A;  1LMP A;  2LZM A;  4W56 A;  1J1O Y;  1L82 A;  3HH5 A;  1LWK A;  4EPF A;  1IC5 Y;  1OUJ A;  3A6B Y;  4DD3 A;  4ARM B;  4NWH A;  2WAR A;  3DN6 A;  162L A;  1L04 A;  3P4Z A;  2A7F A;  1B5V A;  1DZB X;  1ZVH L;  1YL1 X;  1GB3 A;  4Z41 A;  4RLM A;  4DD9 A;  2F2N A;  4WLD A;  1DPW A;  1FN5 A;  1QTE A;  1GFJ A;  2CDS A;  3GUK A;  4XN6 A;  5A3E A;  3HUK A;  3A6C Y;  1L36 A;  2W1Y A;  3C80 A;  1CX7 A;  4I0C A;  4NGZ A;  1LJK A;  3WU9 A;  3WMK A;  3A93 A;  1L73 A;  1LYI A;  4IAT A;  1GE3 A;  1IY3 A;  1VDQ A;  3EBA B;  1GD6 A;  3GXK A;  1QDT A;  3G3B B;  1L88 A;  2ZNX Y;  3LN2 A;  1GFH A;  3W6C A;  3QAK A;  1GXV 2;  1L00 A;  4NGK A;  1L84 A;  1L01 A;  1G7J C;  1IOS A;  3SB8 A;  1OUF A;  1TCY A;  1NBZ C;  1KY1 A;  2BQI A;  1L13 A;  1GF0 A;  1LYJ A;  4LYM A;  3J4G A;  4QEQ A;  1YAM A;  1ZUR A;  1IEE A;  4R6C A;  2MEE A;  1JKB A;  4ETB A;  2CWI A;  2Q9D A;  3SN6 R;  3C7W A;  3HUQ A;  3RZE A;  1LMC A;  1LZR A;  166L A;  1O23 A;  2NTH A;  1LHM A;  4AXT A;  4NIJ A;  156L A;  1EPY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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