1IR9A

Im mutant of lysozyme
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKMVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords lysozyme
publication title Tolerance of point substitution of methionine for isoleucine in hen egg white lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 51
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2001-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ir9A00
135LA 4GLAA 1BWIA 1UIGA 4GCFA 4XJGA 1DPXA 5LAFA 2ZYCA 4H9CA 3WUNA 5B59A 5C6LA 1EQ4A 4WMGA 4ZFPA 5KXMA 3P64A 4EMNA 4G49A 4PRQA 1BWHA 5I4XA 1D0KA 194LA 1OP9B 3WUMA 4ZEEA 1OUAA 2MEHA 3WPKA 2MEDA 3WXUA 3RZ4A 1KXXA 3TXKA 5KXLA 1B7LA 4LGKA 4J1AA 1G7HC 1IOCA 1TAYA 3ATOA 1QTEA 1IWWA 1LJJA 4HSFA 1KXYA 3EMSA 4DD3A 3P68A 1G7MC 4NEBA 5LXWA 2BPUA 5FCPA 5HNLA 1YL1X 1NQIA 1JTOL 2HU1A 5APCA 2HEEA 5KXSA 3WU9A 2C8OA 4WM2A 1AT6A 3LZTA 1UIAA 5APDA 1LHJA 3TXEA 1GF7A 3LZ2A 1IO5A 1REMA 4UWUA 4A7DA 4ETEA 9LYZA 3AGGG 1GBOA 5L3HA 4H94A 1IEEA 2BAAA 2HEBA 4Z3MA 1LSEA 1WQPA 2YBIA 4H8YA 4WOAA 5DL9A 2D4KA 2FYDA 4NSJA 4WLXA 1LZ4A 2Z38A 2Z12A 1LZNA 1RI8B 4II8A 4N8ZA 1XGQC 1XFPL 4WM6A 4TUNA 3LHMA 1JTPL 1OUCA 3WULA 5A3EA 1GB5A 5HNCA 4ETBA 4KT3A 2H9JA 1Z55A 1B7PA 1LHKA 1QUTA 3A6BY 4AGAA 4YF2A 1GD6A 1LYYA 1DXJA 2CDSA 2HUBA 3MGWA 1KIQC 1LSGA 4H93A 5II3A 4NGLA 5KY1A 3A91A 3W6EA 1LSCA 1IIZA 4OWAA 4MR1A 3AW7A 1AKIA 1GF9A 2LYOA 4RDSA 4H90A 3W6AA 1FKQA 1LZCA 3BKHA 1KIRC 2GV0A 4G4CA 1GF5A 4NGOA 4NWEA 1W6ZA 1UUZC 2IHLA 1BB7A 4B1AA 4J1BA 2XTHA 3F6ZA 4Z46A 1WVVA 4OWHA 4YM8A 5KXNA 1JJ1A 1UCOA 1INUA 1JUGA 2WARA 1LSNA 1WVUA 2C8PA 1GBYA 3WW5A 4CFOA 5KKJA 1B7RA 1FLYA 4LYTA 5B06A 1GAZA 5LA8A 4TWSA 1C46A 1HEMA 2MEAA 4NGVA 1FKVA 1GF4A 4LYCA 1D0MA 1FDLY 1LOZA 1QSWA 4L41A 3OJPA 1LZAA 1UACY 1WQOA 4LT0A 1JJ3A 4OWCA 1UIBA 1WQMA 1LJHA 1B5XA 1C10A 3AZ5A 4N1EI 4HJZA 1WQQA 208LA 3WU8A 5L3IA 1B7SA 3TXFA 1LAAA 1EL1A 1GB7A 1BVKC 1JWRA 4CHXA 2Y8PA 4H9BA 3CT5A 5E9RA 3WH1A 5KXXA 154LA 3ATNA 2IFFY 4ZIXA 4TSCA 1BHZA 3AZ4A 1JKDA 2ZNXY 2H5ZA 3AGIA 3N9EA 1IC4Y 4J7VA 4DD2A 1GFGA 1IP7A 1NF5A 1I1ZA 5I54A 3A95A 4OOOA 1CKFA 4N1CC 1QDRA 1ALCA 3A93A 5LYZA 4AXTA 5LA5A 3AGHA 1BB4A 1TDYA 5LINA 2ZWBA 1DKKA 4NGKA 2YVBA 3CT0A 1LMTA 3K3TA 4HTKA 1HC0A 4FDYA 4WM3A 1B7NA 1GF0A 1IR7A 4GN5C 2BQKA 3WPJA 4DD7A 4NG8A 1N4FA 2W1LA 3WVXA 4WM5A 3RNXA 4NG1A 3J4GA 1IP3A 1RJCB 1GXXA 1GE4A 1IOSA 1F6SA 4G4HA 3RT5X 1LZ6A 1T6VL 1BGIA 1GDXA 4TSBA 3SP3A 4YEMA 2HEFA 1FLUA 2FBBA 4UWNA 3M18B 1I20A 4N5RA 5KXRA 4WL6A 1IVMA 1LSFA 2DQFC 1NBZC 1T3PA 1B5VA 2DQEY 3LYTA 4ET8A 1LHMA 1G7JC 1XEJA 2BQFA 1NWGA 2LYMA 5DLAA 4XN6A 4NIJA 4G9SA 1CJ6A 1IWZA 5E4PA 2Z2EA 1LMCA 4LYOA 4B0DA 4NHPA 1YANA 1C7PA 4MCKA 1J1OY 1B5YA 4XJIA 1GDWA 3TXHA 5B07A 1VDSA 3ZEKA 1LJEA 3A94A 4HPIA 3HFMY 1IWXA 3EXDA 5LAGA 1IWVA 1JISA 4NSGA 3FE0A 1HELA 4RW2A 5JENB 4DDAA 1IY4A 4NFVA 1LSZA 1LZYA 1TEWA 1GFJA 5F9XA 1LZGA 1GHLA 1QUSA 4HP0A 1TCYA 5LVKA 1CNSA 5DM9A 3ULRA 2YSSC 4NGZA 3W6BA 1BQLY 1LHIA 2PC2A 1CKCA 1UICA 1EQEA 4M6DA 1LHHA 1OUJA 1YILA 2YBNA 5KJ9A 1B7OA 3A8ZA 3IJVA 5T3FA 3WXTA 1EQ5A 1F6RA 1IR9A 2F2NA 4ML7A 1QDTA 1GFEA 1GB3A 3CSQA 4ET9A 1HFYA 3IWRA 5LVHA 1H87A 4XYYA 1CKGA 1IWUA 2BQHA 1GB2A 4GLVA 1GFTA 2DQGY 3TMXA 1J1XY 132LA 1YL0X 1LZDA 2F4GA 2XBRA 5IELA 4MSTA 1LKSA 2X0AA 4LFPA 3B0IA 4PHIA 1REZA 1GPQC 4WG7A 5I4YA 1HFZA 3HBEX 4DDBA 1LZEA 4LYMA 1IC7Y 3LN2A 1GFHA 1JHLA 1LZRA 4GN4A 3M3UA 5I5QA 3WW6A 1VFBC 1LZ8A 4BAFA 1HEWA 1WQRA 1JJ0A 5C6JA 1OUHA 1IP5A 1MELL 2AUBA 2ZILA 4I8SA 4LYZA 1ZVHL 1DI3A 3G3AB 2CGIA 5A3ZA 4NGIA 2YDGA 3TMWA 1D6PA 4H8ZA 1QQYA 4WG1A 1GF6A 1OQMA 2Z37A 4H9IA 4NHTA 5AMYA 1LTMA 4KXIA 2YBJA 4HV2A 3T6UA 3B6LA 1GEVA 3EBAB 1B7MA 1FN5A 5F81A 1DZBX 1CKHA 2HEAA 1BVXA 3AZ7A 2F30A 4NHQA 2ZIKA 4WM1A 2MEIA 4NSHA 1LSDA 2HECA 2YBMA 2BLXA 2DQCY 5DN5A 2MECA 1XGUC 1D6QA 2D4JA 3RW8A 3W6DA 5LYMA 5C6IA 5HMJA 1UBZA 3HBDA 2BQNA 1NHEA 1LJ4A 2LYZA 6LYZA 4NGWA 5B05A 1KXWA 1LZTA 1YQVY 4DDCA 3W3EA 1IC5Y 4YENA 1LYOA 1HSXA 2Z2FA 1HFXA 3J6KA 5KXKA 4B4JA 4IATA 1MLCE 1D9UA 3A90A 1LZ5A 4QY9A 1XEKA 2G4QA 4CFPA 3P4ZA 1JPOA 2HU3A 2ZQ4A 5ILCA 1QSAA 5I53A 2BQDA 5HQ1A 4YEOA 1LJFA 2FBDA 3CSRA 1OUEA 3CB7A 1SLYA 1LYSA 4W94A 2DQDY 2ZQ3A 2MEGA 4LFXA 1YKXX 5FSTA 2EIZC 5IDDA 1HEOA 1C08C 4BAPA 3ZVQA 4DD0A 1JEFA 1FBIX 3BKVA 1LZ1A 4WL7A 1YAOA 1BB6A 5FHWA 4H9AA 5B1GA 3IJUA 1UA6Y 1GB9A 4H9HA 1GB0A 1JSEA 1IORA 1JKCA 1HERA 4GCDA 4H8XA 1AT5A 1LJIA 2ZNWY 3FI7A 4H92A 1GFRA 1IOTA 1VDQA 4PRUA 3TXDA 4NGJA 3QNGA 1JSFA 1LMNA 1IP4A 1F10A 3B72A 1DQJC 1LSPA 3N9CA 1LCNA 3CQLA 2D6BA 4OWEA 4NHSA 2LZ2A 1CKDA 3D3DA 3AZ6A 3G3BB 2I25L 1LJ3A 3WUAA 1REYA 1RE2A 4G4BA 2EQLA 5F9UA 5FEKA 1LZSA 4LT3A 1LSBA 4H9FA 4OOTA 1GB8A 4XJFA 1LMOA 3AW6A 2N5ZA 4PJ2C 1OUIA 3CSZA 3WYHA 5DN4A 1HHLA 3N9AA 1HSWA 4HJVA 4YOPA 2I6ZA 4HTNA 3A67Y 2CWIA 4NY5A 1GE2A 1XSFA 2BQEA 4QGZA 4BADA 1FLQA 4ETDA 2BQOA 4KPMA 5M1YA 1HF4A 4B49A 2BQLA 3WU7A 1IP6A 1OUDA 1VDPA 1YAQA 4QDNA 4O34A 5KXWA 2H9KA 3KAMA 1P2CC 4Z98A 1IY3A 5HMVA 1BB3A 4GCEA 2W1MA 5I4WA 2HEDA 1VEDA 4ETCA 3T36A 4XJBA 3OK0A 4EOFA 1AZFA 1XGTC 4NSIA 1DKJA 1OUFA 2DQHY 2Z18A 4RW1A 2DQJY 2NWDX 1HEPA 5B1FA 5LVGA 1IX0A 1YKZX 4U3XB 4C3WA 1GBWA 1LJNA 1A2YC 1RCMA 3CT1A 5D5CA 1LZBA 1GXV2 3W6CA 5LVJA 1D0LA 2FYCA 1JIYA 4N0JA 3A34A 3W6FA 2BQMA 1JKAA 1YKYX 2Z19A 1CJ7A 1G7IC 5HLLA 1FLWA 5IHGA 2DBTA 1UIHA 1LMAA 1QIOA 2D4IA 4GCCA 5L9JA 3TXBA 1JKBA 1KIPC 3LYMA 2YBHA 4OWBA 5EBHA 1GBXA 2D91A 1LYZA 1LJKA 3WMKA 1XEIA 4DD1A 1B5UA 1B7QA 2ZYPA 4DC4A 4TX7A 4W96A 4UWVA 1LZ9A 3A3RX 4DD9A 4CGEA 3EO5A 3P66A 1IR8A 2F4AA 4LT1A 3B0KA 2LZTA 4KL7A 4E3UA 1IOQA 1GBSA 1YAMA 2CJLA 1GB6A 5FELA 1UIFA 3HBHA 4PGJB 1V7TA 1UIEA 4WLDA 1WQNA 5LVIA 2B5ZA 1GFAA 4RLMA 4B4IA 1WTNA 1HNLA 4XJDA 1A4VA 2MEBA 3D9AC 2EKSC 1DPWA 5ILFA 4DWXA 1JITA 4QEQA 1BWJA 1HMKA 1OUBA 1REXA 1VDTA 5FDJA 4LZTA 3LYOA 1NDMC 4HPEA 1NDGC 4ETAA 1NMMA 2Z39A 3LYZA 3WVYA 1XGRC 4TTDA 1B0DA 1VATA 1W08A 3QY4A 2A7FA 4WLYA 2BLYA 4HJYA 4IJ4A 1GFVA 2ZIJA 5KXOA 1GBZA 4LT2A 3E3DA 4IASA 1G7LC 1IP2A 1DI4A 1GE3A 2RSCA 1B5ZA 1SQ2L 3A3QA 4WLTA 1C43A 4J0LA 1LPIA 4WO9A 8LYZA 3WPLA 3TMUA 3A92A 4D9ZA 3TXIA 2DKVA 4HTQA 1AM7A 4DYGA 3TMVA 1VAUA 1IWYA 1B5WA 5APEA 5F14A 1GF8A 1BB5A 5LIOA 1GAYA 1QTKA 5KXTA 2YBLA 4NWHA 4LYBA 2DQAA 1ZVYB 2MEFA 1IP1A 1JTTL 1YIKA 5KXYA 1UIDA 4RLNA 5F16A 1LSAA 4GCBA 2DQIY 3GXKA 1C45A 1YROA 1ZMYL 4NGYA 4NHIA 1XGPC 133LA 4H9EA 2G4PA 2G4NA 2A7DA 4FJRA 1F0WA 4H91A 4HV1A 207LA 1B2KA 1J1PY 1HMLA 2W1YA 4WM4A 1LKRA 3WL2A 5KXZA 3A6CY 153LA 2BQGA 6LYTA 4I0CA 5KKIA 2Q0MX 5D5FA 1LSYA 2I26L 3P65A 4GN3A 5K7OA 2HTXA 1NBYC 7LYZA 1HEQA 2BQCA 1O23A 3QE8A 4PPOA 5KXPA 1E8LA 1I56A 1OUGA 2BQIA 1PZYA 2XJWA 3AJNA 1GE1A 2W1XA 2BQAA 3A96A 1LSMA 1GFKA 1IWTA 1CJ9A 3B0OA 4XADA 2VB1A 1DI5A 1LHLA 4H1PA 1LJGA 4OW1A 1GWDA 4DT3A 1GFUA 2MEEA 1YAPA 4R6CA 1UC0A 1B9OA 1HENA 4R0FA 1LMPA 4WO6A 1TBYA 1RFPA 4B4EA 5J7CA 3VWOA 4XENA 2LHMA 4ANRA 1GE0A 1PS5A 3TXGA 4CJ2A 2BQJA 3TXJA 2EPEA 1ZV5L 1V7SA 1CJ8A 4N9RA 1LMQA 5LYTA 3ZVQB 4XJHA 134LA 1WTMA 4X3BA 4BS7A 1H6MA 1NKHA 1GF3A 3AYQA 3AB6A 4M4OA 2XBSA 3GXRA 4P2EA 4C5FA 4Z41A 3RU5A 1GEZA 2BQBA 5APFA 193LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
135LA 5LAFA 4CGEA 4H9CA 1EQ4A 4WMGA 3D4SA 3P64A 4G49A 1BWHA 194LA 1OUAA 2MEDA 3RZ4A 3TXKA 5KXLA 1B7LA 3ATOA 1L98A 1K28A 1C6BA 1L93A 4DD3A 3P68A 1G0LA 1L53A 5HNLA 1JTOL 2HU1A 5KXSA 3WU9A 1G07A 1GF7A 3LZ2A 1REMA 4A7DA 1QT7A 1WQPA 5DL9A 2D4KA 4NSJA 176LA 147LA 2Z38A 2Z12A 1XFPL 5HNCA 3LHMA 237LA 142LA 1L00A 1GB5A 5A3EA 1G0GA 2O7AA 1L05A 1LHKA 1QUTA 1Z55A 1LYJA 4S0WA 1LYFA 1KIQC 1L82A 4NGLA 1LSCA 1IIZA 1KW5A 1L75A 3DN6A 1GF9A 2LYOA 1L72A 1TLAA 3PDSA 4Z46A 1C6PA 4OWHA 3HUQA 2WARA 1LSNA 3GUJA 2C8PA 1GBYA 1C46A 4NGVA 3V2WA 1LGUA 1D0MA 1FDLY 1LOZA 3OJPA 1LZAA 1JJ3A 1QS9A 1JTNA 4OWCA 1LJHA 1C10A 1WQQA 1B7SA 3TXFA 1EL1A 3EMLA 4CHXA 5KXXA 5E9RA 3WH1A 1G0PA 123LA 4LDLA 3N9EA 1CKFA 1QDRA 3A93A 4AXTA 3AGHA 1BB4A 3SN6R 252LA 1C6EA 4FDYA 1B7NA 4GN5C 4DD7A 1L40A 3WVXA 1L97A 1IP3A 1RJCB 3C7ZA 4ARMB 1IOSA 3C8RA 1F6SA 3RT5X 1GDXA 236LA 2HEFA 4UWNA 3M18B 140LA 1QTCA 5KXRA 1CV4A 1OV7A 1LSFA 1QTZA 2DQFC 3LYTA 2BQFA 1XEJA 5DLAA 1LMCA 4LYOA 2ANVA 1C7PA 1G06A 1J1OY 165LA 4EJ4A 3FE0A 4NFVA 1TEWA 5F9XA 4HP0A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 135L A;  4GLA A;  1BWI A;  1UIG A;  4GCF A;  4XJG A;  1DPX A;  5LAF A;  2ZYC A;  4H9C A;  3WUN A;  5B59 A;  5C6L A;  1EQ4 A;  4WMG A;  4ZFP A;  5KXM A;  3P64 A;  4EMN A;  4G49 A;  4PRQ A;  1BWH A;  5I4X A;  1D0K A;  194L A;  1OP9 B;  3WUM A;  4ZEE A;  1OUA A;  2MEH A;  3WPK A;  2MED A;  3WXU A;  3RZ4 A;  1KXX A;  3TXK A;  5KXL A;  1B7L A;  4LGK A;  4J1A A;  1G7H C;  1IOC A;  1TAY A;  3ATO A;  1QTE A;  1IWW A;  1LJJ A;  4HSF A;  1KXY A;  3EMS A;  4DD3 A;  3P68 A;  1G7M C;  4NEB A;  5LXW A;  2BPU A;  5FCP A;  5HNL A;  1YL1 X;  1NQI A;  1JTO L;  2HU1 A;  5APC A;  2HEE A;  5KXS A;  3WU9 A;  2C8O A;  4WM2 A;  1AT6 A;  3LZT A;  1UIA A;  5APD A;  1LHJ A;  3TXE A;  1GF7 A;  3LZ2 A;  1IO5 A;  1REM A;  4UWU A;  4A7D A;  4ETE A;  9LYZ A;  3AGG G;  1GBO A;  5L3H A;  4H94 A;  1IEE A;  2BAA A;  2HEB A;  4Z3M A;  1LSE A;  1WQP A;  2YBI A;  4H8Y A;  4WOA A;  5DL9 A;  2D4K A;  2FYD A;  4NSJ A;  4WLX A;  1LZ4 A;  2Z38 A;  2Z12 A;  1LZN A;  1RI8 B;  4II8 A;  4N8Z A;  1XGQ C;  1XFP L;  4WM6 A;  4TUN A;  3LHM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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