2Z38A

Crystal structure of chloride bound brassica juncea chitinase catalytic module (bjchi3)
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
EFGDLSGIISRDQFYKMLKHMNDNDCHAVGFFTYDAFITAAKSFPSFGNTGDLAMRKKEIAAFFGQTSHETTGGWSGAPDGANTWGYCYKEEIDKSDPHCDSNNLEWPCAPGKFYYGRGPMMLSWNYNYGPCGRDLGLELLKNPDVASSDPVIAFKTAIWFWMTPQAPKPSCHDVITDQWEPSAADISAGRLPGYGVITNIINGGLECAGRDVAKVQDRISFYTRYCGMFGVDPGSNIDCDNQRPFN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitinase
publication title Crystal structures of a family 19 chitinase from Brassica juncea show flexibility of binding cleft loops
pubmed doi rcsb
source organism Brassica juncea
total genus 89
structure length 247
sequence length 247
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2007-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2z38A01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 2z38A02
1IC7Y 1DKKA 4GCBA 2X0AA 1HNLA 4PJ2C 5FHWA 3WXUA 3OJPA 208LA 1IY4A 5K7OA 1J1PY 1GFTA 2ZNWY 1GB0A 2YBNA 4LYZA 3GXRA 4WO9A 3EBAB 1JKBA 1NF5A 1LZCA 1LSAA 2DQCY 2Z38A 5KXYA 4PPOA 1YKZX 3QY4A 2D6BA 1LMPA 4II8A 4OW1A 5FEKA 1UIHA 1W6ZA 2CDSA 133LA 3A6CY 1IP1A 1V7SA 4WM3A 4J0LA 4XJGA 4CHXA 2EPEA 5LVKA 4GLAA 2ZQ4A 5T3FA 2Z18A 1JEFA 1GAYA 4YENA 2YDGA 4NHIA 1GB7A 1FLYA 2DQDY 3EMSA 4WL6A 1XGTC 3OK0A 4PHIA 1GBOA 1MLCE 1IP2A 1UIBA 3A34A 2GV0A 5DM9A 135LA 4NFVA 1IR9A 1QDRA 2BQGA 1P2CC 1D6QA 4DD1A 1IP7A 4DT3A 1B2KA 2HEBA 1LZDA 1LJ4A 2WARA 4X3BA 1ALCA 5E9RA 4CFPA 4NEBA 1B7SA 2H9JA 1GEZA 4OOTA 3CT1A 1IOQA 3M3UA 3W6BA 3WH1A 1REMA 1JJ3A 3CSZA 3A96A 2IFFY 5II3A 5KKIA 2AUBA 4TSCA 1OUIA 1B7QA 5KXOA 1NMMA 1WQPA 4G4HA 4M4OA 1ZVYB 3WU7A 1FLQA 2HTXA 3WVYA 4NGIA 1YAPA 2CGIA 4TX7A 3TXJA 4XJBA 1LJFA 1G7IC 1B7LA 1AZFA 3ZVQA 4H8ZA 4DDBA 4YEOA 1HC0A 2BLYA 2D4JA 4QEQA 4LGKA 3WPLA 1INUA 2NWDX 4ET8A 1C08C 1GBZA 5EBHA 5LA5A 4TUNA 1KXXA 2D91A 2FBBA 2BLXA 3A93A 5I5QA 3ULRA 5M1YA 134LA 1B9OA 1B0DA 1GDWA 1LSPA 5B07A 1HHLA 3CB7A 2MEEA 4C3WA 3P66A 4H9FA 3AGGG 5FDJA 1GBYA 4XYYA 3RU5A 4DWXA 1UIGA 1V7TA 4UWUA 1YL1X 1IP6A 1IWZA 4EMNA 4WOAA 5I54A 1LJGA 4WM1A 1NQIA 4B49A 4DDCA 5JENB 1AT5A 1QTKA 1LSMA 2MEFA 4HJZA 3LYZA 4NGZA 1IY3A 3N9EA 3RNXA 5FCPA 2G4NA 1HSXA 5ILFA 207LA 1DI3A 4Z41A 2ZNXY 2ZWBA 1XEKA 1B5UA 1OQMA 4DD3A 4AGAA 4HTKA 1GF8A 4XADA 1D9UA 1YROA 1C7PA 1LKRA 1G7JC 1B5ZA 1LSNA 2CJLA 4KPMA 1YAMA 4PGJB 154LA 1LKSA 2ZILA 1HERA 4WL7A 4J1BA 1RE2A 1KIQC 1EQEA 1JKAA 1YANA 4YOPA 1LYZA 1TDYA 4G49A 2MEAA 4HSFA 2HEEA 1BB4A 4MCKA 1TAYA 1G7LC 1IP3A 3CSQA 3AW6A 4HJYA 1UC0A 5KXTA 1FBIX 3WU8A 1F6RA 1GFEA 1LHIA 2DQJY 2B5ZA 3B72A 4G9SA 4GN4A 1JPOA 4WLYA 4RW1A 1UBZA 4H92A 3AYQA 4UWNA 4N8ZA 1TCYA 1LJNA 1GF9A 5C6IA 1SQ2L 4RDSA 2MEIA 1LMCA 1KIRC 1NHEA 1OUDA 1HMLA 1LZTA 1KXWA 2LZTA 1T6VL 1LSZA 1UA6Y 1BVXA 1XSFA 3WVXA 3P68A 4PRQA 3SP3A 4QY9A 4NWHA 1YKYX 5APCA 4H8YA 3W6FA 4HP0A 5C6JA 194LA 5KXMA 1NWGA 1OUBA 2BPUA 1LZNA 5A3ZA 4NSIA 3W6EA 2HEFA 3BKHA 3T6UA 1LZ1A 1LJIA 3EO5A 153LA 1H87A 2DQIY 1LMQA 1BGIA 4NSJA 1WQRA 3TXDA 1C10A 2Z2EA 3D3DA 5HNCA 1IO5A 2DQGY 5LYTA 3AZ6A 4DD2A 2LYZA 3WUMA 4GN3A 1LSEA 1IWYA 4WLTA 2IHLA 3QE8A 4A7DA 4WM5A 4H9EA 4R0FA 1RFPA 1VATA 4G4CA 3KAMA 4ET9A 5F14A 3RZ4A 2D4KA 5HLLA 5LINA 2I6ZA 2BQCA 3LZ2A 3AW7A 3B0KA 1WTMA 1LHLA 3GXKA 2DQAA 3HBHA 1IWVA 4I0CA 1JUGA 1RI8B 4L41A 4XJIA 4GCDA 1GE3A 5KJ9A 3F6ZA 2YSSC 2XJWA 1D0MA 4H94A 4B4IA 1GB3A 1CJ9A 5I4WA 1I1ZA 1GF6A 1LZRA 1LHHA 3A3RX 3AGHA 4LYOA 4N1CC 1TBYA 1OUEA 2CWIA 3A8ZA 1NDMC 5B1FA 3A6BY 1LSYA 5LIOA 5KXWA 1C43A 1FLWA 3M18B 3EXDA 3A95A 5APDA 3TXKA 2W1MA 2BQNA 3TMVA 1CKGA 5ILCA 2YBIA 1LJEA 4DDAA 2HU3A 4LYTA 3LHMA 4HPEA 1FLUA 2F4GA 2C8PA 3TMWA 3E3DA 3TXFA 1F6SA 2D4IA 1VFBC 4ETCA 2BQDA 2MEDA 3WXTA 4CFOA 1GFJA 1UIEA 5J7CA 1JITA 4LT1A 1ZV5L 4N1EI 5D5CA 5HNLA 2DQEY 4LFXA 2HUBA 1IOTA 1O23A 3AGIA 4M6DA 1LZEA 2Q0MX 3W6CA 4HPIA 3J4GA 4WLXA 1YILA 1OUAA 1JHLA 3BKVA 4ETAA 2F4AA 1JWRA 1LZBA 2BQIA 4KXIA 3A91A 2YBMA 1XEIA 5LVHA 1DQJC 1UIFA 2F2NA 2Y8PA 4H9AA 5IDDA 3WU9A 5I4YA 1GF5A 1LYSA 4GLVA 4ML7A 2BQLA 4NSGA 1DXJA 1LHJA 4YM8A 4NHPA 4Z98A 1LMTA 4RLMA 4EOFA 4O34A 3IJVA 1OUCA 4HV2A 4NG1A 1HEMA 5DL9A 1N4FA 1UICA 1UUZC 1XFPL 3AZ4A 4QDNA 2BQEA 5I53A 4J1AA 1SLYA 2W1XA 4H9HA 4WG7A 4NG8A 3T36A 3ATOA 1LHKA 2ZIKA 1FKQA 4D9ZA 2FYCA 3ZEKA 4BADA 8LYZA 3WMKA 5KY1A 1D0KA 1J1XY 1LSCA 1WVUA 1JKCA 1NBZC 3A94A 1JJ0A 4IATA 4OOOA 4OWAA 1GBSA 1ZMYL 1GAZA 1QTEA 1GB6A 5LAGA 1F10A 4W94A 5KXSA 3LYMA 4NSHA 3K3TA 1J1OY 1FN5A 4LFPA 1CNSA 1BVKC 1QUTA 4LZTA 1IIZA 2LZ2A 4NWEA 5HMJA 2YBJA 2YVBA 1HFZA 3RT5X 1GE0A 1LJJA 2MECA 2DQFC 1GFKA 1DPWA 4IASA 1GDXA 1HEQA 1B7OA 1LZ6A 1LZ5A 1WQOA 4UWVA 4WO6A 1GFRA 4DYGA 1GB2A 1GFGA 5LVJA 1OP9B 1WQQA 2G4PA 2BQMA 1A4VA 1IR7A 4OWHA 3CT5A 4TSBA 5KXNA 1GD6A 1IOCA 4GCCA 1REXA 4NHTA 1AM7A 1HSWA 1LAAA 3WPJA 5DN4A 4LYCA 1BWIA 1IWTA 5LVIA 4WM6A 1LTMA 1AT6A 1Z55A 4XENA 1LHMA 5APFA 1GF7A 1VAUA 2N5ZA 1I56A 2HECA 1IR8A 2YBLA 5KXZA 9LYZA 3RW8A 5F81A 1HMKA 2I26L 3W3EA 1MELL 1VDPA 193LA 4B4JA 5C6LA 1B7NA 5HQ1A 4LT2A 4R6CA 5HMVA 1HEPA 1WQMA 1CJ8A 4LT0A 5F16A 1WTNA 4ETDA 4ZFPA 1GBWA 2RSCA 1LSBA 3B0IA 4HTNA 1CJ7A 2MEGA 3G3BB 4OWCA 1XGRC 1GHLA 1REZA 2W1YA 1IWUA 4N5RA 2BQKA 2BAAA 1GB8A 4NGKA 5B06A 4E3UA 4ZIXA 2BQJA 2LYMA 2Z37A 4WLDA 1XGQC 2A7DA 4XJHA 5F9UA 3HBDA 1QDTA 1YQVY 2F30A 4H9BA 1OUHA 1IX0A 1DPXA 1LZGA 4H91A 1CKFA 2BQBA 4H8XA 4U3XB 5B1GA 1QSAA 4OWBA 2LHMA 1NBYC 1IORA 4Z3MA 1PZYA 2EKSC 1LZ8A 1HENA 1H6MA 4KT3A 2MEHA 5LYMA 2A7FA 2XBRA 2HEDA 3AB6A 4DC4A 1LZSA 1GFUA 5KXPA 6LYZA 1LMNA 1B5WA 3P64A 4RW2A 4NIJA 1EQ5A 1UACY 1RCMA 5AMYA 4C5FA 4W96A 3AZ5A 3VWOA 1GXXA 1JSFA 1HFYA 5KXLA 3TXBA 1HELA 3WPKA 4HJVA 1OUGA 3CSRA 1HEOA 2G4QA 1JSEA 2EIZC 3B0OA 1LJ3A 3IJUA 4IJ4A 1UCOA 1QQYA 1GF3A 4ETEA 1B5VA 4AXTA 1DI4A 5A3EA 3MGWA 3W6DA 4N9RA 1HEWA 1UIAA 1C46A 4ANRA 1LYYA 3AZ7A 4WM2A 3WYHA 5L3IA 1B7RA 4LT3A 2MEBA 5E4PA 1D0LA 4NGOA 3LN2A 3N9AA 4LYMA 4B0DA 1KXYA 4FJRA 4NGYA 4DD7A 1JTOL 1GXV2 4FDYA 4QGZA 5L3HA 1CKCA 4WMGA 1B5XA 1NDGC 3B6LA 4NY5A 3CT0A 3TXHA 5L9JA 1XEJA 2BQFA 1XGUC 3A3QA 1QIOA 1BWHA 1VDQA 3A90A 2PC2A 1BWJA 1OUJA 7LYZA 1E8LA 1QSWA 2EQLA 1XGPC 1F0WA 1BB7A 4DD0A 1B7MA 4NGWA 4H1PA 4I8SA 1GBXA 1PS5A 1FKVA 1GEVA 4H9CA 2I25L 2BQOA 3W6AA 3P65A 1W08A 4P2EA 1CJ6A 4GN5C 3A67Y 1CKDA 2BQHA 2Z12A 5FELA 3TXIA 1CKHA 1G7HC 2FYDA 2HU1A 1LCNA 4GCFA 1YIKA 4BAPA 1LYOA 1EL1A 1EQ4A 2ZYPA 4NGLA 1LOZA 3LZTA 2BQAA 1IWWA 1D6PA 1LSFA 4ETBA 3FI7A 1IOSA 4TWSA 1UIDA 4HTQA 1C45A 4H9IA 3G3AB 1WQNA 5LVGA 4YF2A 2Z19A 3TXGA 1JTPL 1LJHA 3J6KA 1AKIA 2DBTA 1VDSA 2H5ZA 132LA 4J7VA 4XJDA 1IP4A 2Z39A 4Z46A 1LZ9A 2ZQ3A 3IWRA 1IEEA 1YAOA 3P4ZA 1BQLY 2HEAA 5D5FA 5F9XA 2DKVA 4B4EA 4BAFA 3CQLA 4NHSA 3ZVQB 1JKDA 1KIPC 1HFXA 2ZYCA 5APEA 1B7PA 1BB3A 1JIYA 1GF4A 1GE4A 2DQHY 1IC4Y 1G7MC 2FBDA 3ATNA 4NGVA 3WUAA 1QUSA 2Z2FA 3WUNA 5FSTA 1DKJA 5B05A 4XN6A 1WVVA 2LYOA 4RLNA 5DLAA 1LSGA 1BHZA 1LZ4A 1I20A 4CJ2A 4GCEA 1RJCB 1IP5A 5LAFA 4BS7A 5LYZA 5B59A 3TMUA 2YBHA 1LMAA 1NKHA 3AJNA 4OWEA 4YEMA 1GE1A 1LZYA 4DD9A 5KKJA 1GE2A 1GB9A 2ZIJA 1JISA 4LYBA 1DZBX 4WM4A 4H93A 5DN5A 5KXKA 1T3PA 3WL2A 1OUFA 3FE0A 1GFVA 6LYTA 3QNGA 4NGJA 2W1LA 4XJFA 5IHGA 5KXRA 2XTHA 1GB5A 1IVMA 4PRUA 1VEDA 1FDLY 2C8OA 3WW6A 1YAQA 3D9AC 1A2YC 4NHQA 1TEWA 4CGEA 1LMOA 4G4BA 1YKXX 3HBEX 3WULA 3HFMY 1BB5A 1GPQC 4H90A 1LSDA 4HV1A 4N0JA 5I4XA 1LPIA 3TMXA 1GFAA 4KL7A 1GFHA 2VB1A 5KXXA 1JTTL 3N9CA 1YL0X 3WW5A 1IWXA 1HF4A 1IC5Y 2H9KA 1VDTA 4MR1A 4ZEEA 5LXWA 1LZAA 1REYA 4WG1A 3A92A 3LYTA 1LJKA 3TXEA 2XBSA 1BB6A 3LYOA 5LA8A 1GWDA 1DI5A 4TTDA 1ZVHL 4B1AA 5IELA 1B5YA 4MSTA 1GF0A 1JJ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GCBA 1HNLA 165LA 3C8RA 5FHWA 3WXUA 3OJPA 208LA 1CV5A 5K7OA 4GBRB 1L27A 2YBNA 4WO9A 1L89A 1NF5A 4I7OA 1LZCA 4PPOA 1L11A 250LA 4J0LA 198LA 5T3FA 2Z18A 1P46A 4YENA 4NHIA 1FLYA 242LA 3EMSA 3OK0A 4PHIA 1MLCE 1IP2A 3A34A 5DM9A 1QDRA 247LA 1QUGA 5E9RA 3RUNA 1GEZA 3CT1A 1IOQA 2RBNA 3W6BA 188LA 4TSCA 1OUIA 1ZVYB 1P64A 2HTXA 2CGIA 4XJBA 3F8VA 4H8ZA 4DDBA 1HC0A 1L94A 1GBZA 5EBHA 4TUNA 3ULRA 102LA 5M1YA 4I7PA 5B07A 3CB7A 3AGGG 3RU5A 1QT7A 1QSBA 1QTKA 4HJZA 3LYZA 3N9EA 3HH3A 1L0JA 207LA 1DI3A 2ZNXY 4AGAA 1L14A 127LA 4PGJB 154LA 1LKSA 1HERA 4PJZA 1G07A 4ZPUA 1L66A 1JKAA 158LA 1TDYA 1BB4A 3DN0A 2QARC 1IP3A 3CSQA 3AW6A 3WU8A 2DQJY 4WLYA 1LJNA 1SQ2L 190LA 1L76A 1KNIA 1NHEA 1L72A 173LA 1KXWA 1L33A 3HUKA 181LA 1LSZA 2B70A 1WTHA 1L56A 1QTBA 2BPUA 1LZNA 5A3ZA 3W6EA 1LJIA 153LA 1DYFA 1BGIA 4NSJA 3D3DA 5HNCA 3WUMA 7LZMA 4R0FA 1RFPA 4G4CA 5HLLA 2BQCA 3LZ2A 2DQAA 1JUGA 1G0PA 4GCDA 4ARPA 3F6ZA 1L49A 3NY9A 2O7AA 1TBYA 1OUEA 5B1FA 1NDMC 1L91A 5LIOA 3CDOA 5APDA 1P6YA 3TMVA 3GULA 2F4GA 3E3DA 1GFJA 5J7CA 1JITA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1IC7 Y;  1DKK A;  4GCB A;  2X0A A;  1HNL A;  4PJ2 C;  5FHW A;  3WXU A;  3OJP A;  208L A;  1IY4 A;  5K7O A;  1J1P Y;  1GFT A;  2ZNW Y;  1GB0 A;  2YBN A;  4LYZ A;  3GXR A;  4WO9 A;  3EBA B;  1JKB A;  1NF5 A;  1LZC A;  1LSA A;  2DQC Y;  2Z38 A;  5KXY A;  4PPO A;  1YKZ X;  3QY4 A;  2D6B A;  1LMP A;  4II8 A;  4OW1 A;  5FEK A;  1UIH A;  1W6Z A;  2CDS A;  133L A;  3A6C Y;  1IP1 A;  1V7S A;  4WM3 A;  4J0L A;  4XJG A;  4CHX A;  2EPE A;  5LVK A;  4GLA A;  2ZQ4 A;  5T3F A;  2Z18 A;  1JEF A;  1GAY A;  4YEN A;  2YDG A;  4NHI A;  1GB7 A;  1FLY A;  2DQD Y;  3EMS A;  4WL6 A;  1XGT C;  3OK0 A;  4PHI A;  1GBO A;  1MLC E;  1IP2 A;  1UIB A;  3A34 A;  2GV0 A;  5DM9 A;  135L A;  4NFV A;  1IR9 A;  1QDR A;  2BQG A;  1P2C C;  1D6Q A;  4DD1 A;  1IP7 A;  4DT3 A;  1B2K A;  2HEB A;  1LZD A;  1LJ4 A;  2WAR A;  4X3B A;  1ALC A;  5E9R A;  4CFP A;  4NEB A;  1B7S A;  2H9J A;  1GEZ A;  4OOT A;  3CT1 A;  1IOQ A;  3M3U A;  3W6B A;  3WH1 A;  1REM A;  1JJ3 A;  3CSZ A;  3A96 A;  2IFF Y;  5II3 A;  5KKI A;  2AUB A;  4TSC A;  1OUI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1CNS A;  4LZT A;  2YBJ A;  1GE0 A;  2MEC A;  1HEQ A;  1LZ5 A;  1WQO A;  1GFR A;  1GB2 A;  1GFG A;  1C69 A;  1G06 A;  2G4P A;  1IR7 A;  4OWH A;  3CT5 A;  1IOC A;  4GCC A;  1L68 A;  1BWI A;  1L36 A;  4I7K A;  5LVI A;  1AT6 A;  4XEN A;  1L47 A;  4OO9 A;  1C65 A;  1HMK A;  4B4J A;  1MEL L;  193L A;  5HQ1 A;  5F16 A;  5LZM A;  241L A;  1L20 A;  4OWC A;  4N5R A;  2RAZ X;  2Z37 A;  4WLD A;  5F9U A;  3HBD A;  1YQV Y;  171L A;  2B74 A;  1DPX A;  4U3X B;  5B1G A;  4OWB A;  4W52 A;  2A7F A;  3AB6 A;  120L A;  4DC4 A;  1LZS A;  3HH5 A;  1L15 A;  1T8F A;  4RW2 A;  4NIJ A;  1UAC Y;  3AZ5 A;  6LZM A;  3TXB A;  1HEL A;  3WPK A;  1OUG A;  1JQU A;  2G4Q A;  1LJ3 A;  1UCO A;  1L82 A;  1ZWN A;  4ANR A;  1LYY A;  4WM2 A;  3WYH A;  1OWY A;  2B72 A;  185L A;  1QUD A;  155L A;  1L26 A;  2MEB A;  2B73 A;  1D0L A;  3LN2 A;  3N9A A;  3HT6 A;  1L17 A;  4FJR A;  4NGY A;  4FDY A;  1B5X A;  1QUO A;  4LDE A;  3CT0 A;  1CV1 A;  2BQF A;  1LYJ A;  183L A;  3SB5 A;  167L A;  1XGP C;  1F0W A;  1L51 A;  1BB7 A;  199L A;  1L19 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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