3C82A

Bacteriophage lysozyme t4 lysozyme mutant k85a/r96h
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLAPVYDSLDAVRHCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Contributions of all 20 amino acids at site 96 to the stability and structure of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteriophage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3c82A00
1C6FA 1G1VA 186LA 238LA 3SB6A 4ARMB 1LYHA 1L96A 1L49A 2B7XA 1PQOA 199LA 4EJ4A 4I7PA 3C7WA 1L46A 1L16A 1DYEA 141LA 162LA 138LA 180LA 2OTYX 3G3VA 188LA 1L30A 1L95A 2LC9A 3OE8A 1L61A 192LA 1QSBA 4W55A 2F47A 6LZMA 1LYEA 190LA 1C63A 1SSYA 4I7SA 254LA 1L21A 2CUUA 3HT7A 1QUHA 1C6CA 1L29A 4I7TA 4W58A 2F2QA 245LA 1L0KA 1OVKA 166LA 1L99A 3SN6R 3HTFA 1L19A 1L97A 118LA 1P2LA 1QTBA 3HTBA 1NHBA 1LLHA 1L08A 1C6HA 1L74A 3DMZA 2B6TA 4YX7C 1G0JA 3HT6A 3SB8A 3GUNA 2RBRA 4LDEA 1OV5A 3HH5A 241LA 1LGUA 176LA 1CV3A 3DN6A 2RB0X 1DYCA 2B6ZA 1L18A 5LZMA 1L38A 1L57A 1SSWA 1C6DA 3C8QA 148LE 3HWLA 1L23A 3SB9A 1DYBA 1QUGA 1L55A 161LA 250LA 210LA 215LA 1T8GA 4EKQA 1LGWA 1G0MA 3FADA 131LA 146LA 1L0JA 3SBAA 3HU9A 3HUQA 1PQJA 3GUPA 3L64A 1C69A 1L89A 3C7YA 2L78A 1P56A 2OU0X 169LA 1C66A 1OV7A 1LYFA 127LA 1L85A 2OE9X 1C6JA 228LA 214LA 3DNAA 1L73A 185LA 239LA 2OU9A 175LA 168LA 3D4SA 3DN8A 3L2XA 4I7QA 4EPFA 1P64A 130LA 4DKLA 4EKSA 209LA 1L12A 1L04A 1L11A 1B6IA 3FI5A 1L69A 4PJZA 3HU8A 222LA 4I7RA 3GUKA 1L26A 1L56A 1L92A 205LA 3C81A 220LA 1D3MA 1C6IA 3NY9A 139LA 102LA 1L35A 1C65A 244LA 3HDEA 243LA 1L76A 1C6NA 2LCBA 1CTWA 195LA 1L27A 1L68A 3PBLA 4I7NA 4ARQB 150LA 3HH6A 218LA 1L02A 1L05A 1L00A 151LA 1P37A 155LA 3DN2A 234LA 2NTHA 1K28A 3DN0A 213LA 2LZMA 184LA 4W54A 1C6GA 247LA 1G07A 2HUKA 1L09A 1CU3A 1D9WA 1QT7A 1ZURA 143LA 1L51A 1CUPA 5I14A 3FA0A 1QT5A 157LA 1P3NA 1L32A 4I7OA 2RBQA 2B72A 2RBNA 1L75A 226LA 174LA 4EXMA 1QTCA 163LA 1QSQA 1T6HA 260LA 1L28A 4W53A 4EKRA 1G0PA 249LA 3F8VA 1C6QA 120LA 216LA 3DN1A 1G06A 2B6XA 1L91A 1SX7A 1KNIA 144LA 4K5YA 1L64A 104LA 2QB0B 1PQDA 248LA 1QUDA 4I7MA 4S0WA 1SWZA 3DMXA 113LA 122LA 3OE9A 3CDQA 3GUJA 1L44A 149LA 2OE7X 4OO9A 1XJTA 1DYFA 1C6KA 181LA 1LI3A 1CV0A 1C6LA 189LA 1C60A 1L34A 3JR6A 2HUMA 4I7KA 4W51A 3HUAA 183LA 3RUNA 7LZMA 2O79A 4ARMA 2RH1A 1PQIA 2O4WA 219LA 171LA 3K2RA 1ZYTA 1KS3A 4W56A 1LPYA 235LA 4EKPA 128LA 3HTDA 108LA 4LDLA 1L67A 119LA 1L77A 3C8RA 3HH3A 1JQUA 1PQMA 1CUQA 1WTHA 223LA 1CU0A 3C7ZA 3VW7A 3OE6A 1QT4A 1L83A 2B6WA 2RAYX 3GUIA 1L37A 3GULA 1C64A 1L60A 2Z6BA 261LA 1KW5A 1C6EA 2RBSA 253LA 1L14A 236LA 125LA 2IGCA 3C82A 137LA 2OEAX 1G0KA 4ZPUA 1G1WA 2QARC 3DN3A 3F9LA 3NY8A 1L47A 1LI2A 206LA 3SBBC 259LA 2RBOA 1L06A 1C6AA 4E97A 1QUOA 1P6YA 129LA 3OE0A 3RZEA 187LA 1OWYA 3CDOA 109LA 2OE4X 1JTNA 217LA 1LYJA 1QS5A 1LI6A 4W57A 152LA 1CV1A 1C67A 224LA 1P46A 232LA 2NTGA 2RB1X 3UONA 2RAZX 3SB5A 107LA 198LA 1L87A 173LA 1L66A 1L31A 3C80A 1L50A 3ODUA 1LWGA 1OVHA 2OTZX 1OWZA 191LA 1SX2A 126LA 112LA 3HUKA 1LYDA 3GUOA 1L52A 1QTZA 1L43A 1L94A 231LA 4LZMA 164LA 1L70A 2ANXA 1KW7A 1QTDA 103LA 1L39A 1L48A 1L84A 1L25A 1TLAA 2RBPA 225LA 1L20A 1XEPA 242LA 4GRVA 170LA 197LA 1L36A 2F32A 1C6TA 156LA 4EPIA 1CX7A 1L40A 1LYGA 1P5CA 200LA 1L98A 2OU8A 1L22A 1L90A 4GBRB 1CU2A 1CX6A 1G0GA 147LA 1DYDA 123LA 229LA 3EMLA 1QTVA 1C68A 233LA 1L79A 1CV4A 172LA 1L45A 1L41A 1CU5A 3HH4A 1D3JA 1T8AA 1T97A 1XJUA 4IAPA 212LA 1QT8A 110LA 3GUMA 3HT9A 1OVJA 1L62A 2B6YA 1P2RA 160LA 4I7LA 1LGXA 1LWKA 3CDVA 2A4TA 4ARJA 165LA 1D2YA 1L82A 1C61A 1SWYA 1L24A 1QS9A 4ARQA 1C62A 2B73A 201LA 1L01A 3HTGA 2Q9EA 1D3FA 3G3WA 1CV6A 4YXCA 1L81A 1L13A 4LDOA 177LA 3HT8A 257LA 2B70A 3HDFA 167LA 2O7AA 158LA 2RB2X 1CU6A 1L59A 4W59A 1L93A 2B74A 1QT6A 1QTHA 211LA 1G0QA 1L42A 1PQKA 2Q9DA 1L17A 1P7SA 3CDTA 1DYGA 2HULA 3C83A 140LA 1L10A 1KY1A 1C6MA 178LA 1D3NA 182LA 256LA 227LA 3SB7A 196LA 1KY0A 240LA 3DN4A 258LA 1P36A 114LA 1L86A 3V2YA 1LYIA 4PK0A 4ARPA 1CVKA 1L80A 2B75A 111LA 3PDSA 1L33A 1I6SA 1L53A 1QT3A 3C8SA 1EPYA 159LA 1DYAA 145LA 1L54A 3QAKA 3NYAA 3DMVA 1L65A 1L03A 1L72A 1D2WA 142LA 1ZWNA 1L63A 1C6BA 4ARLA 1OYUA 246LA 3V2WA 115LA 3CDRA 1L15A 3LZMA 230LA 1JTMA 221LA 1G0LA 1L07A 4AQNA 4W52A 4YXAC 4DAJA 3DKEX 251LA 2ANVA 1C6PA 4I7JA 1CV5A 1LW9A 1T8FA 3G3XA 4DJHA 262LA 255LA 1L58A 237LA 252LA 1L88A 1L71A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C6FA 1WQNA 1G1VA 238LA 3SB6A 1L49A 1GF8A 2FYCA 1TEWA 2DQAA 4I7PA 2I25L 2Z38A 138LA 3WVYA 3G3VA 2YBIA 192LA 3WW6A 1LYEA 190LA 2CJLA 4GN3A 4UWUA 3TMXA 3W6DA 5LAFA 1C6CA 5FHWA 4I7TA 1C08C 4N8ZA 2EKSC 2YDGA 4GCEA 1D6PA 1L99A 1P2LA 5HLLA 1OUJA 1LSYA 4WLTA 3OK0A 2B6TA 4YX7C 2BQBA 3HBHA 3SP3A 1LHJA 2HU1A 1IP4A 1JJ1A 4WLXA 1C43A 1OUHA 1B5UA 1LGUA 1O23A 1PZYA 1LSPA 2DQEY 1CV3A 2ZNWY 3BKVA 5C6LA 1SSWA 4ETDA 1NHEA 1LZYA 1AT5A 1B5ZA 1QUGA 2WARA 3LZTA 2EQLA 4DD7A 4KPMA 5B07A 1LZCA 146LA 3HU9A 1PQJA 3GUPA 1OV7A 1LYFA 1B0DA 2B5ZA 3K3TA 228LA 214LA 3DNAA 1KIQC 185LA 239LA 1DPXA 3ZEKA 1YAMA 1B7PA 1LMOA 4EPFA 1TCYA 1LOZA 4HSFA 4EKSA 1LSEA 5A3EA 4ET8A 3FI5A 1N4FA 222LA 5KXKA 1KXWA 1L26A 4PPOA 1D3MA 139LA 1LZ4A 2DQFC 4LT2A 2D4KA 2LCBA 1XEIA 1BB3A 3PBLA 5IDDA 4ARQB 3HH6A 4QDNA 1IX0A 1L00A 1VAUA 2Z19A 3DN2A 1UIHA 1K28A 213LA 2LZMA 4WO9A 1C6GA 1IWWA 2HUKA 3W3EA 2YBHA 2MEBA 1QDRA 1QT7A 5KXYA 2YBMA 143LA 2NWDX 4DWXA 5I14A 2BQFA 1QQYA 4TTDA 1G7HC 1OUEA 3A6BY 1FLYA 1L32A 3A92A 3A96A 2RBQA 4ML7A 2RBNA 3P64A 1BB4A 1XEJA 226LA 2DQCY 1GHLA 4DT3A 1WQQA 1E8LA 4XJBA 1JTPL 3IJUA 2HEAA 1IP5A 1L64A 1KIPC 1QUDA 4I7MA 3OE9A 3CDQA 4P2EA 4CJ2A 5LYMA 3WPJA 1IWYA 3OJPA 1LI3A 3AGHA 1CKHA 4XADA 1LSMA 4WG1A 3RUNA 7LZMA 2O79A 3K2RA 1GAZA 4W56A 4EKPA 128LA 3HTDA 4LYCA 4D9ZA 3HH3A 1CUQA 3C7ZA 3VW7A 1IWZA 4H9AA 1GFHA 1LMQA 2HU3A 4WM2A 261LA 253LA 1L14A 236LA 125LA 2OEAX 3TXJA 1D0KA 3F9LA 3WVXA 4LYBA 2RBOA 1L06A 3B0OA 1QUOA 3OE0A 187LA 1GFJA 1IC5Y 4NIJA 3LYZA 4W57A 4R0FA 1AM7A 1B5WA 1QTKA 4DDBA 3SB5A 3AB6A 1L50A 3AZ4A 1DXJA 1GFTA 1RE2A 3GUOA 5LA5A 2ANXA 1QTDA 1L48A 1LYOA 1HEPA 1YANA 1JKAA 2PC2A 2I26L 5F16A 1DQJC 3TXFA 1IOCA 4GCCA 1C6TA 156LA 1IP2A 4OWEA 4EPIA 1CX7A 1LYGA 2YBJA 1GF0A 1L90A 4GBRB 3W6BA 1LYZA 3AGGG 3WL2A 1C68A 1GAYA 1IVMA 172LA 1L45A 1L41A 2F2NA 3AZ6A 1F6SA 1D3JA 1LSNA 3RZ4A 4ZEEA 1QT8A 4J7VA 1IWTA 3WULA 4XJDA 3HT9A 4OOTA 1GBYA 1OVJA 1P2RA 1GFEA 4X3BA 4DDCA 2RSCA 1EQ4A 1W6ZA 165LA 1D2YA 2DKVA 5I53A 201LA 2Q9EA 2BLXA 1YAQA 1BWJA 5I4XA 4LDOA 4J1AA 1LZ6A 2B70A 1V7SA 3HDFA 1IIZA 2RB2X 1HHLA 1L93A 1FN5A 1LJGA 5FCPA 211LA 4PJ2C 1L42A 4LYTA 1B2KA 1PS5A 4H8ZA 4WG7A 3C83A 4GLVA 1GB3A 182LA 1YIKA 1KXXA 240LA 5I4WA 1LYIA 1J1OY 1CVKA 1L80A 2HTXA 1L33A 1IEEA 3CT1A 1YL1X 1XGRC 1GE0A 5FSTA 3W6EA 4HTQA 1LZ5A 1IC7Y 1L65A 1DPWA 4XJHA 1WQPA 3MGWA 5APEA 1L63A 1HSXA 1GXXA 1OYUA 4A7DA 2C8OA 1OUFA 115LA 1FDLY 1UBZA 3P66A 230LA 1JTMA 221LA 2AUBA 4H1PA 1G0LA 1CJ8A 2HEEA 4W52A 2MECA 1HEMA 1CV5A 1OUDA 1DZBX 5LYTA 262LA 1T6VL 237LA 1GF4A 5KKIA 1IP7A 5HMJA 4NGKA 5APCA 1QUTA 186LA 1LJ4A 2B7XA 1YKYX 199LA 1YILA 4OWAA 1L46A 1L16A 162LA 3LYOA 1JKCA 1NBYC 1L95A 1L61A 1XGPC 2Z2EA 5APFA 4Z3MA 4I7SA 2CUUA 4NHSA 1ZV5L 1NBZC 1L0KA 4LGKA 5LVGA 1IY4A 1D9UA 2MEEA 1GBSA 3CSZA 1HEQA 2BQLA 1LLHA 4OOOA 1IP1A 1L08A 1L74A 5F14A 3DMZA 5KXMA 2BQOA 1G0JA 1LSFA 4LT1A 1CKFA 3GUNA 2RBRA 4DQJA 4B4EA 4NGOA 4G4CA 2XTHA 2ZIKA 6LYZA 176LA 1LZBA 2GV0A 3EMSA 1DYCA 2BQNA 5KXPA 5LZMA 3HBEX 1L38A 2G4PA 3C8QA 1I20A 4N1EI 148LE 1H6MA 3HWLA 4WO6A 1LZEA 1C45A 1B7LA 1GF5A 250LA 210LA 1XGQC 2FYDA 1AKIA 1UIAA 4EKQA 1L0JA 1CKGA 3SBAA 1C69A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1C6F A;  1WQN A;  1G1V A;  238L A;  3SB6 A;  1L49 A;  1GF8 A;  2FYC A;  1TEW A;  2DQA A;  4I7P A;  2I25 L;  2Z38 A;  138L A;  3WVY A;  3G3V A;  2YBI A;  192L A;  3WW6 A;  1LYE A;  190L A;  2CJL A;  4GN3 A;  4UWU A;  3TMX A;  3W6D A;  5LAF A;  1C6C A;  5FHW A;  4I7T A;  1C08 C;  4N8Z A;  2EKS C;  2YDG A;  4GCE A;  1D6P A;  1L99 A;  1P2L A;  5HLL A;  1OUJ A;  1LSY A;  4WLT A;  3OK0 A;  2B6T A;  4YX7 C;  2BQB A;  3HBH A;  3SP3 A;  1LHJ A;  2HU1 A;  1IP4 A;  1JJ1 A;  4WLX A;  1C43 A;  1OUH A;  1B5U A;  1LGU A;  1O23 A;  1PZY A;  1LSP A;  2DQE Y;  1CV3 A;  2ZNW Y;  3BKV A;  5C6L A;  1SSW A;  4ETD A;  1NHE A;  1LZY A;  1AT5 A;  1B5Z A;  1QUG A;  2WAR A;  3LZT A;  2EQL A;  4DD7 A;  4KPM A;  5B07 A;  1LZC A;  146L A;  3HU9 A;  1PQJ A;  3GUP A;  1OV7 A;  1LYF A;  1B0D A;  2B5Z A;  3K3T A;  228L A;  214L A;  3DNA A;  1KIQ C;  185L A;  239L A;  1DPX A;  3ZEK A;  1YAM A;  1B7P A;  1LMO A;  4EPF A;  1TCY A;  1LOZ A;  4HSF A;  4EKS A;  1LSE A;  5A3E A;  4ET8 A;  3FI5 A;  1N4F A;  222L A;  5KXK A;  1KXW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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