1KW7A

Methionine core mutant of t4 lysozyme
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKMKPVYDSMDAVRRAAMINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNMAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Multiple methionine substitutions are tolerated in T4 lysozyme and have coupled effects on folding and stability
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2002-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1kw7A00
1L03A 3V2WA 1D2WA 1G0GA 107LA 4YXCA 3PDSA 1CU3A 2RAYX 128LA 1L88A 1C68A 3OE6A 1LLHA 2LC9A 1SWZA 142LA 1OV5A 1QUOA 1L85A 1L02A 213LA 4W58A 3C7YA 1L80A 3DN6A 1CU6A 2RBQA 1CX6A 183LA 1L31A 1L60A 1L39A 173LA 1LGUA 137LA 1CV1A 1L45A 240LA 4PK0A 3CDVA 1L51A 1LGWA 1L24A 2Q9DA 1DYCA 256LA 3DN8A 4LDEA 123LA 3SBBC 1KY0A 2F2QA 3UONA 1L19A 1L89A 253LA 1QT7A 247LA 3CDRA 1CV6A 211LA 3HT6A 1L0JA 1CTWA 1G0JA 1CUPA 4DJHA 1G0KA 3L2XA 1SSYA 1L86A 1L59A 2LCBA 1L97A 1QTZA 3HUKA 148LE 1L87A 1C6AA 1ZYTA 1G1WA 2B7XA 171LA 138LA 1JTNA 229LA 4E97A 206LA 252LA 1KY1A 3CDOA 1EPYA 112LA 108LA 1C61A 4I7LA 1L13A 4EKSA 159LA 1LPYA 1L22A 1QUHA 1QUDA 2RBSA 3SN6R 1L69A 1C63A 1L09A 4I7NA 158LA 1OVHA 1QSBA 1JTMA 205LA 188LA 1T8FA 3HTBA 195LA 4ZPUA 2B6YA 1L41A 1OVKA 3HTDA 1DYAA 3HH6A 7LZMA 216LA 185LA 1L15A 2OTYX 1C60A 1LYGA 254LA 1L20A 164LA 2B6XA 4EKQA 1LYJA 1L95A 199LA 4GBRB 3HUQA 1L25A 1SSWA 3OE8A 1L37A 3DN4A 1C65A 1D3JA 231LA 3HT8A 146LA 3C8SA 2B74A 170LA 3L64A 4YX7C 1P5CA 250LA 3HH5A 3HT7A 1SX2A 2OE4X 4DKLA 2O79A 4ARLA 4ARMB 1L81A 1PQMA 2HUKA 1G0MA 3GUKA 2OE9X 3C80A 1QTBA 3LZMA 3HT9A 232LA 1L82A 1PQDA 251LA 226LA 249LA 1P46A 2RBPA 3DN2A 1QTDA 1L44A 4EKRA 1L32A 4PJZA 2RBNA 246LA 1QT8A 237LA 139LA 1D3NA 1DYEA 1L35A 4W51A 3NYAA 165LA 3NY8A 172LA 219LA 1L76A 1P6YA 127LA 1L42A 2B75A 3GUNA 1L23A 2B6WA 1C6EA 3HTFA 174LA 192LA 4W56A 1G0LA 1L16A 1L90A 4W53A 3SBAA 3DNAA 4ARQB 217LA 1G06A 2B70A 150LA 1K28A 149LA 1T6HA 1CV4A 1CV0A 1C6GA 4I7JA 115LA 131LA 1L53A 257LA 2RB2X 1L79A 1L52A 1L04A 1SWYA 1L14A 3K2RA 1CUQA 1PQJA 1L30A 1C66A 1I6SA 4LDOA 1L74A 1TLAA 1L05A 1OWYA 3GULA 175LA 196LA 145LA 242LA 1KW5A 1L83A 3HWLA 1D3MA 176LA 3EMLA 118LA 1C6DA 3PBLA 189LA 1L28A 224LA 228LA 2F47A 1OV7A 3DMZA 3QAKA 156LA 2A4TA 218LA 1CVKA 1L99A 2NTHA 1L62A 1C6JA 141LA 1P37A 2RBOA 259LA 1LYDA 143LA 1QTVA 1T8AA 119LA 1D3FA 1L63A 1ZWNA 1L56A 113LA 1B6IA 198LA 122LA 1L55A 1P3NA 244LA 1L75A 130LA 1P56A 187LA 1LYHA 1NHBA 2O7AA 4W54A 102LA 2B73A 1JQUA 1KW7A 260LA 1PQKA 114LA 1C62A 1P2RA 3FADA 3SB9A 1L64A 1QUGA 3HDFA 109LA 1L77A 3HH4A 1SX7A 2F32A 1QT5A 212LA 152LA 3C7ZA 4W57A 166LA 3SB6A 1L71A 3GUMA 1C6HA 4EPFA 168LA 3G3XA 3GUOA 4EKPA 1QS9A 2RBRA 3JR6A 1L58A 1C6NA 3SB8A 1L17A 236LA 3D4SA 4YXAC 261LA 160LA 3FI5A 4ARMA 1CV5A 248LA 3GUJA 3DN0A 180LA 3OE9A 1CU2A 4DAJA 1L68A 214LA 167LA 4S0WA 1DYDA 3C82A 2B6ZA 140LA 1C6BA 1C67A 243LA 4I7OA 4I7PA 178LA 2Q9EA 1L70A 1QTCA 1C6MA 3C7WA 4I7TA 1LYIA 3C81A 3HUAA 163LA 103LA 2Z6BA 230LA 1L11A 104LA 151LA 3DN3A 2RAZX 4EJ4A 1L50A 1C6LA 1L72A 4I7QA 1L33A 1C6CA 1KS3A 169LA 2CUUA 1OVJA 190LA 4ARJA 4ARQA 1CU5A 234LA 157LA 1G0PA 4I7MA 1C6TA 3V2YA 1LYFA 2ANXA 4GRVA 3FA0A 1LWGA 2LZMA 5I14A 210LA 1XJUA 110LA 1L94A 1LI2A 2HUMA 1L84A 1P2LA 5LZMA 1XJTA 144LA 1DYFA 3GUPA 4I7KA 1L65A 1L61A 1T97A 201LA 220LA 197LA 1L40A 221LA 225LA 239LA 3G3VA 3DMXA 3HDEA 1G0QA 1L38A 1G1VA 1L48A 235LA 2RH1A 1L92A 3C8RA 4EXMA 238LA 186LA 4EPIA 227LA 4LZMA 1G07A 2OU0X 1CX7A 1L00A 1CV3A 233LA 215LA 184LA 120LA 1L29A 3HU8A 147LA 1L73A 1L36A 1WTHA 241LA 161LA 1QS5A 2B72A 1XEPA 1DYGA 2O4WA 222LA 2OEAX 3F9LA 1KNIA 1L57A 1OYUA 3C83A 1QT3A 3HH3A 1L27A 1P7SA 262LA 1L43A 182LA 126LA 1P64A 1L07A 1LW9A 3G3WA 3RZEA 1C6QA 1L47A 4IAPA 1L66A 111LA 3ODUA 3NY9A 1C6FA 1L06A 4W52A 3HU9A 125LA 1L01A 1L12A 1L26A 255LA 129LA 1L0KA 1L46A 1LI6A 209LA 2ANVA 191LA 162LA 1QT6A 2QB0B 2NTGA 4I7SA 2OE7X 1LI3A 3SB7A 1L93A 2RB0X 3DKEX 200LA 3F8VA 1CU0A 3GUIA 3CDTA 1QSQA 3HTGA 6LZMA 155LA 1C6KA 1L54A 4ARPA 258LA 1OWZA 2OTZX 3CDQA 4LDLA 1C6IA 1L98A 245LA 2B6TA 1L91A 2RB1X 4OO9A 1L08A 1QTHA 2OU8A 223LA 3OE0A 2QARC 3C8QA 177LA 1QT4A 3SB5A 3VW7A 4AQNA 3DMVA 1C6PA 1ZURA 2HULA 1L96A 1DYBA 1L67A 1C64A 1T8GA 3DN1A 1LYEA 1PQOA 1LGXA 1P36A 1L18A 4K5YA 2OU9A 4W55A 181LA 1L34A 1C69A 4I7RA 1L10A 1L21A 1D9WA 1PQIA 1L49A 2L78A 4W59A 3RUNA 1D2YA 1LWKA 2IGCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L03A 1FKQA 3CT1A 4HV1A 4YXCA 1F10A 3KAMA 1BWIA 1C68A 3OE6A 1LLHA 1J1PY 1KXXA 3P68A 3C7YA 1OUAA 4RW2A 3AW7A 1LGWA 1L24A 1DYCA 4WG7A 3DN8A 4MCKA 1QT7A 2Z2FA 5E4PA 3ZEKA 4DD0A 3OK0A 5F9UA 3W6BA 4TTDA 4QEQA 5LXWA 1L0JA 1CTWA 1G0JA 1CUPA 4WL6A 3T6UA 1G7HC 1EQ5A 3W6AA 4DYGA 1NBYC 1LSCA 148LE 1L87A 4Z41A 1G1WA 4OWEA 1CKGA 4NSHA 229LA 3CDOA 5KXRA 1C61A 4DDBA 5B1GA 1QIOA 1L09A 1IOTA 158LA 1GFAA 1WQNA 188LA 1T8FA 4DDCA 1VEDA 1UC0A 195LA 1YQVY 2LZTA 1OVKA 1LZSA 185LA 1F0WA 5LYZA 1L20A 1GEZA 3TXJA 5M1YA 1REMA 1YL1X 1L25A 3DN4A 1D3JA 2DQHY 146LA 2OE4X 4IJ4A 4NHPA 1L81A 4I8SA 1G0MA 1LKRA 4LFPA 2D4IA 1H6MA 1QTBA 3HT9A 1D9UA 2ZQ3A 251LA 4NSJA 2RBPA 3DN2A 1L44A 3P65A 3LYZA 4PJZA 1QT8A 1JISA 1YAMA 139LA 2ZNWY 1GPQC 1GB0A 4W51A 2ZILA 3NYAA 1IVMA 3NY8A 172LA 1LSFA 1LYYA 5APDA 1L76A 1FKVA 1L42A 1REZA 3TMUA 1CKHA 1YKYX 4XYYA 2BLXA 1LHJA 3WL2A 1IR7A 3VWOA 5I54A 5FEKA 1A2YC 4ARQB 217LA 2B70A 1WQMA 5KXSA 3A91A 149LA 1CV4A 1YL0X 5D5FA 1B7PA 131LA 4TX7A 2RB2X 1YKXX 3K2RA 1CUQA 2BQMA 3AZ4A 1L74A 1L83A 2F2NA 3HWLA 118LA 4WMGA 5KY1A 1FN5A 4WG1A 3QAKA 5F81A 2CWIA 1LYOA 1HSWA 141LA 1GE4A 5L3HA 143LA 1BB7A 1ZWNA 1L56A 4GN4A 1B6IA 5HNCA 122LA 2CJLA 4NFVA 1CJ9A 1AKIA 4U3XB 3AZ6A 1TEWA 260LA 1C62A 1P2RA 4MSTA 1LZEA 4EOFA 2Z37A 3HDFA 109LA 1B0DA 3HH4A 4G49A 3J6KA 3SB6A 4N5RA 1UIEA 3GUMA 4EPFA 1LZ9A 1LSMA 1C6NA 3SB8A 4XJDA 4NHTA 3FI5A 4ARMA 4HTKA 3DN0A 1IY3A 1GB6A 167LA 4S0WA 1DYDA 2Z19A 4OWCA 4W94A 5HLLA 178LA 4H9HA 1G7IC 4I7TA 3C81A 1UIBA 3HUAA 2EIZC 1JITA 1YANA 1KXYA 4N1EI 103LA 1IR9A 2Z6BA 4NGYA 1L11A 3DN3A 2RAZX 4EJ4A 2D4JA 5KJ9A 4N8ZA 4UWUA 4NGOA 4LYBA 2W1YA 1L33A 1LYZA 3WW5A 2LHMA 5B05A 3EXDA 1G0PA 1LZDA 1LSBA 4I7MA 3SP3A 1GF0A 4GRVA 1GBWA 110LA 2HUMA 2LYZA 5LZMA 1XJTA 2W1MA 3GUPA 2BQCA 1VATA 1HEWA 1LJ3A 197LA 5F9XA 3A3QA 4H9FA 4XN6A 2ZIJA 1B5UA 3M18B 4HV2A 1LJIA 3C8RA 186LA 2OU0X 3ATNA 1AM7A 147LA 161LA 1LJEA 1L57A 1V7SA 1QT3A 1C10A 1XGRC 2DQJY 2DQAA 262LA 1LZ8A 5LA5A 126LA 1P64A 2MEEA 2BQKA 2BQGA 2D4KA 4H9IA 1L47A 3N9AA 3HBDA 1KXWA 4B4EA 2Z39A 1HNLA 1BHZA 1L46A 3A6BY 162LA 2QB0B 3P66A 1JIYA 2RB0X 3GUIA 6LZMA 1QSQA 1UBZA 1GE1A 2MEHA 2EQLA 1WQPA 4ARPA 2YVBA 1CJ8A 1LZYA 3A67Y 4R0FA 4OO9A 1DI5A 1LAAA 3OE0A 2YBMA 3LYTA 3AGHA 1C6PA 1B7NA 4C5FA 1LYEA 1PQOA 1XGUC 1RI8B 1HELA 4W55A 1C69A 4I7RA 2W1XA 4KXIA 1LSPA 4H9CA 1J1XY 1LWKA 2H9JA 3V2WA 1LJJA 1WVVA 1CU3A 2BQFA 4XJHA 2RSCA 4IATA 1SWZA 1GEVA 3RW8A 4M6DA 7LYZA 1NKHA 4ETEA 1AZFA 1CX6A 183LA 1LSNA 1FLWA 1L31A 137LA 4NGZA 4YM8A 1IP4A 240LA 2Q9DA 1AT6A 4LDEA 4HPIA 1GXV2 253LA 3B0KA 247LA 1CV6A 2BLYA 1GF6A 4DJHA 3L2XA 2W1LA 4OWHA 4RLNA 1HMLA 1JJ3A 2HUBA 1L97A 3HUKA 1BVKC 1NDGC 1C6AA 2B7XA 171LA 5T3FA 1YILA 3IJVA 1JTNA 4H93A 5KXLA 1YAPA 3N9EA 252LA 4EKSA 1L13A 2XBSA 159LA 1LPYA 1L69A 1C63A 1QSBA 3A6CY 2WARA 4LZTA 3TXDA 3WMKA 2GV0A 1GFRA 1GWDA 4XADA 1IP7A 4ETDA 1DYAA 7LZMA 1LYGA 3WU8A 2ZYCA 2EKSC 3G3AB 1C65A 2XBRA 1T6VL 2B74A 3L64A 4E3UA 4GCFA 3ZVQB 250LA 1NQIA 3HH5A 1O23A 1LMTA 1UIDA 1G7JC 1BGIA 1B7SA 5FCPA 3TXBA 1B2KA 1L82A 1PQDA 1BVXA 249LA 1P46A 4ZFPA 4EKRA 1G7LC 165LA 1BB3A 1EQEA 1CKDA 4PRQA 1P6YA 3CT0A 127LA 1PS5A 3GUNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L03 A;  1FKQ A;  3CT1 A;  4HV1 A;  4YXC A;  1F10 A;  3KAM A;  1BWI A;  1C68 A;  3OE6 A;  1LLH A;  1J1P Y;  1KXX A;  3P68 A;  3C7Y A;  1OUA A;  4RW2 A;  3AW7 A;  1LGW A;  1L24 A;  1DYC A;  4WG7 A;  3DN8 A;  4MCK A;  1QT7 A;  2Z2F A;  5E4P A;  3ZEK A;  4DD0 A;  3OK0 A;  5F9U A;  3W6B A;  4TTD A;  4QEQ A;  5LXW A;  1L0J A;  1CTW A;  1G0J A;  1CUP A;  4WL6 A;  3T6U A;  1G7H C;  1EQ5 A;  3W6A A;  4DYG A;  1NBY C;  1LSC A;  148L E;  1L87 A;  4Z41 A;  1G1W A;  4OWE A;  1CKG A;  4NSH A;  229L A;  3CDO A;  5KXR A;  1C61 A;  4DDB A;  5B1G A;  1QIO A;  1L09 A;  1IOT A;  158L A;  1GFA A;  1WQN A;  188L A;  1T8F A;  4DDC A;  1VED A;  1UC0 A;  195L A;  1YQV Y;  2LZT A;  1OVK A;  1LZS A;  185L A;  1F0W A;  5LYZ A;  1L20 A;  1GEZ A;  3TXJ A;  5M1Y A;  1REM A;  1YL1 X;  1L25 A;  3DN4 A;  1D3J A;  2DQH Y;  146L A;  2OE4 X;  4IJ4 A;  4NHP A;  1L81 A;  4I8S A;  1G0M A;  1LKR A;  4LFP A;  2D4I A;  1H6M A;  1QTB A;  3HT9 A;  1D9U A;  2ZQ3 A;  251L A;  4NSJ A;  2RBP A;  3DN2 A;  1L44 A;  3P65 A;  3LYZ A;  4PJZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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