3D4SA

Cholesterol bound form of human beta2 adrenergic receptor.
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor/T4-lysozyme chimera
publication title A specific cholesterol binding site is established by the 2.8 A structure of the human beta2-adrenergic receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 160
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3d4sA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3d4sA01
189LA 1PY6A 205LA 2OU8A 3GUPA 1QS9A 5B2NA 4MQTA 2F95A 5G54A 3CAPA 4EKRA 1E12A 3C8SA 6LZMA 4XT3A 2OTZX 4WW3A 190LA 1AT9A 5A44A 198LA 3HH5A 3HTFA 5JJEA 2NTGA 3SB9A 3WQJA 1QHJA 2WJKA 172LA 3QBLA 3C9MA 3VG9A 1L9HA 1S8JA 1XJIA 5TGZA 3CODA 5G2AA 138LA 4XTOA 3HT7A 1DZEA 1QT7A 1ZYTA 1U19A 1OVJA 1LYDA 3HWLA 4BWBA 1L77A 169LA 1C8RA 2Y04A 5B6VA 4EPIA 1JV7A 3GUMA 1L17A 212LA 238LA 4UG2A 3HT8A 148LE 4EXMA 257LA 3HASA 4PXKA 3S3DB 3OE9A 1QKOA 1LYIA 2JAFA 1DYCA 5H2NA 162LA 1L92A 4IB4A 5AWZA 2Y01A 1M0MA 1GZMA 1Q5JA 130LA 261LA 1DYFA 2O7AA 1IW6A 1L13A 2B74A 2OU0X 3OAXA 5JJNA 111LA 245LA 129LA 3VVKA 3RUNA 249LA 1DYDA 4DAJA 1P3NA 4DKLA 1C67A 215LA 3EH5B 1BRXA 2OE4X 3S3CB 1C6DA 1L30A 1D9WA 2ANXA 1L31A 1L96A 1L50A 1H68A 1L47A 1C6PA 2LNLA 4GP4B 3VI0A 2RB2X 1KS3A 4BEYA 1C6BA 107LA 1L58A 4ARQA 5H2OA 1P56A 1UAZA 3F8VA 1AP9A 1S54A 2B6WA 1T97A 2HPYA 5B6YA 1NHBA 4IARA 1QT3A 3LZMA 1C6TA 1L0JA 3DN1A 210LA 260LA 1PXSA 4MD1A 3ODUA 4ARMB 1T8AA 4GYCA 1L97A 1CV5A 1QT5A 1KGBA 5BR5A 1L54A 1L55A 2QARC 5EN0A 2ZFEA 3DN0A 4JQ6A 3VHZA 1ZURA 1LN6A 1CV6A 1I6SA 183LA 3UTWA 1LLHA 3CDTA 4YXAC 3SB5A 1CU6A 2O79A 1G0PA 2OE9X 1L51A 182LA 1L89A 1PQDA 3GUNA 1JTNA 1L41A 1L04A 2I35A 1L27A 1L98A 4FBZA 1L59A 1QUOA 243LA 152LA 156LA 1L38A 1L63A 144LA 4ARPA 4E97A 4W55A 1ZWNA 1H2SA 4G7QB 3UTVA 4XT1A 1P36A 2RBRA 2KS9A 209LA 4DJHA 1L80A 1VGOA 1LI2A 1B6IA 1TLAA 216LA 1L00A 4K5YA 2M3GA 4OO9A 4AMIA 187LA 3HUAA 3RZEA 5H2IA 4W56A 3NS0A 1OV7A 4I7TA 1C60A 3QJTB 4ARLA 2HULA 2PEDA 3PBLA 5H2PA 5A45A 1LI3A 5H2JA 4A4MA 5A8EA 3NY8A 1L90A 2OTYX 4EJ4A 4ZPUA 3C7WA 4W52A 1L06A 3HAOA 1L01A 4I7QA 1L65A 2I20A 1T8FA 1P6YA 149LA 1EHKB 239LA 181LA 2F2QA 3NYAA 4N4WA 2YDVA 5DHGA 1L29A 1PQJA 1SX2A 1K28A 2HUMA 1G0KA 1KNIA 2OEAX 1XMEB 3ABWA 188LA 128LA 1DYEA 3OE6A 195LA 4I7RA 2ANVA 1KY1A 237LA 1LGXA 2EI4A 1KY0A 252LA 3VGAA 1LYEA 2RB0X 4QRYA 4WAVA 1L46A 4XTNA 1X0SA 1L18A 4S0WA 3HU8A 218LA 3HTBA 4G7SB 1HZXA 3EH3B 3X3CA 175LA 1C6AA 196LA 214LA 2AT9A 248LA 1QT6A 2F47A 246LA 1F50A 2R4RA 1L10A 1L83A 4EKPA 1LWKA 1XJUA 184LA 4G72B 4PXFA 108LA 4G71B 3HTGA 2RBOA 1VJMA 4G70B 1L62A 1QUGA 1IXFA 5AZDA 3X3BA 4LDEA 1G1WA 4GRVA 7LZMA 5AHYA 1L79A 118LA 1R84A 4PJZA 2IGCA 3UZCA 1G06A 1FBBA 1S51A 5ITEA 232LA 127LA 1CU5A 1C3WA 4IAPA 1C8SA 1L99A 176LA 1KW7A 1L14A 3DNAA 2B70A 220LA 3G3VA 1LYJA 2O4WA 1L44A 173LA 3HH3A 3HUQA 259LA 161LA 166LA 3QJUB 3DMZA 4MBSA 254LA 230LA 4FA7B 151LA 177LA 228LA 231LA 3PWHA 1L28A 199LA 3KJ6A 1GU8A 5G2DA 185LA 164LA 3CDRA 4XTLA 125LA 4EPFA 241LA 1LGWA 3HAPA 4N4YB 253LA 4W59A 1QSQA 3SN6R 1SSYA 2OU9A 1CX6A 1LPYA 5H2MA 1QUHA 3DN6A 256LA 222LA 102LA 1L05A 3ZEVA 1L07A 1OVHA 1T6HA 1KMEA 2RAZX 3QJQB 1IW9A 1KG8A 4I7OA 2YCXA 3FADA 5KKHA 4YX7C 3SB7A 1QTHA 1L56A 4EKQA 1LI6A 2HUKA 3HUKA 3K2RA 2Z55A 1QTBA 1L26A 3L2XA 4KNFA 1OWYA 240LA 1D2YA 4X32A 226LA 1CU2A 1P5CA 251LA 1G0GA 5ITCA 1DYBA 119LA 1L64A 2KSYA 3CDVA 1L36A 3AM6A 2J4YA 2L78A 137LA 4FPDA 2Y00A 1L37A 1L12A 1L87A 1LYHA 1QTCA 1L22A 140LA 2RBPA 1JV6A 2X72A 4EIYA 122LA 1T8GA 1PQOA 1L48A 178LA 3F9LA 3UTYA 4HYXA 1C6CA 1C6GA 2I1XA 5G2CA 120LA 258LA 1L15A 3C9LA 1BM1A 1D3JA 3NY9A 1XJTA 221LA 1PXRA 104LA 4MQSA 5C1MA 3S8FB 1L82A 1L70A 1L73A 4TL3A 1C6KA 3D4SA 1O0AA 4I7PA 206LA 4HYJA 1L42A 234LA 3DN8A 4AMJA 1C63A 1C6HA 2BRDA 170LA 167LA 4G7RB 3UTXA 1M0KA 3DQBA 1QM8A 3MBVA 2QB0B 1R2NA 4W58A 1L85A 3SBAA 2QPDB 197LA 1JQUA 1CVKA 4GBRB 3PXOA 1JFPA 3VW7A 3UONA 1CV0A 1L45A 1SSWA 2WJLA 1C6EA 1CX7A 3HT9A 113LA 1L61A 4Y9HA 3SB8A 3G3XA 1CV3A 141LA 5B6WA 1G1VA 1X0I1 4W53A 1L34A 4W51A 1LYGA 1C62A 4W57A 3HDEA 1C6MA 5FJGA 1PQMA 1QS5A 4HWLA 1F4ZA 3ZPQA 3C8QA 4UHRA 158LA 1P7SA 1QTDA 103LA 2B75A 1TN0A 3GUOA 5B34A 224LA 3DMXA 1L88A 3C82A 3QAKA 4N6HA 1OWZA 1C64A 3C83A 1L19A 1SWZA 200LA 1L16A 1LYFA 2YDOA 1LW9A 3FI5A 1PQKA 3OE0A 1XEPA 165LA 1D3MA 1JTMA 1L39A 1L95A 225LA 227LA 3DN3A 1DYAA 1L72A 2RBNA 147LA 143LA 3L64A 247LA 5I14A 1JGJA 4MD2A 1L11A 1L25A 1L02A 219LA 3C8RA 3GULA 1L74A 1CWQA 3JR6A 1QUDA 5H2HA 3UG9A 1QT8A 4I7KA 1SX7A 3HH4A 1L0MA 2F32A 1L67A 1OV5A 115LA 1L35A 1L43A 4L35A 1L52A 3PDSA 2NTUA 4GPOA 5B6XA 4BEZA 2RAYX 3QBIA 1L49A 1L60A 3CDQA 1P8UA 5J7AA 5BR2A 3P0GA 2L6XA 1G0MA 1P2LA 1P2RA 2NTHA 1S53A 1L53A 5F8UA 3G3WA 3HT6A 2B7XA 3QBKA 109LA 191LA 3AYMA 180LA 1OVKA 4ARMA 1LWGA 4QI1A 1C66A 1CUQA 4JKVA 1EPYA 1CV4A 5G53A 1L66A 5G28A 1D3NA 2YCWA 1X0K1 2LZMA 1MGYA 1OYUA 5G36A 131LA 1SWYA 2KSBA 2QPEB 3PQRA 3HANA 1L32A 2B73A 3C80A 3V2YA 5H2KA 160LA 3HAQA 1L21A 1D3FA 3COCA 233LA 2RH1A 1QTZA 3HTDA 4AQNA 3REYA 5LZMA 4BVNA 1G07A 4BUOA 5ETZA 3C7ZA 1L91A 4FAAB 1F88A 2Q9DA 3EH4B 242LA 3HARA 1QKPA 1L0KA 1P46A 3V2WA 2NTWA 139LA 3QDCA 1L94A 1BRDA 3S3BB 1C61A 2LC9A 1P8HA 4J4QA 4GP8B 1L33A 1C6IA 4ARJA 1Q5IA 1CUPA 1L84A 1CU0A 2ZIYA 112LA 4W54A 4NC3A 1L68A 146LA 235LA 1L57A 1BRRA 5AX0A 1L75A 4YXCA 1L71A 2Z73A 3T45A 4JR8A 4X31A 1QSBA 3EMLA 5JJJA 1L81A 2B6YA 1C68A 3HU9A 2ZZLA 1L76A 3DDLA 1P64A 1G0LA 4GBRA 4QIDA 4LDLA 2OE7X 1GUEA 192LA 2Z6BA 3GUIA 201LA 3GUJA 2RB1X 1S8LA 3QAPA 2JAGA 1L24A 1G0JA 1C6NA 262LA 1L03A 1P8IA 3QBGA 5DHHA 2RBQA 1C65A 4PK0A 4IAQA 123LA 2RBSA 2Q9EA 1C6JA 3RFMA 3CDOA 157LA 4I7MA 229LA 2B6TA 4I7LA 1L23A 3QJRB 236LA 5AHZA 1CV1A 4BV0A 3HDFA 3SBBC 3DMVA 223LA 3ZPRA 1L09A 1KG9A 1DYGA 250LA 4ARQB 159LA 1L08A 155LA 1KW5A 3HH6A 3QJSB 186LA 5H2LA 3C7YA 2Y02A 1D2WA 1XIOA 2Y03A 2LCBA 3SB6A 1WTHA 126LA 2R4SA 4OV0A 1PQIA 3QJVB 2G87A 5AX1A 4LDOA 1L86A 1CU3A 4KLYA 3BVDB 4XXJA 1P37A 110LA 4I7SA 5B6ZA 145LA 3FA0A 1FBKA 2F93A 2B6XA 174LA 5LWEA 1C6FA 2B6ZA 1LGUA 168LA 2VT4A 1QTVA 142LA 1L20A 3OE8A 1CTWA 2YCYA 2B72A 4EKSA 244LA 4I7NA 1S52A 5B0WA 1QT4A 213LA 171LA 1L69A 2A4TA 4LZMA 3UZAA 1UCQA 4GP5B 3S8GB 3DN2A 3AYNA 1TN5A 1M0LA 5B35A 150LA 4I7JA 163LA 211LA 3GUKA 3DN4A 4EA3A 2KSAA 3A7KA 5DYSA 1G0QA 114LA 1C6LA 2I21A 3DKEX 1E0PA 3NSBA 1L93A 255LA 1L40A 2CUUA 4X1HA 217LA 1C6QA 2YCZA 4L6RA 3C81A 1C69A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
189LA 205LA 3RW8A 1RFPA 1NHEA 1YL0X 3AZ5A 5ILCA 4H8YA 2XQOA 3WQJA 172LA 1GF8A 3FE0A 1XJIA 4WG7A 1LZ6A 3HWLA 1B7QA 3GUMA 1B5VA 1HELA 5HNCA 3HT8A 3HASA 3OE9A 5H2NA 1HERA 1LYIA 1DYCA 1L92A 1M0MA 1GZMA 1L13A 1UIBA 2B74A 1FLUA 111LA 1B7SA 3RUNA 4NWHA 4DAJA 1YAMA 4ETDA 3EH5B 4PGJB 4NWEA 4ML7A 3S3CB 3TMXA 1EL1A 1D9WA 2ANXA 4IASA 1ALCA 1GB7A 1H68A 4G4CA 5KXXA 1REYA 1YROA 1KS3A 107LA 1OP9B 1WQNA 5C6IA 1P56A 1AP9A 1NDMC 4XYYA 1S54A 1QUSA 3J4GA 260LA 5KXOA 4II8A 1QT5A 3HBEX 1KGBA 1WQPA 3WL2A 1B5YA 1DKKA 2QARC 3DN0A 4BS7A 1GF7A 1NWGA 1IWYA 2ZQ4A 4OWHA 1L51A 4LYZA 1PQDA 3GUNA 4OWAA 2I35A 2MEGA 4NHSA 2F30A 1QUOA 152LA 1L63A 4E97A 3VWOA 5LYMA 1LHJA 4RDSA 1L80A 1VGOA 1TLAA 4K5YA 1LSDA 1LJIA 2M3GA 3RZEA 5H2IA 4W56A 3PBLA 1LI3A 4A4MA 1UC0A 3K3TA 2LZ2A 3A8ZA 4I7QA 1QIOA 3A3QA 3WPJA 1EHKB 2F2QA 4N4WA 5DHGA 4TSCA 1G0KA 4X3BA 2ZYPA 2HUBA 3LHMA 1JSFA 4DD3A 237LA 1HEOA 1LGXA 3CQLA 2RB0X 4WAVA 3TXKA 1UIGA 3HU8A 1LHIA 4G7SB 1LHMA 3EH3B 3X3CA 3P64A 246LA 4EKPA 3IWRA 3LN2A 2LYMA 4MSTA 4ETCA 1IO5A 2F2NA 1CJ9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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